Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3se8_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 2.A NE1 GLU 48.A OE2 TRP 2.A HE1 2.784 2.029 LYS 3.A N GLN 342.A O LYS 3.A H 3.061 2.337 LYS 3.A NZ GLN 342.A OE1 LYS 3.A HZ1 2.894 2.336 ALA 5.A N VAL 340.A O ALA 5.A H 3.338 2.504 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 2.912 2.053 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 3.039 2.237 CYS 11.A SG ALA 30.A O no hydrogen 3.473 N/A ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.897 2.110 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 2.967 2.216 ALA 15.A N SER 13.A OG ALA 15.A H 3.144 2.295 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 2.792 1.960 LYS 16.A NZ ASP 14.A O LYS 16.A HZ2 2.791 1.953 GLU 19.A N LYS 16.A O GLU 19.A H 3.152 2.300 GLU 21.A N GLU 19.A OE1 GLU 21.A H 3.028 2.207 VAL 22.A N SER 93.A O VAL 22.A H 2.987 2.154 HIS 23.A N GLU 21.A OE2 HIS 23.A H 2.943 2.086 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE2 HIS 23.A HD1 2.819 1.983 ASN 24.A N GLU 21.A OE1 ASN 24.A H 2.933 2.135 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE1 ASN 24.A HD22 2.820 2.001 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 3.092 2.300 TRP 26.A N VAL 22.A O TRP 26.A H 3.062 2.222 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.990 2.137 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 2.921 2.130 HIS 29.A N VAL 25.A O HIS 29.A H 3.253 2.498 HIS 29.A N TRP 26.A O HIS 29.A H 3.023 2.401 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.800 2.166 ALA 30.A N ALA 27.A O ALA 30.A H 3.261 2.609 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 2.704 1.908 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 2.876 2.068 ASN 37.A N ASP 35.A OD1 ASN 37.A H 2.970 2.170 ILE 41.A N SER 128.A O ILE 41.A H 2.941 2.121 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 2.803 1.944 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 2.909 2.110 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 2.871 2.056 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 2.800 1.961 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 3.121 2.328 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 2.947 2.109 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.229 2.413 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 2.847 2.029 GLN 60.A N ASN 56.A O no hydrogen 3.272 N/A GLN 60.A NE2 THR 7.A O GLN 60.A HE21 2.729 1.966 GLN 60.A NE2 ASN 56.A OD1 GLN 60.A HE22 2.993 2.171 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 3.069 2.236 GLN 62.A N VAL 58.A O GLN 62.A H 2.956 2.118 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 3.074 2.255 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.110 2.275 VAL 65.A N MET 61.A O VAL 65.A H 2.926 2.111 ILE 66.A N GLN 62.A O ILE 66.A H 2.973 2.122 SER 67.A N GLU 63.A O SER 67.A H 2.875 2.046 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.868 2.068 TRP 69.A N VAL 65.A O TRP 69.A H 2.939 2.096 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.913 2.125 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 3.024 2.210 SER 72.A N LEU 68.A O SER 72.A H 2.959 2.353 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.869 2.033 CYS 76.A N MET 286.A O CYS 76.A H 2.661 2.046 VAL 77.A N MET 286.A O VAL 77.A H 3.264 2.480 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 2.837 2.078 LYS 78.A NZ GLN 74.A OE1 LYS 78.A HZ1 2.912 2.160 LEU 79.A N GLN 284.A O LEU 79.A H 2.841 1.984 THR 80.A N SER 83.A O THR 80.A H 3.243 2.480 SER 83.A N THR 80.A O SER 83.A H 2.779 1.941 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H 3.025 2.393 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 3.125 2.325 GLN 87.A NE2 GLN 74.A OE1 GLN 87.A HE21 3.351 2.784 LYS 91.A NZ GLU 241.A OE1 LYS 91.A HZ2 3.451 2.850 LYS 91.A NZ GLU 241.A OE2 LYS 91.A HZ2 2.740 1.856 LYS 91.A NZ ALA 288.A O LYS 91.A HZ1 2.994 2.299 LYS 91.A NZ PRO 289.A O LYS 91.A HZ1 2.763 2.102 ASP 95.A N GLU 21.A OE2 ASP 95.A H 2.864 2.063 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H 2.856 2.034 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.877 2.032 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 2.896 2.068 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H 2.894 2.128 THR 103.A N GLN 130.A O THR 103.A H 3.020 2.245 THR 103.A OG1 GLN 130.A O THR 103.A HG1 3.490 2.780 TYR 107.A N PRO 104.A O TYR 107.A H 3.214 2.436 VAL 108.A N VAL 341.A O VAL 108.A H 2.980 2.171 ILE 109.A N VAL 129.A O ILE 109.A H 3.007 2.195 LEU 110.A N LYS 339.A O LEU 110.A H 2.725 1.912 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.797 1.966 CYS 112.A N LYS 337.A O CYS 112.A H 2.739 1.931 ASN 113.A N ASN 125.A O ASN 113.A H 2.735 1.899 ASN 113.A ND2 ASN 125.A O ASN 113.A HD21 3.484 2.966 ASN 113.A ND2 SER 127.A OG ASN 113.A HD22 3.127 2.271 ASN 116.A ND2 GLU 152.A OE1 ASN 116.A HD21 3.239 2.520 PHE 117.A N ASP 114.A O PHE 117.A H 3.226 2.396 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 3.027 2.190 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 2.994 2.356 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.587 1.794 CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.618 N/A LYS 124.A N ASP 114.A OD2 LYS 124.A H 2.983 2.133 ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 2.672 1.872 ASN 125.A ND2 ASN 113.A O ASN 125.A HD21 3.291 2.730 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 2.970 2.152 SER 127.A OG GLU 40.A OE2 SER 127.A HG 2.635 1.825 SER 128.A N ILE 41.A O SER 128.A H 2.683 1.885 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 2.905 2.066 THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.724 1.917 HIS 133.A N TYR 338.A OH HIS 133.A H 3.102 2.251 HIS 133.A ND1 TYR 338.A OH HIS 133.A HD1 2.636 1.808 HIS 133.A NE2 GLU 334.A OE1 HIS 133.A HE2 2.997 2.155 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 2.963 2.120 LYS 136.A NZ ASN 146.A O LYS 136.A HZ1 2.711 1.993 VAL 138.A N LYS 136.A O VAL 138.A H 2.789 2.109 THR 141.A N HIS 235.A O THR 141.A H 2.967 2.226 GLN 142.A NE2 ILE 231.A O GLN 142.A HE22 3.019 2.166 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.806 2.064 LEU 144.A N GLY 303.A O LEU 144.A H 2.868 2.034 ASN 146.A N ASN 300.A O ASN 146.A H 2.712 1.880 GLY 147.A N THR 302.A OG1 GLY 147.A H 3.142 2.402 SER 148.A N GLU 334.A OE2 SER 148.A H 2.734 1.910 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.782 2.002 GLU 153.A N ASN 116.A OD1 GLU 153.A H 3.310 2.488 ILE 155.A N HIS 171.A O ILE 155.A H 3.028 2.196 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.792 1.983 ARG 157.A NE HIS 171.A ND1 ARG 157.A HE 3.578 2.870 ARG 157.A NH1 PHE 117.A O ARG 157.A HH12 3.548 2.955 ARG 157.A NH1 HIS 171.A ND1 ARG 157.A HH11 3.027 2.177 ARG 157.A NH2 PHE 117.A O ARG 157.A HH22 2.817 2.021 ASN 160.A N SER 158.A OG ASN 160.A H 3.217 2.421 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 2.780 1.961 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 2.863 2.058 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 3.006 2.149 ILE 168.A N LEU 306.A O ILE 168.A H 2.841 1.983 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.701 1.870 VAL 170.A N ILE 304.A O VAL 170.A H 2.878 2.038 HIS 171.A N ILE 155.A O HIS 171.A H 2.819 1.961 HIS 171.A NE2 SER 148.A O HIS 171.A HE2 2.670 1.833 LEU 172.A N THR 302.A O LEU 172.A H 3.162 2.360 ASN 173.A ND2 GLU 152.A O ASN 173.A HD21 2.672 2.168 VAL 176.A N ILE 301.A O VAL 176.A H 3.299 2.519 ILE 178.A N SER 299.A O ILE 178.A H 2.747 1.942 ASN 179.A N GLU 193.A O ASN 179.A H 2.926 2.128 CYS 180.A N CYS 297.A O CYS 180.A H 3.230 2.377 THR 181.A N TYR 191.A O THR 181.A H 2.847 2.023 ARG 182.A N ILE 295.A O ARG 182.A H 2.739 1.906 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 2.594 1.865 ARG 182.A NH1 ILE 187.A O ARG 182.A HH11 2.833 1.998 ARG 182.A NH2 ILE 291.A O ARG 182.A HH22 2.898 2.099 ARG 182.A NH2 GLY 293.A O ARG 182.A HH21 2.552 1.696 ARG 188.A N ASP 186.A OD1 ARG 188.A H 3.009 2.173 LYS 189.A N ASP 186.A O LYS 189.A H 3.364 2.553 ALA 190.A N CYS 270.A O ALA 190.A H 2.896 2.062 TYR 191.A N THR 181.A O TYR 191.A H 3.092 2.321 CYS 192.A N LEU 268.A O CYS 192.A H 2.981 2.194 GLU 193.A N ASN 179.A O GLU 193.A H 2.739 1.922 ILE 194.A N ILE 266.A O ILE 194.A H 2.897 2.083 GLY 196.A N GLY 264.A O GLY 196.A H 2.606 1.864 LYS 198.A N ASN 195.A OD1 LYS 198.A H 2.849 2.023 TRP 199.A N ASN 195.A O TRP 199.A H 2.854 2.043 TRP 199.A NE1 LEU 250.A O TRP 199.A HE1 2.580 1.764 ASN 200.A N GLY 196.A O ASN 200.A H 2.740 1.884 ASN 200.A ND2 CYS 262.A O ASN 200.A HD22 2.879 2.406 LYS 201.A N THR 197.A O LYS 201.A H 3.394 2.619 VAL 202.A N LYS 198.A O VAL 202.A H 3.287 2.445 LEU 203.A N TRP 199.A O LEU 203.A H 2.771 1.936 LYS 204.A N ASN 200.A O LYS 204.A H 3.001 2.206 LYS 204.A NZ GLU 208.A OE1 LYS 204.A HZ2 3.295 2.690 LYS 204.A NZ ILE 256.A O LYS 204.A HZ3 3.548 2.839 GLN 205.A N LYS 201.A O GLN 205.A H 3.061 2.225 VAL 206.A N VAL 202.A O VAL 206.A H 2.891 2.127 THR 207.A N LEU 203.A O THR 207.A H 2.939 2.118 THR 207.A OG1 LYS 204.A O THR 207.A HG1 2.651 1.923 GLU 208.A N LYS 204.A O GLU 208.A H 2.999 2.222 LYS 209.A N GLN 205.A O LYS 209.A H 2.991 2.191 LYS 209.A NZ GLU 153.A OE2 LYS 209.A HZ1 2.902 2.137 LYS 209.A NZ GLU 212.A OE1 LYS 209.A HZ3 2.955 2.103 LEU 210.A N VAL 206.A O LEU 210.A H 2.938 2.119 LYS 211.A N THR 207.A O LYS 211.A H 3.004 2.231 GLU 212.A N GLU 208.A O no hydrogen 3.428 N/A HIS 213.A N LEU 210.A O HIS 213.A H 3.054 2.397 HIS 213.A ND1 LYS 209.A O HIS 213.A HD1 3.076 2.279 PHE 214.A N LEU 210.A O PHE 214.A H 2.844 2.213 PHE 214.A N LYS 211.A O PHE 214.A H 3.019 2.348 ASN 216.A N LYS 211.A O ASN 216.A H 2.970 2.126 LYS 217.A N PHE 214.A O LYS 217.A H 2.806 1.948 THR 218.A N SER 316.A O THR 218.A H 3.066 2.267 ILE 220.A N GLU 318.A O no hydrogen 2.882 N/A PHE 221.A N ASN 253.A OD1 PHE 221.A H 2.889 2.036 GLN 222.A N PHE 320.A O GLN 222.A H 2.829 2.010 GLU 230.A N GLU 230.A OE1 GLU 230.A H 2.700 1.925 ILE 231.A N ASP 228.A O ILE 231.A H 3.016 2.188 THR 232.A N ASP 228.A O THR 232.A H 3.063 2.260 THR 232.A OG1 ASP 228.A O THR 232.A HG1 3.464 2.711 MET 233.A N LEU 229.A O MET 233.A H 2.996 2.226 HIS 234.A N CYS 245.A O HIS 234.A H 2.806 2.031 HIS 234.A ND1 THR 141.A O HIS 234.A HD1 2.906 2.056 HIS 235.A N THR 141.A OG1 HIS 235.A H 3.010 2.251 HIS 235.A ND1 PHE 243.A O HIS 235.A HD1 2.956 2.186 PHE 236.A N PHE 243.A O PHE 236.A H 3.297 2.501 CYS 238.A N GLU 241.A O CYS 238.A H 2.904 2.125 ARG 239.A NE ASN 296.A O ARG 239.A HE 3.408 2.619 ARG 239.A NH1 ASN 296.A O ARG 239.A HH11 3.410 2.635 GLY 240.A N ASN 237.A OD1 GLY 240.A H 2.855 2.224 GLU 241.A N CYS 238.A O GLU 241.A H 2.877 2.027 PHE 243.A N PHE 236.A O PHE 243.A H 2.772 1.945 TYR 244.A N LYS 271.A O TYR 244.A H 2.944 2.264 CYS 245.A N HIS 234.A O CYS 245.A H 2.803 1.979 ASN 246.A N PRO 269.A O ASN 246.A H 3.001 2.152 THR 248.A N ASN 246.A OD1 THR 248.A H 2.936 2.094 THR 248.A OG1 ASN 246.A OD1 THR 248.A HG1 2.930 2.352 LEU 250.A N THR 247.A O LEU 250.A H 2.825 2.032 PHE 251.A N THR 248.A O PHE 251.A H 3.422 2.594 ASN 253.A ND2 PHE 221.A O ASN 253.A HD22 2.818 1.986 THR 254.A N ASN 252.A OD1 THR 254.A H 2.973 2.238 CYS 255.A N ASN 252.A O CYS 255.A H 3.060 2.294 GLY 257.A N ASN 253.A O GLY 257.A H 3.153 2.307 MET 259.A N THR 254.A O no hydrogen 3.169 N/A ILE 266.A N ILE 194.A O ILE 266.A H 2.790 1.996 LEU 268.A N CYS 192.A O LEU 268.A H 2.803 2.052 CYS 270.A N ALA 190.A O CYS 270.A H 2.886 2.041 CYS 270.A SG LEU 268.A O no hydrogen 3.735 N/A LYS 271.A N TYR 244.A O LYS 271.A H 2.918 2.145 ILE 272.A N ARG 188.A O ILE 272.A H 2.818 1.996 LYS 273.A N PHE 242.A O LYS 273.A H 3.134 2.356 ILE 276.A N ALA 285.A O ILE 276.A H 2.878 2.056 ASN 277.A N GLU 230.A OE2 ASN 277.A H 2.738 1.885 ASN 277.A ND2 GLU 230.A OE1 ASN 277.A HD21 3.149 2.302 ASN 277.A ND2 GLU 230.A OE2 ASN 277.A HD21 3.556 2.985 MET 278.A N GLY 283.A O MET 278.A H 2.757 1.898 GLN 280.A N GLN 280.A OE1 GLN 280.A H 2.660 1.837 GLN 280.A NE2 ASP 70.A OD1 GLN 280.A HE22 3.426 2.685 GLY 281.A N MET 278.A O GLY 281.A H 2.904 2.072 GLN 284.A N LEU 79.A O GLN 284.A H 3.022 2.222 GLN 284.A NE2 ASN 277.A OD1 GLN 284.A HE22 3.134 2.365 ALA 285.A N ILE 276.A O ALA 285.A H 2.837 2.014 MET 286.A N VAL 77.A O MET 286.A H 2.890 2.080 TYR 287.A N GLN 274.A O TYR 287.A H 2.704 1.892 TYR 287.A OH LEU 73.A O TYR 287.A HH 2.773 2.193 ILE 291.A N GLU 241.A OE2 ILE 291.A H 3.316 2.536 ILE 295.A N ARG 182.A O ILE 295.A H 3.070 2.297 ASN 296.A ND2 ASN 179.A OD1 ASN 296.A HD21 2.871 2.124 ASN 296.A ND2 THR 181.A OG1 ASN 296.A HD22 2.774 1.993 CYS 297.A N CYS 180.A O CYS 297.A H 3.166 2.428 SER 299.A N ILE 178.A O SER 299.A H 2.934 2.099 ASN 300.A N ASN 146.A OD1 ASN 300.A H 3.119 2.326 ILE 301.A N VAL 176.A O ILE 301.A H 3.035 2.179 THR 302.A N LEU 144.A O THR 302.A H 2.910 2.082 ILE 304.A N VAL 170.A O ILE 304.A H 2.996 2.205 LEU 305.A N GLN 142.A O LEU 305.A H 2.854 2.001 LEU 306.A N ILE 168.A O LEU 306.A H 2.985 2.159 THR 307.A N ARG 321.A O THR 307.A H 2.902 2.067 ARG 308.A NH2 LEU 161.A O ARG 308.A HH21 3.105 2.439 ASP 309.A N THR 319.A O ASP 309.A H 2.942 2.112 ASN 313.A N GLY 311.A O ASN 313.A H 2.656 1.918 GLU 318.A N THR 218.A O GLU 318.A H 2.852 2.087 PHE 320.A N ILE 220.A O PHE 320.A H 2.809 2.005 ARG 321.A N THR 307.A O ARG 321.A H 2.908 2.114 ARG 321.A NE ASP 309.A OD1 ARG 321.A HE 3.364 2.667 ARG 321.A NE ASP 309.A OD2 ARG 321.A HE 2.904 2.059 ARG 321.A NH1 PRO 223.A O ARG 321.A HH11 2.848 2.034 ARG 321.A NH2 ASP 309.A OD1 ARG 321.A HH21 2.926 2.114 GLY 323.A N LEU 305.A O GLY 323.A H 3.010 2.248 LYS 328.A N ASN 326.A OD1 LYS 328.A H 3.039 2.266 LYS 328.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 328.A HZ3 2.540 1.830 ASP 329.A N ASN 326.A O ASP 329.A H 2.860 2.032 ASN 330.A N ILE 327.A O ASN 330.A H 2.832 2.169 ASN 330.A ND2 VAL 138.A O ASN 330.A HD22 3.285 2.487 ASN 330.A ND2 SER 140.A O ASN 330.A HD21 3.257 2.435 TRP 331.A NE1 GLN 62.A OE1 TRP 331.A HE1 2.682 1.918 ARG 332.A N LYS 328.A O ARG 332.A H 2.902 2.071 ARG 332.A NH1 ASP 329.A OD1 ARG 332.A HH11 2.656 2.014 SER 333.A N ASP 329.A O SER 333.A H 2.985 2.244 SER 333.A OG ASN 330.A O SER 333.A HG 2.705 2.273 GLU 334.A N TRP 331.A O GLU 334.A H 3.005 2.232 LEU 335.A N TRP 331.A O LEU 335.A H 2.884 2.120 TYR 338.A N LEU 335.A O TYR 338.A H 3.106 2.256 LYS 339.A N LEU 110.A O LYS 339.A H 2.937 2.146 LYS 339.A NZ ASP 4.A OD1 LYS 339.A HZ2 2.902 2.081 LYS 339.A NZ GLU 48.A OE1 LYS 339.A HZ1 2.578 1.772 LYS 339.A NZ ASN 49.A O LYS 339.A HZ3 2.947 2.079 VAL 341.A N VAL 108.A O VAL 341.A H 2.907 2.059 GLN 342.A N LYS 3.A O GLN 342.A H 2.883 2.053 ILE 343.A N GLY 106.A O ILE 343.A H 3.019 2.213