Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3u8o_H.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N GLY 142.A O no hydrogen 3.462 N/A ILE 1.A N ASN 143.A O no hydrogen 2.890 N/A ILE 1.A N ASP 196.A OD1 no hydrogen 3.520 N/A ILE 1.A N ASP 196.A OD2 no hydrogen 2.667 N/A VAL 2.A N ASP 191.A O VAL 2.A H 2.826 1.980 SER 5.A N VAL 154.A O SER 5.A H 3.003 2.220 ALA 7.A N LEU 152.A O ALA 7.A H 2.795 1.938 MET 11.A N GLU 8.A O MET 11.A H 3.111 2.321 SER 12.A OG.A GLN 15.A OE1.B SER 12.A HG.A 2.731 2.142 GLN 15.A N SER 12.A O GLN 15.A H 2.910 2.056 GLN 15.A NE2.A VAL 16.A O GLN 15.A HE22.A 3.221 2.502 GLN 15.A NE2.B THR 139.A O GLN 15.A HE21.B 3.181 2.446 VAL 16.A N ALA 30.A O VAL 16.A H 2.931 2.130 MET 17.A N ARG 62.A O MET 17.A H 2.903 2.047 LEU 18.A N CYS 28.A O LEU 18.A H 2.840 2.009 PHE 19.A N LEU 60.A O PHE 19.A H 2.890 2.057 ARG 20.A N GLU 25.A O ARG 20.A H 2.817 1.983 ARG 20.A NH2 GLU 25.A OE2 ARG 20.A HH21 3.085 2.275 LYS 21.A N ASP 58.A O LYS 21.A H 2.988 2.143 LYS 21.A NZ ASN 57.A O LYS 21.A HZ2 3.400 2.814 GLN 24.A NE2 LYS 21.A O GLN 24.A HE22 2.728 1.894 GLU 25.A N ARG 20.A O GLU 25.A H 3.342 2.579 LEU 27.A N LEU 18.A O LEU 27.A H 2.837 1.984 CYS 28.A SG LEU 27.A O no hydrogen 2.954 N/A GLY 29.A N SER 197.A O GLY 29.A H 2.777 2.034 SER 31.A N LEU 39.A O SER 31.A H 2.883 2.144 SER 31.A OG GLN 213.A OE1 SER 31.A HG 2.637 1.830 LEU 32.A N TRP 14.A O LEU 32.A H 2.838 2.068 ILE 33.A N TRP 37.A O ILE 33.A H 3.060 2.216 ARG 36.A N SER 34.A OG ARG 36.A H 3.271 2.448 ARG 36.A NE GLU 251.A O ARG 36.A HE 2.889 2.069 ARG 36.A NE GLU 251.A OXT ARG 36.A HE 3.093 2.465 ARG 36.A NH2 GLY 250.A O ARG 36.A HH21 3.276 2.646 ARG 36.A NH2 GLU 251.A OXT ARG 36.A HH21 2.912 2.246 TRP 37.A N SER 34.A OG TRP 37.A H 3.236 2.585 TRP 37.A NE1 GLY 250.A O TRP 37.A HE1 2.948 2.186 VAL 38.A N MET 103.A O VAL 38.A H 2.910 2.093 LEU 39.A N SER 31.A O LEU 39.A H 2.854 2.034 THR 40.A N ALA 101.A O THR 40.A H 2.964 2.129 THR 40.A OG1 GLY 29.A O THR 40.A HG1 2.905 2.259 HIS 43.A N ASP 99.A OD1 HIS 43.A H 2.833 2.054 HIS 43.A ND1 ASP 99.A OD2 HIS 43.A HD1 2.774 1.946 CYS 44.A N ALA 41.A O CYS 44.A H 3.143 2.372 CYS 44.A SG SER 197.A O no hydrogen 3.599 N/A LEU 45.A N ALA 42.A O LEU 45.A H 2.882 2.053 LEU 46.A N ALA 42.A O LEU 46.A H 2.869 2.103 TYR 47.A N LYS 52.A O TYR 47.A H 2.834 1.998 TRP 50.A N TYR 47.A O TRP 50.A H 2.977 2.184 ASP 51.A N PRO 48.A O ASP 51.A H 2.862 2.017 LYS 52.A N TYR 47.A O LYS 52.A H 3.169 2.323 PHE 54.A N LEU 45.A O PHE 54.A H 2.894 2.074 THR 55.A N ASP 58.A OD2 THR 55.A H 2.834 1.976 GLU 56.A N GLU 56.A OE1 GLU 56.A H 2.813 1.998 ASP 58.A N THR 55.A O ASP 58.A H 2.986 2.153 LEU 59.A N GLU 56.A O LEU 59.A H 3.291 2.454 LEU 60.A N PHE 19.A O LEU 60.A H 2.850 2.029 VAL 61.A N SER 79.A O VAL 61.A H 2.976 2.136 ARG 62.A N MET 17.A O ARG 62.A H 2.894 2.091 ARG 62.A NE GLU 76.A OE1 ARG 62.A HE 2.785 1.980 ARG 62.A NH1 GLU 76.A OE1 ARG 62.A HH11 3.253 2.568 ARG 62.A NH1 GLU 76.A OE2 ARG 62.A HH11 3.026 2.219 ILE 63.A N LYS 77.A O ILE 63.A H 2.828 2.000 LYS 65.A NZ ARG 70.A O LYS 65.A HZ1 2.738 2.081 LYS 65.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 65.A HZ2 2.855 2.037 LYS 65.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 65.A HZ3 2.779 1.969 HIS 66.A N GLU 72.A OE1 HIS 66.A H 2.915 2.093 SER 67.A N GLU 72.A OE2 SER 67.A H 2.834 1.984 ARG 68.A N SER 150.A O ARG 68.A H 2.912 2.068 ARG 68.A NE PRO 149.A O ARG 68.A HE 2.786 1.991 ARG 70.A N SER 67.A OG ARG 70.A H 2.944 2.089 GLU 72.A N GLU 76.A OE2 GLU 72.A H 2.894 2.043 ILE 75.A N GLU 72.A O ILE 75.A H 2.885 2.053 GLU 76.A N GLU 72.A O GLU 76.A H 2.872 2.020 LYS 77.A N ILE 63.A O LYS 77.A H 2.823 2.012 LYS 77.A NZ.A GLU 76.A O LYS 77.A HZ2.A 3.537 2.961 LYS 77.A NZ.B ILE 78.A O LYS 77.A HZ2.B 2.756 1.872 SER 79.A N VAL 61.A O SER 79.A H 2.845 2.013 GLU 82.A N LYS 104.A O GLU 82.A H 2.736 1.949 ILE 84.A N GLU 56.A OE2 ILE 84.A H 2.866 2.052 TYR 85.A N LEU 102.A O TYR 85.A H 2.819 1.980 HIS 87.A N ILE 100.A O HIS 87.A H 3.209 2.360 TYR 90.A N HIS 87.A O TYR 90.A H 3.151 2.300 ASN 91.A N ASP 97.A O ASN 91.A H 2.844 2.015 ASN 91.A ND2 GLU 94.A OE1 ASN 91.A HD21 3.062 2.324 ASN 95.A N ASN 91.A O ASN 95.A H 3.369 2.597 ASN 95.A ND2 ARG 172.A O ASN 95.A HD22 2.869 2.091 LEU 96.A N ASN 91.A O LEU 96.A H 2.875 2.182 ASP 97.A N ASN 95.A OD1 ASP 97.A H 2.993 2.187 ARG 98.A NH2.A ARG 89.A O ARG 98.A HH21.A 2.870 2.160 ALA 101.A N THR 40.A O ALA 101.A H 2.975 2.185 LEU 102.A N TYR 85.A O LEU 102.A H 2.829 2.006 MET 103.A N VAL 38.A O MET 103.A H 2.835 2.027 LYS 104.A N LYS 83.A O LYS 104.A H 2.926 2.099 LYS 104.A NZ PHE 249.A O LYS 104.A HZ1 2.780 1.902 LEU 105.A N ARG 36.A O LEU 105.A H 2.842 2.003 LYS 106.A N MET 80.A O LYS 106.A H 2.963 2.158 VAL 109.A N ASP 35.A O VAL 109.A H 2.843 2.024 SER 112.A N ILE 115.A O SER 112.A H 2.921 2.094 TYR 114.A N SER 112.A OG TYR 114.A H 3.024 2.196 ILE 115.A N SER 112.A O ILE 115.A H 3.384 2.559 HIS 116.A N PRO 13.A O HIS 116.A H 3.058 2.266 VAL 118.A N LEU 32.A O VAL 118.A H 3.040 2.231 CYS 119.A N TRP 211.A O CYS 119.A H 3.096 2.264 ARG 123.A NH1 GLU 124.A OE1 ARG 123.A HH12 2.993 2.406 ARG 123.A NH2 GLU 124.A OE1 ARG 123.A HH22 2.752 2.092 THR 125.A N ASP 122.A OD1 THR 125.A H 3.011 2.194 ALA 126.A N ASP 122.A O ALA 126.A H 2.991 2.150 ALA 127.A N ARG 123.A O ALA 127.A H 2.918 2.096 SER 128.A N GLU 124.A O SER 128.A H 2.877 2.056 LEU 129.A N THR 125.A O LEU 129.A H 2.932 2.127 LEU 130.A N ALA 126.A O LEU 130.A H 2.981 2.142 GLN 131.A N LEU 129.A O GLN 131.A H 2.900 2.246 GLN 131.A NE2 SER 128.A O GLN 131.A HE22 2.786 1.930 GLY 133.A N ILE 159.A O GLY 133.A H 2.869 2.041 TYR 134.A N GLN 131.A O TYR 134.A H 3.098 2.270 GLY 136.A N LEU 157.A O GLY 136.A H 2.945 2.150 ARG 137.A N VAL 202.A O ARG 137.A H 2.821 2.094 ARG 137.A NE ASN 156.A OD1 ARG 137.A HE 3.038 2.186 VAL 138.A N VAL 155.A O VAL 138.A H 2.870 2.030 THR 139.A OG1 GLN 15.A OE1.A THR 139.A HG1 2.732 2.067 GLY 140.A N GLN 153.A O GLY 140.A H 3.044 2.269 TRP 141.A NE1 HIS 66.A O TRP 141.A HE1 2.929 2.070 GLY 142.A N ASP 196.A OD1 GLY 142.A H 2.783 1.982 ASN 143.A N GLU 194.A O ASN 143.A H 2.841 2.045 LEU 144.A N GLY 147.A O LEU 144.A H 2.882 2.044 GLN 148.A NE2.B ASN 143.A OD1 GLN 148.A HE21.B 2.907 2.182 LEU 152.A N HIS 66.A O LEU 152.A H 2.891 2.126 GLN 153.A N GLY 140.A O GLN 153.A H 2.974 2.122 GLN 153.A NE2 ASP 6.A OD1 GLN 153.A HE21 2.874 2.048 GLN 153.A NE2 VAL 151.A O GLN 153.A HE22 3.046 2.190 GLN 153.A NE2 LEU 152.A O GLN 153.A HE22 3.555 3.087 VAL 154.A N SER 5.A O VAL 154.A H 2.886 2.119 VAL 155.A N VAL 138.A O VAL 155.A H 2.981 2.175 LEU 157.A N GLY 136.A O LEU 157.A H 2.832 2.034 ILE 159.A N TYR 134.A O ILE 159.A H 2.875 2.027 VAL 160.A N CYS 179.A O VAL 160.A H 3.022 2.186 GLU 161.A N GLU 161.A OE1 GLU 161.A H 2.765 1.925 ARG 162.A NH1 THR 174.A O ARG 162.A HH12 2.940 2.312 ARG 162.A NH1 MET 177.A O ARG 162.A HH12 3.212 2.535 ARG 162.A NH2 MET 177.A O ARG 162.A HH22 2.785 1.979 CYS 165.A N GLU 161.A O CYS 165.A H 3.061 2.229 CYS 165.A SG VAL 160.A O no hydrogen 3.650 N/A CYS 165.A SG GLU 161.A O no hydrogen 3.516 N/A LYS 166.A N ARG 162.A O LYS 166.A H 2.817 1.986 ASP 167.A N PRO 163.A O ASP 167.A H 2.951 2.135 SER 168.A N CYS 165.A O SER 168.A H 3.199 2.414 THR 169.A OG1 GLU 221.A OE1 THR 169.A HG1 2.788 2.156 ILE 171.A N THR 169.A OG1 ILE 171.A H 3.130 2.305 ARG 172.A NE GLU 94.A OE2 ARG 172.A HE 2.787 1.931 ARG 172.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 172.A HH11 2.860 2.007 ARG 172.A NH1 GLU 94.A OE2 ARG 172.A HH11 3.406 2.749 THR 174.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 174.A HG1 2.699 1.902 ASN 176.A N THR 174.A OG1 ASN 176.A H 3.058 2.303 ASN 176.A ND2 ASP 97.A OD1 ASN 176.A HD22 2.927 2.089 MET 177.A N THR 174.A O MET 177.A H 3.065 2.295 PHE 178.A N TYR 232.A O PHE 178.A H 2.947 2.163 ALA 180.A N GLY 230.A O ALA 180.A H 3.007 2.238 GLY 181.A N PRO 158.A O GLY 181.A H 2.887 2.068 LYS 183.A N GLU 186.A OE2 LYS 183.A H 2.869 2.034 LYS 183.A NZ.A GLU 161.A OE1 LYS 183.A HZ1.A 2.935 2.150 LYS 183.A NZ.B GLU 161.A OE1 LYS 183.A HZ1.B 2.802 1.970 LYS 183.A NZ.B GLU 161.A OE2 LYS 183.A HZ1.B 3.461 2.693 GLU 186.A N LYS 183.A O GLU 186.A H 2.937 2.100 GLY 187.A N PRO 184.A O GLY 187.A H 3.136 2.323 LYS 188.A NZ.B TYR 182.A OH LYS 188.A HZ3.B 3.224 2.479 ARG 189.A NE ASP 224.A OD2 ARG 189.A HE 2.800 1.968 ARG 189.A NH1 ASP 224.A O ARG 189.A HH11 2.656 1.903 ARG 189.A NH1 ASP 226.A OD1 ARG 189.A HH12 2.901 2.156 ARG 189.A NH2 ASP 226.A OD1 ARG 189.A HH22 2.929 2.186 GLY 190.A N ASP 224.A OD1 GLY 190.A H 2.832 1.977 ASP 191.A N VAL 2.A O ASP 191.A H 3.191 2.420 CYS 193.A N ASP 196.A OD2 CYS 193.A H 2.874 2.150 CYS 193.A SG LYS 145.A O no hydrogen 3.845 N/A ASP 196.A N CYS 193.A O ASP 196.A H 2.928 2.087 GLY 198.A N VAL 217.A O GLY 198.A H 2.875 2.016 GLY 199.A N ASP 196.A O GLY 199.A H 3.000 2.175 PHE 201.A N GLY 215.A O PHE 201.A H 2.934 2.077 VAL 202.A N ARG 137.A O VAL 202.A H 2.841 2.023 MET 203.A N TYR 212.A O MET 203.A H 2.861 2.062 SER 205.A N ARG 210.A O SER 205.A H 2.833 1.978 PHE 207.A N SER 205.A OG PHE 207.A H 2.977 2.205 ASN 208.A ND2 TYR 212.A OH ASN 208.A HD21 2.882 2.048 ASN 209.A N SER 205.A O ASN 209.A H 2.920 2.214 ARG 210.A N ASN 208.A OD1 ARG 210.A H 3.096 2.268 TYR 212.A N MET 203.A O TYR 212.A H 2.886 2.043 GLN 213.A N CYS 119.A O GLN 213.A H 2.838 2.017 GLN 213.A NE2 GLY 215.A O GLN 213.A HE22 2.951 2.116 MET 214.A N PHE 201.A O MET 214.A H 2.872 2.166 GLY 215.A N PHE 201.A O GLY 215.A H 3.063 2.252 ILE 216.A N THR 233.A O ILE 216.A H 3.164 2.464 VAL 217.A N GLY 199.A O VAL 217.A H 2.918 2.093 SER 218.A N PHE 231.A O SER 218.A H 3.007 2.198 TRP 219.A N PHE 231.A O TRP 219.A H 3.220 2.408 CYS 223.A N GLU 146.A OE2 CYS 223.A H 3.016 2.223 CYS 223.A SG ALA 192.A O no hydrogen 3.943 N/A ASP 224.A N ASP 191.A OD2 ASP 224.A H 2.869 2.018 ARG 225.A NE GLU 146.A OE2 ARG 225.A HE 2.949 2.097 ARG 225.A NH1 GLU 146.A OE1 ARG 225.A HH11 2.791 1.939 LYS 228.A N ARG 225.A O LYS 228.A H 3.148 2.305 LYS 228.A NZ SER 168.A O LYS 228.A HZ2 2.775 1.904 LYS 228.A NZ GLU 221.A OE1 LYS 228.A HZ1 2.774 2.007 GLY 230.A N ALA 180.A O GLY 230.A H 3.168 2.469 PHE 231.A N TRP 219.A O PHE 231.A H 2.897 2.050 TYR 232.A N PHE 178.A O TYR 232.A H 2.859 2.076 THR 233.A N ILE 216.A O THR 233.A H 2.887 2.120 THR 233.A OG1 ASP 99.A O THR 233.A HG1 2.806 2.020 HIS 234.A N ASN 176.A O HIS 234.A H 2.866 2.018 VAL 235.A N MET 214.A O VAL 235.A H 3.056 2.215 ARG 237.A NE.B ASN 176.A OD1 ARG 237.A HE.B 3.036 2.240 ARG 237.A NH1.B ASN 176.A OD1 ARG 237.A HH11.B 3.207 2.492 ARG 237.A NH2.A ASP 175.A O ARG 237.A HH21.A 2.817 1.984 LEU 238.A N VAL 235.A O LEU 238.A H 3.024 2.319 LYS 239.A N PHE 236.A O LYS 239.A H 2.950 2.098 LYS 239.A NZ LEU 120.A O LYS 239.A HZ2 3.515 2.796 LYS 239.A NZ PRO 121.A O LYS 239.A HZ2 3.011 2.340 TRP 241.A N LEU 238.A O TRP 241.A H 3.043 2.402 ILE 242.A N LEU 238.A O ILE 242.A H 3.164 2.344 GLN 243.A N LYS 239.A O GLN 243.A H 2.852 2.006 GLN 243.A NE2 ASP 247.A OD1 GLN 243.A HE22 3.551 2.758 GLN 243.A NE2 ASP 247.A OD2 GLN 243.A HE22 2.713 1.927 LYS 244.A N LYS 240.A O LYS 244.A H 3.053 2.251 VAL 245.A N TRP 241.A O VAL 245.A H 2.986 2.155 ILE 246.A N ILE 242.A O ILE 246.A H 2.979 2.142 ASP 247.A N GLN 243.A O ASP 247.A H 2.846 2.014 GLN 248.A N LYS 244.A O GLN 248.A H 3.052 2.254 PHE 249.A N VAL 245.A O PHE 249.A H 2.873 2.077 GLY 250.A N ILE 246.A O GLY 250.A H 2.778 2.013