Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3let_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 2.A NE2 GLN 51.A OE1 GLN 2.A HE22 2.856 2.123 ARG 5.A N GLY 1.A O ARG 5.A H 2.983 2.166 ARG 5.A NE GLU 48.A OE2 ARG 5.A HE 2.738 1.770 ARG 5.A NH2 GLU 48.A OE1 ARG 5.A HH21 2.821 1.973 ARG 5.A NH2 GLU 48.A OE2 ARG 5.A HH21 3.519 2.900 LEU 6.A N GLN 2.A O LEU 6.A H 2.893 2.128 GLN 7.A N GLN 4.A O GLN 7.A H 3.067 2.277 THR 8.A N ARG 5.A O THR 8.A H 3.289 2.450 THR 8.A OG1 ARG 5.A O THR 8.A HG1 2.907 2.192 SER 9.A OG GLU 13.A OE1 SER 9.A HG 3.282 2.606 SER 11.A N GLU 59.A OE1 SER 11.A H 3.380 2.603 SER 11.A N GLU 59.A OE2 SER 11.A H 2.823 2.023 HIS 14.A N SER 10.A O HIS 14.A H 3.239 2.382 HIS 14.A NE2 GLU 48.A OE2 no hydrogen 2.704 N/A GLY 15.A N SER 11.A O GLY 15.A H 2.795 1.941 GLN 16.A N VAL 12.A O GLN 16.A H 2.839 1.991 GLN 16.A NE2 LEU 24.A O GLN 16.A HE22 2.739 1.956 MET 17.A N GLU 13.A O MET 17.A H 2.952 2.174 LEU 18.A N HIS 14.A O LEU 18.A H 2.888 2.067 PHE 19.A N GLY 15.A O PHE 19.A H 2.740 1.894 ASP 21.A N GLN 16.A O ASP 21.A H 3.011 2.242 ASN 23.A N ASP 21.A OD1 ASN 23.A H 3.087 2.259 LEU 24.A N ASP 21.A O LEU 24.A H 3.274 2.424 LYS 25.A N ASP 29.A OD2 LYS 25.A H 3.120 2.275 ASP 29.A N THR 26.A OG1 ASP 29.A H 3.008 2.176 VAL 30.A N THR 26.A O VAL 30.A H 3.104 2.313 LEU 31.A N PRO 27.A O LEU 31.A H 3.024 2.195 ASN 32.A N SER 28.A O ASN 32.A H 2.852 2.032 ALA 33.A N ASP 29.A O ALA 33.A H 3.156 2.516 ALA 33.A N VAL 30.A O ALA 33.A H 3.093 2.384 PHE 34.A N LEU 31.A O PHE 34.A H 3.062 2.234 LYS 36.A N ALA 33.A O LYS 36.A H 2.956 2.171 LEU 37.A N PHE 34.A O LEU 37.A H 3.156 2.300 LYS 40.A N ASP 38.A OD1 LYS 40.A H 3.283 2.433 MET 41.A N ASP 38.A OD2 MET 41.A H 2.876 2.066 VAL 42.A N ASP 38.A O VAL 42.A H 3.127 2.295 LYS 43.A N SER 39.A O LYS 43.A H 3.140 2.338 SER 44.A N LYS 40.A O SER 44.A H 2.866 2.060 SER 44.A OG MET 41.A O SER 44.A HG 3.155 2.397 HIS 45.A N MET 41.A O HIS 45.A H 2.929 2.169 ALA 46.A N LYS 43.A O ALA 46.A H 3.417 2.601 LEU 49.A N HIS 45.A O LEU 49.A H 2.908 2.067 SER 50.A N ALA 46.A O SER 50.A H 2.936 2.144 GLN 51.A N ALA 47.A O GLN 51.A H 3.219 2.405 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 2.877 2.038 ALA 53.A N LEU 49.A O ALA 53.A H 2.871 2.036 GLU 54.A N SER 50.A O GLU 54.A H 3.076 2.241 ARG 55.A N GLN 51.A O ARG 55.A H 2.868 2.029 ARG 55.A NH1 THR 8.A OG1 ARG 55.A HH12 3.235 2.469 ARG 55.A NH1 HIS 14.A ND1 ARG 55.A HH11 3.109 2.453 ARG 55.A NH2 THR 8.A O ARG 55.A HH22 3.201 2.428 ALA 56.A N LEU 52.A O ALA 56.A H 2.919 2.101 MET 57.A N ALA 53.A O MET 57.A H 2.872 2.016 THR 58.A N GLU 54.A O THR 58.A H 2.936 2.110 THR 58.A OG1 GLU 54.A O THR 58.A HG1 2.761 2.012 GLU 59.A N ARG 55.A O GLU 59.A H 3.012 2.168 VAL 60.A N ALA 56.A O VAL 60.A H 2.910 2.069 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 2.857 2.042 LEU 62.A N THR 58.A O LEU 62.A H 2.930 2.143 GLU 63.A N VAL 60.A O GLU 63.A H 3.058 2.326 THR 64.A N MET 61.A O THR 64.A H 3.235 2.412 THR 64.A OG1 MET 61.A O THR 64.A HG1 2.814 2.009 GLY 67.A N THR 64.A OG1 GLY 67.A H 3.042 2.237 LYS 68.A N THR 64.A O LYS 68.A H 2.901 2.074 ASN 69.A N ASP 65.A O ASN 69.A H 2.899 2.104 LEU 70.A N SER 66.A O LEU 70.A H 2.961 2.160 LYS 71.A N GLY 67.A O LYS 71.A H 2.954 2.128 LYS 71.A NZ ASP 76.A OD1 LYS 71.A HZ3 3.014 2.212 ALA 72.A N LYS 68.A O ALA 72.A H 2.939 2.142 LEU 73.A N ASN 69.A O LEU 73.A H 3.236 2.578 LEU 73.A N LEU 70.A O LEU 73.A H 2.959 2.303 ILE 74.A N LEU 70.A O ILE 74.A H 2.856 2.035 GLY 75.A N LYS 71.A O GLY 75.A H 2.917 2.155 VAL 79.A N GLY 75.A O VAL 79.A H 2.984 2.149 LYS 80.A N ASP 76.A O LYS 80.A H 2.969 2.134 SER 81.A N ASP 77.A O SER 81.A H 3.044 2.252 LEU 82.A N ALA 78.A O LEU 82.A H 2.977 2.149 ALA 83.A N VAL 79.A O ALA 83.A H 2.794 1.971 VAL 84.A N LYS 80.A O VAL 84.A H 3.092 2.253 ARG 85.A N SER 81.A O ARG 85.A H 3.292 2.499 VAL 86.A N LEU 82.A O VAL 86.A H 2.994 2.166 VAL 87.A N ALA 83.A O VAL 87.A H 2.917 2.077 LYS 88.A N VAL 84.A O LYS 88.A H 2.966 2.150 LYS 88.A NZ GLU 54.A OE1 LYS 88.A HZ3 2.901 2.232 ASP 89.A N ARG 85.A O ASP 89.A H 2.994 2.295 ASP 89.A N VAL 86.A O ASP 89.A H 3.069 2.463 TYR 90.A N VAL 86.A O TYR 90.A H 2.711 1.951 GLY 91.A N VAL 87.A O GLY 91.A H 2.757 2.009 ALA 96.A N GLY 92.A O ALA 96.A H 3.214 2.370 ALA 97.A N GLY 93.A O ALA 97.A H 3.097 2.279 GLN 98.A N VAL 94.A O GLN 98.A H 2.975 2.223 LYS 99.A N ALA 95.A O LYS 99.A H 3.059 2.332 ASN 100.A N ALA 96.A O ASN 100.A H 2.867 2.026 ARG 104.A N ASN 100.A O ARG 104.A H 3.400 2.583 ARG 104.A NH1 TYR 90.A O ARG 104.A HH11 2.964 2.136 ILE 105.A N PRO 101.A O ILE 105.A H 2.860 2.061 ASN 106.A N GLU 102.A O ASN 106.A H 2.946 2.116 GLN 107.A N VAL 103.A O GLN 107.A H 2.938 2.108 MET 108.A N ARG 104.A O MET 108.A H 2.933 2.111 GLN 109.A N ILE 105.A O GLN 109.A H 2.971 2.195 GLN 109.A NE2 ILE 105.A O GLN 109.A HE22 3.459 2.657 ALA 110.A N ASN 106.A O ALA 110.A H 3.206 2.427 VAL 111.A N GLN 107.A O VAL 111.A H 3.092 2.320 PHE 112.A N MET 108.A O PHE 112.A H 2.914 2.071 ASP 113.A N GLN 109.A O ASP 113.A H 2.855 2.039 MET 114.A N ALA 110.A O MET 114.A H 3.046 2.247 GLU 115.A N VAL 111.A O GLU 115.A H 3.090 2.281 VAL 116.A N PHE 112.A O VAL 116.A H 2.798 1.954 MET 117.A N ASP 113.A O MET 117.A H 2.946 2.109 HIS 118.A N MET 114.A O HIS 118.A H 3.085 2.325 HIS 118.A N GLU 115.A O HIS 118.A H 3.039 2.444 LEU 119.A N GLU 115.A O LEU 119.A H 2.981 2.151 LYS 120.A N VAL 116.A O LYS 120.A H 2.968 2.143 ALA 121.A N MET 117.A O ALA 121.A H 2.953 2.225 ALA 122.A N HIS 118.A O ALA 122.A H 3.251 2.435 GLN 123.A N LEU 119.A O GLN 123.A H 2.925 2.122 GLN 123.A NE2 GLU 127.A OE2 GLN 123.A HE22 3.067 2.249 ARG 124.A N LYS 120.A O ARG 124.A H 2.944 2.117 HIS 125.A NE2 SER 297.A O no hydrogen 2.972 N/A HIS 125.A NE2 LEU 298.A O no hydrogen 2.968 N/A ILE 126.A N ALA 122.A O ILE 126.A H 2.897 2.058 GLU 127.A N GLN 123.A O GLU 127.A H 2.872 2.046 GLY 128.A N ARG 124.A O GLY 128.A H 3.076 2.364 LEU 129.A N ILE 126.A O LEU 129.A H 3.146 2.308 ALA 130.A N GLU 127.A O ALA 130.A H 3.179 2.417 SER 131.A N GLY 128.A O SER 131.A H 3.148 2.311 THR 132.A N LEU 129.A O THR 132.A H 3.051 2.206 THR 132.A OG1 GLY 128.A O THR 132.A HG1 2.967 2.226 ASN 135.A N ASP 133.A OD1 ASN 135.A H 2.802 1.974 GLU 141.A N VAL 138.A O GLU 141.A H 2.621 1.993 ALA 147.A N PRO 144.A O ALA 147.A H 3.100 2.307 PHE 148.A N GLU 145.A O PHE 148.A H 3.161 2.354 ASN 149.A N GLU 145.A O ASN 149.A H 2.649 1.859 ASN 149.A ND2 GLU 145.A OE1 ASN 149.A HD22 3.010 2.030 ASN 149.A ND2 VAL 153.A O ASN 149.A HD21 2.892 1.992 GLY 152.A N ASN 149.A O GLY 152.A H 3.153 2.407 VAL 153.A N ASN 149.A OD1 VAL 153.A H 3.091 2.435 GLU 158.A N ASN 155.A OD1 GLU 158.A H 2.747 1.935 ARG 159.A N ASN 155.A O ARG 159.A H 2.969 2.145 ARG 159.A NE GLU 145.A OE1 ARG 159.A HE 3.030 2.063 ARG 159.A NH1 ASN 156.A OD1 ARG 159.A HH11 2.955 2.240 ARG 159.A NH1 PHE 287.A O ARG 159.A HH12 2.897 2.071 ARG 159.A NH2 GLU 145.A OE2 ARG 159.A HH21 2.941 2.091 ARG 159.A NH2 PHE 287.A O ARG 159.A HH22 3.562 2.929 ALA 160.A N ASN 156.A O ALA 160.A H 2.867 2.041 ALA 161.A N VAL 157.A O ALA 161.A H 2.993 2.144 ALA 162.A N GLU 158.A O ALA 162.A H 2.930 2.089 TRP 163.A N ARG 159.A O TRP 163.A H 3.036 2.264 ILE 164.A N ALA 160.A O ILE 164.A H 2.983 2.142 ILE 165.A N ALA 161.A O ILE 165.A H 2.870 2.020 ASN 166.A N ALA 162.A O ASN 166.A H 2.924 2.116 ALA 167.A N TRP 163.A O ALA 167.A H 3.031 2.213 SER 168.A N ILE 164.A O SER 168.A H 3.069 2.315 ASN 169.A N ASN 166.A O ASN 169.A H 3.155 2.321 SER 170.A N ILE 165.A O SER 170.A H 2.943 2.092 ALA 175.A N LYS 171.A O ALA 175.A H 3.077 2.268 GLU 176.A N GLY 172.A O GLU 176.A H 3.057 2.236 ASN 177.A N ASN 173.A O ASN 177.A H 2.999 2.239 ASN 177.A ND2 ARG 204.A O ASN 177.A HD21 2.872 1.943 ILE 178.A N ASP 174.A O ILE 178.A H 3.097 2.268 THR 179.A N ALA 175.A O THR 179.A H 3.074 2.233 SER 180.A N GLU 176.A O SER 180.A H 2.908 2.069 LEU 181.A N ASN 177.A O LEU 181.A H 2.879 2.035 LEU 182.A N ILE 178.A O LEU 182.A H 3.016 2.228 LYS 183.A N THR 179.A O LYS 183.A H 3.098 2.254 GLU 184.A N SER 180.A O GLU 184.A H 2.929 2.094 TYR 185.A N LEU 181.A O TYR 185.A H 2.901 2.049 ALA 186.A N LEU 182.A O ALA 186.A H 2.868 2.128 THR 187.A N GLU 184.A O THR 187.A H 3.274 2.483 THR 187.A OG1 LYS 183.A O THR 187.A HG1 3.172 2.413 THR 187.A OG1 GLU 184.A O THR 187.A HG1 3.348 2.795 LYS 190.A N ASN 188.A OD1 LYS 190.A H 2.928 2.083 LEU 193.A N ASP 191.A OD1 LEU 193.A H 2.919 2.083 MET 195.A N GLU 238.A OE2 MET 195.A H 2.803 1.944 ASN 197.A N ASN 194.A OD1 ASN 197.A H 2.975 2.155 ASN 197.A ND2 ASP 191.A O ASN 197.A HD22 2.818 1.841 LEU 198.A N ASN 194.A O LEU 198.A H 3.055 2.259 LYS 199.A N MET 195.A O LYS 199.A H 2.836 2.049 LYS 199.A NZ GLU 230.A OE1 LYS 199.A HZ2 3.488 2.659 GLU 200.A N ASP 196.A O GLU 200.A H 3.073 2.272 LEU 201.A N ASN 197.A O LEU 201.A H 3.060 2.226 HIS 202.A N LEU 198.A O HIS 202.A H 2.855 2.002 HIS 202.A NE2 ASP 267.A O no hydrogen 2.796 N/A ALA 203.A N LYS 199.A O ALA 203.A H 2.952 2.145 ARG 204.A N LEU 201.A O ARG 204.A H 3.065 2.398 ARG 204.A NH1 GLU 184.A OE1 ARG 204.A HH12 3.422 2.746 ARG 204.A NH1 GLU 184.A OE2 ARG 204.A HH12 2.945 2.100 ARG 204.A NH2 GLU 184.A OE1 ARG 204.A HH22 2.949 2.132 LEU 205.A N LEU 201.A O LEU 205.A H 2.902 2.167 LEU 205.A N HIS 202.A O LEU 205.A H 3.135 2.547 VAL 206.A N HIS 202.A O VAL 206.A H 2.793 2.004 VAL 209.A N VAL 206.A O VAL 209.A H 3.281 2.484 ASP 212.A N GLU 210.A OE1 ASP 212.A H 3.174 2.397 ARG 214.A NE PRO 224.A O ARG 214.A HE 3.027 2.240 ARG 214.A NH2 PRO 224.A O ARG 214.A HH21 2.681 1.874 SER 219.A N ASN 217.A OD1 SER 219.A H 2.861 2.044 GLY 221.A N ASN 217.A OD1 GLY 221.A H 2.906 2.258 SER 225.A N GLU 115.A OE1 SER 225.A H 3.256 2.483 SER 225.A N GLU 115.A OE2 SER 225.A H 2.936 2.139 SER 226.A N ARG 214.A O SER 226.A H 2.725 1.912 GLY 228.A N SER 225.A OG GLY 228.A H 2.804 1.992 GLY 229.A N SER 225.A O GLY 229.A H 2.886 2.036 GLU 230.A N SER 226.A O GLU 230.A H 3.159 2.309 GLY 231.A N ILE 227.A O GLY 231.A H 2.870 2.062 MET 232.A N GLY 228.A O MET 232.A H 2.980 2.177 LEU 233.A N GLY 229.A O LEU 233.A H 3.006 2.172 LYS 234.A N GLU 230.A O LYS 234.A H 3.016 2.188 LYS 234.A NZ GLU 238.A OE1 LYS 234.A HZ2 2.761 1.882 LYS 234.A NZ GLU 238.A OE2 LYS 234.A HZ2 3.476 2.624 GLN 235.A N GLY 231.A O GLN 235.A H 2.963 2.154 HIS 236.A N MET 232.A O HIS 236.A H 2.799 2.055 ILE 237.A N LEU 233.A O ILE 237.A H 2.988 2.227 GLU 238.A N LYS 234.A O GLU 238.A H 2.949 2.109 GLY 239.A N GLN 235.A O GLY 239.A H 2.960 2.298 PHE 240.A N GLN 235.A O PHE 240.A H 2.919 2.127 LEU 241.A N HIS 236.A O LEU 241.A H 2.891 2.077 LYS 242.A N GLY 239.A O LYS 242.A H 3.021 2.289 LYS 242.A NZ GLU 238.A O LYS 242.A HZ2 2.935 2.016 GLU 243.A N GLY 239.A O GLU 243.A H 2.955 2.144 ASN 244.A N PHE 240.A O ASN 244.A H 2.947 2.202 ASN 244.A ND2 PHE 240.A O ASN 244.A HD22 2.962 2.094 ASP 250.A N ALA 247.A O ASP 250.A H 2.802 2.026 LYS 253.A NZ TYR 139.A O LYS 253.A HZ2 3.060 2.114 HIS 254.A N ASP 250.A O HIS 254.A H 3.256 2.451 LEU 255.A N LEU 251.A O LEU 255.A H 2.952 2.132 PHE 256.A N GLY 252.A O PHE 256.A H 2.924 2.071 ALA 257.A N LYS 253.A O ALA 257.A H 2.922 2.086 GLY 258.A N HIS 254.A O GLY 258.A H 3.004 2.197 VAL 259.A N LEU 255.A O VAL 259.A H 2.990 2.143 ILE 260.A N PHE 256.A O ILE 260.A H 3.174 2.322 GLY 261.A N ALA 257.A O GLY 261.A H 2.738 1.976 TYR 262.A N GLY 258.A O TYR 262.A H 3.147 2.343 HIS 263.A N ILE 260.A O HIS 263.A H 3.234 2.486 GLY 264.A N VAL 259.A O GLY 264.A H 3.061 2.233 PHE 265.A N ASN 269.A OD1 PHE 265.A H 2.847 2.088 THR 266.A OG1 GLU 210.A O THR 266.A HG1 2.715 2.112 GLY 268.A N ASP 267.A OD1 GLY 268.A H 2.690 1.998 ASN 269.A ND2 PHE 265.A O ASN 269.A HD21 2.956 2.063 ARG 271.A NH1 ASP 174.A OD1 ARG 271.A HH12 2.970 2.114 ARG 271.A NH1 ASP 174.A OD2 ARG 271.A HH12 3.460 2.825 ARG 271.A NH2 ASP 174.A OD2 ARG 271.A HH22 2.772 1.921 MET 272.A N GLY 268.A O MET 272.A H 2.955 2.119 GLY 273.A N ASN 269.A O GLY 273.A H 2.822 1.976 ARG 274.A N GLY 270.A O ARG 274.A H 2.998 2.141 ARG 274.A NE GLU 295.A OE2 ARG 274.A HE 2.969 2.006 ARG 274.A NH2 GLU 295.A OE1 ARG 274.A HH21 2.795 1.980 ARG 274.A NH2 GLU 295.A OE2 ARG 274.A HH21 3.537 2.865 MET 275.A N ARG 271.A O MET 275.A H 2.948 2.125 LEU 276.A N MET 272.A O LEU 276.A H 2.775 1.936 TYR 277.A N GLY 273.A O TYR 277.A H 2.969 2.152 ALA 278.A N ARG 274.A O ALA 278.A H 2.986 2.137 ILE 279.A N MET 275.A O ILE 279.A H 2.919 2.081 ALA 280.A N LEU 276.A O ALA 280.A H 2.953 2.102 GLU 281.A N TYR 277.A O GLU 281.A H 2.897 2.089 LEU 282.A N ALA 278.A O LEU 282.A H 2.894 2.092 ARG 283.A N ILE 279.A O ARG 283.A H 2.951 2.120 ARG 283.A NE TYR 185.A O ARG 283.A HE 3.296 2.476 ARG 283.A NH1 LYS 190.A O ARG 283.A HH12 2.918 2.178 ARG 283.A NH2 TYR 185.A O ARG 283.A HH21 2.983 2.192 ARG 283.A NH2 ASN 188.A OD1 ARG 283.A HH21 3.404 2.880 ARG 283.A NH2 LYS 190.A O ARG 283.A HH22 2.847 2.079 ASN 284.A N ALA 280.A O ASN 284.A H 3.185 2.548 ASN 284.A N GLU 281.A O ASN 284.A H 2.989 2.299 ASP 285.A N LEU 282.A O ASP 285.A H 2.841 2.041 SER 286.A N GLU 281.A O SER 286.A H 3.032 2.287 SER 286.A OG GLU 281.A O SER 286.A HG 3.204 2.506 ASN 288.A N GLU 281.A OE1 ASN 288.A H 3.081 2.306 ASN 288.A ND2 GLU 281.A OE1 ASN 288.A HD22 2.935 2.174 ALA 291.A N GLU 141.A O ALA 291.A H 2.998 2.151 ASN 293.A ND2 GLU 141.A OE1 ASN 293.A HD22 3.119 2.192 ALA 294.A N ALA 291.A O ALA 294.A H 3.010 2.396 GLU 295.A N ALA 291.A O GLU 295.A H 2.973 2.140 ASN 296.A N MET 292.A O ASN 296.A H 2.947 2.108 SER 297.A N ASN 293.A O SER 297.A H 3.046 2.221 LEU 298.A N ALA 294.A O LEU 298.A H 2.942 2.208 LEU 298.A N GLU 295.A O LEU 298.A H 3.083 2.464 HIS 299.A N GLU 295.A O HIS 299.A H 3.009 2.172 GLY 300.A N ASN 296.A O GLY 300.A H 2.951 2.166 ILE 301.A N HIS 299.A ND1 ILE 301.A H 3.061 2.213