Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4jd7_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 5.A N LEU 2.A O GLN 5.A H 3.006 2.338 SER 6.A N TYR 3.A O SER 6.A H 2.526 1.713 GLN 9.A NE2 PHE 4.A O GLN 9.A HE21 2.807 2.081 ILE 10.A N LEU 302.A O ILE 10.A H 2.988 2.191 HIS 11.A N LYS 27.A O HIS 11.A H 2.879 2.125 HIS 11.A NE2 ASP 299.A OD1 HIS 11.A HE2 2.618 1.805 VAL 12.A N SER 300.A O.A VAL 12.A H 2.909 2.078 VAL 12.A N SER 300.A O.B VAL 12.A H 2.824 1.969 ILE 13.A N LEU 24.A O ILE 13.A H 2.854 2.049 ASP 14.A N ALA 298.A O ASP 14.A H 2.877 2.090 SER 15.A N THR 22.A O SER 15.A H 2.919 2.113 HIS 16.A N HIS 295.A O HIS 16.A H 2.950 2.187 THR 17.A N GLU 20.A O THR 17.A H 2.890 2.047 THR 17.A OG1 HIS 96.A O THR 17.A HG1 2.862 2.076 GLU 20.A N THR 17.A O GLU 20.A H 3.066 2.213 THR 22.A N SER 15.A O THR 22.A H 2.881 2.058 ARG 23.A N VAL 66.A O ARG 23.A H 2.840 2.015 ARG 23.A NE ASP 14.A OD1 ARG 23.A HE 2.875 2.022 ARG 23.A NH1 CYS 55.A O ARG 23.A HH11 2.992 2.275 ARG 23.A NH1 ARG 60.A O ARG 23.A HH12 2.847 2.002 ARG 23.A NH2 ASP 14.A OD2 ARG 23.A HH21 2.882 2.025 LEU 24.A N ILE 13.A O LEU 24.A H 2.873 2.025 VAL 25.A N ALA 68.A O VAL 25.A H 2.741 1.907 MET 26.A N HIS 11.A O MET 26.A H 2.815 2.004 HIS 33.A N GLU 43.A OE2 HIS 33.A H 2.935 2.081 GLY 34.A N GLU 43.A OE1 GLY 34.A H 2.643 1.919 ARG 35.A N GLU 39.A OE2 ARG 35.A H 3.004 2.185 GLU 39.A N SER 36.A OG GLU 39.A H 3.088 2.236 GLN 40.A N SER 36.A O GLN 40.A H 2.986 2.169 GLN 40.A NE2 GLY 34.A O GLN 40.A HE21 3.000 2.269 ARG 41.A N.A MET 37.A O ARG 41.A H.A 2.806 1.979 ARG 41.A N.B MET 37.A O ARG 41.A H.B 2.807 1.979 ARG 41.A NE.A ASP 42.A OD1 ARG 41.A HE.A 2.891 2.149 ARG 41.A NH1.A ASP 42.A OD1 ARG 41.A HH11.A 3.125 2.464 ARG 41.A NH1.B ASN 92.A OD1 ARG 41.A HH12.B 2.959 2.207 ARG 41.A NH2.B ASN 92.A OD1 ARG 41.A HH22.B 3.179 2.492 ASP 42.A N ALA 38.A O ASP 42.A H.A 3.016 2.189 GLU 43.A N GLU 39.A O GLU 43.A H 2.802 2.011 LEU 44.A N GLN 40.A O LEU 44.A H 2.883 2.061 ARG 45.A N ARG 41.A O.A ARG 45.A H 3.023 2.172 ARG 45.A N ARG 41.A O.B ARG 45.A H 2.991 2.140 GLU 46.A N ASP 42.A O GLU 46.A H 2.889 2.080 LEU 47.A N GLU 43.A O LEU 47.A H 2.661 1.826 HIS 48.A N LEU 44.A O HIS 48.A H 3.027 2.268 TRP 51.A N HIS 48.A O TRP 51.A H 3.296 2.457 ARG 52.A NE ASP 49.A OD1 ARG 52.A HE 2.866 2.017 ARG 52.A NH1 ASN 86.A O ARG 52.A HH11 2.973 2.161 ARG 52.A NH2 ASP 49.A OD1 ARG 52.A HH21 3.562 2.920 ARG 52.A NH2 ASP 49.A OD2 ARG 52.A HH21 2.905 2.102 ARG 53.A N ASP 49.A O ARG 53.A H 3.203 2.364 ARG 53.A NE ASP 49.A OD2 ARG 53.A HE 2.849 2.024 ALA 54.A N ARG 50.A O ALA 54.A H 2.853 2.031 CYS 55.A N TRP 51.A O CYS 55.A H 3.228 2.463 CYS 55.A N ARG 52.A O CYS 55.A H 3.088 2.466 LEU 56.A N ARG 52.A O LEU 56.A H 2.906 2.247 LEU 57.A N ARG 53.A O LEU 57.A H 2.966 2.155 ARG 60.A NH1 ALA 54.A O ARG 60.A HH11 3.010 2.209 ARG 60.A NH1 ALA 311.A O ARG 60.A HH12 2.865 2.073 ARG 60.A NH2 LEU 303.A O ARG 60.A HH21 2.743 1.977 ARG 60.A NH2 ALA 311.A O ARG 60.A HH22 3.111 2.395 GLY 61.A N LEU 57.A O GLY 61.A H 2.852 2.034 VAL 64.A N ASN 62.A OD1 VAL 64.A H 2.868 2.185 LEU 65.A N ASN 62.A OD1 LEU 65.A H 2.909 2.282 VAL 66.A N PRO 21.A O VAL 66.A H 3.227 2.387 GLY 67.A N PHE 85.A O GLY 67.A H 2.767 1.967 ALA 68.A N ARG 23.A O ALA 68.A H 2.840 2.069 LEU 69.A N ILE 83.A O LEU 69.A H 2.805 1.981 TYR 70.A N VAL 25.A O TYR 70.A H 3.070 2.238 CYS 71.A N GLY 81.A O CYS 71.A H 3.008 2.209 VAL 74.A N ASP 119.A OD2 VAL 74.A H 2.928 2.103 SER 75.A N ASP 119.A OD2 SER 75.A H 2.581 1.765 ALA 78.A N SER 75.A O ALA 78.A H 2.971 2.148 THR 79.A N LYS 117.A O THR 79.A H 2.801 1.983 GLY 81.A N CYS 71.A O GLY 81.A H 2.860 2.013 VAL 82.A N ASP 119.A O VAL 82.A H 2.888 2.156 ILE 83.A N LEU 69.A O ILE 83.A H 3.250 2.483 PHE 85.A N GLY 67.A O PHE 85.A H 2.918 2.146 ASN 86.A N GLY 89.A O ASN 86.A H 2.866 2.044 ALA 88.A N ASN 86.A OD1 ALA 88.A H 2.895 2.060 GLY 89.A N ASN 86.A OD1 GLY 89.A H 2.995 2.264 LEU 91.A N PHE 84.A O LEU 91.A H 2.983 2.137 THR 98.A N CYS 94.A O THR 98.A H 2.900 2.169 THR 98.A N GLY 95.A O THR 98.A H 3.112 2.514 THR 98.A OG1 CYS 94.A O THR 98.A HG1 2.833 2.058 ILE 99.A N GLY 95.A O ILE 99.A H 3.058 2.228 GLY 100.A N HIS 96.A O GLY 100.A H 3.017 2.180 LEU 101.A N GLY 97.A O LEU 101.A H 2.822 1.997 VAL 102.A N THR 98.A O VAL 102.A H 2.917 2.081 ALA 103.A N ILE 99.A O ALA 103.A H 3.022 2.166 SER 104.A N GLY 100.A O SER 104.A H 2.940 2.107 LEU 105.A N LEU 101.A O LEU 105.A H 2.893 2.055 GLN 106.A N VAL 102.A O GLN 106.A H 3.041 2.261 HIS 107.A N ALA 103.A O HIS 107.A H 3.088 2.269 LEU 108.A N SER 104.A O LEU 108.A H 2.898 2.115 GLY 109.A N GLN 106.A O GLY 109.A H 2.987 2.180 LEU 110.A N LEU 105.A O LEU 110.A H 2.886 2.066 GLY 114.A N LEU 129.A O GLY 114.A H 2.816 2.042 HIS 116.A N ALA 127.A O HIS 116.A H 2.907 2.067 HIS 116.A ND1 THR 79.A OG1 HIS 116.A HD1 2.944 2.190 HIS 116.A NE2 ALA 112.A O HIS 116.A HE2 2.613 1.771 ASP 119.A N CYS 80.A O ASP 119.A H 2.826 2.009 THR 120.A N GLY 123.A O THR 120.A H 3.047 2.346 THR 120.A OG1 GLY 123.A O THR 120.A HG1 2.436 1.617 VAL 122.A N THR 120.A OG1 VAL 122.A H 3.235 2.413 GLY 123.A N THR 120.A O GLY 123.A H 3.074 2.233 GLN 124.A NE2 ASP 77.A OD1 GLN 124.A HE22 2.574 1.927 GLN 124.A NE2 ASP 77.A OD2 GLN 124.A HE22 3.137 2.377 GLN 124.A NE2 ASP 119.A OD1 GLN 124.A HE21 3.200 2.348 ALA 127.A N HIS 116.A O ALA 127.A H 3.170 2.320 THR 128.A N THR 136.A O THR 128.A H 2.881 2.063 LEU 129.A N GLY 114.A O LEU 129.A H 2.897 2.106 HIS 130.A N ALA 134.A O HIS 130.A H 2.877 2.034 HIS 130.A NE2 THR 136.A OG1 HIS 130.A HE2 2.713 1.880 GLY 133.A N HIS 130.A O GLY 133.A H 2.956 2.113 ALA 134.A N ASP 132.A OD1 ALA 134.A H 3.028 2.177 ILE 135.A N GLY 292.A O ILE 135.A H 2.880 2.058 THR 136.A N THR 128.A O THR 136.A H 2.915 2.111 THR 136.A OG1 THR 291.A OG1 THR 136.A HG1 2.615 1.818 VAL 137.A N ILE 290.A O VAL 137.A H 2.801 1.975 ALA 138.A N SER 126.A O ALA 138.A H 3.371 2.596 ASN 139.A N PRO 288.A O ASN 139.A H 2.937 2.131 ASN 139.A ND2 VAL 140.A O ASN 139.A HD21 3.115 2.293 ASN 139.A ND2 GLY 166.A O ASN 139.A HD22 2.875 2.026 SER 142.A N ILE 286.A O SER 142.A H 2.957 2.150 SER 142.A OG VAL 140.A O SER 142.A HG 3.064 2.528 TYR 143.A N TRP 165.A O TYR 143.A H 3.054 2.284 TYR 143.A OH GLU 207.A OE1 TYR 143.A HH 2.163 1.477 ARG 144.A NH1 ASP 162.A OD2 ARG 144.A HH11 2.904 2.117 ARG 144.A NH1 ASP 256.A OD1 ARG 144.A HH12 3.037 2.306 ARG 144.A NH1 ASP 256.A OD2 ARG 144.A HH12 3.214 2.416 ARG 144.A NH2 ASP 256.A OD1 ARG 144.A HH22 2.852 2.057 TYR 145.A N ILE 163.A O TYR 145.A H 2.787 1.987 ARG 146.A N ILE 163.A O ARG 146.A H 3.211 2.400 HIS 148.A N ASP 162.A OD1 HIS 148.A H 2.914 2.106 VAL 149.A N GLY 161.A O VAL 149.A H 2.800 1.967 VAL 151.A N VAL 159.A O VAL 151.A H 2.839 1.998 ASN 152.A N.A GLN 202.A OE1 ASN 152.A H.A 2.951 2.120 ASN 152.A N.B GLN 202.A OE1 ASN 152.A H.B 2.945 2.097 VAL 153.A N GLY 157.A O VAL 153.A H.A 3.032 2.194 HIS 156.A N VAL 153.A O HIS 156.A H 2.739 1.980 VAL 159.A N VAL 151.A O VAL 159.A H 2.842 2.001 GLY 161.A N VAL 149.A O GLY 161.A H 2.948 2.176 ASP 162.A N LEU 172.A O ASP 162.A H 2.911 2.150 ILE 163.A N ARG 146.A O ILE 163.A H 2.895 2.048 ALA 164.A N PHE 170.A O ALA 164.A H 3.037 2.217 TRP 165.A N TYR 143.A O TRP 165.A H 2.906 2.084 GLY 166.A N ASN 168.A O GLY 166.A H 3.049 2.218 ASN 168.A ND2 THR 244.A OG1 ASN 168.A HD21 3.141 2.362 PHE 170.A N ALA 164.A O PHE 170.A H 2.903 2.047 PHE 171.A N HIS 214.A O PHE 171.A H 3.056 2.262 LEU 172.A N ASP 162.A O LEU 172.A H 2.796 1.975 VAL 173.A N GLU 216.A O VAL 173.A H 2.947 2.110 GLU 175.A N PHE 218.A O GLU 175.A H 2.894 2.072 GLY 177.A N GLU 175.A OE2 GLY 177.A H 2.830 2.096 GLN 178.A N GLU 175.A OE2 GLN 178.A H 2.971 2.334 ARG 179.A NH1 ASP 183.A OD1 ARG 179.A HH12 2.916 2.105 GLU 181.A N ARG 179.A O GLU 181.A H 3.044 2.449 ASN 184.A N GLU 181.A O ASN 184.A H 2.890 2.069 ASN 184.A ND2 ARG 179.A O ASN 184.A HD21 2.992 2.141 ARG 185.A N LEU 182.A O ARG 185.A H 3.079 2.282 ARG 185.A NH1 LEU 182.A O ARG 185.A HH11 2.947 2.138 LEU 188.A N ASN 184.A O LEU 188.A H 3.051 2.225 THR 189.A N ARG 185.A O THR 189.A H 2.828 2.025 THR 189.A OG1 ARG 185.A O THR 189.A HG1 2.740 2.015 GLU 190.A N GLU 186.A O GLU 190.A H 2.998 2.182 TYR 191.A N VAL 187.A O TYR 191.A H 3.009 2.189 THR 192.A N LEU 188.A O THR 192.A H 2.925 2.074 THR 192.A OG1 LEU 188.A O THR 192.A HG1 2.856 2.080 THR 192.A OG1 THR 189.A O THR 192.A HG1 3.351 2.879 TRP 193.A N THR 189.A O TRP 193.A H 2.906 2.066 ALA 194.A N GLU 190.A O ALA 194.A H 2.963 2.118 MET 195.A N TYR 191.A O MET 195.A H 2.891 2.128 LEU 196.A N THR 192.A O LEU 196.A H 2.929 2.136 LYS 197.A N TRP 193.A O LYS 197.A H 3.081 2.259 ALA 198.A N ALA 194.A O ALA 198.A H 2.854 2.062 LEU 199.A N MET 195.A O LEU 199.A H 2.906 2.064 GLU 200.A N LEU 196.A O GLU 200.A H 3.136 2.298 ALA 201.A N LYS 197.A O ALA 201.A H 2.921 2.104 GLN 202.A N ALA 198.A O GLN 202.A H 2.851 2.086 GLN 202.A NE2 ASN 152.A O.A GLN 202.A HE22 2.858 2.024 GLN 202.A NE2 ASN 152.A O.B GLN 202.A HE22 2.913 2.081 GLY 203.A N GLU 200.A O GLY 203.A H 3.160 2.320 ILE 204.A N LEU 199.A O ILE 204.A H 2.848 2.008 THR 205.A OG1 GLY 206.A O THR 205.A HG1 2.866 2.138 GLY 206.A N ALA 210.A O GLY 206.A H 2.690 1.877 ALA 210.A N GLU 207.A O ALA 210.A H 3.095 2.267 HIS 214.A N TRP 169.A O HIS 214.A H 3.331 2.615 HIS 214.A ND1 ASP 213.A OD1 HIS 214.A HD1 2.827 2.033 VAL 215.A N MET 231.A O VAL 215.A H 3.076 2.311 GLU 216.A N PHE 171.A O GLU 216.A H 2.946 2.120 LEU 217.A N PHE 229.A O LEU 217.A H 2.865 2.044 PHE 218.A N VAL 173.A O PHE 218.A H 2.863 2.124 ALA 219.A N ARG 227.A O ALA 219.A H 2.896 2.104 ASN 223.A N ASP 221.A OD1 ASN 223.A H 2.834 1.999 ASP 225.A N VAL 266.A O ASP 225.A H 2.877 2.156 ARG 227.A N ALA 219.A O ARG 227.A H 2.806 1.995 ARG 227.A NE ILE 180.A O ARG 227.A HE 2.862 2.059 ARG 227.A NH1 ASP 221.A OD2 ARG 227.A HH11 2.892 2.048 ARG 227.A NH2 ILE 180.A O ARG 227.A HH21 3.054 2.331 ASN 228.A N ALA 268.A O ASN 228.A H 2.924 2.201 ASN 228.A ND2 PRO 241.A O ASN 228.A HD22 2.977 2.155 PHE 229.A N LEU 217.A O PHE 229.A H 3.009 2.234 MET 231.A N VAL 215.A O MET 231.A H 2.836 2.014 CYS 232.A N ALA 236.A O CYS 232.A H 2.790 1.999 ALA 236.A N CYS 232.A O ALA 236.A H 3.291 2.477 ASP 238.A N VAL 230.A O ASP 238.A H 3.017 2.232 ARG 239.A N GLU 20.A OE1 ARG 239.A H 2.933 2.085 ARG 239.A NH1 TYR 237.A O ARG 239.A HH11 2.877 2.126 SER 240.A N ASP 238.A OD1 SER 240.A H 2.876 2.068 THR 246.A N CYS 242.A O THR 246.A H 2.761 1.935 THR 246.A OG1 PRO 241.A O THR 246.A HG1 3.028 2.438 THR 246.A OG1 CYS 242.A O THR 246.A HG1 2.824 2.157 SER 247.A N GLY 243.A O SER 247.A H 2.901 2.089 ALA 248.A N THR 244.A O ALA 248.A H 2.904 2.080 LYS 249.A N GLY 245.A O LYS 249.A H 2.943 2.142 LEU 250.A N THR 246.A O LEU 250.A H 2.848 2.026 ALA 251.A N SER 247.A O ALA 251.A H 2.993 2.237 CYS 252.A N ALA 248.A O CYS 252.A H 3.156 2.370 CYS 252.A SG ALA 248.A O CYS 252.A HG 3.518 2.438 LEU 253.A N LYS 249.A O LEU 253.A H 2.895 2.050 ALA 254.A N LEU 250.A O ALA 254.A H 2.808 1.979 ALA 255.A N ALA 251.A O ALA 255.A H 2.989 2.187 ASP 256.A N CYS 252.A O ASP 256.A H 3.000 2.213 GLY 257.A N ALA 254.A O GLY 257.A H 3.161 2.386 GLY 262.A N TYR 279.A O GLY 262.A H 3.336 2.553 GLN 263.A N ALA 260.A O GLN 263.A H 3.104 2.269 TRP 265.A N GLY 277.A O TRP 265.A H 2.824 1.985 TRP 265.A NE1 GLN 267.A OE1 TRP 265.A HE1 2.881 2.032 VAL 266.A N ASP 225.A OD2 VAL 266.A H 2.789 1.937 GLN 267.A N PHE 275.A O GLN 267.A H 2.893 2.046 GLN 267.A NE2 ALA 268.A O GLN 267.A HE21 3.139 2.293 ALA 268.A N SER 226.A O ALA 268.A H 2.812 1.962 SER 269.A N SER 273.A O SER 269.A H 2.816 2.064 SER 269.A OG ARG 239.A O SER 269.A HG 3.057 2.456 SER 269.A OG SER 273.A OG SER 269.A HG 2.740 2.153 THR 271.A N SER 269.A OG THR 271.A H 3.088 2.390 THR 271.A OG1 ARG 239.A O THR 271.A HG1 2.783 2.175 THR 271.A OG1 SER 269.A OG THR 271.A HG1 3.034 2.381 GLY 272.A N SER 269.A O GLY 272.A H 3.006 2.171 SER 273.A N SER 269.A OG SER 273.A H 3.071 2.418 SER 273.A OG GLY 18.A O SER 273.A HG 2.740 1.987 GLN 274.A NE2 ASN 223.A O GLN 274.A HE22 2.985 2.262 PHE 275.A N GLN 267.A O PHE 275.A H 2.995 2.174 HIS 276.A N THR 291.A O HIS 276.A H 2.884 2.048 GLY 277.A N TRP 265.A O GLY 277.A H 2.756 1.967 ARG 278.A N PHE 289.A O ARG 278.A H 3.074 2.293 ARG 278.A NH2 GLU 280.A OE2 ARG 278.A HH22 3.250 2.461 GLU 280.A N ARG 287.A O GLU 280.A H 2.998 2.186 ASP 282.A N ARG 285.A O ASP 282.A H 2.893 2.070 ARG 285.A N ASP 282.A O ARG 285.A H 2.980 2.153 ILE 286.A N SER 142.A O ILE 286.A H 2.912 2.081 ARG 287.A N GLU 280.A O ARG 287.A H 2.814 1.990 ARG 287.A NE GLU 280.A OE1 ARG 287.A HE 3.299 2.633 ARG 287.A NH1 GLU 280.A OE1 ARG 287.A HH11 2.793 1.994 PHE 289.A N ARG 278.A O PHE 289.A H 2.841 2.017 ILE 290.A N VAL 137.A O ILE 290.A H 2.869 2.034 THR 291.A N HIS 276.A O THR 291.A H 2.761 1.905 GLY 292.A N ILE 135.A O GLY 292.A H 2.969 2.156 ARG 293.A NH1 ASP 132.A O ARG 293.A HH12 2.950 2.252 ARG 293.A NH2 ASP 132.A O ARG 293.A HH22 2.720 1.939 HIS 295.A N HIS 16.A O HIS 295.A H 2.958 2.160 THR 297.A N ASP 14.A O THR 297.A H 2.812 1.953 ALA 298.A N ASP 14.A O ALA 298.A H 3.223 2.432 SER 300.A N.A VAL 12.A O SER 300.A H.A 2.923 2.064 SER 300.A N.B VAL 12.A O SER 300.A H.B 2.934 2.084 LEU 302.A N ILE 10.A O LEU 302.A H 2.788 2.031 ILE 304.A N LYS 8.A O ILE 304.A H 2.898 2.087 GLN 307.A N ASP 305.A OD1 GLN 307.A H 2.909 2.079 ASP 308.A N ASP 305.A O ASP 308.A H 2.984 2.153 PHE 310.A N ASP 308.A OD1 PHE 310.A H 2.838 2.027 ALA 311.A N ASP 308.A O ALA 311.A H 2.930 2.102 GLY 313.A N PHE 310.A O GLY 313.A H 2.910 2.075 ILE 314.A N GLU 58.A O ILE 314.A H 2.786 1.968