Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2ypc_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 3.A N TYR 76.A O LEU 3.A H 3.365 2.543 LEU 5.A N TYR 212.A O LEU 5.A H 2.667 1.980 PHE 7.A N LYS 72.A O PHE 7.A H 2.961 2.163 GLY 8.A N THR 210.A O GLY 8.A H 3.047 2.249 TRP 9.A N CYS 69.A O TRP 9.A H 2.926 2.131 PHE 10.A N ILE 208.A O PHE 10.A H 2.809 1.965 LEU 11.A N LEU 67.A O LEU 11.A H 3.024 2.174 THR 12.A N LYS 206.A O THR 12.A H 3.235 2.449 SER 15.A N THR 12.A OG1 SER 15.A H 3.110 2.254 SER 16.A N THR 12.A O SER 16.A H 2.936 2.106 GLU 17.A N LYS 13.A O GLU 17.A H 3.079 2.260 THR 18.A N LYS 14.A O THR 18.A H 3.022 2.185 LEU 19.A N SER 15.A O LEU 19.A H 3.000 2.150 ARG 20.A N SER 16.A O ARG 20.A H 2.818 1.964 ARG 20.A NE GLU 17.A OE1 ARG 20.A HE 2.926 2.097 ARG 20.A NE GLU 17.A OE2 ARG 20.A HE 3.120 2.414 ARG 20.A NH1 GLN 24.A OE1 ARG 20.A HH12 2.975 2.128 ARG 20.A NH2 GLU 17.A OE2 ARG 20.A HH21 2.745 1.928 ARG 20.A NH2 GLN 24.A OE1 ARG 20.A HH22 3.491 2.800 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 2.880 2.026 ALA 22.A N THR 18.A O ALA 22.A H 3.072 2.267 GLY 23.A N LEU 19.A O GLY 23.A H 2.848 2.024 GLN 24.A N ARG 20.A O GLN 24.A H 2.924 2.098 GLN 24.A NE2 GLU 28.A OE2 GLN 24.A HE21 2.942 2.097 VAL 25.A N LYS 21.A O VAL 25.A H 2.931 2.093 PHE 26.A N ALA 22.A O PHE 26.A H 3.013 2.179 LEU 27.A N GLY 23.A O LEU 27.A H 3.053 2.226 GLU 28.A N GLN 24.A O GLU 28.A H 3.082 2.281 GLU 29.A N VAL 25.A O GLU 29.A H 2.862 2.005 LEU 30.A N PHE 26.A O LEU 30.A H 2.682 1.837 GLY 31.A N LEU 27.A O GLY 31.A H 3.005 2.167 ASN 32.A N GLU 28.A O ASN 32.A H 3.218 2.515 ASN 32.A N GLU 29.A O ASN 32.A H 3.225 2.566 HIS 33.A N LEU 30.A O HIS 33.A H 3.082 2.239 PHE 36.A N HIS 33.A O PHE 36.A H 2.957 2.301 LYS 37.A N HIS 33.A O LYS 37.A H 3.027 2.182 LYS 38.A N LYS 34.A O LYS 38.A H 2.970 2.185 GLU 39.A N PHE 36.A O GLU 39.A H 2.968 2.174 LEU 40.A N LYS 37.A O LEU 40.A H 3.231 2.397 HIS 42.A N GLU 39.A O HIS 42.A H 2.839 2.030 HIS 42.A ND1 GLU 39.A OE1 HIS 42.A HD1 3.076 2.473 PHE 43.A N LEU 40.A O PHE 43.A H 2.775 1.947 ILE 44.A N LEU 40.A O ILE 44.A H 2.952 2.134 GLU 48.A N GLU 48.A OE1 GLU 48.A H 2.516 1.747 LYS 52.A NZ GLU 54.A OE2 LYS 52.A HZ3 2.546 1.712 SER 57.A N.A GLU 54.A O SER 57.A H.A 3.164 2.547 TYR 58.A N GLU 54.A O TYR 58.A H.B 3.072 2.284 PHE 59.A N LEU 55.A O PHE 59.A H 2.875 2.026 LYS 61.A N CYS 152.A O LYS 61.A H 3.366 2.549 LYS 61.A NZ ALA 154.A O LYS 61.A HZ1 2.999 2.157 LYS 61.A NZ VAL 156.A O LYS 61.A HZ2 2.636 1.769 ARG 62.A NH2 VAL 56.A O ARG 62.A HH21 2.855 2.089 LEU 67.A N SER 16.A OG LEU 67.A H 2.645 1.861 CYS 69.A N TRP 9.A O CYS 69.A H 2.806 2.000 THR 71.A N PHE 7.A O THR 71.A H 3.006 2.198 THR 71.A OG1 TYR 85.A OH THR 71.A HG1 2.848 2.244 LYS 72.A NZ ALA 80.A O LYS 72.A HZ2 2.886 2.015 LYS 72.A NZ ASP 130.A OD1 LYS 72.A HZ1 3.137 2.425 LYS 72.A NZ ASP 130.A OD2 LYS 72.A HZ1 2.736 1.877 CYS 74.A N LEU 5.A O CYS 74.A H 2.800 1.998 ASP 75.A N LEU 5.A O ASP 75.A H 2.840 2.083 TYR 76.A N PRO 4.A O TYR 76.A H 2.938 2.149 GLY 77.A N CYS 74.A O GLY 77.A H 2.805 1.991 LYS 78.A N ASP 75.A O LYS 78.A H 2.966 2.110 ALA 79.A N CYS 74.A O ALA 79.A H 3.086 2.234 ALA 82.A N ALA 79.A O ALA 82.A H 3.147 2.308 GLU 84.A N GLU 84.A OE1 GLU 84.A H 2.649 1.827 TYR 85.A N GLY 81.A O TYR 85.A H 2.905 2.075 ALA 86.A N ALA 82.A O ALA 86.A H 2.940 2.143 GLN 87.A N GLU 83.A O GLN 87.A H 3.102 2.352 GLN 87.A NE2 GLU 83.A O GLN 87.A HE21 3.619 3.120 GLN 88.A N TYR 85.A O GLN 88.A H 3.256 2.411 LYS 92.A N GLN 88.A O LYS 92.A H 3.126 2.284 ARG 93.A N GLU 89.A O ARG 93.A H 2.770 1.912 SER 94.A N VAL 90.A O SER 94.A H 2.983 2.216 TYR 95.A N LYS 92.A O TYR 95.A H 3.367 2.603 GLY 96.A N PHE 209.A O GLY 96.A H 2.586 1.750 LYS 97.A N SER 94.A O LYS 97.A H 2.896 2.048 PHE 99.A N ALA 207.A O PHE 99.A H 2.896 2.088 LEU 101.A N VAL 205.A O LEU 101.A H 2.808 1.969 ILE 103.A N MET 203.A O ILE 103.A H 2.725 1.873 SER 104.A N GLN 116.A O SER 104.A H 3.067 2.287 LEU 106.A N LEU 197.A O LEU 106.A H 2.990 2.221 PHE 107.A N GLY 114.A O PHE 107.A H 2.922 2.093 VAL 108.A N TRP 195.A O VAL 108.A H 2.894 2.084 THR 109.A N THR 112.A O THR 109.A H 2.919 2.103 THR 109.A OG1 ASP 164.A OD2 THR 109.A HG1 2.674 1.984 LYS 111.A N THR 109.A OG1 LYS 111.A H 2.912 2.078 THR 112.A N THR 109.A OG1 THR 112.A H 3.110 2.274 THR 112.A OG1 ASP 164.A OD2 THR 112.A HG1 2.829 2.095 ALA 113.A N GLY 151.A O ALA 113.A H 2.944 2.096 GLY 114.A N PHE 107.A O GLY 114.A H 2.990 2.166 ALA 115.A N VAL 148.A O ALA 115.A H 2.840 2.050 GLN 116.A N ALA 105.A O GLN 116.A H 2.809 2.012 VAL 117.A N ALA 146.A O VAL 117.A H 3.064 2.217 VAL 118.A N SER 102.A O VAL 118.A H 2.823 1.983 THR 120.A N GLU 123.A OE1 THR 120.A H 3.160 2.330 GLU 123.A N THR 120.A OG1 GLU 123.A H 2.962 2.130 LEU 124.A N THR 120.A O LEU 124.A H 2.780 1.984 GLN 125.A N GLN 122.A O GLN 125.A H 3.229 2.485 LEU 126.A N GLU 123.A O LEU 126.A H 2.911 2.128 TRP 127.A N LEU 124.A O TRP 127.A H 3.064 2.217 ASP 132.A N ASP 132.A OD1 ASP 132.A H 2.664 1.998 SER 137.A N PRO 134.A O SER 137.A H 2.957 2.119 GLU 138.A N SER 135.A O GLU 138.A H 2.984 2.147 LEU 140.A N SER 137.A O LEU 140.A H 3.309 2.470 SER 144.A N PRO 141.A O SER 144.A H 3.199 2.476 ALA 146.A N GLY 143.A O ALA 146.A H 3.016 2.166 VAL 148.A N ALA 115.A O VAL 148.A H 2.891 2.109 THR 149.A OG1 PRO 158.A O THR 149.A HG1 3.492 2.909 LEU 150.A N ALA 113.A O LEU 150.A H 2.804 1.971 GLY 151.A N ALA 113.A O GLY 151.A H 3.100 2.346 CYS 152.A N LYS 61.A O CYS 152.A H 2.849 2.178 ALA 153.A N LYS 111.A O ALA 153.A H 2.810 1.964 ASP 155.A N ASP 155.A OD1 ASP 155.A H 2.576 1.922 VAL 156.A N ALA 153.A O VAL 156.A H 2.989 2.164 GLN 157.A NE2 ASP 155.A O GLN 157.A HE22 3.437 2.711 GLN 160.A N GLN 157.A O GLN 160.A H 2.705 1.847 GLN 160.A NE2 ASP 164.A OD1 GLN 160.A HE21 2.906 2.052 THR 161.A N PRO 158.A O THR 161.A H 3.138 2.297 THR 161.A OG1 THR 149.A OG1 THR 161.A HG1 2.900 2.258 ASP 164.A N GLN 160.A O ASP 164.A H 2.738 1.924 LEU 165.A N THR 161.A O LEU 165.A H 2.939 2.122 LEU 166.A N GLY 162.A O LEU 166.A H 3.000 2.188 ASP 167.A N LEU 163.A O ASP 167.A H 3.165 2.361 ILE 168.A N ASP 164.A O ILE 168.A H 2.953 2.118 LEU 169.A N LEU 165.A O LEU 169.A H 2.849 2.051 GLN 170.A N LEU 166.A O GLN 170.A H 2.925 2.100 GLN 170.A NE2 ALA 136.A O GLN 170.A HE21 2.567 1.749 GLN 170.A NE2 GLU 138.A O GLN 170.A HE22 2.853 2.095 GLN 171.A N ASP 167.A O GLN 171.A H 3.061 2.252 GLN 171.A NE2 LEU 190.A O GLN 171.A HE21 3.344 2.810 VAL 172.A N ILE 168.A O VAL 172.A H 3.098 2.388 LYS 173.A N GLN 170.A O LYS 173.A H 3.266 2.441 VAL 179.A N LEU 187.A O VAL 179.A H 2.682 1.907 LEU 182.A N GLY 185.A O LEU 182.A H 2.807 1.970 GLY 185.A N LEU 182.A O GLY 185.A H 3.058 2.282 LEU 187.A N GLY 180.A O LEU 187.A H 2.834 1.985 TYR 188.A N MET 196.A O TYR 188.A H 2.841 1.989 LEU 190.A N ARG 194.A O LEU 190.A H 2.985 2.150 ARG 194.A N GLY 191.A O ARG 194.A H 2.989 2.198 ARG 194.A NE GLY 191.A O ARG 194.A HE 2.825 2.059 ARG 194.A NH1 ASP 167.A OD2 ARG 194.A HH11 2.735 1.946 ARG 194.A NH2 LEU 190.A O ARG 194.A HH21 2.695 1.915 TRP 195.A N VAL 108.A O TRP 195.A H 2.762 1.961 MET 196.A N TYR 188.A O MET 196.A H 3.045 2.214 LEU 197.A N LEU 106.A O LEU 197.A H 2.774 1.928 SER 198.A N LYS 186.A O SER 198.A H 2.930 2.117 LEU 199.A N SER 104.A O LEU 199.A H 3.124 2.302 THR 200.A N ARG 184.A O THR 200.A H 2.928 2.089 MET 203.A N ILE 103.A O MET 203.A H 2.994 2.241 VAL 205.A N LEU 101.A O VAL 205.A H 2.958 2.117 ALA 207.A N PHE 99.A O ALA 207.A H 2.986 2.201 ILE 208.A N PHE 10.A O ILE 208.A H 2.821 2.033 PHE 209.A N LYS 97.A O PHE 209.A H 2.966 2.150 THR 210.A N GLY 8.A O THR 210.A H 2.984 2.169 TYR 212.A N TYR 6.A O TYR 212.A H 2.943 2.088 GLY 214.A N TYR 76.A OH GLY 214.A H 2.917 2.147