Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3pe6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A NE.A GLU 78.A OE2 ARG 2.A HE.A 2.961 2.086 ARG 2.A NE.B GLU 78.A OE2 ARG 2.A HE.B 3.011 2.133 ARG 2.A NH2.A GLY 21.A O ARG 2.A HH22.A 2.941 2.251 ARG 2.A NH2.A GLU 78.A OE1 ARG 2.A HH21.A 2.965 2.176 ARG 2.A NH2.B GLY 21.A O ARG 2.A HH22.B 2.987 2.206 ARG 2.A NH2.B GLU 78.A OE1 ARG 2.A HH21.B 2.828 2.003 ARG 2.A NH2.B GLU 78.A OE2 ARG 2.A HH21.B 3.451 2.741 ARG 3.A NH1 SER 7.A O ARG 3.A HH11 2.777 2.021 THR 4.A N ILE 8.A O THR 4.A H 2.793 1.980 GLN 6.A N THR 4.A OG1 GLN 6.A H 3.184 2.462 GLN 6.A NE2 GLY 75.A O GLN 6.A HE22 3.015 2.316 SER 7.A N THR 4.A O SER 7.A H.B 2.819 1.987 ILE 8.A N THR 4.A OG1 ILE 8.A H.A 3.110 2.261 TYR 10.A N ARG 2.A O TYR 10.A H 3.021 2.196 ASP 12.A N PRO 9.A O ASP 12.A H 3.254 2.410 LEU 13.A N TYR 10.A O LEU 13.A H 2.989 2.147 HIS 15.A ND1 LEU 13.A O HIS 15.A HD1 2.878 2.068 LEU 16.A N LEU 24.A O LEU 16.A H 2.969 2.213 ASN 18.A N GLN 22.A O ASN 18.A H 2.864 2.030 ASN 18.A ND2 GLN 22.A OE1 ASN 18.A HD22 3.060 2.180 ASN 18.A ND2 ASP 93.A OD2 ASN 18.A HD21 2.929 2.140 ASP 20.A N ASN 18.A OD1 ASP 20.A H 2.876 2.185 GLY 21.A N ASN 18.A O GLY 21.A H 2.913 2.073 GLN 22.A N ASN 18.A OD1 GLN 22.A H 2.927 2.089 TYR 23.A N GLU 78.A OE1 TYR 23.A H 2.887 2.045 LEU 24.A N LEU 16.A O LEU 24.A H 2.777 1.929 PHE 25.A N SER 77.A OG PHE 25.A H 2.912 2.148 CYS 26.A N PRO 14.A O CYS 26.A H 3.017 2.174 ARG 27.A N ALA 68.A O ARG 27.A H 2.917 2.081 ARG 27.A NE SER 49.A OG ARG 27.A HE 2.940 2.082 TYR 28.A OH HIS 97.A NE2 TYR 28.A HH 2.859 2.186 TRP 29.A N VAL 66.A O TRP 29.A H 2.859 2.022 TRP 29.A NE1 GLU 53.A OE1 TRP 29.A HE1 3.206 2.451 TRP 29.A NE1 GLU 53.A OE2 TRP 29.A HE1 2.993 2.197 LYS 36.A N ASP 63.A O LYS 36.A H 2.806 1.972 LEU 38.A N PRO 109.A O LEU 38.A H 2.918 2.075 ILE 39.A N LEU 65.A O ILE 39.A H 2.903 2.118 PHE 40.A N PHE 111.A O PHE 40.A H 2.985 2.163 VAL 41.A N PHE 67.A O VAL 41.A H 2.918 2.110 SER 42.A N LEU 113.A O SER 42.A H 2.778 1.944 SER 42.A OG GLY 118.A O SER 42.A HG 3.052 2.353 HIS 43.A ND1 GLY 44.A O HIS 43.A HD1 2.765 1.971 GLY 44.A N GLU 47.A OE2 GLY 44.A H 2.851 1.997 GLY 46.A N HIS 74.A NE2 GLY 46.A H 2.994 2.202 GLU 47.A N GLY 44.A O GLU 47.A H 3.358 2.510 HIS 48.A NE2 ASP 191.A OD2 HIS 48.A HE2 2.773 1.927 SER 49.A N ASP 70.A OD1 SER 49.A H 2.767 1.924 GLY 50.A N HIS 48.A ND1 GLY 50.A H 3.016 2.245 ARG 51.A N HIS 48.A O ARG 51.A H 3.296 2.445 ARG 51.A NH1 ASP 191.A OD2 ARG 51.A HH11 2.744 1.936 TYR 52.A N SER 49.A O TYR 52.A H 3.197 2.380 ALA 56.A N TYR 52.A O ALA 56.A H 2.864 2.025 ARG 57.A N GLU 53.A O ARG 57.A H 2.929 2.116 ARG 57.A NH2 GLU 53.A OE2 ARG 57.A HH22 3.190 2.547 MET 58.A N GLU 54.A O MET 58.A H.A 3.079 2.249 LEU 59.A N LEU 55.A O LEU 59.A H 3.041 2.217 MET 60.A N ALA 56.A O MET 60.A H.A 2.867 2.046 GLY 61.A N ARG 57.A O GLY 61.A H 2.977 2.201 LEU 62.A N LEU 59.A O LEU 62.A H 3.038 2.315 ASP 63.A N MET 60.A O ASP 63.A H 2.845 2.059 LEU 64.A N LEU 59.A O LEU 64.A H 3.356 2.521 LEU 65.A N ALA 37.A O LEU 65.A H 2.950 2.152 VAL 66.A N TRP 29.A O VAL 66.A H 2.939 2.109 PHE 67.A N ILE 39.A O PHE 67.A H 2.880 2.094 ALA 68.A N ARG 27.A O ALA 68.A H 2.953 2.259 ASP 70.A N PHE 25.A O ASP 70.A H 2.876 2.082 HIS 71.A N HIS 43.A NE2 HIS 71.A H 2.937 2.115 HIS 71.A NE2 HIS 43.A O no hydrogen 3.000 N/A GLY 73.A N GLU 78.A O GLY 73.A H 2.892 2.041 HIS 74.A N HIS 71.A O HIS 74.A H 2.907 2.274 HIS 74.A ND1 VAL 72.A O HIS 74.A HD1 2.975 2.136 GLN 76.A N ASP 70.A OD2 GLN 76.A H 2.853 2.009 SER 77.A N HIS 74.A O SER 77.A H 2.965 2.148 SER 77.A OG ASP 70.A O SER 77.A HG 2.697 1.896 GLU 78.A N TYR 23.A O GLU 78.A H 2.864 2.007 ARG 81.A NE GLY 79.A O ARG 81.A HE 3.374 2.710 ARG 81.A NH1 GLY 75.A O ARG 81.A HH12 2.950 2.354 ARG 81.A NH2 SER 77.A O ARG 81.A HH21 2.744 1.924 ARG 81.A NH2 GLY 79.A O ARG 81.A HH22 2.737 1.897 MET 82.A N GLY 73.A O MET 82.A H.A 3.001 2.176 PHE 87.A N GLN 206.A OE1 PHE 87.A H 2.874 2.111 HIS 88.A N ASP 86.A OD2 HIS 88.A H 2.891 2.036 HIS 88.A NE2 GLU 128.A OE1 HIS 88.A HE2 2.912 2.073 VAL 89.A N ASP 86.A O VAL 89.A H 2.945 2.132 PHE 90.A N PHE 87.A O PHE 90.A H 3.028 2.304 ARG 92.A N HIS 88.A O ARG 92.A H 2.868 2.017 ARG 92.A NE ASP 93.A OD1 ARG 92.A HE 2.958 2.138 ARG 92.A NH1 ASP 20.A OD1 ARG 92.A HH12 3.481 2.734 ARG 92.A NH1 ASP 20.A OD2 ARG 92.A HH12 2.930 2.179 ARG 92.A NH2 ASP 20.A OD2 ARG 92.A HH21 2.876 2.112 ARG 92.A NH2 ASP 93.A OD1 ARG 92.A HH22 2.951 2.189 ASP 93.A N VAL 89.A O ASP 93.A H 2.963 2.157 VAL 94.A N PHE 90.A O VAL 94.A H 3.027 2.186 LEU 95.A N VAL 91.A O LEU 95.A H 2.927 2.087 GLN 96.A N ARG 92.A O GLN 96.A H 2.939 2.146 GLN 96.A NE2 VAL 17.A O GLN 96.A HE22 2.903 2.047 HIS 97.A N ASP 93.A O HIS 97.A H 3.084 2.230 HIS 97.A ND1 HIS 69.A ND1 HIS 97.A HD1 2.880 2.093 VAL 98.A N VAL 94.A O VAL 98.A H 2.813 1.976 ASP 99.A N LEU 95.A O ASP 99.A H 2.857 2.011 SER 100.A N GLN 96.A O SER 100.A H.B 2.945 2.131 SER 100.A OG.B HIS 97.A O SER 100.A HG.B 2.956 2.382 MET 101.A N HIS 97.A O MET 101.A H.B 2.951 2.111 GLN 102.A N VAL 98.A O GLN 102.A H 2.826 2.024 GLN 102.A NE2 LEU 108.A O GLN 102.A HE21 3.685 2.916 LYS 103.A N ASP 99.A O LYS 103.A H 3.171 2.382 LYS 103.A NZ SER 100.A OG.A LYS 103.A HZ3 3.230 2.421 LYS 103.A NZ ASP 104.A OD1 LYS 103.A HZ1 3.020 2.097 ASP 104.A N MET 101.A O ASP 104.A H 3.047 2.391 TYR 105.A N MET 101.A O TYR 105.A H 3.093 2.419 TYR 105.A N GLN 102.A O TYR 105.A H 3.114 2.462 LEU 108.A N TYR 105.A O LEU 108.A H 3.273 2.419 PHE 111.A N LEU 38.A O PHE 111.A H 2.851 2.026 LEU 112.A N GLY 135.A O LEU 112.A H 2.968 2.166 LEU 113.A N PHE 40.A O LEU 113.A H 2.844 2.027 GLY 114.A N VAL 137.A O GLY 114.A H 2.921 2.136 HIS 115.A N SER 42.A O HIS 115.A H 3.284 2.492 HIS 115.A ND1 ILE 139.A O HIS 115.A HD1 2.925 2.139 SER 116.A N ILE 139.A O SER 116.A H 3.209 2.475 SER 116.A N SER 140.A O SER 116.A H 3.113 2.477 SER 116.A OG HIS 263.A NE2 SER 116.A HG 2.808 2.337 GLY 118.A N HIS 115.A O GLY 118.A H 2.786 2.128 GLY 119.A N SER 116.A O GLY 119.A H 2.873 2.226 ALA 120.A N SER 116.A O ALA 120.A H 3.211 2.441 ILE 121.A N MET 117.A O ILE 121.A H 2.992 2.180 ALA 122.A N GLY 118.A O ALA 122.A H 2.985 2.182 ILE 123.A N GLY 119.A O ILE 123.A H 2.910 2.090 LEU 124.A N ALA 120.A O LEU 124.A H 2.983 2.142 THR 125.A N ILE 121.A O THR 125.A H 2.869 2.062 THR 125.A OG1 ILE 121.A O THR 125.A HG1 2.784 2.036 ALA 126.A N ALA 122.A O ALA 126.A H 2.973 2.118 ALA 127.A N ILE 123.A O ALA 127.A H 2.981 2.199 GLU 128.A N LEU 124.A O GLU 128.A H 3.047 2.344 GLU 128.A N THR 125.A O GLU 128.A H 3.193 2.559 ARG 129.A N ALA 126.A O ARG 129.A H 3.198 2.427 ARG 129.A NH1 ASP 99.A OD1 ARG 129.A HH12 2.957 2.106 ARG 129.A NH1 ASP 99.A OD2 ARG 129.A HH12 3.508 2.839 ARG 129.A NH2 ASP 99.A OD2 ARG 129.A HH21 2.945 2.095 HIS 132.A N ARG 129.A O HIS 132.A H 3.064 2.268 HIS 132.A NE2 GLN 102.A OE1 HIS 132.A HE2 2.637 1.828 ALA 134.A N VAL 110.A O ALA 134.A H 2.826 1.990 MET 136.A N PRO 224.A O MET 136.A H.A 2.899 2.137 VAL 137.A N LEU 112.A O VAL 137.A H 2.846 2.036 LEU 138.A N LEU 226.A O LEU 138.A H 2.859 2.032 ILE 139.A N GLY 114.A O ILE 139.A H 2.918 2.079 SER 140.A N LEU 228.A O SER 140.A H.B 2.845 2.012 SER 140.A OG.A HIS 263.A O SER 140.A HG.A 2.787 2.324 SER 140.A OG.B HIS 263.A O SER 140.A HG.B 2.698 2.170 LEU 142.A N SER 116.A O LEU 142.A H 3.003 2.177 ASN 146.A N LEU 235.A O ASN 146.A H 3.234 2.445 SER 149.A N ASN 146.A OD1 SER 149.A H 2.974 2.143 ALA 150.A N ASN 146.A O ALA 150.A H 2.890 2.061 THR 151.A N PRO 147.A O THR 151.A H 2.972 2.144 THR 151.A OG1 PRO 147.A O THR 151.A HG1 3.001 2.214 THR 152.A N GLU 148.A O THR 152.A H 2.908 2.063 THR 152.A OG1 GLU 148.A O THR 152.A HG1 3.028 2.380 PHE 153.A N SER 149.A O PHE 153.A H 2.961 2.148 LYS 154.A N ALA 150.A O LYS 154.A H 2.873 2.065 VAL 155.A N THR 151.A O VAL 155.A H 2.938 2.097 LEU 156.A N THR 152.A O LEU 156.A H 2.981 2.137 ALA 157.A N PHE 153.A O ALA 157.A H 2.801 1.960 ALA 158.A N LYS 154.A O ALA 158.A H 3.030 2.227 LYS 159.A N VAL 155.A O LYS 159.A H 3.018 2.179 VAL 160.A N LEU 156.A O VAL 160.A H 2.852 2.054 LEU 161.A N ALA 157.A O LEU 161.A H 2.929 2.082 ASN 162.A N ALA 158.A O ASN 162.A H 2.671 1.866 SER 163.A N LYS 159.A O SER 163.A H.B 3.053 2.358 SER 163.A OG.A LYS 159.A O SER 163.A HG.A 2.582 2.117 LEU 165.A N VAL 160.A O LEU 165.A H 3.170 2.516 SER 170.A N LEU 199.A O SER 170.A H 2.809 2.040 SER 175.A OG ASN 189.A OD1 SER 175.A HG 2.721 2.207 SER 176.A N ASP 174.A OD1 SER 176.A H 3.004 2.301 VAL 177.A N ASP 174.A O VAL 177.A H 3.297 2.470 LEU 178.A N SER 175.A O LEU 178.A H 3.039 2.199 SER 179.A OG LYS 267.A O SER 179.A HG 2.684 2.051 ARG 180.A N GLU 268.A OE1 ARG 180.A H 3.139 2.303 ARG 180.A NE GLU 268.A OE1 ARG 180.A HE 3.011 2.049 ARG 180.A NE GLU 268.A OE2 ARG 180.A HE 3.223 2.563 ARG 180.A NH2 GLU 268.A OE2 ARG 180.A HH22 2.899 2.126 ASN 181.A N SER 179.A OG ASN 181.A H 3.017 2.172 ASN 181.A ND2 GLU 268.A O ASN 181.A HD21 2.963 2.063 GLU 184.A N ASN 181.A OD1 GLU 184.A H 3.065 2.238 VAL 185.A N ASN 181.A O VAL 185.A H 2.976 2.163 ASP 186.A N LYS 182.A O ASP 186.A H 3.027 2.224 ILE 187.A N THR 183.A O ILE 187.A H 2.931 2.102 TYR 188.A N GLU 184.A O TYR 188.A H 2.933 2.094 ASN 189.A N VAL 185.A O ASN 189.A H 2.894 2.064 SER 190.A N ASP 186.A O SER 190.A H.A 3.230 2.504 SER 190.A OG.A ILE 187.A O SER 190.A HG.A 3.554 2.836 ASP 191.A N TYR 188.A O ASP 191.A H 3.061 2.215 LEU 193.A N ASP 191.A OD1 LEU 193.A H 2.835 1.996 ILE 194.A N ASP 191.A O ILE 194.A H 3.490 2.626 CYS 195.A N GLY 46.A O CYS 195.A H 2.924 2.122 LEU 199.A N GLY 171.A O LEU 199.A H 3.173 2.322 PHE 203.A N LYS 200.A O PHE 203.A H 2.987 2.382 GLY 204.A N LYS 200.A O GLY 204.A H 2.914 2.072 ILE 205.A N VAL 201.A O ILE 205.A H 2.922 2.114 GLN 206.A N CYS 202.A O GLN 206.A H 3.257 2.479 LEU 207.A N PHE 203.A O LEU 207.A H 2.965 2.192 LEU 208.A N GLY 204.A O LEU 208.A H 2.919 2.110 ASN 209.A N ILE 205.A O ASN 209.A H 2.898 2.076 ASN 209.A ND2 GLN 206.A OE1 ASN 209.A HD21 3.105 2.357 ALA 210.A N GLN 206.A O ALA 210.A H 2.894 2.107 VAL 211.A N LEU 207.A O VAL 211.A H 3.048 2.225 SER 212.A N LEU 208.A O SER 212.A H.B 3.037 2.208 ARG 213.A N ASN 209.A O ARG 213.A H 2.870 2.059 ARG 213.A NH1 ASP 86.A OD2 ARG 213.A HH12 2.841 2.001 ARG 213.A NH2 ASP 86.A OD1 ARG 213.A HH21 2.920 2.070 VAL 214.A N ALA 210.A O VAL 214.A H 2.765 1.930 GLU 215.A N VAL 211.A O GLU 215.A H 3.075 2.263 ARG 216.A N SER 212.A O ARG 216.A H 3.205 2.399 ARG 216.A NH1 SER 212.A OG.B ARG 216.A HH12 2.834 2.216 ALA 217.A N ARG 213.A O ALA 217.A H 2.946 2.239 ALA 217.A N VAL 214.A O ALA 217.A H 3.009 2.399 LEU 218.A N VAL 214.A O LEU 218.A H 2.977 2.348 LYS 220.A N ALA 217.A O LYS 220.A H 2.953 2.165 LEU 221.A N LEU 218.A O LEU 221.A H 3.073 2.238 PHE 225.A N ASP 252.A O PHE 225.A H 2.890 2.097 LEU 226.A N MET 136.A O LEU 226.A H 2.955 2.153 LEU 227.A N THR 254.A O LEU 227.A H 2.857 2.033 LEU 228.A N LEU 138.A O LEU 228.A H 2.937 2.087 GLN 229.A N LYS 256.A O GLN 229.A H 3.038 2.256 GLN 229.A NE2 GLY 230.A O GLN 229.A HE21 3.203 2.499 GLN 229.A NE2 ASP 233.A OD2 GLN 229.A HE22 3.250 2.528 GLN 229.A NE2 CYS 236.A O GLN 229.A HE22 3.120 2.523 SER 231.A N TYR 258.A O SER 231.A H 2.971 2.148 ALA 232.A N ALA 261.A O ALA 232.A H 2.998 2.240 LEU 235.A N ASP 233.A OD1 LEU 235.A H 2.887 2.046 CYS 236.A N ASP 233.A OD1 CYS 236.A H 2.915 2.103 CYS 236.A SG SER 140.A O CYS 236.A HG 3.491 2.272 ASP 237.A N LEU 144.A O ASP 237.A H 2.859 2.128 LYS 239.A N ASP 237.A OD2 LYS 239.A H 3.001 2.172 GLY 240.A N ASP 237.A O GLY 240.A H 2.874 2.078 ALA 241.A N SER 238.A O ALA 241.A H 2.943 2.326 TYR 242.A N SER 238.A O TYR 242.A H 3.249 2.450 LEU 243.A N LYS 239.A O LEU 243.A H 2.992 2.229 LEU 244.A N GLY 240.A O LEU 244.A H 2.962 2.154 MET 245.A N ALA 241.A O MET 245.A H 3.096 2.270 GLU 246.A N TYR 242.A O GLU 246.A H 2.921 2.154 LEU 247.A N LEU 243.A O LEU 247.A H 2.860 2.050 ALA 248.A N LEU 244.A O ALA 248.A H 3.074 2.233 LYS 249.A N LEU 221.A O LYS 249.A H 2.857 2.162 LYS 249.A NZ LEU 247.A O LYS 249.A HZ3 3.071 2.199 SER 250.A OG.A VAL 223.A O SER 250.A HG.A 2.661 2.160 SER 250.A OG.B ASP 252.A O SER 250.A HG.B 3.041 2.597 ASP 252.A N SER 250.A OG.B ASP 252.A H 3.147 2.421 LYS 253.A NZ MET 245.A O LYS 253.A HZ3 2.670 1.990 LYS 253.A NZ ALA 248.A O LYS 253.A HZ1 2.729 1.891 THR 254.A N PHE 225.A O THR 254.A H 3.184 2.443 LYS 256.A N LEU 227.A O LYS 256.A H 2.911 2.096 TYR 258.A N GLN 229.A O TYR 258.A H 2.856 2.042 GLY 260.A N SER 231.A OG GLY 260.A H 2.748 1.892 ALA 261.A N TYR 258.A O ALA 261.A H 3.202 2.381 TYR 262.A N GLU 268.A OE1 TYR 262.A H 3.030 2.173 HIS 263.A ND1 ASP 233.A OD2 HIS 263.A HD1 2.781 1.933 VAL 264.A N LEU 178.A O VAL 264.A H 2.884 2.058 HIS 266.A N HIS 266.A ND1 HIS 266.A H 2.823 2.106 LYS 267.A N VAL 264.A O LYS 267.A H 2.912 2.073 LYS 267.A NZ ARG 51.A O LYS 267.A HZ2 3.142 2.398 GLU 268.A N THR 273.A OG1 GLU 268.A H 2.863 2.098 LEU 269.A N GLU 268.A OE2 LEU 269.A H 2.817 1.985 THR 273.A N LEU 269.A O THR 273.A H 2.950 2.108 THR 273.A OG1 LEU 265.A O THR 273.A HG1 3.042 2.234 ASN 274.A N PRO 270.A O ASN 274.A H 2.758 1.926 SER 275.A N GLU 271.A O SER 275.A H 3.291 2.480 VAL 276.A N VAL 272.A O VAL 276.A H 2.842 2.002 PHE 277.A N THR 273.A O PHE 277.A H 2.980 2.146 HIS 278.A N ASN 274.A O HIS 278.A H 3.030 2.209 GLU 279.A N SER 275.A O GLU 279.A H 2.795 1.957 ILE 280.A N VAL 276.A O ILE 280.A H 3.022 2.178 ASN 281.A N PHE 277.A O ASN 281.A H 2.906 2.067 MET 282.A N HIS 278.A O MET 282.A H.A 2.964 2.121 TRP 283.A N GLU 279.A O TRP 283.A H 2.986 2.160 VAL 284.A N ILE 280.A O VAL 284.A H 2.932 2.075 SER 285.A N ASN 281.A O SER 285.A H 2.836 1.998 GLN 286.A N MET 282.A O GLN 286.A H 2.965 2.143 ARG 287.A N VAL 284.A O ARG 287.A H 3.075 2.367 ARG 287.A NE ASP 252.A OD2 ARG 287.A HE 2.848 2.099 ARG 287.A NH1 TRP 283.A O ARG 287.A HH11 3.036 2.231 ARG 287.A NH2 ASP 252.A OD1 ARG 287.A HH22 3.011 2.194 ARG 287.A NH2 ASP 252.A OD2 ARG 287.A HH22 3.297 2.604 THR 288.A N SER 285.A O THR 288.A H 3.329 2.474 THR 288.A OG1 VAL 284.A O THR 288.A HG1 2.862 2.061 THR 288.A OG1 SER 285.A O THR 288.A HG1 3.490 3.070