Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3ps3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N GLN 288.A O MET 1.A H1 3.245 2.529 ILE 2.A N PHE 287.A O ILE 2.A H 2.929 2.080 GLN 4.A N CYS 125.A O GLN 4.A H 2.959 2.141 GLN 4.A NE2 ASN 34.A OD1 GLN 4.A HE22 2.961 2.102 GLN 4.A NE2 ALA 126.A O GLN 4.A HE21 2.983 2.142 ARG 5.A N.A ASP 90.A OD2 ARG 5.A H 2.984 2.233 ARG 5.A N.B ASP 90.A OD2 ARG 5.A H 2.979 2.233 ARG 5.A NH2.B GLU 122.A OE2 no hydrogen 2.856 N/A THR 6.A N ASP 121.A O THR 6.A H 2.880 2.103 THR 6.A OG1 ASN 91.A O THR 6.A HG1 2.860 2.080 LYS 8.A N ALA 118.A O LYS 8.A H 2.991 2.337 LYS 8.A N GLY 119.A O LYS 8.A H 3.233 2.501 ARG 9.A N ALA 118.A O ARG 9.A H 2.956 2.257 ARG 9.A NH1 ASP 117.A O ARG 9.A HH11 2.908 2.141 VAL 11.A N LEU 28.A O VAL 11.A H 3.153 2.399 GLN 12.A NE2 THR 27.A OG1 GLN 12.A HE21 2.770 2.150 ALA 13.A N LEU 26.A O ALA 13.A H 2.938 2.165 GLY 15.A N VAL 24.A O GLY 15.A H 3.107 2.392 GLY 17.A N LYS 22.A O GLY 17.A H 3.016 2.241 HIS 19.A N GLU 100.A OE1 HIS 19.A H 3.067 2.212 HIS 19.A N GLU 100.A OE2 HIS 19.A H 3.257 2.612 HIS 19.A ND1 GLU 100.A OE1 no hydrogen 2.992 N/A THR 20.A N GLU 100.A OE2 THR 20.A H 3.051 2.219 THR 20.A OG1 GLU 100.A OE2 THR 20.A HG1 3.253 2.463 GLY 21.A N GLY 17.A O GLY 21.A H 2.850 2.069 LYS 22.A N THR 20.A OG1 LYS 22.A H 3.152 2.306 VAL 24.A N GLY 15.A O VAL 24.A H 2.702 1.851 THR 25.A N ASN 97.A OD1 THR 25.A H 2.913 2.084 LEU 26.A N ALA 13.A O LEU 26.A H 2.743 1.884 THR 27.A N GLU 95.A O THR 27.A H 2.796 1.963 LEU 28.A N VAL 11.A O LEU 28.A H 2.877 2.040 ARG 29.A N VAL 93.A O ARG 29.A H 2.877 2.111 ARG 29.A NE GLU 95.A OE2 ARG 29.A HE 2.930 2.159 ARG 29.A NH2 GLU 95.A OE1 ARG 29.A HH22 3.333 2.520 ALA 31.A N THR 6.A OG1 ALA 31.A H 2.892 2.091 ASN 34.A N GLN 4.A OE1 ASN 34.A H 2.943 2.149 THR 35.A OG1 PRO 32.A O THR 35.A HG1 2.764 2.027 GLY 36.A N ASN 91.A OD1 GLY 36.A H 2.878 2.066 ILE 38.A N ILE 92.A O ILE 38.A H 3.064 2.265 TYR 39.A N PHE 50.A O TYR 39.A H 3.095 2.269 ARG 40.A N ILE 94.A O ARG 40.A H 2.706 1.931 ARG 40.A NE ASP 49.A OD1 ARG 40.A HE 2.881 1.930 ARG 40.A NH1 GLU 95.A OE2 ARG 40.A HH11 2.906 2.117 ARG 40.A NH2 ASP 49.A OD2 ARG 40.A HH22 3.262 2.406 ARG 41.A N VAL 48.A O ARG 41.A H 2.910 2.130 ARG 41.A NE ASP 43.A OD1 ARG 41.A HE 3.065 2.153 ARG 41.A NH1 ARG 73.A O ARG 41.A HH11 2.849 2.070 ARG 41.A NH2 ASP 43.A OD1 ARG 41.A HH22 3.531 2.859 ARG 41.A NH2 ASP 43.A OD2 ARG 41.A HH22 2.919 2.095 THR 42.A N VAL 96.A O THR 42.A H 2.965 2.126 VAL 48.A N ARG 41.A O VAL 48.A H 3.067 2.295 PHE 50.A N TYR 39.A O PHE 50.A H 2.646 1.876 ALA 52.A N VAL 37.A O ALA 52.A H 2.929 2.085 LYS 55.A N ASP 53.A OD1 LYS 55.A H 2.946 2.118 SER 56.A N ASP 53.A O SER 56.A H 2.994 2.172 ARG 58.A N CYS 65.A O ARG 58.A H 2.953 2.126 ARG 58.A NH1 LYS 55.A O ARG 58.A HH12 2.974 2.186 ARG 58.A NH1 VAL 57.A O ARG 58.A HH11 2.900 2.058 THR 60.A OG1 LEU 62.A O THR 60.A HG1 3.058 2.367 THR 60.A OG1 CYS 63.A O THR 60.A HG1 3.537 2.997 THR 64.A N GLU 78.A OE1 THR 64.A H 3.172 2.501 THR 64.A OG1 GLU 78.A OE1 THR 64.A HG1 2.733 1.916 CYS 65.A N ARG 58.A O CYS 65.A H 3.027 2.217 LEU 66.A N ILE 74.A O LEU 66.A H 2.890 2.095 VAL 67.A N SER 56.A O VAL 67.A H 3.062 2.320 ASN 68.A N VAL 72.A O ASN 68.A H 3.149 2.379 GLU 69.A N GLU 69.A OE1 GLU 69.A H 2.921 2.125 HIS 70.A N ASN 68.A OD1 HIS 70.A H 3.033 2.291 ASP 71.A N ASN 68.A O ASP 71.A H 3.026 2.181 VAL 72.A N ASN 68.A OD1 VAL 72.A H 2.944 2.243 ILE 74.A N LEU 66.A O ILE 74.A H 3.092 2.303 SER 75.A N PRO 99.A O SER 75.A H 3.054 2.258 THR 76.A N THR 64.A O THR 76.A H 2.647 1.874 GLU 78.A N GLU 78.A OE1 GLU 78.A H 2.808 2.022 ASN 81.A N VAL 77.A O ASN 81.A H 2.950 2.116 ASN 81.A ND2 GLY 245.A O ASN 81.A HD21 3.016 2.141 ALA 82.A N GLU 78.A O ALA 82.A H 2.933 2.183 ALA 83.A N HIS 79.A O ALA 83.A H 3.171 2.375 LEU 84.A N LEU 80.A O LEU 84.A H 2.992 2.252 ALA 85.A N ASN 81.A O ALA 85.A H 3.156 2.356 GLY 86.A N ALA 82.A O GLY 86.A H 2.998 2.181 LEU 87.A N ALA 83.A O LEU 87.A H 3.035 2.240 GLY 88.A N ALA 85.A O GLY 88.A H 3.236 2.426 ILE 89.A N LEU 84.A O ILE 89.A H 2.926 2.089 ASP 90.A N ARG 5.A O.A ASP 90.A H 3.201 2.382 ASP 90.A N ARG 5.A O.B ASP 90.A H 3.067 2.233 ASN 91.A N ARG 5.A O.A ASN 91.A H 3.159 2.368 ASN 91.A N ARG 5.A O.B ASN 91.A H 3.181 2.378 ASN 91.A ND2 GLN 4.A OE1 ASN 91.A HD22 2.985 2.024 ILE 92.A N GLY 36.A O ILE 92.A H 2.945 2.159 VAL 93.A N ARG 29.A O VAL 93.A H 3.082 2.245 ILE 94.A N ILE 38.A O ILE 94.A H 2.837 1.994 GLU 95.A N THR 27.A O GLU 95.A H 2.788 1.933 VAL 96.A N ARG 40.A O VAL 96.A H 2.999 2.190 ILE 101.A N SER 75.A O ILE 101.A H 3.024 2.187 ILE 103.A N VAL 16.A O ILE 103.A H 2.992 2.180 GLY 106.A N ILE 103.A O GLY 106.A H 3.089 2.272 SER 107.A N ASP 105.A OD1 SER 107.A H 2.860 2.037 ALA 108.A N SER 187.A O ALA 108.A H 2.898 2.155 PHE 111.A N ALA 108.A O PHE 111.A H 2.942 2.289 VAL 112.A N ALA 108.A O VAL 112.A H 3.254 2.560 VAL 112.A N ALA 109.A O VAL 112.A H 2.842 2.201 LEU 114.A N PRO 110.A O LEU 114.A H 3.376 2.559 LEU 115.A N PHE 111.A O LEU 115.A H 2.994 2.167 LEU 116.A N VAL 112.A O LEU 116.A H 2.978 2.174 ASP 117.A N TYR 113.A O ASP 117.A H 2.944 2.158 ALA 118.A N LEU 114.A O ALA 118.A H 3.240 2.559 ALA 118.A N LEU 115.A O ALA 118.A H 3.063 2.433 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 3.125 2.429 ASP 121.A N THR 6.A O ASP 121.A H 2.906 2.066 LEU 123.A N GLN 4.A O LEU 123.A H 2.895 2.046 CYS 125.A N LEU 123.A O CYS 125.A H 2.675 1.978 LYS 127.A N ILE 2.A O LYS 127.A H 2.989 2.151 LYS 127.A NZ ASN 253.A OD1 LYS 127.A HZ1 3.437 2.795 PHE 129.A N VAL 285.A O PHE 129.A H 2.945 2.089 VAL 130.A N ASN 253.A O VAL 130.A H 2.988 2.158 ARG 131.A N GLU 283.A O ARG 131.A H 2.872 2.055 ARG 131.A NE GLU 283.A OE2 ARG 131.A HE 3.062 2.143 ARG 131.A NH2 GLU 283.A OE2 ARG 131.A HH22 3.322 2.597 ILE 132.A N ILE 255.A O ILE 132.A H 3.027 2.201 LYS 133.A N ALA 281.A O LYS 133.A H 3.026 2.171 LYS 133.A NZ GLU 283.A OE1 LYS 133.A HZ3 3.512 2.634 GLU 134.A N ALA 281.A O GLU 134.A H 3.313 2.607 VAL 136.A N PHE 147.A O VAL 136.A H 2.997 2.174 ARG 137.A NE GLU 139.A OE2 ARG 137.A HE 3.140 2.183 ARG 137.A NH1 GLU 146.A OE1 ARG 137.A HH11 3.281 2.584 VAL 138.A N ALA 145.A O VAL 138.A H 2.944 2.101 ASP 140.A N LYS 143.A O ASP 140.A H 3.025 2.193 ASP 142.A N ASP 142.A OD1 ASP 142.A H 2.654 1.987 LYS 143.A N ASP 140.A O LYS 143.A H 3.230 2.402 TRP 144.A N TYR 261.A O TRP 144.A H 3.166 2.343 ALA 145.A N VAL 138.A O ALA 145.A H 3.106 2.305 GLU 146.A N THR 259.A O GLU 146.A H 2.895 2.075 PHE 147.A N VAL 136.A O PHE 147.A H 2.872 2.088 LYS 148.A N ALA 257.A O LYS 148.A H 2.917 2.219 GLY 152.A N TYR 150.A O GLY 152.A H 2.784 2.145 SER 154.A N GLY 256.A O SER 154.A H 3.314 2.525 LEU 155.A N MET 175.A O LEU 155.A H 3.041 2.235 ASP 156.A N PHE 258.A O ASP 156.A H 2.783 2.042 PHE 157.A N TYR 173.A O PHE 157.A H 2.841 1.980 THR 158.A N ALA 260.A O THR 158.A H 2.991 2.153 ILE 159.A N GLN 171.A O ILE 159.A H 3.051 2.275 HIS 163.A NE2 ASP 219.A O no hydrogen 2.709 N/A ILE 166.A N HIS 163.A O ILE 166.A H 2.934 2.097 ASN 170.A N ASP 167.A O ASN 170.A H 2.961 2.169 GLN 171.A NE2 ILE 166.A O GLN 171.A HE21 3.657 2.978 ARG 172.A NH2 ASP 156.A OD2 ARG 172.A HH22 2.867 2.181 TYR 173.A N PHE 157.A O TYR 173.A H 2.838 2.028 MET 175.A N LEU 155.A O MET 175.A H 3.046 2.262 PHE 177.A N PHE 153.A O PHE 177.A H 2.793 2.050 ALA 181.A N SER 178.A OG ALA 181.A H 3.068 2.246 PHE 182.A N SER 178.A O PHE 182.A H 2.842 2.041 MET 183.A N ALA 179.A O MET 183.A H 3.064 2.259 ARG 184.A N ASP 180.A O ARG 184.A H 3.110 2.366 GLN 185.A N.A ALA 181.A O GLN 185.A H 2.935 2.112 GLN 185.A N.B ALA 181.A O GLN 185.A H 2.932 2.112 ILE 186.A N PHE 182.A O ILE 186.A H 3.134 2.369 SER 187.A N PHE 182.A O SER 187.A H 2.763 2.058 ALA 189.A N ILE 186.A O ALA 189.A H 3.010 2.151 ARG 190.A N GLU 234.A OE2 ARG 190.A H 2.825 2.008 ARG 190.A NE GLU 234.A OE2 ARG 190.A HE 2.950 1.980 ARG 190.A NH2 GLY 228.A O ARG 190.A HH21 3.044 2.201 ARG 190.A NH2 GLU 234.A OE1 ARG 190.A HH22 3.030 2.175 THR 191.A N GLY 106.A O THR 191.A H 2.975 2.238 GLY 193.A N ILE 216.A O GLY 193.A H 2.895 2.122 MET 195.A N VAL 218.A O MET 195.A H 2.888 2.071 ARG 196.A NH1 ARG 196.A O ARG 196.A HH11 2.975 2.240 ILE 198.A N PHE 194.A O ILE 198.A H 3.136 2.295 GLU 199.A N MET 195.A O GLU 199.A H 2.887 2.035 TYR 200.A N ARG 196.A O TYR 200.A H 2.991 2.211 LEU 201.A N ASP 197.A O LEU 201.A H 2.910 2.076 GLN 202.A N ILE 198.A O GLN 202.A H 2.922 2.072 GLN 202.A NE2 CYS 207.A O GLN 202.A HE21 2.821 1.968 GLN 202.A NE2 GLY 210.A O GLN 202.A HE22 3.168 2.424 SER 203.A N GLU 199.A O SER 203.A H 3.071 2.404 SER 203.A N TYR 200.A O SER 203.A H 2.935 2.276 SER 203.A OG TYR 200.A O SER 203.A HG 2.658 2.138 ARG 204.A N TYR 200.A O ARG 204.A H 3.087 2.410 ARG 204.A N LEU 201.A O ARG 204.A H 2.930 2.242 ARG 204.A NH1 TYR 200.A OH ARG 204.A HH11 3.112 2.459 GLY 205.A N GLN 202.A O GLY 205.A H 3.270 2.449 LEU 206.A N LEU 201.A O LEU 206.A H 2.792 1.950 LEU 208.A N HIS 19.A O LEU 208.A H 2.975 2.168 GLY 209.A N LEU 18.A O GLY 209.A H 2.858 2.036 GLY 210.A N CYS 207.A O GLY 210.A H 3.063 2.223 ASP 213.A N SER 211.A OG ASP 213.A H 3.108 2.402 CYS 214.A N SER 211.A O CYS 214.A H 3.121 2.270 CYS 214.A SG GLY 209.A O CYS 214.A HG 3.708 2.807 ILE 216.A N THR 191.A O ILE 216.A H 2.937 2.121 VAL 217.A N ASN 225.A OD1 VAL 217.A H 2.866 2.044 VAL 218.A N GLY 193.A O VAL 218.A H 3.146 2.331 ASP 219.A N ARG 222.A O ASP 219.A H 3.089 2.409 TYR 221.A N ASP 219.A OD1 TYR 221.A H 2.946 2.111 ARG 222.A N ASP 219.A OD1 ARG 222.A H 2.915 2.083 LEU 224.A N VAL 217.A O LEU 224.A H 2.846 1.988 ASN 225.A ND2 ALA 215.A O ASN 225.A HD22 2.967 2.029 GLY 228.A N ASN 225.A O GLY 228.A H 2.998 2.206 ARG 230.A N GLU 234.A OE1 ARG 230.A H 2.898 2.062 ARG 230.A NH1 ASP 105.A OD2 ARG 230.A HH12 2.899 2.148 ARG 230.A NH1 ARG 188.A O ARG 230.A HH11 2.803 2.014 ARG 230.A NH2 ASP 105.A OD2 ARG 230.A HH21 2.910 2.163 ASP 233.A N ASP 233.A OD1 ASP 233.A H 2.624 2.004 GLU 234.A N PHE 231.A O GLU 234.A H 3.353 2.629 ARG 237.A N ASP 233.A O ARG 237.A H 3.110 2.260 ARG 237.A NE ASP 233.A OD1 ARG 237.A HE 2.846 1.900 ARG 237.A NH1 GLN 185.A O.A ARG 237.A HH11 2.855 2.049 ARG 237.A NH1 GLN 185.A O.B ARG 237.A HH11 3.011 2.197 ARG 237.A NH1 GLN 185.A OE1.A ARG 237.A HH12 3.111 2.272 HIS 238.A N GLU 234.A O HIS 238.A H 2.892 2.092 HIS 238.A ND1 ALA 189.A O HIS 238.A HD1 3.017 2.191 LYS 239.A N PHE 235.A O LYS 239.A H 3.059 2.298 MET 240.A N VAL 236.A O MET 240.A H 3.063 2.318 MET 240.A N ARG 237.A O MET 240.A H 3.142 2.554 LEU 241.A N ARG 237.A O LEU 241.A H 2.975 2.173 ASP 242.A N HIS 238.A O ASP 242.A H 2.864 2.054 ALA 243.A N LYS 239.A O ALA 243.A H 2.947 2.175 ILE 244.A N MET 240.A O ILE 244.A H 2.981 2.135 GLY 245.A N LEU 241.A O GLY 245.A H 3.101 2.271 ASP 246.A N ASP 242.A O ASP 246.A H 2.825 2.021 LEU 247.A N ALA 243.A O LEU 247.A H 2.919 2.078 PHE 248.A N ILE 244.A O PHE 248.A H 3.129 2.409 MET 249.A N ASP 246.A O MET 249.A H 3.155 2.319 CYS 250.A SG LEU 247.A O CYS 250.A HG 3.538 2.384 GLY 251.A N PHE 248.A O GLY 251.A H 2.980 2.182 HIS 252.A ND1 LYS 128.A O no hydrogen 2.931 N/A ILE 255.A N VAL 130.A O ILE 255.A H 2.869 2.096 ALA 257.A N LYS 148.A O ALA 257.A H 2.773 1.963 PHE 258.A N SER 154.A O PHE 258.A H 2.824 1.987 THR 259.A N GLU 146.A O THR 259.A H 3.043 2.198 ALA 260.A N ASP 156.A O ALA 260.A H 2.885 2.061 TYR 261.A N TRP 144.A O TYR 261.A H 2.962 2.153 LYS 262.A N THR 158.A O LYS 262.A H 2.780 1.924 LYS 262.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 262.A HZ2 3.287 2.516 SER 263.A OG ASN 268.A OD1 SER 263.A HG 2.660 2.113 HIS 265.A ND1 ASP 246.A OD1 HIS 265.A HD1 3.030 2.228 HIS 265.A ND1 ASP 246.A OD2 HIS 265.A HD1 2.982 2.230 ASN 268.A N GLY 264.A O ASN 268.A H 2.869 2.008 ASN 268.A ND2 ASP 246.A OD2 ASN 268.A HD21 3.057 2.079 ASN 269.A N HIS 265.A O ASN 269.A H 2.987 2.151 ASN 269.A ND2 ALA 54.A O ASN 269.A HD22 2.944 1.974 LYS 270.A N ALA 266.A O LYS 270.A H 2.914 2.159 LYS 270.A NZ GLU 139.A O LYS 270.A HZ3 3.173 2.571 LEU 271.A N LEU 267.A O LEU 271.A H 2.910 2.104 LEU 272.A N ASN 268.A O LEU 272.A H 2.994 2.163 GLN 273.A N ASN 269.A O GLN 273.A H 3.001 2.159 GLN 273.A NE2 ASN 269.A OD1 GLN 273.A HE21 2.912 2.128 ALA 274.A N LYS 270.A O ALA 274.A H 2.997 2.246 VAL 275.A N LEU 271.A O VAL 275.A H 2.853 2.028 LEU 276.A N LEU 272.A O LEU 276.A H 3.121 2.278 ALA 277.A N GLN 273.A O ALA 277.A H 2.962 2.248 GLN 279.A NE2 GLU 280.A OE2 GLN 279.A HE21 3.482 2.843 ALA 281.A N LYS 278.A O ALA 281.A H 3.078 2.258 TRP 282.A NE1 LEU 276.A O TRP 282.A HE1 3.130 2.339 GLU 283.A N ARG 131.A O GLU 283.A H 3.136 2.423 VAL 285.A N PHE 129.A O VAL 285.A H 3.019 2.247 ALA 291.A N ASP 289.A OD1 ALA 291.A H 3.002 2.248 GLU 292.A N ASP 289.A O GLU 292.A H 3.183 2.415 LEU 293.A N ASP 290.A O LEU 293.A H 2.991 2.220 PHE 297.A N PRO 294.A O PHE 297.A H 3.198 2.403