Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ka2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 5.A N VAL 333.A O ALA 5.A H 3.134 2.335 LEU 9.A N GLN 60.A OE1 LEU 9.A H 3.035 2.253 PHE 10.A N CYS 102.A O PHE 10.A H 3.168 2.367 CYS 11.A SG.A ALA 30.A O no hydrogen 3.297 N/A CYS 11.A SG.B ASP 64.A OD2 no hydrogen 3.322 N/A ALA 12.A N HIS 100.A O ALA 12.A H 2.902 2.115 SER 13.A N VAL 32.A O SER 13.A H 2.933 2.152 LYS 16.A N ASN 24.A OD1 LYS 16.A H 3.048 2.237 ASP 19.A N LYS 16.A O ASP 19.A H 3.344 2.495 GLU 21.A N ASP 19.A OD1 GLU 21.A H 3.006 2.175 VAL 22.A N SER 93.A O VAL 22.A H 3.005 2.248 HIS 23.A N GLU 21.A OE1 HIS 23.A H 2.980 2.121 HIS 23.A ND1 GLU 21.A OE1 HIS 23.A HD1 2.687 1.848 ASN 24.A N GLU 21.A OE2 ASN 24.A H 2.812 1.988 ASN 24.A ND2 GLU 21.A OE2 ASN 24.A HD22 2.903 2.087 VAL 25.A N GLU 21.A O VAL 25.A H 3.011 2.253 TRP 26.A N VAL 22.A O TRP 26.A H 3.014 2.167 TRP 26.A NE1 SER 67.A OG.A TRP 26.A HE1 2.957 2.326 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 2.939 2.083 THR 28.A N ASN 24.A O THR 28.A H 3.009 2.317 THR 28.A N VAL 25.A O THR 28.A H 3.129 2.471 HIS 29.A N TRP 26.A O HIS 29.A H 3.231 2.552 ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.909 2.112 CYS 31.A N ALA 27.A O CYS 31.A H 2.917 2.143 VAL 32.A N CYS 11.A O VAL 32.A H 2.818 1.994 THR 34.A N SER 13.A O THR 34.A H 2.980 2.293 ASN 37.A N ASP 35.A OD1 ASN 37.A H 3.046 2.194 VAL 41.A N THR 128.A O VAL 41.A H 2.899 2.111 LEU 43.A N VAL 126.A O LEU 43.A H 3.007 2.155 GLU 48.A N CYS 123.A O GLU 48.A H 3.080 2.290 PHE 50.A N GLY 121.A O PHE 50.A H 3.010 2.187 MET 52.A N GLY 119.A O MET 52.A H 2.878 2.085 TRP 53.A N ASN 51.A OD1 TRP 53.A H 3.130 2.341 LYS 54.A N ASN 51.A O LYS 54.A H 3.229 2.400 MET 57.A N ASN 55.A OD1 MET 57.A H 3.154 2.331 VAL 58.A N ASN 55.A O VAL 58.A H 2.961 2.207 GLN 60.A N ASN 56.A O GLN 60.A H 3.016 2.192 GLN 60.A NE2 THR 7.A O GLN 60.A HE21 2.564 1.748 GLN 60.A NE2 ASN 56.A OD1 GLN 60.A HE22 2.892 2.089 MET 61.A N MET 57.A O MET 61.A H 2.948 2.105 HIS 62.A N VAL 58.A O HIS 62.A H 2.925 2.130 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H.A 3.059 2.230 ASP 64.A N GLN 60.A O ASP 64.A H 3.099 2.258 ILE 65.A N MET 61.A O ILE 65.A H 2.962 2.133 ILE 66.A N HIS 62.A O ILE 66.A H 2.994 2.151 SER 67.A N GLU 63.A O SER 67.A H.C 3.058 2.256 LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.930 2.113 TRP 69.A N ILE 65.A O TRP 69.A H 2.939 2.089 ASP 70.A N ILE 66.A O ASP 70.A H 2.753 1.909 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 2.930 2.151 GLN 71.A NE2 SER 67.A OG.C GLN 71.A HE21 2.811 2.189 SER 72.A N TRP 69.A O SER 72.A H 3.098 2.359 SER 72.A OG LEU 68.A O SER 72.A HG 2.477 1.883 LEU 73.A N TRP 69.A O LEU 73.A H 2.819 1.961 LYS 74.A NZ ASP 70.A O LYS 74.A HZ3 3.382 2.597 CYS 76.A N MET 282.A O CYS 76.A H 2.724 2.048 CYS 76.A SG.B MET 282.A O no hydrogen 2.972 N/A VAL 77.A N MET 282.A O VAL 77.A H 3.379 2.581 LYS 78.A N ILE 85.A O LYS 78.A H 2.788 1.993 LEU 79.A N LYS 280.A O LEU 79.A H 2.850 2.009 THR 80.A N SER 83.A O THR 80.A H 3.049 2.219 SER 83.A N THR 80.A O SER 83.A H 2.946 2.107 SER 83.A OG GLY 81.A O SER 83.A HG 3.527 2.694 ILE 85.A N LYS 78.A O ILE 85.A H.B 2.990 2.178 GLN 87.A N CYS 76.A O GLN 87.A H 3.141 2.383 GLN 87.A NE2 PRO 75.A O GLN 87.A HE22 3.052 2.247 CYS 89.A SG.B LYS 74.A O no hydrogen 2.955 N/A LYS 91.A NZ GLU 243.A OE1 LYS 91.A HZ1 3.520 2.634 LYS 91.A NZ GLU 243.A OE2 LYS 91.A HZ1 3.252 2.599 LYS 91.A NZ ALA 284.A O LYS 91.A HZ3 2.895 2.240 LYS 91.A NZ PRO 285.A O LYS 91.A HZ3 3.111 2.463 GLU 95.A N GLU 21.A OE1 GLU 95.A H.A 2.821 1.967 ILE 99.A N ILE 135.A O ILE 99.A H.A 2.965 2.124 HIS 100.A N ALA 12.A O HIS 100.A H 2.859 2.003 HIS 100.A ND1 THR 132.A O HIS 100.A HD1 2.926 2.190 TYR 101.A N THR 132.A OG1 TYR 101.A H 2.923 2.069 CYS 102.A N PHE 10.A O CYS 102.A H.A 2.853 2.092 CYS 102.A SG.B PHE 10.A O no hydrogen 3.515 N/A CYS 102.A SG.B HIS 100.A O no hydrogen 3.812 N/A ALA 103.A N GLN 130.A O ALA 103.A H 3.293 2.508 PHE 107.A N PRO 104.A O PHE 107.A H 3.053 2.286 ALA 108.A N VAL 334.A O ALA 108.A H 2.876 2.050 LEU 110.A N LYS 332.A O LEU 110.A H 2.774 1.946 LYS 111.A N SER 127.A O LYS 111.A H 2.754 1.968 CYS 112.A N LYS 330.A O CYS 112.A H 2.870 2.039 ASN 113.A N ASN 125.A O ASN 113.A H 2.804 1.972 ASN 113.A ND2 ASN 125.A O ASN 113.A HD21 3.232 2.545 ASN 113.A ND2 SER 127.A OG ASN 113.A HD22 3.123 2.268 THR 120.A N ASN 118.A OD1 THR 120.A H 3.105 2.254 GLY 121.A N PHE 50.A O GLY 121.A H 3.047 2.234 CYS 123.A N GLU 48.A O CYS 123.A H 2.796 2.014 CYS 123.A SG ASP 114.A OD1 no hydrogen 3.152 N/A CYS 123.A SG ASN 125.A O no hydrogen 3.666 N/A THR 124.A N ASP 114.A OD2 THR 124.A H 2.958 2.127 ASN 125.A N ASP 114.A OD1 ASN 125.A H 2.839 2.125 SER 127.A N LYS 111.A O SER 127.A H 2.928 2.106 THR 128.A N VAL 41.A O THR 128.A H 2.878 2.078 VAL 129.A N ILE 109.A O VAL 129.A H 3.035 2.221 CYS 131.A SG.B THR 132.A O no hydrogen 3.403 N/A THR 132.A N TYR 101.A O THR 132.A H 2.789 1.988 THR 132.A OG1 HIS 133.A O THR 132.A HG1 2.906 2.140 HIS 133.A N TYR 331.A OH HIS 133.A H 3.073 2.243 HIS 133.A ND1 TYR 331.A OH HIS 133.A HD1 2.771 1.930 HIS 133.A NE2 GLU 327.A OE1 HIS 133.A HE2 3.056 2.234 ILE 135.A N ILE 99.A O ILE 135.A H 2.866 2.012 VAL 138.A N ARG 136.A O VAL 138.A H 2.829 2.164 SER 140.A OG LEU 143.A O SER 140.A HG 2.750 2.250 THR 141.A N SER 237.A O THR 141.A H 3.032 2.246 THR 141.A OG1 GLU 232.A O THR 141.A HG1 2.785 1.977 GLN 142.A N GLY 316.A O GLN 142.A H 3.004 2.341 GLN 142.A NE2 ILE 233.A O GLN 142.A HE21 2.876 2.085 GLN 142.A NE2 VAL 234.A O GLN 142.A HE22 3.128 2.455 LEU 143.A N THR 141.A O LEU 143.A H 2.751 2.012 LEU 144.A N GLY 299.A O LEU 144.A H 2.848 2.002 ASN 146.A N ASN 296.A O ASN 146.A H 2.835 1.993 GLY 147.A N THR 298.A OG1 GLY 147.A H 3.090 2.338 SER 148.A N GLU 327.A OE2 SER 148.A H.A 2.712 1.903 ALA 150.A N LEU 172.A O ALA 150.A H 2.927 2.122 VAL 155.A N GLN 171.A O VAL 155.A H 3.046 2.229 ARG 157.A N ILE 169.A O ARG 157.A H 2.944 2.231 ARG 157.A NE PHE 117.A O ARG 157.A HE 2.851 2.098 ARG 157.A NH1 GLN 171.A OE1 ARG 157.A HH12 3.002 2.145 ARG 157.A NH2 PHE 117.A O ARG 157.A HH21 2.835 2.096 ASN 160.A N SER 158.A OG ASN 160.A H 2.931 2.172 THR 162.A N ASN 160.A OD1 THR 162.A H.A 3.077 2.456 THR 162.A OG1.A ASN 160.A OD1 THR 162.A HG1.A 2.542 1.862 ASN 163.A N ASN 160.A O ASN 163.A H 3.033 2.266 ALA 165.A N ASN 163.A OD1 ALA 165.A H 2.939 2.127 LYS 166.A N ASN 163.A O LYS 166.A H 3.109 2.260 LYS 166.A NZ GLU 159.A OE1 LYS 166.A HZ3 3.103 2.226 ILE 168.A N LEU 302.A O ILE 168.A H 2.912 2.060 ILE 169.A N ARG 157.A O ILE 169.A H 2.833 1.995 VAL 170.A N LEU 300.A O VAL 170.A H 2.857 2.000 GLN 171.A N VAL 155.A O GLN 171.A H 2.842 1.982 GLN 171.A NE2 SER 148.A O GLN 171.A HE21 3.301 2.539 LEU 172.A N THR 298.A O LEU 172.A H 2.942 2.115 SER 175.A OG ASN 296.A OD1 SER 175.A HG 3.479 2.873 VAL 176.A N ILE 297.A O VAL 176.A H 3.050 2.267 ILE 178.A N SER 295.A O ILE 178.A H 2.738 1.906 ASN 179.A N ASN 194.A O ASN 179.A H 3.014 2.168 CYS 180.A N CYS 293.A O CYS 180.A H 2.901 2.054 THR 181.A N HIS 192.A O THR 181.A H 2.825 2.023 ARG 182.A N ILE 291.A O ARG 182.A H 2.889 2.126 ARG 182.A NE ARG 182.A O ARG 182.A HE 3.165 2.491 ARG 182.A NH1 ILE 188.A O ARG 182.A HH11 2.757 1.950 ARG 182.A NH1 ILE 287.A O ARG 182.A HH12 3.368 2.768 ARG 182.A NH2 ILE 287.A O ARG 182.A HH22 2.635 1.812 ARG 182.A NH2 GLY 289.A O ARG 182.A HH21 2.752 1.893 ARG 189.A N ASP 187.A OD1 ARG 189.A H 3.113 2.267 ARG 189.A NE GLN 270.A OE1 ARG 189.A HE 3.287 2.608 ARG 189.A NH2 GLN 270.A OE1 ARG 189.A HH21 2.789 1.990 GLN 190.A N ASP 187.A O GLN 190.A H 3.122 2.270 ALA 191.A N CYS 266.A O ALA 191.A H 3.056 2.240 HIS 192.A N THR 181.A O HIS 192.A H 2.975 2.177 CYS 193.A N LEU 264.A O CYS 193.A H 2.861 2.066 ASN 194.A N ASN 179.A O ASN 194.A H 2.824 2.013 LEU 195.A N ILE 262.A O LEU 195.A H 3.048 2.267 LYS 197.A N ARG 260.A O LYS 197.A H 2.977 2.119 GLN 199.A N SER 196.A OG GLN 199.A H 3.045 2.190 TRP 200.A N SER 196.A O TRP 200.A H 3.025 2.199 TRP 200.A NE1 LEU 252.A O TRP 200.A HE1 2.873 2.023 GLU 201.A N LYS 197.A O GLU 201.A H 2.926 2.072 ASN 202.A N THR 198.A O ASN 202.A H 2.961 2.115 THR 203.A N GLN 199.A O THR 203.A H 3.008 2.334 THR 203.A N TRP 200.A O THR 203.A H 2.930 2.304 LEU 204.A N TRP 200.A O LEU 204.A H 2.905 2.071 GLU 205.A N GLU 201.A O GLU 205.A H 2.973 2.163 GLN 206.A N ASN 202.A O GLN 206.A H 3.166 2.362 ILE 207.A N THR 203.A O ILE 207.A H 2.929 2.111 ALA 208.A N LEU 204.A O ALA 208.A H 2.949 2.110 ILE 209.A N GLU 205.A O ILE 209.A H 3.100 2.309 LYS 210.A N GLN 206.A O LYS 210.A H 3.304 2.501 LYS 210.A NZ GLU 153.A OE1 LYS 210.A HZ3 2.880 2.163 LYS 210.A NZ GLU 213.A OE1 LYS 210.A HZ1 3.293 2.486 LYS 210.A NZ GLU 213.A OE2 LYS 210.A HZ1 3.240 2.476 LEU 211.A N ILE 207.A O LEU 211.A H 2.829 2.051 LYS 212.A N ALA 208.A O LYS 212.A H 2.847 2.009 LYS 212.A NZ ASN 217.A O LYS 212.A HZ3 2.718 1.999 GLU 213.A N ILE 209.A O GLU 213.A H 2.983 2.178 GLN 214.A N LYS 210.A O GLN 214.A H 3.148 2.345 PHE 215.A N LEU 211.A O PHE 215.A H 2.862 2.115 GLY 216.A N LYS 212.A O GLY 216.A H 2.771 1.933 LYS 219.A N GLY 216.A O LYS 219.A H 3.052 2.214 THR 220.A N GLY 309.A O THR 220.A H.B 3.286 2.462 ILE 222.A N GLU 311.A O ILE 222.A H 2.806 1.949 PHE 223.A N TRP 255.A O PHE 223.A H 2.986 2.158 ASN 224.A N PHE 313.A O ASN 224.A H 2.966 2.163 GLY 228.A N SER 226.A OG GLY 228.A H 3.028 2.200 GLU 232.A N GLU 232.A OE2 GLU 232.A H 2.754 1.980 ILE 233.A N ASP 230.A O ILE 233.A H 2.949 2.135 VAL 234.A N ASP 230.A O VAL 234.A H 3.116 2.328 THR 235.A N PRO 231.A O THR 235.A H 2.988 2.153 HIS 236.A N CYS 247.A O HIS 236.A H 2.881 2.092 HIS 236.A ND1 THR 141.A O HIS 236.A HD1 2.765 1.942 SER 237.A N THR 141.A OG1 SER 237.A H 3.060 2.210 SER 237.A OG THR 141.A OG1 SER 237.A HG 3.188 2.399 SER 237.A OG GLU 232.A O SER 237.A HG 2.895 2.308 PHE 238.A N PHE 245.A O PHE 238.A H 3.190 2.440 CYS 240.A N GLU 243.A O CYS 240.A H 3.067 2.247 GLY 242.A N ASN 239.A OD1 GLY 242.A H 2.773 2.068 GLU 243.A N CYS 240.A O GLU 243.A H 3.093 2.238 PHE 245.A N PHE 238.A O PHE 245.A H 2.939 2.133 TYR 246.A N ARG 267.A O TYR 246.A H 2.806 1.987 TYR 246.A OH GLU 232.A OE1 TYR 246.A HH 2.668 1.857 CYS 247.A N HIS 236.A O CYS 247.A H.A 2.920 2.096 CYS 247.A SG.B PRO 265.A O no hydrogen 3.907 N/A ASN 248.A N PRO 265.A O ASN 248.A H 2.900 2.053 SER 249.A OG GLN 142.A OE1 SER 249.A HG 2.618 1.807 THR 250.A N ASN 248.A OD1 THR 250.A H 3.112 2.264 GLN 251.A NE2 THR 263.A O GLN 251.A HE21 2.794 1.973 LEU 252.A N SER 249.A O LEU 252.A H 2.801 2.132 PHE 253.A N THR 250.A O PHE 253.A H 3.204 2.414 TRP 255.A N PHE 223.A O TRP 255.A H 3.140 2.301 ASN 261.A ND2 LEU 195.A O ASN 261.A HD21 3.300 2.482 ILE 262.A N LEU 195.A O ILE 262.A H 2.847 2.067 LEU 264.A N CYS 193.A O LEU 264.A H 2.678 1.848 CYS 266.A N ALA 191.A O CYS 266.A H.A 2.911 2.093 CYS 266.A SG.A LEU 264.A O no hydrogen 3.814 N/A ARG 267.A N TYR 246.A O ARG 267.A H 2.861 2.043 ARG 267.A NH1 ASP 187.A OD2 ARG 267.A HH12 3.047 2.215 ARG 267.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 267.A HH22 3.548 2.867 ILE 268.A N ARG 189.A O ILE 268.A H 2.866 2.052 LYS 269.A N PHE 244.A O LYS 269.A H 2.950 2.145 GLN 270.A NE2 TYR 283.A O GLN 270.A HE22 2.798 1.944 ILE 272.A N ALA 281.A O ILE 272.A H 2.901 2.072 ASN 273.A N GLU 232.A OE1 ASN 273.A H 3.019 2.200 ASN 273.A ND2 GLU 232.A OE2 ASN 273.A HD21 2.974 2.116 MET 274.A N GLY 279.A O MET 274.A H 2.879 2.038 GLN 276.A N GLN 276.A OE1 GLN 276.A H 2.954 2.206 GLN 276.A NE2 ASP 70.A OD1 GLN 276.A HE21 2.824 2.092 LYS 280.A N LEU 79.A O LYS 280.A H 3.033 2.242 LYS 280.A NZ ASN 273.A OD1 LYS 280.A HZ2 3.364 2.526 ALA 281.A N ILE 272.A O ALA 281.A H 2.867 2.061 MET 282.A N VAL 77.A O MET 282.A H.B 2.924 2.089 TYR 283.A N GLN 270.A O TYR 283.A H 2.883 2.053 ILE 287.A N GLU 243.A OE2 ILE 287.A H 3.275 2.485 ILE 291.A N ARG 182.A O ILE 291.A H 3.078 2.233 CYS 293.A N CYS 180.A O CYS 293.A H 3.027 2.225 SER 295.A N ILE 178.A O SER 295.A H 2.891 2.053 ASN 296.A N ASN 146.A OD1 ASN 296.A H 3.121 2.304 ILE 297.A N VAL 176.A O ILE 297.A H 2.773 1.917 THR 298.A N LEU 144.A O THR 298.A H 2.950 2.111 GLY 299.A N LEU 144.A O GLY 299.A H 3.349 2.617 LEU 300.A N VAL 170.A O LEU 300.A H 2.976 2.211 LEU 301.A N GLN 142.A O LEU 301.A H 2.918 2.080 LEU 302.A N ILE 168.A O LEU 302.A H 2.965 2.124 THR 303.A N ARG 314.A O THR 303.A H 2.932 2.107 ARG 304.A NH1 GLU 311.A OE1 ARG 304.A HH11 3.165 2.316 ARG 304.A NH2 PHE 161.A O ARG 304.A HH21 3.149 2.468 ASP 305.A N ILE 312.A O ASP 305.A H 3.095 2.276 THR 310.A OG1 THR 220.A OG1.A THR 310.A HG1 3.119 2.330 GLU 311.A N THR 220.A O GLU 311.A H 3.006 2.170 PHE 313.A N ILE 222.A O PHE 313.A H 2.687 1.888 ARG 314.A N THR 303.A O ARG 314.A H 2.896 2.082 ARG 314.A NE ASP 305.A OD1 ARG 314.A HE 2.865 2.035 ARG 314.A NE ASP 305.A OD2 ARG 314.A HE 3.379 2.653 ARG 314.A NH1 PRO 225.A O ARG 314.A HH11 3.016 2.202 ARG 314.A NH2 ASP 305.A OD2 ARG 314.A HH21 2.983 2.150 GLY 316.A N LEU 301.A O GLY 316.A H 2.717 1.925 ARG 321.A N ASP 319.A OD1 ARG 321.A H 3.114 2.268 ARG 321.A NE GLU 59.A OE1 ARG 321.A HE 3.181 2.439 ARG 321.A NH1 ASP 319.A OD1 ARG 321.A HH11 2.819 2.042 ASP 322.A N ASP 319.A O ASP 322.A H 3.231 2.451 ASN 323.A ND2 VAL 138.A O ASN 323.A HD21 3.477 2.694 ASN 323.A ND2 SER 140.A O ASN 323.A HD22 3.259 2.456 TRP 324.A N MET 320.A O TRP 324.A H 3.157 2.382 ARG 325.A N ARG 321.A O ARG 325.A H 2.770 1.913 ARG 325.A NE ASP 322.A OD1 ARG 325.A HE 3.079 2.248 ARG 325.A NH1 MET 52.A O ARG 325.A HH11 2.881 2.048 SER 326.A N ASP 322.A O SER 326.A H 3.039 2.361 SER 326.A N ASN 323.A O SER 326.A H 3.146 2.462 GLU 327.A N TRP 324.A O GLU 327.A H 3.033 2.231 LEU 328.A N TRP 324.A O LEU 328.A H 2.870 2.093 TYR 331.A N LEU 328.A O TYR 331.A H 2.989 2.141 LYS 332.A N LEU 110.A O LYS 332.A H 3.104 2.302 LYS 332.A NZ GLU 48.A OE2 LYS 332.A HZ1 2.556 1.697 LYS 332.A NZ ASN 49.A O LYS 332.A HZ3 2.886 2.146 VAL 334.A N ALA 108.A O VAL 334.A H 2.912 2.077 LYS 335.A N LYS 3.A O LYS 335.A H 2.926 2.095 ILE 336.A N GLY 106.A O ILE 336.A H 2.968 2.132