Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4jbd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A N ILE 298.A O LYS 2.A H 3.045 2.308 ILE 4.A N LEU 296.A O ILE 4.A H 2.961 2.156 HIS 5.A N LYS 21.A O HIS 5.A H 2.892 2.156 HIS 5.A NE2 ASP 293.A OD1 HIS 5.A HE2 2.654 1.846 VAL 6.A N SER 294.A O.A VAL 6.A H 2.961 2.124 VAL 6.A N SER 294.A O.B VAL 6.A H 2.921 2.072 ILE 7.A N LEU 18.A O ILE 7.A H 2.860 2.065 ASP 8.A N ALA 292.A O ASP 8.A H 2.844 2.039 SER 9.A N THR 16.A O SER 9.A H 2.915 2.092 HIS 10.A N HIS 289.A O HIS 10.A H 2.970 2.193 THR 11.A N GLU 14.A O THR 11.A H 2.806 1.968 THR 11.A OG1 HIS 90.A O THR 11.A HG1 2.879 2.100 GLU 14.A N THR 11.A O GLU 14.A H 3.026 2.174 THR 16.A N SER 9.A O THR 16.A H 2.872 2.038 ARG 17.A N VAL 60.A O ARG 17.A H 2.876 2.053 ARG 17.A NE ASP 8.A OD1 ARG 17.A HE 2.843 1.993 ARG 17.A NH1 CYS 49.A O ARG 17.A HH11 2.966 2.256 ARG 17.A NH1 ARG 54.A O ARG 17.A HH12 2.882 2.039 ARG 17.A NH2 ASP 8.A OD2 ARG 17.A HH21 2.890 2.037 LEU 18.A N ILE 7.A O LEU 18.A H 2.898 2.039 VAL 19.A N ALA 62.A O VAL 19.A H 2.741 1.891 MET 20.A N HIS 5.A O MET 20.A H 2.816 1.992 HIS 27.A N GLU 37.A OE1 HIS 27.A H 3.097 2.487 HIS 27.A N GLU 37.A OE2 HIS 27.A H 2.774 1.918 GLY 28.A N GLU 37.A OE1 GLY 28.A H 2.698 1.897 ARG 29.A N GLU 33.A OE1 ARG 29.A H 3.074 2.284 GLU 33.A N SER 30.A OG GLU 33.A H 3.025 2.185 GLN 34.A N SER 30.A O GLN 34.A H 2.953 2.147 GLN 34.A NE2 GLY 28.A O GLN 34.A HE21 3.165 2.493 ARG 35.A N MET 31.A O ARG 35.A H 2.902 2.084 ARG 35.A NH1 LEU 85.A O ARG 35.A HH11 2.963 2.197 ARG 35.A NH1 ASN 86.A OD1 ARG 35.A HH12 2.772 1.978 ASP 36.A N ALA 32.A O ASP 36.A H 3.067 2.230 GLU 37.A N GLU 33.A O GLU 37.A H 2.955 2.163 LEU 38.A N GLN 34.A O LEU 38.A H 3.015 2.184 ARG 39.A N ARG 35.A O ARG 39.A H 2.958 2.118 ARG 39.A NH2 ASP 36.A OD1 ARG 39.A HH21 2.992 2.183 ARG 39.A NH2 GLU 40.A OE2 ARG 39.A HH22 3.538 2.893 GLU 40.A N ASP 36.A O GLU 40.A H 2.792 1.966 LEU 41.A N GLU 37.A O LEU 41.A H 2.802 2.013 HIS 42.A N LEU 38.A O HIS 42.A H 3.070 2.300 TRP 45.A N HIS 42.A O TRP 45.A H 3.122 2.284 ARG 46.A NE ASP 43.A OD1 ARG 46.A HE 2.844 1.992 ARG 46.A NH1 ASN 80.A O ARG 46.A HH11 2.994 2.186 ARG 46.A NH2 ASP 43.A OD1 ARG 46.A HH21 3.447 2.779 ARG 46.A NH2 ASP 43.A OD2 ARG 46.A HH21 2.847 2.051 ARG 47.A N ASP 43.A O ARG 47.A H 3.156 2.330 ARG 47.A NH1 ASP 43.A OD2 ARG 47.A HH11 2.925 2.141 ALA 48.A N ARG 44.A O ALA 48.A H 2.846 2.066 CYS 49.A N TRP 45.A O CYS 49.A H 3.250 2.490 CYS 49.A N ARG 46.A O CYS 49.A H 3.081 2.455 LEU 50.A N ARG 46.A O LEU 50.A H 2.906 2.232 LEU 50.A N ARG 47.A O LEU 50.A H 3.303 2.614 LEU 51.A N ARG 47.A O LEU 51.A H 2.943 2.115 ARG 54.A NH1 ALA 48.A O ARG 54.A HH11 2.952 2.156 ARG 54.A NH1 ALA 305.A O ARG 54.A HH12 2.869 2.084 ARG 54.A NH2 LEU 297.A O ARG 54.A HH21 2.759 2.002 ARG 54.A NH2 ALA 305.A O ARG 54.A HH22 3.262 2.588 GLY 55.A N LEU 51.A O GLY 55.A H 2.897 2.079 VAL 58.A N ASN 56.A OD1 VAL 58.A H 3.181 2.520 LEU 59.A N ASN 56.A OD1 LEU 59.A H 3.268 2.573 VAL 60.A N PRO 15.A O VAL 60.A H 3.465 2.617 GLY 61.A N PHE 79.A O GLY 61.A H 2.733 1.911 ALA 62.A N ARG 17.A O ALA 62.A H 2.843 2.091 LEU 63.A N ILE 77.A O LEU 63.A H 2.834 2.015 TYR 64.A N VAL 19.A O TYR 64.A H 3.038 2.187 CYS 65.A N GLY 75.A O CYS 65.A H 2.936 2.133 CYS 65.A SG LEU 63.A O CYS 65.A HG 3.606 2.412 VAL 68.A N ASP 113.A OD2 VAL 68.A H 2.965 2.178 SER 69.A N ASP 113.A OD2 SER 69.A H 2.752 1.902 ALA 72.A N SER 69.A O ALA 72.A H 3.139 2.291 THR 73.A N LYS 111.A O THR 73.A H 2.857 2.070 GLY 75.A N CYS 65.A O GLY 75.A H 2.817 1.974 VAL 76.A N ASP 113.A O VAL 76.A H 2.911 2.186 ILE 77.A N LEU 63.A O ILE 77.A H 3.299 2.536 PHE 79.A N GLY 61.A O PHE 79.A H 2.931 2.139 ASN 80.A N GLY 83.A O ASN 80.A H 2.905 2.071 ASN 81.A ND2 ASP 57.A OD1 ASN 81.A HD22 2.648 1.836 ALA 82.A N ASN 80.A OD1 ALA 82.A H 2.846 2.035 GLY 83.A N ASN 80.A OD1 GLY 83.A H 2.989 2.233 LEU 85.A N PHE 78.A O LEU 85.A H 2.932 2.074 HIS 90.A NE2 PRO 15.A O HIS 90.A HE2 2.883 2.042 THR 92.A N CYS 88.A O THR 92.A H 2.942 2.230 THR 92.A N GLY 89.A O THR 92.A H 3.123 2.481 THR 92.A OG1 CYS 88.A O THR 92.A HG1 2.783 2.001 ILE 93.A N GLY 89.A O ILE 93.A H 3.223 2.396 GLY 94.A N HIS 90.A O GLY 94.A H 2.978 2.156 LEU 95.A N GLY 91.A O LEU 95.A H 2.817 1.992 VAL 96.A N THR 92.A O VAL 96.A H 3.037 2.199 ALA 97.A N ILE 93.A O ALA 97.A H 2.997 2.149 SER 98.A N GLY 94.A O SER 98.A H 2.920 2.134 LEU 99.A N LEU 95.A O LEU 99.A H 2.938 2.100 GLN 100.A N VAL 96.A O GLN 100.A H 3.016 2.196 HIS 101.A N ALA 97.A O HIS 101.A H 2.961 2.145 LEU 102.A N SER 98.A O LEU 102.A H 2.997 2.209 GLY 103.A N GLN 100.A O GLY 103.A H 2.985 2.151 LEU 104.A N LEU 99.A O LEU 104.A H 2.976 2.125 GLY 108.A N LEU 123.A O GLY 108.A H 2.867 2.087 HIS 110.A N ALA 121.A O HIS 110.A H 2.678 1.861 HIS 110.A ND1 THR 73.A OG1 HIS 110.A HD1 2.760 1.941 HIS 110.A NE2 ALA 106.A O HIS 110.A HE2 2.784 1.939 LYS 111.A NZ SER 120.A OG.B LYS 111.A HZ2 3.218 2.419 ILE 112.A N VAL 119.A O.A ILE 112.A H 2.913 2.069 ILE 112.A N VAL 119.A O.B ILE 112.A H 2.849 2.006 ASP 113.A N CYS 74.A O ASP 113.A H 3.033 2.221 THR 114.A N GLY 117.A O THR 114.A H 2.967 2.195 THR 114.A OG1 GLY 117.A O THR 114.A HG1 2.690 1.879 VAL 116.A N THR 114.A OG1 VAL 116.A H 3.155 2.338 GLY 117.A N THR 114.A O GLY 117.A H 3.243 2.386 GLN 118.A NE2 ASP 71.A OD1 GLN 118.A HE22 3.062 2.245 GLN 118.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 118.A HE21 3.086 2.269 VAL 119.A N.A ILE 112.A O VAL 119.A H.A 2.968 2.151 VAL 119.A N.B ILE 112.A O VAL 119.A H.B 2.955 2.131 ALA 121.A N HIS 110.A O ALA 121.A H.A 3.008 2.158 THR 122.A N THR 130.A O THR 122.A H 2.868 2.032 LEU 123.A N GLY 108.A O LEU 123.A H 2.870 2.059 HIS 124.A N ALA 128.A O HIS 124.A H 2.838 1.979 HIS 124.A NE2 THR 130.A OG1 HIS 124.A HE2 2.748 1.918 GLY 127.A N HIS 124.A O GLY 127.A H 2.941 2.093 ALA 128.A N ASP 126.A OD1 ALA 128.A H 3.003 2.153 ILE 129.A N GLY 286.A O ILE 129.A H 2.897 2.079 THR 130.A N THR 122.A O THR 130.A H 2.916 2.100 THR 130.A OG1 THR 285.A OG1 THR 130.A HG1 2.695 1.886 VAL 131.A N ILE 284.A O VAL 131.A H 2.765 1.925 ALA 132.A N SER 120.A O.A ALA 132.A H 3.368 2.555 ALA 132.A N SER 120.A O.B ALA 132.A H 3.389 2.573 ASN 133.A N PRO 282.A O ASN 133.A H 2.927 2.096 SER 136.A N ILE 280.A O SER 136.A H 2.954 2.138 SER 136.A OG VAL 134.A O SER 136.A HG 2.915 2.428 TYR 137.A N TRP 159.A O TYR 137.A H 3.048 2.274 TYR 137.A OH GLU 201.A OE1 TYR 137.A HH 2.726 1.999 ARG 138.A NH1 ASP 156.A OD2 ARG 138.A HH11 2.899 2.079 ARG 138.A NH1 ASP 250.A OD1 ARG 138.A HH12 2.866 2.073 ARG 138.A NH2 ASP 250.A OD1 ARG 138.A HH22 3.061 2.333 TYR 139.A N ILE 157.A O TYR 139.A H 2.794 1.965 ARG 140.A N ILE 157.A O ARG 140.A H 3.358 2.548 HIS 142.A N.A ASP 156.A OD1 HIS 142.A H.A 3.006 2.193 HIS 142.A N.B ASP 156.A OD1 HIS 142.A H.B 3.045 2.241 VAL 143.A N GLY 155.A O VAL 143.A H.A 2.794 1.980 VAL 145.A N VAL 153.A O VAL 145.A H 2.882 2.042 ASN 146.A N GLN 196.A OE1 ASN 146.A H 2.995 2.159 VAL 147.A N GLY 151.A O VAL 147.A H 2.972 2.146 HIS 150.A N VAL 147.A O HIS 150.A H 2.952 2.224 GLY 151.A N VAL 147.A O GLY 151.A H 3.011 2.326 VAL 153.A N VAL 145.A O VAL 153.A H 2.920 2.109 HIS 154.A ND1 HIS 142.A O.A HIS 154.A HD1 3.286 2.480 GLY 155.A N VAL 143.A O GLY 155.A H 3.005 2.223 ASP 156.A N LEU 166.A O ASP 156.A H 2.897 2.115 ILE 157.A N ARG 140.A O ILE 157.A H 2.906 2.071 ALA 158.A N PHE 164.A O ALA 158.A H 3.022 2.199 TRP 159.A N TYR 137.A O TRP 159.A H 2.893 2.082 GLY 160.A N ASN 162.A O GLY 160.A H 3.054 2.227 ASN 162.A ND2 THR 238.A OG1 ASN 162.A HD21 3.079 2.279 PHE 164.A N ALA 158.A O PHE 164.A H 2.931 2.089 PHE 165.A N HIS 208.A O PHE 165.A H 3.061 2.259 LEU 166.A N ASP 156.A O LEU 166.A H 2.842 2.021 VAL 167.A N GLU 210.A O VAL 167.A H 2.931 2.114 HIS 170.A NE2 PHE 212.A O HIS 170.A HE2 2.869 2.068 GLN 172.A NE2 HIS 170.A O GLN 172.A HE21 3.009 2.157 ARG 173.A NH1 GLU 175.A OE1 ARG 173.A HH11 2.599 1.817 ARG 173.A NH1 ASP 177.A OD1 ARG 173.A HH12 2.690 1.863 GLU 175.A N ARG 173.A O GLU 175.A H 3.085 2.461 ASN 178.A N GLU 175.A O ASN 178.A H 2.941 2.111 ASN 178.A ND2 ARG 173.A O ASN 178.A HD21 2.952 2.114 ARG 179.A N LEU 176.A O ARG 179.A H 3.114 2.321 ARG 179.A NH1 LEU 176.A O ARG 179.A HH11 3.063 2.247 LEU 182.A N ASN 178.A O LEU 182.A H 3.020 2.187 THR 183.A N ARG 179.A O THR 183.A H 2.811 2.011 THR 183.A OG1 ARG 179.A O THR 183.A HG1 2.825 2.089 GLU 184.A N GLU 180.A O GLU 184.A H 3.039 2.221 TYR 185.A N VAL 181.A O TYR 185.A H 2.964 2.142 THR 186.A N LEU 182.A O THR 186.A H 2.919 2.067 THR 186.A OG1 LEU 182.A O THR 186.A HG1 2.900 2.119 THR 186.A OG1 THR 183.A O THR 186.A HG1 3.271 2.820 TRP 187.A N THR 183.A O TRP 187.A H 2.957 2.124 ALA 188.A N GLU 184.A O ALA 188.A H 3.003 2.162 MET 189.A N TYR 185.A O MET 189.A H 2.843 2.063 LEU 190.A N THR 186.A O LEU 190.A H 2.883 2.062 LYS 191.A N TRP 187.A O LYS 191.A H 3.098 2.273 ALA 192.A N ALA 188.A O ALA 192.A H 2.944 2.140 LEU 193.A N MET 189.A O LEU 193.A H 2.903 2.065 GLU 194.A N LEU 190.A O GLU 194.A H 3.201 2.370 ALA 195.A N LYS 191.A O ALA 195.A H 2.900 2.073 GLN 196.A N ALA 192.A O GLN 196.A H 2.901 2.137 GLN 196.A NE2 ASN 146.A O GLN 196.A HE22 2.841 2.014 GLY 197.A N GLU 194.A O GLY 197.A H 3.075 2.235 ILE 198.A N LEU 193.A O ILE 198.A H 2.920 2.074 THR 199.A OG1 GLY 200.A O THR 199.A HG1 2.897 2.136 GLY 200.A N ALA 204.A O GLY 200.A H 2.717 1.917 ALA 204.A N GLU 201.A O ALA 204.A H 3.163 2.314 HIS 208.A ND1 ASP 207.A OD1 HIS 208.A HD1 2.742 1.952 VAL 209.A N MET 225.A O VAL 209.A H 3.120 2.362 GLU 210.A N PHE 165.A O GLU 210.A H 2.897 2.058 LEU 211.A N PHE 223.A O LEU 211.A H 2.889 2.078 PHE 212.A N VAL 167.A O PHE 212.A H 2.875 2.100 ALA 213.A N ARG 221.A O ALA 213.A H 2.924 2.190 ASN 217.A N ASP 215.A OD1 ASN 217.A H 2.719 1.885 ASP 219.A N VAL 260.A O ASP 219.A H 2.903 2.191 ARG 221.A N ALA 213.A O ARG 221.A H 2.854 2.038 ARG 221.A NE SER 263.A O ARG 221.A HE 2.901 2.149 ARG 221.A NH2 ILE 264.A O ARG 221.A HH21 2.741 1.967 ASN 222.A N ALA 262.A O ASN 222.A H 2.896 2.177 ASN 222.A ND2 PRO 235.A O ASN 222.A HD22 2.994 2.172 PHE 223.A N LEU 211.A O PHE 223.A H 2.977 2.207 MET 225.A N VAL 209.A O MET 225.A H 2.825 2.001 CYS 226.A N ALA 230.A O CYS 226.A H 2.807 2.025 LYS 229.A N CYS 226.A O LYS 229.A H 3.170 2.585 LYS 229.A NZ GLU 184.A OE1 LYS 229.A HZ1 3.517 2.686 LYS 229.A NZ GLU 184.A OE2 LYS 229.A HZ1 2.991 2.250 ASP 232.A N VAL 224.A O ASP 232.A H 3.101 2.311 ARG 233.A N GLU 14.A OE1 ARG 233.A H 2.917 2.065 ARG 233.A NH1 TYR 231.A O ARG 233.A HH11 2.881 2.140 SER 234.A N ASP 232.A OD1 SER 234.A H 2.808 1.982 THR 240.A N CYS 236.A O THR 240.A H 2.788 1.976 THR 240.A OG1 PRO 235.A O THR 240.A HG1 3.028 2.427 THR 240.A OG1 CYS 236.A O THR 240.A HG1 2.861 2.200 SER 241.A N GLY 237.A O SER 241.A H 2.936 2.136 ALA 242.A N THR 238.A O ALA 242.A H 2.980 2.157 LYS 243.A N GLY 239.A O LYS 243.A H 2.965 2.170 LEU 244.A N THR 240.A O LEU 244.A H 2.830 1.990 ALA 245.A N SER 241.A O ALA 245.A H 3.030 2.243 CYS 246.A N ALA 242.A O CYS 246.A H 3.111 2.358 CYS 246.A SG ALA 242.A O CYS 246.A HG 3.488 2.455 LEU 247.A N LYS 243.A O LEU 247.A H 2.892 2.056 ALA 248.A N LEU 244.A O ALA 248.A H 2.890 2.067 ALA 249.A N ALA 245.A O ALA 249.A H 2.975 2.171 ASP 250.A N CYS 246.A O ASP 250.A H 2.912 2.151 GLY 251.A N ALA 248.A O GLY 251.A H 3.134 2.364 THR 252.A N LEU 247.A O THR 252.A H 2.899 2.160 ALA 254.A N GLN 257.A OE1 ALA 254.A H 2.949 2.091 GLY 256.A N TYR 273.A O GLY 256.A H 2.928 2.125 GLN 257.A N ALA 254.A O GLN 257.A H 3.115 2.271 TRP 259.A N GLY 271.A O TRP 259.A H 2.881 2.061 TRP 259.A NE1 GLN 261.A OE1 TRP 259.A HE1 2.902 2.048 VAL 260.A N ASP 219.A OD2 VAL 260.A H 2.773 1.927 GLN 261.A N PHE 269.A O GLN 261.A H 2.946 2.135 GLN 261.A NE2 SER 220.A OG GLN 261.A HE22 3.393 2.586 GLN 261.A NE2 ALA 262.A O GLN 261.A HE21 3.137 2.303 ALA 262.A N SER 220.A O ALA 262.A H 2.850 1.996 SER 263.A N SER 267.A O SER 263.A H 2.843 2.154 SER 263.A OG ARG 233.A O SER 263.A HG 3.009 2.401 SER 263.A OG SER 267.A OG SER 263.A HG 2.799 2.204 THR 265.A N SER 263.A OG THR 265.A H 3.076 2.376 THR 265.A OG1 ARG 233.A O THR 265.A HG1 2.765 2.156 THR 265.A OG1 SER 263.A OG THR 265.A HG1 3.001 2.357 GLY 266.A N SER 263.A O GLY 266.A H 3.037 2.240 SER 267.A OG GLY 12.A O SER 267.A HG 2.756 2.019 GLN 268.A NE2 ASN 217.A O GLN 268.A HE22 3.217 2.549 PHE 269.A N GLN 261.A O PHE 269.A H 2.952 2.144 HIS 270.A N THR 285.A O HIS 270.A H 2.876 2.069 GLY 271.A N TRP 259.A O GLY 271.A H 2.806 1.991 ARG 272.A N PHE 283.A O ARG 272.A H 3.027 2.226 GLU 274.A N ARG 281.A O GLU 274.A H 2.989 2.191 ARG 275.A NH2 ALA 248.A O ARG 275.A HH22 3.329 2.750 ASP 276.A N ARG 279.A O ASP 276.A H 2.799 1.966 ARG 279.A N ASP 276.A O ARG 279.A H 3.012 2.190 ARG 279.A NH1 GLU 278.A O ARG 279.A HH11 3.292 2.487 ILE 280.A N SER 136.A O ILE 280.A H 2.900 2.063 ARG 281.A N GLU 274.A O ARG 281.A H 2.816 1.979 PHE 283.A N ARG 272.A O PHE 283.A H 2.777 1.970 ILE 284.A N VAL 131.A O ILE 284.A H 3.001 2.158 THR 285.A N HIS 270.A O THR 285.A H 2.812 1.964 GLY 286.A N ILE 129.A O GLY 286.A H 2.979 2.174 ARG 287.A NH1 ASP 126.A O ARG 287.A HH12 2.897 2.134 ARG 287.A NH2 ASP 126.A O ARG 287.A HH22 2.954 2.210 HIS 289.A N HIS 10.A O HIS 289.A H 2.942 2.170 THR 291.A N ASP 8.A O THR 291.A H 2.789 1.930 ALA 292.A N ASP 8.A O ALA 292.A H 3.157 2.346 SER 294.A N.A VAL 6.A O SER 294.A H.A 2.931 2.073 SER 294.A N.B VAL 6.A O SER 294.A H.B 2.932 2.087 LEU 296.A N ILE 4.A O LEU 296.A H 2.830 2.098 ILE 298.A N LYS 2.A O ILE 298.A H 2.862 2.015 GLN 301.A N ASP 299.A OD1 GLN 301.A H 2.874 2.048 ASP 302.A N ASP 299.A O ASP 302.A H 2.878 2.044 PHE 304.A N ASP 302.A OD1 PHE 304.A H 2.841 2.010 ALA 305.A N ASP 302.A O ALA 305.A H 2.958 2.119 GLY 307.A N PHE 304.A O GLY 307.A H 2.909 2.094 ILE 308.A N GLU 52.A O ILE 308.A H 2.786 1.972