Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3uyr_L.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 3.A N SER 26.A OG VAL 3.A H 2.882 2.067 THR 5.A N ARG 24.A O THR 5.A H 2.815 1.978 GLN 6.A NE2 TYR 91.A O GLN 6.A HE21 2.914 2.059 GLN 6.A NE2 THR 106.A OG1 GLN 6.A HE22 3.279 2.680 THR 7.A N SER 22.A O THR 7.A H 2.884 2.047 LEU 11.A N LYS 107.A O LEU 11.A H 2.781 1.954 VAL 13.A N GLU 109.A O VAL 13.A H 2.827 2.018 GLY 16.A N VAL 83.A O GLY 16.A H 2.846 2.014 ASP 17.A N SER 14.A O ASP 17.A H 3.065 2.230 ALA 19.A N ILE 80.A O ALA 19.A H 2.802 1.984 ILE 21.A N LEU 78.A O ILE 21.A H 2.800 1.972 SER 22.A N THR 7.A O SER 22.A H 2.799 1.953 CYS 23.A N PHE 76.A O CYS 23.A H 2.894 2.034 ARG 24.A N THR 5.A O ARG 24.A H 2.902 2.048 SER 25.A N THR 74.A O SER 25.A H 2.932 2.139 SER 26.A N VAL 3.A O SER 26.A H 3.009 2.375 LEU 29.A N GLY 73.A O LEU 29.A H 2.942 2.103 VAL 30.A N SER 28.A OG VAL 30.A H 3.144 2.289 HIS 31.A N ASN 35.A O HIS 31.A H 2.791 1.957 ASN 33.A ND2 TYR 37.A OH ASN 33.A HD21 3.083 2.257 GLY 34.A N HIS 31.A O GLY 34.A H 2.876 2.040 ASN 35.A N ASN 33.A OD1 ASN 35.A H 2.918 2.061 TYR 37.A N THR 97.A OG1 TYR 37.A H 3.230 2.410 LEU 38.A N THR 36.A O LEU 38.A H 2.974 2.276 HIS 39.A N SER 94.A O HIS 39.A H 2.838 2.014 HIS 39.A NE2 SER 96.A OG HIS 39.A HE2 3.061 2.256 TRP 40.A N ILE 53.A O TRP 40.A H 2.738 1.914 TYR 41.A N PHE 92.A O TYR 41.A H 2.847 1.994 LEU 42.A N ASN 50.A O LEU 42.A H 2.874 2.066 GLN 43.A N VAL 90.A O GLN 43.A H 2.801 1.950 GLN 43.A NE2 GLN 47.A O GLN 43.A HE22 3.010 2.224 GLN 47.A N LYS 44.A O GLN 47.A H 3.026 2.300 ASN 50.A N LEU 42.A O ASN 50.A H 2.860 2.096 LEU 52.A N TRP 40.A O LEU 52.A H 2.838 2.009 ILE 53.A N TRP 40.A O ILE 53.A H 3.052 2.182 TYR 54.A N ASN 58.A O TYR 54.A H 2.843 2.055 VAL 56.A N LEU 38.A O VAL 56.A H 2.767 1.914 SER 57.A N LYS 55.A O SER 57.A H 2.829 2.113 ASN 58.A N TYR 54.A O ASN 58.A H 2.999 2.190 ASN 58.A ND2 TYR 54.A O ASN 58.A HD22 3.080 2.273 ASN 58.A ND2 LYS 55.A O ASN 58.A HD22 3.133 2.647 ARG 59.A NH1 VAL 63.A O ARG 59.A HH11 3.286 2.492 PHE 60.A N LEU 52.A O PHE 60.A H 2.967 2.109 VAL 63.A N PHE 60.A O VAL 63.A H 2.967 2.122 ARG 66.A NH1 SER 81.A O ARG 66.A HH11 3.309 2.460 ARG 66.A NH1 ASP 87.A OD2 ARG 66.A HH12 2.920 2.119 ARG 66.A NH2 ASP 87.A OD1 ARG 66.A HH22 3.182 2.324 PHE 67.A N PRO 64.A O PHE 67.A H 3.148 2.292 SER 68.A N LYS 79.A O SER 68.A H 2.854 2.015 SER 70.A N THR 77.A O SER 70.A H 2.851 2.048 SER 72.A N ASP 75.A O SER 72.A H 2.899 2.113 ASP 75.A N SER 72.A O ASP 75.A H 2.986 2.106 PHE 76.A N CYS 23.A O PHE 76.A H 2.876 2.062 THR 77.A N SER 70.A O THR 77.A H 2.910 2.061 LEU 78.A N ILE 21.A O LEU 78.A H 2.848 2.016 LYS 79.A N SER 68.A O LYS 79.A H 2.809 1.955 LYS 79.A NZ SER 20.A OG LYS 79.A HZ2 3.088 2.347 ILE 80.A N ALA 19.A O ILE 80.A H 2.830 1.997 SER 81.A N ARG 66.A O SER 81.A H 2.980 2.139 VAL 83.A N ASP 17.A O VAL 83.A H 2.948 2.102 GLU 84.A N ASP 87.A OD2 GLU 84.A H 2.886 2.035 ASP 87.A N GLU 84.A O ASP 87.A H 2.870 2.027 LEU 88.A N ALA 85.A O LEU 88.A H 3.216 2.361 VAL 90.A N GLN 43.A O VAL 90.A H 2.883 2.031 TYR 91.A N THR 106.A O TYR 91.A H 2.842 1.992 PHE 92.A N TYR 41.A O PHE 92.A H 2.858 2.025 CYS 93.A N GLN 6.A OE1 CYS 93.A H 2.996 2.190 SER 94.A N HIS 39.A O SER 94.A H 2.826 2.056 SER 94.A OG THR 101.A O SER 94.A HG 3.464 2.895 GLN 95.A N THR 101.A O GLN 95.A H 2.940 2.124 GLN 95.A NE2 VAL 99.A O GLN 95.A HE22 2.855 2.163 GLN 95.A NE2 THR 101.A OG1 GLN 95.A HE21 3.033 2.175 SER 96.A N TYR 37.A O SER 96.A H 2.944 2.145 HIS 98.A N GLN 95.A OE1 HIS 98.A H 2.948 2.090 HIS 98.A NE2 SER 28.A O HIS 98.A HE2 2.879 2.049 THR 101.A N GLN 95.A O THR 101.A H 3.154 2.371 GLY 103.A N CYS 93.A O GLY 103.A H 2.781 1.929 GLY 105.A N GLN 6.A OE1 GLY 105.A H 3.026 2.310 THR 106.A N TYR 91.A O THR 106.A H 2.835 2.032 LYS 107.A N LEU 9.A O LYS 107.A H 3.009 2.165 LEU 108.A N GLY 89.A O LEU 108.A H 2.940 2.132 GLU 109.A N LEU 11.A O GLU 109.A H 2.822 1.972 ILE 110.A N GLN 170.A OE1 ILE 110.A H 2.982 2.143 LYS 111.A N VAL 13.A O LYS 111.A H 2.907 2.060 ARG 112.A NE ALA 113.A O ARG 112.A HE 2.766 1.907 ARG 112.A NH1 ASP 174.A O ARG 112.A HH11 2.837 2.016 ARG 112.A NH2 ALA 113.A O ARG 112.A HH21 3.520 2.893 ALA 115.A N TYR 144.A O ALA 115.A H 2.816 2.034 THR 118.A N ASN 141.A O THR 118.A H 2.861 2.011 SER 120.A N PHE 139.A O SER 120.A H 2.856 2.031 PHE 122.A N VAL 137.A O PHE 122.A H 2.781 2.001 GLU 127.A N GLU 127.A OE1 GLU 127.A H 2.847 2.051 GLN 128.A NE2 SER 135.A OG GLN 128.A HE22 2.973 2.119 LEU 129.A N SER 125.A O LEU 129.A H 3.027 2.197 THR 130.A N SER 126.A O THR 130.A H 2.821 2.003 SER 131.A N GLN 128.A O SER 131.A H 2.960 2.137 GLY 132.A N LEU 129.A O GLY 132.A H 3.036 2.178 GLY 133.A N GLN 128.A O GLY 133.A H 3.381 2.574 ALA 134.A N LEU 185.A O ALA 134.A H 2.872 2.068 SER 135.A N GLN 128.A OE1 SER 135.A H 2.897 2.071 VAL 136.A N LEU 183.A O VAL 136.A H 2.804 1.973 VAL 137.A N PHE 122.A O VAL 137.A H 2.949 2.098 CYS 138.A N SER 181.A O CYS 138.A H 2.829 1.982 CYS 138.A SG SER 120.A O no hydrogen 3.844 N/A PHE 139.A N SER 120.A O PHE 139.A H 2.796 2.027 LEU 140.A N MET 179.A O LEU 140.A H 2.849 1.988 ASN 141.A N THR 118.A O ASN 141.A H 2.832 1.995 ASN 142.A N SER 178.A OG ASN 142.A H 2.986 2.149 PHE 143.A N TYR 177.A O PHE 143.A H 2.848 2.039 TYR 144.A N ALA 115.A O TYR 144.A H 2.910 2.102 ASN 149.A N THR 201.A O ASN 149.A H 2.855 2.004 LYS 151.A N GLU 199.A O LYS 151.A H 2.821 2.001 TRP 152.A NE1 SER 181.A OG TRP 152.A HE1 3.030 2.211 LYS 153.A N THR 197.A O LYS 153.A H 2.838 2.008 LYS 153.A NZ GLU 199.A OE2 LYS 153.A HZ1 3.046 2.293 ILE 154.A N SER 157.A O ILE 154.A H 2.867 2.032 ASP 155.A N SER 195.A O ASP 155.A H 2.871 2.054 SER 157.A N ILE 154.A O SER 157.A H 2.893 2.047 ARG 159.A N TRP 152.A O ARG 159.A H 3.191 2.406 GLN 160.A N GLN 160.A OE1 GLN 160.A H 2.653 1.860 ASN 161.A N GLN 160.A OE1 ASN 161.A H 3.265 2.509 LEU 164.A N THR 182.A O LEU 164.A H 2.834 1.999 SER 166.A N SER 180.A O SER 166.A H 2.844 2.010 TRP 167.A NE1 LYS 146.A O TRP 167.A HE1 3.042 2.306 THR 168.A N SER 178.A O THR 168.A H 2.869 2.038 THR 168.A OG1 ASP 169.A O THR 168.A HG1 2.955 2.296 GLN 170.A NE2 ILE 110.A O GLN 170.A HE21 2.739 1.920 GLN 170.A NE2 SER 175.A O GLN 170.A HE22 2.946 2.096 ASP 171.A N THR 176.A O ASP 171.A H 2.944 2.091 LYS 173.A N ASP 171.A OD1 LYS 173.A H 3.007 2.155 SER 175.A N ASP 171.A O SER 175.A H 2.691 2.013 THR 176.A N ASP 174.A OD1 THR 176.A H 3.046 2.213 THR 176.A OG1 ASP 174.A OD1 THR 176.A HG1 2.783 1.973 TYR 177.A N PHE 143.A O TYR 177.A H 2.870 2.014 SER 178.A N THR 168.A OG1 SER 178.A H 3.021 2.196 MET 179.A N LEU 140.A O MET 179.A H 2.896 2.093 SER 180.A N SER 166.A O SER 180.A H 2.827 2.008 SER 181.A N CYS 138.A O SER 181.A H 2.839 1.991 THR 182.A N LEU 164.A O THR 182.A H 2.822 1.993 LEU 183.A N VAL 136.A O LEU 183.A H 2.833 1.994 THR 184.A N GLY 162.A O THR 184.A H 3.057 2.215 THR 184.A OG1 SER 135.A OG THR 184.A HG1 3.035 2.235 LEU 185.A N ALA 134.A O LEU 185.A H 2.792 1.942 LYS 187.A N GLY 132.A O LYS 187.A H 3.128 2.278 LYS 187.A NZ LEU 129.A O LYS 187.A HZ1 3.298 2.710 GLU 189.A N THR 186.A OG1 GLU 189.A H 3.198 2.351 TYR 190.A N THR 186.A O TYR 190.A H 2.956 2.124 GLU 191.A N LYS 187.A O GLU 191.A H 2.806 1.997 ARG 192.A N GLU 189.A O ARG 192.A H 3.171 2.327 ARG 192.A NE ASP 188.A OD1 ARG 192.A HE 3.219 2.486 ARG 192.A NH2 ASP 188.A OD1 ARG 192.A HH21 3.145 2.400 HIS 193.A N TYR 190.A O HIS 193.A H 3.428 2.573 HIS 193.A ND1 ASP 155.A OD2 HIS 193.A HD1 2.932 2.155 ASN 194.A N ASP 155.A OD1 ASN 194.A H 3.012 2.164 SER 195.A N ASP 155.A OD1 SER 195.A H 3.000 2.142 TYR 196.A N PHE 213.A O TYR 196.A H 2.865 2.004 TYR 196.A OH TYR 190.A O TYR 196.A HH 2.727 2.107 THR 197.A N LYS 153.A O THR 197.A H 2.908 2.077 CYS 198.A N LYS 211.A O CYS 198.A H 2.833 2.018 GLU 199.A N LYS 151.A O GLU 199.A H 2.792 1.983 ALA 200.A N ILE 209.A O ALA 200.A H 2.744 1.920 THR 201.A N ASN 149.A O THR 201.A H 2.783 1.961 HIS 202.A ND1 THR 204.A OG1 HIS 202.A HD1 2.779 1.926 HIS 202.A NE2 PRO 145.A O HIS 202.A HE2 3.025 2.189 ILE 209.A N ALA 200.A O ILE 209.A H 2.920 2.179 LYS 211.A N CYS 198.A O LYS 211.A H 2.904 2.045 LYS 211.A NZ VAL 119.A O LYS 211.A HZ2 3.264 2.384 SER 212.A OG TYR 196.A O SER 212.A HG 3.198 2.510 PHE 213.A N TYR 196.A O PHE 213.A H 2.868 2.049 ASN 214.A ND2 GLU 217.A OE2 ASN 214.A HD22 3.470 2.611 ARG 215.A N ASN 194.A O ARG 215.A H 2.747 1.971 ARG 215.A NE HIS 193.A O ARG 215.A HE 2.872 2.044 ARG 215.A NH2 HIS 193.A O ARG 215.A HH21 3.562 2.936 ASN 216.A N ASN 194.A OD1 ASN 216.A H 3.154 2.385 GLU 217.A N ASN 214.A O GLU 217.A H 3.124 2.291 CYS 218.A N ARG 215.A O CYS 218.A H 3.120 2.316