Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4j6r_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 2.A NE1 GLU 48.A OE2 TRP 2.A HE1 2.832 2.143 ARG 3.A N GLU 341.A O ARG 3.A H 3.150 2.400 ALA 5.A N VAL 339.A O ALA 5.A H 3.242 2.416 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 2.870 2.015 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 3.033 2.227 CYS 11.A SG ALA 30.A O no hydrogen 3.251 N/A ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.866 2.085 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 2.907 2.155 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 2.848 2.008 GLU 19.A N LYS 16.A O GLU 19.A H 3.092 2.241 GLU 21.A N GLU 19.A OE2 GLU 21.A H 3.113 2.263 LYS 22.A N SER 93.A O LYS 22.A H 3.005 2.195 HIS 23.A N GLU 21.A OE2 HIS 23.A H 2.937 2.087 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE2 HIS 23.A HD1 2.783 1.955 ASN 24.A N GLU 21.A OE1 ASN 24.A H 2.794 1.972 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE1 ASN 24.A HD21 2.798 2.024 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 3.118 2.354 TRP 26.A N LYS 22.A O TRP 26.A H 2.943 2.095 TRP 26.A NE1 SER 67.A OG TRP 26.A HE1 3.140 2.447 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.924 2.066 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 2.960 2.290 THR 28.A N VAL 25.A O THR 28.A H 3.275 2.593 THR 28.A OG1 ASN 24.A O THR 28.A HG1 2.787 1.985 HIS 29.A N TRP 26.A O HIS 29.A H 3.053 2.287 HIS 29.A NE2 GLN 71.A OE1 HIS 29.A HE2 2.945 2.339 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.950 2.197 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 3.108 2.374 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 2.964 2.153 ASN 37.A N ASP 35.A OD1 ASN 37.A H 3.007 2.265 GLU 40.A N GLN 39.A OE1 GLU 40.A H 3.086 2.485 ILE 41.A N THR 128.A O ILE 41.A H 3.117 2.289 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 2.931 2.081 VAL 46.A N LEU 43.A O VAL 46.A H 3.214 2.510 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 3.358 2.567 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 3.031 2.217 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 2.898 2.148 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 2.950 2.180 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.063 2.266 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.108 2.296 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 3.038 2.282 GLU 59.A N ASN 56.A O GLU 59.A H 3.084 2.494 GLN 60.A N ASN 56.A O GLN 60.A H 3.188 2.375 GLN 60.A NE2 THR 7.A O GLN 60.A HE22 2.305 1.639 GLN 60.A NE2 ASN 56.A OD1 GLN 60.A HE21 3.500 2.678 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 3.055 2.205 HIS 62.A N VAL 58.A O HIS 62.A H 2.935 2.115 THR 63.A N GLU 59.A O THR 63.A H 3.047 2.205 THR 63.A OG1 GLU 59.A O THR 63.A HG1 3.556 2.878 THR 63.A OG1 GLN 60.A O THR 63.A HG1 2.840 2.192 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.136 2.339 ILE 65.A N MET 61.A O ILE 65.A H 2.896 2.087 ILE 66.A N HIS 62.A O ILE 66.A H 2.896 2.049 SER 67.A N THR 63.A O SER 67.A H 3.102 2.297 SER 67.A OG ASP 64.A O SER 67.A HG 2.624 2.032 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.862 2.059 TRP 69.A N ILE 65.A O TRP 69.A H 2.963 2.112 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.870 2.029 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 3.074 2.248 GLN 71.A NE2 SER 67.A O GLN 71.A HE21 3.387 2.910 SER 72.A N TRP 69.A O SER 72.A H 3.140 2.345 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.859 1.999 LYS 74.A NZ ASP 70.A O LYS 74.A HZ1 3.450 2.664 CYS 76.A N MET 285.A O CYS 76.A H 2.756 2.088 VAL 77.A N MET 285.A O VAL 77.A H 3.327 2.543 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 2.868 2.076 LEU 79.A N GLN 283.A O LEU 79.A H 2.883 2.031 SER 83.A OG THR 80.A O SER 83.A HG 3.472 2.761 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H 2.740 1.931 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 3.120 2.322 GLN 87.A NE2 PRO 75.A O GLN 87.A HE21 3.124 2.343 LYS 91.A NZ GLU 238.A OE2 LYS 91.A HZ3 2.873 2.054 LYS 91.A NZ ALA 287.A O LYS 91.A HZ2 2.930 2.177 LYS 91.A NZ PRO 288.A O LYS 91.A HZ2 2.950 2.262 GLU 95.A N GLU 21.A OE2 GLU 95.A H 2.827 1.974 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H 2.860 2.025 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.913 2.053 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 2.918 2.115 TYR 101.A N THR 132.A OG1 TYR 101.A H 2.972 2.121 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H 2.773 1.976 THR 103.A N GLN 130.A O THR 103.A H 3.204 2.437 PHE 107.A N PRO 104.A O PHE 107.A H 3.273 2.454 ALA 108.A N VAL 340.A O ALA 108.A H 2.917 2.142 ILE 109.A N VAL 129.A O ILE 109.A H 3.395 2.598 LEU 110.A N LYS 338.A O LEU 110.A H 2.834 2.011 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.876 2.061 CYS 112.A N LYS 336.A O CYS 112.A H 2.816 1.991 LYS 113.A N ASN 125.A O LYS 113.A H 2.855 2.015 PHE 117.A N ASP 114.A O PHE 117.A H 3.312 2.555 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 2.940 2.084 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 3.135 2.341 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.796 1.940 CYS 123.A SG ASP 114.A OD1 no hydrogen 3.190 N/A CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.330 N/A LYS 124.A N ASP 114.A OD1 LYS 124.A H 3.278 2.618 LYS 124.A N ASP 114.A OD2 LYS 124.A H 2.827 1.985 ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 2.764 1.952 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 3.035 2.209 SER 127.A OG GLU 40.A OE1 SER 127.A HG 2.851 2.033 THR 128.A N ILE 41.A O THR 128.A H 2.896 2.097 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 3.040 2.216 THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.861 2.052 THR 132.A OG1 HIS 133.A O THR 132.A HG1 2.903 2.119 HIS 133.A N TYR 337.A OH HIS 133.A H 3.186 2.364 HIS 133.A ND1 TYR 337.A OH HIS 133.A HD1 2.677 1.832 HIS 133.A NE2 GLU 333.A OE1 HIS 133.A HE2 2.882 2.060 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 2.811 1.959 LYS 136.A NZ ASN 146.A O LYS 136.A HZ1 2.875 2.220 VAL 138.A N LYS 136.A O VAL 138.A H 2.793 2.085 SER 140.A OG LEU 143.A O SER 140.A HG 2.710 2.219 THR 141.A N SER 232.A O THR 141.A H 3.130 2.371 THR 141.A OG1 GLU 227.A O THR 141.A HG1 2.698 1.943 GLN 142.A N GLY 322.A O GLN 142.A H 2.827 2.135 GLN 142.A NE2 ILE 228.A O GLN 142.A HE21 2.932 2.086 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.694 1.970 LEU 144.A N GLY 302.A O LEU 144.A H 2.870 2.047 ASN 146.A N ASN 299.A O ASN 146.A H 2.826 2.002 GLY 147.A N THR 301.A OG1 GLY 147.A H 2.941 2.217 SER 148.A N GLU 333.A OE2 SER 148.A H 2.739 1.896 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.835 2.024 THR 155.A N GLN 171.A O THR 155.A H 3.009 2.196 THR 155.A OG1 ASN 153.A O THR 155.A HG1 3.063 2.348 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.773 1.946 ARG 157.A NE PHE 117.A O ARG 157.A HE 2.885 2.129 ARG 157.A NH1 GLN 171.A OE1 ARG 157.A HH12 2.959 2.099 ARG 157.A NH2 PHE 117.A O ARG 157.A HH21 2.803 2.038 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 2.931 2.095 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 2.985 2.170 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 2.870 2.023 LYS 166.A NZ GLU 159.A OE1 LYS 166.A HZ1 2.879 2.009 ILE 168.A N LEU 305.A O ILE 168.A H 2.799 1.977 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.804 1.970 VAL 170.A N LEU 303.A O VAL 170.A H 2.883 2.029 GLN 171.A N THR 155.A O GLN 171.A H 2.846 2.019 GLN 171.A NE2 SER 148.A O GLN 171.A HE21 2.971 2.180 LEU 172.A N THR 301.A O LEU 172.A H 3.021 2.168 VAL 176.A N ILE 300.A O VAL 176.A H 3.128 2.322 THR 177.A OG1 ASN 299.A OD1 THR 177.A HG1 3.386 2.636 ILE 178.A N SER 298.A O ILE 178.A H 2.876 2.036 LYS 179.A N ASN 190.A O LYS 179.A H 2.999 2.165 CYS 180.A N CYS 296.A O CYS 180.A H 2.920 2.060 ILE 181.A N HIS 188.A O ILE 181.A H 2.953 2.173 ARG 182.A N ILE 294.A O ARG 182.A H 2.849 2.065 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 3.182 2.608 ARG 182.A NE GLY 292.A O ARG 182.A HE 3.218 2.560 ARG 182.A NH1 ILE 184.A O ARG 182.A HH11 2.578 1.795 ARG 182.A NH2 ILE 290.A O ARG 182.A HH22 2.860 2.161 ARG 182.A NH2 GLY 292.A O ARG 182.A HH21 2.647 1.818 ARG 185.A N ASP 183.A OD1 ARG 185.A H 3.172 2.345 ARG 185.A NH1 GLN 273.A OE1 ARG 185.A HH11 3.141 2.330 GLN 186.A N ASP 183.A O GLN 186.A H 3.150 2.292 ALA 187.A N CYS 269.A O ALA 187.A H 3.167 2.329 HIS 188.A N ILE 181.A O HIS 188.A H 2.949 2.141 CYS 189.A N LEU 267.A O CYS 189.A H 2.941 2.129 ASN 190.A N LYS 179.A O ASN 190.A H 2.757 1.941 VAL 191.A N ILE 265.A O VAL 191.A H 3.091 2.282 ARG 193.A N ASP 263.A O ARG 193.A H 3.004 2.190 ARG 193.A NH2 THR 264.A O ARG 193.A HH21 2.930 2.205 SER 194.A N ASP 263.A OD1 SER 194.A H 2.818 2.028 ARG 195.A NH1 PRO 175.A O ARG 195.A HH11 3.311 2.529 ARG 195.A NH2 GLN 174.A OE1 ARG 195.A HH22 3.076 2.544 TRP 196.A N THR 192.A O TRP 196.A H 2.938 2.121 TRP 196.A NE1 LEU 247.A O TRP 196.A HE1 2.923 2.077 ASN 197.A N ARG 193.A O ASN 197.A H 2.907 2.095 LYS 198.A N SER 194.A O LYS 198.A H 3.047 2.220 THR 199.A N ARG 195.A O THR 199.A H 3.138 2.334 THR 199.A OG1 ARG 195.A O THR 199.A HG1 2.946 2.173 LEU 200.A N TRP 196.A O LEU 200.A H 3.032 2.208 GLN 201.A N ASN 197.A O GLN 201.A H 2.913 2.096 GLU 202.A N LYS 198.A O GLU 202.A H 3.078 2.306 VAL 203.A N THR 199.A O VAL 203.A H 2.771 1.934 ALA 204.A N LEU 200.A O ALA 204.A H 2.820 1.981 GLU 205.A N GLN 201.A O GLU 205.A H 3.039 2.239 LYS 206.A N GLU 202.A O LYS 206.A H 3.063 2.280 LEU 207.A N VAL 203.A O LEU 207.A H 2.972 2.160 ARG 208.A N ALA 204.A O ARG 208.A H 3.050 2.289 ARG 208.A NE LYS 214.A O ARG 208.A HE 2.784 2.020 ARG 208.A NH2 TRP 252.A O ARG 208.A HH21 2.835 2.142 THR 209.A N LYS 206.A O THR 209.A H 3.075 2.284 THR 209.A OG1 LYS 206.A O THR 209.A HG1 2.602 1.800 TYR 210.A N LEU 207.A O TYR 210.A H 2.963 2.164 PHE 211.A N LEU 207.A O PHE 211.A H 3.017 2.264 GLY 212.A N ARG 208.A O GLY 212.A H 2.802 2.065 LYS 214.A N GLY 212.A O LYS 214.A H 2.573 1.962 LYS 214.A NZ ASN 313.A O LYS 214.A HZ2 3.155 2.442 LYS 214.A NZ GLU 317.A OE2 LYS 214.A HZ1 2.747 1.866 THR 215.A N VAL 315.A O THR 215.A H 2.770 1.979 ILE 216.A N TRP 252.A O ILE 216.A H 2.887 2.054 ILE 217.A N GLU 317.A O ILE 217.A H 2.860 2.025 PHE 218.A N SER 250.A O PHE 218.A H 2.867 2.028 ALA 219.A N PHE 319.A O ALA 219.A H 2.932 2.112 ASN 220.A ND2 SER 245.A OG ASN 220.A HD21 3.418 2.609 GLY 223.A N SER 221.A OG GLY 223.A H 3.213 2.411 ILE 228.A N ASP 225.A O ILE 228.A H 2.973 2.168 THR 229.A N ASP 225.A O THR 229.A H 3.191 2.419 THR 230.A N LEU 226.A O THR 230.A H 3.133 2.359 THR 230.A OG1 LEU 226.A O THR 230.A HG1 2.803 1.992 HIS 231.A N CYS 242.A O HIS 231.A H 2.930 2.174 HIS 231.A ND1 THR 141.A O HIS 231.A HD1 2.824 1.992 SER 232.A N THR 141.A OG1 SER 232.A H 3.101 2.247 PHE 233.A N PHE 240.A O PHE 233.A H 3.105 2.323 CYS 235.A N GLU 238.A O CYS 235.A H 2.887 2.087 GLU 238.A N CYS 235.A O GLU 238.A H 2.863 2.019 PHE 240.A N PHE 233.A O PHE 240.A H 2.813 2.027 TYR 241.A N ARG 270.A O TYR 241.A H 2.908 2.132 CYS 242.A N HIS 231.A O CYS 242.A H 2.859 2.043 ASN 243.A N PRO 268.A O ASN 243.A H 2.885 2.043 THR 244.A OG1 GLN 142.A OE1 THR 244.A HG1 2.602 1.845 SER 245.A N ASN 243.A OD1 SER 245.A H 3.109 2.266 LEU 247.A N THR 244.A O LEU 247.A H 2.931 2.154 PHE 248.A N THR 244.A O PHE 248.A H 3.070 2.303 SER 250.A N PHE 218.A O SER 250.A H 3.090 2.316 TRP 252.A N ILE 216.A O TRP 252.A H 2.769 1.934 TRP 252.A NE1 SER 250.A OG TRP 252.A HE1 2.797 2.067 SER 256.A N TYR 253.A O SER 256.A H 2.983 2.135 THR 257.A N ASP 260.A OD2 THR 257.A H 2.988 2.168 THR 257.A OG1 ASP 260.A OD1 THR 257.A HG1 3.251 2.536 TRP 258.A N GLN 201.A OE1 TRP 258.A H 2.981 2.162 ASP 260.A N THR 257.A O ASP 260.A H 2.874 2.025 THR 264.A N ASN 262.A OD1 THR 264.A H 2.835 1.997 ILE 265.A N VAL 191.A O ILE 265.A H 2.921 2.069 THR 266.A OG1 ASN 190.A OD1 THR 266.A HG1 2.875 2.062 LEU 267.A N CYS 189.A O LEU 267.A H 2.703 1.844 CYS 269.A N ALA 187.A O CYS 269.A H 2.881 2.067 CYS 269.A SG LEU 267.A O no hydrogen 3.504 N/A ARG 270.A N TYR 241.A O ARG 270.A H 2.919 2.157 ARG 270.A NH1 ASP 183.A OD1 ARG 270.A HH12 3.467 2.748 ARG 270.A NH1 ASP 183.A OD2 ARG 270.A HH12 3.168 2.367 ARG 270.A NH2 ASP 183.A OD1 ARG 270.A HH22 3.477 2.760 ILE 271.A N ARG 185.A O ILE 271.A H 2.831 2.010 LYS 272.A N PHE 239.A O LYS 272.A H 3.102 2.313 GLN 273.A NE2 ILE 271.A O GLN 273.A HE22 3.244 2.531 ILE 275.A N ALA 284.A O ILE 275.A H 2.870 2.044 ASN 276.A N GLU 227.A OE2 ASN 276.A H 2.929 2.074 ASN 276.A ND2 GLU 227.A OE1 ASN 276.A HD21 2.723 1.891 MET 277.A N GLY 282.A O MET 277.A H 3.121 2.296 GLN 279.A N GLN 279.A OE1 GLN 279.A H 2.882 2.077 GLN 279.A NE2 ASP 70.A OD1 GLN 279.A HE21 3.270 2.498 ARG 280.A NH1 ASP 70.A OD1 ARG 280.A HH12 3.045 2.208 ARG 280.A NH2 ASP 70.A OD2 ARG 280.A HH22 2.781 2.008 ALA 284.A N ILE 275.A O ALA 284.A H 2.898 2.078 MET 285.A N VAL 77.A O MET 285.A H 2.943 2.114 TYR 286.A N GLN 273.A O TYR 286.A H 2.758 1.959 CYS 296.A N CYS 180.A O CYS 296.A H 3.248 2.452 SER 298.A N ILE 178.A O SER 298.A H 3.005 2.171 ASN 299.A N ASN 146.A OD1 ASN 299.A H 3.180 2.341 ILE 300.A N VAL 176.A O ILE 300.A H 2.760 1.912 THR 301.A N LEU 144.A O THR 301.A H 2.917 2.072 LEU 303.A N VAL 170.A O LEU 303.A H 2.951 2.180 LEU 304.A N GLN 142.A O LEU 304.A H 2.953 2.107 LEU 305.A N ILE 168.A O LEU 305.A H 2.886 2.032 THR 306.A N ARG 320.A O THR 306.A H 2.813 1.990 ARG 307.A NH1 GLU 317.A OE1 ARG 307.A HH11 3.059 2.238 ASP 308.A N THR 318.A O ASP 308.A H 2.881 2.065 GLU 317.A N THR 215.A O GLU 317.A H 2.892 2.099 PHE 319.A N ILE 217.A O PHE 319.A H 2.792 1.959 ARG 320.A N THR 306.A O ARG 320.A H 2.878 2.064 ARG 320.A NE ASP 308.A OD1 ARG 320.A HE 2.839 1.994 ARG 320.A NH1 ASN 220.A O ARG 320.A HH11 2.857 2.018 ARG 320.A NH2 ASP 308.A OD2 ARG 320.A HH21 2.976 2.150 GLY 322.A N LEU 304.A O GLY 322.A H 2.729 1.930 ARG 327.A N ASP 325.A OD1 ARG 327.A H 3.042 2.223 ARG 327.A NE GLU 59.A OE1 ARG 327.A HE 3.009 2.157 ARG 327.A NH1 ASP 325.A OD1 ARG 327.A HH11 3.093 2.299 ASP 328.A N ASP 325.A O ASP 328.A H 2.950 2.153 ASN 329.A ND2 VAL 138.A O ASN 329.A HD21 3.539 2.804 ASN 329.A ND2 SER 140.A O ASN 329.A HD22 3.093 2.275 TRP 330.A N MET 326.A O TRP 330.A H 3.061 2.280 ARG 331.A N ARG 327.A O ARG 331.A H 2.840 2.012 ARG 331.A NH1 ASP 328.A OD1 ARG 331.A HH11 2.680 1.954 SER 332.A N ASP 328.A O SER 332.A H 3.058 2.336 SER 332.A N ASN 329.A O SER 332.A H 3.248 2.599 GLU 333.A N TRP 330.A O GLU 333.A H 2.961 2.158 LEU 334.A N TRP 330.A O LEU 334.A H 2.916 2.177 TYR 337.A N LEU 334.A O TYR 337.A H 3.010 2.156 LYS 338.A N LEU 110.A O LYS 338.A H 3.033 2.257 LYS 338.A NZ ASP 4.A OD1 LYS 338.A HZ3 2.850 1.965 LYS 338.A NZ GLU 48.A OE1 LYS 338.A HZ2 2.695 1.853 LYS 338.A NZ LYS 49.A O LYS 338.A HZ1 2.808 1.955 VAL 340.A N ALA 108.A O VAL 340.A H 2.868 2.027 GLU 341.A N ARG 3.A O GLU 341.A H 2.847 2.031 ILE 342.A N GLY 106.A O ILE 342.A H 2.896 2.082 GLU 343.A N VAL 1.A O GLU 343.A H 2.947 2.095