Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3zk9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ ASP 21.A O LYS 1.A HZ2 2.762 1.853 LYS 3.A N ASP 52.A OD2 LYS 3.A H 2.864 1.861 VAL 4.A N ASP 24.A O VAL 4.A H 2.866 1.871 VAL 5.A N LEU 53.A O VAL 5.A H 2.922 1.978 ALA 6.A N HIS 26.A O ALA 6.A H 2.926 1.973 THR 7.A N PHE 55.A O THR 7.A H 3.045 2.270 THR 7.A OG1 GLU 62.A OE2 THR 7.A HG1 2.687 1.815 SER 9.A OG SER 250.A OG SER 9.A HG 3.103 2.339 ILE 11.A N ASN 8.A OD1 ILE 11.A H 2.990 1.999 ALA 12.A N ASN 8.A O ALA 12.A H 2.896 1.899 ASP 13.A N SER 9.A O ASP 13.A H 2.938 2.004 ILE 14.A N ILE 10.A O ILE 14.A H 2.997 2.000 THR 15.A N ILE 11.A O THR 15.A H 2.956 1.958 THR 15.A OG1 ILE 11.A O THR 15.A HG1 2.827 2.042 LYS 16.A N ALA 12.A O LYS 16.A H 2.930 2.002 ASN 17.A N ASP 13.A O ASN 17.A H 3.131 2.208 ASN 17.A ND2 ASP 13.A O ASN 17.A HD21 2.889 1.897 ILE 18.A N ILE 14.A O ILE 18.A H 3.198 2.375 ILE 18.A N THR 15.A O ILE 18.A H 3.060 2.297 ALA 19.A N THR 15.A O ALA 19.A H 2.806 1.837 GLY 20.A N LYS 16.A O GLY 20.A H 2.895 1.945 LYS 22.A N ALA 19.A O LYS 22.A H 3.086 2.079 ASP 24.A N LEU 2.A O ASP 24.A H 2.860 1.851 HIS 26.A N VAL 4.A O HIS 26.A H 2.926 1.989 HIS 26.A NE2 ASP 44.A OD1 HIS 26.A HE2 2.810 1.835 ILE 28.A N ALA 6.A O ILE 28.A H 2.963 2.085 VAL 29.A N THR 7.A O VAL 29.A H 2.909 1.914 GLY 32.A N SER 250.A OG GLY 32.A H 2.792 1.845 GLN 33.A N PRO 30.A O GLN 33.A H 3.081 2.077 ASP 34.A N GLN 33.A OE1 ASP 34.A H 3.218 2.288 HIS 36.A N ASP 34.A OD1 HIS 36.A H.A 2.910 2.036 TYR 38.A N PRO 35.A O TYR 38.A H 3.276 2.302 LEU 41.A N ASP 44.A OD2 LEU 41.A H 2.919 1.943 VAL 45.A N LEU 41.A O VAL 45.A H 3.163 2.234 LYS 46.A N PRO 42.A O LYS 46.A H 2.973 1.979 LYS 46.A NZ GLU 50.A OE2 LYS 46.A HZ1 2.814 2.039 LYS 47.A N GLU 43.A O LYS 47.A H 2.915 1.914 THR 48.A N ASP 44.A O THR 48.A H 2.913 1.953 THR 48.A OG1 ASP 44.A O THR 48.A HG1 2.791 1.898 SER 49.A N VAL 45.A O SER 49.A H 3.018 2.038 GLU 50.A N LYS 46.A O GLU 50.A H 3.093 2.210 ALA 51.A N THR 48.A O ALA 51.A H 3.283 2.317 ASP 52.A N LYS 3.A O ASP 52.A H 2.805 1.950 LEU 53.A N LYS 3.A O LEU 53.A H 3.149 2.285 ILE 54.A N ASP 83.A O ILE 54.A H 2.838 1.932 PHE 55.A N VAL 5.A O PHE 55.A H 2.808 1.837 TYR 56.A N PHE 85.A O TYR 56.A H 3.118 2.139 ASN 57.A N GLU 62.A OE2 ASN 57.A H 2.932 1.921 ASN 57.A ND2 GLY 58.A O ASN 57.A HD21 2.940 1.964 ASN 57.A ND2 PRO 107.A O ASN 57.A HD22 3.117 2.204 GLY 58.A N GLU 62.A OE1 GLY 58.A H 3.154 2.218 LEU 61.A N GLY 58.A O LEU 61.A H 3.102 2.118 ASN 66.A N GLU 37.A OE1 ASN 66.A H 3.045 2.051 ASN 66.A ND2 TYR 38.A O ASN 66.A HD22 3.136 2.167 ASN 66.A ND2 GLU 39.A OE2 ASN 66.A HD21 3.168 2.249 ALA 67.A N GLY 64.A O ALA 67.A H 2.863 1.919 TRP 68.A N ASN 66.A OD1 TRP 68.A H 3.131 2.376 TRP 68.A NE1 PRO 35.A O TRP 68.A HE1 2.654 1.814 PHE 69.A N GLU 62.A O PHE 69.A H 3.089 2.085 LYS 71.A N ALA 67.A O LYS 71.A H 3.222 2.226 LEU 72.A N TRP 68.A O LEU 72.A H 2.924 1.987 VAL 73.A N PHE 69.A O VAL 73.A H 3.005 2.018 GLU 74.A N THR 70.A O GLU 74.A H 3.009 2.018 ASN 75.A N LYS 71.A O ASN 75.A H 2.969 1.969 ALA 76.A N LEU 72.A O ALA 76.A H 2.996 2.098 LYS 77.A N GLU 74.A O LYS 77.A H 3.093 2.123 LYS 78.A N VAL 73.A O LYS 78.A H 3.058 2.047 LYS 78.A NZ SER 49.A O LYS 78.A HZ2 3.112 2.308 LYS 78.A NZ ALA 51.A O LYS 78.A HZ3 2.815 1.887 THR 79.A N ASP 83.A OD2 THR 79.A H 2.779 1.794 ASN 81.A N TYR 84.A O ASN 81.A H 2.795 1.831 LYS 82.A N THR 79.A O LYS 82.A H 3.183 2.208 ASP 83.A N THR 79.A O ASP 83.A H 2.837 1.873 TYR 84.A N THR 79.A O TYR 84.A H 3.271 2.319 PHE 85.A N ILE 54.A O PHE 85.A H 2.892 2.001 VAL 87.A N TYR 56.A O VAL 87.A H 2.896 1.920 SER 88.A N ASN 57.A O SER 88.A H 3.507 2.622 SER 88.A OG ASN 57.A O SER 88.A HG 2.628 1.682 ASP 89.A N ALA 86.A O ASP 89.A H 3.199 2.185 VAL 91.A N SER 88.A O VAL 91.A H 2.935 1.922 ILE 94.A N TYR 179.A OH ILE 94.A H 2.967 2.122 LEU 96.A N LYS 104.A O LEU 96.A H 2.786 1.809 GLY 98.A N TYR 95.A O GLY 98.A H 2.971 2.025 GLN 99.A N LEU 96.A O GLN 99.A H 3.182 2.223 GLN 99.A NE2 GLU 97.A O GLN 99.A HE21 3.590 2.956 GLY 103.A N GLU 105.A OE1 GLY 103.A H 2.828 2.020 LYS 104.A N GLU 101.A O LYS 104.A H 3.094 2.120 LYS 104.A NZ GLU 101.A OE2 LYS 104.A HZ3 2.935 1.947 GLU 105.A N GLU 105.A OE1 GLU 105.A H 2.834 1.880 ASP 106.A N ILE 94.A O ASP 106.A H 2.844 1.835 HIS 108.A N ASP 106.A OD1 HIS 108.A H 3.026 2.018 HIS 108.A ND1 ASP 106.A OD1 HIS 108.A HD1 2.771 1.857 ALA 109.A N PRO 107.A O ALA 109.A H 2.817 1.962 TRP 110.A NE1 THR 248.A O TRP 110.A HE1 2.763 1.848 LEU 111.A N HIS 108.A O LEU 111.A H 3.347 2.337 ASN 112.A N ALA 109.A O ASN 112.A H 3.380 2.384 ASN 112.A ND2 TYR 179.A O ASN 112.A HD21 2.981 1.976 LEU 113.A N TYR 184.A OH LEU 113.A H 3.162 2.166 ASN 115.A N ASN 112.A O ASN 115.A H 3.276 2.565 ASN 115.A N ASN 112.A OD1 ASN 115.A H 2.898 1.956 ASN 115.A ND2 ALA 109.A O ASN 115.A HD21 2.946 2.014 GLY 116.A N ASN 112.A O GLY 116.A H 3.197 2.261 ILE 117.A N LEU 113.A O ILE 117.A H 2.890 1.943 ILE 118.A N GLU 114.A O ILE 118.A H 3.129 2.200 PHE 119.A N ASN 115.A O PHE 119.A H 2.839 1.873 ALA 120.A N GLY 116.A O ALA 120.A H 2.990 2.026 LYS 121.A N ILE 117.A O LYS 121.A H 2.844 1.865 ASN 122.A N ILE 118.A O ASN 122.A H 2.936 1.944 ASN 122.A ND2 VAL 87.A O ASN 122.A HD21 2.868 1.904 ASN 122.A ND2 ASP 89.A O ASN 122.A HD22 2.814 1.834 ILE 123.A N PHE 119.A O ILE 123.A H 2.957 1.988 ALA 124.A N ALA 120.A O ALA 124.A H 2.876 1.879 LYS 125.A N LYS 121.A O LYS 125.A H 2.975 2.011 GLN 126.A N ASN 122.A O GLN 126.A H 3.101 2.140 LEU 127.A N ILE 123.A O LEU 127.A H 2.928 1.927 SER 128.A N ALA 124.A O SER 128.A H 2.960 1.959 SER 128.A OG ALA 124.A O SER 128.A HG 2.956 2.311 ALA 129.A N LYS 125.A O ALA 129.A H 3.052 2.146 LYS 130.A N GLN 126.A O LYS 130.A H 3.155 2.190 LYS 130.A NZ LYS 82.A O LYS 130.A HZ3 2.749 1.835 ASP 131.A N LEU 127.A O ASP 131.A H 2.854 2.020 ASN 134.A N ASP 131.A O ASN 134.A H 3.035 2.085 ASN 134.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 134.A HD21 2.798 1.816 LYS 135.A N PRO 132.A O LYS 135.A H 3.112 2.109 LYS 135.A NZ GLU 139.A OE2 LYS 135.A HZ1 2.737 1.885 TYR 138.A N ASN 134.A O TYR 138.A H 2.963 1.997 GLU 139.A N LYS 135.A O GLU 139.A H 2.936 1.968 LYS 140.A N GLU 136.A O LYS 140.A H 2.901 1.959 ASN 141.A N PHE 137.A O ASN 141.A H 3.009 2.005 ASN 141.A ND2 ILE 18.A O ASN 141.A HD21 2.826 1.825 LEU 142.A N TYR 138.A O LEU 142.A H 2.826 1.884 LYS 143.A N GLU 139.A O LYS 143.A H 3.006 2.022 LYS 143.A NZ ASP 147.A OD1 LYS 143.A HZ2 3.184 2.490 GLU 144.A N LYS 140.A O GLU 144.A H 3.092 2.093 TYR 145.A N ASN 141.A O TYR 145.A H 2.899 1.947 THR 146.A N LEU 142.A O THR 146.A H 2.809 1.809 THR 146.A OG1 LEU 142.A O THR 146.A HG1 3.068 2.273 ASP 147.A N LYS 143.A O ASP 147.A H 2.963 1.994 LYS 148.A N GLU 144.A O LYS 148.A H 3.147 2.230 LEU 149.A N TYR 145.A O LEU 149.A H 2.995 2.021 ASP 150.A N THR 146.A O ASP 150.A H 2.809 1.828 LYS 151.A N ASP 147.A O LYS 151.A H 2.967 2.021 LEU 152.A N LYS 148.A O LEU 152.A H 3.284 2.285 ASP 153.A N LEU 149.A O ASP 153.A H 2.920 1.970 LYS 154.A N ASP 150.A O LYS 154.A H 2.915 1.927 LYS 154.A NZ ASP 150.A OD2 LYS 154.A HZ3 2.848 1.955 GLU 155.A N LYS 151.A O GLU 155.A H 2.996 2.000 SER 156.A N LEU 152.A O SER 156.A H 2.923 1.983 SER 156.A OG LEU 152.A O SER 156.A HG 2.791 1.878 LYS 157.A N ASP 153.A O LYS 157.A H 2.918 1.931 LYS 157.A NZ GLU 114.A OE1 LYS 157.A HZ2 2.879 1.880 LYS 157.A NZ ASP 153.A OD2 LYS 157.A HZ3 2.825 1.944 ASP 158.A N LYS 154.A O ASP 158.A H 3.000 2.028 LYS 159.A N GLU 155.A O LYS 159.A H 3.210 2.272 PHE 160.A N SER 156.A O PHE 160.A H 2.982 1.995 ASN 161.A N LYS 157.A O ASN 161.A H 2.921 1.962 LYS 162.A N ASP 158.A O LYS 162.A H 3.410 2.621 LYS 162.A N LYS 159.A O LYS 162.A H 3.182 2.336 LYS 162.A NZ ASP 158.A O LYS 162.A HZ1 3.469 2.741 ILE 163.A N PHE 160.A O ILE 163.A H 3.057 2.086 GLU 166.A N GLU 166.A OE1 GLU 166.A H 2.797 1.839 LYS 167.A N PRO 164.A O LYS 167.A H 2.952 1.977 LYS 167.A NZ LYS 278.A O LYS 167.A HZ1 2.772 1.806 LYS 168.A N ALA 165.A O LYS 168.A H 3.056 2.043 ILE 170.A N PRO 187.A O ILE 170.A H 2.811 1.846 THR 172.A N ALA 189.A O THR 172.A H 3.228 2.323 THR 172.A OG1 GLU 174.A O THR 172.A HG1 2.741 1.942 SER 173.A N GLU 223.A OE1 SER 173.A H 2.894 1.922 SER 173.A OG GLU 223.A OE1 SER 173.A HG 2.894 2.014 GLU 174.A N GLU 223.A OE2 GLU 174.A H 2.869 1.859 GLY 175.A N TRP 192.A O GLY 175.A H 2.938 2.065 ALA 176.A N GLU 174.A O ALA 176.A H 2.804 1.965 LYS 178.A NZ GLY 175.A O LYS 178.A HZ3 2.927 2.023 LYS 178.A NZ GLU 193.A OE1 LYS 178.A HZ2 3.499 2.702 LYS 178.A NZ GLU 193.A OE2 LYS 178.A HZ2 2.673 1.827 TYR 179.A OH ASP 106.A O TYR 179.A HH 2.725 1.762 SER 181.A N PHE 177.A O SER 181.A H 2.844 1.881 SER 181.A OG VAL 186.A O SER 181.A HG 2.761 1.859 LYS 182.A N LYS 178.A O LYS 182.A H 3.010 2.071 ALA 183.A N TYR 179.A O ALA 183.A H 3.123 2.130 TYR 184.A N PHE 180.A O TYR 184.A H 2.953 1.969 TYR 184.A OH ASP 153.A OD1 TYR 184.A HH 2.737 1.756 GLY 185.A N SER 181.A O GLY 185.A H 2.972 2.172 VAL 186.A N SER 181.A O VAL 186.A H 3.401 2.552 ALA 189.A N ILE 170.A O ALA 189.A H 3.044 2.063 TYR 190.A OH GLU 193.A OE1 TYR 190.A HH 2.848 1.905 ILE 191.A N THR 172.A O ILE 191.A H 3.400 2.606 ILE 191.A N SER 173.A O ILE 191.A H 2.883 2.090 TRP 192.A N SER 173.A O TRP 192.A H 2.902 1.950 TRP 192.A NE1 GLU 174.A OE1 TRP 192.A HE1 2.903 1.974 ILE 194.A N GLU 193.A OE2 ILE 194.A H 2.805 1.873 THR 196.A OG1 GLU 193.A O THR 196.A HG1 2.612 1.888 GLU 197.A N GLU 197.A OE1 GLU 197.A H 2.631 1.699 GLY 200.A N GLN 204.A OE1 GLY 200.A H 2.786 1.906 THR 201.A N GLN 204.A OE1 THR 201.A H 3.099 2.144 GLN 204.A N THR 201.A OG1 GLN 204.A H 3.063 2.061 GLN 204.A NE2 GLU 198.A O GLN 204.A HE22 2.947 1.989 ILE 205.A N THR 201.A O ILE 205.A H 2.947 1.955 LYS 206.A N PRO 202.A O LYS 206.A H 2.890 1.881 THR 207.A N GLU 203.A O THR 207.A H 2.991 2.038 LEU 208.A N GLN 204.A O LEU 208.A H 3.152 2.196 VAL 209.A N ILE 205.A O VAL 209.A H 2.908 1.914 GLU 210.A N LYS 206.A O GLU 210.A H 2.936 1.976 LYS 211.A N THR 207.A O LYS 211.A H 3.185 2.225 LEU 212.A N LEU 208.A O LEU 212.A H 2.857 1.876 ARG 213.A N VAL 209.A O ARG 213.A H 3.001 2.107 GLN 214.A N LYS 211.A O GLN 214.A H 3.041 2.113 THR 215.A N LEU 212.A O THR 215.A H 2.971 2.014 THR 215.A OG1 LEU 212.A O THR 215.A HG1 2.868 1.878 VAL 217.A N THR 215.A OG1 VAL 217.A H 3.309 2.298 SER 219.A OG GLY 275.A O SER 219.A HG 2.712 1.866 LEU 220.A N PRO 241.A O LEU 220.A H 2.862 1.870 PHE 221.A N VAL 171.A O PHE 221.A H 3.040 2.122 VAL 222.A N ALA 244.A O VAL 222.A H 3.234 2.304 GLU 223.A N GLU 223.A OE1 GLU 223.A H 2.686 1.819 SER 224.A N ILE 246.A O SER 224.A H 2.910 1.980 SER 225.A OG THR 248.A OG1 SER 225.A HG 3.274 2.407 VAL 226.A N GLU 223.A O VAL 226.A H 3.349 2.334 ARG 229.A N ASP 227.A OD1 ARG 229.A H 3.023 2.025 ARG 229.A NE ASP 227.A OD1 ARG 229.A HE 3.060 2.058 ARG 229.A NE ASP 227.A OD2 ARG 229.A HE 3.308 2.512 ARG 229.A NH2 ASP 227.A OD2 ARG 229.A HH21 2.768 1.781 LYS 232.A N ASP 228.A O LYS 232.A H 2.923 1.942 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.988 2.046 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.045 2.373 VAL 234.A N PRO 230.A O VAL 234.A H 2.974 2.015 SER 235.A N MET 231.A O SER 235.A H 2.846 1.869 SER 235.A OG ILE 240.A O SER 235.A HG 2.678 2.054 GLN 236.A N LYS 232.A O GLN 236.A H 2.933 1.955 ASP 237.A N THR 233.A O ASP 237.A H 2.908 1.944 THR 238.A N VAL 234.A O THR 238.A H 2.901 1.997 ASN 239.A N SER 235.A O ASN 239.A H 2.820 2.056 ILE 240.A N THR 238.A OG1 ILE 240.A H 3.203 2.314 TYR 243.A N LEU 220.A O TYR 243.A H 2.844 1.914 TYR 243.A OH GLU 274.A OE1 TYR 243.A HH 2.700 1.805 ILE 246.A N VAL 222.A O ILE 246.A H 2.840 1.951 PHE 247.A N ASN 268.A OD1 PHE 247.A H 2.921 1.946 SER 250.A OG ILE 251.A O SER 250.A HG 2.747 1.783 ILE 251.A N SER 9.A OG ILE 251.A H 3.268 2.315 ALA 252.A N GLY 258.A O ALA 252.A H 2.832 1.835 GLY 255.A N ASP 259.A OD2 GLY 255.A H 2.786 1.831 LYS 256.A N GLU 253.A O LYS 256.A H 3.138 2.144 ASP 259.A N LYS 256.A O ASP 259.A H 3.272 2.563 TYR 261.A N ASP 13.A OD2 TYR 261.A H 2.819 1.831 TYR 261.A OH TRP 110.A O TYR 261.A HH 2.738 1.870 SER 263.A N SER 260.A OG SER 263.A H 2.949 1.954 MET 264.A N SER 260.A O MET 264.A H 2.828 1.845 MET 265.A N TYR 261.A O MET 265.A H 2.949 1.960 LYS 266.A N TYR 262.A O LYS 266.A H 2.817 1.833 LYS 266.A NZ ASP 270.A OD2 LYS 266.A HZ2 2.645 1.639 TYR 267.A N SER 263.A O TYR 267.A H 2.878 1.896 TYR 267.A OH GLN 245.A O TYR 267.A HH 3.157 2.230 ASN 268.A N MET 264.A O ASN 268.A H 3.009 2.016 ASN 268.A ND2 PHE 247.A O ASN 268.A HD22 2.909 1.947 LEU 269.A N MET 265.A O LEU 269.A H 2.801 1.794 ASP 270.A N LYS 266.A O ASP 270.A H 2.835 1.844 LYS 271.A N TYR 267.A O LYS 271.A H 2.888 1.904 ILE 272.A N ASN 268.A O ILE 272.A H 2.893 1.920 ALA 273.A N LEU 269.A O ALA 273.A H 2.913 1.910 GLU 274.A N ASP 270.A O GLU 274.A H 2.957 1.977 GLY 275.A N LYS 271.A O GLY 275.A H 2.816 1.826 LEU 276.A N ILE 272.A O LEU 276.A H 2.955 2.001 ALA 277.A N ALA 273.A O ALA 277.A H 3.296 2.551 ALA 277.A N GLU 274.A O ALA 277.A H 3.264 2.397 LYS 278.A N GLY 275.A O LYS 278.A H 3.514 2.516