Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3dyb_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 1.A N TYR 25.A O ALA 1.A H1 2.730 1.813 GLN 3.A N TYR 23.A O GLN 3.A H 2.777 1.960 GLN 3.A NE2 THR 81.A O GLN 3.A HE21 2.833 1.999 ALA 6.A N SER 21.A O ALA 6.A H 2.876 2.132 TRP 8.A NE1 THR 206.A O TRP 8.A HE1 2.980 2.275 TRP 8.A NE1 ASP 207.A O TRP 8.A HE1 3.107 2.444 LEU 10.A N PRO 7.A O LEU 10.A H 2.991 2.366 ALA 11.A N PRO 7.A O ALA 11.A H 3.204 2.369 ARG 12.A N TRP 8.A O ARG 12.A H 2.787 2.019 ARG 12.A NE ASP 187.A OD1 ARG 12.A HE 2.836 1.878 ARG 12.A NE ASP 187.A OD2 ARG 12.A HE 3.432 2.737 ARG 12.A NH1 ARG 12.A O ARG 12.A HH12 3.156 2.465 ARG 12.A NH1 SER 15.A O ARG 12.A HH11 2.845 2.227 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 12.A HH21 3.530 2.904 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 12.A HH21 2.760 1.936 ILE 13.A N GLY 9.A O ILE 13.A H 3.059 2.284 SER 14.A N ALA 11.A O SER 14.A H 3.128 2.360 SER 15.A N ARG 12.A O SER 15.A H 3.121 2.289 SER 15.A OG.A SER 17.A O SER 15.A HG.A 2.637 1.853 SER 15.A OG.B ALA 11.A O SER 15.A HG.B 2.866 2.320 TYR 23.A N GLN 3.A O TYR 23.A H 2.949 2.131 TYR 23.A OH VAL 84.A O TYR 23.A HH 2.736 1.950 TYR 24.A N SER 14.A OG TYR 24.A H 2.994 2.149 TYR 25.A N ALA 1.A O TYR 25.A H 3.027 2.222 ASP 26.A N TYR 236.A OH ASP 26.A H 2.880 2.026 SER 28.A N ASP 26.A OD2 SER 28.A H 2.927 2.084 ALA 29.A N ASP 26.A O ALA 29.A H 3.057 2.352 GLN 31.A N SER 28.A O GLN 31.A H 2.847 2.000 SER 33.A N GLY 30.A O SER 33.A H 3.091 2.254 SER 33.A OG GLY 30.A O SER 33.A HG 2.626 1.806 CYS 34.A N GLY 126.A O CYS 34.A H 3.036 2.280 CYS 34.A SG ASN 122.A O no hydrogen 3.431 N/A VAL 35.A N GLN 89.A O VAL 35.A H 2.816 1.987 TYR 36.A N VAL 128.A O TYR 36.A H 2.894 2.057 TYR 36.A OH ASP 117.A OD2 TYR 36.A HH 2.654 1.834 VAL 37.A N PHE 91.A O VAL 37.A H 2.866 2.048 ILE 38.A N SER 130.A O ILE 38.A H 3.092 2.239 ASP 39.A N VAL 93.A O ASP 39.A H 2.918 2.110 THR 40.A N ASP 39.A OD1 THR 40.A H 2.668 1.948 THR 40.A OG1 ASP 65.A OD1 THR 40.A HG1 2.699 1.880 GLU 43.A N THR 71.A OG1 GLU 43.A H 2.829 2.013 HIS 46.A N GLU 43.A O HIS 46.A H 3.032 2.178 HIS 46.A NE2 SER 216.A O HIS 46.A HE2 2.855 2.000 GLU 48.A N HIS 46.A ND1 GLU 48.A H 3.039 2.181 PHE 49.A N HIS 46.A O PHE 49.A H 2.887 2.036 GLU 50.A N PRO 47.A O GLU 50.A H 3.146 2.451 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 2.810 1.963 ARG 52.A NE GLU 50.A OE1 ARG 52.A HE 3.238 2.462 ARG 52.A NH1 GLY 78.A O ARG 52.A HH11 2.910 2.156 ARG 52.A NH1 THR 88.A O ARG 52.A HH12 2.914 2.100 ARG 52.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 52.A HH21 2.967 2.165 ARG 52.A NH2 GLY 78.A O ARG 52.A HH22 2.924 2.167 GLN 54.A N LEU 90.A O GLN 54.A H 2.979 2.209 VAL 56.A N GLY 92.A O VAL 56.A H 2.991 2.133 THR 58.A OG1 SER 62.A O THR 58.A HG1 2.845 2.026 TYR 59.A N LYS 94.A O TYR 59.A H 3.220 2.458 TYR 60.A N THR 58.A OG1 TYR 60.A H 3.090 2.244 TYR 60.A OH VAL 95.A O TYR 60.A HH 2.603 1.793 ARG 64.A N SER 62.A OG ARG 64.A H 2.897 2.042 GLY 66.A N ASP 98.A OD1 GLY 66.A H 2.942 2.171 ASN 67.A N ASP 65.A OD1 ASN 67.A H 2.980 2.154 ASN 67.A ND2 ASP 98.A O ASN 67.A HD22 2.987 2.151 GLY 68.A N ASP 65.A OD1 GLY 68.A H 2.950 2.114 HIS 69.A N ASN 67.A OD1 HIS 69.A H 2.976 2.152 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD1 HIS 69.A HD1 2.805 1.965 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD2 HIS 69.A HD1 2.975 2.355 HIS 69.A NE2 SER 224.A OG no hydrogen 2.999 N/A GLY 70.A N THR 40.A OG1 GLY 70.A H 2.927 2.097 THR 71.A N ASP 65.A OD2 THR 71.A H 3.033 2.334 THR 71.A OG1 ASP 65.A OD2 THR 71.A HG1 2.656 1.866 HIS 72.A N GLY 68.A O HIS 72.A H 2.890 2.070 HIS 72.A NE2 ARG 218.A O HIS 72.A HE2 2.970 2.279 CYS 73.A N HIS 69.A O CYS 73.A H 2.898 2.053 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.917 2.059 GLY 75.A N THR 71.A O GLY 75.A H 2.912 2.168 THR 76.A N HIS 72.A O THR 76.A H 3.093 2.319 VAL 77.A N CYS 73.A O VAL 77.A H 3.059 2.263 GLY 78.A N ALA 74.A O GLY 78.A H 2.960 2.178 SER 79.A N GLY 75.A O SER 79.A H 2.969 2.142 SER 79.A OG GLY 75.A O SER 79.A HG 2.727 1.924 ARG 80.A N GLU 48.A O ARG 80.A H 2.900 2.099 ARG 80.A NE GLU 48.A OE2 ARG 80.A HE 3.014 2.073 THR 81.A N GLU 48.A OE1 THR 81.A H 2.756 1.904 THR 81.A OG1 GLU 48.A OE2 THR 81.A HG1 2.708 1.894 TYR 82.A N SER 79.A OG TYR 82.A H 2.908 2.167 GLY 83.A N SER 79.A O GLY 83.A H 2.997 2.363 VAL 84.A N THR 76.A O VAL 84.A H 2.918 2.111 ALA 85.A N VAL 77.A O ALA 85.A H 2.881 2.044 LYS 86.A NZ GLN 3.A OE1 LYS 86.A HZ2 2.747 1.967 LYS 86.A NZ ARG 80.A O LYS 86.A HZ1 2.774 1.846 LYS 86.A NZ GLY 83.A O LYS 86.A HZ3 2.904 2.001 LYS 87.A N ALA 29.A O LYS 87.A H 2.802 1.988 LYS 87.A NZ.B GLU 27.A O LYS 87.A HZ1.B 2.721 1.820 LYS 87.A NZ.B GLN 31.A OE1.B LYS 87.A HZ3.B 2.886 2.124 THR 88.A N ALA 85.A O THR 88.A H 3.257 2.399 THR 88.A OG1 SER 33.A OG THR 88.A HG1 2.817 2.002 GLN 89.A N SER 33.A O GLN 89.A H 3.193 2.335 GLN 89.A NE2.B LEU 90.A O GLN 89.A HE22.B 3.377 2.680 LEU 90.A N ARG 52.A O LEU 90.A H 2.856 2.007 PHE 91.A N VAL 35.A O PHE 91.A H 2.909 2.086 GLY 92.A N GLN 54.A O GLY 92.A H 2.775 1.987 VAL 93.A N VAL 37.A O VAL 93.A H 3.074 2.248 LYS 94.A N LYS 57.A O LYS 94.A H 2.885 2.045 LYS 94.A NZ THR 40.A O LYS 94.A HZ3 2.896 1.972 LYS 94.A NZ LEU 96.A O LYS 94.A HZ1 2.784 1.826 LYS 94.A NZ ASP 98.A OD1 LYS 94.A HZ2 2.788 1.927 VAL 95.A N ASP 39.A O VAL 95.A H 2.985 2.391 LEU 96.A N ASP 39.A O LEU 96.A H 3.147 2.364 ASP 97.A N SER 101.A O ASP 97.A H 2.783 1.955 ASN 99.A N ASP 97.A OD1 ASN 99.A H 2.796 2.071 GLY 100.A N ASP 97.A O GLY 100.A H 2.912 2.076 SER 101.A N ASP 97.A OD1 SER 101.A H 2.990 2.145 TYR 104.A OH GLY 136.A O TYR 104.A HH 2.659 1.936 THR 106.A N GLN 103.A O THR 106.A H 2.982 2.350 ILE 107.A N GLN 103.A O ILE 107.A H 3.130 2.305 ILE 108.A N TYR 104.A O ILE 108.A H 2.904 2.069 ALA 109.A N SER 105.A O ALA 109.A H 3.075 2.234 GLY 110.A N THR 106.A O GLY 110.A H 2.893 2.102 MET 111.A N ILE 107.A O MET 111.A H 3.050 2.268 ASP 112.A N ILE 108.A O ASP 112.A H 3.087 2.245 PHE 113.A N ALA 109.A O PHE 113.A H 2.743 1.934 VAL 114.A N GLY 110.A O VAL 114.A H 3.140 2.356 ALA 115.A N MET 111.A O ALA 115.A H 3.168 2.348 SER 116.A N ASP 112.A O SER 116.A H 3.226 2.452 SER 116.A N PHE 113.A O SER 116.A H 3.172 2.572 ASP 117.A N PHE 113.A O ASP 117.A H 2.704 1.848 LYS 118.A N VAL 114.A O LYS 118.A H 3.091 2.288 LYS 118.A NZ ALA 115.A O LYS 118.A HZ3 2.747 1.907 LYS 118.A NZ SER 151.A OG LYS 118.A HZ1 2.994 2.082 ASN 119.A N SER 116.A O ASN 119.A H 2.887 2.066 ASN 119.A ND2 SER 116.A O ASN 119.A HD22 3.281 2.733 ASN 120.A N ASP 117.A O ASN 120.A H 2.738 1.897 ASN 120.A ND2 ASP 117.A OD1 ASN 120.A HD22 3.213 2.363 ARG 121.A N LYS 118.A O ARG 121.A H 3.153 2.306 ARG 121.A NE ASP 117.A OD2 ARG 121.A HE 2.884 1.921 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD1 ARG 121.A HH21 2.925 2.179 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD2 ARG 121.A HH21 3.440 2.769 LYS 125.A N GLY 32.A O LYS 125.A H 2.897 2.047 GLY 126.A N CYS 123.A O GLY 126.A H 2.908 2.121 VAL 128.A N CYS 34.A O VAL 128.A H 2.865 2.059 ALA 129.A N MET 154.A O ALA 129.A H 2.871 2.045 SER 130.A N TYR 36.A O SER 130.A H 2.785 1.957 LEU 131.A N ALA 156.A O LEU 131.A H 2.841 2.009 SER 132.A OG SER 224.A O SER 132.A HG 2.724 1.908 GLY 135.A N SER 170.A O GLY 135.A H 2.971 2.184 SER 138.A N SER 170.A OG SER 138.A H 2.873 2.045 VAL 141.A N SER 138.A OG VAL 141.A H 3.035 2.183 ASN 142.A N SER 138.A O ASN 142.A H 3.038 2.202 ASN 142.A ND2 SER 173.A OG ASN 142.A HD21 2.954 2.100 SER 143.A N SER 139.A O SER 143.A H 2.835 2.036 ALA 144.A N SER 140.A O ALA 144.A H 3.009 2.209 ALA 145.A N VAL 141.A O ALA 145.A H 3.052 2.245 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.883 2.086 ARG 147.A N SER 143.A O ARG 147.A H 2.786 1.974 ARG 147.A NE ASP 112.A OD1 ARG 147.A HE 2.923 1.972 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 147.A HH21 3.313 2.604 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD2 ARG 147.A HH21 2.832 2.050 LEU 148.A N ALA 144.A O LEU 148.A H 3.028 2.198 GLN 149.A N ALA 145.A O GLN 149.A H 3.028 2.175 GLN 149.A NE2 ALA 245.A O GLN 149.A HE21 3.108 2.359 SER 150.A N ALA 146.A O SER 150.A H 2.847 2.001 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.852 2.131 SER 151.A N LEU 148.A O SER 151.A H 3.148 2.510 SER 151.A OG LEU 148.A O SER 151.A HG 2.722 1.909 GLY 152.A N GLN 149.A O GLY 152.A H 3.007 2.156 MET 154.A N VAL 127.A O MET 154.A H 2.992 2.158 VAL 155.A N GLN 149.A OE1 VAL 155.A H 2.935 2.075 ALA 156.A N ALA 129.A O ALA 156.A H 2.895 2.041 VAL 157.A N CYS 178.A O VAL 157.A H 2.836 2.000 ALA 158.A N LEU 131.A O ALA 158.A H 3.077 2.281 ALA 159.A N VAL 180.A O ALA 159.A H 2.900 2.126 GLY 160.A N THR 223.A OG1 GLY 160.A H 3.091 2.305 ASN 162.A N ASN 194.A OD1 ASN 162.A H 2.942 2.202 ASN 162.A ND2.B TYR 169.A OH ASN 162.A HD22.B 3.073 2.254 ASN 163.A N PHE 192.A O ASN 163.A H 2.940 2.129 ALA 164.A N ASN 194.A OD1 ALA 164.A H 2.887 2.073 ALA 166.A N TYR 195.A O ALA 166.A H 2.787 1.950 ARG 167.A N ASP 165.A OD1 ARG 167.A H 2.831 1.978 ASN 168.A N ASP 165.A O ASN 168.A H 3.332 2.484 TYR 169.A N ALA 166.A O TYR 169.A H 3.010 2.179 SER 170.A N GLY 135.A O SER 170.A H 2.848 2.042 SER 170.A OG ASN 142.A OD1 SER 170.A HG 2.665 1.904 SER 173.A N TYR 169.A O SER 173.A H 2.879 2.141 SER 173.A OG TYR 169.A O SER 173.A HG 2.663 1.955 GLU 174.A N PRO 171.A O GLU 174.A H 2.987 2.134 SER 176.A N GLU 174.A OE1 SER 176.A H 2.967 2.133 SER 176.A OG GLU 174.A OE1 SER 176.A HG 2.652 1.858 CYS 178.A N VAL 155.A O CYS 178.A H 2.877 2.026 THR 179.A N ASP 200.A OD2 THR 179.A H 2.826 1.983 THR 179.A OG1 ALA 172.A O THR 179.A HG1 2.592 1.797 VAL 180.A N VAL 157.A O VAL 180.A H 2.856 2.061 GLY 181.A N ILE 201.A O GLY 181.A H 2.909 2.095 ALA 182.A N SER 193.A OG ALA 182.A H 2.930 2.089 SER 183.A N GLY 203.A O SER 183.A H 2.865 2.079 ASP 184.A N ARG 188.A O ASP 184.A H 2.819 2.037 TYR 186.A N ASP 184.A OD1 TYR 186.A H 2.907 2.127 ASP 187.A N ASP 184.A O ASP 187.A H 2.941 2.132 ARG 188.A N ASP 184.A OD1 ARG 188.A H 2.977 2.133 ARG 188.A NE ASP 184.A OD2 ARG 188.A HE 2.763 1.862 ARG 188.A NH2 ASP 184.A OD2 ARG 188.A HH21 2.937 2.213 ARG 189.A N SER 262.A O ARG 189.A H 2.918 2.063 ARG 189.A NE ASN 263.A O ARG 189.A HE 2.748 1.792 ARG 189.A NH1 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH11 2.871 2.056 ARG 189.A NH1 SER 193.A O ARG 189.A HH12 2.798 2.155 ARG 189.A NH2 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH22 3.452 2.809 SER 190.A N ALA 182.A O SER 190.A H 2.856 2.006 SER 190.A OG THR 206.A OG1 SER 190.A HG 2.774 2.177 SER 193.A N SER 190.A O SER 193.A H 2.991 2.138 SER 193.A OG ASN 194.A O SER 193.A HG 2.905 2.086 ASN 194.A N GLY 160.A O ASN 194.A H 2.836 1.980 ASN 194.A ND2 ALA 159.A O ASN 194.A HD22 2.826 2.041 ASN 194.A ND2 ASN 162.A OD1.A ASN 194.A HD21 2.986 2.190 TYR 195.A N ALA 164.A O TYR 195.A H 2.946 2.162 GLY 196.A N THR 268.A OG1 GLY 196.A H 2.831 2.062 LEU 199.A N GLY 196.A O LEU 199.A H 3.094 2.289 ASP 200.A N THR 179.A O ASP 200.A H 2.859 2.002 PHE 202.A N LEU 271.A O PHE 202.A H 2.859 2.068 GLY 203.A N GLY 181.A O GLY 203.A H 2.872 2.047 GLY 205.A N SER 183.A O GLY 205.A H 2.833 1.986 THR 206.A N SER 183.A O THR 206.A H 3.234 2.480 ASP 207.A N SER 221.A OG ASP 207.A H 2.857 2.026 ILE 208.A N ILE 220.A O ILE 208.A H 2.932 2.076 SER 210.A N ARG 218.A O SER 210.A H 3.006 2.197 SER 210.A OG HIS 72.A O SER 210.A HG 2.773 1.953 THR 211.A OG1 THR 71.A O THR 211.A HG1 2.791 2.066 TRP 212.A N SER 216.A O TRP 212.A H 2.880 2.083 GLY 214.A N GLU 43.A OE1 GLY 214.A H 2.826 2.024 GLY 215.A N GLU 43.A OE2 GLY 215.A H 2.861 2.117 SER 216.A N TRP 212.A O SER 216.A H 3.229 2.424 SER 216.A OG.A ILE 213.A O SER 216.A HG.A 2.758 1.971 ARG 218.A N SER 210.A O ARG 218.A H 3.000 2.241 ILE 220.A N ILE 208.A O ILE 220.A H 3.218 2.443 GLY 222.A N GLY 205.A O GLY 222.A H 2.819 2.016 THR 223.A N ASN 161.A OD1 THR 223.A H 2.881 2.028 THR 223.A OG1 ASN 161.A OD1 THR 223.A HG1 2.779 1.977 MET 225.A N GLY 222.A O MET 225.A H 2.936 2.121 THR 227.A N THR 223.A O THR 227.A H 3.028 2.204 THR 227.A OG1 THR 223.A O THR 227.A HG1 2.770 1.951 HIS 229.A N ALA 226.A O HIS 229.A H 3.044 2.445 HIS 229.A ND1 MET 225.A O HIS 229.A HD1 2.827 2.036 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.269 2.464 ALA 231.A N THR 227.A O ALA 231.A H 2.911 2.083 GLY 232.A N PRO 228.A O GLY 232.A H 2.868 2.014 LEU 233.A N HIS 229.A O LEU 233.A H 2.883 2.097 ALA 234.A N VAL 230.A O ALA 234.A H 2.853 2.026 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.056 2.231 TYR 236.A N GLY 232.A O TYR 236.A H 2.877 2.038 LEU 237.A N LEU 233.A O LEU 237.A H 2.844 2.015 MET 238.A N ALA 234.A O MET 238.A H 2.762 1.929 THR 239.A N ALA 235.A O THR 239.A H 2.915 2.099 THR 239.A OG1 GLN 31.A O THR 239.A HG1 2.982 2.166 LEU 240.A N TYR 236.A O LEU 240.A H 3.223 2.482 GLY 241.A N MET 238.A O GLY 241.A H 2.944 2.160 LYS 242.A N LEU 237.A O LYS 242.A H 3.022 2.209 THR 244.A N SER 247.A OG.B THR 244.A H 3.350 2.540 THR 244.A OG1 SER 247.A OG.B THR 244.A HG1 2.890 2.233 SER 247.A N THR 244.A O SER 247.A H 3.087 2.334 SER 247.A OG.B THR 243.A OG1 SER 247.A HG.B 2.906 2.140 TYR 251.A N SER 247.A O TYR 251.A H 2.877 2.070 ILE 252.A N ALA 248.A O ILE 252.A H 2.848 2.017 ALA 253.A N CYS 249.A O ALA 253.A H 2.951 2.160 ASP 254.A N ARG 250.A O ASP 254.A H 2.810 1.977 THR 255.A N TYR 251.A O THR 255.A H 2.934 2.196 THR 255.A OG1 TYR 251.A O THR 255.A HG1 2.832 2.023 THR 255.A OG1 ILE 252.A O THR 255.A HG1 3.559 3.167 ALA 256.A N ALA 253.A O ALA 256.A H 3.353 2.522 ASN 257.A N LEU 272.A O ASN 257.A H 2.966 2.241 ASN 257.A ND2 SER 15.A O ASN 257.A HD21 2.907 2.194 LYS 258.A NZ ASP 254.A O LYS 258.A HZ2 2.765 1.863 LYS 258.A NZ ALA 256.A O LYS 258.A HZ1 2.721 1.808 GLY 259.A N ASN 270.A O GLY 259.A H 2.977 2.148 LEU 261.A N ASN 270.A OD1 LEU 261.A H 3.041 2.195 SER 262.A N ASP 187.A O SER 262.A H 2.851 2.058 THR 268.A N PRO 265.A O THR 268.A H 3.027 2.178 ASN 270.A ND2 LEU 261.A O ASN 270.A HD21 2.862 2.066 LEU 272.A N ASN 257.A O LEU 272.A H 2.892 2.080 ALA 273.A N PHE 202.A O ALA 273.A H 2.959 2.118 ASN 275.A N ILE 13.A O ASN 275.A H 2.784 2.092 ASN 275.A ND2 TYR 24.A O ASN 275.A HD21 2.887 2.060 ASN 276.A ND2.B THR 255.A O ASN 276.A HD21.B 2.787 1.988 ASN 276.A ND2.B TYR 274.A O ASN 276.A HD22.B 3.572 2.957 TYR 277.A N ASN 275.A OD1 TYR 277.A H 2.916 2.074 GLN 278.A NE2 ASN 276.A OD1.A GLN 278.A HE22 3.192 2.632