Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3uyi_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 4.A NE GLU 13.A OE1 ARG 4.A HE 2.979 2.128 ARG 4.A NH1 THR 45.A OG1 ARG 4.A HH12 3.044 2.185 ARG 4.A NH2 GLU 13.A OE1 ARG 4.A HH21 3.537 2.878 VAL 5.A N VAL 14.A O VAL 5.A H 2.746 1.907 LEU 7.A N LEU 12.A O LEU 7.A H 2.870 2.079 GLN 10.A NE2 THR 9.A OG1 GLN 10.A HE21 3.008 2.283 VAL 14.A N VAL 5.A O VAL 14.A H 2.758 1.934 LYS 16.A N PRO 3.A O LYS 16.A H 2.787 1.988 LYS 16.A NZ LEU 244.A O LYS 16.A HZ1 3.055 2.179 LYS 16.A NZ VAL 250.A O LYS 16.A HZ2 2.938 2.055 GLY 18.A N PRO 252.A O GLY 18.A H 2.915 2.056 PHE 19.A N PHE 46.A O PHE 19.A H 2.835 2.040 GLY 20.A N PRO 254.A O GLY 20.A H 3.166 2.331 CYS 21.A N ASP 48.A O CYS 21.A H 2.843 1.991 LEU 24.A N CYS 21.A O LEU 24.A H 2.869 2.077 SER 25.A N MET 22.A O SER 25.A H 3.159 2.324 GLN 31.A N PRO 28.A O GLN 31.A H 3.208 2.622 GLN 31.A NE2 GLN 31.A O GLN 31.A HE21 3.329 2.789 GLY 32.A N PRO 28.A O GLY 32.A H 3.018 2.192 ILE 33.A N GLU 29.A O ILE 33.A H 2.909 2.110 ALA 34.A N GLU 30.A O ALA 34.A H 3.162 2.350 VAL 35.A N GLN 31.A O VAL 35.A H 2.915 2.107 ILE 36.A N GLY 32.A O ILE 36.A H 3.114 2.291 LYS 37.A N ILE 33.A O LYS 37.A H 2.811 1.993 GLU 38.A N ALA 34.A O GLU 38.A H 2.803 1.948 ALA 39.A N VAL 35.A O ALA 39.A H 2.875 2.035 PHE 40.A N ILE 36.A O PHE 40.A H 2.947 2.106 ASN 41.A N LYS 37.A O ASN 41.A H 2.800 1.969 CYS 42.A N GLU 38.A O CYS 42.A H 2.997 2.293 CYS 42.A N ALA 39.A O CYS 42.A H 3.031 2.411 GLY 43.A N PHE 40.A O GLY 43.A H 2.795 1.969 ILE 44.A N ALA 39.A O ILE 44.A H 3.003 2.179 THR 45.A OG1 GLN 76.A OE1 THR 45.A HG1 2.666 1.998 PHE 47.A N GLN 76.A O PHE 47.A H 2.991 2.164 ASP 48.A N PHE 19.A O ASP 48.A H 2.887 2.055 THR 49.A N GLY 78.A O THR 49.A H 2.822 1.997 THR 49.A OG1 ASN 59.A OD1 THR 49.A HG1 2.749 2.022 SER 50.A OG ASP 51.A OD1 SER 50.A HG 3.443 2.790 ASP 51.A N LYS 80.A O ASP 51.A H 3.258 2.406 TYR 53.A N SER 50.A O TYR 53.A H 3.303 2.451 GLU 55.A N SER 58.A OG GLU 55.A H 3.163 2.358 SER 58.A N GLU 55.A O SER 58.A H 3.169 2.545 ASN 59.A ND2 CYS 21.A O ASN 59.A HD22 2.937 2.150 ASN 59.A ND2 SER 25.A OG ASN 59.A HD21 2.938 2.102 GLU 61.A N GLY 57.A O GLU 61.A H 3.142 2.351 LEU 62.A N SER 58.A O LEU 62.A H 2.921 2.170 LEU 63.A N ASN 59.A O LEU 63.A H 3.069 2.226 GLY 64.A N GLU 60.A O GLY 64.A H 2.911 2.103 LYS 65.A N GLU 61.A O LYS 65.A H 3.100 2.352 LYS 65.A NZ GLU 29.A OE2 LYS 65.A HZ1 3.325 2.477 ALA 66.A N LEU 62.A O ALA 66.A H 2.967 2.205 LEU 67.A N LEU 63.A O LEU 67.A H 2.838 1.990 LYS 68.A N LYS 65.A O LYS 68.A H 3.207 2.582 GLN 69.A N ALA 66.A O GLN 69.A H 2.792 1.994 LEU 70.A N LEU 67.A O LEU 70.A H 2.904 2.091 ARG 72.A NE ARG 72.A O ARG 72.A HE 2.794 1.935 ARG 72.A NH2 ARG 72.A O ARG 72.A HH21 3.459 2.801 ARG 72.A NH2 ILE 75.A O ARG 72.A HH21 2.597 1.912 ARG 72.A NH2 ASP 117.A OD1 ARG 72.A HH22 2.419 1.563 GLU 73.A N GLU 73.A OE1 GLU 73.A H 2.939 2.188 LYS 74.A N PRO 71.A O LYS 74.A H 2.848 2.006 ILE 75.A N ARG 72.A O ILE 75.A H 2.893 2.044 GLN 76.A N THR 45.A O GLN 76.A H 2.622 1.815 GLN 76.A NE2 LYS 74.A O GLN 76.A HE22 3.233 2.735 VAL 77.A N ASP 117.A OD1 VAL 77.A H 2.796 1.942 GLY 78.A N PHE 47.A O GLY 78.A H 2.825 1.967 THR 79.A N LEU 118.A O THR 79.A H 2.955 2.274 THR 79.A OG1 GLU 60.A OE2 THR 79.A HG1 2.574 1.803 LYS 80.A NZ ASP 48.A OD1 LYS 80.A HZ1 2.945 2.275 LYS 80.A NZ ASP 48.A OD2 LYS 80.A HZ1 3.049 2.399 LYS 80.A NZ THR 49.A O LYS 80.A HZ2 3.120 2.231 LYS 80.A NZ GLN 171.A OE1 LYS 80.A HZ1 3.274 2.730 PHE 81.A N TYR 120.A O PHE 81.A H 3.053 2.249 HIS 84.A N LYS 92.A O HIS 84.A H 2.846 2.002 GLU 85.A N LYS 92.A O GLU 85.A H 3.293 2.514 GLY 87.A N GLY 90.A O GLY 87.A H 2.834 1.987 LYS 92.A N GLU 85.A O LYS 92.A H 2.768 1.909 LYS 94.A N GLY 82.A O LYS 94.A H 2.833 2.055 GLY 95.A N ASP 125.A OD2 GLY 95.A H 2.862 2.057 TYR 99.A N THR 96.A O TYR 99.A H 2.946 2.341 TYR 99.A N THR 96.A OG1 TYR 99.A H 3.365 2.557 VAL 100.A N THR 96.A O VAL 100.A H 3.013 2.200 ARG 101.A N PRO 97.A O ARG 101.A H 3.004 2.212 ARG 101.A NE GLU 136.A OE2 ARG 101.A HE 3.171 2.447 ARG 101.A NH1 GLU 142.A OE1 ARG 101.A HH12 2.693 1.939 ARG 101.A NH1 GLU 142.A OE2 ARG 101.A HH12 3.403 2.733 ARG 101.A NH2 GLU 136.A OE2 ARG 101.A HH21 2.806 1.980 ARG 101.A NH2 GLU 142.A OE2 ARG 101.A HH22 2.847 2.001 SER 102.A N ASP 98.A O SER 102.A H 2.861 2.020 CYS 103.A N TYR 99.A O CYS 103.A H 2.785 1.928 CYS 104.A N VAL 100.A O CYS 104.A H 3.062 2.212 GLU 105.A N ARG 101.A O GLU 105.A H 2.980 2.130 ALA 106.A N SER 102.A O ALA 106.A H 2.902 2.117 SER 107.A N CYS 103.A O SER 107.A H 2.862 2.102 LEU 108.A N CYS 104.A O LEU 108.A H 2.897 2.088 LYS 109.A N GLU 105.A O LYS 109.A H 3.341 2.583 ARG 110.A N ALA 106.A O ARG 110.A H 3.037 2.184 ARG 110.A NE GLU 60.A OE1 ARG 110.A HE 2.748 1.952 ARG 110.A NH2 GLU 60.A OE1 ARG 110.A HH21 2.898 2.173 LEU 111.A N SER 107.A O LEU 111.A H 2.789 1.931 ASP 112.A N LYS 109.A O ASP 112.A H 3.252 2.577 VAL 113.A N LEU 108.A O VAL 113.A H 3.176 2.374 ILE 116.A N LYS 144.A O ILE 116.A H 2.966 2.181 LEU 118.A N VAL 77.A O LEU 118.A H 2.986 2.157 PHE 119.A N TYR 147.A O PHE 119.A H 3.037 2.220 TYR 120.A N THR 79.A O TYR 120.A H 2.815 2.016 ILE 121.A N GLY 149.A O ILE 121.A H 3.061 2.292 HIS 122.A N PHE 81.A O HIS 122.A H 2.811 1.973 THR 127.A N ASP 125.A OD1 THR 127.A H 2.813 1.970 THR 127.A OG1 ASP 125.A OD1 THR 127.A HG1 2.628 1.819 THR 127.A OG1 ASP 125.A OD2 THR 127.A HG1 3.545 2.990 GLU 131.A N GLU 131.A OE1 GLU 131.A H 3.084 2.330 ILE 132.A N PRO 129.A O ILE 132.A H 2.923 2.161 THR 133.A OG1 GLY 95.A O THR 133.A HG1 2.765 1.959 MET 134.A N ILE 130.A O MET 134.A H 2.873 2.024 GLY 135.A N GLU 131.A O GLY 135.A H 2.953 2.269 GLY 135.A N ILE 132.A O GLY 135.A H 3.026 2.411 LEU 137.A N THR 133.A O LEU 137.A H 3.269 2.457 LEU 139.A N GLU 136.A O LEU 139.A H 2.880 2.045 VAL 140.A N LEU 137.A O VAL 140.A H 2.887 2.145 GLU 142.A N LYS 138.A O GLU 142.A H 2.895 2.103 GLY 143.A N VAL 140.A O GLY 143.A H 2.914 2.135 LYS 144.A N LEU 139.A O LYS 144.A H 3.029 2.350 LYS 144.A NZ GLU 105.A OE2 LYS 144.A HZ2 2.544 1.754 ILE 145.A N LEU 139.A O ILE 145.A H 3.422 2.592 LYS 146.A N ILE 116.A O LYS 146.A H 3.005 2.268 GLY 149.A N PHE 119.A O GLY 149.A H 3.103 2.308 LEU 150.A N ALA 169.A O LEU 150.A H 2.893 2.105 GLU 152.A N GLN 171.A O GLU 152.A H 3.148 2.429 THR 157.A N SER 154.A OG THR 157.A H 3.054 2.199 THR 157.A OG1 SER 154.A OG THR 157.A HG1 3.124 2.487 ILE 158.A N SER 154.A O ILE 158.A H 2.879 2.056 ARG 159.A N PRO 155.A O ARG 159.A H 2.907 2.062 ARG 160.A N ASP 156.A O ARG 160.A H 2.926 2.096 ARG 160.A NE GLU 131.A OE2 ARG 160.A HE 3.076 2.231 ARG 160.A NH1 ASP 156.A OD2 ARG 160.A HH11 3.207 2.406 ARG 160.A NH2 GLU 131.A OE1 ARG 160.A HH21 2.692 1.834 ALA 161.A N THR 157.A O ALA 161.A H 2.732 1.909 HIS 162.A N ILE 158.A O HIS 162.A H 2.915 2.095 ALA 163.A N ARG 159.A O ALA 163.A H 3.252 2.498 VAL 164.A N ALA 161.A O VAL 164.A H 2.995 2.353 HIS 165.A N ALA 161.A O HIS 165.A H 3.278 2.448 THR 168.A N VAL 148.A O THR 168.A H 2.794 1.991 LEU 170.A N GLY 195.A O LEU 170.A H 2.828 2.038 GLN 171.A N LEU 150.A O GLN 171.A H 2.904 2.092 GLN 171.A NE2 ASP 48.A OD2 GLN 171.A HE22 2.946 2.087 GLN 171.A NE2 TYR 120.A OH GLN 171.A HE21 3.358 2.698 ILE 172.A N VAL 197.A O ILE 172.A H 3.178 2.425 TYR 174.A N TYR 199.A O TYR 174.A H 3.163 2.382 SER 175.A N THR 178.A O SER 175.A H 2.917 2.088 THR 178.A N SER 175.A O THR 178.A H 3.115 2.269 ARG 179.A NE LEU 176.A O ARG 179.A HE 3.273 2.457 ARG 179.A NH2 LEU 176.A O ARG 179.A HH21 3.351 2.571 ARG 179.A NH2 SER 282.A O ARG 179.A HH22 3.021 2.194 GLU 182.A N ARG 179.A O GLU 182.A H 3.067 2.209 VAL 186.A N ILE 181.A O VAL 186.A H 2.883 2.078 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 3.114 2.279 CYS 189.A N ILE 185.A O CYS 189.A H 2.839 2.016 CYS 189.A SG ILE 185.A O CYS 189.A HG 3.469 2.420 ARG 190.A N VAL 186.A O ARG 190.A H 2.770 1.943 ARG 190.A NE ASP 249.A OD2 ARG 190.A HE 2.768 1.914 ARG 190.A NH2 GLN 246.A O ARG 190.A HH22 2.804 1.992 ARG 190.A NH2 ASP 249.A OD1 ARG 190.A HH21 2.926 2.134 ARG 190.A NH2 ASP 249.A OD2 ARG 190.A HH21 3.485 2.853 GLN 191.A N PRO 187.A O GLN 191.A H 2.851 2.244 GLN 191.A N LEU 188.A O GLN 191.A H 2.907 2.228 LEU 192.A N LEU 188.A O LEU 192.A H 2.913 2.108 ILE 194.A N CYS 189.A O ILE 194.A H 2.919 2.072 GLY 195.A N THR 168.A O GLY 195.A H 2.877 2.099 ILE 196.A N ASP 249.A O ILE 196.A H 2.978 2.117 VAL 197.A N LEU 170.A O VAL 197.A H 2.820 1.962 TYR 199.A N ILE 172.A O TYR 199.A H 3.015 2.252 TYR 199.A OH GLU 152.A OE2 TYR 199.A HH 2.715 1.918 ARG 204.A N ILE 202.A O ARG 204.A H 2.787 2.075 GLY 205.A N ILE 212.A O GLY 205.A H 3.109 2.357 PHE 207.A N LYS 210.A O PHE 207.A H 2.856 2.029 LYS 210.A N PHE 207.A O LYS 210.A H 2.817 1.967 ILE 212.A N GLY 205.A O ILE 212.A H 3.103 2.272 LYS 213.A N ILE 299.A O LYS 213.A H 3.187 2.388 GLU 214.A N GLY 203.A O GLU 214.A H 3.320 2.541 SER 215.A N GLU 297.A O SER 215.A H 3.246 2.400 SER 215.A OG GLU 297.A OE2 SER 215.A HG 3.453 2.636 ILE 220.A N ASN 217.A O ILE 220.A H 2.577 1.725 TYR 222.A N LYS 218.A O TYR 222.A H 2.909 2.139 ARG 223.A N GLN 219.A O ARG 223.A H 3.381 2.559 ILE 224.A N ILE 220.A O ILE 224.A H 3.249 2.428 GLU 225.A N TYR 221.A O GLU 225.A H 2.883 2.026 ALA 226.A N TYR 222.A O ALA 226.A H 2.853 2.017 LEU 227.A N ARG 223.A O LEU 227.A H 3.002 2.237 SER 228.A N ILE 224.A O SER 228.A H 2.774 1.963 SER 228.A OG GLU 225.A O SER 228.A HG 2.951 2.444 GLN 229.A N GLU 225.A O GLN 229.A H 2.753 1.909 LYS 230.A N ALA 226.A O LYS 230.A H 2.973 2.171 LYS 230.A NZ GLU 280.A OE1 LYS 230.A HZ3 3.467 2.656 HIS 231.A N LEU 227.A O HIS 231.A H 2.937 2.299 HIS 231.A N SER 228.A O HIS 231.A H 2.785 2.120 HIS 231.A ND1 LEU 227.A O HIS 231.A HD1 2.905 2.305 GLY 232.A N GLN 229.A O GLY 232.A H 3.092 2.247 CYS 233.A N SER 228.A O CYS 233.A H 3.075 2.217 THR 234.A N GLN 237.A OE1 THR 234.A H 2.826 1.990 GLN 237.A N THR 234.A OG1 GLN 237.A H 2.999 2.183 GLN 237.A NE2 ASN 264.A O GLN 237.A HE21 2.902 2.047 LEU 238.A N THR 234.A O LEU 238.A H 2.757 2.006 ALA 239.A N PRO 235.A O ALA 239.A H 3.037 2.237 LEU 240.A N VAL 236.A O LEU 240.A H 3.178 2.359 ALA 241.A N GLN 237.A O ALA 241.A H 2.793 1.947 TRP 242.A N LEU 238.A O TRP 242.A H 3.004 2.186 VAL 243.A N ALA 239.A O VAL 243.A H 3.291 2.472 LEU 244.A N LEU 240.A O LEU 244.A H 2.898 2.054 HIS 245.A N ALA 241.A O HIS 245.A H 2.932 2.232 HIS 245.A N TRP 242.A O HIS 245.A H 3.240 2.570 HIS 245.A ND1 ALA 241.A O HIS 245.A HD1 2.894 2.079 GLN 246.A N VAL 243.A O GLN 246.A H 2.870 2.017 GLN 246.A NE2 TRP 242.A O GLN 246.A HE21 3.135 2.348 ASP 249.A N ASP 249.A OD1 ASP 249.A H 2.566 1.902 VAL 250.A N GLY 247.A O VAL 250.A H 3.007 2.164 VAL 251.A N ILE 196.A O VAL 251.A H 2.920 2.094 LYS 258.A N THR 256.A OG1 LYS 258.A H 2.882 2.036 LEU 262.A N LYS 258.A O LEU 262.A H 3.032 2.199 HIS 263.A N ILE 259.A O HIS 263.A H 2.933 2.128 HIS 263.A NE2 GLU 38.A OE2 HIS 263.A HE2 3.249 2.391 ASN 264.A N LYS 260.A O ASN 264.A H 2.958 2.140 ASN 265.A N ASN 261.A O ASN 265.A H 2.831 2.058 VAL 266.A N LEU 262.A O VAL 266.A H 2.964 2.149 GLY 267.A N HIS 263.A O GLY 267.A H 2.875 2.055 ALA 268.A N ASN 265.A O ALA 268.A H 2.915 2.139 LEU 269.A N VAL 266.A O LEU 269.A H 3.082 2.251 LYS 270.A N GLY 267.A O LYS 270.A H 2.968 2.111 VAL 271.A N ALA 268.A O VAL 271.A H 3.141 2.330 THR 274.A N ASP 277.A OD2 THR 274.A H 3.071 2.231 GLU 276.A N GLU 276.A OE1 GLU 276.A H 2.922 2.172 ASP 277.A N THR 274.A OG1 ASP 277.A H 2.829 2.006 LEU 278.A N THR 274.A O LEU 278.A H 3.079 2.298 LYS 279.A N LYS 275.A O LYS 279.A H 3.161 2.342 LYS 279.A NZ ASP 283.A OD1 LYS 279.A HZ2 3.213 2.357 GLU 280.A N GLU 276.A O GLU 280.A H 3.204 2.377 ILE 281.A N ASP 277.A O ILE 281.A H 3.113 2.327 SER 282.A N LEU 278.A O SER 282.A H 2.784 1.935 ASP 283.A N LYS 279.A O ASP 283.A H 2.815 1.995 ALA 284.A N GLU 280.A O ALA 284.A H 3.168 2.549 ALA 284.A N ILE 281.A O ALA 284.A H 3.256 2.512 VAL 285.A N SER 282.A O VAL 285.A H 3.141 2.310 HIS 296.A ND1 GLU 214.A OE2 HIS 296.A HD1 3.101 2.261 HIS 296.A NE2 SER 294.A OG HIS 296.A HE2 2.608 1.838 ILE 299.A N LYS 213.A O ILE 299.A H 2.823 2.017 VAL 301.A N ALA 211.A O VAL 301.A H 3.177 2.404 ASN 303.A ND2 GLY 209.A O ASN 303.A HD22 3.447 2.714 ALA 307.A N TRP 304.A O ALA 307.A H 2.921 2.085