Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4d1u_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 4.A N ASP 7.A OD2 THR 4.A H 2.874 2.045 THR 4.A OG1 ASP 7.A OD2 THR 4.A HG1 3.037 2.261 ASP 6.A N THR 4.A OG1 ASP 6.A H 3.304 2.556 ASP 7.A N THR 4.A O ASP 7.A H 2.872 2.049 GLU 12.A N PRO 9.A O GLU 12.A H 3.165 2.329 ARG 14.A N ILE 26.A O ARG 14.A H 2.998 2.175 ARG 14.A NH1 GLU 12.A OE1 ARG 14.A HH12 3.015 2.294 ARG 14.A NH2 ASP 7.A O ARG 14.A HH21 3.452 2.875 ARG 14.A NH2 GLU 12.A OE1 ARG 14.A HH22 2.815 2.027 TYR 16.A N SER 24.A O TYR 16.A H 2.929 2.146 ILE 18.A N VAL 22.A O ILE 18.A H 2.766 1.913 GLY 19.A N VAL 22.A O GLY 19.A H 3.223 2.404 VAL 22.A N GLY 19.A O VAL 22.A H 2.986 2.149 TRP 23.A N ILE 42.A O TRP 23.A H 2.954 2.124 SER 24.A N TYR 16.A O SER 24.A H 2.841 2.086 SER 24.A OG TYR 2.A OH SER 24.A HG 2.959 2.248 HIS 25.A N GLY 40.A O HIS 25.A H 3.063 2.296 HIS 25.A NE2 ILE 52.A O HIS 25.A HE2 3.141 2.388 HIS 25.A NE2 ASP 53.A O HIS 25.A HE2 2.985 2.362 ILE 26.A N ARG 14.A O ILE 26.A H 2.863 2.048 ALA 27.A N SER 38.A O.A ALA 27.A H 3.100 2.305 ALA 27.A N SER 38.A O.B ALA 27.A H 3.093 2.294 THR 28.A OG1.B ILE 8.A O THR 28.A HG1.B 2.772 2.032 GLN 29.A N TYR 36.A O GLN 29.A H.B 3.086 2.304 GLN 29.A NE2 TRP 56.A O GLN 29.A HE21 2.883 2.119 LYS 30.A N GLN 29.A OE1 LYS 30.A H 3.020 2.244 LEU 31.A N THR 34.A O LEU 31.A H 2.719 1.970 THR 34.A N LEU 31.A O THR 34.A H 2.657 2.002 TYR 36.A N GLN 29.A O TYR 36.A H 2.843 2.001 SER 38.A N.A ALA 27.A O SER 38.A H.A 2.867 2.059 SER 38.A N.B ALA 27.A O SER 38.A H.B 2.911 2.161 ASN 39.A N GLY 208.A O ASN 39.A H.B 2.894 2.044 ASN 39.A ND2 PRO 207.A O ASN 39.A HD21 2.925 2.068 ASN 39.A ND2 GLY 210.A O ASN 39.A HD22 2.781 1.947 GLY 40.A N HIS 25.A O GLY 40.A H 2.829 2.019 LEU 41.A N ILE 52.A O LEU 41.A H 3.003 2.191 ILE 42.A N TRP 23.A O ILE 42.A H 2.803 2.008 VAL 43.A N LEU 50.A O VAL 43.A H 2.866 2.066 ARG 44.A N GLY 21.A O ARG 44.A H 2.828 1.994 ARG 44.A NE ALA 46.A O ARG 44.A HE 2.670 1.817 ARG 44.A NH2 ALA 46.A O ARG 44.A HH21 3.292 2.653 ARG 44.A NH2 ASP 47.A OD1 ARG 44.A HH21 3.143 2.464 ASP 45.A N GLU 48.A O ASP 45.A H 2.882 2.028 GLU 48.A N ASP 45.A O GLU 48.A H 2.971 2.153 LEU 49.A N PRO 75.A O LEU 49.A H 2.854 2.102 LEU 50.A N VAL 43.A O LEU 50.A H 2.846 1.990 LEU 51.A N ARG 78.A O LEU 51.A H 2.932 2.098 ILE 52.A N LEU 41.A O ILE 52.A H 2.749 1.896 ASP 53.A N ILE 80.A O ASP 53.A H 2.812 2.010 THR 54.A N ARG 88.A O THR 54.A H 3.386 2.528 THR 54.A OG1 GLY 90.A O THR 54.A HG1 2.713 2.038 ALA 55.A N THR 61.A OG1 ALA 55.A H 3.209 2.376 TRP 56.A N THR 54.A OG1 TRP 56.A H 3.354 2.509 GLY 57.A N GLY 90.A O GLY 57.A H 2.817 1.991 ASN 60.A ND2 THR 28.A O.A ASN 60.A HD22 2.891 2.082 ASN 60.A ND2 THR 28.A O.B ASN 60.A HD22 2.968 2.149 ASN 60.A ND2 ALA 55.A O ASN 60.A HD21 2.923 2.127 THR 61.A N GLY 57.A O THR 61.A H 2.980 2.187 THR 61.A OG1 GLY 57.A O THR 61.A HG1 2.812 2.126 VAL 62.A N ALA 58.A O VAL 62.A H 2.905 2.070 ALA 63.A N LYS 59.A O ALA 63.A H 3.187 2.361 LEU 64.A N ASN 60.A O LEU 64.A H 2.797 2.011 LEU 65.A N THR 61.A O LEU 65.A H 3.045 2.230 ALA 66.A N VAL 62.A O ALA 66.A H 3.083 2.255 GLU 67.A N ALA 63.A O GLU 67.A H 2.899 2.120 ILE 68.A N LEU 64.A O ILE 68.A H 2.942 2.113 GLU 69.A N LEU 65.A O GLU 69.A H 2.984 2.148 LYS 70.A N ALA 66.A O LYS 70.A H 2.964 2.155 GLN 71.A N.A GLU 67.A O no hydrogen 2.872 N/A GLN 71.A N.B GLU 67.A O no hydrogen 2.851 N/A GLN 71.A NE2.A GLU 67.A OE2 GLN 71.A HE21.A 2.847 2.013 ILE 72.A N ILE 68.A O ILE 72.A H.A 2.811 1.982 GLY 73.A N ILE 68.A O GLY 73.A H 2.933 2.106 THR 77.A N LEU 49.A O THR 77.A H 3.075 2.269 THR 77.A OG1 GLU 48.A OE1 THR 77.A HG1 2.634 1.823 SER 79.A N ALA 101.A O SER 79.A H 2.977 2.197 ILE 80.A N LEU 51.A O ILE 80.A H 2.848 2.089 SER 81.A N TYR 103.A O SER 81.A H 3.039 2.261 THR 82.A N ASP 53.A OD1 THR 82.A H 2.702 1.926 THR 82.A OG1 ASP 53.A OD1 THR 82.A HG1 3.259 2.456 THR 82.A OG1 ASP 53.A OD2 THR 82.A HG1 2.720 2.126 HIS 83.A NE2 HIS 85.A ND1 no hydrogen 3.072 N/A HIS 85.A NE2 ASP 182.A OD2 HIS 85.A HE2 2.874 2.026 ARG 88.A N HIS 85.A O ARG 88.A H 2.813 1.960 ARG 88.A NH1 ASN 39.A O ARG 88.A HH12 2.661 1.815 ARG 88.A NH1 ASP 53.A OD2 ARG 88.A HH11 2.866 2.204 ARG 88.A NH2 ASN 39.A O ARG 88.A HH22 3.440 2.835 ARG 88.A NH2 GLY 208.A O ARG 88.A HH22 2.962 2.305 VAL 89.A N HIS 85.A O VAL 89.A H 3.096 2.297 GLY 90.A N ASP 86.A O GLY 90.A H 2.751 2.017 GLY 91.A N GLU 118.A OE1 GLY 91.A H 3.131 2.382 GLY 91.A N GLU 118.A OE2 GLY 91.A H 3.313 2.493 VAL 92.A N VAL 89.A O VAL 92.A H 2.933 2.109 ASP 93.A N GLU 118.A OE1 ASP 93.A H 2.821 1.980 LEU 95.A N GLY 91.A O LEU 95.A H 3.037 2.219 ARG 96.A N VAL 92.A O ARG 96.A H 2.913 2.095 ALA 97.A N ASP 93.A O ALA 97.A H 2.962 2.162 ALA 98.A N VAL 94.A O ALA 98.A H 3.039 2.304 ALA 98.A N LEU 95.A O ALA 98.A H 3.139 2.518 GLY 99.A N ARG 96.A O GLY 99.A H 2.944 2.110 VAL 100.A N LEU 95.A O VAL 100.A H 2.914 2.081 ALA 101.A N THR 77.A O ALA 101.A H 2.989 2.129 TYR 103.A N SER 79.A O TYR 103.A H 3.000 2.280 THR 104.A N HIS 122.A O THR 104.A H 3.059 2.315 THR 104.A OG1 SER 81.A O THR 104.A HG1 2.765 2.094 THR 108.A N SER 105.A OG THR 108.A H 3.036 2.192 ARG 109.A N SER 105.A O ARG 109.A H 3.101 2.283 ARG 109.A NE PRO 120.A O ARG 109.A HE 2.862 2.043 GLN 110.A N PRO 106.A O GLN 110.A H 3.095 2.300 LEU 111.A N LEU 107.A O LEU 111.A H 2.862 2.013 ALA 112.A N THR 108.A O ALA 112.A H 2.786 1.942 GLU 113.A N ARG 109.A O GLU 113.A H 2.964 2.148 ALA 114.A N GLN 110.A O ALA 114.A H 2.916 2.079 ALA 115.A N LEU 111.A O ALA 115.A H 2.939 2.153 GLY 116.A N GLU 113.A O GLY 116.A H 3.127 2.315 ASN 117.A N ALA 112.A O ASN 117.A H 2.847 2.034 ASN 117.A ND2 PHE 84.A O ASN 117.A HD21 2.874 2.056 ALA 121.A N THR 102.A OG1 ALA 121.A H 2.880 2.048 HIS 122.A N THR 102.A O HIS 122.A H 2.824 2.097 LEU 124.A N THR 104.A O LEU 124.A H 2.767 1.982 LEU 127.A N LEU 124.A O LEU 127.A H 3.371 2.564 SER 128.A N ASP 132.A OD2 SER 128.A H 2.945 2.098 SER 129.A N ASP 132.A OD2 SER 129.A H 2.726 1.898 GLY 131.A N TYR 143.A O GLY 131.A H 2.730 1.905 ASP 132.A N SER 129.A O ASP 132.A H 2.770 1.968 VAL 134.A N VAL 141.A O VAL 134.A H 2.977 2.157 ARG 135.A NE GLY 137.A O ARG 135.A HE 2.878 2.025 ARG 135.A NH2 GLY 137.A O ARG 135.A HH21 3.438 2.764 PHE 136.A N VAL 139.A O PHE 136.A H 2.875 2.023 VAL 139.A N PHE 136.A O VAL 139.A H 3.064 2.207 GLU 140.A N TYR 156.A O GLU 140.A H 2.882 2.057 VAL 141.A N VAL 134.A O VAL 141.A H 2.848 2.021 PHE 142.A N VAL 154.A O PHE 142.A H 2.870 2.024 TYR 143.A N ASP 132.A O TYR 143.A H 2.913 2.071 TYR 143.A OH GLY 150.A O TYR 143.A HH 2.549 1.941 ALA 147.A N SER 149.A O ALA 147.A H 3.044 2.199 SER 149.A N ASN 152.A OD1 SER 149.A H 3.138 2.301 ASP 151.A N ASP 151.A OD1 ASP 151.A H 2.628 1.962 ASN 152.A ND2 GLY 145.A O ASN 152.A HD22 2.847 2.248 LEU 153.A N THR 82.A O LEU 153.A H 2.864 2.094 VAL 154.A N PHE 142.A O VAL 154.A H 2.990 2.155 VAL 155.A N PHE 164.A O VAL 155.A H 3.044 2.213 TYR 156.A N GLU 140.A O TYR 156.A H 2.883 2.049 VAL 157.A N VAL 162.A O VAL 157.A H 2.802 1.967 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.286 2.553 ARG 161.A N VAL 157.A O ARG 161.A H 2.788 2.188 ARG 161.A NE GLU 203.A OE2 ARG 161.A HE 2.688 1.881 ARG 161.A NH2 GLU 203.A OE2 ARG 161.A HH21 2.949 2.245 VAL 162.A N VAL 157.A O VAL 162.A H 3.311 2.512 LEU 163.A N VAL 204.A O LEU 163.A H 2.891 2.035 PHE 164.A N VAL 155.A O PHE 164.A H 2.725 1.872 GLY 165.A N ILE 206.A O GLY 165.A H 2.828 2.005 VAL 169.A N GLY 166.A O VAL 169.A H 3.122 2.278 HIS 170.A N THR 221.A OG1 HIS 170.A H 2.853 2.012 ARG 174.A N GLU 171.A O ARG 174.A H 3.162 2.363 ALA 181.A N ASN 179.A OD1 ALA 181.A H 3.075 2.224 ALA 183.A N VAL 180.A O ALA 183.A H 3.023 2.196 ASN 184.A N ALA 147.A O ASN 184.A H 2.763 1.967 GLU 187.A N ASN 184.A O GLU 187.A H 3.073 2.401 GLU 187.A N ASN 184.A OD1 GLU 187.A H 2.933 2.190 TRP 188.A N ASN 184.A O TRP 188.A H 3.018 2.413 TRP 188.A NE1 ALA 168.A O TRP 188.A HE1 2.972 2.180 THR 191.A N GLU 187.A O THR 191.A H 3.017 2.215 THR 191.A OG1 ALA 146.A O THR 191.A HG1 2.663 1.913 ILE 192.A N TRP 188.A O ILE 192.A H 2.934 2.112 LYS 193.A N PRO 189.A O LYS 193.A H 3.005 2.211 ARG 194.A N ALA 190.A O ARG 194.A H 3.064 2.293 ARG 194.A NH1 PRO 144.A O ARG 194.A HH11 2.469 1.731 ILE 195.A N THR 191.A O ILE 195.A H 3.104 2.362 GLN 196.A N ILE 192.A O GLN 196.A H 2.888 2.037 GLN 196.A NE2 GLN 219.A OE1 GLN 196.A HE22 3.593 2.750 GLN 197.A N LYS 193.A O GLN 197.A H 2.921 2.115 ARG 198.A N ARG 194.A O ARG 198.A H 3.106 2.396 ARG 198.A N ILE 195.A O ARG 198.A H 3.149 2.517 ARG 198.A NH2 GLU 140.A OE1 ARG 198.A HH21 3.370 2.516 TYR 199.A N ILE 195.A O TYR 199.A H 3.071 2.320 ALA 202.A N TYR 199.A O ALA 202.A H 3.217 2.364 GLU 203.A N ARG 161.A O GLU 203.A H 2.787 1.957 VAL 204.A N ARG 161.A O VAL 204.A H 3.420 2.608 VAL 205.A N GLY 213.A O VAL 205.A H 2.816 1.976 ILE 206.A N LEU 163.A O ILE 206.A H 2.822 2.006 HIS 209.A ND1 SER 37.A O.A HIS 209.A HD1 3.036 2.244 HIS 209.A ND1 SER 37.A O.B HIS 209.A HD1 2.582 1.763 LEU 211.A N GLU 171.A OE1 LEU 211.A H 3.053 2.228 GLY 213.A N VAL 205.A O GLY 213.A H 2.891 2.042 GLY 214.A N GLU 216.A OE2 GLY 214.A H 2.888 2.029 GLU 216.A N GLU 216.A OE1 GLU 216.A H 2.669 1.901 LEU 217.A N GLY 214.A O LEU 217.A H 3.053 2.207 LEU 218.A N LEU 215.A O LEU 218.A H 3.033 2.227 GLN 219.A NE2 ASN 223.A OD1 GLN 219.A HE21 3.183 2.361 HIS 220.A N GLU 216.A O HIS 220.A H 3.108 2.254 HIS 220.A NE2 ARG 174.A O HIS 220.A HE2 2.830 2.193 THR 221.A N LEU 217.A O THR 221.A H 2.942 2.166 THR 221.A OG1 LEU 217.A O THR 221.A HG1 2.757 1.954 THR 222.A N LEU 218.A O THR 222.A H 3.233 2.414 ASN 223.A N GLN 219.A O ASN 223.A H 2.941 2.111 VAL 224.A N HIS 220.A O VAL 224.A H 2.998 2.224 VAL 225.A N THR 221.A O VAL 225.A H 2.893 2.060 LYS 226.A N THR 222.A O LYS 226.A H 3.149 2.347