Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3tm9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 4.A NE2 ASN 8.A OD1 GLN 4.A HE21 2.966 2.153 THR 6.A N ASP 3.A OD1 THR 6.A H 2.869 2.032 THR 6.A OG1 ASP 3.A OD1 THR 6.A HG1 2.663 1.931 ILE 7.A N ASP 3.A O ILE 7.A H 3.062 2.224 ASN 8.A N GLN 4.A O ASN 8.A H 2.925 2.104 ILE 9.A N GLN 5.A O ILE 9.A H 3.115 2.336 ILE 10.A N THR 6.A O ILE 10.A H 3.059 2.228 LYS 11.A N ILE 7.A O LYS 11.A H 2.904 2.073 LYS 11.A NZ.A ASN 8.A OD1 LYS 11.A HZ2.A 3.351 2.779 LYS 11.A NZ.B GLU 69.A OE1 LYS 11.A HZ2.B 3.263 2.548 ALA 12.A N ASN 8.A O ALA 12.A H 2.985 2.214 THR 13.A N ILE 9.A O THR 13.A H 3.030 2.363 THR 13.A N ILE 10.A O THR 13.A H 3.212 2.519 VAL 14.A N ILE 10.A O VAL 14.A H 2.909 2.143 LEU 17.A N THR 13.A O LEU 17.A H.A 3.112 2.288 LYS 18.A N VAL 14.A O LYS 18.A H 2.927 2.095 LYS 18.A NZ GLN 66.A OE1.A LYS 18.A HZ1 2.862 2.068 GLU 19.A N PRO 15.A O GLU 19.A H 3.024 2.245 HIS 20.A N LEU 17.A O HIS 20.A H 3.009 2.318 GLY 21.A N LYS 18.A O GLY 21.A H 3.028 2.274 ILE 24.A N HIS 20.A O ILE 24.A H 2.893 2.040 THR 25.A N GLY 21.A O THR 25.A H 2.971 2.116 THR 26.A N VAL 22.A O THR 26.A H 3.003 2.191 THR 26.A OG1 VAL 22.A O THR 26.A HG1 2.767 2.053 THR 27.A N THR 23.A O THR 27.A H 2.968 2.145 PHE 28.A N ILE 24.A O PHE 28.A H 2.923 2.063 ALA 29.A N THR 25.A O ALA 29.A H 2.983 2.172 LYS 30.A N THR 26.A O LYS 30.A H 3.042 2.203 ASN 31.A N THR 27.A O ASN 31.A H 2.904 2.057 ASN 31.A ND2 GLU 108.A OE1 ASN 31.A HD21 3.071 2.248 LEU 32.A N PHE 28.A O LEU 32.A H 2.846 2.022 PHE 33.A N ALA 29.A O PHE 33.A H 3.118 2.281 ALA 34.A N LYS 30.A O ALA 34.A H 2.959 2.275 LYS 35.A N ASN 31.A O LYS 35.A H 2.831 1.990 LYS 35.A NZ GLU 101.A OE1 LYS 35.A HZ3 3.437 2.609 LYS 35.A NZ GLU 101.A OE2 LYS 35.A HZ3 3.258 2.614 HIS 36.A N LEU 32.A O HIS 36.A H 2.928 2.148 HIS 36.A NE2 GLU 101.A OE2 no hydrogen 3.055 N/A GLU 38.A N GLU 38.A OE1 GLU 38.A H 2.902 2.092 VAL 39.A N HIS 36.A O VAL 39.A H 3.109 2.260 ARG 40.A N PRO 37.A O ARG 40.A H 3.081 2.273 ARG 40.A NE PHE 33.A O ARG 40.A HE 3.122 2.325 ARG 40.A NH2 PHE 33.A O ARG 40.A HH21 3.237 2.481 LEU 42.A N VAL 39.A O LEU 42.A H 2.994 2.225 PHE 43.A N ARG 40.A O PHE 43.A H 3.093 2.304 ASP 44.A N GLN 53.A OE1 ASP 44.A H 2.820 1.961 GLN 48.A N GLN 48.A OE1 GLN 48.A H 2.594 1.958 GLU 52.A N GLU 49.A O GLU 52.A H 3.349 2.490 LYS 55.A N LEU 51.A O LYS 55.A H 2.912 2.074 LYS 55.A NZ GLU 52.A OE2.A LYS 55.A HZ1 2.879 2.000 ALA 56.A N GLU 52.A O ALA 56.A H 3.064 2.295 LEU 57.A N GLN 53.A O LEU 57.A H 2.981 2.165 ALA 58.A N PRO 54.A O ALA 58.A H 3.168 2.327 MET 59.A N LYS 55.A O MET 59.A H 2.948 2.122 THR 60.A N ALA 56.A O THR 60.A H 2.940 2.143 THR 60.A OG1 ALA 56.A O THR 60.A HG1 2.730 1.979 VAL 61.A N LEU 57.A O VAL 61.A H 3.123 2.322 LEU 62.A N ALA 58.A O LEU 62.A H 3.165 2.366 ALA 63.A N MET 59.A O ALA 63.A H 2.914 2.130 ALA 64.A N THR 60.A O ALA 64.A H 2.800 1.955 ALA 65.A N VAL 61.A O ALA 65.A H 2.870 2.033 GLN 66.A N LEU 62.A O GLN 66.A H 3.024 2.251 ASN 67.A N ALA 64.A O ASN 67.A H 2.991 2.285 ILE 68.A N ALA 65.A O ILE 68.A H 3.133 2.401 ASN 70.A N ASN 67.A O ASN 70.A H 2.894 2.056 ALA 73.A N ASN 70.A O ALA 73.A H 3.046 2.321 ILE 74.A N LEU 71.A O ILE 74.A H 2.910 2.158 LEU 75.A N PRO 72.A O no hydrogen 3.350 N/A ALA 77.A N ILE 74.A O ALA 77.A H 2.888 2.289 VAL 78.A N ILE 74.A O VAL 78.A H 3.001 2.169 LYS 79.A N LEU 75.A O LYS 79.A H.A 2.928 2.131 LYS 80.A N PRO 76.A O LYS 80.A H 3.360 2.542 ILE 81.A N ALA 77.A O ILE 81.A H 3.138 2.292 ALA 82.A N VAL 78.A O ALA 82.A H 2.875 2.083 VAL 83.A N LYS 79.A O VAL 83.A H 3.190 2.465 HIS 85.A N ILE 81.A O HIS 85.A H 2.808 1.973 HIS 85.A ND1 GLU 137.A OE2 no hydrogen 2.665 N/A CYS 86.A N ALA 82.A O CYS 86.A H 2.831 1.991 GLN 87.A N VAL 83.A O GLN 87.A H 2.981 2.205 ALA 88.A N LYS 84.A O ALA 88.A H 2.924 2.246 ALA 88.A N HIS 85.A O ALA 88.A H 3.101 2.461 GLY 89.A N CYS 86.A O GLY 89.A H 3.288 2.506 VAL 90.A N HIS 85.A O VAL 90.A H 2.956 2.125 ALA 91.A N HIS 94.A ND1 ALA 91.A H 3.144 2.286 HIS 94.A N ALA 91.A O HIS 94.A H 2.948 2.131 TYR 95.A N ALA 92.A O TYR 95.A H 3.103 2.273 TYR 95.A OH GLU 137.A OE1 TYR 95.A HH 2.657 1.888 VAL 98.A N HIS 94.A O VAL 98.A H 3.261 2.441 GLY 99.A N TYR 95.A O GLY 99.A H 2.987 2.186 GLN 100.A N PRO 96.A O GLN 100.A H 2.914 2.087 GLU 101.A N ILE 97.A O GLU 101.A H 3.067 2.238 LEU 102.A N VAL 98.A O LEU 102.A H 2.889 2.074 LEU 103.A N GLY 99.A O LEU 103.A H 2.914 2.070 GLY 104.A N GLN 100.A O GLY 104.A H 2.960 2.150 ALA 105.A N GLU 101.A O ALA 105.A H 2.899 2.090 ILE 106.A N LEU 102.A O ILE 106.A H 2.937 2.130 LYS 107.A N LEU 103.A O LYS 107.A H 3.051 2.215 LYS 107.A NZ GLY 111.A O LYS 107.A HZ3 3.114 2.248 LYS 107.A NZ ALA 114.A O LYS 107.A HZ1 3.017 2.292 GLU 108.A N GLY 104.A O GLU 108.A H 2.843 2.021 VAL 109.A N ALA 105.A O VAL 109.A H 2.973 2.184 LEU 110.A N ILE 106.A O LEU 110.A H 2.908 2.060 GLY 111.A N LYS 107.A O GLY 111.A H 3.001 2.243 ALA 113.A N LEU 110.A O ALA 113.A H 3.159 2.350 ALA 114.A N GLY 111.A O ALA 114.A H 3.089 2.264 ILE 118.A N THR 115.A OG1 ILE 118.A H 3.135 2.312 LEU 119.A N THR 115.A O LEU 119.A H 2.844 2.002 ASP 120.A N ASP 116.A O ASP 120.A H 2.824 2.007 ALA 121.A N ASP 117.A O ALA 121.A H 3.132 2.350 TRP 122.A N ILE 118.A O TRP 122.A H 3.056 2.255 GLY 123.A N LEU 119.A O GLY 123.A H 2.867 2.043 LYS 124.A N ASP 120.A O LYS 124.A H 2.977 2.167 LYS 124.A NZ.A ASP 120.A OD1.B LYS 124.A HZ1.A 2.385 1.723 LYS 124.A NZ.A ASP 120.A OD2.B LYS 124.A HZ1.A 3.038 2.180 LYS 124.A NZ.B ASP 120.A OD2.B LYS 124.A HZ1.B 2.816 2.117 ALA 125.A N ALA 121.A O ALA 125.A H 2.927 2.100 TYR 126.A N TRP 122.A O TYR 126.A H 2.938 2.088 GLY 127.A N GLY 123.A O GLY 127.A H 3.169 2.376 VAL 128.A N LYS 124.A O VAL 128.A H 3.182 2.386 ILE 129.A N ALA 125.A O ILE 129.A H 3.062 2.221 ALA 130.A N TYR 126.A O ALA 130.A H 2.807 1.947 ASP 131.A N GLY 127.A O ASP 131.A H 2.972 2.158 PHE 133.A N ILE 129.A O PHE 133.A H 3.286 2.454 ILE 134.A N ALA 130.A O ILE 134.A H 2.827 1.977 GLN 135.A N ASP 131.A O GLN 135.A H 3.030 2.207 GLN 135.A NE2.A ASP 139.A OD2 GLN 135.A HE22.A 3.173 2.387 VAL 136.A N VAL 132.A O VAL 136.A H 3.032 2.179 GLU 137.A N PHE 133.A O GLU 137.A H 2.833 1.993 ALA 138.A N ILE 134.A O ALA 138.A H 2.861 2.046 ASP 139.A N GLN 135.A O ASP 139.A H 3.163 2.322 LEU 140.A N VAL 136.A O LEU 140.A H 3.043 2.211 TYR 141.A N GLU 137.A O TYR 141.A H 2.863 2.029 TYR 141.A OH VAL 90.A O TYR 141.A HH 2.688 1.850 ALA 142.A N ALA 138.A O ALA 142.A H 3.010 2.194 GLN 143.A N ASP 139.A O GLN 143.A H 2.931 2.141 ALA 144.A N TYR 141.A O ALA 144.A H 3.217 2.483 GLU 146.A N ALA 142.A O GLU 146.A H 3.240 2.391