Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3ioh_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 3.A OG.B LEU 4.A O no hydrogen 3.197 N/A THR 16.A N LYS 13.A O THR 16.A H 3.128 2.288 ARG 19.A NE ASP 21.A OD1 ARG 19.A HE 2.839 1.930 ARG 19.A NH1 ASP 21.A OD1 ARG 19.A HH11 3.284 2.608 ARG 19.A NH1 ASP 21.A OD2 ARG 19.A HH11 2.930 2.091 ARG 19.A NH1 VAL 273.A O ARG 19.A HH12 3.072 2.242 ARG 19.A NH2 GLU 35.A O ARG 19.A HH21 2.899 2.088 ASP 21.A N ASP 21.A OD1 ASP 21.A H 2.647 2.013 THR 26.A N ALA 30.A O THR 26.A H 2.778 1.945 TRP 28.A N THR 26.A OG1 TRP 28.A H 3.212 2.493 TRP 28.A NE1 PRO 253.A O TRP 28.A HE1 2.782 1.979 LEU 29.A N THR 26.A O LEU 29.A H 2.870 2.058 ALA 30.A N THR 26.A OG1 ALA 30.A H 3.056 2.213 ILE 32.A N VAL 24.A O ILE 32.A H 2.913 2.058 VAL 33.A N VAL 256.A O VAL 33.A H 2.822 2.031 TRP 34.A NE1 LEU 23.A O TRP 34.A HE1 2.968 2.229 GLU 35.A N GLU 260.A OE1 GLU 35.A H 3.205 2.607 GLU 35.A N GLU 260.A OE2 GLU 35.A H 2.775 1.932 THR 37.A N TRP 34.A O THR 37.A H 3.084 2.255 THR 37.A OG1 TRP 34.A O THR 37.A HG1 2.740 1.940 ASP 41.A N ASN 39.A OD1 ASP 41.A H 2.831 2.197 ILE 42.A N ASN 39.A OD1 ILE 42.A H 3.236 2.447 LEU 43.A N ASN 39.A O LEU 43.A H 3.273 2.429 ASN 44.A N ILE 40.A O ASN 44.A H 2.816 1.971 GLU 45.A N ASP 41.A O GLU 45.A H 3.149 2.313 GLN 46.A N ILE 42.A O GLN 46.A H 3.040 2.216 PHE 47.A N LEU 43.A O PHE 47.A H 2.985 2.148 ARG 48.A N ASN 44.A O ARG 48.A H 2.853 2.009 ARG 48.A NH1 ASN 51.A OD1.A ARG 48.A HH12 2.945 2.150 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 2.971 2.130 GLN 50.A N PHE 47.A O GLN 50.A H 3.250 2.574 GLN 50.A NE2 GLN 46.A O GLN 50.A HE22 3.261 2.443 ASN 51.A N.A ARG 48.A O ASN 51.A H.A 2.870 2.041 ASN 51.A N.B ARG 48.A O no hydrogen 2.896 N/A THR 52.A N PHE 47.A O THR 52.A H.A 3.280 2.479 THR 52.A OG1 PHE 47.A O THR 52.A HG1 2.850 2.145 THR 53.A N ASP 143.A OD2 THR 53.A H 2.886 2.047 ILE 54.A N ARG 84.A O ILE 54.A H 2.902 2.066 GLY 55.A N TYR 144.A O GLY 55.A H 2.822 1.968 LEU 56.A N HIS 86.A O LEU 56.A H 2.923 2.117 THR 57.A N VAL 146.A O THR 57.A H 2.867 2.050 VAL 58.A N TYR 88.A O VAL 58.A H 3.056 2.275 ALA 60.A N PHE 90.A O ALA 60.A H 2.831 2.007 LYS 62.A N ASP 92.A OD1 LYS 62.A H 3.142 2.391 LYS 62.A N ASP 92.A OD2 LYS 62.A H 3.006 2.195 TYR 64.A N ILE 61.A O TYR 64.A H 2.915 2.109 VAL 65.A N LYS 62.A O VAL 65.A H 3.346 2.487 ALA 66.A N LYS 63.A O ALA 66.A H 3.174 2.340 PHE 67.A N TYR 64.A O PHE 67.A H 3.040 2.194 LEU 68.A N VAL 65.A O LEU 68.A H 3.128 2.271 LYS 69.A NZ GLU 73.A OE2 LYS 69.A HZ3 2.649 1.808 PHE 71.A N PHE 67.A O PHE 71.A H 3.131 2.289 LEU 72.A N LEU 68.A O LEU 72.A H 2.881 2.036 GLU 73.A N LYS 69.A O GLU 73.A H 2.935 2.085 THR 74.A N LEU 70.A O THR 74.A H 2.966 2.127 THR 74.A OG1 LEU 70.A O THR 74.A HG1 2.873 2.107 THR 74.A OG1 PHE 71.A O THR 74.A HG1 3.290 2.760 ALA 75.A N PHE 71.A O ALA 75.A H 2.915 2.106 GLU 76.A N LEU 72.A O GLU 76.A H 2.946 2.145 LYS 77.A N THR 74.A O LYS 77.A H.A 3.047 2.425 LYS 77.A NZ.A GLU 73.A O LYS 77.A HZ2.A 3.543 2.614 HIS 78.A N THR 74.A O HIS 78.A H 3.030 2.433 HIS 78.A N ALA 75.A O HIS 78.A H 3.253 2.511 PHE 79.A N ALA 75.A O PHE 79.A H 2.795 1.949 MET 80.A N VAL 158.A O MET 80.A H 2.870 2.057 HIS 83.A N MET 80.A O HIS 83.A H 2.986 2.148 HIS 83.A NE2 ASN 44.A OD1 no hydrogen 2.862 N/A ARG 84.A NE THR 53.A OG1 ARG 84.A HE 2.865 1.946 VAL 85.A N GLY 105.A O VAL 85.A H 3.200 2.400 HIS 86.A N ILE 54.A O HIS 86.A H 2.916 2.105 HIS 86.A NE2 SER 109.A OG no hydrogen 2.686 N/A TYR 87.A N GLN 107.A O TYR 87.A H 2.780 1.946 TYR 88.A N LEU 56.A O TYR 88.A H 2.802 1.963 VAL 89.A N SER 109.A O VAL 89.A H 2.912 2.064 PHE 90.A N VAL 58.A O PHE 90.A H 2.876 2.033 THR 91.A N LEU 111.A O THR 91.A H 2.941 2.149 THR 91.A OG1 ALA 60.A O THR 91.A HG1 2.737 1.954 GLN 93.A N THR 91.A OG1 GLN 93.A H 2.992 2.135 GLN 93.A NE2 LYS 62.A O GLN 93.A HE21 2.850 2.035 GLN 93.A NE2 ASP 92.A OD1 GLN 93.A HE22 2.918 2.061 ALA 96.A N GLN 93.A O ALA 96.A H 2.891 2.072 VAL 97.A N PRO 94.A O VAL 97.A H 3.222 2.367 GLY 103.A N GLU 76.A OE1 GLY 103.A H 2.775 1.942 ARG 106.A NE GLU 76.A OE2 ARG 106.A HE 2.761 1.899 ARG 106.A NH1 PHE 79.A O ARG 106.A HH12 3.039 2.304 ARG 106.A NH1 MET 80.A O ARG 106.A HH12 3.301 2.704 ARG 106.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 106.A HH21 3.512 2.933 ARG 106.A NH2 PHE 79.A O ARG 106.A HH22 2.840 2.043 ARG 106.A NH2 TYR 87.A OH ARG 106.A HH21 2.975 2.119 GLN 107.A N VAL 85.A O GLN 107.A H 2.995 2.211 SER 109.A N TYR 87.A O SER 109.A H 2.861 2.025 LEU 111.A N VAL 89.A O LEU 111.A H 2.826 1.976 VAL 113.A N THR 91.A O VAL 113.A H 2.930 2.165 ARG 114.A NH1 GLU 128.A OE2 ARG 114.A HH12 3.561 2.753 GLN 120.A N GLN 120.A OE1 GLN 120.A H 2.856 2.054 ASP 121.A N ARG 118.A O ASP 121.A H 2.932 2.282 VAL 122.A N ARG 118.A O VAL 122.A H 3.161 2.348 SER 123.A N TRP 119.A O SER 123.A H 2.803 1.988 SER 123.A OG GLU 235.A OE2 SER 123.A HG 2.984 2.224 MET 124.A N GLN 120.A O MET 124.A H 3.212 2.424 ARG 125.A N VAL 122.A O ARG 125.A H 3.088 2.242 ARG 125.A NH1 ARG 114.A O ARG 125.A HH11 2.920 2.128 ARG 126.A NE ASP 240.A OD2 ARG 126.A HE 3.526 2.633 ARG 126.A NH1 ASP 149.A OD1 ARG 126.A HH12 2.676 1.905 ARG 126.A NH2 ASP 240.A OD1 ARG 126.A HH21 3.208 2.415 ARG 126.A NH2 ASP 240.A OD2 ARG 126.A HH21 3.483 2.703 GLU 128.A N MET 124.A O GLU 128.A H 3.004 2.151 MET 129.A N ARG 125.A O MET 129.A H 2.772 1.939 ILE 130.A N ARG 126.A O ILE 130.A H 2.904 2.048 SER 131.A N MET 127.A O SER 131.A H.A 2.988 2.138 SER 131.A OG.B MET 127.A O no hydrogen 2.974 N/A SER 131.A OG.B GLU 128.A O no hydrogen 2.720 N/A ASP 132.A N GLU 128.A O ASP 132.A H 2.942 2.111 PHE 133.A N MET 129.A O PHE 133.A H 2.874 2.059 CYS 134.A N ILE 130.A O CYS 134.A H 2.928 2.197 CYS 134.A N SER 131.A O CYS 134.A H 3.225 2.600 CYS 134.A SG ILE 130.A O CYS 134.A HG 3.278 2.097 GLU 135.A N ASP 132.A O GLU 135.A H 3.078 2.402 ARG 136.A N ASP 132.A O ARG 136.A H 3.204 2.398 ARG 136.A NH1 ASP 132.A OD2 ARG 136.A HH11 2.822 1.982 ARG 137.A N PHE 133.A O ARG 137.A H 3.021 2.215 ARG 137.A NE GLU 141.A OE1 ARG 137.A HE 2.898 1.979 ARG 137.A NH2 GLU 141.A OE1 ARG 137.A HH21 3.290 2.602 ARG 137.A NH2 GLU 141.A OE2 ARG 137.A HH21 2.886 2.142 PHE 138.A N PHE 133.A O PHE 138.A H 3.029 2.177 LEU 139.A N CYS 134.A O LEU 139.A H 3.189 2.423 SER 140.A N ARG 137.A O SER 140.A H.A 3.206 2.568 SER 140.A OG.A ARG 137.A O SER 140.A HG.A 3.036 2.238 GLU 141.A N ARG 137.A O GLU 141.A H 3.053 2.423 GLU 141.A N PHE 138.A O GLU 141.A H 3.142 2.434 VAL 142.A N PHE 138.A O VAL 142.A H 2.974 2.129 ASP 143.A N THR 53.A O ASP 143.A H 2.846 2.014 TYR 144.A N THR 53.A O TYR 144.A H 3.409 2.617 LEU 145.A N GLY 210.A O LEU 145.A H 2.848 2.026 VAL 146.A N GLY 55.A O VAL 146.A H 2.835 2.065 CYS 147.A N PHE 208.A O CYS 147.A H 2.809 1.967 VAL 148.A N THR 57.A O VAL 148.A H 3.163 2.307 ASP 149.A N ALA 206.A O ASP 149.A H 3.192 2.468 GLU 153.A N THR 280.A O GLU 153.A H 2.842 2.063 PHE 154.A N THR 74.A OG1 PHE 154.A H 2.875 2.061 ARG 155.A N ARG 278.A O ARG 155.A H 2.785 1.979 ARG 155.A NH1 GLN 265.A OE1 ARG 155.A HH12 2.826 2.151 ARG 155.A NH2 GLN 265.A OE1 ARG 155.A HH22 2.601 1.844 ASP 156.A N ARG 278.A O ASP 156.A H 3.256 2.452 HIS 157.A N ASP 156.A OD1 HIS 157.A H 2.775 2.002 HIS 157.A NE2 GLU 161.A OE1 no hydrogen 2.680 N/A VAL 158.A N HIS 78.A O VAL 158.A H 2.935 2.076 GLY 159.A N GLU 161.A OE2 GLY 159.A H 2.934 2.085 GLU 161.A N GLU 161.A OE1 GLU 161.A H 2.822 2.025 ILE 162.A N GLY 159.A O ILE 162.A H 3.064 2.205 LEU 163.A N VAL 160.A O LEU 163.A H 2.990 2.144 LEU 166.A N THR 254.A OG1 LEU 166.A H 3.034 2.210 PHE 167.A N GLY 209.A O PHE 167.A H 2.838 1.989 THR 169.A OG1 PHE 207.A O THR 169.A HG1 2.859 2.361 LEU 170.A N LEU 257.A O LEU 170.A H 2.890 2.044 HIS 171.A N TYR 202.A O HIS 171.A H 2.946 2.098 GLY 173.A N HIS 171.A ND1 GLY 173.A H 2.926 2.081 PHE 174.A N HIS 171.A O PHE 174.A H 3.194 2.339 SER 177.A N PHE 174.A O SER 177.A H 2.969 2.117 ARG 179.A NE GLY 199.A O ARG 179.A HE 2.831 1.946 ARG 179.A NH2 GLY 199.A O ARG 179.A HH21 2.893 2.130 ALA 181.A N SER 178.A O ALA 181.A H 2.937 2.183 PHE 182.A N ARG 179.A O PHE 182.A H 3.065 2.331 ARG 186.A NH1 ILE 194.A O ARG 186.A HH11 2.859 2.095 ARG 186.A NH2 ARG 179.A O ARG 186.A HH22 2.962 2.303 ARG 186.A NH2 PHE 182.A O ARG 186.A HH21 3.008 2.322 ARG 187.A N GLU 185.A OE2 ARG 187.A H 2.821 1.992 ARG 187.A NE GLU 185.A OE2 ARG 187.A HE 2.776 1.809 ARG 187.A NH2 GLU 185.A OE1 ARG 187.A HH21 2.942 2.085 ARG 187.A NH2 GLU 185.A OE2 ARG 187.A HH21 3.529 2.912 ARG 187.A NH2 GLU 235.A O ARG 187.A HH22 2.841 2.125 SER 190.A N ARG 187.A O SER 190.A H 3.005 2.148 GLN 191.A N ASP 229.A OD1 GLN 191.A H 2.840 1.995 TYR 193.A N SER 190.A O TYR 193.A H 3.088 2.247 ILE 194.A N GLU 185.A O ILE 194.A H 2.977 2.150 LYS 196.A NZ GLU 180.A O LYS 196.A HZ3 2.819 2.051 GLU 198.A N PRO 195.A O GLU 198.A H 3.053 2.209 TYR 202.A OH GLU 241.A OE1 TYR 202.A HH 2.677 2.097 TYR 203.A N ASN 245.A OD1 TYR 203.A H 2.832 1.992 GLY 204.A N THR 169.A O GLY 204.A H 2.857 2.054 GLY 205.A N GLU 241.A OE2 GLY 205.A H 2.806 1.956 PHE 207.A N GLY 204.A O PHE 207.A H 3.429 2.581 PHE 208.A N CYS 147.A O PHE 208.A H 3.098 2.289 GLY 209.A N PHE 167.A O GLY 209.A H 3.166 2.362 GLY 210.A N LEU 145.A O GLY 210.A H 2.957 2.173 SER 211.A N PRO 165.A O SER 211.A H 2.862 2.111 GLU 214.A N SER 211.A OG GLU 214.A H 3.100 2.250 VAL 215.A N SER 211.A O VAL 215.A H 2.917 2.069 GLN 216.A N VAL 212.A O GLN 216.A H 2.832 2.001 ARG 217.A N GLN 213.A O ARG 217.A H 3.099 2.279 ARG 217.A NH1 GLU 214.A OE2 ARG 217.A HH11 2.750 2.067 LEU 218.A N GLU 214.A O LEU 218.A H 2.943 2.125 THR 219.A N VAL 215.A O THR 219.A H 2.901 2.048 THR 219.A OG1 VAL 215.A O THR 219.A HG1 2.855 2.067 THR 219.A OG1 GLN 216.A O THR 219.A HG1 3.391 2.930 ARG 220.A N GLN 216.A O ARG 220.A H 2.965 2.118 ALA 221.A N ARG 217.A O ALA 221.A H 2.987 2.141 CYS 222.A N LEU 218.A O CYS 222.A H 2.905 2.074 CYS 222.A SG LEU 218.A O CYS 222.A HG 3.362 2.382 HIS 223.A N THR 219.A O HIS 223.A H 2.904 2.063 GLN 224.A N ARG 220.A O GLN 224.A H 2.808 1.966 ALA 225.A N ALA 221.A O ALA 225.A H 2.941 2.113 MET 226.A N CYS 222.A O MET 226.A H 2.911 2.103 MET 227.A N HIS 223.A O MET 227.A H.A 2.973 2.186 VAL 228.A N GLN 224.A O VAL 228.A H 3.105 2.289 ASP 229.A N ALA 225.A O ASP 229.A H 3.010 2.169 GLN 230.A N MET 226.A O GLN 230.A H 2.898 2.065 ALA 231.A N MET 227.A O ALA 231.A H 3.005 2.167 ASN 232.A N VAL 228.A O ASN 232.A H 3.032 2.291 GLY 233.A N GLN 230.A O GLY 233.A H 3.016 2.178 ILE 234.A N ASP 229.A O ILE 234.A H 2.984 2.130 VAL 237.A N GLU 185.A OE1 VAL 237.A H 2.815 2.067 TRP 238.A N SER 242.A OG TRP 238.A H 2.912 2.120 HIS 239.A N ALA 236.A O HIS 239.A H 2.992 2.150 HIS 239.A ND1 GLU 235.A OE2 no hydrogen 2.667 N/A GLU 241.A N TRP 238.A O GLU 241.A H 3.037 2.380 SER 242.A N HIS 239.A O SER 242.A H 3.016 2.367 LEU 244.A N ASP 240.A O LEU 244.A H 2.831 2.008 ASN 245.A N GLU 241.A O ASN 245.A H 2.990 2.173 ASN 245.A ND2 TYR 203.A O ASN 245.A HD21 2.863 1.960 ASN 245.A ND2 GLU 241.A O ASN 245.A HD22 2.987 2.044 LYS 246.A N SER 242.A O LYS 246.A H 3.082 2.290 LYS 246.A NZ GLN 191.A O LYS 246.A HZ3 2.891 1.986 LYS 246.A NZ TYR 193.A O LYS 246.A HZ2 2.820 1.915 TYR 247.A N HIS 243.A O TYR 247.A H 2.904 2.080 LEU 248.A N LEU 244.A O LEU 248.A H 2.943 2.113 LEU 249.A N ASN 245.A O LEU 249.A H 3.026 2.254 ARG 250.A N LYS 246.A O ARG 250.A H.A 3.290 2.493 ARG 250.A NH1.B GLU 198.A OE1 no hydrogen 2.820 N/A HIS 251.A N TYR 247.A O HIS 251.A H 2.817 2.151 HIS 251.A ND1 TYR 247.A O no hydrogen 2.929 N/A LYS 252.A NZ ASP 200.A OD2 LYS 252.A HZ2 2.738 1.778 LYS 252.A NZ LEU 249.A O LYS 252.A HZ3 2.833 1.884 THR 254.A N LEU 166.A O THR 254.A H 2.738 2.053 THR 254.A OG1 THR 164.A OG1 THR 254.A HG1 2.667 2.031 LYS 255.A N LEU 166.A O LYS 255.A H 3.359 2.563 LYS 255.A NZ GLU 161.A O LYS 255.A HZ3 2.758 1.905 LYS 255.A NZ LEU 163.A O LYS 255.A HZ2 2.781 1.920 VAL 256.A N PRO 31.A O VAL 256.A H 2.953 2.117 LEU 257.A N GLY 168.A O LEU 257.A H 2.829 1.998 SER 258.A N VAL 33.A O SER 258.A H 3.112 2.286 GLU 260.A N SER 258.A OG GLU 260.A H 3.380 2.614 TYR 261.A N SER 258.A O TYR 261.A H 3.002 2.149 LEU 262.A N PRO 259.A O LEU 262.A H 3.068 2.223 TRP 263.A N PHE 279.A O TRP 263.A H 2.997 2.287 TRP 263.A NE1 GLY 269.A O TRP 263.A HE1 2.770 1.931 LEU 267.A N ASP 264.A OD1 LEU 267.A H 3.059 2.241 LEU 268.A N ASP 264.A O LEU 268.A H 2.984 2.335 GLY 269.A N GLN 265.A O GLY 269.A H 2.816 2.024 TRP 270.A NE1 LEU 274.A O TRP 270.A HE1 2.750 1.991 LEU 274.A N PRO 271.A O LEU 274.A H 3.004 2.186 ARG 278.A N GLU 260.A O ARG 278.A H 2.831 2.001 ARG 278.A NE GLU 260.A OE1 ARG 278.A HE 2.818 1.928 ARG 278.A NH1 HIS 157.A O ARG 278.A HH11 2.878 2.054 ARG 278.A NH2 GLU 35.A OE1 ARG 278.A HH22 2.905 2.092 ARG 278.A NH2 GLU 260.A OE1 ARG 278.A HH21 2.848 2.086 THR 280.A N GLU 153.A O THR 280.A H 2.926 2.096 ALA 281.A N TRP 263.A O ALA 281.A H 2.837 2.065 VAL 282.A N ASP 151.A O VAL 282.A H 3.332 2.510