Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yq9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 80.A OE2 LYS 1.A HZ1 3.019 2.183 LEU 6.A N TYR 211.A O LEU 6.A H 2.763 2.054 TYR 7.A N TYR 211.A O TYR 7.A H 3.349 2.561 PHE 8.A N LYS 69.A O PHE 8.A H 3.027 2.200 GLY 9.A N THR 209.A O GLY 9.A H 2.936 2.107 TRP 10.A N CYS 66.A O TRP 10.A H 2.743 1.926 PHE 11.A N ILE 207.A O PHE 11.A H 2.848 2.002 LEU 12.A N LEU 64.A O LEU 12.A H 3.015 2.189 THR 13.A N LYS 205.A O THR 13.A H 3.011 2.218 SER 16.A N THR 13.A OG1 SER 16.A H 2.973 2.119 SER 17.A N THR 13.A O SER 17.A H 2.788 1.935 GLU 18.A N LYS 14.A O GLU 18.A H 2.959 2.123 THR 19.A N LYS 15.A O THR 19.A H 3.043 2.260 THR 19.A OG1 LYS 15.A O THR 19.A HG1 2.978 2.203 LEU 20.A N SER 16.A O LEU 20.A H 2.959 2.116 ARG 21.A N SER 17.A O ARG 21.A H 2.767 1.916 LYS 22.A N GLU 18.A O LYS 22.A H 3.006 2.185 ALA 23.A N THR 19.A O ALA 23.A H 3.121 2.278 GLY 24.A N LEU 20.A O GLY 24.A H 2.882 2.044 GLN 25.A N ARG 21.A O GLN 25.A H 2.975 2.193 VAL 26.A N LYS 22.A O VAL 26.A H 2.869 2.015 PHE 27.A N ALA 23.A O PHE 27.A H 2.959 2.117 LEU 28.A N GLY 24.A O LEU 28.A H 2.926 2.123 GLU 29.A N GLN 25.A O GLU 29.A H 2.909 2.121 GLU 30.A N VAL 26.A O GLU 30.A H 2.806 1.973 LEU 31.A N PHE 27.A O LEU 31.A H 2.824 1.986 GLY 32.A N LEU 28.A O GLY 32.A H 3.138 2.285 ASN 33.A N GLU 30.A O ASN 33.A H 3.198 2.481 ASN 33.A ND2 GLU 29.A O ASN 33.A HD21 2.920 2.139 HIS 34.A N LEU 31.A O HIS 34.A H 2.952 2.110 LYS 38.A N HIS 34.A O LYS 38.A H 2.952 2.110 LYS 39.A N LYS 35.A O LYS 39.A H 2.917 2.078 GLU 40.A N PHE 37.A O GLU 40.A H 2.943 2.154 LEU 41.A N LYS 38.A O LEU 41.A H 3.149 2.328 HIS 43.A N GLU 40.A O HIS 43.A H 2.827 1.992 PHE 44.A N LEU 41.A O PHE 44.A H 2.774 1.923 ILE 45.A N LEU 41.A O ILE 45.A H 3.144 2.309 LYS 49.A NZ LEU 50.A O LYS 49.A HZ1 3.500 2.858 SER 54.A N GLU 51.A O SER 54.A H 3.052 2.456 TYR 55.A N GLU 51.A O TYR 55.A H 3.018 2.208 PHE 56.A N LEU 52.A O PHE 56.A H 2.919 2.101 LYS 58.A N CYS 149.A O.A LYS 58.A H 3.288 2.463 LYS 58.A N CYS 149.A O.B LYS 58.A H 3.343 2.504 LYS 58.A NZ ALA 151.A O LYS 58.A HZ1 2.706 1.892 LYS 58.A NZ VAL 153.A O LYS 58.A HZ2 3.004 2.140 ARG 59.A NE PHE 56.A O ARG 59.A HE 3.181 2.411 ARG 59.A NH2 VAL 53.A O ARG 59.A HH21 2.865 2.169 LEU 64.A N SER 17.A OG LEU 64.A H 2.969 2.124 CYS 66.A N TRP 10.A O CYS 66.A H 2.827 2.018 THR 68.A N PHE 8.A O THR 68.A H 2.913 2.087 THR 68.A OG1 TYR 82.A OH THR 68.A HG1 2.947 2.339 LYS 69.A NZ ALA 77.A O LYS 69.A HZ2 2.693 1.832 LYS 69.A NZ ASP 127.A OD2 LYS 69.A HZ1 2.549 1.659 CYS 71.A N LEU 6.A O CYS 71.A H 2.822 2.003 ASP 72.A N LEU 6.A O ASP 72.A H 2.920 2.126 TYR 73.A N PRO 5.A O TYR 73.A H 2.900 2.142 GLY 74.A N CYS 71.A O GLY 74.A H 2.986 2.346 LYS 75.A N ASP 72.A O LYS 75.A H 2.937 2.083 ALA 76.A N CYS 71.A O ALA 76.A H 3.039 2.187 ALA 79.A N ALA 76.A O ALA 79.A H 3.155 2.336 GLU 81.A N GLU 81.A OE1 GLU 81.A H 2.752 1.951 TYR 82.A N GLY 78.A O TYR 82.A H 2.891 2.147 ALA 83.A N ALA 79.A O ALA 83.A H 2.776 1.956 GLN 84.A N GLU 80.A O GLN 84.A H 3.014 2.264 GLN 84.A NE2 GLU 81.A O GLN 84.A HE21 2.590 1.904 GLN 85.A N TYR 82.A O GLN 85.A H 3.293 2.452 GLN 85.A NE2 TYR 82.A O GLN 85.A HE21 3.349 2.499 VAL 88.A N GLN 85.A O VAL 88.A H 3.251 2.626 LYS 89.A N GLN 85.A O LYS 89.A H 3.164 2.325 ARG 90.A N GLU 86.A O ARG 90.A H 2.645 1.789 SER 91.A N VAL 87.A O SER 91.A H 2.980 2.320 TYR 92.A N LYS 89.A O TYR 92.A H 3.373 2.551 GLY 93.A N PHE 208.A O GLY 93.A H 2.641 1.798 LYS 94.A N SER 91.A O LYS 94.A H 2.899 2.048 PHE 96.A N ALA 206.A O PHE 96.A H 2.859 2.023 LEU 98.A N VAL 204.A O LEU 98.A H 2.847 2.020 ILE 100.A N MET 202.A O ILE 100.A H 2.828 1.986 SER 101.A N GLN 113.A O SER 101.A H 3.070 2.308 LEU 103.A N LEU 196.A O LEU 103.A H 2.902 2.132 PHE 104.A N GLY 111.A O PHE 104.A H 2.906 2.077 VAL 105.A N TRP 194.A O VAL 105.A H 2.958 2.150 THR 106.A N THR 109.A O THR 106.A H 2.899 2.118 THR 106.A OG1 ASP 161.A OD2 THR 106.A HG1 2.784 2.092 LYS 108.A N THR 106.A OG1 LYS 108.A H 2.925 2.087 THR 109.A N THR 106.A OG1 THR 109.A H 3.121 2.303 THR 109.A OG1 ASP 161.A OD2 THR 109.A HG1 2.762 2.046 ALA 110.A N GLY 148.A O ALA 110.A H 2.870 2.035 GLY 111.A N PHE 104.A O GLY 111.A H 3.005 2.188 ALA 112.A N VAL 145.A O ALA 112.A H 2.810 2.001 GLN 113.A N ALA 102.A O GLN 113.A H 2.826 1.996 VAL 114.A N ALA 143.A O VAL 114.A H 3.115 2.263 VAL 115.A N SER 99.A O VAL 115.A H 2.826 1.982 THR 117.A N GLU 120.A OE1 THR 117.A H 3.120 2.283 GLU 120.A N THR 117.A OG1 GLU 120.A H 2.935 2.102 LEU 121.A N THR 117.A O LEU 121.A H 2.865 2.151 LEU 121.A N ASP 118.A O LEU 121.A H 3.158 2.560 GLN 122.A N GLN 119.A O GLN 122.A H 3.291 2.547 LEU 123.A N GLU 120.A O LEU 123.A H 3.072 2.254 TRP 124.A N LEU 121.A O TRP 124.A H 3.082 2.263 LEU 137.A N SER 134.A O LEU 137.A H 3.077 2.285 SER 141.A N PRO 138.A O SER 141.A H 3.210 2.444 ALA 143.A N GLY 140.A O ALA 143.A H 2.987 2.148 HIS 144.A ND1 ARG 142.A O HIS 144.A HD1 2.764 1.940 VAL 145.A N ALA 112.A O VAL 145.A H 2.862 2.056 LEU 147.A N ALA 110.A O LEU 147.A H 2.813 1.969 GLY 148.A N ALA 110.A O GLY 148.A H 3.162 2.390 CYS 149.A N.A LYS 58.A O CYS 149.A H.A 2.843 2.086 CYS 149.A N.B LYS 58.A O CYS 149.A H.B 2.792 2.053 CYS 149.A SG.A ALA 150.A O CYS 149.A HG.A 3.807 2.716 ALA 150.A N LYS 108.A O ALA 150.A H 2.918 2.109 VAL 153.A N ALA 150.A O VAL 153.A H 3.135 2.313 GLN 157.A N GLN 154.A O GLN 157.A H 3.404 2.604 GLN 157.A NE2 ASP 161.A OD1 GLN 157.A HE21 2.977 2.147 LEU 160.A N ALA 156.A O LEU 160.A H 3.333 2.493 ASP 161.A N GLN 157.A O ASP 161.A H 2.859 2.116 LEU 162.A N THR 158.A O LEU 162.A H 2.810 1.991 LEU 163.A N GLY 159.A O LEU 163.A H 2.949 2.102 ASP 164.A N LEU 160.A O ASP 164.A H 3.037 2.244 ILE 165.A N ASP 161.A O ILE 165.A H 2.983 2.148 LEU 166.A N LEU 162.A O LEU 166.A H 2.776 1.946 GLN 167.A N LEU 163.A O GLN 167.A H 2.685 1.867 GLN 167.A NE2 ALA 133.A O GLN 167.A HE21 2.921 2.070 GLN 167.A NE2 GLU 135.A O GLN 167.A HE22 2.750 2.079 GLN 168.A N ASP 164.A O GLN 168.A H 3.056 2.377 GLN 168.A N ILE 165.A O GLN 168.A H 3.134 2.458 VAL 169.A N ILE 165.A O VAL 169.A H 3.003 2.164 LYS 170.A N LEU 166.A O LYS 170.A H 2.747 1.912 GLY 171.A N GLN 168.A O GLY 171.A H 2.715 2.077 GLY 172.A N VAL 169.A O GLY 172.A H 3.107 2.332 SER 173.A N GLN 168.A O SER 173.A H 3.233 2.375 VAL 178.A N LEU 186.A O VAL 178.A H 2.807 2.019 LEU 181.A N GLY 184.A O LEU 181.A H 2.915 2.205 GLY 184.A N LEU 181.A O GLY 184.A H 3.172 2.405 LEU 186.A N GLY 179.A O LEU 186.A H 2.931 2.087 TYR 187.A N MET 195.A O TYR 187.A H 2.835 2.020 LEU 189.A N ARG 193.A O LEU 189.A H 2.904 2.066 ARG 193.A N GLY 190.A O ARG 193.A H 2.832 2.031 ARG 193.A NE GLY 190.A O ARG 193.A HE 2.985 2.373 ARG 193.A NH1 ASP 164.A OD2 ARG 193.A HH11 2.663 1.904 ARG 193.A NH2 LEU 189.A O ARG 193.A HH21 2.824 2.003 TRP 194.A N VAL 105.A O TRP 194.A H 2.838 2.029 MET 195.A N TYR 187.A O MET 195.A H 2.976 2.169 LEU 196.A N LEU 103.A O LEU 196.A H 2.762 1.915 SER 197.A N LYS 185.A O SER 197.A H 3.050 2.243 LEU 198.A N SER 101.A O LEU 198.A H 3.223 2.434 THR 199.A N ARG 183.A O THR 199.A H 2.805 1.989 MET 202.A N ILE 100.A O MET 202.A H 2.956 2.188 VAL 204.A N LEU 98.A O VAL 204.A H 2.933 2.101 ALA 206.A N PHE 96.A O ALA 206.A H 2.877 2.087 ILE 207.A N PHE 11.A O ILE 207.A H 2.777 1.964 PHE 208.A N LYS 94.A O PHE 208.A H 2.854 2.038 THR 209.A N GLY 9.A O THR 209.A H 2.932 2.110 TYR 211.A N TYR 7.A O TYR 211.A H 2.761 1.912