Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3g3k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A N ASN 1.A OD1 ARG 2.A H 2.868 2.160 ARG 2.A NH1 ASP 82.A OD2 ARG 2.A HH12 2.924 2.090 ARG 2.A NH2 ASP 82.A OD1 ARG 2.A HH22 2.997 2.148 LEU 4.A N THR 48.A O LEU 4.A H 2.830 2.078 ILE 5.A N ASP 82.A OD2 ILE 5.A H 2.844 2.002 VAL 6.A N GLU 50.A O VAL 6.A H 2.908 2.052 THR 7.A N LEU 83.A O THR 7.A H 2.881 2.113 THR 7.A OG1 GLU 75.A OE1.B THR 7.A HG1 2.680 2.121 THR 8.A N ARG 52.A O THR 8.A H 3.222 2.507 THR 8.A OG1 VAL 85.A O THR 8.A HG1 2.718 2.140 GLU 11.A N VAL 15.A O GLU 11.A H.A 2.905 2.083 TYR 14.A N GLU 11.A O TYR 14.A H.A 2.850 2.243 VAL 15.A N GLU 11.A O VAL 15.A H 2.961 2.130 LEU 16.A N GLU 31.A O LEU 16.A H 2.829 2.029 LYS 18.A N ARG 29.A O LYS 18.A H.A 2.893 2.091 LYS 18.A NZ.A ASP 28.A O LYS 18.A HZ2.A 3.097 2.274 LYS 18.A NZ.B ASP 28.A OD1 LYS 18.A HZ3.B 2.937 2.269 ASN 27.A ND2 TYR 49.A O ASN 27.A HD21 2.848 1.910 ASP 28.A N TYR 25.A O ASP 28.A H 3.209 2.520 ARG 29.A N GLY 26.A O ARG 29.A H 3.131 2.272 ARG 29.A NE GLY 26.A O ARG 29.A HE 2.812 1.853 ARG 29.A NH2 GLY 26.A O ARG 29.A HH21 3.533 2.902 PHE 30.A N ASN 27.A O PHE 30.A H 3.244 2.393 GLU 31.A N LEU 16.A O GLU 31.A H 2.906 2.092 TYR 33.A N PRO 13.A O TYR 33.A H 2.976 2.141 CYS 34.A N TYR 14.A O CYS 34.A H 2.841 2.076 ASP 36.A N GLY 32.A O ASP 36.A H 2.914 2.075 LEU 37.A N TYR 33.A O LEU 37.A H 2.953 2.175 LEU 38.A N CYS 34.A O LEU 38.A H 2.874 2.048 ARG 39.A N ILE 35.A O ARG 39.A H 2.925 2.089 GLU 40.A N ASP 36.A O GLU 40.A H 3.026 2.198 LEU 41.A N LEU 37.A O LEU 41.A H 2.823 1.994 SER 42.A N LEU 38.A O SER 42.A H.A 2.896 2.082 SER 42.A OG.A ARG 39.A O SER 42.A HG.A 2.801 2.226 THR 43.A N ARG 39.A O THR 43.A H 3.092 2.288 THR 43.A OG1 ARG 39.A O THR 43.A HG1 3.308 2.616 HIS 44.A N GLU 40.A O HIS 44.A H 3.020 2.179 HIS 44.A ND1 GLU 40.A O HIS 44.A HD1 2.980 2.266 LEU 45.A N LEU 41.A O LEU 45.A H 2.859 2.046 GLY 46.A N SER 42.A O GLY 46.A H 2.869 2.192 PHE 47.A N SER 42.A O PHE 47.A H 3.127 2.372 THR 48.A OG1 SER 3.A OG.A THR 48.A HG1 2.788 2.204 GLU 50.A N LEU 4.A O GLU 50.A H.A 2.832 2.036 ILE 51.A N ASN 27.A OD1 ILE 51.A H 2.895 2.038 ARG 52.A N VAL 6.A O ARG 52.A H 2.866 2.038 ARG 52.A NE GLU 50.A OE2.A ARG 52.A HE 3.074 2.107 ARG 52.A NH2 GLU 50.A OE1.A ARG 52.A HH21 2.933 2.205 VAL 54.A N THR 8.A O VAL 54.A H 2.858 2.023 GLU 55.A N GLU 75.A OE2.B GLU 55.A H.A 3.232 2.412 GLY 57.A N VAL 54.A O GLY 57.A H 3.150 2.337 LYS 58.A N ASP 56.A OD1 LYS 58.A H.A 3.068 2.308 LYS 58.A NZ.A ASP 138.A OD2 LYS 58.A HZ2.A 3.157 2.230 LYS 58.A NZ.B ASP 56.A O LYS 58.A HZ3.B 3.322 2.661 GLY 60.A N ASP 138.A O GLY 60.A H 2.973 2.150 ALA 61.A N ASN 70.A OD1 ALA 61.A H 2.928 2.124 GLN 62.A NE2 GLY 67.A O GLN 62.A HE22 2.881 2.028 ASP 63.A N GLN 68.A O ASP 63.A H 2.788 1.945 VAL 65.A N ASP 63.A OD1 VAL 65.A H 2.992 2.186 ASN 66.A N ASP 63.A OD1 ASN 66.A H 2.982 2.138 GLY 67.A N ASP 63.A O GLY 67.A H 3.145 2.404 GLN 68.A N ASN 66.A OD1 GLN 68.A H 2.727 1.873 ASN 70.A N ALA 61.A O ASN 70.A H 3.217 2.532 ASN 70.A ND2 ASP 138.A OD2 ASN 70.A HD21 2.944 2.118 GLY 71.A N ASP 56.A OD2 GLY 71.A H 2.884 2.037 MET 72.A N LYS 58.A O MET 72.A H 3.144 2.471 VAL 73.A N TYR 59.A O VAL 73.A H 3.311 2.515 ARG 74.A N ASN 70.A O ARG 74.A H 3.136 2.310 ARG 74.A NE ASP 78.A OD1 ARG 74.A HE 3.560 2.757 ARG 74.A NE ASP 78.A OD2 ARG 74.A HE 2.768 1.858 ARG 74.A NH1 TRP 69.A O ARG 74.A HH11 2.896 2.089 GLU 75.A N GLY 71.A O GLU 75.A H.B 3.183 2.373 LEU 76.A N MET 72.A O LEU 76.A H 3.138 2.347 ILE 77.A N VAL 73.A O ILE 77.A H 2.951 2.106 ASP 78.A N ARG 74.A O ASP 78.A H 2.952 2.170 HIS 79.A N LEU 76.A O HIS 79.A H 2.976 2.134 LYS 80.A N GLU 75.A O LYS 80.A H 2.862 2.098 ASP 82.A N ILE 5.A O ASP 82.A H 2.793 2.062 LEU 83.A N ILE 5.A O LEU 83.A H 3.200 2.379 ALA 84.A N GLY 218.A O ALA 84.A H 2.847 2.037 VAL 85.A N THR 7.A O VAL 85.A H 3.101 2.344 LEU 88.A N ALA 86.A O LEU 88.A H 2.797 2.129 ILE 90.A N GLY 214.A O ILE 90.A H 2.880 2.030 ARG 94.A N THR 91.A OG1 ARG 94.A H 3.256 2.420 ARG 94.A NE GLY 60.A O ARG 94.A HE 3.338 2.546 ARG 94.A NH1 ALA 89.A O ARG 94.A HH11 2.975 2.168 ARG 94.A NH2 GLY 60.A O ARG 94.A HH21 2.949 2.119 GLU 95.A N THR 91.A O GLU 95.A H.A 2.886 2.042 GLU 96.A N TYR 92.A O GLU 96.A H 3.111 2.393 VAL 97.A N ARG 94.A O VAL 97.A H 2.952 2.115 ILE 98.A N ARG 94.A O ILE 98.A H 2.889 2.045 ASP 99.A N.A THR 219.A O ASP 99.A H.A 2.959 2.106 ASP 99.A N.B THR 219.A O ASP 99.A H.B 2.984 2.176 PHE 100.A N GLU 95.A OE1.B PHE 100.A H 3.276 2.534 SER 101.A N VAL 217.A O SER 101.A H 2.899 2.089 LYS 102.A N THR 230.A OG1 LYS 102.A H 2.881 2.061 PHE 104.A N TYR 215.A O PHE 104.A H 2.892 2.150 LEU 107.A N LYS 213.A O LEU 107.A H 2.897 2.156 GLY 108.A N SER 190.A OG GLY 108.A H 3.039 2.230 ILE 109.A N ASP 211.A OD1 ILE 109.A H 2.829 1.991 SER 110.A N MET 188.A O SER 110.A H 2.853 2.002 SER 110.A OG ILE 206.A O SER 110.A HG 3.453 2.921 LEU 112.A N PHE 186.A O LEU 112.A H 2.810 1.958 TYR 113.A N THR 204.A O TYR 113.A H 3.052 2.221 ARG 114.A NE.B VAL 179.A O ARG 114.A HE.B 3.095 2.408 ARG 114.A NH1.A TYR 113.A OH ARG 114.A HH11.A 3.235 2.590 ARG 114.A NH2.A SER 182.A O ARG 114.A HH22.A 3.194 2.458 ARG 114.A NH2.B VAL 179.A O ARG 114.A HH21.B 3.128 2.539 ARG 114.A NH2.B SER 182.A O ARG 114.A HH21.B 2.992 2.235 LYS 115.A N ASN 202.A O LYS 115.A H 3.061 2.297 LYS 115.A NZ CYS 201.A O LYS 115.A HZ2 2.842 1.927 ILE 119.A N THR 117.A OG1 ILE 119.A H 3.081 2.247 ASP 120.A N ASP 124.A OD2 ASP 120.A H 2.870 2.031 ASP 124.A N SER 121.A O ASP 124.A H 3.170 2.567 ASP 124.A N SER 121.A OG ASP 124.A H 3.193 2.396 ALA 126.A N ALA 122.A O ALA 126.A H 2.869 2.071 LYS 127.A N ASP 123.A O LYS 127.A H 3.215 2.489 GLN 128.A N LEU 125.A O GLN 128.A H 3.188 2.365 GLN 128.A NE2 LEU 125.A O GLN 128.A HE22 2.995 2.145 GLN 128.A NE2 ILE 131.A O GLN 128.A HE21 2.823 1.964 ILE 131.A N GLN 128.A OE1 ILE 131.A H 2.782 1.925 GLU 132.A N ASP 183.A O GLU 132.A H 3.100 2.368 GLY 134.A N ALA 185.A O GLY 134.A H 3.326 2.625 GLU 137.A N VAL 169.A O GLU 137.A H.A 2.803 1.966 THR 143.A N GLY 139.A O THR 143.A H 3.092 2.274 THR 143.A OG1 GLY 139.A O THR 143.A HG1 3.039 2.296 PHE 144.A N ALA 140.A O PHE 144.A H 2.916 2.107 PHE 145.A N THR 141.A O PHE 145.A H 3.138 2.298 LYS 146.A N MET 142.A O LYS 146.A H 2.909 2.079 LYS 146.A NZ ASP 64.A OD2 LYS 146.A HZ1 2.944 2.130 ARG 147.A N THR 143.A O ARG 147.A H 2.940 2.188 SER 148.A N PHE 145.A O SER 148.A H 3.372 2.532 ASP 154.A N ILE 150.A O ASP 154.A H 2.889 2.052 LYS 155.A N SER 151.A O LYS 155.A H 3.009 2.170 MET 156.A N THR 152.A O MET 156.A H 3.070 2.261 TRP 157.A N TYR 153.A O TRP 157.A H 2.861 2.061 ALA 158.A N ASP 154.A O ALA 158.A H 3.026 2.200 PHE 159.A N LYS 155.A O PHE 159.A H 3.147 2.333 MET 160.A N MET 156.A O MET 160.A H 2.945 2.105 SER 161.A N TRP 157.A O SER 161.A H.A 2.821 1.971 SER 161.A OG.B ALA 158.A O SER 161.A HG.B 3.091 2.350 SER 162.A N ALA 158.A O SER 162.A H.A 3.021 2.179 SER 162.A OG.B PHE 159.A O SER 162.A HG.B 2.802 2.148 ARG 163.A N PHE 159.A O ARG 163.A H 2.963 2.148 ARG 163.A NH1 GLU 132.A OE2 ARG 163.A HH11 2.814 2.030 ARG 164.A N SER 161.A O ARG 164.A H.A 3.333 2.514 ARG 164.A NH1.A SER 161.A O ARG 164.A HH11.A 2.814 1.967 ARG 164.A NH2.B GLU 137.A OE2.B ARG 164.A HH21.B 2.627 1.894 SER 166.A N ARG 163.A O SER 166.A H 2.922 2.183 VAL 167.A N ARG 163.A O VAL 167.A H 2.943 2.130 LEU 168.A N ARG 164.A O LEU 168.A H 3.087 2.254 VAL 169.A N ALA 135.A O VAL 169.A H 3.061 2.260 LYS 170.A N GLU 174.A OE1.A LYS 170.A H 3.011 2.373 LYS 170.A N GLU 174.A OE1.B LYS 170.A H 2.746 1.895 ASN 172.A ND2.A GLU 11.A OE1.B ASN 172.A HD22.A 3.447 2.562 ASN 172.A ND2.A GLU 11.A OE2.A ASN 172.A HD22.A 2.981 2.047 ASN 172.A ND2.B GLU 11.A OE2.B ASN 172.A HD22.B 2.785 1.814 GLU 174.A N SER 171.A OG GLU 174.A H.B 3.121 2.282 GLY 175.A N SER 171.A O GLY 175.A H 3.106 2.300 ILE 176.A N ASN 172.A O ILE 176.A H 2.932 2.112 GLN 177.A N GLU 173.A O GLN 177.A H.A 3.044 2.221 GLN 177.A NE2.A GLU 173.A OE2.B GLN 177.A HE22.A 2.674 1.829 ARG 178.A N GLU 174.A O ARG 178.A H 3.012 2.212 ARG 178.A NE SER 182.A OG ARG 178.A HE 3.334 2.477 ARG 178.A NH1 GLU 132.A OE1 ARG 178.A HH12 3.263 2.504 ARG 178.A NH1 SER 166.A O ARG 178.A HH11 3.156 2.344 ARG 178.A NH2 GLU 132.A OE1 ARG 178.A HH22 3.107 2.298 ARG 178.A NH2 SER 182.A OG ARG 178.A HH21 3.078 2.263 VAL 179.A N GLY 175.A O VAL 179.A H 2.992 2.176 LEU 180.A N ILE 176.A O LEU 180.A H 2.949 2.156 THR 181.A N ARG 178.A O THR 181.A H 3.383 2.604 THR 181.A OG1 GLN 177.A O THR 181.A HG1 2.781 2.007 SER 182.A N ARG 178.A O SER 182.A H 3.041 2.448 SER 182.A OG ARG 178.A O SER 182.A HG 2.714 2.085 ALA 185.A N GLU 132.A O ALA 185.A H 2.882 2.063 PHE 186.A N LEU 112.A O PHE 186.A H 2.907 2.072 LEU 187.A N GLY 134.A O LEU 187.A H.A 2.870 2.015 MET 188.A N SER 110.A O MET 188.A H 2.935 2.112 SER 190.A N GLY 108.A O SER 190.A H 2.790 2.049 THR 191.A OG1 TYR 14.A OH.A THR 191.A HG1 3.120 2.523 ILE 193.A N GLU 189.A O ILE 193.A H 2.951 2.135 GLU 194.A N SER 190.A O GLU 194.A H 2.968 2.162 PHE 195.A N THR 191.A O PHE 195.A H 3.333 2.522 VAL 196.A N THR 192.A O VAL 196.A H 2.954 2.122 THR 197.A N ILE 193.A O THR 197.A H 2.854 2.012 THR 197.A OG1 ILE 193.A O THR 197.A HG1 3.051 2.280 THR 197.A OG1 GLU 194.A O THR 197.A HG1 3.448 2.912 GLN 198.A N GLU 194.A O GLN 198.A H.A 3.361 2.574 GLN 198.A NE2.B TRP 250.A O GLN 198.A HE21.B 3.354 2.828 ARG 199.A N VAL 196.A O ARG 199.A H.A 3.044 2.243 ARG 199.A NH1.A PHE 195.A O ARG 199.A HH11.A 2.900 2.130 ARG 199.A NH1.A GLN 198.A OE1.A ARG 199.A HH12.A 3.031 2.213 ARG 199.A NH2.A TRP 250.A O ARG 199.A HH22.A 3.012 2.153 ASN 200.A ND2 VAL 196.A O ASN 200.A HD22 2.887 1.920 CYS 201.A SG GLY 252.A O no hydrogen 3.861 N/A LEU 203.A N ASN 200.A O LEU 203.A H 2.949 2.109 THR 204.A N TYR 113.A O THR 204.A H 2.901 2.101 THR 204.A OG1 GLN 205.A O THR 204.A HG1 3.226 2.447 GLN 205.A NE2 GLY 207.A O GLN 205.A HE22 3.048 2.189 ILE 206.A N ILE 111.A O ILE 206.A H 2.864 2.056 ILE 210.A N ILE 109.A O ILE 210.A H 2.806 1.958 LYS 213.A N LEU 107.A O LYS 213.A H.A 2.945 2.099 LYS 213.A NZ.B ASP 211.A OD2 LYS 213.A HZ2.B 2.855 2.034 TYR 215.A N MET 105.A O TYR 215.A H 2.963 2.183 GLY 216.A N LEU 88.A O GLY 216.A H 3.157 2.372 VAL 217.A N SER 101.A OG VAL 217.A H 2.932 2.143 GLY 218.A N ALA 84.A O GLY 218.A H 3.020 2.241 THR 219.A N ASP 99.A O.A THR 219.A H 2.869 2.194 THR 219.A N ASP 99.A O.B THR 219.A H 2.886 2.057 THR 219.A OG1 ASP 99.A O.A THR 219.A HG1 2.852 2.041 GLY 222.A N ASP 99.A OD2 GLY 222.A H 2.861 2.010 SER 223.A N PRO 220.A O SER 223.A H 3.052 2.229 TYR 225.A N SER 223.A OG TYR 225.A H 2.963 2.168 ARG 226.A N SER 223.A O ARG 226.A H.A 3.316 2.482 ARG 226.A NE.B PHE 100.A O ARG 226.A HE.B 2.886 1.962 ARG 226.A NH2.A ASP 99.A OD2 ARG 226.A HH21.A 3.308 2.590 LYS 228.A NZ.B LEU 45.A O LYS 228.A HZ3.B 2.966 2.346 ILE 229.A N TYR 225.A O ILE 229.A H 2.910 2.078 THR 230.A N ARG 226.A O THR 230.A H 3.006 2.162 LEU 231.A N ASP 227.A O LEU 231.A H 3.072 2.250 ALA 232.A N LYS 228.A O ALA 232.A H 2.997 2.176 ILE 233.A N ILE 229.A O ILE 233.A H 2.901 2.063 LEU 234.A N THR 230.A O LEU 234.A H 2.936 2.090 LYS 235.A N LEU 231.A O LYS 235.A H 2.908 2.115 LEU 236.A N ALA 232.A O LEU 236.A H 2.948 2.108 GLN 237.A N ILE 233.A O GLN 237.A H 2.928 2.131 GLN 237.A NE2 PRO 103.A O GLN 237.A HE21 3.331 2.610 GLU 238.A N.A LEU 234.A O GLU 238.A H.A 3.111 2.477 GLU 238.A N.A LYS 235.A O GLU 238.A H.A 3.177 2.485 GLU 238.A N.B LEU 234.A O GLU 238.A H.B 3.015 2.278 GLU 238.A N.B LYS 235.A O GLU 238.A H.B 3.107 2.553 GLN 239.A N.A LEU 236.A O GLN 239.A H.A 3.193 2.381 GLN 239.A N.B LYS 235.A O GLN 239.A H.B 3.026 2.305 GLY 240.A N.A GLN 237.A O GLY 240.A H.A 3.435 2.585 GLY 240.A N.B LEU 236.A O GLY 240.A H.B 2.936 2.335 LYS 241.A N LEU 236.A O no hydrogen 3.080 N/A LYS 241.A NZ.B GLU 40.A OE2 no hydrogen 3.386 N/A MET 244.A N GLY 240.A O.A MET 244.A H 3.201 2.401 MET 244.A N GLY 240.A O.B MET 244.A H 3.210 2.421 MET 245.A N LYS 241.A O MET 245.A H.A 3.003 2.206 LYS 246.A N LEU 242.A O LYS 246.A H.A 2.920 2.099 LYS 246.A NZ.A GLU 194.A OE1 LYS 246.A HZ1.A 3.076 2.223 LYS 246.A NZ.B GLU 194.A OE1 LYS 246.A HZ1.B 3.019 2.081 GLU 247.A N HIS 243.A O GLU 247.A H.A 2.894 2.058 LYS 248.A N MET 244.A O LYS 248.A H 2.958 2.141 LYS 248.A NZ ASP 36.A OD2 LYS 248.A HZ3 2.882 1.931 TRP 249.A N MET 245.A O TRP 249.A H 3.184 2.398 TRP 249.A NE1 ASP 36.A OD2 TRP 249.A HE1 2.831 1.978 TRP 250.A N LYS 246.A O TRP 250.A H 2.817 2.059 TRP 250.A NE1 THR 191.A O TRP 250.A HE1 2.977 2.129 ARG 251.A N GLU 247.A O ARG 251.A H 3.005 2.341 CYS 253.A SG THR 197.A O no hydrogen 3.355 N/A CYS 253.A SG GLN 198.A O no hydrogen 3.722 N/A