Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3ony_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ GLU 244.A O LYS 2.A HZ2 3.097 2.337 THR 10.A N GLU 13.A OE1 THR 10.A H 3.118 2.311 GLU 13.A N THR 10.A O GLU 13.A H 2.914 2.081 LEU 14.A N LEU 11.A O LEU 14.A H 3.276 2.448 THR 15.A N GLU 236.A OE1 THR 15.A H 2.794 1.957 THR 15.A OG1 GLU 236.A OE1 THR 15.A HG1 3.517 2.795 THR 15.A OG1 GLU 236.A OE2 THR 15.A HG1 2.868 2.085 ASN 16.A N LEU 21.A O ASN 16.A H 2.830 1.982 ASN 16.A ND2 SER 216.A OG ASN 16.A HD22 2.911 2.119 ASN 16.A ND2 ILE 229.A O ASN 16.A HD21 3.162 2.490 ARG 18.A N ASN 16.A OD1 ARG 18.A H 2.864 2.041 ARG 18.A NE ASP 101.A OD1 ARG 18.A HE 3.180 2.441 ARG 18.A NE ASP 101.A OD2 ARG 18.A HE 2.973 2.198 ARG 18.A NH1 GLN 182.A OE1 ARG 18.A HH12 2.985 2.296 ARG 18.A NH1 ASP 230.A O ARG 18.A HH11 2.842 2.017 ARG 18.A NH2 ASP 101.A OD1 ARG 18.A HH21 2.939 2.143 ARG 18.A NH2 GLN 182.A O ARG 18.A HH22 2.775 2.038 ILE 23.A N LEU 14.A O ILE 23.A H 3.019 2.166 ASP 24.A N ARG 215.A O ASP 24.A H 2.860 2.026 VAL 25.A N ARG 215.A O VAL 25.A H 3.201 2.390 TYR 27.A N PHE 213.A O TYR 27.A H 3.005 2.333 THR 28.A N GLY 285.A O THR 28.A H 3.072 2.259 ASN 29.A ND2 GLU 32.A OE1 ASN 29.A HD22 3.521 2.954 GLU 32.A N ASN 29.A O GLU 32.A H 3.114 2.271 ALA 34.A N GLU 32.A OE2 ALA 34.A H 3.013 2.172 GLN 37.A NE2 ALA 199.A O GLN 37.A HE22 2.988 2.154 GLN 39.A N ASP 101.A OD2 GLN 39.A H 2.886 2.127 GLN 39.A NE2 GLN 37.A O GLN 39.A HE22 2.885 2.066 GLN 39.A NE2 ALA 199.A O GLN 39.A HE21 3.214 2.366 ASN 40.A N ASP 101.A OD2 ASN 40.A H 3.057 2.197 ASN 40.A ND2 THR 99.A O ASN 40.A HD21 2.907 2.134 ARG 42.A N THR 53.A OG1 ARG 42.A H 2.843 1.987 ARG 42.A NH1 CYS 38.A O ARG 42.A HH11 2.887 2.102 ARG 42.A NH1 PRO 200.A O ARG 42.A HH12 3.045 2.298 ARG 42.A NH2 PRO 200.A O ARG 42.A HH22 2.921 2.133 CYS 43.A SG THR 44.A O CYS 43.A HG 3.420 2.256 THR 44.A N GLU 48.A O THR 44.A H 3.055 2.240 LEU 45.A N ARG 273.A O LEU 45.A H 2.893 2.114 GLY 47.A N THR 44.A O GLY 47.A H 2.960 2.121 GLU 48.A N THR 44.A OG1 GLU 48.A H 3.027 2.195 GLN 50.A N ARG 42.A O GLN 50.A H 3.000 2.179 THR 52.A N GLN 39.A O THR 52.A H 2.949 2.255 THR 52.A OG1 ASN 40.A OD1 THR 52.A HG1 2.820 2.044 THR 53.A N GLN 50.A O THR 53.A H 3.059 2.223 THR 53.A OG1 GLN 39.A O THR 53.A HG1 2.941 2.264 THR 53.A OG1 GLN 50.A O THR 53.A HG1 3.110 2.578 GLN 54.A NE2 LEU 56.A O GLN 54.A HE21 3.011 2.187 LEU 56.A N GLN 54.A OE1 LEU 56.A H 3.093 2.373 GLY 59.A N LEU 56.A O GLY 59.A H 2.958 2.125 CYS 61.A N GLY 98.A O CYS 61.A H 2.754 2.027 CYS 61.A SG ARG 18.A O CYS 61.A HG 3.496 2.705 ALA 62.A N GLY 59.A O ALA 62.A H 3.269 2.424 ARG 64.A NH1 LEU 82.A O ARG 64.A HH11 2.877 2.102 GLY 65.A N THR 164.A O GLY 65.A H 3.027 2.296 LYS 66.A N THR 78.A O LYS 66.A H 3.205 2.519 THR 68.A N ASN 76.A O THR 68.A H 2.875 2.043 THR 68.A OG1 ASN 76.A OD1 THR 68.A HG1 2.830 2.397 VAL 71.A N HIS 74.A O VAL 71.A H 2.990 2.148 THR 73.A N THR 152.A O THR 73.A H 3.235 2.386 TRP 75.A N PHE 150.A O TRP 75.A H 2.848 2.070 TRP 75.A NE1 THR 152.A OG1 TRP 75.A HE1 2.971 2.137 ASN 76.A N GLN 69.A O ASN 76.A H 2.978 2.130 MET 77.A N ILE 148.A O MET 77.A H 2.917 2.069 THR 78.A N LYS 66.A O THR 78.A H 2.895 2.228 VAL 79.A N GLY 146.A O VAL 79.A H 2.848 2.047 THR 80.A N ARG 64.A O THR 80.A H 2.870 2.047 THR 80.A OG1 ASN 81.A O THR 80.A HG1 2.947 2.197 ASN 81.A N THR 85.A O ASN 81.A H 2.955 2.192 ASN 81.A ND2 THR 85.A OG1 ASN 81.A HD22 2.936 2.084 GLY 84.A N ASN 81.A O GLY 84.A H 2.940 2.097 THR 85.A N ASN 83.A OD1 THR 85.A H 2.995 2.144 THR 85.A OG1 ASN 83.A OD1 THR 85.A HG1 2.784 1.978 THR 90.A N ASP 88.A OD2 THR 90.A H 3.137 2.283 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD1 THR 90.A HG1 3.033 2.460 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD2 THR 90.A HG1 2.895 2.087 GLU 91.A N ASP 88.A O GLU 91.A H 2.905 2.064 VAL 93.A N GLU 91.A O VAL 93.A H 2.912 2.178 GLY 98.A N THR 52.A O GLY 98.A H 2.865 2.080 THR 99.A N PRO 96.A O THR 99.A H 3.128 2.278 THR 99.A OG1 PRO 96.A O THR 99.A HG1 2.685 1.953 GLY 104.A N THR 136.A OG1 GLY 104.A H 2.917 2.268 GLN 105.A NE2 TYR 137.A OH GLN 105.A HE22 3.005 2.146 ILE 106.A N ILE 134.A O ILE 106.A H 2.874 2.046 TYR 107.A N GLY 170.A O TYR 107.A H 2.764 1.937 GLY 108.A N ALA 132.A O GLY 108.A H 2.958 2.138 VAL 109.A N THR 167.A O VAL 109.A H 2.885 2.079 ILE 110.A N HIS 130.A O ILE 110.A H 2.877 2.088 SER 111.A N LYS 165.A O SER 111.A H 2.923 2.107 GLN 112.A N ARG 128.A O GLN 112.A H 2.854 2.115 GLN 112.A NE2 SER 159.A O GLN 112.A HE21 2.883 2.100 GLN 112.A NE2 THR 164.A OG1 GLN 112.A HE22 2.978 2.156 ARG 113.A NE ASN 127.A OD1 ARG 113.A HE 2.666 1.813 ARG 113.A NH2 ASN 127.A OD1 ARG 113.A HH21 3.263 2.612 ASN 114.A N ALA 126.A O ASN 114.A H 3.107 2.248 THR 115.A N GLN 162.A OE1 THR 115.A H 3.106 2.324 VAL 118.A N LEU 124.A O VAL 118.A H 3.336 2.497 GLU 121.A N VAL 118.A O GLU 121.A H 2.923 2.132 ASN 123.A N VAL 118.A O ASN 123.A H 2.876 2.223 ARG 128.A N GLN 112.A O ARG 128.A H 3.279 2.501 ARG 128.A NH1 GLN 112.A OE1 ARG 128.A HH11 2.927 2.113 ARG 128.A NH1 ASN 114.A OD1 ARG 128.A HH12 2.937 2.117 ARG 128.A NH2 ASN 114.A OD1 ARG 128.A HH22 3.221 2.496 HIS 130.A N ILE 110.A O HIS 130.A H 2.902 2.111 HIS 130.A NE2 ASP 157.A OD2 HIS 130.A HE2 2.953 2.166 ALA 132.A N GLY 108.A O ALA 132.A H 2.887 2.121 VAL 133.A N SER 151.A O VAL 133.A H 2.904 2.125 ILE 134.A N ILE 106.A O ILE 134.A H 2.860 2.039 THR 136.A N GLY 104.A O THR 136.A H 2.975 2.139 THR 136.A OG1 PHE 102.A O THR 136.A HG1 2.700 1.905 SER 138.A N ALA 135.A O SER 138.A H 3.371 2.529 LYS 140.A N SER 138.A OG LYS 140.A H 3.194 2.356 PHE 141.A N SER 138.A O PHE 141.A H 2.958 2.114 THR 142.A N ASN 147.A O THR 142.A H 3.128 2.392 THR 142.A OG1 ASN 147.A O THR 142.A HG1 2.848 2.402 LYS 144.A N TYR 188.A O LYS 144.A H 3.027 2.219 LYS 144.A NZ PRO 89.A O LYS 144.A HZ2 2.876 2.214 LYS 144.A NZ VAL 93.A O LYS 144.A HZ3 2.857 2.003 LEU 145.A N THR 142.A O LEU 145.A H 2.846 2.102 GLY 146.A N PRO 143.A O GLY 146.A H 2.923 2.126 ASN 147.A N THR 142.A O ASN 147.A H 3.336 2.478 ASN 147.A ND2 LEU 145.A O ASN 147.A HD22 3.426 2.792 ILE 148.A N MET 77.A O ILE 148.A H 2.934 2.105 PHE 150.A N TRP 75.A O PHE 150.A H 2.969 2.186 SER 151.A N VAL 133.A O SER 151.A H 2.931 2.113 THR 152.A N THR 73.A O THR 152.A H 2.918 2.138 THR 152.A OG1 GLU 154.A O THR 152.A HG1 2.696 2.016 GLN 156.A N GLU 154.A OE2 GLN 156.A H 3.124 2.356 ASP 157.A N GLU 154.A OE2 ASP 157.A H 2.813 2.056 VAL 158.A N GLN 156.A O VAL 158.A H 2.835 2.106 SER 159.A N GLN 112.A OE1 SER 159.A H 3.113 2.264 GLY 161.A N VAL 67.A O GLY 161.A H 2.696 1.839 GLN 162.A NE2 ASN 116.A OD1 GLN 162.A HE21 2.955 2.101 THR 164.A N GLY 65.A O THR 164.A H 2.752 1.989 THR 164.A OG1 GLN 162.A O THR 164.A HG1 2.819 2.072 LYS 165.A N SER 111.A O LYS 165.A H 2.861 2.046 PHE 166.A N PHE 63.A O PHE 166.A H 2.916 2.067 THR 167.A N VAL 109.A O THR 167.A H 2.888 2.038 VAL 169.A N TYR 107.A O VAL 169.A H 2.860 2.042 GLY 170.A N TYR 107.A O GLY 170.A H 2.951 2.113 LEU 171.A N PRO 219.A O LEU 171.A H 2.833 1.996 ALA 172.A N GLN 105.A O ALA 172.A H 2.853 2.030 ASP 175.A N SER 173.A OG ASP 175.A H 3.086 2.226 SER 178.A N ASP 175.A O SER 178.A H 2.873 2.018 HIS 179.A N ALA 176.A O HIS 179.A H 3.439 2.585 ASP 181.A N SER 103.A O ASP 181.A H 3.055 2.231 GLN 182.A NE2 ASP 230.A OD2 GLN 182.A HE21 2.895 2.097 TRP 183.A N ASP 181.A OD1 TRP 183.A H 3.065 2.233 THR 184.A N ASP 181.A O THR 184.A H 3.148 2.313 TYR 188.A N ASN 195.A OD1 TYR 188.A H 2.938 2.126 GLY 190.A N SER 187.A O GLY 190.A H 2.955 2.100 THR 193.A N GLY 190.A O THR 193.A H 3.157 2.357 ASN 195.A ND2 PRO 186.A O ASN 195.A HD21 2.960 2.126 ALA 199.A N GLN 39.A OE1 ALA 199.A H 2.855 2.071 VAL 202.A N VAL 36.A O VAL 202.A H 2.990 2.194 GLU 209.A N PHE 206.A O GLU 209.A H 3.100 2.254 CYS 210.A N VAL 279.A O CYS 210.A H 2.910 2.124 LEU 212.A N LEU 277.A O LEU 212.A H 3.016 2.200 PHE 213.A N TYR 27.A O PHE 213.A H 2.896 2.044 PHE 214.A N CYS 231.A O PHE 214.A H 2.939 2.101 ARG 215.A N VAL 25.A O ARG 215.A H 2.803 1.951 ARG 215.A NE ASP 230.A OD1 ARG 215.A HE 2.807 1.948 ARG 215.A NH2 ASP 230.A OD2 ARG 215.A HH21 2.975 2.116 SER 216.A N ILE 229.A O SER 216.A H 2.976 2.140 PHE 217.A N ASP 24.A OD2 PHE 217.A H 2.938 2.105 ILE 218.A N PRO 227.A O ILE 218.A H 3.059 2.227 LYS 221.A N LEU 171.A O LYS 221.A H 2.893 2.111 LYS 221.A NZ GLU 131.A OE1 LYS 221.A HZ3 3.509 2.887 LYS 221.A NZ GLU 131.A OE2 LYS 221.A HZ3 2.786 1.901 ILE 229.A N SER 216.A O ILE 229.A H 2.815 1.989 ASP 230.A N GLN 182.A OE1 ASP 230.A H 2.864 2.012 CYS 231.A N PHE 214.A O CYS 231.A H 2.914 2.068 CYS 231.A SG PHE 214.A O CYS 231.A HG 3.618 2.561 GLN 235.A N THR 15.A O GLN 235.A H 2.920 2.121 GLN 235.A NE2 GLN 54.A O GLN 235.A HE21 2.962 2.150 GLN 235.A NE2 LEU 55.A O GLN 235.A HE22 2.960 2.160 GLU 236.A N GLU 236.A OE1 GLU 236.A H 2.760 2.022 TRP 237.A N PRO 234.A O TRP 237.A H 2.995 2.334 VAL 238.A N PRO 234.A O VAL 238.A H 3.233 2.425 GLN 239.A N GLN 235.A O GLN 239.A H 2.943 2.111 GLN 239.A NE2 LEU 55.A O GLN 239.A HE22 3.044 2.319 HIS 240.A N GLU 236.A O HIS 240.A H 2.920 2.123 HIS 240.A NE2 THR 5.A OG1 HIS 240.A HE2 2.861 2.045 LEU 241.A N TRP 237.A O LEU 241.A H 2.850 1.996 TYR 242.A N VAL 238.A O TYR 242.A H 3.023 2.212 GLN 243.A N GLN 239.A O GLN 243.A H 3.068 2.260 GLU 244.A N HIS 240.A O GLU 244.A H 2.944 2.124 SER 245.A N LEU 241.A O SER 245.A H 3.029 2.189 SER 245.A OG TYR 242.A O SER 245.A HG 3.352 2.909 SER 250.A OG VAL 301.A O SER 250.A HG 2.672 1.927 VAL 252.A N SER 250.A OG VAL 252.A H 3.166 2.329 ALA 253.A N LEU 271.A O ALA 253.A H 2.880 2.024 LEU 254.A N SER 299.A O LEU 254.A H 2.801 1.979 VAL 255.A N ALA 269.A O VAL 255.A H 2.986 2.128 ARG 256.A N ARG 296.A O ARG 256.A H 2.899 2.074 ARG 256.A NH1 THR 265.A OG1 ARG 256.A HH11 2.970 2.184 TYR 257.A N PHE 267.A O TYR 257.A H 2.869 2.032 VAL 258.A N TYR 294.A O VAL 258.A H 2.853 2.010 ASN 259.A N ARG 264.A O ASN 259.A H 2.925 2.076 THR 262.A N ASN 259.A OD1 THR 262.A H 3.221 2.432 GLY 263.A N ASN 259.A O GLY 263.A H 2.670 2.047 LEU 266.A N TYR 257.A O LEU 266.A H 2.772 1.948 ALA 269.A N VAL 255.A O ALA 269.A H 2.977 2.171 LYS 270.A N THR 278.A O LYS 270.A H 2.998 2.194 LYS 270.A NZ GLU 209.A OE1 LYS 270.A HZ2 2.809 1.968 LYS 270.A NZ TYR 305.A O LYS 270.A HZ1 2.940 2.226 LEU 271.A N ALA 253.A O LEU 271.A H 2.774 1.923 HIS 272.A N PHE 276.A O HIS 272.A H 2.792 1.936 HIS 272.A NE2 THR 278.A OG1 HIS 272.A HE2 2.854 2.001 ARG 273.A N ASP 251.A O ARG 273.A H 2.942 2.186 ARG 273.A NH1 ASP 251.A OD1 ARG 273.A HH11 3.135 2.525 GLY 275.A N HIS 272.A O GLY 275.A H 2.884 2.055 THR 278.A N LYS 270.A O THR 278.A H 2.991 2.210 VAL 279.A N CYS 210.A O VAL 279.A H 2.931 2.144 ARG 281.A NH1 THR 28.A OG1 ARG 281.A HH11 2.805 2.012 ARG 281.A NH1 GLY 285.A O ARG 281.A HH12 2.967 2.191 ARG 281.A NH2 PRO 286.A O ARG 281.A HH22 3.002 2.155 GLY 285.A N THR 28.A O GLY 285.A H 2.830 1.998 VAL 287.A N LEU 26.A O VAL 287.A H 2.871 2.083 ASN 292.A ND2 ASN 259.A OD1 ASN 292.A HD21 3.051 2.334 GLY 293.A N PRO 290.A O GLY 293.A H 3.226 2.407 TYR 294.A N VAL 258.A O TYR 294.A H 3.191 2.426 ARG 296.A N ARG 256.A O ARG 296.A H 2.828 2.069 ASP 298.A N LEU 254.A O ASP 298.A H 2.883 2.040 VAL 301.A N VAL 252.A O VAL 301.A H 2.826 2.045 PHE 304.A N ASN 302.A OD1 PHE 304.A H 2.878 2.121 TYR 305.A N ASN 302.A O TYR 305.A H 3.179 2.323 ALA 308.A N GLU 268.A OE2 ALA 308.A H 2.839 1.992 MET 310.A N ALA 280.A O MET 310.A H 2.869 2.039