Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3skd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 4.A N SER 1.A OG ALA 4.A H 3.239 2.397 LEU 5.A N SER 1.A O LEU 5.A H 3.148 2.312 ALA 6.A N MET 2.A O ALA 6.A H 2.831 2.016 LEU 7.A N ALA 3.A O LEU 7.A H 3.043 2.217 TRP 8.A N ALA 4.A O TRP 8.A H 2.904 2.173 ALA 9.A N LEU 5.A O ALA 9.A H 3.217 2.529 LYS 10.A N GLN 76.A OE1 LYS 10.A H 2.775 1.918 LYS 10.A NZ TRP 8.A O LYS 10.A HZ2 2.748 1.856 SER 11.A N HIS 16.A O SER 11.A H 2.924 2.069 PHE 15.A N ASN 13.A OD1 PHE 15.A H 2.709 1.868 HIS 16.A N ASN 13.A O HIS 16.A H 2.953 2.135 LEU 18.A N ALA 9.A O LEU 18.A H 2.903 2.060 HIS 21.A N PRO 17.A O HIS 21.A H 3.127 2.320 MET 22.A N LEU 18.A O MET 22.A H 2.833 2.036 LEU 23.A N LEU 19.A O LEU 23.A H 2.931 2.118 ASP 24.A N ALA 20.A O ASP 24.A H 2.947 2.138 THR 25.A N HIS 21.A O THR 25.A H 2.956 2.121 THR 25.A OG1 HIS 21.A O THR 25.A HG1 2.902 2.180 ALA 26.A N MET 22.A O ALA 26.A H 3.009 2.169 ALA 27.A N LEU 23.A O ALA 27.A H 2.905 2.187 VAL 28.A N ASP 24.A O VAL 28.A H 2.897 2.063 ALA 29.A N THR 25.A O ALA 29.A H 2.903 2.071 LEU 30.A N ALA 26.A O LEU 30.A H 2.909 2.094 ALA 31.A N ALA 27.A O ALA 31.A H 2.928 2.091 VAL 32.A N VAL 28.A O VAL 32.A H 2.838 2.012 LEU 33.A N ALA 29.A O LEU 33.A H 2.903 2.064 ARG 34.A N LEU 30.A O ARG 34.A H 2.954 2.182 MET 35.A N VAL 32.A O MET 35.A H 2.984 2.318 GLU 36.A N LEU 33.A O GLU 36.A H 3.308 2.507 THR 40.A N PRO 37.A O THR 40.A H 2.849 2.241 THR 40.A OG1 GLY 224.A O THR 40.A HG1 2.850 2.067 ARG 41.A N PRO 37.A O ARG 41.A H 3.068 2.259 ARG 41.A NE GLU 36.A O ARG 41.A HE 3.061 2.260 ARG 41.A NH1 GLU 52.A OE2 ARG 41.A HH11 3.080 2.246 ARG 41.A NH2 GLU 36.A O ARG 41.A HH21 3.228 2.559 ALA 42.A N PRO 38.A O ALA 42.A H 2.944 2.122 LEU 43.A N ARG 39.A O LEU 43.A H 3.199 2.392 TYR 44.A N THR 40.A O TYR 44.A H 3.302 2.517 ALA 45.A N ARG 41.A O ALA 45.A H 3.121 2.332 GLU 46.A N ALA 42.A O GLU 46.A H 2.938 2.127 ASP 47.A N LEU 43.A O ASP 47.A H 2.673 1.912 TRP 48.A N TYR 44.A O TRP 48.A H 3.220 2.502 LEU 50.A N ALA 45.A O LEU 50.A H 3.277 2.510 ALA 55.A N PRO 51.A O ALA 55.A H 2.911 2.110 LEU 56.A N GLU 52.A O LEU 56.A H 3.017 2.219 ALA 57.A N GLU 53.A O ALA 57.A H 3.173 2.343 TRP 58.A N GLY 54.A O TRP 58.A H 2.981 2.143 ALA 59.A N ALA 55.A O ALA 59.A H 3.015 2.208 ALA 60.A N LEU 56.A O ALA 60.A H 2.951 2.113 ALA 61.A N ALA 57.A O ALA 61.A H 3.007 2.178 LEU 62.A N TRP 58.A O LEU 62.A H 3.067 2.247 VAL 63.A N ALA 59.A O VAL 63.A H 2.984 2.157 GLY 64.A N ALA 60.A O GLY 64.A H 2.930 2.137 LEU 65.A N ALA 61.A O LEU 65.A H 3.230 2.612 LEU 65.A N LEU 62.A O LEU 65.A H 2.956 2.215 HIS 66.A N VAL 63.A O HIS 66.A H 3.125 2.284 HIS 66.A ND1 VAL 63.A O HIS 66.A HD1 3.009 2.297 LEU 68.A N LEU 65.A O LEU 68.A H 3.043 2.191 GLY 69.A N THR 85.A OG1 GLY 69.A H 2.936 2.139 LYS 70.A N ASP 67.A O LYS 70.A H 2.983 2.152 LYS 70.A NZ ASP 67.A OD2 LYS 70.A HZ2 3.083 2.248 ALA 71.A N LEU 68.A O ALA 71.A H 2.927 2.074 PHE 75.A N SER 72.A O PHE 75.A H 2.972 2.155 GLN 76.A N PRO 73.A O GLN 76.A H 3.433 2.596 GLN 76.A NE2 LYS 10.A O GLN 76.A HE21 2.971 2.119 GLN 76.A NE2 LYS 70.A O GLN 76.A HE22 2.833 1.978 VAL 83.A N ALA 80.A O VAL 83.A H 3.041 2.267 THR 85.A N HIS 81.A O THR 85.A H 2.940 2.143 THR 85.A OG1 HIS 66.A O THR 85.A HG1 2.875 2.129 GLU 86.A N GLY 82.A O GLU 86.A H 2.906 2.090 LEU 87.A N VAL 83.A O LEU 87.A H 3.015 2.173 PHE 88.A N PHE 84.A O PHE 88.A H 2.825 1.995 LEU 89.A N THR 85.A O LEU 89.A H 2.843 2.006 ARG 90.A N GLU 86.A O ARG 90.A H 3.065 2.288 LEU 92.A N PHE 88.A O LEU 92.A H 2.947 2.092 LEU 93.A N LEU 89.A O LEU 93.A H 2.954 2.103 LYS 94.A NZ GLU 100.A OE1 LYS 94.A HZ3 3.464 2.653 LYS 94.A NZ ASN 104.A OD1 LYS 94.A HZ1 2.948 2.108 GLU 95.A N ARG 91.A O GLU 95.A H 3.021 2.217 LYS 96.A N LEU 92.A O LYS 96.A H 3.008 2.300 LYS 96.A NZ GLU 146.A OE1 LYS 96.A HZ3 3.045 2.207 LYS 96.A NZ GLU 146.A OE2 LYS 96.A HZ3 3.445 2.789 GLY 97.A N LYS 94.A O GLY 97.A H 2.942 2.142 LEU 98.A N LEU 93.A O LEU 98.A H 3.079 2.290 ALA 103.A N PRO 99.A O ALA 103.A H 3.042 2.205 ASN 104.A N GLU 100.A O ASN 104.A H 2.909 2.073 ASP 105.A N ARG 101.A O ASP 105.A H 3.017 2.178 LEU 106.A N ALA 102.A O LEU 106.A H 2.975 2.134 ALA 107.A N ALA 103.A O ALA 107.A H 2.997 2.193 ALA 108.A N ASN 104.A O ALA 108.A H 3.243 2.406 ALA 109.A N ASP 105.A O ALA 109.A H 3.037 2.240 LEU 110.A N LEU 106.A O LEU 110.A H 3.009 2.285 LEU 110.A N ALA 107.A O LEU 110.A H 3.235 2.570 GLY 111.A N ALA 108.A O GLY 111.A H 3.058 2.216 HIS 113.A NE2 GLU 122.A OE1 HIS 113.A HE2 2.877 2.108 HIS 113.A NE2 GLU 122.A OE2 HIS 113.A HE2 2.774 2.122 PHE 116.A N HIS 113.A O PHE 116.A H 2.843 1.984 ALA 118.A N GLU 86.A OE1 ALA 118.A H 2.896 2.040 ASN 119.A N GLU 122.A OE1 ASN 119.A H 3.140 2.373 GLU 122.A N ASN 119.A OD1 GLU 122.A H 2.883 2.041 LYS 123.A N ASN 119.A O LYS 123.A H 3.199 2.362 SER 124.A N ALA 120.A O SER 124.A H 2.924 2.073 ARG 125.A N GLU 121.A O ARG 125.A H 2.878 2.042 ARG 125.A NH1 TRP 78.A O ARG 125.A HH11 2.666 2.019 ALA 126.A N GLU 122.A O ALA 126.A H 2.987 2.132 ARG 127.A N LYS 123.A O ARG 127.A H 2.948 2.094 ARG 128.A N SER 124.A O ARG 128.A H 3.168 2.420 ARG 128.A N ARG 125.A O ARG 128.A H 2.964 2.328 ARG 128.A NH2 SER 124.A OG ARG 128.A HH21 3.265 2.581 HIS 129.A N ALA 126.A O HIS 129.A H 2.959 2.368 LEU 130.A N ALA 126.A O LEU 130.A H 3.045 2.264 ARG 131.A N ARG 127.A O ARG 131.A H 2.982 2.285 THR 132.A N HIS 129.A O THR 132.A H 3.113 2.405 GLU 133.A N LEU 130.A O GLU 133.A H 3.271 2.437 LEU 136.A N ASP 134.A OD2 LEU 136.A H 3.094 2.242 TRP 137.A N ASP 134.A O TRP 137.A H 3.070 2.244 LYS 138.A N PRO 135.A O LYS 138.A H 2.986 2.337 LYS 138.A NZ GLU 133.A OE1 LYS 138.A HZ2 3.077 2.200 ALA 140.A N LEU 136.A O ALA 140.A H 2.797 1.973 ARG 141.A N TRP 137.A O ARG 141.A H 3.039 2.243 ARG 141.A NE ALA 71.A O ARG 141.A HE 3.498 2.730 ARG 141.A NH1 GLU 133.A OE1 ARG 141.A HH12 2.862 2.048 ARG 141.A NH2 ALA 71.A O ARG 141.A HH21 2.891 2.040 ARG 141.A NH2 GLU 133.A OE1 ARG 141.A HH22 3.375 2.720 ARG 141.A NH2 GLU 133.A OE2 ARG 141.A HH22 2.969 2.114 ARG 142.A N LYS 138.A O ARG 142.A H 3.366 2.576 ARG 142.A NE GLU 95.A OE1 ARG 142.A HE 2.886 2.216 ARG 142.A NE GLU 95.A OE2 ARG 142.A HE 3.373 2.655 ARG 142.A NH1 LYS 138.A O ARG 142.A HH11 3.108 2.345 ARG 142.A NH2 GLU 95.A OE2 ARG 142.A HH21 2.790 1.996 TRP 143.A N GLU 139.A O TRP 143.A H 3.026 2.204 LEU 144.A N ALA 140.A O LEU 144.A H 2.952 2.155 LEU 145.A N ARG 141.A O LEU 145.A H 3.111 2.269 GLU 146.A N ARG 142.A O GLU 146.A H 2.979 2.125 GLU 147.A N TRP 143.A O GLU 147.A H 2.839 2.081 VAL 148.A N LEU 144.A O VAL 148.A H 3.073 2.244 PHE 149.A N LEU 145.A O PHE 149.A H 3.058 2.201 ARG 150.A N GLU 146.A O ARG 150.A H 2.992 2.150 ARG 150.A NH2 GLU 147.A OE1 ARG 150.A HH21 2.741 1.962 ARG 151.A N GLU 147.A O ARG 151.A H 2.938 2.100 ARG 151.A NE GLU 147.A OE2 ARG 151.A HE 3.190 2.373 ARG 151.A NH1 PRO 190.A O ARG 151.A HH12 3.099 2.432 ARG 151.A NH2 GLU 147.A OE2 ARG 151.A HH21 2.779 1.939 ARG 151.A NH2 PRO 190.A O ARG 151.A HH22 2.692 1.883 LEU 152.A N VAL 148.A O LEU 152.A H 2.978 2.183 GLY 153.A N ARG 150.A O GLY 153.A H 3.275 2.467 ALA 154.A N PHE 149.A O ALA 154.A H 3.108 2.282 ARG 160.A NE ASP 47.A OD1 ARG 160.A HE 2.721 1.864 ARG 160.A NH1 GLU 46.A OE2 ARG 160.A HH12 3.408 2.734 ARG 160.A NH2 LEU 43.A O ARG 160.A HH21 3.558 2.858 ARG 160.A NH2 GLU 46.A OE2 ARG 160.A HH22 2.956 2.145 ARG 160.A NH2 ASP 47.A OD1 ARG 160.A HH21 2.889 2.183 ALA 163.A N ARG 160.A O ALA 163.A H 2.880 2.207 VAL 164.A N ARG 160.A O VAL 164.A H 3.315 2.511 LEU 165.A N PRO 161.A O LEU 165.A H 2.999 2.161 ARG 166.A N GLU 162.A O ARG 166.A H 2.907 2.091 ARG 166.A NE ASP 47.A OD2 ARG 166.A HE 2.941 1.974 ARG 166.A NH1 PHE 223.A O ARG 166.A HH11 2.757 1.948 ARG 166.A NH2 ASP 47.A OD1 ARG 166.A HH21 3.036 2.179 VAL 167.A N ALA 163.A O VAL 167.A H 3.196 2.392 MET 168.A N VAL 164.A O MET 168.A H 2.943 2.105 ALA 169.A N LEU 165.A O ALA 169.A H 2.959 2.129 LEU 170.A N ARG 166.A O LEU 170.A H 3.158 2.345 ALA 171.A N VAL 167.A O ALA 171.A H 2.878 2.092 SER 172.A N MET 168.A O SER 172.A H 3.159 2.320 PHE 173.A N ALA 169.A O PHE 173.A H 3.151 2.305 ALA 174.A N LEU 170.A O ALA 174.A H 2.831 2.002 ASP 175.A N ALA 171.A O ASP 175.A H 2.810 1.966 TRP 176.A N SER 172.A O TRP 176.A H 3.272 2.461 VAL 177.A N PHE 173.A O VAL 177.A H 3.031 2.201 ALA 178.A N ALA 174.A O ALA 178.A H 2.941 2.084 SER 179.A N ASP 175.A O SER 179.A H 2.990 2.352 ASP 180.A N VAL 177.A O ASP 180.A H 3.111 2.260 SER 182.A N ASP 180.A OD1 SER 182.A H 2.906 2.123 LEU 183.A N ASP 180.A O LEU 183.A H 2.872 2.100 PHE 184.A N ASP 180.A O PHE 184.A H 2.860 2.055 ARG 188.A NE PRO 185.A O ARG 188.A HE 2.937 2.042 ARG 188.A NH1 ASP 24.A OD1 ARG 188.A HH12 2.955 2.112 ARG 188.A NH2 ASP 24.A OD2 ARG 188.A HH22 2.827 1.991 ARG 188.A NH2 PRO 185.A O ARG 188.A HH21 3.060 2.316 ARG 191.A N ASP 189.A OD2 ARG 191.A H 2.956 2.102 ARG 191.A NE ASP 189.A OD2 ARG 191.A HE 3.175 2.241 ARG 192.A N ASP 189.A O ARG 192.A H 3.179 2.325 TYR 195.A N ARG 192.A O TYR 195.A H 3.187 2.349 TYR 195.A OH ASP 24.A OD1 TYR 195.A HH 2.722 2.004 GLU 198.A N ASP 194.A O GLU 198.A H 3.068 2.239 ALA 199.A N TYR 195.A O ALA 199.A H 2.829 1.993 LEU 200.A N LEU 196.A O LEU 200.A H 2.856 2.028 ARG 201.A N LYS 197.A O ARG 201.A H 3.214 2.415 ARG 201.A NE GLU 198.A OE1 ARG 201.A HE 3.368 2.435 ARG 201.A NE GLU 198.A OE2 ARG 201.A HE 3.131 2.335 ARG 201.A NH1 GLU 205.A OE2 ARG 201.A HH12 2.638 2.044 ARG 201.A NH2 GLU 198.A OE2 ARG 201.A HH21 2.784 1.988 LEU 202.A N GLU 198.A O LEU 202.A H 2.984 2.184 ALA 203.A N ALA 199.A O ALA 203.A H 2.784 1.990 GLN 204.A N LEU 200.A O GLN 204.A H 2.929 2.181 GLN 204.A NE2 GLN 204.A O GLN 204.A HE22 3.415 2.816 GLN 204.A NE2 ASN 208.A OD1 GLN 204.A HE22 3.482 2.766 GLU 205.A N ARG 201.A O GLU 205.A H 3.019 2.194 ALA 206.A N LEU 202.A O ALA 206.A H 2.850 2.036 LEU 207.A N ALA 203.A O LEU 207.A H 2.940 2.101 ASN 208.A N GLN 204.A O ASN 208.A H 3.116 2.266 ARG 209.A N GLU 205.A O ARG 209.A H 3.016 2.168 LEU 210.A N ALA 206.A O LEU 210.A H 2.860 2.046 GLY 211.A N LEU 207.A O GLY 211.A H 3.217 2.558 GLY 211.A N ASN 208.A O GLY 211.A H 3.067 2.338 TRP 212.A N ARG 209.A O TRP 212.A H 2.969 2.132 PHE 215.A N TRP 212.A O PHE 215.A H 2.963 2.126 ALA 216.A N TRP 212.A O ALA 216.A H 3.075 2.372 LYS 217.A N TYR 229.A O LYS 217.A H 2.984 2.140 ARG 220.A N PHE 227.A O ARG 220.A H 2.745 1.904 ARG 220.A NE GLU 222.A OE1 ARG 220.A HE 2.849 1.999 ARG 220.A NH2 GLU 222.A OE1 ARG 220.A HH21 2.898 2.193 GLU 222.A N GLU 225.A O GLU 222.A H 2.922 2.086 GLU 225.A N GLU 222.A O GLU 225.A H 2.842 2.000 LEU 226.A N GLU 36.A OE1 LEU 226.A H 2.949 2.136 PHE 227.A N ARG 220.A O PHE 227.A H 2.940 2.135 TYR 229.A N ALA 218.A O TYR 229.A H 2.710 1.862