Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4k0a_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A N GLU 337.A OE1 LYS 3.A H 3.296 2.472 ALA 5.A N VAL 333.A O ALA 5.A H 3.015 2.208 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 2.838 2.161 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 3.142 2.429 CYS 11.A SG.B ASP 64.A OD2 no hydrogen 3.581 N/A ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.785 1.983 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 3.026 2.239 ALA 15.A N SER 13.A OG ALA 15.A H 3.169 2.362 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 3.149 2.317 ASP 19.A N LYS 16.A O ASP 19.A H 3.407 2.553 VAL 22.A N SER 93.A O VAL 22.A H 3.088 2.272 HIS 23.A N GLU 21.A OE1 HIS 23.A H 2.992 2.141 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE1 HIS 23.A HD1 2.756 1.949 ASN 24.A N GLU 21.A OE2 ASN 24.A H 2.782 2.000 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE2 ASN 24.A HD22 2.696 1.902 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 2.965 2.164 TRP 26.A N VAL 22.A O TRP 26.A H 3.008 2.162 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.991 2.144 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 2.965 2.294 THR 28.A N VAL 25.A O THR 28.A H 3.226 2.554 THR 28.A OG1 ASN 24.A O THR 28.A HG1 2.807 2.004 HIS 29.A N TRP 26.A O HIS 29.A H 3.291 2.562 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 3.008 2.281 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 2.840 2.032 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 2.940 2.125 THR 34.A N SER 13.A O THR 34.A H 3.079 2.463 ASN 37.A N ASP 35.A OD1 ASN 37.A H 3.108 2.409 VAL 41.A N THR 128.A O VAL 41.A H 3.013 2.198 LYS 42.A NZ GLU 44.A OE1 LYS 42.A HZ2 3.449 2.666 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 2.979 2.122 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 3.195 2.408 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 3.025 2.192 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 3.010 2.205 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 3.258 2.465 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.127 2.328 ASN 55.A ND2 LEU 328.A O ASN 55.A HD22 3.644 3.190 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.210 2.368 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 3.120 2.374 GLN 60.A N ASN 56.A O GLN 60.A H 3.010 2.220 GLN 60.A NE2 THR 7.A O GLN 60.A HE22 3.205 2.471 GLN 60.A NE2 ASN 56.A OD1 GLN 60.A HE21 3.100 2.480 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 2.996 2.174 HIS 62.A N VAL 58.A O HIS 62.A H 2.927 2.089 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 3.157 2.341 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.174 2.396 ILE 65.A N MET 61.A O ILE 65.A H 3.014 2.181 ILE 66.A N HIS 62.A O ILE 66.A H 3.099 2.291 SER 67.A N GLU 63.A O SER 67.A H 3.037 2.200 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.791 2.018 TRP 69.A N ILE 65.A O TRP 69.A H 2.931 2.092 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.848 2.032 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 3.151 2.462 SER 72.A N LEU 68.A O SER 72.A H 3.066 2.439 SER 72.A N TRP 69.A O SER 72.A H 3.133 2.459 SER 72.A OG LEU 68.A O SER 72.A HG 2.665 2.012 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.826 2.053 LYS 74.A NZ ASP 70.A O LYS 74.A HZ3 2.992 2.202 CYS 76.A N MET 281.A O CYS 76.A H 2.647 1.967 VAL 77.A N MET 281.A O VAL 77.A H 3.332 2.540 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 2.870 2.109 LEU 79.A N LYS 279.A O LEU 79.A H 2.840 2.001 THR 80.A N SER 83.A O THR 80.A H 3.043 2.198 SER 83.A N THR 80.A O SER 83.A H 2.866 2.043 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H.A 3.040 2.221 THR 86.A OG1.B CYS 76.A O THR 86.A HG1.B 2.974 2.199 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 3.169 2.386 GLN 87.A NE2 PRO 75.A O GLN 87.A HE21 3.169 2.369 LYS 91.A NZ GLU 242.A OE1 LYS 91.A HZ2 3.295 2.566 LYS 91.A NZ GLU 242.A OE2 LYS 91.A HZ2 3.181 2.398 LYS 91.A NZ ALA 283.A O LYS 91.A HZ1 2.847 2.085 LYS 91.A NZ PRO 284.A O LYS 91.A HZ1 3.132 2.502 GLU 95.A N GLU 21.A OE1 GLU 95.A H 2.819 1.959 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H 2.867 2.051 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.772 1.922 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 2.967 2.224 TYR 101.A N THR 132.A OG1 TYR 101.A H 2.948 2.090 TYR 101.A OH ASP 64.A OD2 TYR 101.A HH 3.318 2.541 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H 2.801 1.983 PHE 107.A N PRO 104.A O PHE 107.A H 3.237 2.434 ALA 108.A N VAL 334.A O ALA 108.A H 2.913 2.112 LEU 110.A N LYS 332.A O LEU 110.A H 2.870 2.046 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.657 1.853 CYS 112.A N LYS 330.A O CYS 112.A H 2.961 2.134 ASN 113.A N ASN 125.A O ASN 113.A H 3.024 2.235 ASN 113.A ND2 ASN 125.A O ASN 113.A HD22 2.940 2.129 ASN 113.A ND2 SER 127.A OG ASN 113.A HD21 3.233 2.376 LYS 115.A NZ ASN 113.A O LYS 115.A HZ2 3.445 2.658 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 2.988 2.161 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 3.164 2.478 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.736 2.041 CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.757 N/A THR 124.A N ASP 114.A OD2 THR 124.A H 3.181 2.353 ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 3.130 2.406 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 2.955 2.125 SER 127.A OG GLU 40.A OE2 SER 127.A HG 2.737 1.905 THR 128.A N VAL 41.A O THR 128.A H 2.816 1.997 THR 128.A OG1 ILE 109.A O THR 128.A HG1 3.308 2.609 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 2.921 2.103 GLN 130.A NE2.A GLN 39.A OE1.B GLN 130.A HE22.A 2.515 1.897 GLN 130.A NE2.B ALA 103.A O GLN 130.A HE22.B 3.077 2.589 GLN 130.A NE2.B GLN 130.A O GLN 130.A HE21.B 3.396 2.869 THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.882 2.067 THR 132.A OG1 HIS 133.A O THR 132.A HG1 3.129 2.344 HIS 133.A N TYR 331.A OH HIS 133.A H 3.166 2.357 HIS 133.A NE2 GLU 327.A OE1 HIS 133.A HE2 3.009 2.188 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 3.097 2.289 ARG 136.A NH1 PRO 96.A O ARG 136.A HH11 3.383 2.711 VAL 138.A N ARG 136.A O VAL 138.A H 2.790 2.104 THR 141.A N SER 236.A O THR 141.A H 3.103 2.357 THR 141.A OG1 GLU 231.A O THR 141.A HG1 2.613 1.791 GLN 142.A N GLY 316.A O GLN 142.A H 3.232 2.555 GLN 142.A NE2 ILE 232.A O GLN 142.A HE21 2.830 2.019 GLN 142.A NE2 VAL 233.A O GLN 142.A HE22 3.043 2.367 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.676 1.962 LEU 144.A N GLY 298.A O LEU 144.A H 2.841 1.992 ASN 146.A N ASN 295.A O ASN 146.A H 2.746 1.924 GLY 147.A N THR 297.A OG1 GLY 147.A H 3.111 2.369 SER 148.A N GLU 327.A OE2 SER 148.A H 2.728 1.901 SER 148.A OG.B GLU 327.A OE1 SER 148.A HG.B 2.918 2.308 SER 148.A OG.B GLU 327.A OE2 SER 148.A HG.B 3.259 2.429 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.808 1.991 VAL 155.A N GLN 171.A O VAL 155.A H 3.106 2.281 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.827 2.019 ARG 157.A NE PHE 117.A O ARG 157.A HE 2.867 2.139 ARG 157.A NH1 GLN 171.A OE1 ARG 157.A HH12 2.959 2.104 ARG 157.A NH2 PHE 117.A O ARG 157.A HH21 2.803 2.071 ARG 157.A NH2 GLN 171.A OE1 ARG 157.A HH22 3.557 2.883 ASN 160.A N SER 158.A OG ASN 160.A H 3.098 2.358 THR 162.A N ASN 160.A OD1 THR 162.A H 3.241 2.519 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 3.039 2.309 ASN 164.A ND2 ASP 304.A O ASN 164.A HD22 3.180 2.534 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 2.868 2.045 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 3.009 2.153 LYS 166.A NZ GLU 159.A OE1 LYS 166.A HZ2 3.404 2.529 ILE 168.A N LEU 301.A O ILE 168.A H 2.788 1.931 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.736 1.919 VAL 170.A N LEU 299.A O VAL 170.A H 2.825 1.965 GLN 171.A N VAL 155.A O GLN 171.A H 2.827 1.985 GLN 171.A NE2 SER 148.A O GLN 171.A HE21 3.398 2.601 GLN 171.A NE2 TYR 329.A OH GLN 171.A HE22 3.507 2.703 LEU 172.A N THR 297.A O LEU 172.A H 2.859 2.035 ASN 173.A ND2 GLU 152.A O ASN 173.A HD21 3.104 2.257 VAL 176.A N ILE 296.A O VAL 176.A H 3.131 2.325 ILE 178.A N SER 294.A O ILE 178.A H 2.849 2.022 ASN 179.A N ASN 193.A O ASN 179.A H 2.930 2.097 CYS 180.A N CYS 292.A O CYS 180.A H 3.070 2.222 THR 181.A N HIS 191.A O THR 181.A H 2.871 2.049 ARG 182.A N ILE 290.A O ARG 182.A H 2.806 2.006 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 2.998 2.298 ARG 182.A NH1 ILE 187.A O ARG 182.A HH11 2.665 1.869 ARG 182.A NH1 ILE 286.A O ARG 182.A HH12 3.228 2.607 ARG 182.A NH2 ILE 286.A O ARG 182.A HH22 2.572 1.733 ARG 182.A NH2 GLY 288.A O ARG 182.A HH21 2.661 1.817 ARG 188.A N ASP 186.A OD1 ARG 188.A H 3.399 2.574 ARG 188.A NH2 GLN 269.A OE1 ARG 188.A HH21 2.644 1.869 GLN 189.A N ASP 186.A O GLN 189.A H 3.184 2.366 ALA 190.A N CYS 265.A O ALA 190.A H 2.972 2.141 HIS 191.A N THR 181.A O HIS 191.A H 3.111 2.325 CYS 192.A N LEU 263.A O CYS 192.A H 2.838 2.040 ASN 193.A N ASN 179.A O ASN 193.A H 2.718 1.896 LEU 194.A N ILE 261.A O LEU 194.A H 3.053 2.297 LYS 196.A N ARG 259.A O LYS 196.A H 2.891 2.035 GLN 198.A N SER 195.A OG GLN 198.A H 3.344 2.501 TRP 199.A N SER 195.A O TRP 199.A H 3.175 2.349 TRP 199.A NE1 LEU 251.A O TRP 199.A HE1 2.776 1.918 GLU 200.A N LYS 196.A O GLU 200.A H 2.972 2.128 ASN 201.A N THR 197.A O ASN 201.A H 2.941 2.137 THR 202.A N GLN 198.A O THR 202.A H 2.945 2.213 LEU 203.A N TRP 199.A O LEU 203.A H 2.862 2.027 GLU 204.A N GLU 200.A O GLU 204.A H 3.080 2.335 GLN 205.A N ASN 201.A O GLN 205.A H 3.108 2.335 ILE 206.A N THR 202.A O ILE 206.A H 2.962 2.136 ALA 207.A N LEU 203.A O ALA 207.A H 3.063 2.262 ILE 208.A N GLU 204.A O ILE 208.A H 3.309 2.520 LYS 209.A N GLN 205.A O LYS 209.A H.B 3.259 2.437 LYS 209.A NZ.A GLU 153.A OE1 LYS 209.A HZ1.A 2.757 1.890 LYS 209.A NZ.B GLU 153.A OE1 LYS 209.A HZ1.B 3.303 2.664 LEU 210.A N ILE 206.A O LEU 210.A H 2.950 2.188 LYS 211.A N ALA 207.A O LYS 211.A H 2.919 2.128 LYS 211.A NZ ASN 216.A O LYS 211.A HZ1 3.046 2.383 GLU 212.A N ILE 208.A O GLU 212.A H 3.127 2.350 GLN 213.A N LEU 210.A O GLN 213.A H 3.089 2.470 PHE 214.A N LEU 210.A O PHE 214.A H 2.893 2.115 GLY 215.A N LYS 211.A O GLY 215.A H 2.808 2.021 LYS 218.A N GLY 215.A O LYS 218.A H 3.150 2.391 LYS 218.A NZ GLU 311.A OE2 LYS 218.A HZ2 3.500 2.795 ILE 221.A N GLU 311.A O ILE 221.A H 3.000 2.201 PHE 222.A N TRP 254.A O PHE 222.A H 2.963 2.113 ASN 223.A N PHE 313.A O ASN 223.A H 3.015 2.207 GLY 227.A N SER 225.A OG GLY 227.A H 3.211 2.440 GLU 231.A N GLU 231.A OE2 GLU 231.A H 2.704 1.962 ILE 232.A N ASP 229.A O ILE 232.A H 3.162 2.335 VAL 233.A N ASP 229.A O VAL 233.A H 3.193 2.385 THR 234.A N PRO 230.A O THR 234.A H 3.160 2.365 THR 234.A OG1 PRO 230.A O THR 234.A HG1 2.785 1.963 HIS 235.A N CYS 246.A O HIS 235.A H 2.919 2.155 HIS 235.A ND1 THR 141.A O HIS 235.A HD1 2.814 1.983 SER 236.A N THR 141.A OG1 SER 236.A H 2.994 2.159 SER 236.A OG PHE 244.A O SER 236.A HG 3.092 2.354 PHE 237.A N PHE 244.A O PHE 237.A H 3.244 2.465 CYS 239.A N GLU 242.A O CYS 239.A H 2.811 1.985 GLY 241.A N ASN 238.A OD1 GLY 241.A H 2.913 2.251 GLU 242.A N CYS 239.A O GLU 242.A H 2.978 2.143 PHE 244.A N PHE 237.A O PHE 244.A H 2.824 1.980 TYR 245.A N ARG 266.A O TYR 245.A H 2.746 1.953 TYR 245.A OH GLU 231.A OE1 TYR 245.A HH 2.621 1.810 CYS 246.A N HIS 235.A O CYS 246.A H 2.975 2.152 CYS 246.A SG.B ASN 247.A O no hydrogen 3.855 N/A ASN 247.A N PRO 264.A O ASN 247.A H 2.972 2.151 SER 248.A OG GLN 142.A OE1 SER 248.A HG 2.635 1.822 THR 249.A N ASN 247.A OD1 THR 249.A H 2.972 2.121 GLN 250.A NE2 THR 262.A O GLN 250.A HE22 2.935 2.117 LEU 251.A N SER 248.A O LEU 251.A H 3.054 2.412 PHE 252.A N THR 249.A O PHE 252.A H 3.133 2.376 THR 253.A OG1 THR 249.A O THR 253.A HG1 2.779 1.999 TRP 254.A N PHE 222.A O TRP 254.A H 3.134 2.313 ILE 261.A N LEU 194.A O ILE 261.A H 2.722 1.879 THR 262.A OG1 ASN 193.A OD1 THR 262.A HG1 2.740 1.908 LEU 263.A N CYS 192.A O LEU 263.A H 2.729 1.890 CYS 265.A N ALA 190.A O CYS 265.A H 2.815 1.977 CYS 265.A SG LEU 263.A O no hydrogen 3.991 N/A ARG 266.A N TYR 245.A O ARG 266.A H 2.853 2.041 ARG 266.A NH1 ASP 186.A OD1 ARG 266.A HH12 3.569 2.913 ARG 266.A NH1 ASP 186.A OD2 ARG 266.A HH12 3.542 2.753 ILE 267.A N ARG 188.A O ILE 267.A H 2.867 2.060 LYS 268.A N PHE 243.A O LYS 268.A H 3.150 2.347 GLN 269.A NE2 TYR 282.A O GLN 269.A HE21 2.687 1.840 ILE 271.A N ALA 280.A O ILE 271.A H 2.927 2.114 ASN 272.A N GLU 231.A OE1 ASN 272.A H 2.963 2.112 ASN 272.A ND2 GLU 231.A OE2 ASN 272.A HD22 2.955 2.101 MET 273.A N GLY 278.A O MET 273.A H 2.983 2.134 TRP 274.A N GLN 275.A OE1 TRP 274.A H 3.104 2.500 GLN 275.A N GLN 275.A OE1 GLN 275.A H 2.767 1.954 GLN 275.A NE2 ASP 70.A OD1 GLN 275.A HE21 3.296 2.545 LYS 279.A N LEU 79.A O LYS 279.A H 2.978 2.245 ALA 280.A N ILE 271.A O ALA 280.A H 2.963 2.186 MET 281.A N VAL 77.A O MET 281.A H 2.862 2.032 TYR 282.A N GLN 269.A O TYR 282.A H 2.960 2.153 ILE 286.A N GLU 242.A OE2 ILE 286.A H 3.316 2.583 ILE 290.A N ARG 182.A O ILE 290.A H 3.120 2.287 CYS 292.A N CYS 180.A O CYS 292.A H.B 3.116 2.331 SER 294.A N ILE 178.A O SER 294.A H 2.914 2.066 ASN 295.A N ASN 146.A OD1 ASN 295.A H 3.031 2.188 ILE 296.A N VAL 176.A O ILE 296.A H 2.937 2.087 THR 297.A N LEU 144.A O THR 297.A H 2.921 2.073 LEU 299.A N VAL 170.A O LEU 299.A H 3.019 2.268 LEU 300.A N GLN 142.A O LEU 300.A H 2.887 2.074 LEU 301.A N ILE 168.A O LEU 301.A H 2.837 1.984 THR 302.A N ARG 314.A O THR 302.A H 2.889 2.067 ARG 303.A NH1 GLU 311.A OE1 ARG 303.A HH11 3.039 2.223 ARG 303.A NH2 PHE 161.A O ARG 303.A HH21 3.218 2.477 ASP 304.A N ILE 312.A O ASP 304.A H 2.933 2.114 GLU 311.A N THR 219.A O GLU 311.A H 3.059 2.212 PHE 313.A N ILE 221.A O PHE 313.A H 2.800 1.966 ARG 314.A N THR 302.A O ARG 314.A H 2.849 2.013 ARG 314.A NE ASP 304.A OD1 ARG 314.A HE 2.804 2.046 ARG 314.A NE ASP 304.A OD2 ARG 314.A HE 3.152 2.414 ARG 314.A NH1 PRO 224.A O ARG 314.A HH11 2.847 2.059 ARG 314.A NH2 ASP 304.A OD2 ARG 314.A HH21 2.939 2.150 GLY 316.A N LEU 300.A O GLY 316.A H 2.662 1.817 ARG 321.A N ASP 319.A OD1 ARG 321.A H 3.005 2.158 ARG 321.A NH1 ASP 319.A OD1 ARG 321.A HH11 2.766 1.976 ASP 322.A N ASP 319.A O ASP 322.A H 3.114 2.285 ASN 323.A N MET 320.A O ASN 323.A H 3.077 2.469 ASN 323.A ND2 VAL 138.A O ASN 323.A HD22 3.614 2.849 ASN 323.A ND2 SER 140.A O ASN 323.A HD21 3.075 2.251 TRP 324.A N MET 320.A O TRP 324.A H 3.292 2.477 TRP 324.A NE1 HIS 62.A ND1 TRP 324.A HE1 3.084 2.275 ARG 325.A N ARG 321.A O ARG 325.A H 2.829 2.063 ARG 325.A NE ASP 322.A OD1 ARG 325.A HE 3.317 2.482 ARG 325.A NH1 MET 52.A O ARG 325.A HH11 2.873 2.024 SER 326.A N ASP 322.A O SER 326.A H 3.046 2.379 SER 326.A N ASN 323.A O SER 326.A H 3.120 2.427 SER 326.A OG ASN 323.A O SER 326.A HG 2.575 1.739 GLU 327.A N TRP 324.A O GLU 327.A H 3.187 2.367 LEU 328.A N TRP 324.A O LEU 328.A H 2.971 2.205 TYR 331.A N LEU 328.A O TYR 331.A H 3.038 2.192 TYR 331.A OH HIS 133.A ND1 TYR 331.A HH 3.054 2.222 LYS 332.A N LEU 110.A O LYS 332.A H 3.203 2.442 LYS 332.A NZ GLU 48.A OE2 LYS 332.A HZ3 2.834 1.971 LYS 332.A NZ ASN 49.A O LYS 332.A HZ2 2.739 1.932 VAL 334.A N ALA 108.A O VAL 334.A H 2.932 2.082 LYS 335.A N LYS 3.A O LYS 335.A H 2.995 2.184 ILE 336.A N GLY 106.A O ILE 336.A H 2.728 1.886