Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3lvd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 5.A N SER 2.A O ALA 5.A H 3.211 2.553 ALA 5.A N SER 2.A OG ALA 5.A H 3.125 2.356 GLU 6.A N LYS 3.A O GLU 6.A H 3.083 2.340 LEU 7.A N GLY 4.A O LEU 7.A H 2.944 2.106 PHE 8.A N ALA 5.A O PHE 8.A H 3.055 2.215 VAL 12.A N GLY 35.A O VAL 12.A H 2.965 2.136 ILE 14.A N GLY 33.A O ILE 14.A H 2.887 2.119 LEU 15.A N LEU 116.A O LEU 15.A H 2.950 2.135 ILE 16.A N GLY 31.A O ILE 16.A H 2.858 2.029 GLU 17.A N ASN 118.A O GLU 17.A H.B 3.007 2.196 LEU 18.A N VAL 29.A O LEU 18.A H.B 2.855 2.041 ASN 19.A N ILE 120.A O ASN 19.A H 3.056 2.236 ASN 19.A ND2 GLU 121.A OE2 ASN 19.A HD22 3.009 2.060 GLY 20.A N PHE 27.A O GLY 20.A H 2.848 1.995 ASP 21.A N LEU 122.A O ASP 21.A H 3.031 2.357 VAL 22.A N HIS 25.A O VAL 22.A H 2.895 2.080 ASN 23.A N GLY 124.A O ASN 23.A H 2.930 2.093 GLY 24.A N ASP 21.A OD1 GLY 24.A H 2.992 2.349 HIS 25.A N VAL 22.A O HIS 25.A H 2.906 2.058 HIS 25.A ND1 VAL 22.A O no hydrogen 2.958 N/A LYS 26.A NZ ASP 21.A OD2 LYS 26.A HZ3 2.830 2.122 PHE 27.A N GLY 20.A O PHE 27.A H 3.023 2.233 SER 28.A N THR 50.A OG1 SER 28.A H 3.053 2.260 VAL 29.A N LEU 18.A O VAL 29.A H 2.892 2.080 SER 30.A N ILE 47.A O SER 30.A H.C 3.032 2.217 GLY 31.A N ILE 16.A O GLY 31.A H 2.738 1.934 GLU 32.A N LYS 45.A O GLU 32.A H 2.974 2.197 GLY 33.A N ILE 14.A O GLY 33.A H 3.160 2.388 GLU 34.A N THR 43.A O GLU 34.A H 3.032 2.240 GLY 35.A N VAL 12.A O GLY 35.A H 2.916 2.124 ASP 36.A N LYS 41.A O ASP 36.A H 2.818 2.002 TYR 39.A N ASP 36.A O TYR 39.A H 3.196 2.505 LYS 41.A N ASP 36.A O LYS 41.A H.A 2.997 2.165 LEU 42.A N GLU 219.A O LEU 42.A H 2.914 2.098 THR 43.A N GLU 34.A O THR 43.A H 3.082 2.241 LEU 44.A N TYR 217.A O LEU 44.A H 2.891 2.068 LYS 45.A N GLU 32.A O LYS 45.A H 2.929 2.086 LYS 45.A NZ GLU 210.A OE1 LYS 45.A HZ1 2.806 1.864 PHE 46.A N MET 215.A O PHE 46.A H 2.927 2.097 ILE 47.A N SER 30.A O ILE 47.A H.A 2.859 2.059 CYS 48.A N ASP 213.A O CYS 48.A H 2.934 2.083 THR 49.A N SER 28.A O THR 49.A H 2.928 2.177 LEU 53.A N ASP 213.A OD2 LEU 53.A H 2.900 2.053 TRP 57.A NE1 ASP 213.A OD1 TRP 57.A HE1 2.935 2.076 THR 59.A N PRO 56.A O THR 59.A H 3.029 2.278 THR 59.A OG1 PRO 56.A O THR 59.A HG1 2.902 2.081 LEU 60.A N TRP 57.A O LEU 60.A H 2.982 2.149 VAL 61.A N PRO 58.A O VAL 61.A H 3.323 2.480 THR 62.A OG1 HIS 178.A NE2 THR 62.A HG1 2.797 1.980 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 2.913 2.061 PHE 68.A N VAL 65.A O PHE 68.A H 3.060 2.207 SER 69.A N GLN 66.A O SER 69.A H.A 3.236 2.385 ARG 70.A N VAL 221.A O ARG 70.A H 2.996 2.146 TYR 71.A OH HIS 196.A NE2 TYR 71.A HH 2.798 2.176 MET 75.A N PRO 72.A O MET 75.A H.A 2.850 2.004 LYS 76.A N ASP 73.A O LYS 76.A H 3.253 2.392 LYS 76.A NZ TYR 71.A O LYS 76.A HZ2 2.811 1.964 LYS 76.A NZ ASP 73.A OD1 LYS 76.A HZ3 3.218 2.331 GLN 77.A N GLN 77.A OE1 GLN 77.A H 2.846 2.048 HIS 78.A N MET 75.A O HIS 78.A H 2.847 2.022 ASP 79.A N LYS 76.A O ASP 79.A H 3.393 2.564 LYS 82.A N ASP 79.A OD1 LYS 82.A H 3.199 2.356 LYS 82.A NZ SER 69.A O LYS 82.A HZ1 2.805 1.944 LYS 82.A NZ ASP 79.A OD2 LYS 82.A HZ3 2.768 2.098 SER 83.A N ASP 79.A O SER 83.A H 3.345 2.556 SER 83.A OG PHE 80.A O SER 83.A HG 2.727 2.202 ALA 84.A N PHE 80.A O ALA 84.A H 3.112 2.442 MET 85.A N LYS 82.A O MET 85.A H 3.033 2.192 GLU 87.A N GLU 87.A OE1.A GLU 87.A H.A 2.936 2.103 GLY 88.A N ALA 84.A O GLY 88.A H 2.832 2.030 TYR 89.A N VAL 109.A O TYR 89.A H 2.958 2.199 ILE 90.A N THR 183.A O ILE 90.A H 2.791 1.981 GLN 91.A N ALA 107.A O GLN 91.A H 2.917 2.112 GLU 92.A N GLN 181.A O GLU 92.A H 2.966 2.123 ARG 93.A N SER 105.A O ARG 93.A H 3.002 2.189 ARG 93.A NE GLN 180.A OE1 ARG 93.A HE 2.855 2.124 ARG 93.A NH1 THR 62.A O ARG 93.A HH12 2.831 2.026 ARG 93.A NH2 GLN 180.A OE1 ARG 93.A HH21 2.930 2.261 THR 94.A N TYR 179.A O THR 94.A H 2.972 2.207 ILE 95.A N TYR 103.A O ILE 95.A H 2.780 1.959 PHE 96.A N ASP 177.A O PHE 96.A H 2.952 2.129 PHE 97.A N GLY 101.A O PHE 97.A H 2.930 2.106 GLU 98.A N LEU 175.A O GLU 98.A H 2.916 2.113 ASP 100.A N PHE 97.A O ASP 100.A H 2.928 2.182 GLY 101.A N ASP 100.A OD1 GLY 101.A H 2.820 2.222 ASN 102.A N THR 125.A O ASN 102.A H 3.095 2.292 TYR 103.A N ILE 95.A O TYR 103.A H 2.891 2.139 LYS 104.A N THR 123.A O LYS 104.A H 2.782 1.968 SER 105.A N ARG 93.A O SER 105.A H 2.995 2.179 ARG 106.A N GLU 121.A O ARG 106.A H 2.940 2.148 ARG 106.A NH1 GLU 108.A OE2 ARG 106.A HH12 3.175 2.350 ARG 106.A NH2 GLU 108.A OE2 ARG 106.A HH22 3.480 2.746 ALA 107.A N GLN 91.A O ALA 107.A H 2.877 2.090 GLU 108.A N ARG 119.A O GLU 108.A H 3.011 2.221 VAL 109.A N TYR 89.A O VAL 109.A H 2.982 2.128 LYS 110.A N VAL 117.A O LYS 110.A H 3.059 2.275 LYS 110.A NZ GLU 108.A OE1 LYS 110.A HZ2 3.335 2.423 PHE 111.A N PRO 86.A O PHE 111.A H 3.054 2.240 GLU 112.A N THR 115.A O GLU 112.A H 2.878 2.058 THR 115.A N GLU 112.A O THR 115.A H 3.075 2.232 THR 115.A OG1 ASP 114.A OD1.B THR 115.A HG1 2.996 2.250 LEU 116.A N PRO 13.A O LEU 116.A H 2.917 2.109 VAL 117.A N LYS 110.A O VAL 117.A H 2.863 2.007 ASN 118.A N LEU 15.A O ASN 118.A H 2.860 2.045 ASN 118.A ND2 THR 63.A O ASN 118.A HD21 3.627 2.728 ASN 118.A ND2 LEU 64.A O ASN 118.A HD22 3.030 2.335 ARG 119.A N GLU 108.A O ARG 119.A H 2.954 2.126 ARG 119.A NE GLU 17.A OE1.B ARG 119.A HE 3.143 2.265 ARG 119.A NH1 GLU 112.A OE1 ARG 119.A HH12 3.354 2.740 ARG 119.A NH1 GLU 112.A OE2 ARG 119.A HH12 2.740 1.888 ARG 119.A NH2 GLU 112.A OE1 ARG 119.A HH22 2.732 1.929 ARG 119.A NH2 GLU 112.A OE2 ARG 119.A HH22 3.564 2.965 ILE 120.A N GLU 17.A O ILE 120.A H 2.825 2.015 GLU 121.A N ARG 106.A O GLU 121.A H 2.907 2.062 LEU 122.A N ASN 19.A O LEU 122.A H 2.961 2.170 THR 123.A N LYS 104.A O THR 123.A H.A 2.842 2.002 GLY 124.A N ASP 21.A O GLY 124.A H 2.751 1.921 THR 125.A N ASN 102.A O THR 125.A H 2.984 2.198 LYS 128.A N ASP 100.A OD1 LYS 128.A H 2.844 2.025 LYS 128.A NZ ASP 99.A O LYS 128.A HZ3 3.117 2.497 GLY 131.A N LYS 128.A O GLY 131.A H 2.995 2.151 GLY 135.A N GLY 131.A O GLY 135.A H 2.903 2.165 ASN 136.A N ILE 133.A O ASN 136.A H 3.111 2.321 LYS 137.A N ASN 132.A O LYS 137.A H 3.024 2.180 LYS 137.A NZ ASP 130.A O LYS 137.A HZ2 2.886 2.258 GLU 139.A N ASN 167.A O GLU 139.A H 2.893 2.071 ASN 141.A N GLU 139.A O ASN 141.A H 2.998 2.368 ASN 141.A ND2 GLU 139.A OE1 ASN 141.A HD21 3.133 2.245 ASN 143.A ND2 ARG 165.A O ASN 143.A HD22 2.831 1.924 ASN 143.A ND2 ASN 167.A OD1 ASN 143.A HD21 3.085 2.124 HIS 145.A N THR 200.A O HIS 145.A H 2.912 2.116 ASN 146.A ND2 TYR 148.A OH ASN 146.A HD22 3.345 2.470 VAL 147.A N LEU 198.A O VAL 147.A H 2.874 2.061 TYR 148.A N ASN 161.A O TYR 148.A H 3.014 2.173 ILE 149.A N HIS 196.A O ILE 149.A H 2.898 2.045 MET 150.A N LYS 159.A O MET 150.A H 2.991 2.170 THR 151.A OG1 PRO 193.A O THR 151.A HG1 2.683 1.986 ASP 152.A N GLY 157.A O ASP 152.A H 2.835 1.990 LYS 155.A N ASP 152.A O LYS 155.A H 3.043 2.287 ASN 156.A N LYS 153.A O ASN 156.A H 3.131 2.300 GLY 157.A N ASP 152.A O GLY 157.A H 3.319 2.462 ILE 158.A N ASN 182.A O ILE 158.A H 3.075 2.276 LYS 159.A N MET 150.A O LYS 159.A H 2.933 2.118 VAL 160.A N GLN 180.A O VAL 160.A H 2.805 2.013 ASN 161.A N TYR 148.A O ASN 161.A H 2.932 2.151 PHE 162.A N HIS 178.A O PHE 162.A H 3.223 2.420 ILE 164.A N ALA 176.A O ILE 164.A H 2.858 2.040 ARG 165.A N HIS 145.A NE2 ARG 165.A H 2.880 2.033 HIS 166.A N GLN 174.A O HIS 166.A H 2.853 2.010 ILE 168.A N SER 172.A O ILE 168.A H 2.999 2.164 GLU 169.A N LYS 137.A O GLU 169.A H.A 2.943 2.113 GLY 171.A N ILE 168.A O GLY 171.A H 2.901 2.080 SER 172.A N ASP 170.A OD1 SER 172.A H 2.913 2.065 GLN 174.A N HIS 166.A O GLN 174.A H 2.886 2.047 LEU 175.A N GLU 98.A OE1 LEU 175.A H 3.044 2.189 ALA 176.A N ILE 164.A O ALA 176.A H 2.871 2.086 ASP 177.A N PHE 96.A O ASP 177.A H 2.905 2.074 HIS 178.A N PHE 162.A O HIS 178.A H 2.775 1.932 HIS 178.A ND1 ALA 176.A O no hydrogen 2.819 N/A TYR 179.A N THR 94.A O TYR 179.A H 2.946 2.098 GLN 180.A N VAL 160.A O GLN 180.A H 2.911 2.236 GLN 180.A NE2 GLN 66.A OE1 GLN 180.A HE21 2.932 2.094 GLN 180.A NE2 ASN 182.A OD1 GLN 180.A HE22 2.804 1.952 GLN 181.A N GLU 92.A O GLN 181.A H 2.927 2.127 GLN 181.A NE2 ASN 182.A O GLN 181.A HE22 3.548 2.833 ASN 182.A N ILE 158.A O ASN 182.A H 2.916 2.097 ASN 182.A ND2 GLN 91.A OE1 ASN 182.A HD21 2.855 1.918 THR 183.A N ILE 90.A O THR 183.A H.B 2.968 2.189 ILE 185.A N GLY 88.A O ILE 185.A H 2.854 2.001 LEU 191.A N SER 83.A OG LEU 191.A H 2.873 2.043 HIS 196.A N ILE 149.A O HIS 196.A H 3.191 2.397 HIS 196.A ND1 ASP 194.A O no hydrogen 2.839 N/A TYR 197.A N ALA 224.A O TYR 197.A H 3.166 2.314 LEU 198.A N VAL 147.A O LEU 198.A H 2.751 1.982 SER 199.A N THR 222.A O SER 199.A H 2.827 2.019 THR 200.A N HIS 145.A O THR 200.A H.A 2.907 2.073 THR 200.A OG1.B HIS 145.A O THR 200.A HG1.B 2.842 2.073 GLN 201.A N PHE 220.A O GLN 201.A H 2.885 2.099 ALA 203.A N PHE 218.A O ALA 203.A H 2.849 2.073 SER 205.A N ILE 216.A O SER 205.A H.A 2.802 1.988 LYS 206.A NZ TYR 140.A OH LYS 206.A HZ3 3.569 2.792 ASP 207.A N HIS 214.A NE2 ASP 207.A H 2.905 2.056 ASN 209.A N ASP 207.A OD1 ASN 209.A H 2.951 2.112 GLU 210.A N ASP 207.A O GLU 210.A H 3.003 2.148 ARG 212.A N GLU 210.A OE2 ARG 212.A H 2.857 2.020 ARG 212.A NE GLU 210.A OE2 ARG 212.A HE 2.909 1.980 ARG 212.A NH2 GLU 210.A OE1 ARG 212.A HH21 2.917 2.105 HIS 214.A ND1 ARG 212.A O no hydrogen 2.907 N/A MET 215.A N PHE 46.A O MET 215.A H 2.954 2.186 ILE 216.A N SER 205.A O ILE 216.A H 2.917 2.064 TYR 217.A N LEU 44.A O TYR 217.A H 2.792 1.962 PHE 218.A N ALA 203.A O PHE 218.A H 3.028 2.190 GLU 219.A N LEU 42.A O GLU 219.A H 3.081 2.259 PHE 220.A N GLN 201.A O PHE 220.A H 2.857 2.024 VAL 221.A N GLY 40.A O VAL 221.A H.B 2.825 2.035 THR 222.A N SER 199.A O THR 222.A H 3.064 2.271 ALA 223.A N ARG 70.A O ALA 223.A H 2.840 2.015 ALA 224.A N TYR 197.A O ALA 224.A H 2.859 2.079