Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4b88_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 5.A N GLN 1.A O GLN 5.A H 2.989 2.172 LEU 6.A N LEU 2.A O LEU 6.A H 2.930 2.154 ALA 7.A N SER 3.A O ALA 7.A H 3.287 2.510 GLU 8.A N GLU 4.A O GLU 8.A H 3.289 2.511 LEU 9.A N GLN 5.A O LEU 9.A H 2.919 2.103 GLU 10.A N LEU 6.A O GLU 10.A H 2.891 2.152 ARG 12.A N GLU 8.A O ARG 12.A H.A 3.394 2.596 SER 13.A N GLU 10.A O SER 13.A H 3.017 2.263 ARG 16.A N THR 236.A O ARG 16.A H 2.803 1.947 ARG 16.A NE GLU 237.A OE2 ARG 16.A HE 3.194 2.349 ARG 16.A NH1 GLU 36.A OE1 ARG 16.A HH11 3.004 2.255 ARG 16.A NH1 ARG 37.A O ARG 16.A HH12 3.085 2.315 ARG 16.A NH2 ARG 37.A O ARG 16.A HH22 3.044 2.260 LEU 17.A N GLU 10.A OE2 LEU 17.A H 2.878 2.025 GLY 18.A N TYR 234.A O GLY 18.A H 2.701 1.854 VAL 19.A N TYR 32.A O VAL 19.A H 2.958 2.133 ALA 20.A N THR 232.A O ALA 20.A H 3.023 2.239 VAL 21.A N ILE 30.A O VAL 21.A H 2.768 1.939 LEU 22.A N VAL 230.A O LEU 22.A H 2.864 2.030 ASP 23.A N ARG 28.A O ASP 23.A H 2.905 2.051 THR 24.A N PRO 228.A O THR 24.A H 3.191 2.379 THR 24.A OG1 PRO 228.A O THR 24.A HG1 2.717 1.913 ALA 25.A N ASP 23.A OD1 ALA 25.A H 2.865 2.052 THR 26.A OG1 ASP 23.A OD2 THR 26.A HG1 3.117 2.434 GLY 27.A N ASP 23.A O GLY 27.A H 2.692 1.955 ARG 28.A N THR 26.A OG1 ARG 28.A H 3.220 2.374 ILE 30.A N VAL 21.A O ILE 30.A H 2.837 2.013 TYR 32.A N VAL 19.A O TYR 32.A H 2.843 2.023 ARG 33.A NE GLU 10.A OE2 ARG 33.A HE 2.720 1.897 ARG 33.A NH1 GLU 36.A OE2 ARG 33.A HH11 2.902 2.096 ARG 33.A NH2 GLU 10.A OE1 ARG 33.A HH21 2.984 2.146 ARG 33.A NH2 GLU 10.A OE2 ARG 33.A HH21 3.398 2.789 GLU 36.A N ARG 33.A O GLU 36.A H 3.246 2.412 ARG 37.A NH1 VAL 131.A O ARG 37.A HH12 3.032 2.273 ARG 37.A NH1 THR 152.A OG1 ARG 37.A HH11 2.831 2.049 ARG 37.A NH2 VAL 131.A O ARG 37.A HH22 3.109 2.374 PHE 38.A N THR 153.A O PHE 38.A H 2.900 2.088 MET 40.A N ASP 151.A O MET 40.A H 3.069 2.220 SER 42.A OG SER 102.A OG SER 42.A HG 3.266 2.644 THR 43.A N MET 40.A O THR 43.A H 3.140 2.334 THR 43.A OG1 MET 40.A O THR 43.A HG1 2.735 1.930 PHE 44.A N CYS 41.A O PHE 44.A H 3.355 2.498 LYS 45.A N SER 42.A O LYS 45.A H 3.024 2.178 LYS 45.A NZ SER 42.A OG LYS 45.A HZ3 2.893 2.113 LYS 45.A NZ SER 102.A O LYS 45.A HZ1 2.901 2.168 LYS 45.A NZ ASN 104.A OD1 LYS 45.A HZ2 2.707 1.849 ALA 46.A N THR 43.A O ALA 46.A H 3.330 2.525 LEU 47.A N PHE 44.A O LEU 47.A H 2.910 2.284 LEU 48.A N PHE 44.A O LEU 48.A H 3.012 2.194 ALA 49.A N LYS 45.A O ALA 49.A H 3.070 2.250 ALA 50.A N ALA 46.A O ALA 50.A H 3.239 2.445 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 2.956 2.176 VAL 52.A N LEU 48.A O VAL 52.A H 3.123 2.309 LEU 53.A N ALA 49.A O LEU 53.A H 3.015 2.179 ALA 54.A N ALA 50.A O ALA 54.A H 2.858 2.069 ARG 55.A N ALA 51.A O ARG 55.A H 3.313 2.559 ARG 55.A NH2 LEU 114.A O ARG 55.A HH22 2.890 2.286 VAL 56.A N VAL 52.A O VAL 56.A H 3.027 2.235 ASP 57.A N LEU 53.A O ASP 57.A H 2.831 1.996 GLN 58.A N ALA 54.A O GLN 58.A H 3.210 2.520 GLN 58.A N ARG 55.A O GLN 58.A H 3.194 2.552 GLY 59.A N VAL 56.A O GLY 59.A H 2.945 2.114 LYS 60.A N ARG 55.A O LYS 60.A H 2.848 2.041 ARG 62.A N GLU 61.A OE1 ARG 62.A H 2.825 2.039 ARG 62.A NH1 ASP 64.A OD1 ARG 62.A HH11 3.155 2.402 ARG 65.A N ARG 62.A O ARG 65.A H 3.192 2.337 ARG 65.A NE GLU 61.A OE1 ARG 65.A HE 2.795 1.934 ARG 65.A NH2 GLU 61.A OE2 ARG 65.A HH21 2.759 1.908 ARG 66.A NH1 ASP 87.A O ARG 66.A HH11 3.029 2.332 ILE 67.A N MET 89.A O ILE 67.A H 2.767 1.907 GLY 70.A N ASP 73.A OD2 GLY 70.A H 2.848 1.989 ASP 73.A N GLY 70.A O ASP 73.A H 2.944 2.129 LEU 74.A N LYS 71.A O LEU 74.A H 3.184 2.376 VAL 75.A N THR 105.A OG1 VAL 75.A H 2.966 2.142 SER 78.A OG THR 105.A OG1 SER 78.A HG 2.600 1.952 VAL 80.A N ASP 103.A OD2 VAL 80.A H 2.905 2.201 THR 81.A N ASP 103.A OD2 THR 81.A H 2.879 2.049 THR 81.A OG1 ASP 103.A OD2 THR 81.A HG1 3.173 2.356 GLU 82.A N SER 78.A O GLU 82.A H 3.162 2.353 LYS 83.A N VAL 80.A O LYS 83.A H 3.086 2.310 HIS 84.A N THR 81.A O HIS 84.A H 3.098 2.267 HIS 84.A ND1 ASP 87.A OD2 HIS 84.A HD1 3.006 2.191 ASP 87.A N ASP 87.A OD1 ASP 87.A H 2.584 1.916 GLY 88.A N HIS 84.A O GLY 88.A H 2.868 2.096 MET 89.A N ILE 67.A O MET 89.A H 3.021 2.217 THR 90.A N GLU 93.A OE1 THR 90.A H 3.001 2.175 VAL 91.A N ARG 65.A O VAL 91.A H 2.904 2.197 ALA 92.A N LEU 63.A O ALA 92.A H 2.986 2.151 GLU 93.A N THR 90.A OG1 GLU 93.A H 3.174 2.344 LEU 94.A N THR 90.A O LEU 94.A H 2.895 2.089 CYS 95.A N VAL 91.A O CYS 95.A H 2.972 2.167 CYS 95.A SG VAL 91.A O CYS 95.A HG 3.495 2.511 GLU 96.A N ALA 92.A O GLU 96.A H 3.005 2.169 ALA 97.A N GLU 93.A O ALA 97.A H 2.962 2.119 ALA 98.A N LEU 94.A O ALA 98.A H 2.896 2.065 ILE 99.A N CYS 95.A O ILE 99.A H.B 2.970 2.178 THR 100.A N GLU 96.A O THR 100.A H 2.835 1.978 THR 100.A OG1 GLU 96.A O THR 100.A HG1 2.866 2.073 LEU 101.A N ALA 97.A O LEU 101.A H 3.197 2.392 ASP 103.A N ALA 97.A O ASP 103.A H 3.100 2.242 ASN 104.A N TYR 77.A O.A ASN 104.A H 2.897 2.038 ASN 104.A N TYR 77.A O.B ASN 104.A H 2.935 2.086 ASN 104.A ND2 ASP 76.A O.A ASN 104.A HD21 3.029 2.224 ASN 104.A ND2 ASP 76.A O.B ASN 104.A HD21 2.941 2.169 ASN 104.A ND2 ASP 76.A OD1.B ASN 104.A HD21 3.259 2.547 THR 105.A OG1 SER 78.A OG THR 105.A HG1 2.600 1.915 ALA 106.A N ASP 103.A OD1 ALA 106.A H 2.906 2.062 ALA 107.A N ASP 103.A O ALA 107.A H 3.378 2.579 ASN 108.A N ASN 104.A O ASN 108.A H 3.097 2.280 ASN 108.A ND2 GLU 138.A O ASN 108.A HD22 3.067 2.207 LEU 109.A N THR 105.A O LEU 109.A H 2.918 2.107 LEU 110.A N ALA 106.A O LEU 110.A H 3.025 2.183 LEU 111.A N ALA 107.A O LEU 111.A H 2.878 2.041 GLU 112.A N ASN 108.A O GLU 112.A H.A 2.959 2.146 ALA 113.A N LEU 109.A O ALA 113.A H 2.992 2.159 LEU 114.A N LEU 110.A O LEU 114.A H 2.997 2.291 LEU 114.A N LEU 111.A O LEU 114.A H 3.121 2.503 GLY 115.A N LEU 111.A O GLY 115.A H 3.054 2.403 GLY 115.A N GLU 112.A O GLY 115.A H 3.168 2.457 GLY 116.A N LEU 111.A O GLY 116.A H 2.743 1.980 ALA 119.A N GLY 116.A O ALA 119.A H 2.976 2.315 LEU 120.A N GLY 116.A O LEU 120.A H 3.211 2.413 THR 121.A N PRO 117.A O THR 121.A H 2.946 2.118 THR 121.A OG1 PRO 117.A O THR 121.A HG1 2.999 2.236 ALA 122.A N ALA 118.A O ALA 122.A H 2.904 2.090 PHE 123.A N ALA 119.A O PHE 123.A H 2.953 2.135 LEU 124.A N LEU 120.A O LEU 124.A H 3.085 2.263 ARG 125.A N THR 121.A O ARG 125.A H 3.014 2.184 ARG 125.A NH1 ASP 129.A O ARG 125.A HH11 2.777 2.076 ARG 125.A NH1 THR 132.A O ARG 125.A HH12 2.865 2.092 ARG 125.A NH2 THR 132.A O ARG 125.A HH22 3.092 2.396 SER 126.A N ALA 122.A O SER 126.A H 2.988 2.244 SER 126.A OG PHE 123.A O SER 126.A HG 2.735 2.295 ILE 127.A N PHE 123.A O ILE 127.A H.B 3.236 2.619 ILE 127.A N LEU 124.A O ILE 127.A H.B 3.136 2.405 GLY 128.A N ARG 125.A O GLY 128.A H 3.212 2.384 ASP 129.A N LEU 124.A O ASP 129.A H 2.907 2.115 VAL 131.A N ASP 129.A OD1 VAL 131.A H 2.791 1.964 THR 132.A N ASP 129.A OD1 THR 132.A H 2.885 2.043 ARG 133.A N THR 152.A O ARG 133.A H 3.008 2.179 ARG 133.A NE ASP 135.A OD2 ARG 133.A HE 2.963 2.235 ARG 133.A NH2 ASP 135.A OD1 ARG 133.A HH21 2.893 2.045 ARG 133.A NH2 ASP 135.A OD2 ARG 133.A HH21 3.558 2.936 LEU 134.A N THR 121.A OG1 LEU 134.A H 3.019 2.179 ASP 135.A N ASP 151.A OD1 ASP 135.A H 2.716 1.861 ARG 136.A N ASP 151.A OD1 ARG 136.A H 2.949 2.167 ARG 136.A NE ASP 151.A OD2 ARG 136.A HE 2.746 1.949 ARG 136.A NH1 GLU 143.A OE1 ARG 136.A HH12 2.794 1.960 ARG 136.A NH2 ASP 151.A OD2 ARG 136.A HH21 2.969 2.264 GLU 138.A N ASN 108.A OD1 GLU 138.A H 2.984 2.170 GLU 140.A N GLU 140.A OE1 GLU 140.A H 2.817 2.052 LEU 141.A N TRP 137.A O LEU 141.A H 3.088 2.330 ASN 142.A N PRO 139.A O ASN 142.A H 3.270 2.417 ASN 142.A ND2 GLU 138.A OE1 ASN 142.A HD22 2.889 2.196 ASN 142.A ND2 PRO 139.A O ASN 142.A HD21 3.090 2.425 GLU 143.A N GLU 140.A O GLU 143.A H 3.180 2.366 ASP 148.A N ALA 145.A O ASP 148.A H 3.189 2.366 ARG 150.A N ASP 148.A OD1 ARG 150.A H 3.022 2.170 ARG 150.A NE ASP 148.A OD1 ARG 150.A HE 3.114 2.271 ARG 150.A NE ASP 148.A OD2 ARG 150.A HE 3.257 2.565 ARG 150.A NH2 ASP 148.A OD2 ARG 150.A HH21 2.813 2.001 ASP 151.A N ASP 135.A OD2 ASP 151.A H 2.992 2.191 THR 152.A OG1 PRO 149.A O THR 152.A HG1 2.724 2.016 THR 153.A N PHE 38.A O THR 153.A H 2.981 2.186 THR 153.A OG1 THR 132.A OG1 THR 153.A HG1 2.726 1.974 ALA 156.A N GLY 34.A O ALA 156.A H 3.034 2.186 ALA 157.A N THR 154.A OG1 ALA 157.A H 3.016 2.180 MET 158.A N THR 154.A O MET 158.A H 2.986 2.126 ALA 159.A N PRO 155.A O ALA 159.A H 3.111 2.301 ALA 160.A N ALA 156.A O ALA 160.A H 3.115 2.285 THR 161.A N ALA 157.A O THR 161.A H 2.925 2.085 THR 161.A OG1 ASP 129.A OD2 THR 161.A HG1 2.673 1.914 LEU 162.A N MET 158.A O LEU 162.A H 2.907 2.062 ARG 163.A N ALA 159.A O ARG 163.A H 2.984 2.176 THR 164.A N ALA 160.A O THR 164.A H 3.022 2.188 THR 164.A OG1 ALA 160.A O THR 164.A HG1 3.064 2.290 LEU 165.A N THR 161.A O LEU 165.A H 2.997 2.191 LEU 166.A N LEU 162.A O LEU 166.A H 2.807 1.965 LEU 167.A N ARG 163.A O LEU 167.A H 2.903 2.121 GLY 168.A N THR 164.A O GLY 168.A H 3.170 2.490 SER 172.A N ASP 57.A OD2 SER 172.A H 2.884 2.054 SER 175.A N SER 172.A OG SER 175.A H 3.268 2.430 ARG 176.A N SER 172.A O ARG 176.A H 2.911 2.058 ARG 176.A NH1 LEU 171.A O ARG 176.A HH11 2.873 2.219 GLN 177.A N PRO 173.A O GLN 177.A H 2.967 2.114 GLN 178.A N ALA 174.A O GLN 178.A H 3.023 2.199 LEU 179.A N SER 175.A O LEU 179.A H 2.978 2.157 VAL 180.A N ARG 176.A O VAL 180.A H 2.983 2.128 ASP 181.A N GLN 177.A O ASP 181.A H 2.862 2.033 TRP 182.A N GLN 178.A O TRP 182.A H 3.028 2.236 LEU 183.A N LEU 179.A O LEU 183.A H 3.065 2.241 VAL 184.A N VAL 180.A O VAL 184.A H 2.864 2.025 ALA 185.A N ASP 181.A O ALA 185.A H 3.096 2.339 ASN 186.A N LEU 183.A O ASN 186.A H 3.062 2.222 ASN 186.A ND2 THR 188.A OG1 ASN 186.A HD22 3.159 2.410 ASN 186.A ND2 ASP 205.A OD1 ASN 186.A HD21 2.947 2.096 ASN 186.A ND2 ASP 205.A OD2 ASN 186.A HD21 3.350 2.726 LYS 187.A N THR 100.A O LYS 187.A H.A 2.997 2.171 THR 188.A N ASN 186.A OD1 THR 188.A H 3.237 2.381 ARG 192.A N GLY 189.A O ARG 192.A H 3.079 2.225 ARG 192.A NE ASP 246.A OD1 ARG 192.A HE 2.866 2.224 ARG 192.A NH1 GLY 208.A O ARG 192.A HH12 2.908 2.215 ARG 192.A NH1 THR 209.A OG1 ARG 192.A HH12 3.304 2.627 ARG 192.A NH1 ASN 216.A O ARG 192.A HH11 2.987 2.250 ARG 192.A NH2 THR 209.A OG1 ARG 192.A HH22 2.818 1.983 LEU 193.A N ASP 217.A OD2 LEU 193.A H 3.158 2.330 ARG 194.A NE ASP 205.A OD1 ARG 194.A HE 2.977 2.172 ARG 194.A NH1 VAL 184.A O ARG 194.A HH12 3.549 2.849 ARG 194.A NH2 VAL 184.A O ARG 194.A HH22 3.223 2.427 ARG 194.A NH2 ASP 205.A OD1 ARG 194.A HH21 3.042 2.273 ALA 195.A N ARG 192.A O ALA 195.A H 2.946 2.202 GLY 196.A N LEU 193.A O GLY 196.A H 2.873 2.048 LEU 197.A N ARG 194.A O LEU 197.A H 3.232 2.375 ASP 200.A N.A ASP 200.A OD1.A ASP 200.A H.A 2.561 1.888 TRP 201.A N PRO 198.A O TRP 201.A H 3.236 2.417 ARG 202.A N TRP 222.A O ARG 202.A H 3.279 2.505 GLY 204.A N VAL 220.A O GLY 204.A H 3.010 2.171 ASP 205.A N LEU 183.A O ASP 205.A H 3.128 2.381 LYS 206.A N ILE 218.A O LYS 206.A H 2.927 2.148 LYS 206.A NZ SER 102.A OG LYS 206.A HZ2 2.750 1.902 LYS 206.A NZ THR 207.A O LYS 206.A HZ3 2.946 2.087 GLY 208.A N ASN 216.A O GLY 208.A H 3.112 2.306 GLY 210.A N THR 214.A O GLY 210.A H 2.946 2.138 GLY 211.A N ASN 142.A O GLY 211.A H 3.053 2.210 THR 214.A OG1 GLY 211.A O THR 214.A HG1 2.774 2.101 THR 215.A N LEU 235.A O THR 215.A H 2.862 2.051 ASN 216.A N GLY 208.A O ASN 216.A H 2.802 1.972 ASN 216.A ND2 PRO 39.A O ASN 216.A HD22 2.929 2.301 ASN 216.A ND2 MET 40.A O ASN 216.A HD21 3.133 2.381 ASP 217.A N VAL 233.A O ASP 217.A H 2.984 2.162 ILE 218.A N LYS 206.A O ILE 218.A H 3.014 2.171 ALA 219.A N VAL 231.A O ALA 219.A H 2.760 1.965 VAL 220.A N GLY 204.A O VAL 220.A H.A 3.010 2.221 ILE 221.A N ILE 229.A O.A ILE 221.A H 2.987 2.228 ILE 221.A N ILE 229.A O.B ILE 221.A H 2.881 2.049 TRP 222.A N ARG 202.A O TRP 222.A H 2.807 1.966 ARG 226.A N.A PRO 223.A O ARG 226.A H.A 3.382 2.597 ARG 226.A NE.A ALA 227.A O ARG 226.A HE.A 2.757 1.967 ARG 226.A NH1.B ASP 23.A OD1 ARG 226.A HH12.B 2.787 1.957 ARG 226.A NH1.B ALA 227.A O ARG 226.A HH11.B 3.045 2.271 ARG 226.A NH2.A ASP 23.A OD1 ARG 226.A HH22.A 2.456 1.734 ARG 226.A NH2.A ALA 227.A O ARG 226.A HH21.A 2.978 2.276 ARG 226.A NH2.B ASP 23.A OD1 ARG 226.A HH22.B 3.205 2.515 ARG 226.A NH2.B ASP 23.A OD2 ARG 226.A HH22.B 2.652 1.823 ILE 229.A N.A ILE 221.A O ILE 229.A H.A 2.822 2.005 ILE 229.A N.B ILE 221.A O ILE 229.A H.B 2.836 2.034 VAL 230.A N LEU 22.A O VAL 230.A H 2.946 2.145 VAL 231.A N ALA 219.A O VAL 231.A H 2.823 1.983 THR 232.A N ALA 20.A O THR 232.A H 2.903 2.082 THR 232.A OG1 PRO 155.A O THR 232.A HG1 2.905 2.137 VAL 233.A N ASP 217.A O VAL 233.A H 2.909 2.168 TYR 234.A N GLY 18.A O TYR 234.A H 2.758 1.909 TYR 234.A OH THR 43.A OG1 TYR 234.A HH 2.959 2.359 LEU 235.A N THR 215.A O LEU 235.A H 3.142 2.465 LEU 235.A N ASN 216.A OD1 LEU 235.A H 3.324 2.567 THR 236.A N ARG 16.A O THR 236.A H 2.932 2.103 THR 236.A OG1 THR 214.A OG1 THR 236.A HG1 2.585 1.814 GLU 237.A N HIS 212.A O GLU 237.A H 2.796 2.163 SER 238.A N GLY 213.A O SER 238.A H 3.417 2.599 GLN 239.A N GLY 14.A O GLN 239.A H 3.350 2.616 ASP 243.A N ASP 241.A OD1 ASP 243.A H 3.219 2.619 ALA 244.A N ASP 241.A OD1 ALA 244.A H 3.265 2.461 ARG 245.A N ASP 241.A O ARG 245.A H 2.974 2.184 ARG 245.A NE THR 215.A OG1 ARG 245.A HE 3.006 2.191 ARG 245.A NH1 VAL 240.A O ARG 245.A HH11 2.762 2.213 ASP 246.A N ALA 242.A O ASP 246.A H 3.130 2.304 ALA 247.A N ASP 243.A O ALA 247.A H 3.048 2.240 VAL 248.A N ALA 244.A O VAL 248.A H 3.005 2.214 ILE 249.A N ARG 245.A O ILE 249.A H.A 3.305 2.512 ALA 250.A N ASP 246.A O ALA 250.A H 2.986 2.165 GLU 251.A N ALA 247.A O GLU 251.A H 2.998 2.236 VAL 252.A N VAL 248.A O VAL 252.A H 3.095 2.305 GLY 253.A N ILE 249.A O GLY 253.A H 3.147 2.330 ARG 254.A N ALA 250.A O ARG 254.A H 3.042 2.267 ARG 254.A NH1 GLU 251.A OE1 ARG 254.A HH11 2.883 2.141 LEU 255.A N GLU 251.A O LEU 255.A H 2.942 2.142 VAL 256.A N VAL 252.A O VAL 256.A H 3.024 2.226 VAL 257.A N GLY 253.A O VAL 257.A H 3.087 2.263 GLU 258.A N ARG 254.A O GLU 258.A H 3.056 2.239 ALA 259.A N LEU 255.A O ALA 259.A H 2.985 2.269 PHE 260.A N VAL 256.A O PHE 260.A H 2.992 2.335