Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4by9_D.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 8.A OE1 LYS 1.A HZ3 2.691 1.725 SER 3.A N GLU 58.A OE1 SER 3.A H 2.802 1.794 SER 3.A OG GLU 58.A OE1 SER 3.A HG 2.599 1.613 TYR 4.A OH ALA 52.A O TYR 4.A HH 2.630 1.659 LYS 6.A NZ SER 3.A O LYS 6.A HZ3 2.886 2.011 ALA 14.A N GLU 12.A O ALA 14.A H 2.843 1.938 ALA 17.A N LEU 13.A O ALA 17.A H 2.895 2.020 LEU 18.A N ALA 14.A O LEU 18.A H 3.056 2.066 GLN 19.A N GLU 15.A O GLN 19.A H 2.888 1.886 ALA 20.A N LYS 16.A O ALA 20.A H 2.900 2.003 VAL 21.A N ALA 17.A O VAL 21.A H 3.088 2.155 GLU 22.A N LEU 18.A O GLU 22.A H 2.997 1.988 ILE 23.A N GLN 19.A O ILE 23.A H 3.038 2.059 ALA 24.A N ALA 20.A O ALA 24.A H 3.039 2.167 ARG 25.A N VAL 21.A O ARG 25.A H 3.075 2.129 ARG 25.A NH1 ALA 87.A O ARG 25.A HH11 2.809 1.855 THR 27.A N ALA 24.A O THR 27.A H 3.030 2.106 THR 27.A OG1 ILE 23.A O THR 27.A HG1 2.624 1.662 GLY 28.A N ALA 24.A O GLY 28.A H 2.906 1.942 LYS 29.A N GLU 101.A O LYS 29.A H 2.912 1.934 LYS 29.A NZ GLY 28.A O LYS 29.A HZ2 2.778 1.840 ARG 31.A N ALA 98.A O ARG 31.A H 2.956 1.951 ARG 31.A NH1 GLU 36.A OE1 ARG 31.A HH11 2.809 1.797 GLY 33.A N SER 96.A O GLY 33.A H 2.930 2.011 THR 34.A OG1 SER 96.A OG THR 34.A HG1 2.781 1.812 THR 37.A N GLY 33.A O THR 37.A H 2.878 1.966 THR 37.A OG1 GLY 33.A O THR 37.A HG1 2.661 1.709 THR 38.A N THR 34.A O THR 38.A H 2.801 1.844 THR 38.A OG1 THR 34.A O THR 38.A HG1 2.608 1.638 LYS 39.A N ASN 35.A O LYS 39.A H 3.018 2.032 ALA 40.A N GLU 36.A O ALA 40.A H 3.126 2.127 VAL 41.A N THR 38.A O VAL 41.A H 3.156 2.390 GLU 42.A N THR 38.A O GLU 42.A H 2.916 1.988 ARG 43.A N LYS 39.A O ARG 43.A H 2.839 1.842 ARG 43.A NE GLU 42.A OE1 ARG 43.A HE 2.838 1.882 ARG 43.A NH2 GLU 42.A OE1 ARG 43.A HH21 2.833 1.921 LYS 47.A N ILE 99.A O LYS 47.A H 2.810 1.796 LYS 47.A NZ GLN 45.A O LYS 47.A HZ1 2.765 1.823 LYS 47.A NZ ILE 100.A O LYS 47.A HZ3 2.797 1.791 ILE 50.A N VAL 97.A O ILE 50.A H 2.854 1.853 ILE 51.A N ILE 76.A O ILE 51.A H 2.998 2.069 ALA 52.A N ALA 95.A O ALA 52.A H 2.958 2.006 GLU 53.A N VAL 78.A O GLU 53.A H 2.846 1.962 VAL 55.A N TYR 4.A OH VAL 55.A H 3.390 2.471 VAL 61.A N GLU 58.A O VAL 61.A H 3.253 2.428 ALA 62.A N GLU 58.A O ALA 62.A H 2.963 2.145 HIS 63.A ND1 ILE 60.A O HIS 63.A HD1 2.976 2.043 LEU 64.A N VAL 61.A O LEU 64.A H 2.935 1.965 LEU 67.A N HIS 63.A O LEU 67.A H 3.130 2.159 CYS 68.A N LEU 64.A O CYS 68.A H 2.961 2.140 CYS 68.A N PRO 65.A O CYS 68.A H 3.029 2.298 CYS 68.A SG PRO 65.A O CYS 68.A HG 3.100 1.773 GLU 69.A N PRO 65.A O GLU 69.A H 3.168 2.307 GLU 70.A N PRO 66.A O GLU 70.A H 3.207 2.275 LYS 71.A NZ VAL 41.A O LYS 71.A HZ3 2.673 1.790 ILE 73.A N CYS 68.A O ILE 73.A H 3.351 2.417 TYR 75.A OH TYR 4.A O TYR 75.A HH 2.747 1.796 ILE 76.A N VAL 49.A O ILE 76.A H 3.238 2.351 TYR 77.A OH PHE 7.A O TYR 77.A HH 2.639 1.695 VAL 78.A N ILE 51.A O VAL 78.A H 2.939 1.993 SER 80.A OG GLU 83.A OE1 SER 80.A HG 2.597 1.638 LYS 81.A N ASP 54.A OD1 LYS 81.A H 2.754 1.770 LYS 81.A NZ ASP 54.A O LYS 81.A HZ3 2.787 1.899 LYS 81.A NZ ASP 54.A OD2 LYS 81.A HZ2 2.832 1.893 LYS 82.A N SER 80.A OG LYS 82.A H 3.246 2.457 LYS 82.A NZ VAL 92.A O LYS 82.A HZ1 2.805 1.803 LEU 84.A N SER 80.A O LEU 84.A H 2.965 2.003 GLY 85.A N LYS 81.A O GLY 85.A H 3.026 2.054 ALA 86.A N LYS 82.A O ALA 86.A H 3.115 2.136 ALA 87.A N GLU 83.A O ALA 87.A H 2.838 1.897 ALA 88.A N LEU 84.A O ALA 88.A H 3.053 2.082 GLY 89.A N GLY 85.A O GLY 89.A H 2.956 2.184 ILE 90.A N GLY 85.A O ILE 90.A H 3.051 2.037 ALA 94.A N LYS 81.A O ALA 94.A H 2.939 1.963 SER 96.A OG THR 37.A OG1 SER 96.A HG 2.829 1.879 VAL 97.A N ILE 50.A O VAL 97.A H 2.875 1.891 ALA 98.A N ARG 31.A O ALA 98.A H 2.876 1.871 ILE 99.A N LEU 48.A O ILE 99.A H 2.935 1.929 ILE 100.A N LYS 29.A O ILE 100.A H 2.845 1.909 GLU 101.A N LYS 29.A O GLU 101.A H 3.005 1.999 LYS 104.A N THR 27.A OG1 LYS 104.A H 2.927 1.931 ALA 105.A N PRO 102.A O ALA 105.A H 2.852 1.944 ARG 106.A NH1 GLY 103.A O ARG 106.A HH12 2.983 2.221 VAL 109.A N ALA 105.A O VAL 109.A H 2.936 1.948 GLU 110.A N ARG 106.A O GLU 110.A H 3.086 2.131 GLU 111.A N ASP 107.A O GLU 111.A H 3.053 2.064 ILE 112.A N LEU 108.A O ILE 112.A H 2.955 1.972 ALA 113.A N VAL 109.A O ALA 113.A H 2.939 1.942 MET 114.A N GLU 110.A O MET 114.A H 3.113 2.119 LYS 115.A N GLU 111.A O LYS 115.A H 3.113 2.130 LYS 115.A NZ GLU 111.A OE2 LYS 115.A HZ1 2.747 1.752 VAL 116.A N ILE 112.A O VAL 116.A H 2.943 1.951 LYS 117.A N ALA 113.A O LYS 117.A H 3.171 2.186 LEU 119.A N VAL 116.A O LEU 119.A H 3.038 2.194 MET 120.A N VAL 116.A O MET 120.A H 3.290 2.293 LYS 121.A NZ GLU 118.A OE2 LYS 121.A HZ2 2.756 1.751