Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3zdj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 2.A N GLU 261.A OE1 HIS 2.A H.B 2.990 2.287 HIS 2.A NE2 GLU 254.A OE2 HIS 2.A HE2 2.470 1.617 GLU 7.A N GLN 4.A O GLU 7.A H 2.785 2.135 GLN 8.A N GLN 4.A O GLN 8.A H 3.001 2.208 GLN 8.A NE2 GLN 8.A O GLN 8.A HE21 3.004 2.522 GLN 8.A NE2 SER 12.A OG GLN 8.A HE21 3.078 2.277 ILE 9.A N THR 5.A O ILE 9.A H 2.930 2.159 LYS 10.A N LEU 6.A O LYS 10.A H 3.167 2.338 GLU 11.A N GLU 7.A O GLU 11.A H 3.080 2.240 SER 12.A N GLN 8.A O SER 12.A H 2.858 2.061 GLU 13.A N ILE 9.A O GLU 13.A H 2.847 1.992 SER 14.A N LYS 10.A O SER 14.A H 2.909 2.094 GLN 15.A N GLU 11.A O GLN 15.A H 2.883 2.033 LEU 16.A N SER 12.A O LEU 16.A H 2.932 2.127 SER 17.A N SER 14.A O SER 17.A H 2.809 2.064 GLY 18.A N GLU 13.A O GLY 18.A H 3.268 2.483 ARG 19.A N THR 239.A O ARG 19.A H 2.984 2.214 ARG 19.A NE GLU 240.A OE2 ARG 19.A HE 3.083 2.312 ARG 19.A NH1 GLU 39.A OE1 ARG 19.A HH11 3.002 2.262 ARG 19.A NH1 ARG 40.A O ARG 19.A HH12 3.207 2.527 ARG 19.A NH2 ARG 40.A O ARG 19.A HH22 2.757 1.929 VAL 20.A N GLU 13.A OE2 VAL 20.A H 2.871 2.031 GLY 21.A N TYR 237.A O GLY 21.A H 2.711 1.865 MET 22.A N.A TYR 35.A O MET 22.A H.A 2.866 2.038 MET 22.A N.B TYR 35.A O MET 22.A H.B 2.858 2.035 VAL 23.A N VAL 235.A O VAL 23.A H.B 3.137 2.346 GLU 24.A N LEU 33.A O GLU 24.A H 2.808 1.985 LEU 25.A N ILE 233.A O LEU 25.A H 2.801 1.966 ASP 26.A N ARG 31.A O ASP 26.A H 2.862 2.022 LEU 27.A N SER 231.A O LEU 27.A H 2.950 2.102 SER 29.A N ASP 26.A OD2 SER 29.A H 2.930 2.082 GLY 30.A N ASP 26.A O GLY 30.A H 2.940 2.119 LEU 33.A N GLU 24.A O LEU 33.A H 2.947 2.159 TYR 35.A N MET 22.A O.A TYR 35.A H 2.973 2.177 TYR 35.A N MET 22.A O.B TYR 35.A H 2.953 2.169 ARG 36.A NE GLU 13.A OE2 ARG 36.A HE 2.625 1.946 ARG 36.A NH1 GLU 39.A OE1 ARG 36.A HH11 3.522 2.766 ARG 36.A NH1 GLU 39.A OE2 ARG 36.A HH11 3.147 2.362 ARG 36.A NH2 GLU 13.A OE1 ARG 36.A HH21 3.159 2.304 ARG 36.A NH2 GLU 13.A OE2 ARG 36.A HH21 3.018 2.408 GLU 39.A N ARG 36.A O GLU 39.A H 3.103 2.246 ARG 40.A NH1 VAL 134.A O ARG 40.A HH12 2.916 2.114 ARG 40.A NH1 THR 155.A OG1 ARG 40.A HH11 2.809 2.065 ARG 40.A NH2 VAL 134.A O ARG 40.A HH22 3.244 2.545 PHE 41.A N THR 156.A O PHE 41.A H 2.952 2.116 MET 43.A N ASP 154.A O MET 43.A H.B 3.118 2.291 SER 45.A OG SER 105.A OG SER 45.A HG 3.054 2.389 THR 46.A N MET 43.A O THR 46.A H 3.064 2.297 THR 46.A OG1 MET 43.A O THR 46.A HG1 2.596 1.782 PHE 47.A N MET 44.A O PHE 47.A H 3.272 2.412 LYS 48.A N SER 45.A O LYS 48.A H 2.931 2.084 LYS 48.A NZ SER 45.A OG LYS 48.A HZ3 2.599 1.767 LYS 48.A NZ SER 105.A O LYS 48.A HZ1 3.179 2.411 LYS 48.A NZ ASN 107.A OD1 LYS 48.A HZ2 2.833 2.065 LYS 48.A NZ GLU 141.A OE2 LYS 48.A HZ2 3.148 2.546 VAL 49.A N THR 46.A O VAL 49.A H 3.370 2.547 LEU 50.A N PHE 47.A O LEU 50.A H 2.901 2.270 LEU 51.A N PHE 47.A O LEU 51.A H 3.039 2.225 CYS 52.A N LYS 48.A O CYS 52.A H 3.127 2.318 GLY 53.A N VAL 49.A O GLY 53.A H 3.025 2.225 ALA 54.A N LEU 50.A O ALA 54.A H 2.936 2.131 VAL 55.A N LEU 51.A O VAL 55.A H 3.086 2.303 LEU 56.A N CYS 52.A O LEU 56.A H 2.957 2.121 ALA 57.A N GLY 53.A O ALA 57.A H 2.973 2.227 ARG 58.A N ALA 54.A O ARG 58.A H 3.286 2.490 VAL 59.A N VAL 55.A O VAL 59.A H 2.941 2.190 ASP 60.A N LEU 56.A O ASP 60.A H 2.822 1.985 ALA 61.A N ALA 57.A O ALA 61.A H 3.075 2.360 GLY 62.A N VAL 59.A O GLY 62.A H 3.086 2.273 LEU 63.A N ARG 58.A O LEU 63.A H 3.003 2.331 GLU 64.A N ARG 58.A O GLU 64.A H 3.131 2.391 GLN 65.A N GLU 64.A OE1 GLN 65.A H 2.922 2.136 ARG 68.A N GLN 65.A O ARG 68.A H 3.334 2.497 ARG 68.A NE GLU 64.A OE1 ARG 68.A HE 2.843 2.034 ARG 68.A NH2 GLU 64.A OE1 ARG 68.A HH21 3.255 2.572 ARG 68.A NH2 GLU 64.A OE2 ARG 68.A HH21 2.779 1.935 ARG 69.A NE ASP 90.A O.A ARG 69.A HE 2.965 2.376 ARG 69.A NE ASP 90.A O.B ARG 69.A HE 3.010 2.444 ILE 70.A N MET 92.A O ILE 70.A H 2.803 1.962 ARG 73.A N ASP 76.A OD2 ARG 73.A H 3.184 2.345 ASP 76.A N ARG 73.A O ASP 76.A H 2.906 2.134 LEU 77.A N GLN 74.A O LEU 77.A H 3.384 2.539 VAL 78.A N THR 108.A OG1 VAL 78.A H 2.807 1.978 SER 81.A OG THR 108.A OG1 SER 81.A HG 2.640 1.997 VAL 83.A N ASP 106.A OD2 VAL 83.A H 2.832 2.071 THR 84.A N ASP 106.A OD2 THR 84.A H 2.984 2.151 THR 84.A OG1 ASP 106.A OD2 THR 84.A HG1 3.256 2.438 GLU 85.A N SER 81.A O GLU 85.A H 3.101 2.331 LYS 86.A N VAL 83.A O LYS 86.A H 3.020 2.227 HIS 87.A N THR 84.A O HIS 87.A H 3.406 2.561 HIS 87.A ND1 VAL 83.A O HIS 87.A HD1 3.223 2.434 ASP 90.A N.B ASP 90.A OD1.B ASP 90.A H.B 2.468 1.782 GLY 91.A N HIS 87.A O GLY 91.A H.B 2.856 2.105 MET 92.A N ILE 70.A O MET 92.A H 3.088 2.297 THR 93.A N GLU 96.A OE1 THR 93.A H 3.000 2.186 VAL 94.A N ARG 68.A O VAL 94.A H 2.939 2.161 ALA 95.A N LEU 66.A O ALA 95.A H 2.926 2.102 GLU 96.A N THR 93.A OG1 GLU 96.A H 3.012 2.194 LEU 97.A N THR 93.A O LEU 97.A H 2.787 1.959 CYS 98.A N VAL 94.A O CYS 98.A H 2.933 2.113 CYS 98.A SG VAL 94.A O CYS 98.A HG 3.469 2.458 ALA 99.A N ALA 95.A O ALA 99.A H 3.036 2.222 ALA 100.A N GLU 96.A O ALA 100.A H 2.891 2.060 ALA 101.A N LEU 97.A O ALA 101.A H 2.881 2.099 ILE 102.A N CYS 98.A O ILE 102.A H 3.044 2.317 ILE 102.A N ALA 99.A O ILE 102.A H 3.227 2.573 THR 103.A N ALA 99.A O THR 103.A H 2.715 1.860 THR 103.A OG1 ALA 99.A O THR 103.A HG1 2.773 1.977 MET 104.A N ALA 100.A O MET 104.A H.B 3.164 2.379 ASP 106.A N ALA 100.A O ASP 106.A H 3.065 2.236 ASN 107.A N TYR 80.A O ASN 107.A H 2.971 2.112 ASN 107.A ND2 GLU 79.A O ASN 107.A HD21 2.981 2.157 THR 108.A OG1 SER 81.A OG THR 108.A HG1 2.640 2.016 ALA 109.A N ASP 106.A OD1 ALA 109.A H 2.919 2.092 ALA 110.A N ASP 106.A O ALA 110.A H 3.352 2.579 ASN 111.A N ASN 107.A O ASN 111.A H 3.040 2.201 ASN 111.A ND2 GLU 141.A O ASN 111.A HD22 2.872 2.028 LEU 112.A N THR 108.A O LEU 112.A H 2.894 2.083 LEU 113.A N ALA 109.A O LEU 113.A H 3.099 2.251 LEU 114.A N ALA 110.A O LEU 114.A H 2.841 2.022 ALA 115.A N ASN 111.A O ALA 115.A H 3.038 2.239 THR 116.A N LEU 113.A O THR 116.A H 3.068 2.407 THR 116.A OG1 LEU 113.A O THR 116.A HG1 2.716 1.910 ILE 117.A N LEU 114.A O ILE 117.A H 3.114 2.317 GLY 119.A N LEU 114.A O GLY 119.A H 2.862 2.041 GLY 122.A N GLY 118.A O GLY 122.A H 3.296 2.591 LEU 123.A N GLY 119.A O LEU 123.A H 3.169 2.403 THR 124.A N PRO 120.A O THR 124.A H 2.915 2.135 THR 124.A OG1 LEU 137.A O THR 124.A HG1 2.989 2.505 ALA 125.A N ALA 121.A O ALA 125.A H 2.829 1.983 PHE 126.A N GLY 122.A O PHE 126.A H 3.070 2.213 LEU 127.A N LEU 123.A O LEU 127.A H 3.037 2.215 ARG 128.A N THR 124.A O ARG 128.A H 2.966 2.170 ARG 128.A NH1 ASP 132.A O ARG 128.A HH11 2.590 1.914 ARG 128.A NH1 THR 135.A O ARG 128.A HH12 2.940 2.204 ARG 128.A NH2 THR 135.A O ARG 128.A HH22 3.036 2.334 ASN 129.A N ALA 125.A O ASN 129.A H 2.797 1.984 ILE 130.A N PHE 126.A O ILE 130.A H 3.080 2.468 ILE 130.A N LEU 127.A O ILE 130.A H 3.056 2.336 GLY 131.A N ARG 128.A O GLY 131.A H 3.072 2.250 ASP 132.A N LEU 127.A O ASP 132.A H 3.025 2.175 VAL 134.A N ASP 132.A OD1 VAL 134.A H 2.833 1.991 THR 135.A N ASP 132.A OD1 THR 135.A H 2.868 2.020 ARG 136.A N THR 155.A O ARG 136.A H 3.053 2.258 ARG 136.A NE ASP 138.A OD2 ARG 136.A HE 2.877 2.091 ARG 136.A NH2 ASP 138.A OD1 ARG 136.A HH21 2.941 2.097 ARG 136.A NH2 ASP 138.A OD2 ARG 136.A HH21 3.440 2.820 LEU 137.A N THR 124.A OG1 LEU 137.A H 2.904 2.056 ASP 138.A N ASP 154.A OD1 ASP 138.A H 2.738 1.886 ARG 139.A N ASP 154.A OD1 ARG 139.A H 3.034 2.243 ARG 139.A NE ASP 154.A OD2 ARG 139.A HE 2.861 2.065 ARG 139.A NH1 GLU 146.A OE1 ARG 139.A HH12 2.985 2.198 ARG 139.A NH2 ASP 154.A OD2 ARG 139.A HH21 2.974 2.231 GLU 141.A N ASN 111.A OD1 GLU 141.A H 2.947 2.107 GLU 143.A N GLU 143.A OE1 GLU 143.A H 3.184 2.422 LEU 144.A N TRP 140.A O LEU 144.A H 3.066 2.292 ASN 145.A N THR 142.A O ASN 145.A H 3.228 2.370 ASN 145.A ND2 GLU 141.A OE1 ASN 145.A HD22 2.854 2.120 ASN 145.A ND2 THR 142.A O ASN 145.A HD21 3.089 2.291 GLU 146.A N GLU 143.A O GLU 146.A H 3.233 2.515 ASP 151.A N LEU 148.A O ASP 151.A H 3.184 2.355 ARG 153.A N ASP 151.A OD1 ARG 153.A H 3.136 2.284 ARG 153.A NE ASP 151.A OD1 ARG 153.A HE 3.383 2.668 ARG 153.A NE ASP 151.A OD2 ARG 153.A HE 3.012 2.222 ARG 153.A NH2 ASP 151.A OD2 ARG 153.A HH21 3.045 2.283 ASP 154.A N ASP 138.A OD2 ASP 154.A H 3.120 2.332 THR 155.A OG1 GLU 152.A O THR 155.A HG1 2.651 1.938 THR 156.A N PHE 41.A O THR 156.A H 3.050 2.271 THR 156.A OG1 THR 135.A OG1 THR 156.A HG1 2.698 2.033 ALA 159.A N ALA 37.A O ALA 159.A H 2.975 2.128 ALA 160.A N THR 157.A OG1 ALA 160.A H 3.096 2.255 MET 161.A N THR 157.A O MET 161.A H 2.859 2.005 ALA 162.A N PRO 158.A O ALA 162.A H 2.988 2.140 ALA 163.A N ALA 159.A O ALA 163.A H 3.125 2.321 THR 164.A N ALA 160.A O THR 164.A H 2.906 2.056 THR 164.A OG1 ASP 132.A OD2 THR 164.A HG1 2.555 1.844 LEU 165.A N MET 161.A O LEU 165.A H 2.836 1.982 ARG 166.A N ALA 162.A O ARG 166.A H.B 2.974 2.200 ARG 166.A NH2.B LEU 27.A O ARG 166.A HH21.B 2.846 2.123 LYS 167.A N ALA 163.A O LYS 167.A H 3.078 2.255 LYS 167.A NZ ILE 130.A O LYS 167.A HZ1 3.187 2.328 LEU 168.A N THR 164.A O LEU 168.A H 2.938 2.093 LEU 169.A N LEU 165.A O LEU 169.A H 2.818 1.964 THR 170.A N ARG 166.A O THR 170.A H.B 3.024 2.274 THR 170.A OG1.B ARG 166.A O THR 170.A HG1.B 2.796 1.995 GLY 171.A N LYS 167.A O GLY 171.A H 2.811 2.168 SER 175.A N ASP 60.A OD2 SER 175.A H 2.781 1.941 SER 178.A N SER 175.A OG SER 178.A H 3.216 2.381 SER 178.A OG ASP 60.A OD1 SER 178.A HG 2.715 2.159 ARG 179.A N SER 175.A O ARG 179.A H 2.925 2.069 ARG 179.A NH1 LEU 174.A O ARG 179.A HH11 3.004 2.265 GLN 180.A N ALA 176.A O GLN 180.A H 3.069 2.229 GLN 181.A N ALA 177.A O GLN 181.A H 2.892 2.134 LEU 182.A N SER 178.A O LEU 182.A H 2.930 2.129 ILE 183.A N ARG 179.A O ILE 183.A H 3.106 2.278 THR 184.A N GLN 180.A O THR 184.A H 2.901 2.078 THR 184.A OG1 GLN 180.A O THR 184.A HG1 3.120 2.541 THR 184.A OG1 GLN 180.A OE1 THR 184.A HG1 3.364 2.660 TRP 185.A N GLN 181.A O TRP 185.A H 3.209 2.378 MET 186.A N LEU 182.A O MET 186.A H.B 3.302 2.508 VAL 187.A N ILE 183.A O VAL 187.A H 2.820 1.988 ALA 188.A N THR 184.A O ALA 188.A H 3.221 2.521 ASP 189.A N MET 186.A O ASP 189.A H 3.212 2.366 LYS 190.A N THR 103.A O LYS 190.A H 3.018 2.176 LYS 190.A NZ ALA 188.A O LYS 190.A HZ1 2.870 2.318 VAL 191.A N ASP 189.A OD1 VAL 191.A H 3.321 2.461 LEU 195.A N ALA 192.A O LEU 195.A H 3.298 2.450 ARG 197.A NE ASP 208.A OD1 ARG 197.A HE 3.262 2.555 ARG 197.A NE ASP 208.A OD2 ARG 197.A HE 3.037 2.278 ARG 197.A NH2 VAL 187.A O ARG 197.A HH22 3.231 2.425 ARG 197.A NH2 ASP 208.A OD1 ARG 197.A HH21 2.812 1.979 SER 198.A N LEU 195.A O SER 198.A H 2.997 2.193 VAL 199.A N LEU 196.A O VAL 199.A H 3.007 2.159 PHE 205.A N GLY 225.A O PHE 205.A H 2.719 1.984 ALA 207.A N VAL 223.A O ALA 207.A H 2.820 2.038 ASP 208.A N MET 186.A O ASP 208.A H 3.343 2.560 LYS 209.A N ILE 221.A O LYS 209.A H 3.006 2.222 LYS 209.A NZ SER 105.A OG LYS 209.A HZ2 2.942 2.079 LYS 209.A NZ THR 210.A O LYS 209.A HZ3 2.724 1.911 GLY 211.A N GLY 219.A O GLY 211.A H 3.020 2.224 GLY 213.A N SER 217.A O GLY 213.A H 3.060 2.264 GLU 214.A N ASN 145.A O GLU 214.A H 2.877 2.020 ARG 215.A NH1.B GLU 146.A O ARG 215.A HH11.B 2.825 2.233 SER 217.A N GLY 213.A O SER 217.A H 3.279 2.480 ARG 218.A N LEU 238.A O ARG 218.A H 2.863 2.031 ARG 218.A NE ASN 249.A OD1 ARG 218.A HE 2.957 2.143 ARG 218.A NH1 GLY 211.A O ARG 218.A HH11 2.851 2.061 ARG 218.A NH2 ASN 249.A OD1 ARG 218.A HH21 3.143 2.409 GLY 219.A N GLY 211.A O GLY 219.A H 2.990 2.197 ILE 220.A N ILE 236.A O ILE 220.A H 2.782 1.997 ILE 221.A N LYS 209.A O ILE 221.A H 3.019 2.185 ALA 222.A N VAL 234.A O ALA 222.A H 2.803 2.128 VAL 223.A N ALA 207.A O VAL 223.A H 2.809 1.980 LEU 224.A N ARG 232.A O LEU 224.A H.B 2.967 2.135 GLY 225.A N PHE 205.A O GLY 225.A H 3.095 2.331 LYS 229.A N PRO 226.A O LYS 229.A H 3.421 2.561 SER 231.A N LEU 224.A O SER 231.A H 2.973 2.114 ARG 232.A N LEU 224.A O ARG 232.A H 2.958 2.129 ARG 232.A NE ASP 26.A OD1 ARG 232.A HE 3.160 2.395 ARG 232.A NH1 GLU 24.A OE2 ARG 232.A HH11 2.749 2.007 ARG 232.A NH1 TRP 263.A O ARG 232.A HH12 3.007 2.218 ARG 232.A NH2 TRP 263.A O ARG 232.A HH22 3.100 2.340 ILE 233.A N LEU 25.A O ILE 233.A H 2.822 1.999 VAL 234.A N ALA 222.A O VAL 234.A H 2.731 1.887 VAL 235.A N VAL 23.A O VAL 235.A H.B 2.978 2.134 ILE 236.A N ILE 220.A O ILE 236.A H 2.835 1.985 TYR 237.A N GLY 21.A O TYR 237.A H 2.893 2.055 LEU 238.A N ARG 218.A O LEU 238.A H 2.858 2.022 THR 239.A N ARG 19.A O THR 239.A H 3.028 2.258 THR 239.A OG1 SER 217.A OG THR 239.A HG1 2.518 1.723 THR 241.A N ARG 215.A O THR 241.A H 3.135 2.390 THR 241.A OG1 LEU 16.A O THR 241.A HG1 2.720 2.058 ALA 243.A N THR 241.A OG1 ALA 243.A H.A 3.188 2.386 ARG 248.A N SER 244.A O ARG 248.A H 3.047 2.296 ARG 248.A NE ALA 243.A O ARG 248.A HE 3.132 2.380 ARG 248.A NE SER 244.A O ARG 248.A HE 3.315 2.598 ARG 248.A NH1 SER 217.A O ARG 248.A HH11 2.845 2.269 ASN 249.A N MET 245.A O.A ASN 249.A H 2.833 2.036 ASN 249.A N MET 245.A O.B ASN 249.A H 2.870 2.075 GLN 250.A N ASP 246.A O GLN 250.A H 3.033 2.267 GLN 250.A NE2 GLU 254.A OE1 GLN 250.A HE21 3.179 2.396 GLN 251.A N GLU 247.A O GLN 251.A H 3.157 2.344 ILE 252.A N ARG 248.A O ILE 252.A H 3.183 2.341 ALA 253.A N ASN 249.A O ALA 253.A H 2.843 1.997 GLU 254.A N GLN 250.A O GLU 254.A H 2.821 2.088 ILE 255.A N GLN 251.A O ILE 255.A H 3.027 2.182 GLY 256.A N ILE 252.A O GLY 256.A H 2.868 2.076 ALA 257.A N ALA 253.A O ALA 257.A H 2.862 2.062 ALA 258.A N GLU 254.A O ALA 258.A H 3.043 2.218 LEU 259.A N ILE 255.A O LEU 259.A H 2.942 2.116 ILE 260.A N GLY 256.A O ILE 260.A H 2.875 2.062 GLU 261.A N ALA 257.A O GLU 261.A H 2.874 2.023 HIS 262.A N ALA 258.A O HIS 262.A H 2.951 2.158 HIS 262.A NE2 HIS 2.A O HIS 262.A HE2 2.733 1.914