Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3n9r_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H1 3.055 2.240 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H2 2.843 2.157 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.813 2.002 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.214 2.389 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 2.930 2.129 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 3.027 2.255 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.042 2.215 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.834 2.026 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ3 3.309 2.669 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.174 2.349 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.868 2.037 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.936 2.148 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.994 2.228 GLY 16.A N ALA 12.A O GLY 16.A H 2.697 2.062 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 2.987 2.239 GLY 18.A N LEU 291.A O GLY 18.A H 2.937 2.079 VAL 19.A N ASN 240.A O VAL 19.A H 2.759 1.947 ALA 21.A N VAL 242.A O ALA 21.A H 2.933 2.096 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.983 2.169 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD21 3.160 2.326 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.105 2.345 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.889 2.168 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.180 2.334 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.156 2.324 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.830 1.993 ASN 31.A ND2 GLN 277.A OE1 ASN 31.A HD22 2.936 2.096 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.194 2.347 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 3.100 2.275 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.095 2.246 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.882 2.044 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.024 2.223 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.035 2.206 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.880 2.068 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.925 2.149 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.895 2.140 ASN 41.A ND2 ASN 295.A OD1 ASN 41.A HD22 3.046 2.189 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 3.028 2.192 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 3.008 2.191 PHE 45.A N GLY 20.A O PHE 45.A H 3.452 2.610 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.916 2.063 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.889 2.062 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE22 2.980 2.241 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 2.959 2.147 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 3.033 2.207 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.944 2.138 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 3.013 2.228 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 3.050 2.264 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.942 2.122 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.695 1.969 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 2.976 2.286 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.031 2.213 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 3.076 2.219 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.996 2.185 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.855 2.017 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.290 2.473 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.892 2.046 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.096 2.303 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 3.024 2.228 CYS 69.A N VAL 65.A O CYS 69.A H 2.860 2.043 CYS 69.A SG VAL 65.A O CYS 69.A HG 3.418 2.494 GLU 70.A N LYS 66.A O GLU 70.A H 3.167 2.391 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 3.039 2.308 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 2.998 2.285 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.186 2.332 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 2.860 2.040 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 3.021 2.218 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 3.052 2.284 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.883 2.093 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.980 2.178 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.975 2.147 HIS 83.A ND1 ASP 104.A OD2 HIS 83.A HD1 2.785 2.001 GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.837 2.181 THR 85.A N GLU 50.A OE2 THR 85.A H 2.851 2.078 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 85.A HG1 2.910 2.279 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE2 THR 85.A HG1 3.220 2.407 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 2.962 2.154 SER 89.A OG GLU 50.A OE2 SER 89.A HG 2.636 1.869 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.266 2.428 CYS 90.A SG THR 86.A O CYS 90.A HG 3.644 2.702 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.869 2.045 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.909 2.091 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.095 2.285 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.935 2.117 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.959 2.124 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.972 2.262 ALA 96.A N ALA 93.A O ALA 96.A H 3.152 2.539 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.172 2.524 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.233 2.494 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 3.055 2.239 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.928 2.134 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.762 2.126 SER 100.A N LEU 79.A O SER 100.A H 3.162 2.556 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.903 2.107 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.849 2.042 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 2.952 2.178 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.854 2.001 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.042 2.183 HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 2.972 2.156 ALA 109.A N GLU 112.A OE1 ALA 109.A H 3.227 2.477 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.938 2.095 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD21 2.937 2.133 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.903 2.079 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 2.981 2.152 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 2.990 2.131 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.874 2.024 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.913 2.235 THR 117.A OG1 ASN 113.A OD1 THR 117.A HG1 3.046 2.601 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.848 2.016 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.028 2.291 LYS 119.A N LEU 116.A O LYS 119.A H 3.116 2.531 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 3.022 2.188 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.842 2.037 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 3.059 2.234 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.300 2.468 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.812 1.977 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.805 1.953 HIS 125.A NE2 ASP 160.A OD2 HIS 125.A HE2 2.810 1.966 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.190 2.380 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.910 2.159 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.167 2.313 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.880 2.027 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.273 2.423 VAL 131.A N ASP 160.A OD2 VAL 131.A H 2.776 2.004 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.878 2.054 ALA 133.A N TYR 161.A O ALA 133.A H 3.206 2.441 LEU 135.A N ALA 163.A O LEU 135.A H 3.134 2.328 ARG 137.A N VAL 143.A O ARG 137.A H 2.842 2.018 VAL 145.A N ALA 165.A O VAL 145.A H 3.045 2.190 LYS 148.A N ASN 146.A OD1 LYS 148.A H 3.035 2.380 GLU 149.A N ASN 146.A OD1 GLU 149.A H 3.202 2.381 ALA 150.A N ASN 146.A O ALA 150.A H 2.913 2.116 GLU 151.A N PRO 147.A O GLU 151.A H 2.962 2.173 GLN 152.A N LYS 148.A O GLN 152.A H 3.244 2.411 GLN 152.A NE2 GLU 156.A OE2 GLN 152.A HE22 2.893 2.203 PHE 153.A N GLU 149.A O PHE 153.A H 2.819 1.984 VAL 154.A N ALA 150.A O VAL 154.A H 2.944 2.107 LYS 155.A N GLU 151.A O LYS 155.A H 3.159 2.320 GLU 156.A N GLN 152.A O GLU 156.A H 2.944 2.145 SER 157.A N PHE 153.A O SER 157.A H 2.959 2.151 GLN 158.A N VAL 154.A O GLN 158.A H 2.991 2.246 ASP 160.A N VAL 131.A O ASP 160.A H 3.031 2.344 TYR 161.A N VAL 131.A O TYR 161.A H 3.151 2.349 LEU 162.A N PRO 196.A O LEU 162.A H 3.321 2.558 ALA 163.A N ALA 133.A O ALA 163.A H 2.811 1.991 ALA 165.A N LEU 135.A O ALA 165.A H 3.057 2.251 THR 168.A OG1 HIS 200.A O THR 168.A HG1 2.656 1.936 LYS 174.A N LYS 224.A O LYS 174.A H 3.014 2.169 LYS 174.A NZ SER 169.A O LYS 174.A HZ2 2.753 2.088 LYS 174.A NZ GLY 171.A O LYS 174.A HZ3 2.677 1.982 LYS 174.A NZ GLY 201.A O LYS 174.A HZ2 3.213 2.638 ASP 182.A N ILE 166.A O ASP 182.A H 2.903 2.070 ARG 185.A N ASP 182.A OD1 ARG 185.A H 3.086 2.246 ARG 185.A NE ASP 182.A OD2 ARG 185.A HE 2.842 1.988 ARG 185.A NH2 VAL 145.A O ARG 185.A HH21 2.761 1.941 LEU 186.A N ASP 182.A O LEU 186.A H 3.119 2.309 GLN 187.A N PHE 183.A O GLN 187.A H 2.972 2.164 GLU 188.A N GLU 184.A O GLU 188.A H 3.096 2.314 VAL 189.A N ARG 185.A O VAL 189.A H 2.999 2.158 LYS 190.A N LEU 186.A O LYS 190.A H 2.927 2.101 LYS 190.A NZ ILE 195.A O LYS 190.A HZ2 2.925 2.049 LYS 190.A NZ GLY 238.A O LYS 190.A HZ3 2.952 2.074 ARG 191.A N GLN 187.A O ARG 191.A H 2.984 2.159 ARG 191.A NE GLU 188.A OE1 ARG 191.A HE 3.216 2.402 ARG 191.A NH2 GLU 188.A OE1 ARG 191.A HH21 3.335 2.575 ARG 191.A NH2 GLU 188.A OE2 ARG 191.A HH21 3.024 2.218 LEU 192.A N GLU 188.A O LEU 192.A H 3.042 2.241 THR 193.A N VAL 189.A O THR 193.A H 2.921 2.208 THR 193.A OG1 VAL 189.A O THR 193.A HG1 2.850 2.089 ASN 194.A N LYS 190.A O ASN 194.A H 2.811 1.984 VAL 198.A N LEU 162.A O VAL 198.A H 2.836 2.091 LEU 199.A N LYS 241.A O LEU 199.A H 2.886 2.054 HIS 200.A NE2 GLU 132.A OE2 HIS 200.A HE2 2.738 1.880 ALA 202.A N ASN 243.A O ALA 202.A H 3.268 2.483 ALA 204.A N ASP 247.A OD2 ALA 204.A H 2.811 1.967 ILE 205.A N ASP 247.A OD1 ILE 205.A H 2.762 1.974 VAL 209.A N PRO 206.A O VAL 209.A H 3.043 2.422 ARG 210.A N PRO 206.A O ARG 210.A H 2.916 2.067 ARG 210.A NH1 SER 223.A O ARG 210.A HH12 3.212 2.473 ARG 210.A NH2 SER 223.A O ARG 210.A HH22 3.059 2.271 LYS 211.A N ASP 207.A O LYS 211.A H 2.872 2.053 LYS 211.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 211.A HZ3 2.945 2.191 SER 212.A N ASN 208.A O SER 212.A H 2.917 2.082 TYR 213.A N VAL 209.A O TYR 213.A H 2.969 2.153 LEU 214.A N ARG 210.A O LEU 214.A H 2.891 2.061 ASP 215.A N LYS 211.A O ASP 215.A H 2.831 2.000 ALA 216.A N SER 212.A O ALA 216.A H 3.214 2.557 ALA 216.A N TYR 213.A O ALA 216.A H 3.156 2.465 GLY 217.A N LEU 214.A O GLY 217.A H 2.985 2.168 GLY 218.A N TYR 213.A O GLY 218.A H 2.954 2.157 LYS 221.A N ASP 219.A OD1 LYS 221.A H 3.068 2.211 SER 223.A N LEU 220.A O SER 223.A H 3.045 2.217 LYS 224.A N ALA 172.A O LYS 224.A H 2.828 2.118 VAL 226.A N SER 203.A O VAL 226.A H 2.886 2.049 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.804 2.000 PHE 230.A N PRO 227.A O PHE 230.A H 2.970 2.333 LEU 231.A N PRO 227.A O LEU 231.A H 3.073 2.294 GLN 232.A N PHE 228.A O GLN 232.A H 2.989 2.174 GLU 233.A N GLU 229.A O GLU 233.A H 2.975 2.166 SER 234.A N PHE 230.A O SER 234.A H 2.900 2.142 VAL 235.A N LEU 231.A O VAL 235.A H 3.114 2.313 LYS 236.A N GLN 232.A O LYS 236.A H 3.009 2.173 GLY 237.A N GLU 233.A O GLY 237.A H 2.931 2.214 GLY 238.A N VAL 235.A O GLY 238.A H 3.021 2.218 ILE 239.A N SER 234.A O ILE 239.A H 2.991 2.149 ASN 240.A N LEU 197.A O ASN 240.A H 2.852 2.024 ASN 240.A ND2 TYR 17.A O ASN 240.A HD22 3.104 2.250 LYS 241.A N LEU 197.A O LYS 241.A H 3.184 2.415 LYS 241.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 241.A HZ1 2.655 1.911 LYS 241.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 241.A HZ2 2.944 2.080 LYS 241.A NZ ASN 243.A OD1 LYS 241.A HZ3 2.867 2.014 VAL 242.A N VAL 19.A O VAL 242.A H 2.991 2.220 ASN 243.A N LEU 199.A O ASN 243.A H 2.935 2.098 THR 244.A N ALA 21.A O THR 244.A H 2.911 2.086 THR 244.A OG1 VAL 242.A O THR 244.A HG1 3.062 2.282 ASP 247.A N SER 203.A OG ASP 247.A H 3.061 2.239 ARG 249.A N ASP 245.A O ARG 249.A H 3.091 2.282 ARG 249.A NE ASP 245.A OD1 ARG 249.A HE 2.859 2.026 ARG 249.A NH2 ASP 245.A OD2 ARG 249.A HH21 2.935 2.186 ILE 250.A N THR 246.A O ILE 250.A H 2.949 2.113 ALA 251.A N ASP 247.A O ALA 251.A H 3.153 2.308 PHE 252.A N LEU 248.A O PHE 252.A H 3.149 2.336 ILE 253.A N ARG 249.A O ILE 253.A H 2.956 2.097 ALA 254.A N ILE 250.A O ALA 254.A H 2.942 2.132 GLU 255.A N PHE 252.A O GLU 255.A H 3.145 2.533 VAL 256.A N PHE 252.A O VAL 256.A H 3.242 2.450 ARG 257.A N ILE 253.A O ARG 257.A H 2.775 1.935 LYS 258.A N ALA 254.A O LYS 258.A H 2.993 2.237 VAL 259.A N GLU 255.A O VAL 259.A H 3.299 2.447 ALA 260.A N VAL 256.A O ALA 260.A H 3.069 2.222 ASN 261.A N ARG 257.A O ASN 261.A H 2.802 1.998 ASN 261.A ND2 ALA 216.A O ASN 261.A HD21 2.611 1.958 GLU 262.A N LYS 258.A O GLU 262.A H 3.044 2.332 GLU 262.A N VAL 259.A O GLU 262.A H 3.195 2.547 ASP 263.A N VAL 259.A O ASP 263.A H 3.078 2.224 LYS 264.A NZ ALA 260.A O LYS 264.A HZ3 3.011 2.154 SER 265.A N ASP 263.A OD1 SER 265.A H 3.078 2.277 SER 265.A OG ASP 263.A OD1 SER 265.A HG 2.876 2.238 GLN 266.A N ASP 263.A O GLN 266.A H 3.238 2.393 ASP 268.A N GLN 266.A OE1 ASP 268.A H 2.984 2.139 ARG 270.A N ASP 268.A OD1 ARG 270.A H 3.052 2.344 ARG 270.A NE ASP 268.A OD1 ARG 270.A HE 3.239 2.381 ARG 270.A NH2 ASP 268.A OD2 ARG 270.A HH21 3.064 2.277 LYS 271.A N ASP 268.A O LYS 271.A H 2.935 2.159 PHE 272.A N LEU 269.A O PHE 272.A H 3.024 2.348 PHE 273.A N LEU 269.A O PHE 273.A H 2.995 2.231 SER 274.A N ARG 270.A O SER 274.A H 2.926 2.099 GLN 277.A N PHE 273.A O GLN 277.A H 2.853 2.022 LEU 278.A N SER 274.A O LEU 278.A H 3.038 2.249 ALA 279.A N PRO 275.A O ALA 279.A H 3.077 2.252 LEU 280.A N ALA 276.A O LEU 280.A H 3.063 2.240 LYS 281.A N GLN 277.A O LYS 281.A H 2.782 1.930 LYS 281.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 281.A HZ2 3.116 2.469 LYS 281.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 281.A HZ2 3.125 2.246 ASN 282.A N LEU 278.A O ASN 282.A H 2.971 2.154 VAL 283.A N ALA 279.A O VAL 283.A H 3.153 2.347 VAL 284.A N LEU 280.A O VAL 284.A H 3.089 2.258 LYS 285.A N LYS 281.A O LYS 285.A H 2.877 2.040 LYS 285.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 285.A HZ2 2.789 1.949 GLU 286.A N ASN 282.A O GLU 286.A H 3.068 2.216 ARG 287.A N VAL 283.A O ARG 287.A H 3.004 2.185 ARG 287.A NH1 ASP 247.A OD2 ARG 287.A HH12 2.888 2.137 ARG 287.A NH2 ASP 247.A OD2 ARG 287.A HH22 2.859 2.095 MET 288.A N VAL 284.A O MET 288.A H 2.825 2.024 LYS 289.A N LYS 285.A O LYS 289.A H 3.203 2.395 LEU 290.A N GLU 286.A O LEU 290.A H 2.988 2.164 LEU 291.A N ARG 287.A O LEU 291.A H 2.977 2.159 GLY 292.A N MET 288.A O GLY 292.A H 3.106 2.438 ALA 294.A N MET 288.A O ALA 294.A H 3.212 2.409 ASN 295.A N GLU 40.A O ASN 295.A H 2.857 2.110 LYS 296.A N ASN 41.A O LYS 296.A H 3.069 2.387