Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4jyb_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N ASP 1.A O LEU 5.A H 2.993 2.199 ARG 6.A N MET 2.A O ARG 6.A H 2.909 2.068 ARG 6.A NH1 ASP 3.A OD1 ARG 6.A HH12 2.835 2.238 GLU 7.A N ASP 3.A O GLU 7.A H 3.220 2.365 ARG 8.A N THR 4.A O ARG 8.A H 2.704 1.860 LEU 9.A N LEU 5.A O LEU 9.A H 2.867 2.028 LEU 10.A N ARG 6.A O LEU 10.A H 2.801 1.975 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.010 2.263 GLY 12.A N LEU 9.A O GLY 12.A H 2.956 2.121 ASP 13.A N ARG 8.A O ASP 13.A H 2.854 2.011 ARG 14.A NH1.A ALA 112.A O ARG 14.A HH12.A 2.535 1.712 ARG 14.A NH1.B ARG 110.A O ARG 14.A HH12.B 2.749 2.112 ARG 14.A NH2.A ALA 112.A O ARG 14.A HH22.A 3.345 2.768 ARG 14.A NH2.B ARG 110.A O ARG 14.A HH22.B 2.410 1.654 ALA 16.A N ASP 13.A OD1 ALA 16.A H 3.210 2.395 LEU 17.A N ASP 13.A O LEU 17.A H 2.985 2.191 ALA 18.A N ARG 14.A O ALA 18.A H 2.856 2.005 ARG 19.A N ALA 15.A O ARG 19.A H 2.999 2.203 ALA 20.A N ALA 16.A O ALA 20.A H 2.946 2.113 ILE 21.A N LEU 17.A O ILE 21.A H 3.036 2.230 THR 22.A N ALA 18.A O THR 22.A H 3.034 2.188 THR 22.A OG1 ARG 19.A O THR 22.A HG1 2.815 2.029 LEU 23.A N ARG 19.A O LEU 23.A H 3.239 2.472 ALA 24.A N ALA 20.A O ALA 24.A H 2.920 2.127 GLU 25.A N ILE 21.A O GLU 25.A H 2.850 2.085 SER 26.A N LEU 23.A O SER 26.A H 3.229 2.411 SER 26.A OG HIS 31.A ND1 SER 26.A HG 3.165 2.326 ARG 28.A N SER 26.A OG ARG 28.A H 2.978 2.142 HIS 31.A N ARG 28.A O HIS 31.A H 3.155 2.543 ARG 32.A N ARG 28.A O ARG 32.A H 3.184 2.360 ARG 32.A NE SER 26.A O ARG 32.A HE 2.857 2.172 ALA 33.A N ALA 29.A O ALA 33.A H 2.953 2.116 ALA 34.A N ASP 30.A O ALA 34.A H 3.233 2.506 ALA 34.A N HIS 31.A O ALA 34.A H 3.079 2.484 ARG 36.A N ALA 33.A O ARG 36.A H 3.105 2.264 ILE 39.A N VAL 35.A O ILE 39.A H 3.161 2.325 ASP 40.A N ARG 36.A O ASP 40.A H 3.105 2.273 ALA 41.A N ASP 37.A O ALA 41.A H 2.804 1.995 VAL 42.A N LEU 38.A O VAL 42.A H 3.005 2.286 VAL 42.A N ILE 39.A O VAL 42.A H 3.257 2.630 LEU 43.A N ASP 40.A O LEU 43.A H 3.396 2.554 GLN 45.A N VAL 42.A O GLN 45.A H 2.864 2.070 THR 46.A N LEU 43.A O THR 46.A H 2.943 2.088 THR 46.A OG1 LEU 43.A O THR 46.A HG1 2.796 1.956 GLY 47.A N GLU 138.A OE1 GLY 47.A H 2.784 1.972 ILE 50.A N ASP 143.A O ILE 50.A H 2.920 2.125 ARG 51.A N ASP 164.A OD2 ARG 51.A H 3.271 2.445 ARG 51.A NE GLU 138.A OE2 ARG 51.A HE 2.702 1.848 ARG 51.A NH2 GLU 138.A OE1 ARG 51.A HH21 2.793 1.938 ARG 51.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 51.A HH21 3.339 2.691 VAL 52.A N ILE 145.A O VAL 52.A H 2.922 2.084 GLY 53.A N PHE 165.A O GLY 53.A H 2.749 1.952 ILE 54.A N VAL 147.A O ILE 54.A H 2.733 1.931 THR 55.A N LEU 167.A O THR 55.A H 2.997 2.177 THR 55.A OG1 THR 149.A OG1 THR 55.A HG1 2.558 1.737 VAL 60.A N VAL 57.A O VAL 60.A H 3.084 2.269 LYS 62.A NZ GLY 56.A O LYS 62.A HZ2 2.917 2.114 THR 65.A N GLY 61.A O THR 65.A H 2.880 2.112 THR 65.A OG1 GLY 61.A O THR 65.A HG1 2.707 1.891 ILE 66.A N LYS 62.A O ILE 66.A H 2.898 2.056 ASP 67.A N SER 63.A O ASP 67.A H 2.897 2.054 ALA 68.A N THR 64.A O ALA 68.A H 3.134 2.292 LEU 69.A N THR 65.A O LEU 69.A H 2.838 1.986 GLY 70.A N ILE 66.A O GLY 70.A H 2.719 1.866 SER 71.A N ASP 67.A O SER 71.A H 3.156 2.342 SER 71.A OG ASP 67.A O SER 71.A HG 2.812 1.993 LEU 72.A N ALA 68.A O LEU 72.A H 3.099 2.283 LEU 73.A N LEU 69.A O LEU 73.A H 3.015 2.230 THR 74.A N GLY 70.A O THR 74.A H 2.682 1.854 THR 74.A OG1 ASP 109.A OD2 THR 74.A HG1 2.711 1.875 ALA 75.A N SER 71.A O ALA 75.A H 2.977 2.180 ALA 76.A N LEU 72.A O ALA 76.A H 3.260 2.500 ALA 76.A N LEU 73.A O ALA 76.A H 3.177 2.577 GLY 77.A N THR 74.A O GLY 77.A H 2.967 2.124 HIS 78.A N LEU 73.A O HIS 78.A H 3.118 2.285 HIS 78.A ND1 ASP 143.A OD2 HIS 78.A HD1 2.463 1.658 LYS 79.A N ASP 143.A OD1 LYS 79.A H 2.767 1.929 LYS 79.A NZ GLY 77.A O LYS 79.A HZ3 3.533 2.912 VAL 80.A N ASN 111.A O VAL 80.A H 3.014 2.200 ALA 81.A N VAL 144.A O ALA 81.A H 2.892 2.053 VAL 82.A N PHE 113.A O VAL 82.A H 2.879 2.055 LEU 83.A N LEU 146.A O LEU 83.A H 2.872 2.037 VAL 85.A N GLU 148.A O VAL 85.A H 2.908 2.069 ASP 86.A N SER 117.A OG ASP 86.A H 2.753 1.930 SER 88.A N ASP 86.A OD1 SER 88.A H 2.990 2.180 SER 88.A OG ASP 86.A OD1 SER 88.A HG 2.663 1.901 SER 89.A N ASP 86.A O SER 89.A H 2.907 2.081 THR 90.A N PRO 87.A O THR 90.A H 3.364 2.508 THR 90.A OG1 PRO 87.A O THR 90.A HG1 3.036 2.197 ARG 91.A N SER 88.A O ARG 91.A H 2.915 2.090 GLY 94.A N THR 92.A OG1 GLY 94.A H 2.804 1.978 GLY 98.A N SER 95.A OG GLY 98.A H 2.693 1.943 LYS 100.A NZ LEU 97.A O LYS 100.A HZ3 2.979 2.124 ARG 102.A NE ASP 99.A O ARG 102.A HE 2.540 1.812 MET 103.A N LYS 100.A O MET 103.A H 2.981 2.261 LEU 106.A N ASP 67.A OD1 LEU 106.A H 2.984 2.127 ALA 107.A N MET 103.A O ALA 107.A H 2.925 2.122 ILE 108.A N ARG 105.A O ILE 108.A H 3.096 2.322 ASP 109.A N LEU 106.A O ASP 109.A H 3.033 2.207 ASN 111.A N ASP 109.A OD1 ASN 111.A H 2.962 2.131 ASN 111.A ND2 ASP 109.A OD1 ASN 111.A HD22 3.119 2.460 ALA 112.A N ASP 109.A O ALA 112.A H 2.984 2.148 PHE 113.A N VAL 80.A O PHE 113.A H 2.982 2.314 ARG 115.A N VAL 82.A O ARG 115.A H 2.839 2.023 SER 117.A OG PRO 118.A O SER 117.A HG 3.312 2.474 SER 119.A OG THR 92.A O SER 119.A HG 2.817 2.040 GLY 121.A N GLU 280.A OE2 GLY 121.A H 2.737 1.938 THR 122.A OG1 GLU 280.A OE1 THR 122.A HG1 2.669 1.838 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 2.859 2.257 GLY 125.A N THR 122.A OG1 GLY 125.A H 3.155 2.433 VAL 126.A N THR 122.A O VAL 126.A H 2.944 2.143 ALA 127.A N LEU 123.A O ALA 127.A H 2.987 2.141 ALA 128.A N GLY 124.A O ALA 128.A H 2.883 2.077 LYS 129.A N GLY 125.A O LYS 129.A H 2.995 2.146 LYS 129.A NZ GLU 25.A O LYS 129.A HZ3 2.881 2.030 LYS 129.A NZ SER 119.A O LYS 129.A HZ2 2.594 1.783 THR 130.A N VAL 126.A O THR 130.A H 3.007 2.213 THR 130.A OG1 VAL 126.A O THR 130.A HG1 3.331 2.515 ARG 131.A N ALA 127.A O ARG 131.A H 2.917 2.107 ARG 131.A NH2 LEU 162.A O ARG 131.A HH21 3.062 2.300 ARG 131.A NH2 GLN 269.A OE1 ARG 131.A HH22 2.940 2.133 GLU 132.A N ALA 128.A O GLU 132.A H 3.098 2.283 THR 133.A N LYS 129.A O THR 133.A H 2.996 2.175 THR 133.A OG1 GLU 25.A OE1 THR 133.A HG1 2.632 1.810 MET 134.A N THR 130.A O MET 134.A H 2.772 1.974 LEU 135.A N ARG 131.A O LEU 135.A H 3.017 2.201 LEU 136.A N GLU 132.A O LEU 136.A H 3.027 2.203 CYS 137.A N THR 133.A O CYS 137.A H 3.027 2.179 CYS 137.A SG THR 133.A O CYS 137.A HG 3.360 2.332 GLU 138.A N MET 134.A O GLU 138.A H 3.028 2.196 ALA 139.A N LEU 135.A O ALA 139.A H 3.007 2.178 ALA 140.A N LEU 136.A O ALA 140.A H 2.981 2.264 ALA 140.A N CYS 137.A O ALA 140.A H 2.917 2.296 GLY 141.A N GLU 138.A O GLY 141.A H 3.003 2.231 PHE 142.A N CYS 137.A O PHE 142.A H 3.121 2.264 ASP 143.A N LYS 79.A O ASP 143.A H 3.075 2.315 VAL 144.A N LYS 79.A O VAL 144.A H 3.190 2.351 ILE 145.A N ILE 50.A O ILE 145.A H 2.982 2.136 LEU 146.A N ALA 81.A O LEU 146.A H 2.732 1.873 VAL 147.A N VAL 52.A O VAL 147.A H 2.877 2.050 GLU 148.A N LEU 83.A O GLU 148.A H 3.034 2.209 THR 149.A N ILE 54.A O THR 149.A H 3.135 2.339 VAL 150.A N VAL 85.A O VAL 150.A H 3.061 2.299 SER 155.A N GLY 153.A O SER 155.A H 3.143 2.510 GLU 156.A N GLU 156.A OE1 GLU 156.A H 2.831 2.055 VAL 159.A N SER 155.A O VAL 159.A H 3.066 2.253 ALA 160.A N GLU 156.A O ALA 160.A H 2.847 1.999 ASP 161.A N THR 157.A O ASP 161.A H 2.767 1.961 LEU 162.A N VAL 159.A O LEU 162.A H 2.959 2.142 THR 163.A N ALA 160.A O THR 163.A H 3.400 2.545 THR 163.A OG1 VAL 159.A O THR 163.A HG1 2.960 2.120 ASP 164.A N ARG 51.A O ASP 164.A H 2.815 1.998 PHE 166.A N ASP 190.A OD2 PHE 166.A H 2.953 2.184 LEU 167.A N GLY 53.A O LEU 167.A H 2.732 1.877 VAL 168.A N MET 191.A O VAL 168.A H 3.026 2.171 LEU 169.A N THR 55.A O LEU 169.A H 2.814 1.963 MET 170.A N ALA 193.A O MET 170.A H 2.915 2.097 LEU 171.A N GLN 179.A OE1 LEU 171.A H 2.980 2.143 GLY 173.A N ARG 205.A O GLY 173.A H 3.126 2.324 GLY 175.A N GLU 212.A OE2 GLY 175.A H 2.962 2.151 GLU 177.A N ALA 174.A O GLU 177.A H 3.042 2.235 LEU 178.A N GLY 175.A O LEU 178.A H 2.959 2.104 GLY 180.A N TYR 213.A OH GLY 180.A H 3.247 2.393 LYS 182.A NZ GLU 156.A OE1 LYS 182.A HZ3 3.538 2.893 LYS 182.A NZ GLU 156.A OE2 LYS 182.A HZ3 2.849 1.960 ILE 185.A N LYS 182.A O ILE 185.A H 3.008 2.168 LEU 188.A N ILE 185.A O LEU 188.A H 3.197 2.578 ALA 189.A N PHE 186.A O ALA 189.A H 3.206 2.395 ASP 190.A N PHE 166.A O ASP 190.A H 2.754 1.918 ILE 192.A N PRO 230.A O ILE 192.A H 3.012 2.220 ALA 193.A N VAL 168.A O ALA 193.A H 2.868 2.030 VAL 194.A N VAL 232.A O VAL 194.A H 2.776 1.956 ASN 195.A N MET 170.A O ASN 195.A H 2.903 2.056 ASN 195.A ND2 VAL 60.A O ASN 195.A HD22 2.865 2.011 LYS 196.A NZ GLY 59.A O LYS 196.A HZ1 2.845 2.031 ALA 197.A N ILE 234.A O ALA 197.A H 2.951 2.125 GLU 203.A N ASP 198.A O GLU 203.A H 3.037 2.287 ARG 204.A NH2 ASP 201.A OD1 ARG 204.A HH21 2.611 1.980 ARG 205.A N ASP 201.A O ARG 205.A H 3.230 2.384 ALA 206.A N GLY 202.A O ALA 206.A H 2.832 1.997 SER 207.A N GLU 203.A O SER 207.A H 2.927 2.093 SER 207.A OG GLU 203.A O SER 207.A HG 2.400 1.648 ALA 208.A N ARG 204.A O ALA 208.A H 3.077 2.273 ALA 209.A N ARG 205.A O ALA 209.A H 3.023 2.164 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.821 2.023 SER 211.A N SER 207.A O SER 211.A H 3.168 2.331 SER 211.A OG ALA 208.A O SER 211.A HG 2.979 2.165 GLU 212.A N ALA 208.A O GLU 212.A H 3.298 2.443 TYR 213.A N ALA 209.A O TYR 213.A H 3.024 2.186 ARG 214.A N ALA 210.A O ARG 214.A H 2.711 1.876 ARG 214.A NH2 VAL 231.A O ARG 214.A HH21 2.839 2.169 ALA 215.A N SER 211.A O ALA 215.A H 2.848 2.040 ALA 216.A N GLU 212.A O ALA 216.A H 3.235 2.377 LEU 217.A N TYR 213.A O LEU 217.A H 2.979 2.133 HIS 218.A N ARG 214.A O HIS 218.A H 3.166 2.351 ILE 219.A N ALA 215.A O ILE 219.A H 3.190 2.352 LEU 220.A N ALA 216.A O LEU 220.A H 2.941 2.185 THR 221.A N LEU 217.A O THR 221.A H 2.739 2.051 THR 221.A OG1 LEU 217.A O THR 221.A HG1 2.671 1.870 THR 226.A OG1 GLU 261.A OE2 THR 226.A HG1 2.633 1.833 TRP 227.A NE1 ASP 190.A O TRP 227.A HE1 2.847 2.000 VAL 232.A N ILE 192.A O VAL 232.A H 2.874 2.077 ILE 234.A N VAL 194.A O ILE 234.A H 2.764 1.992 SER 235.A N LYS 240.A O SER 235.A H 2.802 1.989 GLY 236.A N ASN 195.A OD1 GLY 236.A H 2.760 1.963 HIS 238.A N SER 235.A OG HIS 238.A H 3.121 2.284 LYS 240.A NZ ALA 197.A O LYS 240.A HZ3 2.729 1.911 LYS 240.A NZ ASP 199.A OD1 LYS 240.A HZ2 2.907 2.166 LYS 240.A NZ GLU 203.A OE1 LYS 240.A HZ1 3.133 2.460 LEU 245.A N GLY 241.A O LEU 245.A H 2.775 1.954 TRP 246.A N LEU 242.A O TRP 246.A H 3.000 2.239 SER 247.A N ASP 243.A O SER 247.A H 2.807 1.994 ARG 248.A N SER 244.A O ARG 248.A H 3.130 2.292 GLU 250.A N TRP 246.A O GLU 250.A H 2.901 2.101 ASP 251.A N SER 247.A O ASP 251.A H 2.907 2.112 HIS 252.A N ARG 248.A O HIS 252.A H 2.935 2.085 ARG 253.A N ILE 249.A O ARG 253.A H 3.088 2.277 SER 254.A N GLU 250.A O SER 254.A H 2.920 2.104 LYS 255.A N ASP 251.A O LYS 255.A H 2.849 1.998 LEU 256.A N HIS 252.A O LEU 256.A H 2.883 2.023 THR 257.A N ARG 253.A O THR 257.A H 2.956 2.209 THR 257.A OG1 ARG 253.A O THR 257.A HG1 2.562 1.782 ALA 258.A N SER 254.A O ALA 258.A H 3.236 2.466 ALA 258.A N LYS 255.A O ALA 258.A H 3.079 2.480 THR 259.A N LYS 255.A O THR 259.A H 3.328 2.561 THR 259.A OG1 GLU 261.A OE2 THR 259.A HG1 2.293 1.542 GLY 260.A N THR 257.A O GLY 260.A H 3.218 2.446 ILE 262.A N LEU 256.A O ILE 262.A H 3.109 2.323 GLY 264.A N GLY 260.A O GLY 264.A H 3.067 2.246 LYS 265.A N GLU 261.A O LYS 265.A H 3.105 2.269 LYS 265.A NZ ASP 164.A O LYS 265.A HZ2 2.961 2.201 ARG 266.A N ILE 262.A O ARG 266.A H 3.111 2.282 ARG 266.A NE ASP 164.A OD1 ARG 266.A HE 2.895 2.046 ARG 266.A NH1 GLY 47.A O ARG 266.A HH12 2.740 1.887 ARG 266.A NH2 ALA 49.A O ARG 266.A HH22 2.901 2.156 ARG 266.A NH2 ASP 164.A OD1 ARG 266.A HH21 3.481 2.819 ARG 266.A NH2 ASP 164.A OD2 ARG 266.A HH21 2.664 1.807 ARG 267.A N ALA 263.A O ARG 267.A H 3.117 2.312 ARG 267.A NE ASP 270.A OD2 ARG 267.A HE 3.359 2.543 ARG 267.A NH2 ASP 270.A OD2 ARG 267.A HH21 3.440 2.661 GLU 268.A N GLY 264.A O GLU 268.A H 3.291 2.491 GLN 269.A N LYS 265.A O GLN 269.A H 2.934 2.096 GLN 269.A NE2 THR 163.A O GLN 269.A HE22 2.749 1.894 ASP 270.A N ARG 266.A O ASP 270.A H 2.886 2.075 VAL 271.A N ARG 267.A O VAL 271.A H 3.365 2.523 LYS 272.A N GLU 268.A O LYS 272.A H.A 3.109 2.259 TRP 273.A N GLN 269.A O TRP 273.A H 2.823 2.042 TRP 273.A NE1 ASP 161.A O TRP 273.A HE1 2.929 2.167 MET 274.A N ASP 270.A O MET 274.A H 2.885 2.079 TRP 275.A N VAL 271.A O TRP 275.A H 2.932 2.111 ALA 276.A N LYS 272.A O ALA 276.A H 2.912 2.061 LEU 277.A N TRP 273.A O LEU 277.A H 2.974 2.151 VAL 278.A N MET 274.A O VAL 278.A H 3.055 2.225 HIS 279.A N TRP 275.A O HIS 279.A H 2.823 2.021 GLU 280.A N ALA 276.A O GLU 280.A H 2.806 2.062 ARG 281.A N LEU 277.A O ARG 281.A H 3.046 2.219 LEU 282.A N VAL 278.A O LEU 282.A H 3.250 2.433 HIS 283.A N HIS 279.A O HIS 283.A H 3.026 2.167 GLN 284.A N GLU 280.A O GLN 284.A H 2.892 2.085 GLN 284.A NE2 GLU 280.A OE2 GLN 284.A HE21 3.019 2.172 ARG 285.A N ARG 281.A O ARG 285.A H 3.109 2.266 LEU 286.A N HIS 283.A O LEU 286.A H 3.005 2.263 VAL 287.A N GLN 284.A O VAL 287.A H 2.887 2.062 ARG 293.A N SER 289.A O ARG 293.A H 3.013 2.161 GLN 294.A N ALA 290.A O GLN 294.A H 2.880 2.025 ALA 295.A N GLU 291.A O ALA 295.A H 3.058 2.237 THR 296.A N VAL 292.A O THR 296.A H 2.827 1.967 THR 296.A OG1 VAL 292.A O THR 296.A HG1 2.908 2.104 ALA 297.A N ARG 293.A O ALA 297.A H 2.849 2.016 GLU 298.A N GLN 294.A O GLU 298.A H 2.896 2.093 ALA 299.A N ALA 295.A O ALA 299.A H 2.893 2.039 GLU 300.A N THR 296.A O GLU 300.A H 2.958 2.129 ARG 301.A N ALA 297.A O ARG 301.A H.B 2.782 1.935 ALA 302.A N GLU 298.A O ALA 302.A H 2.929 2.153 VAL 303.A N ALA 299.A O VAL 303.A H 3.239 2.500 VAL 303.A N GLU 300.A O VAL 303.A H 3.009 2.402 ALA 304.A N GLU 300.A O ALA 304.A H 2.828 1.974 GLY 305.A N ARG 301.A O GLY 305.A H 2.871 2.247 GLY 306.A N VAL 303.A O GLY 306.A H 3.172 2.339 GLU 307.A N ALA 302.A O GLU 307.A H 2.951 2.125 HIS 308.A N ALA 302.A O HIS 308.A H 3.057 2.247 GLY 313.A N SER 309.A O GLY 313.A H 2.877 2.039 ALA 314.A N PRO 310.A O ALA 314.A H 2.863 2.047 ASP 315.A N ALA 311.A O ASP 315.A H 2.985 2.232 ALA 316.A N ALA 312.A O ALA 316.A H 3.049 2.212 ILE 317.A N GLY 313.A O ILE 317.A H 2.826 1.967 ALA 318.A N ALA 314.A O ALA 318.A H 2.893 2.163 THR 319.A N ASP 315.A O THR 319.A H 3.211 2.377 THR 319.A OG1 ASP 315.A O THR 319.A HG1 3.010 2.190 LEU 320.A N ALA 316.A O LEU 320.A H 3.336 2.507 ILE 321.A N ALA 318.A O ILE 321.A H 3.354 2.627 GLY 322.A N ALA 318.A O GLY 322.A H 3.197 2.567 GLY 322.A N THR 319.A O GLY 322.A H 2.956 2.291 LEU 323.A N ALA 318.A O LEU 323.A H 2.859 2.201