Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3hgp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 1.A N LEU 134.A O VAL 1.A H3 2.937 2.213 VAL 1.A N ASP 187.A OD1 VAL 1.A H1 2.686 2.028 VAL 1.A N ASP 187.A OD2 VAL 1.A H1 3.545 2.667 VAL 2.A N SER 182.A O VAL 2.A H 2.878 2.104 THR 5.A N GLN 147.A O THR 5.A H 2.889 2.059 ALA 7.A N LEU 145.A O ALA 7.A H 2.896 2.061 ARG 9.A NH1 ASP 66.A OD2 ARG 9.A HH12 2.885 2.053 SER 11.A N GLN 8.A O SER 11.A H 3.199 2.347 TRP 12.A NE1 GLN 147.A OE1 TRP 12.A HE1 2.837 2.007 GLN 15.A N TRP 12.A O GLN 15.A H 3.069 2.238 GLN 15.A NE2 ILE 16.A O GLN 15.A HE22 2.942 2.098 ILE 16.A N GLY 32.A O ILE 16.A H 2.934 2.104 SER 17.A N VAL 56.A O SER 17.A H 2.978 2.128 SER 17.A OG HIS 28.A ND1 SER 17.A HG 2.767 1.972 LEU 18.A N CYS 30.A O LEU 18.A H 2.825 1.998 GLN 19.A N ARG 54A.A O GLN 19.A H 2.897 2.042 GLN 19.A NE2 SER 17.A OG GLN 19.A HE22 3.008 2.205 TYR 20.A N ALA 27.A O TYR 20.A H 2.873 2.050 ARG 21.A N THR 52.A O ARG 21.A H 2.953 2.171 SER 25.A N SER 22A.A O SER 25.A H 2.725 1.956 ALA 27.A N TYR 20.A O ALA 27.A H 2.864 2.032 HIS 28.A NE2 GLY 186.A O HIS 28.A HE2 2.852 2.027 THR 29.A N LEU 18.A O THR 29.A H 2.885 2.030 CYS 30.A N LEU 18.A O CYS 30.A H 3.172 2.331 CYS 30.A SG THR 29.A O no hydrogen 3.164 N/A GLY 31.A N SER 188.A O GLY 31.A H 2.798 2.094 THR 33.A N MET 41.A O THR 33.A H 2.849 2.014 LEU 34.A N SER 14.A O LEU 34.A H 2.846 2.001 ILE 35.A N TRP 39.A O ILE 35.A H 2.874 2.040 ARG 36.A N TRP 39.A O ARG 36.A H 3.196 2.341 ARG 36.A NH1 ILE 35.A O ARG 36.A HH11 3.051 2.207 TRP 39.A N ARG 36.A O TRP 39.A H 3.162 2.304 VAL 40.A N LEU 97.A O VAL 40.A H 2.882 2.040 MET 41.A N THR 33.A O MET 41.A H 2.846 1.996 THR 42.A N ALA 95.A O THR 42.A H 2.919 2.062 THR 42.A OG1 GLY 31.A O THR 42.A HG1 2.825 2.205 HIS 45.A N ASP 93.A OD1 HIS 45.A H 2.927 2.110 HIS 45.A ND1 ASP 93.A OD2 HIS 45.A HD1 2.603 1.819 HIS 45.A NE2 SER 188.A OG HIS 45.A HE2 2.763 1.945 CYS 46.A N ALA 43.A O CYS 46.A H 3.066 2.321 CYS 46.A SG SER 188.A O no hydrogen 3.620 N/A VAL 47.A N ALA 44.A O VAL 47.A H 3.017 2.217 ASP 48.A N ALA 44.A O ASP 48.A H 3.043 2.396 ARG 49.A NE.B CYS 46.A O ARG 49.A HE.B 2.959 2.213 ARG 49.A NH2.B THR 29.A OG1 ARG 49.A HH22.B 2.817 2.009 ARG 49.A NH2.B CYS 46.A O ARG 49.A HH21.B 2.860 2.084 LEU 51.A N ARG 49.A O LEU 51.A H 2.954 2.311 VAL 55.A N VAL 72.A O VAL 55.A H 2.839 1.982 VAL 56.A N SER 17.A O VAL 56.A H 2.863 2.026 VAL 57.A N GLN 70.A O VAL 57.A H 3.009 2.194 HIS 60.A N ASP 66.A OD1 HIS 60.A H 2.970 2.169 HIS 60.A NE2 GLU 6.A OE1 HIS 60.A HE2 2.704 1.604 ASN 61.A N ASP 66.A OD1 ASN 61.A H 2.826 1.967 LEU 62.A N GLN 143.A O LEU 62.A H 2.868 2.045 ASN 63.A N ASN 61.A OD1 ASN 63.A H 2.847 2.043 GLN 64.A N ASN 61.A O GLN 64.A H 3.472 2.615 ASP 66.A N GLU 69.A OE2 ASP 66.A H 2.803 1.946 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 3.227 2.505 GLY 67.A N GLU 69.A OE1 GLY 67.A H 2.962 2.363 THR 68.A N GLU 69.A OE1 THR 68.A H 3.120 2.405 THR 68.A OG1 GLY 58.A O THR 68.A HG1 2.675 1.920 GLU 69.A N GLU 69.A OE1 GLU 69.A H 2.772 2.009 GLN 70.A N VAL 57.A O GLN 70.A H 2.932 2.100 VAL 72.A N VAL 55.A O VAL 72.A H 2.900 2.075 GLN 75.A N ARG 98.A O GLN 75.A H 2.804 2.022 LYS 76.A N ARG 98.A O LYS 76.A H 3.237 2.425 LYS 76.A NZ ASN 240.A OD1 LYS 76.A HZ2 2.477 1.741 VAL 78.A N LEU 96.A O VAL 78.A H 2.825 1.971 HIS 80.A N ILE 94.A O HIS 80.A H 3.041 2.204 TRP 83.A N HIS 80.A O TRP 83.A H 3.027 2.205 TRP 83.A NE1 ASP 48.A OD2.A TRP 83.A HE1 3.040 2.276 TRP 83.A NE1 ASP 48.A OD2.B TRP 83.A HE1 2.883 2.038 GLY 91.A N VAL 88.A O GLY 91.A H 3.058 2.243 ILE 94.A N TYR 92.A O ILE 94.A H 2.904 2.256 ALA 95.A N THR 42.A O ALA 95.A H 2.920 2.125 LEU 96.A N VAL 78.A O LEU 96.A H 2.877 2.035 LEU 97.A N VAL 40.A O LEU 97.A H 2.779 1.950 ARG 98.A N LYS 76.A O ARG 98.A H 2.844 2.041 ARG 98.A NE GLN 75.A OE1 ARG 98.A HE 3.027 2.352 ARG 98.A NH1 GLN 75.A OE1 ARG 98.A HH12 3.204 2.600 ARG 98.A NH2 ASN 240.A O ARG 98.A HH22 2.771 1.973 LEU 99.A N ASN 38.A O LEU 99.A H 2.826 1.973 ALA 100.A N GLY 73.A O ALA 100.A H 2.856 2.041 VAL 103.A N GLN 37.A O VAL 103.A H 2.938 2.114 THR 104.A OG1 GLN 70.A OE1 THR 104.A HG1 3.368 2.604 ASN 106.A N VAL 109.A O ASN 106.A H 2.916 2.079 TYR 108.A N ASN 106.A OD1 TYR 108.A H 2.801 2.034 VAL 109.A N ASN 106.A O VAL 109.A H 3.069 2.243 GLN 110.A N PRO 13.A O GLN 110.A H 3.110 2.275 GLN 110.A NE2 ASN 106.A O GLN 110.A HE22 2.912 2.063 GLY 112.A N LEU 34.A O GLY 112.A H 2.756 1.900 GLY 118.A N SER 227.A O GLY 118.A H 3.047 2.196 THR 119.A N ARG 116.A O THR 119.A H 3.116 2.304 ASN 124.A N THR 152.A O ASN 124.A H 2.826 2.098 SER 125.A N THR 152.A OG1 SER 125.A H 2.945 2.133 SER 125.A OG ALA 122.A O SER 125.A HG 2.648 1.877 CYS 127.A SG SER 125.A O no hydrogen 3.816 N/A TYR 128.A N HIS 193.A O TYR 128.A H 2.791 1.970 ILE 129.A N ALA 148.A O ILE 129.A H 2.917 2.170 GLY 131.A N GLN 146.A O GLY 131.A H 2.963 2.157 TRP 132.A NE1 HIS 60.A O TRP 132.A HE1 2.948 2.135 GLY 133.A N ASP 187.A OD2 GLY 133.A H 2.774 2.002 LEU 134.A N GLN 185.A O LEU 134.A H 2.815 2.011 THR 135.A N GLN 140.A O THR 135.A H 3.051 2.263 GLY 139.A N ARG 136.A O GLY 139.A H 2.858 2.177 ALA 142.A N TRP 132.A O ALA 142.A H 2.959 2.247 LEU 145.A N HIS 60.A O LEU 145.A H 2.956 2.251 GLN 146.A N GLY 131.A O GLN 146.A H 3.019 2.195 GLN 146.A NE2 THR 144.A O GLN 146.A HE22 3.054 2.216 GLN 147.A N THR 5.A O GLN 147.A H 2.854 2.030 ALA 148.A N ILE 129.A O ALA 148.A H 2.967 2.159 LEU 150.A N CYS 127.A O LEU 150.A H 2.854 2.034 THR 152.A N SER 125.A O THR 152.A H 2.988 2.182 VAL 153.A N CYS 174.A O VAL 153.A H 2.922 2.066 ASP 154.A N ASN 123.A OD1 ASP 154.A H 2.879 2.046 ILE 157.A N ASP 154.A OD1 ILE 157.A H 2.869 2.024 CYS 158.A N ASP 154.A O CYS 158.A H 2.727 1.886 SER 159.A N TYR 155.A O SER 159.A H 2.835 2.017 SER 159.A OG TYR 155.A O SER 159.A HG 2.728 1.941 SER 160.A N ILE 157.A O SER 160.A H 3.106 2.310 TYR 163.A N SER 160.A O TYR 163.A H 3.016 2.238 TRP 164.A N CYS 158.A O TRP 164.A H 2.798 2.011 TRP 164.A NE1 PRO 220.A O TRP 164.A HE1 2.873 2.074 GLY 165.A N SER 160.A O GLY 165.A H 2.922 2.156 THR 167.A N TRP 164.A O THR 167.A H 3.187 2.438 THR 167.A OG1 TRP 164.A O no hydrogen 3.463 N/A MET 172.A N LYS 169.A O MET 172.A H 3.000 2.232 VAL 173.A N PHE 223.A O VAL 173.A H 2.808 1.987 ALA 175.A N THR 221.A O ALA 175.A H 2.988 2.149 GLY 176.A N PRO 151.A O GLY 176.A H 2.844 2.007 VAL 180.A N ASP 178.A OD1 VAL 180.A H 2.760 1.936 SER 182.A N VAL 2.A O SER 182.A H 3.194 2.403 SER 182.A OG GLY 183.A O SER 182.A HG 2.811 2.107 GLY 183.A N THR 221.A OG1 GLY 183.A H 3.010 2.187 CYS 184.A N ASP 187.A OD1 CYS 184.A H 2.865 2.098 CYS 184.A SG ARG 136.A O no hydrogen 3.854 N/A CYS 184.A SG GLN 185.A OE1 no hydrogen 3.346 N/A GLN 185.A N GLN 185.A OE1 GLN 185.A H 2.812 2.093 ASP 187.A N CYS 184.A O ASP 187.A H 2.918 2.088 GLY 189.A N THR 206.A O GLY 189.A H 2.797 1.941 GLY 190.A N ASP 187.A O GLY 190.A H 2.998 2.180 LEU 192.A N GLY 204.A O LEU 192.A H 2.961 2.150 HIS 193.A N TYR 128.A O HIS 193.A H 2.875 2.025 CYS 194.A N ALA 201.A O CYS 194.A H 2.813 1.966 LEU 195.A N PRO 126.A O LEU 195.A H 2.995 2.161 VAL 196.A N GLN 199.A O VAL 196.A H 2.994 2.134 GLN 199.A N VAL 196.A O GLN 199.A H 3.104 2.256 ALA 201.A N CYS 194.A O ALA 201.A H 2.991 2.163 VAL 202.A N VAL 113.A O VAL 202.A H 2.765 1.909 HIS 203.A N LEU 192.A O HIS 203.A H 2.904 2.217 GLY 204.A N LEU 192.A O GLY 204.A H 3.417 2.616 VAL 205.A N THR 224.A O VAL 205.A H 2.989 2.179 THR 206.A N GLY 190.A O THR 206.A H 2.897 2.068 THR 206.A OG1 GLY 190.A O THR 206.A HG1 3.281 2.475 SER 207.A N VAL 222.A O SER 207.A H 2.848 2.089 SER 207.A OG ASP 93.A OD2 SER 207.A HG 2.707 1.904 PHE 208.A N VAL 222.A O PHE 208.A H 3.048 2.230 LEU 212.A N SER 210.A OG LEU 212.A H 2.784 1.947 GLY 213.A N SER 210.A O GLY 213.A H 3.345 2.523 CYS 214.A N THR 137.A OG1 CYS 214.A H 3.039 2.222 CYS 214.A SG GLN 185.A OE1 no hydrogen 3.469 N/A ASN 215.A ND2 GLY 179.A O ASN 215.A HD22 2.942 2.146 ARG 218.A N GLY 177.A O ARG 218.A H 2.903 2.068 LYS 219.A N VAL 216A.A O LYS 219.A H 3.011 2.215 LYS 219.A NZ TYR 163.A O LYS 219.A HZ3 2.814 2.172 VAL 222.A N PHE 208.A O VAL 222.A H 2.950 2.111 PHE 223.A N VAL 173.A O PHE 223.A H 2.842 2.050 THR 224.A N VAL 205.A O THR 224.A H 2.809 2.026 ARG 225.A N SER 171.A O ARG 225.A H 2.856 2.019 ARG 225.A NE ASN 170.A O ARG 225.A HE 2.909 2.113 ARG 225.A NH1 ASN 170.A O ARG 225.A HH12 2.965 2.202 ARG 225.A NH2 SER 227.A OG ARG 225.A HH22 2.912 2.096 VAL 226.A N HIS 203.A O VAL 226.A H 2.991 2.166 SER 227.A OG THR 119.A O SER 227.A HG 2.691 1.882 ALA 228.A N ARG 225.A O ALA 228.A H 3.025 2.221 TYR 229.A N VAL 226.A O TYR 229.A H 2.885 2.056 ILE 233.A N TYR 229.A O ILE 233.A H 2.879 2.022 ASN 234.A N ILE 230.A O ASN 234.A H 2.947 2.097 ASN 235.A N SER 231.A O ASN 235.A H 2.864 2.046 VAL 236.A N TRP 232.A O VAL 236.A H 2.907 2.070 ILE 237.A N ILE 233.A O ILE 237.A H 3.017 2.169 ALA 238.A N ASN 234.A O ALA 238.A H 2.966 2.144 SER 239.A N ASN 235.A O SER 239.A H 3.049 2.368 SER 239.A N VAL 236.A O SER 239.A H 3.237 2.575 SER 239.A OG.A ASN 235.A O SER 239.A HG.A 2.894 2.143 ASN 240.A N ILE 237.A O ASN 240.A H 3.247 2.417 ASN 240.A ND2 VAL 236.A O ASN 240.A HD22 2.927 2.118 SER 22A.A N SER 25.A O SER 22A.A H 2.756 1.900 ARG 54A.A N GLN 19.A O ARG 54A.A H 2.916 2.093 ARG 54A.A NE GLN 19.A OE1 ARG 54A.A HE 2.896 2.115 ARG 54A.A NH1 GLN 19.A OE1 ARG 54A.A HH12 2.863 2.084 ARG 181A.A N ASP 178.A OD1 ARG 181A.A H 2.803 1.951 ARG 181A.A NE ASP 178.A OD2 ARG 181A.A HE 2.974 2.172 ARG 181A.A NH2 ASP 178.A OD2 ARG 181A.A HH21 3.012 2.243 ALA 90B.A N ASP 87.A O ALA 90B.A H 3.329 2.584 SER 24C.A OG SER 25.A OG SER 24C.A HG 3.262 2.508