Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3v0s_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 3.A NE GLU 12.A OE2 ARG 3.A HE 2.692 1.835 ARG 3.A NH1 THR 42.A OG1 ARG 3.A HH12 2.815 1.958 ARG 3.A NH2 GLU 12.A OE2 ARG 3.A HH21 3.519 2.905 VAL 4.A N VAL 13.A O VAL 4.A H 2.834 2.014 LEU 6.A N LEU 11.A O LEU 6.A H 2.903 2.138 VAL 13.A N VAL 4.A O VAL 13.A H 2.913 2.089 LYS 15.A N PRO 2.A O LYS 15.A H 2.942 2.169 LYS 15.A NZ LEU 231.A O LYS 15.A HZ1 3.052 2.204 LYS 15.A NZ VAL 237.A O LYS 15.A HZ2 2.762 1.885 GLY 17.A N PRO 239.A O GLY 17.A H 2.922 2.085 PHE 18.A N PHE 43.A O PHE 18.A H 2.868 2.076 GLY 19.A N PRO 241.A O GLY 19.A H 3.091 2.248 CYS 20.A N ASP 45.A O CYS 20.A H 2.875 2.025 LEU 23.A N CYS 20.A O LEU 23.A H 3.031 2.272 SER 24.A N MET 21.A O SER 24.A H 3.127 2.272 GLN 28.A N PRO 25.A O GLN 28.A H 2.783 2.074 GLY 29.A N PRO 25.A O GLY 29.A H 3.063 2.271 ILE 30.A N GLU 26.A O ILE 30.A H 2.887 2.029 ALA 31.A N GLU 27.A O ALA 31.A H 2.994 2.227 VAL 32.A N GLN 28.A O VAL 32.A H 3.088 2.295 ILE 33.A N GLY 29.A O ILE 33.A H 3.151 2.319 LYS 34.A N ILE 30.A O LYS 34.A H 2.921 2.092 LYS 34.A NZ GLN 66.A OE1 LYS 34.A HZ2 2.175 1.413 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.946 2.126 ALA 36.A N VAL 32.A O ALA 36.A H 2.922 2.118 PHE 37.A N ILE 33.A O PHE 37.A H 3.061 2.241 ASN 38.A N LYS 34.A O ASN 38.A H 2.960 2.165 CYS 39.A N GLU 35.A O CYS 39.A H 2.920 2.207 CYS 39.A N ALA 36.A O CYS 39.A H 3.071 2.447 CYS 39.A SG GLU 35.A O CYS 39.A HG 3.345 2.461 CYS 39.A SG GLU 35.A OE2 CYS 39.A HG 3.598 2.705 GLY 40.A N PHE 37.A O GLY 40.A H 2.858 2.027 ILE 41.A N ALA 36.A O ILE 41.A H 2.990 2.199 THR 42.A N SER 14.A OG THR 42.A H 2.946 2.109 THR 42.A OG1 GLN 72.A OE1 THR 42.A HG1 2.618 1.954 PHE 44.A N GLN 72.A O PHE 44.A H 2.985 2.155 ASP 45.A N PHE 18.A O ASP 45.A H 2.949 2.161 THR 46.A N GLY 74.A O THR 46.A H 2.909 2.108 THR 46.A OG1 ASN 56.A OD1 THR 46.A HG1 2.619 1.922 SER 47.A OG ASP 48.A OD1 SER 47.A HG 3.474 2.836 ASP 48.A N LYS 76.A O ASP 48.A H 3.324 2.489 TYR 50.A N SER 47.A O TYR 50.A H 3.274 2.427 GLU 52.A N SER 55.A OG GLU 52.A H 2.878 2.135 SER 55.A N GLU 52.A O SER 55.A H 3.012 2.355 ASN 56.A ND2 CYS 20.A O ASN 56.A HD22 2.872 2.078 ASN 56.A ND2 SER 24.A OG ASN 56.A HD21 2.920 2.071 GLU 58.A N GLY 54.A O GLU 58.A H 3.032 2.217 LEU 59.A N SER 55.A O LEU 59.A H 2.787 1.986 LEU 60.A N ASN 56.A O LEU 60.A H 2.938 2.137 GLY 61.A N GLU 57.A O GLY 61.A H 2.903 2.079 LYS 62.A N GLU 58.A O LYS 62.A H 2.979 2.187 ALA 63.A N LEU 59.A O ALA 63.A H 3.002 2.194 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 2.845 2.082 LYS 65.A N LYS 62.A O LYS 65.A H 3.129 2.393 LYS 65.A NZ ASP 107.A OD2 LYS 65.A HZ1 3.036 2.408 GLN 66.A N ALA 63.A O GLN 66.A H 2.997 2.165 LEU 67.A N LEU 64.A O LEU 67.A H 2.930 2.088 ARG 69.A NH1 ARG 69.A O ARG 69.A HH11 2.874 2.104 ARG 69.A NH1 ILE 71.A O ARG 69.A HH12 2.825 2.211 ARG 69.A NH1 ASP 112.A OD1 ARG 69.A HH12 3.178 2.495 ARG 69.A NH2 TYR 110.A O ARG 69.A HH21 2.837 2.006 ARG 69.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 69.A HH22 2.740 1.911 ILE 71.A N ARG 69.A O ILE 71.A H 3.037 2.192 GLN 72.A N THR 42.A O GLN 72.A H 2.715 1.929 VAL 73.A N ASP 112.A OD1 VAL 73.A H 2.924 2.070 GLY 74.A N PHE 44.A O GLY 74.A H 2.833 1.977 THR 75.A N LEU 113.A O THR 75.A H 2.981 2.245 THR 75.A OG1 GLU 57.A OE2 THR 75.A HG1 2.608 1.835 LYS 76.A NZ ASP 45.A OD1 LYS 76.A HZ1 2.824 2.062 LYS 76.A NZ ASP 45.A OD2 LYS 76.A HZ1 3.209 2.577 LYS 76.A NZ THR 46.A O LYS 76.A HZ2 2.960 2.080 LYS 76.A NZ TYR 50.A OH LYS 76.A HZ3 3.335 2.526 PHE 77.A N TYR 115.A O PHE 77.A H 3.079 2.278 HIS 80.A N LYS 88.A O HIS 80.A H 2.828 1.974 GLU 81.A N LYS 88.A O GLU 81.A H 3.413 2.605 GLY 83.A N GLY 86.A O GLY 83.A H 3.140 2.343 GLY 86.A N GLY 83.A O GLY 86.A H 2.847 2.110 LYS 88.A N GLU 81.A O LYS 88.A H 2.827 1.970 GLY 90.A N ASP 120.A OD2 GLY 90.A H 2.754 1.994 TYR 94.A N THR 91.A O TYR 94.A H 2.942 2.307 VAL 95.A N THR 91.A O VAL 95.A H 3.014 2.188 ARG 96.A N PRO 92.A O ARG 96.A H 3.163 2.324 ARG 96.A NE GLU 131.A OE2 ARG 96.A HE 2.641 1.904 ARG 96.A NH1 GLU 136.A OE1 ARG 96.A HH12 2.979 2.127 ARG 96.A NH2 GLU 131.A OE2 ARG 96.A HH21 2.766 2.088 ARG 96.A NH2 GLU 136.A OE1 ARG 96.A HH22 3.535 2.846 ARG 96.A NH2 GLU 136.A OE2 ARG 96.A HH22 2.779 2.009 SER 97.A N ASP 93.A O SER 97.A H 3.011 2.191 CYS 98.A N TYR 94.A O CYS 98.A H 2.885 2.041 CYS 99.A N VAL 95.A O CYS 99.A H 3.036 2.241 GLU 100.A N ARG 96.A O GLU 100.A H 3.021 2.190 ALA 101.A N SER 97.A O ALA 101.A H 3.046 2.222 SER 102.A N CYS 98.A O SER 102.A H 2.958 2.156 LEU 103.A N CYS 99.A O LEU 103.A H 2.876 2.036 LYS 104.A N GLU 100.A O LYS 104.A H 3.016 2.228 ARG 105.A N ALA 101.A O ARG 105.A H 2.936 2.109 ARG 105.A NE GLU 57.A OE1 ARG 105.A HE 2.758 1.980 ARG 105.A NH2 GLU 57.A OE1 ARG 105.A HH21 2.785 2.038 LEU 106.A N SER 102.A O LEU 106.A H 2.832 1.975 ASP 107.A N LYS 104.A O ASP 107.A H 3.083 2.345 VAL 108.A N LEU 103.A O VAL 108.A H 3.094 2.294 ILE 111.A N LYS 138.A O ILE 111.A H 2.992 2.168 ASP 112.A N VAL 73.A O ASP 112.A H 3.170 2.587 LEU 113.A N VAL 73.A O LEU 113.A H 3.021 2.192 PHE 114.A N TYR 140.A O PHE 114.A H 2.998 2.174 TYR 115.A N THR 75.A O TYR 115.A H 2.878 2.066 ILE 116.A N GLY 142.A O ILE 116.A H 3.016 2.254 HIS 117.A N PHE 77.A O HIS 117.A H 2.735 1.876 HIS 117.A ND1 SER 47.A OG HIS 117.A HD1 2.894 2.262 ARG 118.A NE HIS 117.A O ARG 118.A HE 3.218 2.745 THR 122.A N ASP 120.A OD1 THR 122.A H 3.112 2.269 THR 122.A OG1 ASP 120.A OD1 THR 122.A HG1 2.868 2.049 VAL 123.A N ASP 120.A O VAL 123.A H 3.226 2.368 GLU 126.A N GLU 126.A OE1 GLU 126.A H 2.841 2.043 ILE 127.A N PRO 124.A O ILE 127.A H 3.082 2.294 THR 128.A OG1 GLY 90.A O THR 128.A HG1 2.641 1.827 MET 129.A N ILE 125.A O MET 129.A H 2.935 2.076 GLY 130.A N GLU 126.A O GLY 130.A H 2.908 2.217 GLU 131.A N ILE 127.A O GLU 131.A H 3.375 2.588 LEU 132.A N THR 128.A O LEU 132.A H 3.138 2.327 LEU 133.A N GLU 131.A O LEU 133.A H 2.942 2.134 VAL 134.A N LEU 132.A O VAL 134.A H 3.012 2.208 GLY 137.A N VAL 134.A O GLY 137.A H 3.178 2.357 LYS 138.A N LEU 133.A O LYS 138.A H 2.963 2.296 LYS 138.A NZ GLU 100.A OE1 LYS 138.A HZ2 3.567 2.725 LYS 138.A NZ GLU 100.A OE2 LYS 138.A HZ2 2.634 1.887 ILE 139.A N LEU 133.A O ILE 139.A H 3.398 2.574 TYR 140.A N ASP 112.A O TYR 140.A H 2.763 2.074 GLY 142.A N PHE 114.A O GLY 142.A H 2.883 2.044 LEU 143.A N ALA 162.A O LEU 143.A H 2.967 2.163 GLU 145.A N GLN 164.A O GLU 145.A H 3.201 2.461 THR 150.A N SER 147.A OG THR 150.A H 2.942 2.104 THR 150.A OG1 SER 147.A OG THR 150.A HG1 3.121 2.453 ILE 151.A N SER 147.A O ILE 151.A H 2.938 2.100 ARG 152.A N PRO 148.A O ARG 152.A H 2.992 2.153 ARG 153.A N ASP 149.A O ARG 153.A H 3.022 2.185 ARG 153.A NE GLU 126.A OE2 ARG 153.A HE 2.911 2.062 ARG 153.A NH1 ASP 149.A OD2 ARG 153.A HH11 3.316 2.512 ARG 153.A NH2 GLU 126.A OE1 ARG 153.A HH21 2.845 2.015 ARG 153.A NH2 GLU 126.A OE2 ARG 153.A HH21 3.538 2.881 ALA 154.A N THR 150.A O ALA 154.A H 2.882 2.040 HIS 155.A N ILE 151.A O HIS 155.A H 2.971 2.130 ALA 156.A N ARG 152.A O ALA 156.A H 3.197 2.439 VAL 157.A N ALA 154.A O VAL 157.A H 2.914 2.111 HIS 158.A N ALA 154.A O HIS 158.A H 3.119 2.291 THR 161.A N VAL 141.A O THR 161.A H 2.840 2.028 LEU 163.A N GLY 188.A O LEU 163.A H 2.839 2.015 GLN 164.A N LEU 143.A O GLN 164.A H 2.870 2.042 GLN 164.A NE2 ASP 45.A OD2 GLN 164.A HE22 2.958 2.122 GLN 164.A NE2 TYR 115.A OH GLN 164.A HE21 3.275 2.583 ILE 165.A N VAL 190.A O ILE 165.A H 3.255 2.507 SER 168.A N THR 171.A O SER 168.A H 3.123 2.314 TRP 170.A N SER 168.A OG TRP 170.A H 2.950 2.208 THR 171.A N SER 168.A O THR 171.A H 3.057 2.226 THR 171.A OG1 GLU 166.A OE2 THR 171.A HG1 3.173 2.380 ARG 172.A NE GLU 175.A OE2 ARG 172.A HE 3.001 2.149 ARG 172.A NH2 GLU 175.A OE1 ARG 172.A HH21 3.165 2.384 GLU 175.A N ARG 172.A O GLU 175.A H 3.048 2.195 VAL 179.A N ILE 174.A O VAL 179.A H 2.868 2.037 LEU 181.A N GLU 177.A O LEU 181.A H 3.036 2.213 CYS 182.A N ILE 178.A O CYS 182.A H 2.868 2.040 ARG 183.A N VAL 179.A O ARG 183.A H 2.994 2.204 ARG 183.A NE ASP 236.A OD2 ARG 183.A HE 2.815 1.959 ARG 183.A NH2 GLN 233.A O ARG 183.A HH22 2.807 1.971 ARG 183.A NH2 ASP 236.A OD1 ARG 183.A HH21 2.796 1.964 GLN 184.A N PRO 180.A O GLN 184.A H 2.952 2.146 LEU 185.A N LEU 181.A O LEU 185.A H 3.061 2.285 ILE 187.A N CYS 182.A O ILE 187.A H 2.880 2.073 GLY 188.A N THR 161.A O GLY 188.A H 2.938 2.131 ILE 189.A N ASP 236.A O ILE 189.A H 2.902 2.046 VAL 190.A N LEU 163.A O VAL 190.A H 2.897 2.058 TYR 192.A N ILE 165.A O TYR 192.A H 3.021 2.219 ARG 197.A NE GLU 166.A OE2 ARG 197.A HE 2.524 1.773 ARG 197.A NH2 GLU 166.A OE1 ARG 197.A HH21 3.271 2.680 LEU 199.A N ILE 195.A O LEU 199.A H 2.904 2.115 PHE 200.A N GLY 196.A O PHE 200.A H 2.985 2.141 TRP 201.A N ARG 197.A O TRP 201.A H 2.980 2.128 GLY 202.A N GLY 198.A O GLY 202.A H 2.765 1.933 LYS 203.A N LEU 199.A O LYS 203.A H 2.954 2.171 ALA 204.A N PHE 200.A O ALA 204.A H 2.945 2.141 ILE 205.A N TRP 201.A O ILE 205.A H 2.865 2.022 LYS 206.A N GLY 202.A O LYS 206.A H 2.900 2.119 GLU 207.A N LYS 203.A O GLU 207.A H 3.068 2.289 GLU 212.A N TYR 208.A O GLU 212.A H 3.011 2.188 ALA 213.A N TYR 209.A O ALA 213.A H 2.737 1.916 LEU 214.A N ARG 210.A O LEU 214.A H 3.035 2.240 SER 215.A N ILE 211.A O SER 215.A H 2.878 2.048 SER 215.A OG GLU 212.A O SER 215.A HG 2.699 2.001 GLN 216.A N GLU 212.A O GLN 216.A H 2.975 2.136 LYS 217.A N ALA 213.A O LYS 217.A H 2.967 2.130 HIS 218.A N LEU 214.A O HIS 218.A H 2.968 2.207 GLY 219.A N GLN 216.A O GLY 219.A H 2.943 2.118 CYS 220.A N SER 215.A O CYS 220.A H 3.002 2.147 THR 221.A N GLN 224.A OE1 THR 221.A H 3.004 2.178 GLN 224.A N THR 221.A OG1 GLN 224.A H 3.326 2.496 GLN 224.A NE2 ASN 251.A O GLN 224.A HE21 2.883 2.047 LEU 225.A N THR 221.A O LEU 225.A H 2.899 2.097 ALA 226.A N PRO 222.A O ALA 226.A H 3.071 2.256 LEU 227.A N VAL 223.A O LEU 227.A H 2.989 2.170 ALA 228.A N GLN 224.A O ALA 228.A H 2.783 1.947 TRP 229.A N LEU 225.A O TRP 229.A H 2.870 2.115 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.258 2.445 LEU 231.A N LEU 227.A O LEU 231.A H 2.852 2.000 HIS 232.A N ALA 228.A O HIS 232.A H 2.892 2.121 HIS 232.A ND1 ALA 228.A O HIS 232.A HD1 2.703 1.893 GLN 233.A N VAL 230.A O GLN 233.A H 3.007 2.150 GLN 233.A NE2 TRP 229.A O GLN 233.A HE21 3.152 2.329 VAL 237.A N GLY 234.A O VAL 237.A H 3.196 2.387 VAL 238.A N ILE 189.A O VAL 238.A H 2.897 2.067 ILE 240.A N PRO 191.A O ILE 240.A H 3.248 2.475 LYS 245.A N THR 243.A OG1 LYS 245.A H 2.984 2.135 LYS 245.A NZ THR 244.A OG1 LYS 245.A HZ1 3.272 2.458 LEU 249.A N LYS 245.A O LEU 249.A H 2.970 2.146 HIS 250.A N ILE 246.A O HIS 250.A H 2.910 2.124 HIS 250.A NE2 GLU 35.A OE2 HIS 250.A HE2 2.808 1.973 ASN 251.A N LYS 247.A O ASN 251.A H 3.089 2.310 ASN 252.A N ASN 248.A O ASN 252.A H 2.851 2.074 VAL 253.A N LEU 249.A O VAL 253.A H 3.034 2.197 GLY 254.A N HIS 250.A O GLY 254.A H 2.975 2.169 ALA 255.A N ASN 252.A O ALA 255.A H 2.977 2.186 LEU 256.A N VAL 253.A O LEU 256.A H 3.068 2.226 LYS 257.A N GLY 254.A O LYS 257.A H 3.069 2.249 VAL 258.A N ALA 255.A O VAL 258.A H 3.249 2.461 THR 260.A N ASP 263.A OD2 THR 260.A H 2.999 2.154 ASP 263.A N THR 260.A OG1 ASP 263.A H 2.872 2.018 LEU 264.A N THR 260.A O LEU 264.A H 2.794 2.039 LYS 265.A N LYS 261.A O LYS 265.A H 3.033 2.218 LYS 265.A NZ ASP 269.A OD1 LYS 265.A HZ2 3.503 2.645 LYS 265.A NZ ASP 269.A OD2 LYS 265.A HZ2 2.957 2.328 GLU 266.A N GLU 262.A O GLU 266.A H 2.999 2.141 ILE 267.A N ASP 263.A O ILE 267.A H 3.013 2.201 SER 268.A N LEU 264.A O SER 268.A H 2.891 2.061 ASP 269.A N LYS 265.A O ASP 269.A H 2.630 1.774 ALA 270.A N GLU 266.A O ALA 270.A H 3.150 2.528 ALA 270.A N ILE 267.A O ALA 270.A H 3.155 2.448 VAL 271.A N SER 268.A O VAL 271.A H 2.862 2.029 ALA 276.A N TRP 273.A O ALA 276.A H 2.787 1.948 ASN 277.A N PHE 275.A O ASN 277.A H 2.690 1.981