Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3nk3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 5.A N THR 16.A O ALA 5.A H 2.904 2.067 GLN 7.A N VAL 14.A O GLN 7.A H 2.835 1.991 CYS 8.A SG GLU 101.A O no hydrogen 3.677 N/A GLN 9.A N GLN 12.A O GLN 9.A H 2.907 2.180 GLN 9.A NE2 GLN 7.A OE1 GLN 9.A HE22 3.227 2.650 GLU 10.A N GLU 10.A OE1 GLU 10.A H 2.928 2.134 GLN 12.A NE2 GLN 9.A OE1 GLN 12.A HE22 2.762 1.908 LEU 13.A N ALA 56.A O LEU 13.A H 2.980 2.190 VAL 14.A N GLN 7.A O VAL 14.A H 2.989 2.198 VAL 15.A N PHE 54.A O VAL 15.A H 2.830 2.044 THR 16.A N ALA 5.A O THR 16.A H 2.857 2.035 THR 16.A OG1 THR 53.A OG1 THR 16.A HG1 3.182 2.372 VAL 17.A N VAL 52.A O VAL 17.A H 2.817 1.967 HIS 18.A N PRO 3.A O HIS 18.A H 3.114 2.281 ARG 19.A N ASN 50.A O ARG 19.A H 2.922 2.067 ARG 19.A NE ILE 28.A O ARG 19.A HE 3.118 2.151 GLY 23.A N ASP 20.A O GLY 23.A H 3.344 2.562 ILE 28.A N ARG 19.A O ILE 28.A H 3.178 2.330 ASP 32.A N ASN 29.A O ASP 32.A H 2.942 2.140 LEU 33.A N ALA 30.A O LEU 33.A H 3.061 2.208 THR 34.A N ASN 79.A O THR 34.A H 3.095 2.302 LEU 35.A N CYS 40.A O LEU 35.A H 3.071 2.305 GLY 36.A N LEU 77.A O GLY 36.A H 2.646 1.788 ALA 39.A N GLY 36.A O ALA 39.A H 2.851 2.003 CYS 40.A N LEU 35.A O CYS 40.A H 3.052 2.221 SER 43.A N THR 53.A O SER 43.A H 2.788 1.953 SER 44.A N THR 53.A O SER 44.A H 3.356 2.562 ASN 46.A N THR 51.A O ASN 46.A H 3.170 2.351 ALA 48.A N ASN 46.A OD1 ALA 48.A H 3.339 2.498 THR 51.A N ASN 46.A O THR 51.A H 3.151 2.338 VAL 52.A N VAL 17.A O VAL 52.A H 2.873 2.084 THR 53.A N SER 44.A O THR 53.A H 2.981 2.123 PHE 54.A N VAL 15.A O PHE 54.A H 2.775 1.942 ALA 56.A N LEU 13.A O ALA 56.A H 3.116 2.300 GLY 57.A N GLU 60.A OE1 GLY 57.A H 2.987 2.144 GLU 60.A N GLY 57.A O GLU 60.A H 3.047 2.220 SER 63.A N GLU 60.A O SER 63.A H 3.263 2.433 SER 63.A OG LEU 58.A O SER 63.A HG 2.766 1.992 VAL 64.A N ARG 75.A O VAL 64.A H 2.968 2.248 GLN 66.A N ILE 73.A O GLN 66.A H 2.856 2.027 GLN 66.A NE2 GLU 137.A OE1 GLN 66.A HE21 3.428 2.625 GLN 66.A NE2 GLU 137.A OE2 GLN 66.A HE21 3.408 2.617 THR 68.A N THR 71.A O THR 68.A H 2.945 2.145 THR 68.A OG1 THR 71.A O THR 68.A HG1 2.976 2.279 THR 71.A N THR 68.A OG1 THR 71.A H 3.118 2.441 THR 71.A OG1 ASP 70.A OD1 THR 71.A HG1 3.551 2.798 LEU 72.A N TYR 104.A O LEU 72.A H 2.795 1.949 ILE 73.A N GLN 66.A O ILE 73.A H 3.013 2.161 TYR 74.A N CYS 102.A O TYR 74.A H 2.849 2.035 ARG 75.A N VAL 64.A O ARG 75.A H 2.884 2.088 ARG 75.A NE GLU 101.A OE2 ARG 75.A HE 3.096 2.232 ARG 75.A NH1 GLN 66.A OE1 ARG 75.A HH12 3.123 2.337 ARG 75.A NH2 GLN 66.A OE1 ARG 75.A HH22 3.234 2.483 THR 76.A N ILE 100.A O THR 76.A H 2.929 2.096 ILE 78.A N ILE 98.A O ILE 78.A H 2.840 2.051 ASN 79.A N THR 34.A O ASN 79.A H 2.962 2.156 ASN 79.A ND2 THR 34.A OG1 ASN 79.A HD22 3.091 2.223 ASN 79.A ND2 GLY 36.A O ASN 79.A HD21 2.944 2.093 TYR 80.A N ALA 96.A O TYR 80.A H 3.025 2.176 ASP 81.A N ASP 32.A O ASP 81.A H 2.884 2.037 VAL 89.A N ASN 87.A OD1 VAL 89.A H 3.360 2.509 ILE 90.A N ASN 87.A O ILE 90.A H 3.412 2.577 ALA 96.A N TYR 80.A O ALA 96.A H 2.910 2.145 ILE 98.A N ILE 78.A O ILE 98.A H 2.825 2.022 ILE 100.A N THR 76.A O ILE 100.A H 2.849 2.026 CYS 102.A N TYR 74.A O CYS 102.A H 2.879 2.142 CYS 102.A SG GLU 101.A O no hydrogen 3.510 N/A HIS 103.A NE2 GLU 101.A OE1 HIS 103.A HE2 2.948 2.119 TYR 104.A N LEU 72.A O TYR 104.A H 2.888 2.101 ARG 106.A N ASP 70.A O ARG 106.A H 3.289 2.438 ARG 106.A NH1 THR 68.A O ARG 106.A HH11 3.341 2.611 TRP 110.A N ASN 159.A O TRP 110.A H 3.367 2.615 PHE 113.A N SER 111.A OG PHE 113.A H 3.164 2.367 ASN 114.A N SER 111.A OG ASN 114.A H 3.397 2.558 SER 115.A N SER 111.A O SER 115.A H 3.332 2.480 GLU 121.A N SER 118.A O GLU 121.A H 3.100 2.309 ARG 122.A N GLU 120.A O ARG 122.A H 2.911 2.293 SER 126.A N GLU 154.A O SER 126.A H 3.088 2.300 ARG 128.A N GLN 152.A O ARG 128.A H 2.926 2.116 ARG 128.A NE GLU 137.A OE1 ARG 128.A HE 3.139 2.210 ARG 128.A NH1 GLU 154.A OE2 ARG 128.A HH11 3.246 2.399 ARG 128.A NH2 GLU 137.A OE1 ARG 128.A HH21 3.343 2.595 MET 130.A N ASN 150.A O MET 130.A H 2.850 2.009 SER 131.A N THR 136.A O SER 131.A H 3.010 2.187 TRP 134.A N SER 131.A O TRP 134.A H 2.752 1.918 SER 135.A N ASP 133.A OD1 SER 135.A H 3.180 2.346 ARG 138.A N LEU 129.A O ARG 138.A H 2.934 2.109 ARG 138.A NE PRO 139.A O ARG 138.A HE 2.840 2.043 ARG 138.A NH2 PRO 139.A O ARG 138.A HH21 3.316 2.737 GLN 144.A N ASP 147.A OD2 GLN 144.A H 2.935 2.156 ASP 147.A N GLN 144.A O ASP 147.A H 2.960 2.126 LEU 149.A N ILE 219.A O LEU 149.A H 2.810 2.028 ASN 150.A ND2 SER 131.A O ASN 150.A HD22 3.127 2.202 ILE 151.A N PHE 217.A O ILE 151.A H 2.902 2.093 GLN 152.A N ARG 128.A O GLN 152.A H 2.930 2.081 GLN 152.A NE2 GLU 154.A OE2 GLN 152.A HE22 2.902 2.112 ALA 153.A N LEU 215.A O ALA 153.A H 2.914 2.071 GLU 154.A N SER 126.A O GLU 154.A H 3.114 2.299 SER 156.A N VAL 124.A O SER 156.A H 3.116 2.374 VAL 161.A N TRP 110.A O VAL 161.A H 3.254 2.576 ARG 164.A N THR 241.A O ARG 164.A H 2.910 2.069 ARG 164.A NE GLU 212.A OE1 ARG 164.A HE 3.439 2.514 ARG 164.A NH2 GLU 212.A OE1 ARG 164.A HH21 3.525 2.742 LEU 165.A N GLU 212.A O LEU 165.A H 2.945 2.170 PHE 166.A N LYS 239.A O PHE 166.A H 2.874 2.056 ASP 168.A N HIS 237.A O ASP 168.A H 2.827 2.015 CYS 170.A N ILE 187.A O CYS 170.A H 3.078 2.358 VAL 171.A N THR 235.A O VAL 171.A H 3.067 2.310 ALA 172.A N TYR 184.A O ALA 172.A H 2.880 2.053 ALA 173.A N TYR 233.A O ALA 173.A H 2.906 2.128 ASP 179.A N ASP 177.A OD1 ASP 179.A H 3.248 2.411 SER 180.A N ASP 177.A O SER 180.A H 3.365 2.564 HIS 183.A ND1 SER 180.A O HIS 183.A HD1 2.882 2.099 TYR 184.A N ALA 172.A O TYR 184.A H 2.969 2.207 ILE 186.A N CYS 170.A O ILE 186.A H 3.069 2.433 ILE 187.A N CYS 170.A O ILE 187.A H 3.343 2.546 ASP 188.A N CYS 192.A O ASP 188.A H 2.938 2.111 GLY 191.A N ASP 168.A O GLY 191.A H 3.187 2.455 CYS 192.A N ASP 188.A O CYS 192.A H 2.879 2.163 CYS 192.A SG PHE 189.A O no hydrogen 3.539 N/A LEU 193.A N CYS 254.A O LEU 193.A H 2.908 2.053 ASP 195.A N ILE 186.A O ASP 195.A H 3.269 2.498 GLY 196.A N LEU 193.A O GLY 196.A H 3.317 2.512 ARG 197.A N VAL 194.A O ARG 197.A H 3.231 2.396 ARG 197.A NE GLU 277.A OE2 ARG 197.A HE 3.056 2.154 ARG 197.A NH1 ARG 197.A O ARG 197.A HH11 3.142 2.359 ARG 197.A NH2 GLU 277.A OE1 ARG 197.A HH21 2.921 2.087 ARG 197.A NH2 GLU 277.A OE2 ARG 197.A HH21 3.349 2.651 THR 201.A OG1 VAL 198.A O THR 201.A HG1 3.068 2.303 SER 202.A N ASP 220.A OD2 SER 202.A H 2.761 1.968 SER 203.A OG ASP 195.A OD2 SER 203.A HG 2.568 1.788 ALA 204.A N ARG 218.A O ALA 204.A H 3.118 2.379 ILE 206.A N ARG 216.A O ILE 206.A H 2.928 2.098 ARG 209.A NE GLU 267.A OE1 ARG 209.A HE 3.051 2.152 ARG 209.A NH1 LEU 165.A O ARG 209.A HH12 2.805 2.015 ARG 209.A NH1 VAL 214.A O ARG 209.A HH11 3.047 2.274 ARG 209.A NH2 LEU 165.A O ARG 209.A HH22 3.066 2.364 ARG 209.A NH2 GLU 267.A OE2 ARG 209.A HH21 2.833 2.003 ARG 211.A NE ASP 213.A OD1 ARG 211.A HE 2.868 2.065 ARG 211.A NE ASP 213.A OD2 ARG 211.A HE 3.398 2.607 ARG 211.A NH2 ASP 213.A OD2 ARG 211.A HH21 3.095 2.318 VAL 214.A N ARG 211.A O VAL 214.A H 3.204 2.399 LEU 215.A N ALA 153.A O LEU 215.A H 3.010 2.178 ARG 216.A NE GLN 152.A OE1 ARG 216.A HE 2.751 1.876 ARG 216.A NH2 GLN 152.A OE1 ARG 216.A HH21 2.947 2.232 PHE 217.A N ILE 151.A O PHE 217.A H 3.020 2.203 ARG 218.A N ALA 204.A O ARG 218.A H 2.865 2.038 ILE 219.A N LEU 149.A O ILE 219.A H 2.848 2.022 ASP 220.A N SER 203.A OG ASP 220.A H 3.224 2.394 VAL 221.A N ASP 147.A O VAL 221.A H 3.064 2.205 ASP 227.A N PHE 224.A O ASP 227.A H 3.254 2.420 ARG 229.A N ASP 227.A OD1 ARG 229.A H 3.007 2.210 ASN 230.A N ASP 227.A OD1 ASN 230.A H 3.345 2.605 ASN 230.A N ASP 227.A OD2 ASN 230.A H 2.927 2.253 TYR 233.A N ALA 173.A O TYR 233.A H 2.925 2.067 THR 235.A N VAL 171.A O THR 235.A H 2.949 2.131 HIS 237.A N SER 169.A O HIS 237.A H 2.819 2.018 LYS 239.A N PHE 166.A O LYS 239.A H 3.032 2.222 LYS 239.A NZ GLN 250.A O LYS 239.A HZ1 2.647 1.707 THR 241.A N ARG 164.A O THR 241.A H 3.135 2.315 ALA 243.A N PRO 162.A O ALA 243.A H 3.054 2.335 GLN 245.A N PRO 242.A O GLN 245.A H 3.060 2.213 ASP 248.A N ASN 251.A O ASP 248.A H 3.156 2.378 GLN 250.A N ASP 248.A OD1 GLN 250.A H 3.246 2.451 ASN 251.A N ASP 248.A O ASN 251.A H 2.808 2.055 ASN 251.A N ASP 248.A OD1 ASN 251.A H 2.904 2.291 ASN 251.A ND2 ASP 248.A OD1 ASN 251.A HD22 2.982 2.038 LYS 252.A NZ PHE 189.A O LYS 252.A HZ2 2.980 2.330 LYS 252.A NZ ASN 190.A O LYS 252.A HZ1 2.953 2.021 LYS 252.A NZ PRO 249.A O LYS 252.A HZ3 3.116 2.251 CYS 254.A N GLY 191.A O CYS 254.A H 2.979 2.140 SER 255.A N VAL 264.A O SER 255.A H 3.065 2.216 ASN 257.A N THR 262.A O ASN 257.A H 2.853 1.994 LYS 258.A NZ GLY 196.A O LYS 258.A HZ2 2.680 1.942 LYS 258.A NZ VAL 198.A O LYS 258.A HZ1 3.170 2.363 LYS 258.A NZ THR 201.A O LYS 258.A HZ3 2.962 2.015 ALA 259.A N ASN 257.A OD1 ALA 259.A H 3.120 2.506 ASN 261.A N LYS 258.A O ASN 261.A H 3.325 2.610 THR 262.A N ASN 257.A O THR 262.A H 3.302 2.541 TRP 263.A NE1 GLU 277.A OE2 TRP 263.A HE1 3.194 2.339 VAL 264.A N SER 255.A O VAL 264.A H 2.820 2.040 VAL 266.A N ALA 253.A O VAL 266.A H 2.891 2.152 VAL 272.A N SER 269.A O VAL 272.A H 3.082 2.228 ASN 274.A N ASP 271.A O ASN 274.A H 3.371 2.526 CYS 275.A SG VAL 272.A O no hydrogen 3.941 N/A CYS 276.A N CYS 273.A O CYS 276.A H 2.988 2.185 THR 278.A OG1 CYS 275.A O THR 278.A HG1 2.858 2.306 GLY 279.A N CYS 275.A O GLY 279.A H 3.067 2.419 GLY 279.A N CYS 276.A O GLY 279.A H 3.193 2.525 CYS 281.A SG PHE 189.A O no hydrogen 3.577 N/A GLU 282.A N ASN 280.A OD1 GLU 282.A H 3.117 2.351