Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yph_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N TYR 210.A O LEU 5.A H 2.726 2.001 PHE 7.A N LYS 68.A O PHE 7.A H 2.825 2.018 GLY 8.A N THR 208.A O GLY 8.A H 3.123 2.338 TRP 9.A N CYS 65.A O TRP 9.A H 2.856 2.043 PHE 10.A N ILE 206.A O PHE 10.A H 2.868 2.017 LEU 11.A N LEU 63.A O LEU 11.A H 3.001 2.193 THR 12.A N LYS 204.A O THR 12.A H 3.200 2.399 LYS 13.A NZ GLU 17.A OE2 LYS 13.A HZ1 2.687 1.936 SER 15.A N THR 12.A OG1 SER 15.A H 3.292 2.433 SER 16.A N THR 12.A O SER 16.A H.B 2.840 1.987 GLU 17.A N LYS 13.A O GLU 17.A H 3.176 2.330 THR 18.A N LYS 14.A O THR 18.A H 3.155 2.370 THR 18.A OG1 LYS 14.A O THR 18.A HG1 3.089 2.303 LEU 19.A N SER 15.A O LEU 19.A H 2.903 2.072 ARG 20.A N SER 16.A O ARG 20.A H 2.827 1.969 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 2.905 2.080 ALA 22.A N THR 18.A O ALA 22.A H 3.016 2.215 GLY 23.A N LEU 19.A O GLY 23.A H 2.838 2.022 GLN 24.A N ARG 20.A O GLN 24.A H 2.987 2.163 GLN 24.A NE2 GLU 28.A OE2 GLN 24.A HE21 3.255 2.433 VAL 25.A N LYS 21.A O VAL 25.A H 3.072 2.220 PHE 26.A N ALA 22.A O PHE 26.A H 3.053 2.272 LEU 27.A N GLY 23.A O LEU 27.A H 3.061 2.274 GLU 28.A N GLN 24.A O GLU 28.A H 3.042 2.255 GLU 29.A N VAL 25.A O GLU 29.A H 2.917 2.080 LEU 30.A N PHE 26.A O LEU 30.A H 2.799 1.958 GLY 31.A N LEU 27.A O GLY 31.A H 2.987 2.183 ASN 32.A N GLU 28.A O ASN 32.A H 3.160 2.489 ASN 32.A N GLU 29.A O ASN 32.A H 3.237 2.572 HIS 33.A N GLU 29.A O HIS 33.A H 2.909 2.251 HIS 33.A N LEU 30.A O HIS 33.A H 3.288 2.620 PHE 36.A N HIS 33.A O PHE 36.A H 3.268 2.570 LYS 37.A N HIS 33.A O LYS 37.A H 3.372 2.545 LYS 37.A NZ ASN 32.A O LYS 37.A HZ1 3.447 2.891 LYS 38.A N LYS 34.A O LYS 38.A H 3.026 2.313 GLU 39.A N PHE 36.A O GLU 39.A H 3.008 2.197 LEU 40.A N LYS 37.A O LEU 40.A H 3.418 2.565 HIS 42.A N GLU 39.A O HIS 42.A H 2.865 2.070 PHE 43.A N LEU 40.A O PHE 43.A H 3.151 2.343 ILE 44.A N LEU 40.A O ILE 44.A H 3.257 2.416 VAL 52.A N GLU 50.A OE1 VAL 52.A H 3.329 2.490 SER 53.A N GLU 50.A O SER 53.A H.B 3.055 2.353 SER 53.A OG.B GLU 50.A O SER 53.A HG.B 2.673 2.003 TYR 54.A N GLU 50.A O TYR 54.A H 3.077 2.312 PHE 55.A N LEU 51.A O PHE 55.A H 2.868 2.021 LYS 57.A NZ ALA 150.A O LYS 57.A HZ1 3.023 2.321 LYS 57.A NZ VAL 152.A O LYS 57.A HZ2 2.868 2.034 ARG 58.A NH1 PHE 55.A O ARG 58.A HH11 3.501 2.900 LEU 63.A N SER 16.A OG.A LEU 63.A H 3.016 2.196 LEU 63.A N SER 16.A OG.B LEU 63.A H 2.928 2.101 CYS 65.A N TRP 9.A O CYS 65.A H 2.729 1.911 THR 67.A N PHE 7.A O THR 67.A H 2.913 2.060 LYS 68.A NZ ALA 76.A O LYS 68.A HZ2 2.961 2.098 CYS 70.A N LEU 5.A O CYS 70.A H 2.910 2.114 ASP 71.A N LEU 5.A O ASP 71.A H 2.797 2.007 TYR 72.A N PRO 4.A O TYR 72.A H 2.986 2.208 GLY 73.A N CYS 70.A O GLY 73.A H 2.811 2.072 LYS 74.A N ASP 71.A O LYS 74.A H 3.188 2.338 ALA 75.A N CYS 70.A O ALA 75.A H 2.970 2.139 ALA 78.A N ALA 75.A O ALA 78.A H 3.087 2.306 GLU 80.A N GLU 80.A OE1.A GLU 80.A H.A 2.546 1.845 TYR 81.A N GLY 77.A O TYR 81.A H 3.216 2.440 ALA 82.A N ALA 78.A O ALA 82.A H 3.241 2.429 GLN 84.A N TYR 81.A O GLN 84.A H 3.240 2.393 VAL 87.A N GLN 84.A O VAL 87.A H 3.180 2.520 LYS 88.A N GLN 84.A O LYS 88.A H 3.197 2.370 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ2 3.141 2.397 ARG 89.A N GLU 85.A O ARG 89.A H 2.776 1.943 SER 90.A N VAL 86.A O SER 90.A H 3.025 2.296 GLY 92.A N PHE 207.A O GLY 92.A H 2.651 1.817 LYS 93.A N SER 90.A O LYS 93.A H 3.000 2.213 LYS 93.A NZ ARG 89.A O LYS 93.A HZ1 3.347 2.808 LYS 93.A NZ TYR 91.A O LYS 93.A HZ1 3.206 2.624 PHE 95.A N ALA 205.A O PHE 95.A H 2.867 2.069 LEU 97.A N VAL 203.A O LEU 97.A H 2.870 2.038 ILE 99.A N MET 201.A O ILE 99.A H 2.757 1.907 SER 100.A N GLN 112.A O SER 100.A H 2.967 2.184 LEU 102.A N LEU 195.A O LEU 102.A H 3.038 2.247 PHE 103.A N GLY 110.A O PHE 103.A H 2.996 2.163 VAL 104.A N TRP 193.A O VAL 104.A H 2.877 2.068 THR 105.A N THR 108.A O THR 105.A H 2.866 2.075 THR 105.A OG1 ASP 160.A OD2 THR 105.A HG1 2.587 1.865 LYS 107.A N THR 105.A OG1 LYS 107.A H 3.060 2.267 THR 108.A N THR 105.A OG1 THR 108.A H 3.079 2.228 THR 108.A OG1 ASP 160.A OD2 THR 108.A HG1 3.008 2.229 ALA 109.A N GLY 147.A O ALA 109.A H 2.847 2.024 GLY 110.A N PHE 103.A O GLY 110.A H 3.142 2.338 ALA 111.A N VAL 144.A O ALA 111.A H 2.851 2.096 GLN 112.A N ALA 101.A O GLN 112.A H 2.720 1.904 VAL 113.A N ALA 142.A O VAL 113.A H 3.168 2.319 VAL 114.A N SER 98.A O VAL 114.A H 2.853 2.008 THR 116.A N GLU 119.A OE1 THR 116.A H 3.237 2.422 GLN 118.A NE2 THR 116.A OG1 GLN 118.A HE21 3.366 2.629 LEU 120.A N THR 116.A O LEU 120.A H 2.844 2.088 LEU 122.A N GLU 119.A O LEU 122.A H 3.027 2.230 TRP 123.A N LEU 120.A O TRP 123.A H 2.922 2.087 ASP 128.A N ASP 126.A OD2 ASP 128.A H 2.882 2.235 LYS 129.A N LEU 127.A O LYS 129.A H 3.045 2.433 SER 140.A N PRO 137.A O SER 140.A H 3.213 2.566 ALA 142.A N GLY 139.A O ALA 142.A H 3.165 2.351 HIS 143.A ND1 ARG 141.A O HIS 143.A HD1 2.787 1.992 VAL 144.A N ALA 111.A O VAL 144.A H 2.956 2.146 LEU 146.A N ALA 109.A O LEU 146.A H 2.786 1.973 GLY 147.A N ALA 109.A O GLY 147.A H 2.931 2.204 CYS 148.A N LYS 57.A O CYS 148.A H.A 3.010 2.305 CYS 148.A SG.B VAL 152.A O CYS 148.A HG.B 3.489 2.766 ALA 149.A N LYS 107.A O ALA 149.A H 2.820 2.014 VAL 152.A N ALA 149.A O VAL 152.A H 3.188 2.403 GLN 156.A N GLN 153.A O GLN 156.A H 2.900 2.057 GLN 156.A NE2 ASP 160.A OD1 GLN 156.A HE21 2.808 1.950 THR 157.A N PRO 154.A O THR 157.A H 3.058 2.225 THR 157.A OG1 PRO 154.A O THR 157.A HG1 3.242 2.669 ASP 160.A N GLN 156.A O ASP 160.A H 2.831 2.003 LEU 161.A N THR 157.A O LEU 161.A H 3.046 2.244 LEU 162.A N GLY 158.A O LEU 162.A H 3.084 2.247 ASP 163.A N LEU 159.A O ASP 163.A H 3.096 2.283 ILE 164.A N ASP 160.A O ILE 164.A H 3.046 2.232 LEU 165.A N LEU 161.A O LEU 165.A H 2.830 2.008 GLN 166.A N LEU 162.A O GLN 166.A H 2.724 1.922 GLN 166.A NE2 ALA 132.A O GLN 166.A HE21 2.751 1.932 GLN 166.A NE2 GLU 134.A O GLN 166.A HE22 3.121 2.304 GLN 167.A N ASP 163.A O GLN 167.A H 3.170 2.540 GLN 167.A N ILE 164.A O GLN 167.A H 3.150 2.446 VAL 168.A N ILE 164.A O VAL 168.A H 3.114 2.405 VAL 168.A N LEU 165.A O VAL 168.A H 3.130 2.542 LYS 169.A N LEU 165.A O LYS 169.A H 3.125 2.315 GLY 171.A N VAL 168.A O GLY 171.A H 3.076 2.281 SER 172.A N GLN 167.A O SER 172.A H 3.130 2.275 GLN 173.A N GLN 173.A OE1 GLN 173.A H 2.708 1.891 VAL 177.A N LEU 185.A O VAL 177.A H 3.004 2.274 LEU 180.A N GLY 183.A O LEU 180.A H 2.737 2.064 GLY 183.A N LEU 180.A O GLY 183.A H 3.093 2.358 LEU 185.A N GLY 178.A O LEU 185.A H 3.158 2.312 TYR 186.A N MET 194.A O TYR 186.A H 2.918 2.141 LEU 188.A N ARG 192.A O LEU 188.A H 3.145 2.304 ARG 192.A N GLY 189.A O ARG 192.A H 2.961 2.130 ARG 192.A NE GLY 189.A O ARG 192.A HE 2.927 2.234 ARG 192.A NH1 ASP 163.A OD2 ARG 192.A HH11 2.547 1.867 ARG 192.A NH2 LEU 188.A O ARG 192.A HH21 2.915 2.088 TRP 193.A N VAL 104.A O TRP 193.A H 2.772 1.996 MET 194.A N TYR 186.A O MET 194.A H 3.083 2.273 LEU 195.A N LEU 102.A O LEU 195.A H 2.715 1.899 SER 196.A N LYS 184.A O SER 196.A H 3.067 2.316 LEU 197.A N SER 100.A O LEU 197.A H 3.298 2.480 THR 198.A N ARG 182.A O THR 198.A H 2.799 1.963 MET 201.A N ILE 99.A O MET 201.A H 3.011 2.193 VAL 203.A N LEU 97.A O VAL 203.A H 3.005 2.174 LYS 204.A N SER 15.A OG LYS 204.A H 2.925 2.112 ALA 205.A N PHE 95.A O ALA 205.A H 2.964 2.164 ILE 206.A N PHE 10.A O ILE 206.A H 2.908 2.092 PHE 207.A N LYS 93.A O PHE 207.A H 3.008 2.187 THR 208.A N GLY 8.A O THR 208.A H 3.075 2.247 TYR 210.A N TYR 6.A O TYR 210.A H 3.104 2.257