Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3pvj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 1.A N GLY 16.A O no hydrogen 3.543 N/A THR 2.A N SER 15.A O THR 2.A H 2.752 1.905 THR 4.A N GLN 13.A O THR 4.A H 2.782 1.926 LEU 6.A N GLY 11.A O LEU 6.A H 2.904 2.048 SER 7.A OG.A LEU 6.A O SER 7.A HG.A 3.030 2.551 ALA 9.A N SER 7.A OG.B ALA 9.A H 3.003 2.308 GLY 11.A N HIS 38.A O GLY 11.A H 2.842 1.994 ALA 12.A N VAL 40.A O ALA 12.A H 3.043 2.289 GLN 13.A N THR 4.A O GLN 13.A H 2.733 1.921 ILE 14.A N PHE 42.A O ILE 14.A H 2.741 1.915 SER 15.A N THR 2.A O SER 15.A H 2.991 2.180 ILE 19.A N GLN 46.A OE1 ILE 19.A H 3.159 2.330 SER 20.A N ASP 18.A OD1 SER 20.A H 3.088 2.307 ARG 21.A N ASP 18.A O ARG 21.A H 3.298 2.450 SER 24.A N GLU 27.A OE1 SER 24.A H 2.915 2.089 GLU 26.A N GLU 26.A OE1 GLU 26.A H 2.840 2.146 GLU 27.A N SER 24.A OG GLU 27.A H 2.930 2.080 ARG 28.A N SER 24.A O ARG 28.A H 2.888 2.048 ARG 28.A NE ARG 59.A O ARG 28.A HE 2.820 1.994 ARG 28.A NH1 ASP 29.A OD1 ARG 28.A HH11 2.939 2.211 ARG 28.A NH2 ARG 59.A O ARG 28.A HH21 3.147 2.446 ASP 29.A N ALA 25.A O ASP 29.A H 2.916 2.083 ALA 30.A N GLU 26.A O ALA 30.A H 2.878 2.107 ILE 31.A N GLU 27.A O ILE 31.A H 2.979 2.154 GLU 32.A N ARG 28.A O GLU 32.A H 2.867 2.027 GLN 33.A N ASP 29.A O GLN 33.A H 2.936 2.136 ALA 34.A N ALA 30.A O ALA 34.A H 2.995 2.185 LEU 35.A N ILE 31.A O LEU 35.A H 2.846 2.066 LEU 36.A N GLU 32.A O LEU 36.A H 2.968 2.152 GLN 37.A N GLN 33.A O GLN 37.A H 2.933 2.180 HIS 38.A N ALA 34.A O HIS 38.A H 2.754 1.898 GLN 39.A N LEU 35.A O GLN 39.A H 2.760 2.018 GLN 39.A NE2 ALA 9.A O GLN 39.A HE21 3.445 2.810 GLN 39.A NE2 GLN 37.A O GLN 39.A HE22 3.110 2.257 VAL 40.A N HIS 38.A O VAL 40.A H.B 2.757 2.026 LEU 41.A N PHE 243.A O LEU 41.A H 2.826 2.008 PHE 42.A N ALA 12.A O PHE 42.A H 2.891 2.120 LEU 43.A N VAL 241.A O LEU 43.A H 2.920 2.100 ARG 44.A NE ASP 240.A OD1 ARG 44.A HE 2.917 2.074 ARG 44.A NH2 ARG 235.A O ARG 44.A HH22 2.890 2.164 ARG 44.A NH2 ASP 240.A OD1 ARG 44.A HH21 3.538 2.875 ARG 44.A NH2 ASP 240.A OD2 ARG 44.A HH21 2.846 2.075 GLN 46.A N ASN 239.A O GLN 46.A H 2.898 2.066 GLN 46.A NE2 ASP 18.A OD1 GLN 46.A HE21 3.410 2.615 GLN 46.A NE2 PRO 47.A O GLN 46.A HE22 3.160 2.344 ASN 49.A N GLN 52.A OE1 ASN 49.A H 3.006 2.187 GLN 52.A N ASN 49.A OD1 GLN 52.A H 2.912 2.080 GLN 53.A N ASN 49.A O GLN 53.A H 2.922 2.110 GLN 53.A NE2 VAL 109.A O GLN 53.A HE22 2.971 2.368 GLN 53.A NE2 HIS 265.A O GLN 53.A HE21 2.986 2.131 ALA 54.A N PRO 50.A O ALA 54.A H 2.960 2.115 ARG 55.A N GLU 51.A O ARG 55.A H 2.942 2.118 ARG 55.A NE ASP 22.A OD1 ARG 55.A HE 3.154 2.347 ARG 55.A NH2 ASP 22.A OD1 ARG 55.A HH21 3.306 2.568 ARG 55.A NH2 ASP 22.A OD2 ARG 55.A HH21 3.064 2.248 PHE 56.A N GLN 52.A O PHE 56.A H 2.972 2.156 ALA 57.A N GLN 53.A O ALA 57.A H 2.930 2.081 ALA 58.A N ALA 54.A O ALA 58.A H 2.898 2.094 ARG 59.A N PHE 56.A O ARG 59.A H 3.046 2.222 ARG 59.A NH1 ILE 23.A O ARG 59.A HH12 2.892 2.052 ARG 59.A NH2 ILE 23.A O ARG 59.A HH22 3.508 2.854 PHE 60.A N ALA 57.A O PHE 60.A H 2.962 2.120 HIS 64.A N THR 268.A O HIS 64.A H 2.868 2.025 VAL 72.A N VAL 78.A O VAL 72.A H 2.905 2.101 THR 75.A N VAL 72.A O THR 75.A H 2.910 2.191 VAL 78.A N THR 75.A O VAL 78.A H 2.891 2.036 LEU 79.A N ARG 266.A O LEU 79.A H 2.860 2.013 VAL 80.A N PRO 70.A O VAL 80.A H 2.922 2.102 LEU 81.A N MET 264.A O.A LEU 81.A H 2.844 1.993 LEU 81.A N MET 264.A O.B LEU 81.A H 2.819 1.964 THR 83.A N ARG 262.A O THR 83.A H 2.879 2.037 ALA 84.A N ASP 82.A OD1 ALA 84.A H 2.907 2.066 VAL 85.A N ASP 82.A O VAL 85.A H 2.796 1.950 THR 86.A N ASP 82.A O THR 86.A H 2.838 2.041 ARG 89.A N ASP 87.A OD1 ARG 89.A H 2.973 2.128 ASN 91.A N VAL 88.A O ASN 91.A H 2.988 2.162 ALA 92.A N ARG 89.A O ALA 92.A H 2.995 2.147 HIS 95.A N HIS 251.A O HIS 95.A H 3.185 2.365 HIS 95.A ND1 VAL 93.A O HIS 95.A HD1 2.784 1.937 THR 96.A OG1 THR 249.A O THR 96.A HG1 2.708 1.988 ASP 97.A N ASN 246.A OD1 ASP 97.A H 2.869 2.040 THR 99.A OG1 ASN 199.A OD1 THR 99.A HG1 3.052 2.343 LEU 101.A N VAL 98.A O LEU 101.A H 3.098 2.249 LEU 106.A N ILE 269.A O LEU 106.A H 2.794 2.073 ALA 108.A N TRP 244.A O ALA 108.A H 3.182 2.429 VAL 109.A N ALA 267.A O VAL 109.A H 2.870 2.059 LEU 110.A N ALA 242.A O LEU 110.A H 2.705 1.896 SER 111.A N HIS 265.A O SER 111.A H 2.835 2.037 ALA 112.A N ASP 240.A O ALA 112.A H 3.097 2.280 LYS 113.A N VAL 263.A O LYS 113.A H 2.888 2.064 LYS 113.A NZ SER 111.A OG LYS 113.A HZ3 3.109 2.445 GLN 114.A N VAL 263.A O GLN 114.A H 3.196 2.424 LEU 115.A N GLU 238.A OE2 LEU 115.A H 3.066 2.271 GLY 120.A N ASP 256.A OD1 GLY 120.A H 2.694 1.902 THR 122.A N TRP 234.A O THR 122.A H 3.141 2.364 LEU 123.A N PHE 252.A O LEU 123.A H 2.779 1.935 TRP 124.A N ILE 232.A O TRP 124.A H 3.082 2.330 ALA 125.A N GLN 250.A O ALA 125.A H 2.847 2.043 SER 126.A N PHE 230.A O SER 126.A H 2.849 2.034 GLY 127.A N VAL 248.A O GLY 127.A H 2.779 1.977 ALA 129.A N SER 126.A OG ALA 129.A H 2.986 2.137 ALA 130.A N SER 126.A O ALA 130.A H 3.072 2.240 PHE 131.A N GLY 127.A O PHE 131.A H 2.920 2.082 GLU 132.A N ILE 128.A O GLU 132.A H 3.025 2.183 ALA 133.A N ALA 129.A O ALA 133.A H 3.130 2.442 LEU 134.A N PHE 131.A O LEU 134.A H 3.090 2.321 LEU 138.A N SER 135.A O LEU 138.A H 3.090 2.490 ARG 139.A N SER 135.A O ARG 139.A H 3.010 2.170 ARG 139.A NH1 LEU 134.A O ARG 139.A HH11 2.855 2.113 GLU 140.A N ALA 136.A O GLU 140.A H.A 2.959 2.129 MET 141.A N PRO 137.A O MET 141.A H 3.011 2.201 LEU 142.A N LEU 138.A O LEU 142.A H 3.000 2.184 ASP 143.A N ARG 139.A O ASP 143.A H 2.960 2.157 LEU 145.A N LEU 142.A O LEU 145.A H 2.938 2.102 THR 146.A N GLU 208.A OE1 THR 146.A H 2.895 2.053 THR 146.A OG1 GLU 208.A OE2 THR 146.A HG1 2.771 1.980 ALA 147.A N HIS 182.A O ALA 147.A H 2.851 2.046 THR 148.A N ARG 205.A O THR 148.A H 2.766 2.034 THR 148.A OG1 ASN 207.A OD1 THR 148.A HG1 2.773 2.031 HIS 149.A N LEU 180.A O HIS 149.A H 2.822 1.996 ASP 150.A N PHE 202.A O ASP 150.A H 2.877 2.127 THR 152.A N ASP 150.A OD1 THR 152.A H 2.966 2.141 THR 152.A OG1 ASP 150.A OD1 THR 152.A HG1 2.791 1.981 THR 152.A OG1 ASP 150.A OD2 THR 152.A HG1 3.148 2.572 LYS 153.A N ASP 150.A O LYS 153.A H 3.029 2.193 LYS 153.A NZ GLU 200.A O LYS 153.A HZ3 2.939 2.121 LYS 153.A NZ THR 203.A O LYS 153.A HZ2 2.782 1.908 SER 154.A N PHE 151.A O SER 154.A H 3.090 2.395 PHE 155.A N PHE 151.A O PHE 155.A H 2.978 2.263 GLU 158.A N GLU 158.A OE1 GLU 158.A H 2.885 2.059 ARG 159.A N PRO 156.A O ARG 159.A H 2.802 2.001 ARG 159.A NH1 ASP 90.A OD2 ARG 159.A HH11 2.736 2.149 PHE 160.A N LEU 157.A O PHE 160.A H 2.719 1.886 GLY 161.A N LEU 157.A O GLY 161.A H 3.350 2.609 THR 163.A N ASP 166.A OD2 THR 163.A H 3.089 2.265 ASP 166.A N THR 163.A OG1 ASP 166.A H 3.056 2.249 LEU 167.A N THR 163.A O LEU 167.A H 2.920 2.088 ALA 168.A N PRO 164.A O ALA 168.A H 2.986 2.202 ARG 169.A N GLN 165.A O ARG 169.A H 3.090 2.251 ARG 169.A NH1 PHE 160.A O ARG 169.A HH12 3.005 2.311 ARG 169.A NH2 ASP 166.A OD1 ARG 169.A HH22 3.322 2.483 TRP 170.A N ASP 166.A O TRP 170.A H 2.979 2.167 TRP 170.A NE1 PHE 155.A O TRP 170.A HE1 3.053 2.215 GLU 171.A N LEU 167.A O GLU 171.A H 2.909 2.112 ALA 172.A N ALA 168.A O ALA 172.A H 2.976 2.145 THR 173.A N ARG 169.A O THR 173.A H 2.957 2.186 THR 173.A OG1 ARG 169.A O THR 173.A HG1 2.843 2.050 ARG 174.A N TRP 170.A O ARG 174.A H 2.855 2.037 ARG 175.A N GLU 171.A O ARG 175.A H 3.013 2.195 ASN 176.A N ALA 172.A O ASN 176.A H 3.001 2.212 ASN 177.A N THR 173.A O ASN 177.A H 2.862 2.223 ASN 177.A N ARG 174.A O ASN 177.A H 3.062 2.386 ASN 177.A ND2 THR 173.A O ASN 177.A HD22 3.000 2.180 LEU 180.A N HIS 149.A O LEU 180.A H 3.228 2.422 HIS 182.A N ALA 147.A O HIS 182.A H 3.002 2.196 HIS 182.A NE2 THR 99.A O HIS 182.A HE2 2.831 2.236 HIS 182.A NE2 LEU 101.A O HIS 182.A HE2 2.886 2.217 VAL 184.A N LEU 145.A O VAL 184.A H 2.850 2.004 ARG 186.A N ALA 195.A O ARG 186.A H 2.789 2.021 ARG 186.A NH1 ARG 247.A O ARG 186.A HH11 3.539 3.006 THR 187.A N PHE 275.A O THR 187.A H 2.785 1.972 HIS 188.A N ARG 193.A O HIS 188.A H 2.984 2.137 HIS 188.A NE2 ASP 245.A OD2 HIS 188.A HE2 2.705 1.850 GLY 192.A N HIS 188.A O GLY 192.A H 2.901 2.155 ARG 193.A N SER 191.A OG ARG 193.A H 3.267 2.410 ARG 193.A NH1 LEU 36.A O ARG 193.A HH11 2.903 2.164 ARG 193.A NH1 GLN 37.A O ARG 193.A HH12 2.903 2.100 LYS 194.A NZ ASP 143.A OD2 LYS 194.A HZ3 2.639 1.845 ALA 195.A N ARG 186.A O ALA 195.A H 2.943 2.164 LEU 196.A N GLY 127.A O LEU 196.A H 3.008 2.232 PHE 197.A N VAL 184.A O PHE 197.A H 2.858 2.115 ASN 199.A N THR 203.A OG1 ASN 199.A H 2.949 2.120 GLY 201.A N TRP 94.A O GLY 201.A H 3.184 2.513 PHE 202.A N ASN 199.A O PHE 202.A H 3.355 2.613 THR 203.A N ASN 199.A O THR 203.A H 2.995 2.149 THR 204.A N THR 148.A O THR 204.A H 2.967 2.145 ARG 205.A NE ILE 206.A O ARG 205.A HE 3.121 2.505 ARG 205.A NE LEU 209.A O ARG 205.A HE 3.139 2.419 ARG 205.A NH2 LEU 209.A O ARG 205.A HH21 2.880 2.093 ILE 206.A N SER 214.A OG ILE 206.A H 2.803 1.958 ASN 207.A N THR 146.A O ASN 207.A H 2.850 2.011 ASN 207.A ND2 THR 146.A OG1 ASN 207.A HD22 2.915 2.067 ASN 207.A ND2 SER 181.A OG ASN 207.A HD21 2.878 2.231 LEU 209.A N ILE 206.A O LEU 209.A H 3.354 2.547 SER 210.A N GLU 213.A OE1 SER 210.A H 2.925 2.087 GLU 213.A N SER 210.A OG GLU 213.A H 3.117 2.266 SER 214.A N SER 210.A O SER 214.A H 2.794 1.961 ASP 215.A N GLU 211.A O ASP 215.A H 2.913 2.087 ALA 216.A N LEU 212.A O ALA 216.A H 3.211 2.376 LEU 217.A N GLU 213.A O LEU 217.A H 2.906 2.085 LEU 218.A N SER 214.A O LEU 218.A H 2.844 1.989 ARG 219.A N ASP 215.A O ARG 219.A H.B 3.080 2.233 ARG 219.A NE.A ASP 215.A OD1 ARG 219.A HE.A 3.335 2.497 ARG 219.A NE.A ASP 215.A OD2 ARG 219.A HE.A 3.065 2.362 ARG 219.A NE.B ASP 215.A OD2 ARG 219.A HE.B 2.879 2.039 ARG 219.A NH2.B ASP 215.A OD2 ARG 219.A HH21.B 3.233 2.520 LEU 220.A N ALA 216.A O LEU 220.A H 3.061 2.243 LEU 221.A N LEU 217.A O LEU 221.A H 2.897 2.073 PHE 222.A N LEU 218.A O PHE 222.A H 2.745 1.900 ALA 223.A N ARG 219.A O ALA 223.A H 3.178 2.330 HIS 224.A N LEU 220.A O HIS 224.A H 2.780 1.935 HIS 224.A NE2 ALA 130.A O HIS 224.A HE2 2.889 2.062 ALA 225.A N LEU 221.A O ALA 225.A H 2.902 2.060 THR 226.A N ALA 223.A O THR 226.A H 3.297 2.501 THR 226.A OG1 PHE 222.A O THR 226.A HG1 2.907 2.168 THR 226.A OG1 ALA 223.A O THR 226.A HG1 3.328 2.847 ARG 227.A N HIS 224.A O ARG 227.A H 3.208 2.350 ARG 227.A NH2 GLU 229.A OE2 ARG 227.A HH21 2.837 2.027 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.717 1.924 PHE 230.A N ARG 227.A O PHE 230.A H 3.029 2.194 SER 231.A N PRO 228.A O SER 231.A H 3.174 2.319 ILE 232.A N TRP 124.A O ILE 232.A H 2.973 2.189 ARG 233.A NE ASP 121.A OD2 ARG 233.A HE 2.797 1.974 ARG 233.A NH2 ASP 121.A OD2 ARG 233.A HH21 3.445 2.807 TRP 234.A N THR 122.A O TRP 234.A H 2.761 1.901 TRP 234.A NE1 ASP 240.A OD2 TRP 234.A HE1 2.843 2.072 GLN 237.A N ASP 240.A OD2 GLN 237.A H.B 2.886 2.066 ASN 239.A N ALA 112.A O ASN 239.A H 2.930 2.080 ASP 240.A N GLN 237.A O ASP 240.A H 3.015 2.223 VAL 241.A N LEU 43.A O VAL 241.A H 2.780 1.989 ALA 242.A N LEU 110.A O ALA 242.A H 2.883 2.101 PHE 243.A N LEU 41.A O PHE 243.A H 2.915 2.086 TRP 244.A N ALA 108.A O TRP 244.A H 3.064 2.275 ASP 245.A N GLN 39.A O ASP 245.A H 2.900 2.093 ASN 246.A N LEU 106.A O ASN 246.A H 2.770 2.099 ASN 246.A ND2 ASP 97.A O ASN 246.A HD21 3.068 2.255 ASN 246.A ND2 ALA 105.A O ASN 246.A HD22 2.992 2.153 ARG 247.A N ASP 245.A OD1 ARG 247.A H 2.934 2.100 ARG 247.A NE ASP 245.A OD1 ARG 247.A HE 2.880 2.027 ARG 247.A NH2 ASP 245.A OD2 ARG 247.A HH21 2.911 2.101 THR 249.A OG1 ASP 245.A O THR 249.A HG1 2.774 2.079 GLN 250.A N ALA 125.A O GLN 250.A H 3.031 2.242 HIS 251.A N HIS 95.A O HIS 251.A H 2.922 2.134 PHE 252.A N LEU 123.A O PHE 252.A H 2.936 2.218 ALA 253.A N ASN 91.A O ALA 253.A H 2.822 1.963 VAL 254.A N ASP 121.A O VAL 254.A H 2.962 2.129 ARG 258.A NE ASP 255.A OD1 ARG 258.A HE 2.996 2.246 ARG 258.A NE ASP 255.A OD2 ARG 258.A HE 3.299 2.583 ARG 258.A NH2 ASP 255.A OD2 ARG 258.A HH21 2.880 2.046 ASN 260.A N TYR 257.A O ASN 260.A H 2.958 2.263 ARG 261.A NE ASP 82.A OD1 ARG 261.A HE 3.011 2.231 ARG 261.A NH2 ASP 82.A OD2 ARG 261.A HH21 2.836 1.998 ARG 262.A N THR 83.A OG1 ARG 262.A H 2.923 2.169 ARG 262.A NH2 GLY 120.A O ARG 262.A HH21 3.047 2.517 VAL 263.A N GLN 114.A O VAL 263.A H 2.816 1.991 MET 264.A N.A LEU 81.A O MET 264.A H.A 2.856 2.030 MET 264.A N.B LEU 81.A O MET 264.A H.B 2.872 2.053 HIS 265.A N SER 111.A O HIS 265.A H.A 2.957 2.138 ARG 266.A N LEU 79.A O ARG 266.A H 2.847 2.053 ARG 266.A NH1 ASP 97.A OD2 ARG 266.A HH12 2.888 2.036 ARG 266.A NH2 THR 268.A OG1 ARG 266.A HH21 2.822 2.033 ALA 267.A N VAL 109.A O ALA 267.A H 2.877 2.046 ILE 269.A N GLY 107.A O ILE 269.A H 2.936 2.080 LEU 270.A N ASP 62.A O LEU 270.A H 2.806 1.958