Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3zk8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ ASP 21.A O LYS 1.A HZ2 2.745 1.747 LYS 3.A N ASP 52.A OD2 LYS 3.A H 2.953 1.939 VAL 4.A N ASP 24.A O VAL 4.A H 2.842 1.836 VAL 5.A N LEU 53.A O VAL 5.A H 2.942 2.003 ALA 6.A N HIS 26.A O ALA 6.A H 2.894 1.929 THR 7.A N PHE 55.A O THR 7.A H 3.043 2.232 THR 7.A OG1 GLU 62.A OE2 THR 7.A HG1 2.655 1.767 SER 9.A OG SER 250.A OG SER 9.A HG 3.164 2.472 ILE 11.A N ASN 8.A OD1 ILE 11.A H 3.029 2.045 ALA 12.A N ASN 8.A O ALA 12.A H 2.888 1.908 ASP 13.A N SER 9.A O ASP 13.A H 2.929 1.972 ILE 14.A N ILE 10.A O ILE 14.A H 3.053 2.061 THR 15.A N ILE 11.A O THR 15.A H 2.912 1.907 THR 15.A OG1 ILE 11.A O THR 15.A HG1 2.902 2.158 LYS 16.A N ALA 12.A O LYS 16.A H 2.917 1.966 ASN 17.A N ASP 13.A O ASN 17.A H 3.130 2.213 ASN 17.A ND2 ASP 13.A O ASN 17.A HD21 2.882 1.940 ILE 18.A N ILE 14.A O ILE 18.A H 3.227 2.494 ILE 18.A N THR 15.A O ILE 18.A H 3.089 2.241 ALA 19.A N THR 15.A O ALA 19.A H 2.790 1.846 GLY 20.A N LYS 16.A O GLY 20.A H 2.836 1.877 LYS 22.A N ALA 19.A O LYS 22.A H 3.071 2.068 ASP 24.A N LEU 2.A O ASP 24.A H 2.874 1.866 HIS 26.A N VAL 4.A O HIS 26.A H 2.950 2.017 HIS 26.A NE2 ASP 44.A OD1 HIS 26.A HE2 2.801 1.820 ILE 28.A N ALA 6.A O ILE 28.A H 2.969 2.054 VAL 29.A N THR 7.A O VAL 29.A H 2.901 1.902 GLY 32.A N SER 250.A OG GLY 32.A H 2.780 1.806 GLN 33.A N PRO 30.A O GLN 33.A H 2.943 1.950 ASP 34.A N GLN 33.A OE1 ASP 34.A H 3.018 2.065 HIS 36.A N ASP 34.A OD1 HIS 36.A H 2.995 2.027 HIS 36.A ND1 LEU 61.A O no hydrogen 2.725 N/A GLU 37.A N ASP 34.A OD1 GLU 37.A H 3.257 2.269 LEU 41.A N ASP 44.A OD2 LEU 41.A H 2.929 1.936 VAL 45.A N LEU 41.A O VAL 45.A H 3.230 2.296 LYS 46.A N PRO 42.A O LYS 46.A H 3.035 2.079 LYS 47.A N GLU 43.A O LYS 47.A H 2.940 1.932 THR 48.A N ASP 44.A O THR 48.A H 2.907 1.959 THR 48.A OG1 ASP 44.A O THR 48.A HG1 2.845 1.953 SER 49.A N VAL 45.A O SER 49.A H 3.007 2.020 GLU 50.A N LYS 46.A O GLU 50.A H 3.120 2.209 ALA 51.A N THR 48.A O ALA 51.A H 3.198 2.224 ASP 52.A N LYS 3.A O ASP 52.A H 2.831 1.956 LEU 53.A N LYS 3.A O LEU 53.A H 3.166 2.296 ILE 54.A N ASP 83.A O ILE 54.A H 2.935 2.023 PHE 55.A N VAL 5.A O PHE 55.A H 2.805 1.839 TYR 56.A N PHE 85.A O TYR 56.A H 3.120 2.146 ASN 57.A N GLU 62.A OE2 ASN 57.A H 2.890 1.878 ASN 57.A ND2 GLY 58.A O ASN 57.A HD21 2.947 1.955 ASN 57.A ND2 PRO 107.A O ASN 57.A HD22 3.090 2.194 GLY 58.A N GLU 62.A OE1 GLY 58.A H 3.172 2.239 ASN 60.A ND2 GLU 105.A O ASN 60.A HD21 2.998 2.041 ASN 60.A ND2 GLU 105.A OE1 ASN 60.A HD22 2.911 1.937 LEU 61.A N GLY 58.A O LEU 61.A H 3.125 2.112 ASN 66.A ND2 TYR 38.A O ASN 66.A HD22 3.362 2.386 ALA 67.A N GLY 64.A O ALA 67.A H 2.883 1.899 TRP 68.A N ASN 66.A OD1 TRP 68.A H 3.217 2.441 TRP 68.A NE1 PRO 35.A O TRP 68.A HE1 3.284 2.334 PHE 69.A N GLU 62.A O PHE 69.A H 3.043 2.043 LYS 71.A N ALA 67.A O LYS 71.A H 3.268 2.272 LYS 71.A NZ ASN 66.A O LYS 71.A HZ1 2.788 1.896 LEU 72.A N TRP 68.A O LEU 72.A H 3.039 2.066 VAL 73.A N PHE 69.A O VAL 73.A H 2.972 1.970 GLU 74.A N THR 70.A O GLU 74.A H 3.024 2.057 ASN 75.A N LYS 71.A O ASN 75.A H 2.945 1.947 ALA 76.A N LEU 72.A O ALA 76.A H 2.994 2.064 LYS 77.A N GLU 74.A O LYS 77.A H 3.224 2.238 LYS 78.A N VAL 73.A O LYS 78.A H 3.006 2.002 LYS 78.A NZ SER 49.A O LYS 78.A HZ2 3.452 2.755 LYS 78.A NZ ALA 51.A O LYS 78.A HZ3 2.753 1.832 THR 79.A N ASP 83.A OD2 THR 79.A H 2.816 1.831 ASN 81.A N TYR 84.A O ASN 81.A H 2.855 1.934 LYS 82.A N THR 79.A O LYS 82.A H 3.318 2.385 ASP 83.A N THR 79.A O ASP 83.A H 2.851 1.885 TYR 84.A N THR 79.A O TYR 84.A H 3.210 2.258 PHE 85.A N ILE 54.A O PHE 85.A H 2.897 2.002 VAL 87.A N TYR 56.A O VAL 87.A H 2.909 1.924 SER 88.A N ASN 57.A O SER 88.A H 3.489 2.609 SER 88.A OG ASN 57.A O SER 88.A HG 2.622 1.760 ASP 89.A N ALA 86.A O ASP 89.A H 3.178 2.168 VAL 91.A N SER 88.A O VAL 91.A H 2.994 1.983 ILE 94.A N TYR 179.A OH ILE 94.A H 3.027 2.030 LEU 96.A N LYS 104.A O LEU 96.A H 2.829 1.829 GLY 98.A N TYR 95.A O GLY 98.A H 2.954 2.037 GLN 99.A N LEU 96.A O GLN 99.A H 3.225 2.272 GLN 99.A NE2 GLU 97.A O GLN 99.A HE21 3.592 2.940 GLY 103.A N GLU 105.A OE1 GLY 103.A H 2.769 1.899 LYS 104.A N GLU 101.A O LYS 104.A H 2.977 1.993 LYS 104.A NZ GLU 97.A OE1 LYS 104.A HZ2 2.827 1.914 GLU 105.A N GLU 105.A OE1 GLU 105.A H 2.799 1.857 ASP 106.A N ILE 94.A O ASP 106.A H 2.764 1.758 HIS 108.A N ASP 106.A OD1 HIS 108.A H 2.940 1.926 HIS 108.A ND1 ASP 106.A OD1 HIS 108.A HD1 2.876 1.944 ALA 109.A N PRO 107.A O ALA 109.A H 2.878 2.017 TRP 110.A NE1 THR 248.A O TRP 110.A HE1 2.785 1.862 LEU 111.A N HIS 108.A O LEU 111.A H 3.334 2.323 ASN 112.A N ALA 109.A O ASN 112.A H 3.342 2.497 ASN 112.A ND2 TYR 179.A O ASN 112.A HD21 3.082 2.319 LEU 113.A N TYR 184.A OH LEU 113.A H 3.122 2.111 ASN 115.A N ASN 112.A O ASN 115.A H 3.107 2.324 ASN 115.A N ASN 112.A OD1 ASN 115.A H 2.919 2.011 ASN 115.A ND2 ALA 109.A O ASN 115.A HD21 2.962 2.030 GLY 116.A N ASN 112.A O GLY 116.A H 3.284 2.380 ILE 117.A N LEU 113.A O ILE 117.A H 2.963 2.018 ILE 118.A N GLU 114.A O ILE 118.A H 3.092 2.179 PHE 119.A N ASN 115.A O PHE 119.A H 2.827 1.846 ALA 120.A N GLY 116.A O ALA 120.A H 2.992 1.998 LYS 121.A N ILE 117.A O LYS 121.A H 2.889 1.911 ASN 122.A N ILE 118.A O ASN 122.A H 2.950 1.966 ASN 122.A ND2 VAL 87.A O ASN 122.A HD21 2.914 1.994 ASN 122.A ND2 ASP 89.A O ASN 122.A HD22 2.802 1.824 ILE 123.A N PHE 119.A O ILE 123.A H 2.939 1.952 ALA 124.A N ALA 120.A O ALA 124.A H 2.870 1.856 LYS 125.A N LYS 121.A O LYS 125.A H 2.940 1.961 GLN 126.A N ASN 122.A O GLN 126.A H 3.094 2.125 LEU 127.A N ILE 123.A O LEU 127.A H 2.898 1.893 SER 128.A N ALA 124.A O SER 128.A H 2.994 2.007 SER 128.A OG ALA 124.A O SER 128.A HG 3.002 2.110 ALA 129.A N LYS 125.A O ALA 129.A H 3.088 2.196 LYS 130.A N GLN 126.A O LYS 130.A H 3.130 2.179 LYS 130.A NZ LYS 82.A O LYS 130.A HZ3 2.712 1.819 ASP 131.A N LEU 127.A O ASP 131.A H 2.786 1.957 ASN 134.A N ASP 131.A O ASN 134.A H 3.115 2.149 ASN 134.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 134.A HD21 2.853 1.847 LYS 135.A N PRO 132.A O LYS 135.A H 3.083 2.085 TYR 138.A N ASN 134.A O TYR 138.A H 2.973 1.997 TYR 138.A OH ASP 131.A OD2 TYR 138.A HH 2.688 1.805 GLU 139.A N LYS 135.A O GLU 139.A H 2.914 1.944 LYS 140.A N GLU 136.A O LYS 140.A H 2.938 1.976 ASN 141.A N PHE 137.A O ASN 141.A H 2.970 1.973 ASN 141.A ND2 ILE 18.A O ASN 141.A HD21 2.851 1.852 LEU 142.A N TYR 138.A O LEU 142.A H 2.811 1.844 LYS 143.A N GLU 139.A O LYS 143.A H 3.061 2.091 GLU 144.A N LYS 140.A O GLU 144.A H 3.100 2.132 TYR 145.A N ASN 141.A O TYR 145.A H 2.853 1.869 THR 146.A N LEU 142.A O THR 146.A H 2.927 1.924 THR 146.A OG1 LEU 142.A O THR 146.A HG1 2.880 1.985 ASP 147.A N LYS 143.A O ASP 147.A H 3.003 2.051 LYS 148.A N GLU 144.A O LYS 148.A H 3.123 2.209 LEU 149.A N TYR 145.A O LEU 149.A H 3.023 2.052 ASP 150.A N THR 146.A O ASP 150.A H 2.808 1.843 LYS 151.A N ASP 147.A O LYS 151.A H 2.989 2.020 LEU 152.A N LYS 148.A O LEU 152.A H 3.313 2.310 ASP 153.A N LEU 149.A O ASP 153.A H 2.887 1.955 LYS 154.A N ASP 150.A O LYS 154.A H 2.992 2.048 GLU 155.A N LYS 151.A O GLU 155.A H 3.005 1.994 SER 156.A N LEU 152.A O SER 156.A H 2.924 1.943 SER 156.A OG LEU 152.A O SER 156.A HG 2.781 1.951 LYS 157.A N ASP 153.A O LYS 157.A H 2.960 1.972 LYS 157.A NZ GLU 114.A OE2 LYS 157.A HZ2 3.066 2.135 LYS 157.A NZ ASP 153.A OD2 LYS 157.A HZ3 2.896 1.924 ASP 158.A N LYS 154.A O ASP 158.A H 3.076 2.097 LYS 159.A N GLU 155.A O LYS 159.A H 3.155 2.245 LYS 159.A NZ ASP 270.A OD1 LYS 159.A HZ3 2.782 2.015 PHE 160.A N SER 156.A O PHE 160.A H 3.012 2.045 ASN 161.A N LYS 157.A O ASN 161.A H 2.959 2.003 LYS 162.A N LYS 159.A O LYS 162.A H 3.239 2.400 ILE 163.A N PHE 160.A O ILE 163.A H 3.135 2.163 GLU 166.A N GLU 166.A OE1 GLU 166.A H 2.768 1.860 LYS 167.A N PRO 164.A O LYS 167.A H 2.960 1.984 LYS 167.A NZ ALA 277.A O LYS 167.A HZ1 3.280 2.413 LYS 167.A NZ LYS 278.A O LYS 167.A HZ1 3.031 2.256 LYS 168.A N ALA 165.A O LYS 168.A H 3.132 2.135 LYS 168.A NZ PHE 160.A O LYS 168.A HZ3 3.359 2.583 ILE 170.A N PRO 187.A O ILE 170.A H 2.838 1.863 THR 172.A N ALA 189.A O THR 172.A H 3.261 2.354 THR 172.A OG1 GLN 174.A O THR 172.A HG1 2.753 1.901 SER 173.A N GLU 223.A OE1 SER 173.A H 2.943 1.980 SER 173.A OG GLU 223.A OE1 SER 173.A HG 2.901 2.068 GLN 174.A N GLU 223.A OE2 GLN 174.A H 2.876 1.865 GLN 174.A NE2 GLU 223.A OE2 GLN 174.A HE21 3.179 2.274 GLY 175.A N TRP 192.A O GLY 175.A H 3.054 2.227 ALA 176.A N GLN 174.A O ALA 176.A H 2.821 2.014 LYS 178.A NZ ASP 106.A OD2 LYS 178.A HZ1 2.718 1.863 LYS 178.A NZ GLY 175.A O LYS 178.A HZ3 2.603 1.695 LYS 178.A NZ GLU 193.A OE1 LYS 178.A HZ2 2.813 1.818 TYR 179.A OH ASP 106.A O TYR 179.A HH 2.721 1.991 SER 181.A N PHE 177.A O SER 181.A H 2.837 1.864 SER 181.A OG VAL 186.A O SER 181.A HG 2.642 1.752 LYS 182.A N LYS 178.A O LYS 182.A H 2.980 2.043 LYS 182.A NZ ASP 92.A O LYS 182.A HZ2 2.731 1.969 ALA 183.A N TYR 179.A O ALA 183.A H 3.129 2.164 TYR 184.A N PHE 180.A O TYR 184.A H 2.965 1.982 TYR 184.A OH ASP 153.A OD1 TYR 184.A HH 2.721 1.742 GLY 185.A N SER 181.A O GLY 185.A H 3.010 2.228 VAL 186.A N SER 181.A O VAL 186.A H 3.419 2.620 ALA 189.A N ILE 170.A O ALA 189.A H 3.052 2.078 ILE 191.A N SER 173.A O ILE 191.A H 2.907 2.076 TRP 192.A N SER 173.A O TRP 192.A H 2.966 2.014 ILE 194.A N GLU 193.A OE1 ILE 194.A H 2.834 1.900 THR 196.A N GLU 193.A O THR 196.A H 3.284 2.366 THR 196.A OG1 GLU 193.A O THR 196.A HG1 2.869 2.026 GLY 200.A N GLN 204.A OE1 GLY 200.A H 2.755 1.825 THR 201.A N GLN 204.A OE1 THR 201.A H 3.113 2.177 GLN 204.A N THR 201.A OG1 GLN 204.A H 3.197 2.203 GLN 204.A NE2 GLU 198.A O GLN 204.A HE22 2.932 1.954 ILE 205.A N THR 201.A O ILE 205.A H 3.040 2.043 LYS 206.A N PRO 202.A O LYS 206.A H 2.863 1.875 THR 207.A N GLU 203.A O THR 207.A H 2.965 2.000 THR 207.A OG1 GLU 203.A O THR 207.A HG1 3.025 2.095 LEU 208.A N GLN 204.A O LEU 208.A H 3.132 2.168 VAL 209.A N ILE 205.A O VAL 209.A H 2.889 1.892 GLU 210.A N LYS 206.A O GLU 210.A H 2.931 1.937 LYS 211.A N THR 207.A O LYS 211.A H 3.240 2.298 LEU 212.A N LEU 208.A O LEU 212.A H 2.911 1.941 ARG 213.A N VAL 209.A O ARG 213.A H 2.994 2.069 GLN 214.A N LYS 211.A O GLN 214.A H 3.151 2.230 THR 215.A N LEU 212.A O THR 215.A H 2.985 1.985 THR 215.A OG1 LEU 212.A O THR 215.A HG1 2.832 1.845 VAL 217.A N THR 215.A OG1 VAL 217.A H 3.380 2.368 SER 219.A OG GLY 275.A O SER 219.A HG 2.778 1.965 LEU 220.A N PRO 241.A O LEU 220.A H 2.842 1.876 PHE 221.A N VAL 171.A O PHE 221.A H 3.037 2.149 VAL 222.A N ALA 244.A O VAL 222.A H 3.265 2.329 GLU 223.A N GLU 223.A OE1 GLU 223.A H 2.731 1.869 SER 224.A N ILE 246.A O SER 224.A H 2.967 2.017 VAL 226.A N GLU 223.A O VAL 226.A H 3.428 2.417 ARG 229.A N ASP 227.A OD1 ARG 229.A H 3.050 2.038 ARG 229.A NE ASP 227.A OD1 ARG 229.A HE 3.121 2.126 ARG 229.A NE ASP 227.A OD2 ARG 229.A HE 3.361 2.546 ARG 229.A NH2 ASP 227.A OD2 ARG 229.A HH21 2.868 1.881 LYS 232.A N ASP 228.A O LYS 232.A H 2.939 1.952 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.998 2.046 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.093 2.193 VAL 234.A N PRO 230.A O VAL 234.A H 2.998 2.019 SER 235.A N MET 231.A O SER 235.A H 2.782 1.789 GLN 236.A N LYS 232.A O GLN 236.A H 2.989 2.007 ASP 237.A N THR 233.A O ASP 237.A H 2.804 1.828 THR 238.A N VAL 234.A O THR 238.A H 3.016 2.149 THR 238.A OG1 VAL 234.A O THR 238.A HG1 2.774 1.915 ASN 239.A N GLN 236.A O ASN 239.A H 3.447 2.531 ILE 240.A N SER 235.A O ILE 240.A H 3.258 2.549 ILE 240.A N THR 238.A OG1 ILE 240.A H 3.238 2.347 TYR 243.A N LEU 220.A O TYR 243.A H 2.879 1.927 TYR 243.A OH GLU 274.A OE1 TYR 243.A HH 3.154 2.301 ILE 246.A N VAL 222.A O ILE 246.A H 2.890 2.008 PHE 247.A N ASN 268.A OD1 PHE 247.A H 2.891 1.921 SER 250.A OG ILE 251.A O SER 250.A HG 2.885 1.928 ILE 251.A N SER 9.A OG ILE 251.A H 3.349 2.372 ALA 252.A N GLY 258.A O ALA 252.A H 2.886 1.880 GLU 253.A N GLU 253.A OE1 GLU 253.A H 2.899 2.105 GLY 255.A N ASP 259.A OD2 GLY 255.A H 2.894 1.916 LYS 256.A N GLU 253.A O LYS 256.A H 3.010 2.020 TYR 261.A N ASP 13.A OD2 TYR 261.A H 2.862 1.881 TYR 261.A OH TRP 110.A O TYR 261.A HH 2.714 1.750 SER 263.A N SER 260.A OG SER 263.A H 2.887 1.896 SER 263.A OG ASP 259.A OD1 SER 263.A HG 3.513 2.773 MET 264.A N SER 260.A O MET 264.A H 2.824 1.836 MET 265.A N TYR 261.A O MET 265.A H 3.017 2.029 LYS 266.A N TYR 262.A O LYS 266.A H 2.877 1.907 LYS 266.A NZ ASP 270.A OD2 LYS 266.A HZ3 2.892 1.910 TYR 267.A N SER 263.A O TYR 267.A H 2.959 1.953 TYR 267.A OH GLN 245.A O TYR 267.A HH 2.963 2.235 ASN 268.A N MET 264.A O ASN 268.A H 2.984 1.977 ASN 268.A ND2 PHE 247.A O ASN 268.A HD22 2.782 1.794 LEU 269.A N MET 265.A O LEU 269.A H 2.806 1.797 ASP 270.A N LYS 266.A O ASP 270.A H 2.915 1.914 LYS 271.A N TYR 267.A O LYS 271.A H 2.854 1.875 LYS 271.A NZ GLU 274.A OE1 LYS 271.A HZ2 3.464 2.551 ILE 272.A N ASN 268.A O ILE 272.A H 2.904 1.902 ALA 273.A N LEU 269.A O ALA 273.A H 3.000 2.011 GLU 274.A N ASP 270.A O GLU 274.A H 2.872 1.909 GLY 275.A N LYS 271.A O GLY 275.A H 2.857 1.863 LEU 276.A N ILE 272.A O LEU 276.A H 2.934 1.966 ALA 277.A N ALA 273.A O ALA 277.A H 3.171 2.396 ALA 277.A N GLU 274.A O ALA 277.A H 3.317 2.483 LYS 278.A N GLY 275.A O LYS 278.A H 3.410 2.428