Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3tf1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N ILE 43.A O MET 1.A H3 2.622 1.939 MET 1.A N ASP 45.A OD1 MET 1.A H1 2.969 2.071 LYS 2.A NZ LEU 105.A O LYS 2.A HZ2 2.700 1.842 GLY 3.A N GLU 41.A O GLY 3.A H 2.934 2.257 GLY 3.A N ASP 42.A OD1 GLY 3.A H 3.309 2.529 ILE 5.A N LYS 2.A O ILE 5.A H 3.045 2.390 VAL 6.A N LYS 2.A O VAL 6.A H 3.214 2.378 GLY 7.A N GLY 3.A O GLY 7.A H 2.979 2.197 THR 8.A N THR 4.A O THR 8.A H 3.179 2.441 THR 8.A OG1 ILE 5.A O THR 8.A HG1 2.577 1.838 TRP 9.A N ILE 5.A O TRP 9.A H 3.000 2.224 TRP 9.A NE1 TYR 140.A OH TRP 9.A HE1 2.842 2.008 ILE 10.A N VAL 6.A O ILE 10.A H 3.127 2.353 LYS 11.A N GLY 7.A O LYS 11.A H 3.334 2.493 LYS 11.A NZ ASP 15.A OD1 LYS 11.A HZ2 3.529 2.799 LYS 11.A NZ ASP 15.A OD2 LYS 11.A HZ2 2.788 1.995 THR 12.A N THR 8.A O THR 12.A H 2.908 2.065 THR 12.A OG1 ASN 74.A OD1 THR 12.A HG1 2.701 2.075 LEU 13.A N TRP 9.A O LEU 13.A H 2.807 1.959 ARG 14.A N ILE 10.A O ARG 14.A H 3.064 2.257 ARG 14.A NH1 ASN 19.A OD1 ARG 14.A HH11 3.189 2.380 ARG 14.A NH1 ASP 23.A OD1 ARG 14.A HH12 2.884 2.076 ARG 14.A NH2 ASP 23.A OD1 ARG 14.A HH22 3.089 2.348 ASP 15.A N LYS 11.A O ASP 15.A H 2.861 2.039 LEU 16.A N THR 12.A O LEU 16.A H 2.900 2.159 TYR 17.A N LEU 13.A O TYR 17.A H 2.822 1.997 TYR 17.A OH GLU 69.A OE1 TYR 17.A HH 2.596 2.020 GLY 18.A N ARG 14.A O GLY 18.A H 2.876 2.095 VAL 22.A N GLY 18.A O VAL 22.A H 3.237 2.409 ASP 23.A N ASN 19.A O ASP 23.A H 2.780 1.928 GLU 24.A N ASP 20.A O GLU 24.A H.B 3.055 2.205 SER 25.A N VAL 21.A O SER 25.A H 2.982 2.209 LEU 26.A N VAL 22.A O LEU 26.A H 2.872 2.034 LYS 27.A N ASP 23.A O LYS 27.A H 2.854 2.016 SER 28.A N GLU 24.A O SER 28.A H 3.043 2.407 SER 28.A N SER 25.A O SER 28.A H 3.002 2.334 VAL 29.A N LEU 26.A O VAL 29.A H 3.118 2.392 GLY 30.A N LYS 27.A O GLY 30.A H 2.833 2.035 TRP 31.A N LEU 26.A O TRP 31.A H 2.941 2.155 TRP 31.A NE1 GLU 47.A OE2 TRP 31.A HE1 3.043 2.229 ASP 34.A N ASP 34.A OD1 ASP 34.A H 2.681 2.024 ARG 35.A N GLU 32.A O ARG 35.A H 2.856 2.005 ARG 35.A NH2 GLU 41.A OE2 ARG 35.A HH21 2.888 2.059 THR 38.A N GLU 41.A OE1 THR 38.A H 2.645 1.798 LEU 40.A N THR 38.A OG1 LEU 40.A H 3.074 2.394 GLU 41.A N THR 38.A O GLU 41.A H 3.202 2.455 ILE 43.A N MET 1.A O ILE 43.A H 2.794 1.943 GLU 47.A N ASP 44.A O GLU 47.A H 2.964 2.364 GLU 47.A N ASP 44.A OD2 GLU 47.A H 3.084 2.386 VAL 48.A N ASP 44.A O VAL 48.A H 3.273 2.458 ARG 49.A N ASP 45.A O ARG 49.A H 2.951 2.189 ARG 49.A NH1 ASP 46.A OD1 ARG 49.A HH11 3.068 2.309 ARG 49.A NH2 ARG 135.A O ARG 49.A HH21 3.198 2.557 ARG 50.A N ASP 46.A O ARG 50.A H.B 2.945 2.154 ILE 51.A N GLU 47.A O ILE 51.A H 2.930 2.135 PHE 52.A N VAL 48.A O PHE 52.A H 2.890 2.053 ALA 53.A N ARG 49.A O ALA 53.A H 2.849 2.064 LYS 54.A N ARG 50.A O LYS 54.A H 3.056 2.284 LYS 54.A NZ GLU 57.A OE1 LYS 54.A HZ3 2.905 2.124 VAL 55.A N ILE 51.A O VAL 55.A H 3.011 2.199 SER 56.A N PHE 52.A O SER 56.A H 2.889 2.065 GLU 57.A N ALA 53.A O GLU 57.A H 2.941 2.125 LYS 58.A N LYS 54.A O LYS 58.A H 2.895 2.072 LYS 58.A NZ GLU 24.A OE1.A LYS 58.A HZ2 2.687 1.845 THR 59.A N VAL 55.A O THR 59.A H 2.909 2.108 THR 59.A OG1 VAL 55.A O THR 59.A HG1 2.948 2.186 LYS 61.A N THR 59.A OG1 LYS 61.A H 3.166 2.336 LYS 61.A NZ GLU 69.A OE1 LYS 61.A HZ3 2.918 2.029 GLU 65.A N ASN 62.A OD1 GLU 65.A H 2.891 2.136 ILE 66.A N ASN 62.A O ILE 66.A H 3.177 2.349 TRP 67.A N VAL 63.A O TRP 67.A H 2.985 2.159 ARG 68.A N ASN 64.A O ARG 68.A H 2.956 2.206 ARG 68.A NE GLU 146.A OE1 ARG 68.A HE 2.825 2.036 ARG 68.A NH1 ASP 139.A OD1 ARG 68.A HH11 3.288 2.565 ARG 68.A NH2 GLU 146.A OE2 ARG 68.A HH21 2.831 1.998 GLU 69.A N GLU 65.A O GLU 69.A H 2.873 2.022 VAL 70.A N ILE 66.A O VAL 70.A H 2.739 1.907 GLY 71.A N TRP 67.A O GLY 71.A H 2.825 2.009 ARG 72.A N ARG 68.A O ARG 72.A H 3.084 2.248 ARG 72.A NE GLU 146.A OE1 ARG 72.A HE 2.802 1.976 ARG 72.A NH2 GLU 146.A OE1 ARG 72.A HH21 3.121 2.418 GLN 73.A N GLU 69.A O GLN 73.A H 3.010 2.173 ASN 74.A N VAL 70.A O ASN 74.A H 2.724 2.009 ASN 74.A ND2 THR 8.A OG1 ASN 74.A HD21 3.090 2.291 ASN 74.A ND2 TYR 140.A OH ASN 74.A HD22 3.046 2.373 LYS 76.A N GLN 73.A O LYS 76.A H 3.055 2.452 THR 77.A N GLN 73.A O THR 77.A H 3.326 2.519 THR 77.A OG1 THR 12.A OG1 THR 77.A HG1 2.659 1.976 PHE 78.A N ASN 74.A O PHE 78.A H 2.756 1.926 SER 79.A N ILE 75.A O SER 79.A H 2.813 2.018 SER 79.A OG LYS 76.A O SER 79.A HG 2.725 2.158 GLU 80.A N LYS 76.A O GLU 80.A H 3.055 2.382 GLU 80.A N THR 77.A O GLU 80.A H 3.124 2.425 TRP 81.A N THR 77.A O TRP 81.A H 2.970 2.139 PHE 82.A N PHE 78.A O PHE 82.A H 2.719 1.901 TYR 85.A N PHE 82.A O TYR 85.A H 3.179 2.355 PHE 86.A N PRO 83.A O PHE 86.A H 2.985 2.151 ALA 87.A N PRO 83.A O ALA 87.A H 3.088 2.276 ARG 89.A N PHE 86.A O ARG 89.A H 3.062 2.397 ARG 89.A NH1 SER 84.A O ARG 89.A HH12 2.933 2.320 ARG 89.A NH1 TYR 85.A O ARG 89.A HH11 3.330 2.803 ARG 90.A NE GLU 154.A OE2 ARG 90.A HE 3.300 2.594 LEU 91.A N GLU 154.A OE2 LEU 91.A H 2.841 2.000 ASN 93.A N ARG 90.A O ASN 93.A H 3.167 2.579 PHE 94.A N ARG 90.A O PHE 94.A H 3.086 2.231 LEU 95.A N LEU 91.A O LEU 95.A H 2.917 2.063 MET 96.A N VAL 92.A O MET 96.A H 3.093 2.284 MET 97.A N ASN 93.A O MET 97.A H 3.093 2.424 MET 97.A N PHE 94.A O MET 97.A H 3.225 2.470 MET 98.A N LEU 95.A O MET 98.A H 3.246 2.396 VAL 101.A N MET 97.A O VAL 101.A H 2.943 2.085 HIS 102.A N MET 98.A O HIS 102.A H 2.865 2.061 HIS 102.A ND1 MET 98.A O HIS 102.A HD1 2.817 2.005 LEU 103.A N ASP 99.A O LEU 103.A H 3.245 2.439 GLN 104.A N GLU 100.A O GLN 104.A H 2.801 1.977 GLN 104.A NE2 GLU 100.A OE2 GLN 104.A HE22 2.846 2.042 LEU 105.A N VAL 101.A O LEU 105.A H 2.935 2.205 THR 106.A N LEU 103.A O THR 106.A H 3.269 2.496 THR 106.A OG1 HIS 102.A O THR 106.A HG1 2.900 2.144 THR 106.A OG1 LEU 103.A O THR 106.A HG1 3.522 3.060 LYS 107.A NZ GLN 104.A OE1 LYS 107.A HZ3 3.091 2.293 ILE 109.A N THR 106.A O ILE 109.A H 2.942 2.101 ALA 112.A N ILE 109.A O ALA 112.A H 3.147 2.477 ARG 116.A N VAL 132.A O ARG 116.A H 2.856 2.011 ARG 116.A NE ASP 99.A OD1 ARG 116.A HE 2.760 1.929 ARG 116.A NH2 ASP 99.A OD2 ARG 116.A HH21 2.768 1.921 LEU 117.A N ASP 99.A OD1 LEU 117.A H 2.900 2.075 LYS 120.A N GLU 128.A O LYS 120.A H 2.908 2.120 VAL 122.A N ALA 126.A O VAL 122.A H 3.000 2.161 ALA 126.A N ALA 123.A O ALA 126.A H 3.344 2.488 ILE 127.A N ILE 176.A O ILE 127.A H 2.967 2.189 GLU 128.A N LYS 120.A O GLU 128.A H 2.817 1.986 MET 129.A N VAL 174.A O MET 129.A H 2.887 2.086 GLU 130.A N ILE 118.A O GLU 130.A H 3.037 2.221 TYR 131.A N LEU 172.A O TYR 131.A H 2.810 2.019 VAL 132.A N ARG 116.A O VAL 132.A H 2.921 2.123 SER 133.A N SER 170.A O SER 133.A H 2.982 2.174 ARG 135.A N SER 133.A OG ARG 135.A H 2.869 2.013 ARG 135.A NE ASP 45.A OD2 ARG 135.A HE 2.856 2.050 PHE 141.A N MET 137.A O PHE 141.A H 3.076 2.222 LEU 142.A N TYR 138.A O LEU 142.A H 3.011 2.174 GLY 143.A N ASP 139.A O GLY 143.A H 2.792 1.955 LEU 144.A N TYR 140.A O LEU 144.A H 2.809 2.001 ILE 145.A N PHE 141.A O ILE 145.A H 3.212 2.393 GLU 146.A N LEU 142.A O GLU 146.A H 2.945 2.112 GLY 147.A N GLY 143.A O GLY 147.A H 2.822 1.989 SER 148.A N LEU 144.A O SER 148.A H 2.710 1.909 SER 149.A N ILE 145.A O SER 149.A H 3.036 2.216 LYS 150.A N GLU 146.A O LYS 150.A H 3.081 2.244 PHE 151.A N GLY 147.A O PHE 151.A H 2.839 2.006 PHE 152.A N SER 148.A O PHE 152.A H 3.031 2.184 LYS 153.A N LYS 150.A O LYS 153.A H 3.017 2.231 GLU 154.A N SER 149.A O GLU 154.A H 3.078 2.310 SER 157.A N LYS 177.A O SER 157.A H 2.929 2.126 GLU 159.A N ARG 175.A O GLU 159.A H 2.961 2.104 VAL 161.A N LYS 173.A O VAL 161.A H 2.938 2.244 GLU 162.A N LYS 173.A O GLU 162.A H 3.390 2.579 ARG 163.A NH1 GLU 160.A OE1 ARG 163.A HH11 2.992 2.325 GLY 164.A N ARG 171.A O GLY 164.A H 2.970 2.213 LYS 166.A N PHE 169.A O LYS 166.A H 2.836 2.038 PHE 169.A N LYS 166.A O PHE 169.A H 3.012 2.164 SER 170.A N SER 133.A O SER 170.A H 3.019 2.381 ARG 171.A N GLY 164.A O ARG 171.A H 2.847 2.125 ARG 171.A NE GLU 130.A OE2 ARG 171.A HE 3.265 2.469 ARG 171.A NH2 GLU 130.A OE1 ARG 171.A HH21 2.949 2.262 ARG 171.A NH2 GLU 130.A OE2 ARG 171.A HH21 3.562 2.856 LEU 172.A N TYR 131.A O LEU 172.A H 2.886 2.100 LYS 173.A N GLU 162.A O LYS 173.A H 2.873 2.047 LYS 173.A NZ GLU 162.A OE2 LYS 173.A HZ2 3.209 2.559 VAL 174.A N MET 129.A O VAL 174.A H 2.874 2.029 ARG 175.A N GLU 159.A O ARG 175.A H 2.833 2.043 ILE 176.A N ILE 127.A O ILE 176.A H 2.697 1.879 LYS 177.A N SER 157.A O LYS 177.A H 2.862 2.040 PHE 178.A N ASP 125.A O PHE 178.A H 2.803 1.970 VAL 182.A N LYS 124.A O VAL 182.A H 2.748 1.897 PHE 183.A N LYS 124.A O PHE 183.A H 2.960 2.114 LYS 187.A NZ ASN 188.A OD1 LYS 187.A HZ3 3.460 2.654