Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4kaf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 9.A N PHE 7.A O PHE 9.A H 2.885 2.159 HIS 12.A N TYR 22.A O HIS 12.A H 3.212 2.449 VAL 16.A N GLU 19.A O VAL 16.A H 2.643 1.792 GLU 19.A N VAL 16.A O GLU 19.A H 2.866 2.016 ARG 20.A N ASP 70.A OD2 ARG 20.A H 2.877 2.031 HIS 21.A N SER 69.A OG HIS 21.A H 2.907 2.120 HIS 21.A ND1 ASP 63.A OD2 HIS 21.A HD1 2.854 2.102 TYR 22.A N HIS 12.A O TYR 22.A H 2.936 2.141 VAL 23.A N ALA 61.A O VAL 23.A H 2.988 2.173 VAL 25.A N CYS 59.A O VAL 25.A H 3.067 2.252 THR 31.A OG1 GLU 95.A OE2 THR 31.A HG1 2.762 1.913 VAL 33.A N ARG 58.A O VAL 33.A H 2.841 2.012 LEU 34.A N VAL 97.A O LEU 34.A H 2.821 1.983 PHE 35.A N ILE 60.A O PHE 35.A H 2.844 1.999 LEU 36.A N VAL 99.A O LEU 36.A H 2.922 2.126 HIS 37.A ND1 GLY 38.A O HIS 37.A HD1 2.871 2.052 ASN 39.A N ASP 102.A OD2 ASN 39.A H 2.836 1.997 ASN 39.A ND2 LEU 195.A O ASN 39.A HD21 3.390 2.605 THR 41.A N GLY 38.A O THR 41.A H 3.037 2.246 SER 43.A N ASP 63.A OD1 SER 43.A H 2.853 1.996 SER 43.A OG ASP 63.A OD1 SER 43.A HG 2.767 2.014 TYR 44.A N SER 42.A OG TYR 44.A H 3.049 2.224 TYR 44.A OH THR 5.A O TYR 44.A HH 2.705 1.904 VAL 45.A N SER 42.A O VAL 45.A H 2.990 2.146 TRP 46.A N SER 43.A O TRP 46.A H 2.949 2.123 ARG 47.A N TYR 44.A O ARG 47.A H 3.122 2.271 ARG 47.A NE GLY 4.A O ARG 47.A HE 2.907 2.244 ARG 47.A NH1 TYR 44.A O ARG 47.A HH11 2.939 2.104 ARG 47.A NH1 GLU 268.A OE1 ARG 47.A HH12 3.472 2.859 ARG 47.A NH1 GLU 268.A OE2 ARG 47.A HH12 2.813 1.987 ARG 47.A NH2 GLY 4.A O ARG 47.A HH21 3.251 2.630 ARG 47.A NH2 GLU 268.A OE1 ARG 47.A HH22 2.836 2.054 ARG 47.A NH2 GLU 268.A OE2 ARG 47.A HH22 3.376 2.720 ASN 48.A ND2 GLY 4.A O ASN 48.A HD21 2.881 2.025 ILE 49.A N TRP 46.A O ILE 49.A H 2.978 2.200 ILE 50.A N TRP 46.A O ILE 50.A H 2.992 2.138 HIS 52.A N ILE 49.A O HIS 52.A H 3.013 2.228 HIS 52.A NE2 ASP 272.A OD1 HIS 52.A HE2 2.889 2.090 VAL 53.A N ILE 50.A O VAL 53.A H 2.873 2.058 ALA 54.A N ILE 50.A O ALA 54.A H 2.888 2.047 THR 56.A N VAL 53.A O THR 56.A H 3.096 2.273 HIS 57.A N VAL 53.A O HIS 57.A H 2.987 2.219 ARG 58.A NE ASP 24.A OD1 ARG 58.A HE 2.802 1.944 ARG 58.A NH2 ASP 24.A OD2 ARG 58.A HH21 2.902 2.082 CYS 59.A N VAL 25.A O CYS 59.A H 2.810 1.982 CYS 59.A SG HIS 57.A O CYS 59.A HG 3.553 2.404 ILE 60.A N VAL 33.A O ILE 60.A H 2.897 2.055 ALA 61.A N VAL 23.A O ALA 61.A H 2.936 2.132 ASP 63.A N HIS 21.A O ASP 63.A H 2.860 2.012 GLY 66.A N ASP 70.A O GLY 66.A H 2.889 2.093 LYS 68.A N ASP 63.A OD2 LYS 68.A H 2.849 1.995 SER 69.A OG ASP 63.A O SER 69.A HG 2.716 1.959 ASP 70.A N ARG 20.A O ASP 70.A H 2.858 2.006 LYS 71.A NZ PRO 185.A O LYS 71.A HZ2 2.854 2.257 LEU 74.A N PRO 72.A O LEU 74.A H 2.967 2.334 TYR 76.A OH PRO 72.A O TYR 76.A HH 2.637 1.993 PHE 77.A N ASP 80.A OD2 PHE 77.A H 3.051 2.417 PHE 78.A N GLU 201.A OE2 PHE 78.A H 2.807 1.977 ASP 80.A N PHE 77.A O ASP 80.A H 2.862 2.225 HIS 81.A N PHE 77.A O HIS 81.A H 3.312 2.512 VAL 82.A N PHE 78.A O VAL 82.A H 2.847 2.015 ARG 83.A N ASP 79.A O ARG 83.A H 3.051 2.219 ARG 83.A NH1 ASP 80.A OD1 ARG 83.A HH12 2.842 2.001 ARG 83.A NH2 ASP 80.A OD1 ARG 83.A HH22 3.519 2.887 PHE 84.A N ASP 80.A O PHE 84.A H 3.059 2.219 ASP 85.A N VAL 82.A O ASP 85.A H 2.885 2.033 ALA 86.A N ARG 83.A O ALA 86.A H 3.096 2.267 PHE 87.A N PHE 84.A O PHE 87.A H 2.831 2.044 GLU 89.A N ASP 85.A O GLU 89.A H 3.169 2.342 ALA 90.A N ALA 86.A O ALA 90.A H 2.845 2.058 LEU 91.A N PHE 87.A O LEU 91.A H 3.088 2.329 GLY 92.A N GLU 89.A O GLY 92.A H 2.894 2.097 LEU 93.A N ILE 88.A O LEU 93.A H 3.251 2.398 GLU 95.A N GLU 95.A OE1 GLU 95.A H 2.760 1.964 VAL 96.A N ARG 118.A O VAL 96.A H 2.908 2.115 VAL 97.A N PRO 32.A O VAL 97.A H 3.014 2.165 LEU 98.A N GLY 121.A O LEU 98.A H 2.956 2.122 VAL 99.A N LEU 34.A O VAL 99.A H 2.869 2.035 ILE 100.A N ALA 123.A O ILE 100.A H 2.872 2.096 HIS 101.A N LEU 36.A O HIS 101.A H 3.226 2.524 HIS 101.A NE2 ASN 264.A O HIS 101.A HE2 2.759 2.073 ASP 102.A N GLU 125.A O ASP 102.A H 2.929 2.224 SER 105.A N HIS 101.A O SER 105.A H 3.254 2.590 SER 105.A N ASP 102.A O SER 105.A H 2.820 2.120 SER 105.A OG ASP 102.A O SER 105.A HG 2.592 1.750 LEU 107.A N TRP 103.A O LEU 107.A H 3.131 2.295 GLY 108.A N GLY 104.A O GLY 108.A H 2.847 2.041 PHE 109.A N SER 105.A O PHE 109.A H 2.830 1.971 HIS 110.A N ALA 106.A O HIS 110.A H 3.016 2.175 TRP 111.A N LEU 107.A O TRP 111.A H 2.957 2.131 ALA 112.A N GLY 108.A O ALA 112.A H 2.850 2.026 LYS 113.A N PHE 109.A O LYS 113.A H 2.949 2.112 ARG 114.A N HIS 110.A O ARG 114.A H 3.316 2.534 ARG 114.A NE HIS 110.A O ARG 114.A HE 2.978 2.206 ARG 114.A NH1 ASP 85.A OD2 ARG 114.A HH12 2.840 1.996 ARG 114.A NH2 ASP 85.A OD1 ARG 114.A HH22 2.898 2.084 ARG 114.A NH2 ASP 85.A OD2 ARG 114.A HH22 3.489 2.842 ASN 115.A N ALA 112.A O ASN 115.A H 3.033 2.265 ASN 115.A ND2 TRP 111.A O ASN 115.A HD22 2.977 2.144 ARG 118.A N ASN 115.A O ARG 118.A H 2.989 2.166 ARG 118.A NE GLU 94.A O ARG 118.A HE 2.893 2.036 ARG 118.A NH1 GLU 89.A OE2 ARG 118.A HH12 3.142 2.412 ARG 118.A NH1 ASN 115.A OD1 ARG 118.A HH11 3.022 2.359 ARG 118.A NH2 GLU 89.A OE2 ARG 118.A HH22 2.899 2.089 ARG 118.A NH2 LEU 93.A O ARG 118.A HH21 2.799 2.134 LYS 120.A N VAL 96.A O LYS 120.A H 2.917 2.090 ILE 122.A N PRO 227.A O ILE 122.A H 2.915 2.099 ALA 123.A N LEU 98.A O ALA 123.A H 2.830 1.993 PHE 124.A N LEU 229.A O PHE 124.A H 2.828 2.039 ILE 127.A N.A SER 105.A OG ILE 127.A H.A 3.085 2.311 ILE 127.A N.B SER 105.A OG ILE 127.A H.B 3.065 2.273 ARG 128.A NE LEU 238.A O ARG 128.A HE 3.004 2.171 ARG 128.A NH2 LEU 238.A O ARG 128.A HH21 3.305 2.579 ILE 130.A N PRO 203.A O ILE 130.A H 2.901 2.077 ASP 134.A N THR 132.A OG1 ASP 134.A H 3.184 2.536 GLU 135.A N THR 132.A O GLU 135.A H 3.129 2.284 TRP 136.A N TRP 133.A O TRP 136.A H 3.175 2.361 ALA 140.A N PRO 137.A O ALA 140.A H 2.977 2.156 ARG 141.A N GLU 138.A O ARG 141.A H 3.339 2.495 ARG 141.A NE TRP 133.A O ARG 141.A HE 3.028 2.379 ARG 141.A NE TRP 136.A O ARG 141.A HE 3.370 2.746 ARG 141.A NH2 TRP 136.A O ARG 141.A HH21 2.881 2.146 PHE 144.A N ALA 140.A O PHE 144.A H 3.055 2.221 GLN 145.A N ARG 141.A O GLN 145.A H 2.972 2.138 ALA 146.A N GLU 142.A O ALA 146.A H 2.918 2.116 PHE 147.A N THR 143.A O PHE 147.A H 2.843 2.029 ARG 148.A N PHE 144.A O ARG 148.A H 3.207 2.519 ARG 148.A N GLN 145.A O ARG 148.A H 3.250 2.575 ARG 148.A NH1 LEU 202.A O ARG 148.A HH12 3.528 2.976 ARG 148.A NH1 GLU 207.A O ARG 148.A HH12 2.924 2.110 ARG 148.A NH2 PRO 199.A O ARG 148.A HH21 2.867 2.056 ARG 148.A NH2 LEU 202.A O ARG 148.A HH22 2.807 2.063 THR 149.A N ALA 146.A O THR 149.A H 2.945 2.103 THR 149.A OG1 GLN 145.A O THR 149.A HG1 2.699 1.861 VAL 152.A N THR 150.A O VAL 152.A H 2.836 2.089 GLY 153.A N THR 149.A O GLY 153.A H 3.026 2.168 ARG 154.A NH1 GLU 193.A OE1 ARG 154.A HH12 3.333 2.649 ARG 154.A NH1 GLU 193.A OE2 ARG 154.A HH12 2.943 2.104 ARG 154.A NH2 GLU 193.A OE1 ARG 154.A HH22 2.894 2.072 LYS 155.A N ASP 151.A O LYS 155.A H 3.087 2.248 LEU 156.A N VAL 152.A O LEU 156.A H 3.042 2.221 ILE 157.A N GLY 153.A O ILE 157.A H 2.918 2.073 ILE 158.A N ARG 154.A O ILE 158.A H 2.769 2.019 ASP 159.A N ARG 154.A O ASP 159.A H 3.125 2.340 GLN 160.A N LYS 155.A O GLN 160.A H 3.026 2.372 VAL 162.A N LEU 156.A O VAL 162.A H 2.969 2.112 ILE 164.A N ASN 161.A O ILE 164.A H 3.148 2.483 GLU 165.A N ASN 161.A O GLU 165.A H 2.950 2.107 GLY 166.A N VAL 162.A O GLY 166.A H 2.831 2.098 THR 167.A N VAL 162.A O THR 167.A H 2.944 2.135 LEU 168.A N PHE 163.A O LEU 168.A H 2.885 2.157 GLY 170.A N LEU 168.A O GLY 170.A H 2.946 2.142 VAL 171.A N PRO 169.A O VAL 171.A H 3.186 2.338 VAL 172.A N ASP 269.A OD2 VAL 172.A H 2.828 1.977 ARG 173.A N ASP 269.A OD1 ARG 173.A H 2.942 2.096 ARG 173.A NE GLU 268.A O ARG 173.A HE 2.682 1.826 ARG 173.A NH1 PRO 174.A O ARG 173.A HH11 3.364 2.761 ARG 173.A NH1 GLU 179.A OE1 ARG 173.A HH12 2.854 2.019 ARG 173.A NH1 GLU 179.A OE2 ARG 173.A HH12 3.567 2.954 ARG 173.A NH2 GLU 179.A OE1 ARG 173.A HH22 3.396 2.725 ARG 173.A NH2 GLU 179.A OE2 ARG 173.A HH22 2.933 2.156 ARG 173.A NH2 GLU 268.A O ARG 173.A HH21 3.473 2.853 THR 176.A N GLU 179.A OE1 THR 176.A H 2.860 2.011 GLU 179.A N THR 176.A OG1 GLU 179.A H 3.233 2.399 ASP 180.A N GLU 177.A O ASP 180.A H 2.853 2.033 HIS 181.A N VAL 178.A O HIS 181.A H 3.092 2.285 TYR 182.A N GLU 179.A O TYR 182.A H 3.083 2.256 TYR 182.A OH GLU 268.A OE2 TYR 182.A HH 2.628 1.820 ARG 183.A NE GLU 165.A OE2 ARG 183.A HE 2.919 2.192 ARG 183.A NH1 GLU 177.A OE1 ARG 183.A HH12 3.036 2.221 ARG 183.A NH1 ASP 180.A OD1 ARG 183.A HH11 2.855 2.062 ARG 183.A NH2 GLU 165.A OE1 ARG 183.A HH21 2.913 2.057 ARG 183.A NH2 GLU 165.A OE2 ARG 183.A HH21 3.545 2.959 GLU 184.A N ASP 180.A O GLU 184.A H 3.140 2.550 GLU 184.A N HIS 181.A O GLU 184.A H 3.367 2.583 PHE 186.A N ARG 183.A O PHE 186.A H 2.979 2.123 VAL 190.A N ASN 188.A OD1 VAL 190.A H 3.203 2.382 ASP 191.A N ASN 188.A O ASP 191.A H 2.930 2.157 ARG 192.A N PRO 189.A O ARG 192.A H 2.937 2.105 ARG 192.A NE PHE 186.A O ARG 192.A HE 2.858 2.060 ARG 192.A NH1 ILE 158.A O ARG 192.A HH11 2.803 2.004 ARG 192.A NH2 PHE 186.A O ARG 192.A HH21 2.975 2.233 LEU 195.A N ARG 192.A O LEU 195.A H 2.939 2.283 TRP 196.A N GLU 193.A O TRP 196.A H 3.090 2.392 ARG 197.A N GLU 193.A O ARG 197.A H 2.922 2.089 PHE 198.A N PRO 194.A O PHE 198.A H 3.094 2.260 ASN 200.A ND2 PHE 147.A O ASN 200.A HD21 3.038 2.256 ASN 200.A ND2 TRP 196.A O ASN 200.A HD22 2.908 2.052 GLU 201.A N PHE 198.A O GLU 201.A H 2.897 2.084 LEU 202.A N PRO 199.A O LEU 202.A H 3.419 2.604 ILE 204.A N GLU 207.A O ILE 204.A H 3.139 2.302 ALA 205.A N ILE 130.A O ALA 205.A H 2.752 1.924 GLU 207.A N ILE 204.A O GLU 207.A H 3.140 2.300 ILE 211.A N PRO 208.A O ILE 211.A H 3.133 2.535 VAL 212.A N PRO 208.A O VAL 212.A H 3.057 2.213 ALA 213.A N ALA 209.A O ALA 213.A H 2.987 2.175 LEU 214.A N ASN 210.A O LEU 214.A H 3.114 2.292 VAL 215.A N ILE 211.A O VAL 215.A H 2.856 2.011 GLU 216.A N VAL 212.A O GLU 216.A H 2.874 2.022 GLU 217.A N ALA 213.A O GLU 217.A H 2.937 2.157 TYR 218.A N LEU 214.A O TYR 218.A H 3.058 2.267 TYR 218.A OH ILE 127.A O.A TYR 218.A HH 2.679 1.890 TYR 218.A OH ILE 127.A O.B TYR 218.A HH 2.817 2.009 ASP 219.A N GLU 216.A O ASP 219.A H 2.873 2.043 TRP 220.A N GLU 217.A O TRP 220.A H 2.963 2.160 LEU 221.A N TYR 218.A O LEU 221.A H 2.877 2.076 GLN 223.A N.A TRP 220.A O GLN 223.A H.A 3.020 2.238 GLN 223.A N.B ASP 219.A O GLN 223.A H.B 3.195 2.529 GLN 223.A N.B TRP 220.A O GLN 223.A H.B 3.101 2.389 GLN 223.A NE2.B TRP 220.A O GLN 223.A HE21.B 3.026 2.191 SER 224.A N LEU 221.A O SER 224.A H.A 3.387 2.537 VAL 226.A N SER 224.A OG VAL 226.A H 3.050 2.194 LYS 228.A N ASN 253.A O LYS 228.A H 2.927 2.140 LYS 228.A NZ SER 224.A O LYS 228.A HZ1 2.745 1.908 LYS 228.A NZ VAL 226.A O LYS 228.A HZ2 2.780 1.899 LYS 228.A NZ PRO 252.A O LYS 228.A HZ3 2.742 1.891 LEU 229.A N ILE 122.A O LEU 229.A H 2.895 2.108 LEU 230.A N LYS 255.A O LEU 230.A H 2.817 1.976 PHE 231.A N PHE 124.A O PHE 231.A H 2.946 2.128 TRP 232.A N VAL 257.A O TRP 232.A H 3.038 2.240 THR 234.A N GLY 260.A O THR 234.A H 3.119 2.345 GLY 236.A N GLY 262.A O GLY 236.A H 2.934 2.086 VAL 237.A N GLU 125.A OE2 VAL 237.A H 3.023 2.188 LEU 238.A N GLU 125.A OE1 LEU 238.A H 2.771 1.915 ILE 239.A N GLU 125.A OE2 ILE 239.A H 3.156 2.425 GLU 243.A N PRO 240.A O GLU 243.A H 2.954 2.343 ALA 244.A N PRO 240.A O ALA 244.A H 3.051 2.225 ALA 245.A N PRO 241.A O ALA 245.A H 3.002 2.162 ARG 246.A N ALA 242.A O ARG 246.A H 3.052 2.259 ARG 246.A NE GLU 243.A OE1 ARG 246.A HE 3.249 2.409 ARG 246.A NH2 GLU 243.A OE2 ARG 246.A HH21 2.617 1.873 LEU 247.A N GLU 243.A O LEU 247.A H 2.981 2.144 ALA 248.A N ALA 244.A O ALA 248.A H 3.015 2.210 LYS 249.A N ARG 246.A O LYS 249.A H 3.123 2.408 SER 250.A N ARG 246.A O SER 250.A H 2.916 2.145 LEU 251.A N LEU 247.A O LEU 251.A H 2.810 1.952 ASN 253.A ND2 PRO 225.A O ASN 253.A HD22 3.037 2.178 LYS 255.A N LYS 228.A O LYS 255.A H 3.021 2.183 VAL 257.A N LEU 230.A O VAL 257.A H 2.767 1.951 ILE 259.A N TRP 232.A O ILE 259.A H 2.817 1.972 GLY 260.A N ASP 258.A OD1 GLY 260.A H 3.002 2.154 GLY 262.A N THR 234.A O GLY 262.A H 3.026 2.201 ASN 264.A N GLY 170.A O ASN 264.A H 3.001 2.227 ASN 264.A ND2 ASP 102.A OD1 ASN 264.A HD21 3.452 2.713 ASN 264.A ND2 GLU 125.A OE1 ASN 264.A HD22 3.027 2.224 LEU 265.A N GLY 170.A O LEU 265.A H 2.923 2.098 LEU 266.A N ASN 264.A O LEU 266.A H 2.951 2.298 GLN 267.A N GLN 267.A OE1 GLN 267.A H 2.729 1.891 GLU 268.A N LEU 265.A O GLU 268.A H 2.882 2.070 ASP 269.A N LEU 266.A O ASP 269.A H 3.016 2.258 ASN 270.A N LEU 266.A O ASN 270.A H 3.090 2.280 ASN 270.A ND2 ILE 259.A O ASN 270.A HD22 2.958 2.100 LEU 273.A N ASN 270.A OD1 LEU 273.A H 3.249 2.421 ILE 274.A N ASN 270.A O ILE 274.A H 3.133 2.280 GLY 275.A N PRO 271.A O GLY 275.A H 2.801 1.949 SER 276.A N ASP 272.A O SER 276.A H 2.938 2.119 SER 276.A OG ASP 272.A O SER 276.A HG 2.887 2.229 SER 276.A OG LEU 273.A O SER 276.A HG 3.361 2.685 GLU 277.A N LEU 273.A O GLU 277.A H 2.904 2.061 ILE 278.A N ILE 274.A O ILE 278.A H 2.936 2.090 ALA 279.A N GLY 275.A O ALA 279.A H 2.969 2.136 ARG 280.A N SER 276.A O ARG 280.A H 2.964 2.146 ARG 280.A NH2 GLU 277.A OE1 ARG 280.A HH21 2.628 1.847 ARG 280.A NH2 GLU 277.A OE2 ARG 280.A HH21 3.323 2.558 TRP 281.A N GLU 277.A O TRP 281.A H 2.892 2.045 LEU 282.A N ILE 278.A O LEU 282.A H 2.866 2.024 SER 283.A N ALA 279.A O SER 283.A H.B 3.246 2.503 SER 283.A N ARG 280.A O SER 283.A H.B 3.170 2.537 SER 283.A OG.A ALA 279.A O SER 283.A HG.A 3.335 2.550 SER 283.A OG.B ARG 280.A O SER 283.A HG.B 2.670 1.831 THR 284.A N TRP 281.A O THR 284.A H 2.953 2.143 THR 284.A OG1 TRP 281.A O THR 284.A HG1 2.635 1.813 LEU 285.A N LEU 282.A O LEU 285.A H 3.192 2.360 SER 288.A N THR 31.A OG1 SER 288.A H 3.036 2.188