Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3ps1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N GLN 288.A O MET 1.A H2 2.986 2.337 ILE 2.A N PHE 287.A O ILE 2.A H 2.877 2.040 GLN 4.A N CYS 125.A O GLN 4.A H 2.936 2.126 GLN 4.A NE2 ASN 34.A OD1 GLN 4.A HE21 2.968 2.127 GLN 4.A NE2 ALA 126.A O GLN 4.A HE22 2.990 2.137 ARG 5.A N ASP 90.A OD2 ARG 5.A H 2.855 2.115 THR 6.A N ASP 121.A O THR 6.A H 2.962 2.129 THR 6.A OG1 ASN 91.A O THR 6.A HG1 2.760 1.986 LYS 8.A N ALA 118.A O LYS 8.A H 3.012 2.323 LYS 8.A N GLY 119.A O LYS 8.A H 3.148 2.415 ARG 9.A N ALA 118.A O ARG 9.A H 2.984 2.284 ARG 9.A NH2 ASP 117.A O ARG 9.A HH21 3.097 2.238 VAL 11.A N LEU 28.A O VAL 11.A H 3.122 2.339 ALA 13.A N LEU 26.A O ALA 13.A H 2.898 2.127 THR 14.A OG1 VAL 24.A O THR 14.A HG1 3.353 2.702 GLY 15.A N VAL 24.A O GLY 15.A H 3.011 2.222 GLY 17.A N LYS 22.A O GLY 17.A H 2.953 2.156 HIS 19.A N GLU 100.A OE1 HIS 19.A H 2.959 2.100 HIS 19.A ND1 GLU 100.A OE1 no hydrogen 2.929 N/A THR 20.A N GLU 100.A OE2 THR 20.A H 2.927 2.090 THR 20.A OG1 GLU 100.A OE2 THR 20.A HG1 3.020 2.247 GLY 21.A N GLY 17.A O GLY 21.A H 2.876 2.083 LYS 22.A N THR 20.A OG1 LYS 22.A H 3.147 2.299 LYS 23.A NZ THR 14.A OG1 LYS 23.A HZ3 3.285 2.471 VAL 24.A N GLY 15.A O VAL 24.A H 2.805 1.972 THR 25.A N ASN 97.A OD1 THR 25.A H 2.866 2.018 LEU 26.A N ALA 13.A O LEU 26.A H 2.818 1.972 THR 27.A N GLU 95.A O THR 27.A H 2.870 2.030 LEU 28.A N VAL 11.A O LEU 28.A H 2.873 2.062 ARG 29.A N VAL 93.A O ARG 29.A H 2.847 2.060 ARG 29.A NE GLU 95.A OE2 ARG 29.A HE 2.908 2.272 ARG 29.A NH2 GLU 95.A OE1 ARG 29.A HH21 3.267 2.472 ALA 31.A N THR 6.A OG1 ALA 31.A H 2.924 2.108 ASN 34.A N GLN 4.A OE1 ASN 34.A H 2.917 2.124 GLY 36.A N ASN 91.A OD1 GLY 36.A H 2.920 2.081 ILE 38.A N ILE 92.A O ILE 38.A H 2.977 2.144 TYR 39.A N PHE 50.A O TYR 39.A H 3.051 2.217 ARG 40.A N ILE 94.A O ARG 40.A H 2.707 2.004 ARG 40.A NE ASP 49.A OD1 ARG 40.A HE 2.931 2.103 ARG 40.A NH1 GLU 95.A OE2 ARG 40.A HH11 2.794 2.052 ARG 40.A NH2 ASP 49.A OD2 ARG 40.A HH21 3.523 2.677 ARG 41.A N VAL 48.A O ARG 41.A H 2.947 2.160 ARG 41.A NE ASP 43.A OD1 ARG 41.A HE 3.066 2.238 ARG 41.A NH1 ARG 73.A O ARG 41.A HH11 2.852 2.043 ARG 41.A NH2 ASP 43.A OD2 ARG 41.A HH21 2.911 2.114 THR 42.A N VAL 96.A O THR 42.A H 2.928 2.086 LEU 44.A N ASP 43.A OD1 LEU 44.A H 2.778 2.092 VAL 48.A N ARG 41.A O VAL 48.A H 3.006 2.232 PHE 50.A N TYR 39.A O PHE 50.A H 2.660 1.831 ALA 52.A N VAL 37.A O ALA 52.A H 2.962 2.112 LYS 55.A N ASP 53.A OD1 LYS 55.A H 3.076 2.252 SER 56.A N ASP 53.A O SER 56.A H 2.971 2.151 VAL 57.A N ALA 54.A O VAL 57.A H 3.409 2.553 ARG 58.A N CYS 65.A O ARG 58.A H 2.902 2.087 ARG 58.A NH1 LYS 55.A O ARG 58.A HH12 3.082 2.305 ARG 58.A NH1 VAL 57.A O ARG 58.A HH11 2.956 2.105 THR 60.A OG1 LEU 62.A O THR 60.A HG1 2.872 2.200 THR 60.A OG1 CYS 63.A O THR 60.A HG1 3.493 3.038 THR 64.A N GLU 78.A OE1 THR 64.A H 3.208 2.520 THR 64.A OG1 GLU 78.A OE1 THR 64.A HG1 2.877 2.059 CYS 65.A N ARG 58.A O CYS 65.A H 2.972 2.186 LEU 66.A N ILE 74.A O LEU 66.A H 2.847 2.037 VAL 67.A N SER 56.A O VAL 67.A H 2.973 2.197 ASN 68.A N VAL 72.A O ASN 68.A H 3.046 2.277 HIS 70.A N ASN 68.A OD1 HIS 70.A H 2.960 2.186 ASP 71.A N ASN 68.A O ASP 71.A H 3.035 2.191 VAL 72.A N ASN 68.A OD1 VAL 72.A H 2.961 2.234 ILE 74.A N LEU 66.A O ILE 74.A H 2.957 2.171 SER 75.A N PRO 99.A O SER 75.A H 2.930 2.150 THR 76.A N THR 64.A O THR 76.A H 2.731 1.919 GLU 78.A N GLU 78.A OE1 GLU 78.A H 2.812 2.009 ASN 81.A N VAL 77.A O ASN 81.A H 2.928 2.128 ASN 81.A ND2 TYR 39.A OH ASN 81.A HD22 2.847 2.060 ALA 82.A N GLU 78.A O ALA 82.A H 2.949 2.206 ALA 83.A N HIS 79.A O ALA 83.A H 3.222 2.449 LEU 84.A N LEU 80.A O LEU 84.A H 3.020 2.228 ALA 85.A N ASN 81.A O ALA 85.A H 3.132 2.310 GLY 86.A N ALA 82.A O GLY 86.A H 2.927 2.106 LEU 87.A N ALA 83.A O LEU 87.A H 3.043 2.251 GLY 88.A N ALA 85.A O GLY 88.A H 3.148 2.386 ILE 89.A N LEU 84.A O ILE 89.A H 2.935 2.136 ASP 90.A N ARG 5.A O ASP 90.A H 3.008 2.194 ASN 91.A N ARG 5.A O ASN 91.A H 3.148 2.328 ASN 91.A ND2 GLN 4.A OE1 ASN 91.A HD21 3.004 2.172 ILE 92.A N GLY 36.A O ILE 92.A H 3.021 2.211 VAL 93.A N ARG 29.A O VAL 93.A H 3.063 2.224 ILE 94.A N ILE 38.A O ILE 94.A H 2.814 1.977 GLU 95.A N THR 27.A O GLU 95.A H 2.857 2.001 VAL 96.A N ARG 40.A O VAL 96.A H 2.981 2.175 ILE 101.A N SER 75.A O ILE 101.A H 3.045 2.227 ILE 103.A N VAL 16.A O ILE 103.A H 3.087 2.282 GLY 106.A N ILE 103.A O GLY 106.A H 3.038 2.226 SER 107.A N ASP 105.A OD1 SER 107.A H 2.955 2.126 ALA 108.A N SER 187.A O ALA 108.A H 2.874 2.112 PHE 111.A N ALA 108.A O PHE 111.A H 2.981 2.317 VAL 112.A N ALA 108.A O VAL 112.A H 3.211 2.481 VAL 112.A N ALA 109.A O VAL 112.A H 3.015 2.417 TYR 113.A N ALA 109.A O TYR 113.A H 3.320 2.511 LEU 114.A N PRO 110.A O LEU 114.A H 3.220 2.430 LEU 115.A N PHE 111.A O LEU 115.A H 2.909 2.096 LEU 116.A N VAL 112.A O LEU 116.A H 2.977 2.165 ASP 117.A N TYR 113.A O ASP 117.A H 2.949 2.146 ALA 118.A N LEU 114.A O ALA 118.A H 3.187 2.496 ALA 118.A N LEU 115.A O ALA 118.A H 3.065 2.449 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 3.102 2.464 GLY 119.A N LEU 116.A O GLY 119.A H 3.190 2.486 ASP 121.A N THR 6.A O ASP 121.A H 2.853 2.002 LEU 123.A N GLN 4.A O LEU 123.A H 2.994 2.143 CYS 125.A N LEU 123.A O CYS 125.A H 2.881 2.215 LYS 127.A N ILE 2.A O LYS 127.A H 2.970 2.121 LYS 127.A NZ ASN 253.A OD1 LYS 127.A HZ1 3.243 2.566 PHE 129.A N VAL 285.A O PHE 129.A H 2.942 2.084 VAL 130.A N ASN 253.A O VAL 130.A H 3.078 2.252 ARG 131.A N GLU 283.A O ARG 131.A H 2.869 2.027 ARG 131.A NE GLU 283.A OE2 ARG 131.A HE 3.073 2.252 ARG 131.A NH2 GLU 283.A OE2 ARG 131.A HH21 3.280 2.537 ILE 132.A N ILE 255.A O ILE 132.A H 3.002 2.154 LYS 133.A N ALA 281.A O LYS 133.A H 2.908 2.050 GLU 134.A N ALA 281.A O GLU 134.A H 3.335 2.508 VAL 136.A N PHE 147.A O VAL 136.A H 2.925 2.105 ARG 137.A NE GLU 139.A OE2 ARG 137.A HE 3.185 2.330 ARG 137.A NH1 GLU 146.A OE1 ARG 137.A HH11 2.935 2.183 VAL 138.A N ALA 145.A O VAL 138.A H 2.894 2.047 ASP 140.A N LYS 143.A O ASP 140.A H 2.895 2.061 ASP 142.A N ASP 142.A OD1 ASP 142.A H 2.753 2.149 LYS 143.A N ASP 140.A O LYS 143.A H 3.171 2.359 TRP 144.A N TYR 261.A O TRP 144.A H 3.211 2.420 ALA 145.A N VAL 138.A O ALA 145.A H 3.032 2.220 GLU 146.A N THR 259.A O GLU 146.A H 2.894 2.086 PHE 147.A N VAL 136.A O PHE 147.A H 2.835 2.047 LYS 148.A N ALA 257.A O LYS 148.A H 2.921 2.150 GLY 152.A N TYR 150.A O GLY 152.A H 2.905 2.275 SER 154.A N GLY 256.A O SER 154.A H 3.236 2.453 LEU 155.A N MET 175.A O LEU 155.A H 3.040 2.215 ASP 156.A N PHE 258.A O ASP 156.A H 2.819 2.102 PHE 157.A N TYR 173.A O PHE 157.A H 2.825 1.969 THR 158.A N ALA 260.A O THR 158.A H 3.044 2.210 ILE 159.A N GLN 171.A O ILE 159.A H 2.796 1.961 HIS 163.A NE2 ASP 219.A O no hydrogen 2.713 N/A ILE 166.A N HIS 163.A O ILE 166.A H 2.999 2.156 SER 168.A OG ASP 167.A OD2 SER 168.A HG 3.285 2.519 SER 169.A N ASP 167.A OD2 SER 169.A H 2.943 2.084 ASN 170.A N ASP 167.A O ASN 170.A H 2.940 2.106 GLN 171.A NE2 PHE 161.A O GLN 171.A HE21 3.477 2.790 TYR 173.A N PHE 157.A O TYR 173.A H 2.842 2.018 MET 175.A N LEU 155.A O MET 175.A H 2.962 2.176 PHE 177.A N PHE 153.A O PHE 177.A H 2.894 2.077 ALA 181.A N SER 178.A OG ALA 181.A H 3.054 2.234 PHE 182.A N SER 178.A O PHE 182.A H 2.834 2.006 MET 183.A N ALA 179.A O MET 183.A H 2.994 2.169 ARG 184.A N ASP 180.A O ARG 184.A H 3.033 2.228 GLN 185.A N ALA 181.A O GLN 185.A H 2.953 2.137 ILE 186.A N PHE 182.A O ILE 186.A H 3.038 2.254 SER 187.A N PHE 182.A O SER 187.A H 2.813 2.098 ALA 189.A N ILE 186.A O ALA 189.A H 3.023 2.172 ARG 190.A N GLU 234.A OE2 ARG 190.A H 2.886 2.044 ARG 190.A NE GLU 234.A OE2 ARG 190.A HE 2.942 2.081 ARG 190.A NH2 GLY 228.A O ARG 190.A HH22 3.069 2.235 ARG 190.A NH2 GLU 234.A OE1 ARG 190.A HH21 3.018 2.164 THR 191.A N GLY 106.A O THR 191.A H 2.947 2.154 GLY 193.A N ILE 216.A O GLY 193.A H 2.911 2.166 MET 195.A N VAL 218.A O MET 195.A H 2.910 2.070 ARG 196.A NH1 ARG 196.A O ARG 196.A HH11 3.107 2.397 ILE 198.A N PHE 194.A O ILE 198.A H 3.058 2.240 GLU 199.A N MET 195.A O GLU 199.A H 2.814 1.973 TYR 200.A N ARG 196.A O TYR 200.A H 3.022 2.216 LEU 201.A N ASP 197.A O LEU 201.A H 2.952 2.126 GLN 202.A N ILE 198.A O GLN 202.A H 2.936 2.104 GLN 202.A NE2 CYS 207.A O GLN 202.A HE22 2.936 2.086 GLN 202.A NE2 GLY 210.A O GLN 202.A HE21 3.680 3.002 SER 203.A N GLU 199.A O SER 203.A H 2.944 2.210 ARG 204.A N LEU 201.A O ARG 204.A H 2.996 2.229 ARG 204.A NH1 TYR 200.A OH ARG 204.A HH11 3.070 2.445 GLY 205.A N GLN 202.A O GLY 205.A H 3.113 2.274 LEU 206.A N LEU 201.A O LEU 206.A H 2.806 1.985 LEU 208.A N HIS 19.A O LEU 208.A H 3.041 2.220 GLY 209.A N LEU 18.A O GLY 209.A H 2.854 2.023 GLY 210.A N CYS 207.A O GLY 210.A H 3.121 2.280 ASP 213.A N SER 211.A OG ASP 213.A H 3.044 2.330 CYS 214.A N SER 211.A O CYS 214.A H 3.131 2.275 ILE 216.A N THR 191.A O ILE 216.A H 2.957 2.139 VAL 217.A N ASN 225.A OD1 VAL 217.A H 2.891 2.053 VAL 218.A N GLY 193.A O VAL 218.A H 3.131 2.321 ASP 219.A N ARG 222.A O ASP 219.A H 3.141 2.403 TYR 221.A N ASP 219.A OD1 TYR 221.A H 2.889 2.045 ARG 222.A N ASP 219.A OD1 ARG 222.A H 2.870 2.076 LEU 224.A N VAL 217.A O LEU 224.A H 2.800 1.945 ASN 225.A ND2 ALA 215.A O ASN 225.A HD21 2.992 2.154 GLY 228.A N ASN 225.A O GLY 228.A H 3.077 2.261 ARG 230.A N GLU 234.A OE1 ARG 230.A H 2.802 1.999 ARG 230.A NH1 ASP 105.A OD2 ARG 230.A HH12 3.015 2.249 ARG 230.A NH1 ARG 188.A O ARG 230.A HH11 2.804 2.015 ARG 230.A NH2 ASP 105.A OD2 ARG 230.A HH22 2.988 2.214 ASP 233.A N ASP 233.A OD1 ASP 233.A H 2.645 2.024 GLU 234.A N PHE 231.A O GLU 234.A H 3.097 2.431 ARG 237.A N ASP 233.A O ARG 237.A H 3.214 2.380 ARG 237.A NE ASP 233.A OD1 ARG 237.A HE 2.845 1.991 ARG 237.A NH1 GLN 185.A O ARG 237.A HH11 2.827 2.009 ARG 237.A NH1 GLN 185.A OE1 ARG 237.A HH12 3.013 2.169 ARG 237.A NH2 ASP 233.A OD1 ARG 237.A HH21 3.560 2.923 HIS 238.A N GLU 234.A O HIS 238.A H 2.960 2.186 HIS 238.A ND1 ALA 189.A O HIS 238.A HD1 2.913 2.062 LYS 239.A N PHE 235.A O LYS 239.A H 3.111 2.335 LYS 239.A NZ ASP 242.A OD2 LYS 239.A HZ2 3.012 2.352 MET 240.A N VAL 236.A O MET 240.A H 3.061 2.314 LEU 241.A N ARG 237.A O LEU 241.A H 2.995 2.185 ASP 242.A N HIS 238.A O ASP 242.A H 2.817 2.012 ALA 243.A N LYS 239.A O ALA 243.A H 2.944 2.178 ILE 244.A N MET 240.A O ILE 244.A H 2.914 2.100 GLY 245.A N LEU 241.A O GLY 245.A H 3.075 2.261 ASP 246.A N ASP 242.A O ASP 246.A H 2.858 2.046 LEU 247.A N ALA 243.A O LEU 247.A H 2.941 2.103 PHE 248.A N ILE 244.A O PHE 248.A H 3.130 2.408 MET 249.A N ASP 246.A O MET 249.A H 3.133 2.296 CYS 250.A SG LEU 247.A O CYS 250.A HG 3.493 2.382 GLY 251.A N PHE 248.A O GLY 251.A H 2.937 2.134 HIS 252.A ND1 LYS 128.A O no hydrogen 2.966 N/A ASN 253.A ND2 ALA 85.A O ASN 253.A HD21 3.571 2.767 ILE 255.A N VAL 130.A O ILE 255.A H 2.884 2.076 ALA 257.A N LYS 148.A O ALA 257.A H 2.793 1.956 PHE 258.A N SER 154.A O PHE 258.A H 2.828 1.982 THR 259.A N GLU 146.A O THR 259.A H 3.088 2.257 ALA 260.A N ASP 156.A O ALA 260.A H 2.944 2.128 TYR 261.A N TRP 144.A O TYR 261.A H 2.896 2.050 LYS 262.A N THR 158.A O LYS 262.A H 2.846 1.877 LYS 262.A NZ ASP 142.A OD1 LYS 262.A HZ3 3.283 2.547 LYS 262.A NZ ASP 142.A OD2 LYS 262.A HZ3 2.496 1.523 LYS 262.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 262.A HZ2 3.106 2.191 SER 263.A OG ASN 268.A OD1 SER 263.A HG 2.687 2.060 HIS 265.A ND1 ASP 246.A OD1 HIS 265.A HD1 3.020 2.210 HIS 265.A ND1 ASP 246.A OD2 HIS 265.A HD1 3.138 2.392 ASN 268.A N GLY 264.A O ASN 268.A H 2.956 2.121 ASN 268.A ND2 ASP 246.A OD2 ASN 268.A HD22 3.058 2.203 ASN 269.A N HIS 265.A O ASN 269.A H 2.995 2.166 ASN 269.A ND2 ALA 54.A O ASN 269.A HD21 2.942 2.088 LYS 270.A N ALA 266.A O LYS 270.A H 2.996 2.246 LYS 270.A NZ GLU 139.A O LYS 270.A HZ3 3.354 2.574 LEU 271.A N LEU 267.A O LEU 271.A H 2.975 2.197 LEU 272.A N ASN 268.A O LEU 272.A H 3.063 2.237 GLN 273.A N ASN 269.A O GLN 273.A H 2.946 2.111 GLN 273.A NE2 ASN 269.A OD1 GLN 273.A HE22 2.877 2.061 ALA 274.A N LYS 270.A O ALA 274.A H 3.013 2.238 VAL 275.A N LEU 271.A O VAL 275.A H 2.943 2.102 LEU 276.A N LEU 272.A O LEU 276.A H 3.108 2.262 ALA 277.A N GLN 273.A O ALA 277.A H 2.920 2.171 LYS 278.A N VAL 275.A O LYS 278.A H 3.132 2.410 LYS 278.A NZ GLU 280.A OE1 LYS 278.A HZ2 3.440 2.582 GLU 280.A N GLU 280.A OE1 GLU 280.A H 2.965 2.194 ALA 281.A N LYS 278.A O ALA 281.A H 3.001 2.194 TRP 282.A NE1 LEU 276.A O TRP 282.A HE1 3.180 2.415 GLU 283.A N ARG 131.A O GLU 283.A H 3.092 2.358 VAL 285.A N PHE 129.A O VAL 285.A H 2.937 2.144 ALA 291.A N ASP 289.A OD1 ALA 291.A H 2.965 2.123 GLU 292.A N ASP 289.A O GLU 292.A H 3.259 2.526 PHE 297.A N PRO 294.A O PHE 297.A H 3.232 2.400 LYS 298.A N LEU 295.A O LYS 298.A H 3.385 2.604 LYS 298.A NZ LEU 293.A O LYS 298.A HZ3 3.332 2.616