Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4fre_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 8.A N LYS 5.A O THR 8.A H 3.101 2.317 ARG 11.A NE ASP 13.A OD1 ARG 11.A HE 2.832 1.867 ARG 11.A NH1 ASP 13.A OD1 ARG 11.A HH11 3.481 2.837 ARG 11.A NH1 ASP 13.A OD2 ARG 11.A HH11 2.840 2.037 ARG 11.A NH1 VAL 254.A O ARG 11.A HH12 3.057 2.242 ARG 11.A NH2 GLU 27.A O ARG 11.A HH21 2.919 2.112 ASP 13.A N ASP 13.A OD1 ASP 13.A H 2.587 1.883 THR 18.A N ALA 22.A O THR 18.A H 2.827 2.013 TRP 20.A N THR 18.A OG1 TRP 20.A H 3.168 2.443 TRP 20.A NE1 PRO 234.A O TRP 20.A HE1 2.781 1.773 LEU 21.A N THR 18.A O LEU 21.A H 2.936 2.110 ALA 22.A N THR 18.A OG1 ALA 22.A H 3.145 2.313 ILE 24.A N VAL 16.A O ILE 24.A H 2.882 2.030 VAL 25.A N VAL 237.A O VAL 25.A H 2.939 2.133 TRP 26.A NE1 LEU 15.A O TRP 26.A HE1 2.916 2.030 GLU 27.A N GLU 241.A OE1 GLU 27.A H 2.847 2.006 THR 29.A N TRP 26.A O THR 29.A H 3.068 2.256 ASP 33.A N ASN 31.A OD1 ASP 33.A H 2.879 2.151 ILE 34.A N ASN 31.A O ILE 34.A H 3.140 2.537 LEU 35.A N ASN 31.A O LEU 35.A H 3.301 2.455 ASN 36.A N ILE 32.A O ASN 36.A H 2.825 1.991 GLU 37.A N ASP 33.A O GLU 37.A H 3.221 2.411 GLN 38.A N ILE 34.A O GLN 38.A H 3.118 2.293 PHE 39.A N LEU 35.A O PHE 39.A H 2.966 2.120 ARG 40.A N ASN 36.A O ARG 40.A H 2.861 2.030 ARG 40.A NH2 ASN 43.A OD1 ARG 40.A HH22 2.956 2.140 LEU 41.A N GLU 37.A O LEU 41.A H 2.979 2.159 GLN 42.A N PHE 39.A O GLN 42.A H 3.095 2.366 ASN 43.A N ARG 40.A O ASN 43.A H 2.913 2.063 THR 44.A N PHE 39.A O THR 44.A H 3.399 2.581 THR 45.A N ASP 124.A OD2 THR 45.A H 2.813 1.970 ILE 46.A N ARG 76.A O ILE 46.A H 2.845 2.003 GLY 47.A N TYR 125.A O GLY 47.A H 2.771 1.913 LEU 48.A N HIS 78.A O LEU 48.A H 2.807 2.000 THR 49.A N VAL 127.A O THR 49.A H 2.794 1.956 VAL 50.A N TYR 80.A O VAL 50.A H 3.106 2.321 ALA 52.A N PHE 82.A O ALA 52.A H 2.718 1.871 LYS 54.A N ASP 84.A OD1 LYS 54.A H 3.101 2.367 LYS 54.A N ASP 84.A OD2 LYS 54.A H 3.258 2.433 TYR 56.A N ILE 53.A O TYR 56.A H 3.129 2.353 VAL 57.A N LYS 54.A O VAL 57.A H 3.304 2.452 ALA 58.A N LYS 55.A O ALA 58.A H 3.126 2.282 PHE 59.A N TYR 56.A O PHE 59.A H 3.041 2.238 LEU 60.A N VAL 57.A O LEU 60.A H 3.133 2.283 LYS 61.A NZ GLU 65.A OE1 LYS 61.A HZ3 2.862 2.008 PHE 63.A N PHE 59.A O PHE 63.A H 3.161 2.323 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 2.861 2.002 GLU 65.A N LYS 61.A O GLU 65.A H 2.961 2.106 THR 66.A N LEU 62.A O THR 66.A H 2.944 2.098 ALA 67.A N PHE 63.A O ALA 67.A H 2.889 2.102 GLU 68.A N LEU 64.A O GLU 68.A H 2.944 2.124 LYS 69.A N THR 66.A O LYS 69.A H 3.141 2.555 HIS 70.A N THR 66.A O HIS 70.A H 3.050 2.409 HIS 70.A N ALA 67.A O HIS 70.A H 3.244 2.554 PHE 71.A N ALA 67.A O PHE 71.A H 2.793 1.949 MET 72.A N VAL 139.A O MET 72.A H 2.849 2.021 HIS 75.A N MET 72.A O HIS 75.A H 2.987 2.155 HIS 75.A NE2 ASN 36.A OD1 HIS 75.A HE2 2.900 1.852 VAL 77.A N GLY 97.A O VAL 77.A H 3.101 2.316 HIS 78.A N ILE 46.A O HIS 78.A H 2.906 2.085 HIS 78.A NE2 SER 101.A OG HIS 78.A HE2 2.671 1.625 TYR 79.A N GLN 99.A O TYR 79.A H 2.843 2.013 TYR 80.A N LEU 48.A O TYR 80.A H 2.752 1.913 VAL 81.A N SER 101.A O VAL 81.A H 2.779 1.927 PHE 82.A N VAL 50.A O PHE 82.A H 2.882 2.037 THR 83.A N LEU 103.A O THR 83.A H 2.836 2.009 GLN 85.A N THR 83.A OG1 GLN 85.A H 2.963 2.116 GLN 85.A NE2 LYS 54.A O GLN 85.A HE21 2.966 2.206 GLN 85.A NE2 ASP 84.A OD1 GLN 85.A HE22 2.756 1.875 ALA 88.A N GLN 85.A O ALA 88.A H 2.966 2.246 VAL 89.A N PRO 86.A O VAL 89.A H 3.297 2.446 GLY 95.A N GLU 68.A OE2 GLY 95.A H 2.842 1.995 ARG 98.A NE GLU 68.A OE1 ARG 98.A HE 2.728 2.014 ARG 98.A NH1 PHE 71.A O ARG 98.A HH12 3.031 2.303 ARG 98.A NH1 MET 72.A O ARG 98.A HH12 3.313 2.708 ARG 98.A NH2 GLU 68.A OE1 ARG 98.A HH21 3.534 2.969 ARG 98.A NH2 PHE 71.A O ARG 98.A HH22 2.829 2.035 ARG 98.A NH2 TYR 79.A OH ARG 98.A HH21 3.037 2.179 GLN 99.A N VAL 77.A O GLN 99.A H 2.880 2.089 SER 101.A N TYR 79.A O SER 101.A H 2.829 1.990 LEU 103.A N VAL 81.A O LEU 103.A H 2.619 1.768 VAL 105.A N THR 83.A O VAL 105.A H 2.899 2.100 ARG 108.A NH1 ASP 130.A OD1 ARG 108.A HH12 3.012 2.379 ARG 108.A NH2 ASP 130.A OD1 ARG 108.A HH22 2.586 1.807 MET 111.A N ARG 107.A O MET 111.A H 2.547 1.718 ILE 112.A N ARG 108.A O ILE 112.A H 2.616 1.766 SER 113.A N MET 109.A O SER 113.A H 2.909 2.099 ARG 118.A NE GLU 122.A OE1 ARG 118.A HE 3.408 2.474 ARG 118.A NH2 GLU 122.A OE2 ARG 118.A HH21 3.495 2.927 PHE 119.A N CYS 115.A O PHE 119.A H 3.213 2.392 LEU 120.A N GLU 116.A O LEU 120.A H 3.394 2.554 SER 121.A N ARG 117.A O SER 121.A H 3.227 2.457 GLU 122.A N PHE 119.A O GLU 122.A H 3.155 2.377 VAL 123.A N PHE 119.A O VAL 123.A H 3.233 2.412 ASP 124.A N THR 45.A O ASP 124.A H 2.848 2.001 TYR 125.A N THR 45.A O TYR 125.A H 3.339 2.513 LEU 126.A N GLY 191.A O LEU 126.A H 2.813 2.003 VAL 127.A N GLY 47.A O VAL 127.A H 2.893 2.140 CYS 128.A N PHE 189.A O CYS 128.A H 2.851 2.010 VAL 129.A N THR 49.A O VAL 129.A H 3.253 2.400 ASP 130.A N ALA 187.A O ASP 130.A H 3.191 2.470 MET 133.A N VAL 131.A O MET 133.A H 2.785 2.114 GLU 134.A N THR 261.A O GLU 134.A H 2.859 2.070 ARG 136.A N ARG 259.A O ARG 136.A H 2.796 1.978 ARG 136.A NH1 GLN 246.A OE1 ARG 136.A HH12 2.845 2.094 ARG 136.A NH2 GLN 246.A OE1 ARG 136.A HH22 2.829 2.077 ASP 137.A N ARG 259.A O ASP 137.A H 3.253 2.471 HIS 138.A N ASP 137.A OD2 HIS 138.A H 2.710 1.957 HIS 138.A NE2 GLU 142.A OE2 HIS 138.A HE2 2.691 1.693 VAL 139.A N HIS 70.A O VAL 139.A H 2.966 2.121 GLY 140.A N GLU 142.A OE1 GLY 140.A H 2.847 1.995 GLU 142.A N GLU 142.A OE2 GLU 142.A H 2.878 2.142 ILE 143.A N GLY 140.A O ILE 143.A H 3.096 2.247 LEU 144.A N VAL 141.A O LEU 144.A H 3.015 2.205 LEU 147.A N THR 235.A OG1 LEU 147.A H 3.058 2.253 PHE 148.A N GLY 190.A O PHE 148.A H 2.882 2.040 LEU 151.A N LEU 238.A O LEU 151.A H 3.131 2.278 HIS 152.A N TYR 183.A O HIS 152.A H 2.993 2.133 PHE 155.A N HIS 152.A O PHE 155.A H 3.190 2.336 SER 158.A N PHE 155.A O SER 158.A H 3.083 2.258 ARG 160.A NE GLY 180.A O ARG 160.A HE 2.909 2.065 ARG 160.A NH1 GLY 180.A O ARG 160.A HH11 2.788 2.021 GLU 161.A N GLU 161.A OE2 GLU 161.A H 2.738 1.930 ALA 162.A N SER 159.A O ALA 162.A H 3.203 2.553 PHE 163.A N ARG 160.A O PHE 163.A H 2.660 1.819 ARG 167.A NH1 ILE 175.A O ARG 167.A HH11 2.922 2.141 ARG 167.A NH2 ARG 160.A O ARG 167.A HH22 3.163 2.526 ARG 167.A NH2 PHE 163.A O ARG 167.A HH21 2.896 2.258 ARG 168.A N GLU 166.A OE1 ARG 168.A H 2.747 1.889 ARG 168.A NE GLU 166.A OE1 ARG 168.A HE 3.079 2.166 ARG 168.A NH2 GLU 166.A OE2 ARG 168.A HH21 3.074 2.216 ARG 168.A NH2 GLU 216.A O ARG 168.A HH22 2.685 1.930 SER 171.A N ARG 168.A O SER 171.A H 3.022 2.167 GLN 172.A N ASP 210.A OD2 GLN 172.A H 2.807 1.968 ALA 173.A N SER 171.A OG ALA 173.A H 3.182 2.371 TYR 174.A N SER 171.A O TYR 174.A H 2.965 2.147 ILE 175.A N GLU 166.A O ILE 175.A H 3.108 2.263 LYS 177.A NZ GLU 161.A O LYS 177.A HZ3 2.963 2.245 ASP 178.A N ASP 178.A OD1 ASP 178.A H 2.363 1.731 GLU 179.A N PRO 176.A O GLU 179.A H 3.100 2.251 TYR 184.A N ASN 226.A OD1 TYR 184.A H 2.875 2.028 MET 185.A N THR 150.A O MET 185.A H 2.870 2.114 GLY 186.A N GLU 222.A OE2 GLY 186.A H 2.872 2.028 PHE 189.A N CYS 128.A O PHE 189.A H 3.191 2.381 GLY 190.A N PHE 148.A O GLY 190.A H 3.191 2.365 GLY 191.A N LEU 126.A O GLY 191.A H 2.859 2.095 SER 192.A N PRO 146.A O SER 192.A H 2.877 2.140 VAL 193.A N ASP 124.A O VAL 193.A H 3.257 2.505 GLU 195.A N SER 192.A OG GLU 195.A H 3.095 2.247 VAL 196.A N SER 192.A O VAL 196.A H 2.917 2.076 GLN 197.A N VAL 193.A O GLN 197.A H 2.880 2.042 GLN 197.A NE2 ILE 112.A O GLN 197.A HE21 3.491 3.026 ARG 198.A N GLN 194.A O ARG 198.A H 3.022 2.198 ARG 198.A NH2 GLU 195.A OE1 ARG 198.A HH21 2.684 2.031 LEU 199.A N GLU 195.A O LEU 199.A H 2.962 2.147 THR 200.A N VAL 196.A O THR 200.A H 2.957 2.127 ARG 201.A N GLN 197.A O ARG 201.A H 2.983 2.139 ALA 202.A N ARG 198.A O ALA 202.A H 2.883 2.029 CYS 203.A N LEU 199.A O CYS 203.A H 2.876 2.037 HIS 204.A N THR 200.A O HIS 204.A H 2.833 2.008 GLN 205.A N ARG 201.A O GLN 205.A H 2.888 2.031 ALA 206.A N ALA 202.A O ALA 206.A H 2.846 2.029 MET 207.A N CYS 203.A O MET 207.A H 2.812 1.981 MET 208.A N HIS 204.A O MET 208.A H 3.121 2.374 VAL 209.A N GLN 205.A O VAL 209.A H 3.140 2.327 ASP 210.A N ALA 206.A O ASP 210.A H 3.035 2.213 GLN 211.A N MET 207.A O GLN 211.A H 2.956 2.160 ALA 212.A N MET 208.A O ALA 212.A H 2.886 2.049 ASN 213.A N ASP 210.A O ASN 213.A H 2.993 2.285 GLY 214.A N GLN 211.A O GLY 214.A H 2.849 1.996 ILE 215.A N ASP 210.A O ILE 215.A H 2.988 2.148 VAL 218.A N GLU 166.A OE2 VAL 218.A H 2.704 1.932 HIS 220.A N ALA 217.A O HIS 220.A H 2.966 2.175 HIS 220.A ND1 GLU 216.A OE1 HIS 220.A HD1 2.831 2.020 HIS 220.A ND1 GLU 216.A OE2 HIS 220.A HD1 3.272 2.463 SER 223.A N HIS 220.A O SER 223.A H 3.112 2.470 LEU 225.A N ASP 221.A O LEU 225.A H 2.835 1.990 ASN 226.A N GLU 222.A O ASN 226.A H 3.052 2.272 ASN 226.A ND2 TYR 184.A O ASN 226.A HD21 2.914 1.977 ASN 226.A ND2 GLU 222.A O ASN 226.A HD22 2.966 2.022 LYS 227.A N SER 223.A O LYS 227.A H 3.026 2.213 LYS 227.A NZ GLN 172.A O LYS 227.A HZ3 2.958 2.024 LYS 227.A NZ TYR 174.A O LYS 227.A HZ1 2.393 1.677 TYR 228.A N HIS 224.A O TYR 228.A H 2.828 1.974 LEU 229.A N LEU 225.A O LEU 229.A H 3.002 2.171 LEU 230.A N ASN 226.A O LEU 230.A H 3.064 2.317 ARG 231.A N LYS 227.A O ARG 231.A H 3.292 2.528 ARG 231.A N TYR 228.A O ARG 231.A H 3.088 2.492 ARG 231.A NH1 GLU 179.A OE1 ARG 231.A HH11 2.998 2.382 HIS 232.A N TYR 228.A O HIS 232.A H 2.668 1.911 HIS 232.A ND1 TYR 228.A O HIS 232.A HD1 3.152 2.274 LYS 233.A NZ ASP 181.A OD2 LYS 233.A HZ1 2.652 1.820 LYS 233.A NZ LEU 230.A O LYS 233.A HZ3 2.753 1.992 THR 235.A N LEU 147.A O THR 235.A H 2.740 2.111 LYS 236.A N LEU 147.A O LYS 236.A H 3.290 2.476 LYS 236.A NZ GLU 142.A O LYS 236.A HZ3 2.643 1.840 LYS 236.A NZ LEU 144.A O LYS 236.A HZ1 2.782 1.978 VAL 237.A N PRO 23.A O VAL 237.A H 2.946 2.115 LEU 238.A N GLY 149.A O LEU 238.A H 2.837 2.007 SER 239.A N VAL 25.A O SER 239.A H 3.132 2.305 TYR 242.A N SER 239.A O TYR 242.A H 3.012 2.160 LEU 243.A N PRO 240.A O LEU 243.A H 3.071 2.255 TRP 244.A N PHE 260.A O TRP 244.A H 3.115 2.323 TRP 244.A NE1 GLY 250.A O TRP 244.A HE1 2.699 1.676 GLN 247.A N ASP 245.A OD1 GLN 247.A H 2.934 2.316 LEU 248.A N ASP 245.A OD1 LEU 248.A H 3.207 2.382 LEU 249.A N ASP 245.A O LEU 249.A H 2.937 2.235 GLY 250.A N GLN 246.A O GLY 250.A H 2.857 2.095 TRP 251.A NE1 LEU 255.A O TRP 251.A HE1 2.745 1.845 LEU 255.A N PRO 252.A O LEU 255.A H 3.011 2.225 LYS 257.A NZ ASP 137.A OD2 LYS 257.A HZ3 3.506 2.540 ARG 259.A N GLU 241.A O ARG 259.A H 2.866 2.029 ARG 259.A NE GLU 241.A OE2 ARG 259.A HE 2.883 1.996 ARG 259.A NH1 HIS 138.A O ARG 259.A HH11 2.898 2.081 ARG 259.A NH2 GLU 27.A OE1 ARG 259.A HH22 2.917 2.104 ARG 259.A NH2 GLU 241.A OE2 ARG 259.A HH21 2.902 2.146 THR 261.A N GLU 134.A O THR 261.A H 2.901 2.066 ALA 262.A N TRP 244.A O ALA 262.A H 2.838 2.038 VAL 263.A N ASP 132.A O VAL 263.A H 3.369 2.544