Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3se9_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A N GLN 342.A O LYS 3.A H 3.098 2.395 ALA 5.A N VAL 340.A O ALA 5.A H 3.372 2.522 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 2.892 2.032 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 2.973 2.172 ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.871 2.111 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 2.928 2.152 ALA 15.A N SER 13.A OG ALA 15.A H 2.983 2.142 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 2.904 2.074 GLU 19.A N LYS 16.A O GLU 19.A H 3.144 2.329 THR 20.A N GLU 19.A OE2 THR 20.A H 2.721 2.046 GLU 21.A N GLU 19.A OE2 GLU 21.A H 2.882 2.045 VAL 22.A N SER 93.A O VAL 22.A H 2.971 2.179 HIS 23.A N GLU 21.A OE2 HIS 23.A H 3.096 2.238 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE2 HIS 23.A HD1 2.728 1.881 ASN 24.A N GLU 21.A OE1 ASN 24.A H 2.809 1.987 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE1 ASN 24.A HD21 2.832 2.009 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 3.088 2.333 TRP 26.A N VAL 22.A O TRP 26.A H 2.975 2.133 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.896 2.077 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 2.958 2.217 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.870 2.025 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 2.893 2.105 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 2.973 2.151 THR 34.A N SER 13.A O THR 34.A H 3.181 2.588 ASN 37.A N ASP 35.A OD2 ASN 37.A H 2.885 2.120 ILE 41.A N SER 128.A O ILE 41.A H 2.904 2.118 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 2.837 1.981 VAL 46.A N LEU 43.A O VAL 46.A H 3.276 2.556 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 3.158 2.348 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 2.803 1.979 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 2.838 2.067 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 3.131 2.325 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.040 2.233 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.121 2.301 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 2.891 2.093 GLN 60.A N ASN 56.A O GLN 60.A H 3.290 2.546 GLN 60.A N MET 57.A O GLN 60.A H 3.152 2.553 GLN 60.A NE2 THR 7.A O GLN 60.A HE22 2.725 1.936 GLN 60.A NE2 ASN 56.A OD1 GLN 60.A HE21 2.753 1.963 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 3.029 2.198 GLN 62.A N VAL 58.A O GLN 62.A H 2.945 2.118 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 3.058 2.246 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.061 2.255 VAL 65.A N MET 61.A O VAL 65.A H 2.987 2.153 ILE 66.A N GLN 62.A O ILE 66.A H 2.943 2.092 SER 67.A N GLU 63.A O SER 67.A H 2.940 2.136 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.780 1.942 TRP 69.A N VAL 65.A O TRP 69.A H 2.984 2.142 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.937 2.196 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 3.215 2.537 GLN 71.A NE2 SER 67.A O GLN 71.A HE22 3.294 2.569 SER 72.A N LEU 68.A O SER 72.A H 3.117 2.532 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.844 2.029 CYS 76.A SG MET 286.A O no hydrogen 3.479 N/A VAL 77.A N MET 286.A O VAL 77.A H 3.233 2.434 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 2.898 2.065 LYS 78.A NZ GLN 74.A OE1 LYS 78.A HZ3 2.577 1.833 LEU 79.A N GLN 284.A O LEU 79.A H 2.882 2.030 THR 80.A N SER 83.A O THR 80.A H 3.318 2.480 SER 83.A N THR 80.A O SER 83.A H 3.151 2.409 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H 2.948 2.109 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 3.023 2.198 GLN 87.A NE2 PRO 75.A O GLN 87.A HE22 3.504 2.848 LYS 91.A NZ GLU 242.A OE1 LYS 91.A HZ3 3.396 2.719 LYS 91.A NZ GLU 242.A OE2 LYS 91.A HZ3 3.043 2.189 LYS 91.A NZ ALA 288.A O LYS 91.A HZ2 3.010 2.346 LYS 91.A NZ PRO 289.A O LYS 91.A HZ2 2.835 2.089 ASP 95.A N GLU 21.A OE2 ASP 95.A H 2.746 1.901 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H 2.817 1.984 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.773 1.915 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 3.016 2.213 TYR 101.A N THR 132.A OG1 TYR 101.A H 2.951 2.092 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H 2.851 2.069 THR 103.A N GLN 130.A O THR 103.A H 3.229 2.459 THR 103.A OG1 TYR 107.A O THR 103.A HG1 3.550 3.122 TYR 107.A N PRO 104.A O TYR 107.A H 3.269 2.502 VAL 108.A N VAL 341.A O VAL 108.A H 2.975 2.157 ILE 109.A N VAL 129.A O ILE 109.A H 3.141 2.318 LEU 110.A N LYS 339.A O LEU 110.A H 2.878 2.077 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.603 1.795 CYS 112.A N LYS 337.A O CYS 112.A H 2.851 2.032 ASN 113.A N ASN 125.A O ASN 113.A H 2.783 1.960 ASN 113.A ND2 ASN 125.A O ASN 113.A HD21 3.276 2.650 ASN 113.A ND2 SER 127.A OG ASN 113.A HD22 3.125 2.276 PHE 117.A N ASP 114.A O PHE 117.A H 3.333 2.487 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 3.081 2.231 THR 120.A OG1 ASN 118.A OD1 THR 120.A HG1 3.516 2.739 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 2.957 2.248 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.737 2.000 CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.829 N/A LYS 124.A N ASP 114.A OD2 LYS 124.A H 2.840 2.004 ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 2.751 2.009 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 2.981 2.154 SER 127.A OG GLU 40.A OE2 SER 127.A HG 2.654 1.888 SER 128.A N ILE 41.A O SER 128.A H 2.815 2.023 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 2.833 2.006 THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.729 1.920 HIS 133.A NE2 GLU 334.A OE1 HIS 133.A HE2 3.086 2.273 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 2.799 1.940 VAL 138.A N LYS 136.A O VAL 138.A H 2.909 2.204 SER 140.A OG LEU 143.A O SER 140.A HG 2.641 2.127 THR 141.A N HIS 236.A O THR 141.A H 2.996 2.263 THR 141.A OG1 GLU 231.A O THR 141.A HG1 2.658 1.880 GLN 142.A N GLY 323.A O GLN 142.A H 2.754 2.057 GLN 142.A NE2 ILE 232.A O GLN 142.A HE22 2.856 2.009 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.602 1.868 LEU 144.A N GLY 303.A O LEU 144.A H 2.949 2.149 ASN 146.A N ASN 300.A O ASN 146.A H 2.687 1.861 GLY 147.A N THR 302.A OG1 GLY 147.A H 3.170 2.443 SER 148.A N GLU 334.A OE2 SER 148.A H 2.653 1.816 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.854 2.117 ILE 155.A N HIS 171.A O ILE 155.A H 3.040 2.223 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.811 2.033 ASN 160.A N SER 158.A OG ASN 160.A H 3.089 2.356 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 2.756 1.961 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 2.986 2.188 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 2.893 2.045 LYS 166.A NZ GLU 159.A OE1 LYS 166.A HZ3 3.135 2.490 ILE 168.A N LEU 306.A O ILE 168.A H 2.900 2.041 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.827 1.994 VAL 170.A N ILE 304.A O VAL 170.A H 2.828 1.975 HIS 171.A N ILE 155.A O HIS 171.A H 2.813 1.961 HIS 171.A NE2 SER 148.A O HIS 171.A HE2 2.735 1.916 LEU 172.A N THR 302.A O LEU 172.A H 2.997 2.189 VAL 176.A N ILE 301.A O VAL 176.A H 3.165 2.394 ILE 178.A N SER 299.A O ILE 178.A H 2.942 2.125 ASN 179.A N GLU 194.A O ASN 179.A H 2.880 2.074 CYS 180.A N CYS 297.A O CYS 180.A H 3.075 2.217 THR 181.A N TYR 192.A O THR 181.A H 2.760 1.945 ARG 182.A N ILE 295.A O ARG 182.A H 2.806 1.994 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 2.923 2.230 ARG 182.A NH1 ILE 188.A O ARG 182.A HH11 2.727 1.907 ARG 182.A NH1 ILE 291.A O ARG 182.A HH12 3.554 2.989 ARG 182.A NH2 ILE 291.A O ARG 182.A HH22 2.736 1.951 ARG 182.A NH2 GLY 293.A O ARG 182.A HH21 2.636 1.775 ARG 189.A N ASP 187.A OD1 ARG 189.A H 2.967 2.134 ARG 189.A NE GLN 274.A OE1 ARG 189.A HE 2.857 2.161 ARG 189.A NH1 GLN 274.A OE1 ARG 189.A HH11 2.620 1.835 LYS 190.A N ASP 187.A O LYS 190.A H 3.258 2.417 ALA 191.A N CYS 270.A O ALA 191.A H 3.060 2.206 TYR 192.A N THR 181.A O TYR 192.A H 2.969 2.183 CYS 193.A N LEU 268.A O CYS 193.A H 2.978 2.196 GLU 194.A N ASN 179.A O GLU 194.A H 2.814 1.986 ILE 195.A N ILE 266.A O ILE 195.A H 2.978 2.186 GLY 197.A N GLY 264.A O GLY 197.A H 2.596 1.908 LYS 199.A N ASN 196.A OD1 LYS 199.A H 3.076 2.249 TRP 200.A N ASN 196.A O TRP 200.A H 2.982 2.125 TRP 200.A NE1 LEU 251.A O TRP 200.A HE1 2.401 1.589 ASN 201.A N GLY 197.A O ASN 201.A H 2.966 2.129 LYS 202.A N THR 198.A O LYS 202.A H 3.113 2.290 VAL 203.A N LYS 199.A O VAL 203.A H 3.143 2.288 LEU 204.A N TRP 200.A O LEU 204.A H 2.948 2.126 LYS 205.A N ASN 201.A O LYS 205.A H 2.898 2.155 GLN 206.A N LYS 202.A O GLN 206.A H 3.123 2.300 VAL 207.A N VAL 203.A O VAL 207.A H 2.844 2.073 THR 208.A N LEU 204.A O THR 208.A H 3.129 2.338 GLU 209.A N LYS 205.A O GLU 209.A H 3.008 2.194 LYS 210.A N GLN 206.A O LYS 210.A H 2.931 2.171 LEU 211.A N VAL 207.A O LEU 211.A H 2.904 2.077 LYS 212.A N THR 208.A O LYS 212.A H 2.835 2.025 GLU 213.A N LYS 210.A O GLU 213.A H 2.998 2.321 HIS 214.A N LEU 211.A O HIS 214.A H 2.888 2.183 PHE 215.A N LEU 211.A O PHE 215.A H 3.039 2.366 ASN 217.A N LYS 212.A O ASN 217.A H 2.781 1.985 LYS 218.A N PHE 215.A O LYS 218.A H 2.824 1.980 LYS 218.A NZ ALA 312.A O LYS 218.A HZ3 3.213 2.628 LYS 218.A NZ GLU 318.A OE1 LYS 218.A HZ2 3.212 2.395 THR 219.A N SER 316.A O THR 219.A H 3.111 2.271 ILE 221.A N GLU 318.A O ILE 221.A H 2.859 2.072 PHE 222.A N ASN 254.A OD1 PHE 222.A H 2.867 2.016 GLN 223.A N PHE 320.A O GLN 223.A H 2.861 2.062 GLN 223.A NE2 PHE 222.A O GLN 223.A HE22 2.610 1.799 ILE 232.A N ASP 229.A O ILE 232.A H 2.957 2.140 THR 233.A N ASP 229.A O THR 233.A H 2.958 2.150 MET 234.A N LEU 230.A O MET 234.A H 3.017 2.289 HIS 235.A N CYS 246.A O HIS 235.A H 2.805 2.041 HIS 235.A ND1 THR 141.A O HIS 235.A HD1 2.940 2.142 HIS 236.A N THR 141.A OG1 HIS 236.A H 3.054 2.239 PHE 237.A N PHE 244.A O PHE 237.A H 3.199 2.410 CYS 239.A N GLU 242.A O CYS 239.A H 2.810 2.033 ARG 240.A NE ASN 296.A O ARG 240.A HE 3.353 2.570 ARG 240.A NH2 ASN 296.A O ARG 240.A HH21 3.312 2.535 GLY 241.A N ASN 238.A OD1 GLY 241.A H 2.815 2.150 GLU 242.A N CYS 239.A O GLU 242.A H 2.905 2.070 PHE 244.A N PHE 237.A O PHE 244.A H 2.773 1.930 TYR 245.A N LYS 271.A O TYR 245.A H 2.877 2.116 CYS 246.A N HIS 235.A O CYS 246.A H 2.821 2.010 ASN 247.A N PRO 269.A O ASN 247.A H 3.009 2.164 THR 248.A OG1 GLN 142.A OE1 THR 248.A HG1 2.679 2.028 THR 249.A N ASN 247.A OD1 THR 249.A H 2.982 2.130 GLN 250.A NE2 THR 267.A O GLN 250.A HE21 2.666 1.887 LEU 251.A N THR 248.A O LEU 251.A H 2.794 2.003 ASN 254.A ND2 PHE 222.A O ASN 254.A HD21 2.736 1.879 THR 255.A N ASN 253.A OD1 THR 255.A H 2.890 2.294 CYS 256.A N ASN 253.A O CYS 256.A H 3.314 2.524 ILE 266.A N ILE 195.A O ILE 266.A H 2.788 1.934 LEU 268.A N CYS 193.A O LEU 268.A H 2.865 2.029 CYS 270.A N ALA 191.A O CYS 270.A H 2.843 2.001 CYS 270.A SG LEU 268.A O no hydrogen 3.749 N/A LYS 271.A N TYR 245.A O LYS 271.A H 2.877 2.103 ILE 272.A N ARG 189.A O ILE 272.A H 2.870 2.063 LYS 273.A N PHE 243.A O LYS 273.A H 3.057 2.283 GLN 274.A NE2 TYR 287.A O GLN 274.A HE22 3.065 2.261 ILE 276.A N ALA 285.A O ILE 276.A H 2.959 2.142 ASN 277.A N GLU 231.A OE2 ASN 277.A H 2.817 1.966 ASN 277.A ND2 GLU 231.A OE1 ASN 277.A HD21 2.864 2.023 MET 278.A N GLY 283.A O MET 278.A H 2.790 1.932 GLN 280.A N GLN 280.A OE1 GLN 280.A H 2.723 1.913 GLY 281.A N MET 278.A O GLY 281.A H 2.722 1.876 GLN 284.A N LEU 79.A O GLN 284.A H 3.143 2.333 ALA 285.A N ILE 276.A O ALA 285.A H 2.933 2.099 MET 286.A N VAL 77.A O MET 286.A H 2.932 2.192 TYR 287.A N GLN 274.A O TYR 287.A H 2.667 1.856 ILE 291.A N GLU 242.A OE2 ILE 291.A H 3.136 2.321 ILE 295.A N ARG 182.A O ILE 295.A H 2.970 2.130 ASN 296.A ND2 ASN 179.A OD1 ASN 296.A HD21 2.930 2.174 ASN 296.A ND2 CYS 180.A O ASN 296.A HD22 3.203 2.701 ASN 296.A ND2 THR 181.A OG1 ASN 296.A HD22 2.970 2.233 CYS 297.A N CYS 180.A O CYS 297.A H 3.021 2.226 SER 299.A N ILE 178.A O SER 299.A H 2.992 2.158 ASN 300.A N ASN 146.A OD1 ASN 300.A H 3.104 2.285 ILE 301.A N VAL 176.A O ILE 301.A H 2.898 2.050 THR 302.A N LEU 144.A O THR 302.A H 3.023 2.193 ILE 304.A N VAL 170.A O ILE 304.A H 2.964 2.195 LEU 305.A N GLN 142.A O LEU 305.A H 2.914 2.057 LEU 306.A N ILE 168.A O LEU 306.A H 2.876 2.076 THR 307.A N ARG 321.A O THR 307.A H 2.881 2.053 ARG 308.A NH1 GLU 318.A OE2 ARG 308.A HH11 2.713 1.884 ARG 308.A NH2 LEU 161.A O ARG 308.A HH21 3.021 2.268 ASP 309.A N THR 319.A O ASP 309.A H 2.808 1.962 THR 315.A N ALA 312.A O THR 315.A H 3.039 2.205 GLU 318.A N THR 219.A O GLU 318.A H 2.628 1.825 PHE 320.A N ILE 221.A O PHE 320.A H 2.757 1.937 ARG 321.A N THR 307.A O ARG 321.A H 2.949 2.147 ARG 321.A NE PRO 224.A O ARG 321.A HE 2.727 2.129 ARG 321.A NH1 ASP 309.A OD2 ARG 321.A HH11 3.436 2.623 ARG 321.A NH2 PRO 224.A O ARG 321.A HH21 3.082 2.560 GLY 323.A N LEU 305.A O GLY 323.A H 2.803 2.020 LYS 328.A N ASN 326.A OD1 LYS 328.A H 3.085 2.344 LYS 328.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 328.A HZ2 2.755 2.076 ASP 329.A N ASN 326.A O ASP 329.A H 3.011 2.201 ASN 330.A N ILE 327.A O ASN 330.A H 2.822 2.164 ASN 330.A ND2 VAL 138.A O ASN 330.A HD22 3.491 2.719 ASN 330.A ND2 SER 140.A O ASN 330.A HD21 3.191 2.386 TRP 331.A NE1 GLN 62.A OE1 TRP 331.A HE1 2.693 1.891 ARG 332.A N LYS 328.A O ARG 332.A H 2.938 2.141 ARG 332.A NH1 ASP 329.A OD1 ARG 332.A HH11 3.009 2.240 SER 333.A N ASP 329.A O SER 333.A H 2.988 2.250 SER 333.A N ASN 330.A O SER 333.A H 3.222 2.604 GLU 334.A N TRP 331.A O GLU 334.A H 3.080 2.276 LEU 335.A N TRP 331.A O LEU 335.A H 2.820 2.044 TYR 338.A N LEU 335.A O TYR 338.A H 2.938 2.110 LYS 339.A N LEU 110.A O LYS 339.A H 3.129 2.364 LYS 339.A NZ ASP 4.A OD1 LYS 339.A HZ1 2.626 1.919 LYS 339.A NZ GLU 48.A OE1 LYS 339.A HZ3 2.626 1.856 LYS 339.A NZ ASN 49.A O LYS 339.A HZ2 2.935 2.056 VAL 341.A N VAL 108.A O VAL 341.A H 2.956 2.099 GLN 342.A N LYS 3.A O GLN 342.A H 2.801 1.982 ILE 343.A N GLY 106.A O ILE 343.A H 2.985 2.204 GLU 344.A N VAL 1.A O GLU 344.A H 2.869 2.092