Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3v4y_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 5.A N ASN 2.A OD1 SER 5.A H 3.088 2.254 ILE 6.A N ASN 2.A O ILE 6.A H 3.047 2.233 ILE 7.A N LEU 3.A O ILE 7.A H 2.933 2.099 GLY 8.A N ASP 4.A O GLY 8.A H 2.887 2.066 ARG 9.A N SER 5.A O ARG 9.A H 2.973 2.144 ARG 9.A NE SER 5.A OG ARG 9.A HE 3.269 2.569 ARG 9.A NH1 GLU 28.A OE1 ARG 9.A HH12 2.839 2.020 ARG 9.A NH1 GLU 28.A OE2 ARG 9.A HH12 3.330 2.709 ARG 9.A NH2 SER 5.A OG ARG 9.A HH21 2.937 2.156 ARG 9.A NH2 GLU 28.A OE2 ARG 9.A HH22 2.732 1.929 LEU 10.A N ILE 6.A O LEU 10.A H 2.946 2.128 LEU 11.A N ILE 7.A O LEU 11.A H 2.890 2.107 GLN 14.A N LEU 11.A O GLN 14.A H 2.981 2.137 SER 16.A N VAL 13.A O SER 16.A H 3.101 2.388 VAL 22.A N GLU 96.A OE2 VAL 22.A H 2.853 2.040 GLN 23.A NE2 ARG 137.A O GLN 23.A HE22 2.874 2.123 THR 25.A N GLU 28.A OE1 THR 25.A H 2.975 2.141 GLU 28.A N THR 25.A OG1 GLU 28.A H 3.040 2.219 ILE 29.A N THR 25.A O ILE 29.A H 3.171 2.372 ARG 30.A N GLU 26.A O ARG 30.A H 2.904 2.057 ARG 30.A NH1 THR 145.A OG1 ARG 30.A HH11 2.891 2.116 ARG 30.A NH2 GLU 26.A OE2 ARG 30.A HH22 3.093 2.270 GLY 31.A N ASN 27.A O GLY 31.A H 2.896 2.066 LEU 32.A N GLU 28.A O LEU 32.A H 3.007 2.183 CYS 33.A N ILE 29.A O CYS 33.A H 2.969 2.138 LEU 34.A N ARG 30.A O LEU 34.A H 2.924 2.110 LYS 35.A N GLY 31.A O LYS 35.A H 2.942 2.086 LYS 35.A NZ GLU 38.A OE1.A LYS 35.A HZ2 3.076 2.376 SER 36.A N LEU 32.A O SER 36.A H 2.981 2.128 ARG 37.A N CYS 33.A O ARG 37.A H 2.990 2.187 GLU 38.A N LEU 34.A O GLU 38.A H.A 3.191 2.388 ILE 39.A N LYS 35.A O ILE 39.A H 3.145 2.318 PHE 40.A N SER 36.A O PHE 40.A H 2.783 1.941 LEU 41.A N ARG 37.A O LEU 41.A H 3.101 2.283 SER 42.A N GLU 38.A O SER 42.A H 3.100 2.421 SER 42.A N ILE 39.A O SER 42.A H 3.037 2.377 SER 42.A OG ILE 39.A O SER 42.A HG 2.861 2.267 GLN 43.A N PHE 40.A O GLN 43.A H 3.232 2.422 GLN 43.A NE2 PRO 109.A O GLN 43.A HE22 2.928 2.081 LEU 47.A N ALA 156.A O LEU 47.A H 2.955 2.141 LEU 49.A N ILE 158.A O LEU 49.A H 2.874 2.034 ALA 51.A N ASP 160.A OD2 ALA 51.A H 2.860 2.003 LEU 53.A N VAL 279.A O LEU 53.A H 3.014 2.233 LYS 54.A N ASN 80.A O LYS 54.A H 2.878 2.047 LYS 54.A NZ GLY 73.A O LYS 54.A HZ1 2.672 1.836 ILE 55.A N MET 277.A O ILE 55.A H 2.774 1.946 CYS 56.A N LEU 82.A O CYS 56.A H 2.966 2.166 GLY 57.A N SER 262.A OG GLY 57.A H 2.647 1.936 ILE 59.A N ASP 86.A O ILE 59.A H 3.035 2.241 HIS 60.A N ASP 86.A O HIS 60.A H 2.898 2.043 HIS 60.A ND1 VAL 88.A O HIS 60.A HD1 2.845 2.061 GLY 61.A N TYR 87.A O GLY 61.A H 2.859 2.119 GLN 62.A N ILE 59.A O GLN 62.A H 3.172 2.327 GLN 62.A NE2 ASP 65.A OD2 GLN 62.A HE21 2.717 2.008 GLN 62.A NE2 PRO 264.A O GLN 62.A HE22 3.004 2.149 LEU 66.A N GLN 62.A O LEU 66.A H 2.991 2.171 LEU 67.A N TYR 63.A O LEU 67.A H 2.971 2.179 ARG 68.A N TYR 64.A O ARG 68.A H 3.118 2.355 ARG 68.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 68.A HH21 2.964 2.312 LEU 69.A N ASP 65.A O LEU 69.A H 3.017 2.202 PHE 70.A N LEU 66.A O PHE 70.A H 3.004 2.152 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.814 2.023 TYR 72.A N ARG 68.A O TYR 72.A H 3.057 2.267 GLY 73.A N LEU 69.A O GLY 73.A H 2.800 1.947 GLY 74.A N PHE 70.A O GLY 74.A H 2.693 1.974 GLU 78.A N PHE 75.A O GLU 78.A H 2.824 1.993 SER 79.A OG GLY 73.A O SER 79.A HG 2.687 2.078 ASN 80.A ND2 PRO 52.A O ASN 80.A HD21 3.121 2.314 TYR 81.A N ASN 111.A O TYR 81.A H 3.327 2.568 LEU 82.A N LYS 54.A O LEU 82.A H 2.849 2.033 PHE 83.A N PHE 113.A O PHE 83.A H 2.915 2.097 LEU 84.A N CYS 56.A O LEU 84.A H 3.010 2.290 ASP 86.A N GLU 120.A OE1 ASP 86.A H 2.706 1.897 TYR 87.A N GLU 120.A OE2 TYR 87.A H 2.723 1.885 ARG 90.A N TYR 128.A O ARG 90.A H 2.949 2.179 GLY 91.A N ASP 89.A O GLY 91.A H 2.832 2.082 GLN 93.A N GLY 61.A O GLN 93.A H 2.970 2.189 GLN 93.A NE2 LYS 20.A O GLN 93.A HE22 3.012 2.256 GLN 93.A NE2 ASN 21.A OD1 GLN 93.A HE21 3.045 2.362 SER 94.A N GLU 133.A OE1 SER 94.A H 2.978 2.196 LEU 95.A N GLU 133.A OE2 LEU 95.A H 2.846 1.997 GLU 96.A N GLU 96.A OE1 GLU 96.A H 2.650 1.889 THR 97.A N GLN 93.A O THR 97.A H 3.225 2.407 THR 97.A OG1 GLN 93.A O THR 97.A HG1 2.816 2.088 ILE 98.A N SER 94.A O ILE 98.A H 2.898 2.043 CYS 99.A N LEU 95.A O CYS 99.A H 2.939 2.093 CYS 99.A SG LEU 95.A O CYS 99.A HG 3.238 2.495 LEU 100.A N GLU 96.A O LEU 100.A H 3.057 2.210 LEU 101.A N THR 97.A O LEU 101.A H 3.099 2.242 LEU 102.A N ILE 98.A O LEU 102.A H 2.825 1.980 ALA 103.A N CYS 99.A O ALA 103.A H 2.871 2.064 TYR 104.A N LEU 100.A O TYR 104.A H 2.973 2.139 LYS 105.A N LEU 101.A O LYS 105.A H 3.036 2.243 LYS 105.A NZ GLN 43.A OE1 LYS 105.A HZ3 2.758 1.895 LYS 105.A NZ PRO 109.A O LYS 105.A HZ1 2.838 2.059 LYS 105.A NZ PHE 112.A O LYS 105.A HZ2 2.851 2.237 ILE 106.A N LEU 102.A O ILE 106.A H 3.074 2.272 LYS 107.A N ALA 103.A O LYS 107.A H 2.889 2.077 LYS 107.A NZ ASP 4.A OD1 LYS 107.A HZ2 2.802 2.107 TYR 108.A N TYR 104.A O TYR 108.A H 2.909 2.092 ASN 111.A N TYR 108.A O ASN 111.A H 3.000 2.150 ASN 111.A ND2 ASN 80.A OD1 ASN 111.A HD21 2.851 2.015 PHE 113.A N TYR 81.A O PHE 113.A H 2.925 2.217 LEU 115.A N PHE 83.A O LEU 115.A H 2.896 2.058 ARG 116.A N PRO 154.A O ARG 116.A H 2.998 2.308 ARG 116.A NE GLU 120.A O ARG 116.A HE 2.832 2.057 ARG 116.A NH1 THR 187.A O ARG 116.A HH12 2.736 1.888 ARG 116.A NH2 GLU 120.A O ARG 116.A HH21 2.915 2.187 ARG 116.A NH2 ASN 151.A OD1 ARG 116.A HH22 2.902 2.294 ARG 116.A NH2 THR 187.A O ARG 116.A HH22 3.387 2.748 GLY 117.A N GLU 120.A OE1 GLY 117.A H 2.754 1.998 HIS 119.A N ASP 86.A OD1 HIS 119.A H 2.866 2.022 HIS 119.A ND1 ASP 89.A OD2 HIS 119.A HD1 2.523 1.668 GLU 120.A N GLY 117.A O GLU 120.A H 3.105 2.316 CYS 121.A SG ASP 188.A OD1 CYS 121.A HG 3.631 2.436 ILE 124.A N CYS 121.A O ILE 124.A H 3.000 2.308 ASN 125.A N CYS 121.A O ASN 125.A H 2.958 2.112 ASN 125.A ND2 HIS 119.A O ASN 125.A HD21 3.021 2.272 ARG 126.A N ALA 122.A O ARG 126.A H 2.847 2.091 ARG 126.A NH1 ARG 126.A O ARG 126.A HH11 2.964 2.124 ILE 127.A N ILE 124.A O ILE 127.A H 2.925 2.094 TYR 128.A N ILE 124.A O TYR 128.A H 3.155 2.404 PHE 130.A N ASP 89.A OD1 PHE 130.A H 2.977 2.244 TYR 131.A N ASN 125.A O TYR 131.A H 3.030 2.179 GLU 133.A N GLY 129.A O GLU 133.A H 2.931 2.118 CYS 134.A N PHE 130.A O CYS 134.A H 2.949 2.099 LYS 135.A N TYR 131.A O LYS 135.A H 2.847 2.025 ARG 136.A N ASP 132.A O ARG 136.A H 2.931 2.132 ARG 137.A N GLU 133.A O ARG 137.A H 2.967 2.132 ARG 137.A NE GLN 23.A OE1 ARG 137.A HE 3.302 2.495 ARG 137.A NH1 GLU 96.A OE1 ARG 137.A HH12 2.991 2.148 ARG 137.A NH1 GLU 96.A OE2 ARG 137.A HH12 3.006 2.377 ARG 137.A NH2 GLN 23.A OE1 ARG 137.A HH21 3.522 2.769 ARG 137.A NH2 GLU 96.A OE2 ARG 137.A HH22 2.640 1.893 TYR 138.A N CYS 134.A O TYR 138.A H 2.782 1.995 ASN 139.A ND2 GLU 26.A OE2 ASN 139.A HD22 3.470 2.614 LEU 142.A N ASN 139.A O LEU 142.A H 3.232 2.591 LEU 142.A N ASN 139.A OD1 LEU 142.A H 2.933 2.176 TRP 143.A NE1 ASN 125.A OD1 TRP 143.A HE1 2.832 2.077 LYS 144.A N ILE 140.A O LYS 144.A H 3.086 2.325 LYS 144.A NZ ASP 148.A OD1 LYS 144.A HZ3 3.052 2.165 THR 145.A N LYS 141.A O THR 145.A H 3.019 2.230 PHE 146.A N LEU 142.A O PHE 146.A H 2.942 2.131 THR 147.A N TRP 143.A O THR 147.A H 3.028 2.215 THR 147.A OG1 TRP 143.A O THR 147.A HG1 3.209 2.426 ASP 148.A N LYS 144.A O ASP 148.A H 3.040 2.209 CYS 149.A N THR 145.A O CYS 149.A H 3.157 2.391 PHE 150.A N PHE 146.A O PHE 150.A H 2.777 1.929 ASN 151.A N THR 147.A O ASN 151.A H 2.836 2.068 CYS 152.A N CYS 149.A O CYS 152.A H 3.006 2.162 CYS 152.A SG ASP 148.A O CYS 152.A HG 3.619 2.538 LEU 153.A N PHE 150.A O LEU 153.A H 3.158 2.301 ILE 155.A N ILE 45.A O ILE 155.A H 2.940 2.094 ALA 157.A N CYS 165.A O ALA 157.A H 2.878 2.099 ILE 158.A N LEU 47.A O ILE 158.A H 2.873 2.045 VAL 159.A N ILE 163.A O VAL 159.A H 2.894 2.080 ASP 160.A N LEU 49.A O ASP 160.A H 2.735 1.898 LYS 162.A N VAL 159.A O LYS 162.A H 2.883 2.037 LYS 162.A NZ ASP 234.A O LYS 162.A HZ2 3.134 2.270 ILE 163.A N VAL 159.A O ILE 163.A H 3.169 2.357 PHE 164.A N LEU 237.A O PHE 164.A H 2.885 2.132 CYS 165.A N ALA 157.A O CYS 165.A H 2.622 1.781 CYS 166.A N CYS 239.A O CYS 166.A H 3.235 2.500 CYS 166.A SG GLY 169.A O CYS 166.A HG 3.708 2.692 HIS 167.A ND1 LEU 84.A O HIS 167.A HD1 2.849 2.150 GLY 168.A N LEU 198.A O GLY 168.A H 2.819 2.013 ASP 173.A N SER 171.A OG ASP 173.A H 2.970 2.160 LEU 174.A N SER 171.A O LEU 174.A H 2.949 2.093 GLN 175.A N GLN 179.A OE1 GLN 175.A H 2.732 1.910 GLN 175.A NE2 PRO 172.A O GLN 175.A HE21 3.276 2.543 SER 176.A N GLN 179.A OE1 SER 176.A H 3.010 2.199 GLN 179.A N SER 176.A O GLN 179.A H 3.025 2.274 GLN 179.A NE2 ASP 173.A O GLN 179.A HE22 2.963 2.283 ILE 180.A N MET 177.A O ILE 180.A H 3.063 2.454 ARG 181.A NH1 GLU 178.A OE1 ARG 181.A HH11 3.189 2.404 ARG 181.A NH2 GLU 48.A OE2 ARG 181.A HH21 2.990 2.145 ARG 182.A N GLN 179.A O ARG 182.A H 3.037 2.279 ARG 182.A NE GLU 178.A OE2 ARG 182.A HE 2.630 1.780 ILE 183.A N ILE 180.A O ILE 183.A H 3.140 2.321 ARG 185.A NH1 PHE 40.A O ARG 185.A HH12 3.209 2.692 ARG 185.A NH1 CYS 152.A O ARG 185.A HH11 2.923 2.280 ARG 185.A NH2 GLN 43.A O ARG 185.A HH22 2.820 1.998 THR 187.A N ASN 151.A O THR 187.A H 2.970 2.174 THR 187.A OG1 ASP 188.A O THR 187.A HG1 2.699 1.901 VAL 189.A N ASP 188.A OD1 VAL 189.A H 2.749 2.046 ASP 197.A N GLY 193.A O ASP 197.A H 2.899 2.056 LEU 198.A N LEU 194.A O LEU 198.A H 3.029 2.183 LEU 199.A N CYS 196.A O LEU 199.A H 3.034 2.312 TRP 200.A N ASP 197.A O TRP 200.A H 3.083 2.330 SER 201.A N ASP 197.A O SER 201.A H 2.931 2.076 SER 201.A OG LEU 170.A O SER 201.A HG 2.899 2.147 ASP 202.A N PHE 219.A O ASP 202.A H 3.234 2.444 ASP 204.A N PHE 221.A O ASP 204.A H 2.975 2.235 ASP 206.A N ASP 204.A OD1 ASP 206.A H 2.630 1.795 GLY 211.A N THR 220.A O GLY 211.A H 2.969 2.138 ASN 213.A ND2 ASP 202.A OD1 ASN 213.A HD22 2.864 2.022 ASN 213.A ND2 PHE 219.A O ASN 213.A HD21 2.880 2.039 ARG 215.A N ASN 213.A OD1 ARG 215.A H 2.837 1.989 ARG 215.A NE ASP 202.A OD1 ARG 215.A HE 2.743 1.887 ARG 215.A NH2 ASP 202.A OD2 ARG 215.A HH21 3.060 2.245 ARG 215.A NH2 HIS 242.A O ARG 215.A HH22 3.223 2.517 GLY 216.A N ASN 213.A O GLY 216.A H 2.920 2.068 THR 220.A N GLY 211.A O THR 220.A H 3.046 2.217 THR 220.A OG1 GLU 212.A O THR 220.A HG1 3.550 3.024 PHE 221.A N ASP 202.A O PHE 221.A H 2.993 2.283 GLY 222.A N GLY 209.A O GLY 222.A H 2.947 2.223 VAL 226.A N GLY 222.A O VAL 226.A H 3.230 2.415 ALA 227.A N ALA 223.A O ALA 227.A H 2.936 2.131 LYS 228.A N GLU 224.A O LYS 228.A H 2.964 2.113 PHE 229.A N VAL 225.A O PHE 229.A H 3.006 2.198 LEU 230.A N VAL 226.A O LEU 230.A H 2.982 2.130 HIS 231.A N ALA 227.A O HIS 231.A H 2.951 2.098 LYS 232.A N LYS 228.A O LYS 232.A H 2.912 2.064 HIS 233.A N PHE 229.A O HIS 233.A H 3.098 2.281 ASP 234.A N HIS 231.A O ASP 234.A H 3.324 2.499 LEU 235.A N LEU 230.A O LEU 235.A H 3.009 2.187 ASP 236.A N LYS 162.A O ASP 236.A H 2.810 1.964 LEU 237.A N LYS 162.A O LEU 237.A H 3.203 2.481 ILE 238.A N GLN 256.A O ILE 238.A H 2.968 2.133 CYS 239.A N PHE 164.A O CYS 239.A H 2.889 2.057 ARG 240.A N VAL 258.A O ARG 240.A H 3.053 2.212 ARG 240.A NE GLY 168.A O ARG 240.A HE 2.644 1.811 ARG 240.A NH1 GLN 243.A OE1 ARG 240.A HH12 2.949 2.113 ARG 240.A NH1 THR 259.A OG1 ARG 240.A HH11 2.903 2.063 ARG 240.A NH2 GLY 168.A O ARG 240.A HH21 3.225 2.582 ARG 240.A NH2 SER 201.A O ARG 240.A HH21 3.103 2.427 ARG 240.A NH2 ASP 202.A OD2 ARG 240.A HH22 2.938 2.171 ALA 241.A N HIS 167.A O ALA 241.A H 2.938 2.093 HIS 242.A N ASP 58.A OD1 HIS 242.A H 2.992 2.135 HIS 242.A NE2 TRP 200.A O HIS 242.A HE2 2.935 2.221 GLY 248.A N VAL 245.A O GLY 248.A H 2.938 2.086 GLU 250.A N THR 259.A O GLU 250.A H 3.007 2.294 PHE 252.A N LEU 257.A O PHE 252.A H 2.822 2.138 GLN 256.A N ALA 253.A O GLN 256.A H 3.113 2.302 GLN 256.A NE2 ALA 253.A O GLN 256.A HE21 3.063 2.211 LEU 257.A N PHE 252.A O LEU 257.A H 3.126 2.371 VAL 258.A N ILE 238.A O VAL 258.A H 2.883 2.068 THR 259.A N GLU 250.A O THR 259.A H 2.888 2.036 LEU 260.A N ARG 240.A O LEU 260.A H 2.766 1.964 PHE 261.A N GLY 248.A O PHE 261.A H 2.838 2.028 SER 262.A N ASP 58.A O SER 262.A H 3.142 2.421 SER 262.A OG ALA 275.A O SER 262.A HG 2.847 2.384 ASN 265.A N ASN 272.A O ASN 265.A H 2.992 2.152 ASN 265.A ND2 PHE 270.A O ASN 265.A HD21 3.651 2.955 TYR 266.A N ASN 272.A OD1 TYR 266.A H 2.800 1.970 GLY 268.A N ASN 265.A O GLY 268.A H 2.818 2.020 GLU 269.A N TYR 266.A O GLU 269.A H 2.924 2.079 PHE 270.A N TYR 266.A O PHE 270.A H 3.112 2.277 ASN 272.A ND2 ALA 263.A O ASN 272.A HD22 2.913 2.061 ASN 272.A ND2 ALA 273.A O ASN 272.A HD21 2.827 2.100 ALA 273.A N GLU 246.A O ALA 273.A H 2.755 1.916 GLY 274.A N LEU 290.A O GLY 274.A H 2.879 2.061 ALA 275.A N PHE 261.A O ALA 275.A H 2.877 2.135 MET 276.A N GLN 288.A O MET 276.A H 2.913 2.111 MET 277.A N ILE 55.A O MET 277.A H 2.824 1.998 SER 278.A N SER 286.A O SER 278.A H 2.824 2.056 VAL 279.A N LEU 53.A O VAL 279.A H 2.821 1.975 ASP 280.A N MET 284.A O ASP 280.A H 3.081 2.239 THR 282.A N ASP 280.A OD1 THR 282.A H 2.877 2.123 THR 282.A OG1 ASP 280.A OD1 THR 282.A HG1 2.765 2.019 LEU 283.A N ASP 280.A O LEU 283.A H 2.746 1.923 MET 284.A N ASP 280.A OD1 MET 284.A H 2.992 2.168 CYS 285.A SG LEU 283.A O CYS 285.A HG 3.908 2.753 SER 286.A N SER 278.A O SER 286.A H 2.879 2.073 GLN 288.A N MET 276.A O GLN 288.A H 2.936 2.099 GLN 288.A NE2 SER 286.A OG GLN 288.A HE22 3.124 2.425 LEU 290.A N GLY 274.A O LEU 290.A H 2.812 2.003 ALA 293.A N ASN 265.A OD1 ALA 293.A H 2.706 1.949