Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4kcd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 3.A N ASN 82.A O LEU 3.A H 3.403 2.617 HIS 4.A ND1 ASP 84.A OD1 no hydrogen 2.977 N/A HIS 4.A NE2 ASP 86.A OD2 no hydrogen 2.992 N/A LEU 5.A N ASP 84.A O LEU 5.A H 2.942 2.135 ARG 6.A N ASN 116.A OD1 ARG 6.A H 2.795 1.945 ARG 6.A NE THR 114.A O ARG 6.A HE 2.864 2.081 ARG 6.A NH1 ASP 45.A OD1 ARG 6.A HH12 2.855 2.035 ARG 6.A NH2 ASP 45.A OD1 ARG 6.A HH22 3.279 2.588 ARG 6.A NH2 THR 114.A O ARG 6.A HH21 2.919 2.176 VAL 7.A N ASP 86.A O VAL 7.A H 2.795 1.948 VAL 8.A N MET 117.A O VAL 8.A H 2.905 2.077 THR 9.A N TYR 88.A O THR 9.A H 2.906 2.129 THR 9.A OG1 VAL 119.A O THR 9.A HG1 2.725 1.946 GLU 12.A N VAL 16.A O GLU 12.A H 2.904 2.180 PHE 15.A N GLU 12.A O PHE 15.A H 2.851 2.210 VAL 16.A N GLU 12.A O VAL 16.A H 2.929 2.097 PHE 17.A N TYR 67.A O PHE 17.A H 2.761 1.938 ARG 19.A N CYS 65.A O ARG 19.A H 2.815 2.014 ARG 19.A NH1 ALA 29.A O ARG 19.A HH12 3.191 2.389 ASP 22.A N LEU 26.A O ASP 22.A H 2.992 2.152 GLU 24.A N ASP 22.A OD1 GLU 24.A H 2.685 2.043 GLY 25.A N ASP 22.A O GLY 25.A H 2.867 2.038 LEU 26.A N ASP 22.A OD1 LEU 26.A H 2.828 1.979 CYS 27.A SG LYS 64.A O no hydrogen 3.802 N/A GLY 30.A N CYS 27.A O GLY 30.A H 3.073 2.352 GLN 31.A N CYS 66.A O GLN 31.A H 2.826 2.015 GLN 31.A NE2 GLU 75.A OE2 GLN 31.A HE21 2.939 2.089 CYS 33.A N LYS 64.A O CYS 33.A H 2.963 2.137 CYS 33.A SG GLN 31.A O no hydrogen 3.987 N/A CYS 33.A SG LYS 64.A O no hydrogen 3.754 N/A LEU 34.A N LEU 87.A O LEU 34.A H 2.996 2.210 ASP 35.A N PHE 62.A O ASP 35.A H 2.753 2.015 ASP 40.A N THR 38.A OG1 ASP 40.A H 3.105 2.273 SER 42.A N ASP 40.A OD1 SER 42.A H.A 2.886 2.296 MET 43.A N ASP 40.A OD1 MET 43.A H 3.180 2.409 LEU 44.A N ASP 40.A O LEU 44.A H 3.057 2.222 ASP 45.A N SER 41.A O ASP 45.A H 2.832 2.002 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 3.087 2.276 ARG 46.A NH2 SER 42.A OG.B ARG 46.A HH22 3.189 2.617 LEU 47.A N MET 43.A O LEU 47.A H 2.972 2.137 PHE 48.A N LEU 44.A O PHE 48.A H 2.926 2.070 SER 49.A N ASP 45.A O SER 49.A H 2.875 2.047 SER 50.A N.A ARG 46.A O SER 50.A H.A 2.983 2.146 SER 50.A N.B ARG 46.A O SER 50.A H.B 2.989 2.157 SER 50.A OG.B ASN 55.A O SER 50.A HG.B 3.281 2.694 LEU 51.A N LEU 47.A O LEU 51.A H.A 2.864 2.032 HIS 52.A N PHE 48.A O HIS 52.A H 3.067 2.247 HIS 52.A NE2 ASP 86.A OD1 no hydrogen 2.681 N/A SER 53.A N SER 50.A O.A SER 53.A H 2.930 2.091 SER 53.A N SER 50.A O.B SER 53.A H 3.042 2.207 THR 57.A N SER 50.A OG.B THR 57.A H 2.988 2.138 THR 57.A OG1 SER 50.A OG.B THR 57.A HG1 3.213 2.472 VAL 58.A N ASP 56.A OD1 VAL 58.A H 3.014 2.202 PHE 62.A N PRO 59.A O PHE 62.A H 2.899 2.069 LYS 63.A N ILE 60.A O LYS 63.A H 3.097 2.263 LYS 64.A N CYS 33.A O LYS 64.A H 2.951 2.122 CYS 65.A N ARG 19.A O CYS 65.A H 2.822 1.973 CYS 65.A SG GLU 20.A O no hydrogen 3.782 N/A CYS 65.A SG LEU 26.A O no hydrogen 3.722 N/A CYS 66.A N GLN 31.A O CYS 66.A H 2.762 1.908 TYR 67.A N PHE 17.A O TYR 67.A H 2.977 2.192 TYR 69.A N PRO 14.A O TYR 69.A H 3.018 2.168 CYS 70.A N PHE 15.A O CYS 70.A H 2.834 2.019 ASP 72.A N GLY 68.A O ASP 72.A H 2.939 2.095 LEU 73.A N TYR 69.A O LEU 73.A H 3.024 2.214 LEU 74.A N CYS 70.A O LEU 74.A H 2.862 2.026 GLU 75.A N ILE 71.A O GLU 75.A H 2.910 2.091 GLN 76.A N ASP 72.A O GLN 76.A H 3.151 2.354 GLN 76.A NE2 ASP 80.A OD1 GLN 76.A HE21 3.450 2.870 GLN 76.A NE2 ASP 80.A OD2 GLN 76.A HE21 2.987 2.128 LEU 77.A N LEU 73.A O LEU 77.A H 2.973 2.138 ALA 78.A N LEU 74.A O ALA 78.A H 2.871 2.023 GLU 79.A N GLU 75.A O GLU 79.A H 3.062 2.251 ASP 80.A N GLN 76.A O ASP 80.A H 2.915 2.108 MET 81.A N LEU 77.A O MET 81.A H 2.709 1.908 ASN 82.A ND2 ASN 1.A OD1 ASN 82.A HD22 3.426 2.647 PHE 83.A N ALA 78.A O PHE 83.A H 3.074 2.281 ASP 84.A N LEU 3.A O ASP 84.A H 2.988 2.235 ASP 86.A N LEU 5.A O ASP 86.A H 2.965 2.187 TYR 88.A N VAL 7.A O TYR 88.A H 3.051 2.246 ILE 89.A N LEU 34.A O ILE 89.A H 2.884 2.099 VAL 90.A N THR 9.A O VAL 90.A H 2.896 2.047 GLY 93.A N VAL 90.A O GLY 93.A H 3.340 2.542 LYS 94.A N ASP 92.A OD1 LYS 94.A H 3.008 2.195 LYS 94.A NZ ASP 92.A O LYS 94.A HZ3 3.239 2.395 ALA 97.A N THR 104.A OG1 ALA 97.A H 2.949 2.164 LYS 99.A N HIS 102.A O LYS 99.A H 2.810 1.966 LYS 99.A NZ GLU 176.A OE2.B LYS 99.A HZ2 2.660 1.971 HIS 102.A N LYS 99.A O HIS 102.A H 3.218 2.421 THR 104.A N ALA 97.A O THR 104.A H 2.931 2.094 GLY 105.A N ASP 92.A OD2 GLY 105.A H 2.910 2.128 LEU 106.A N LYS 94.A O LEU 106.A H 3.089 2.419 LEU 106.A N TYR 95.A O LEU 106.A H 3.146 2.562 VAL 107.A N TYR 95.A O VAL 107.A H 3.299 2.523 GLY 108.A N THR 104.A O GLY 108.A H 3.016 2.194 ASP 109.A N GLY 105.A O ASP 109.A H 3.112 2.317 LEU 110.A N LEU 106.A O LEU 110.A H 2.992 2.199 LEU 111.A N VAL 107.A O LEU 111.A H 2.945 2.115 SER 112.A N GLY 108.A O SER 112.A H 2.985 2.253 GLY 113.A N LEU 110.A O GLY 113.A H 3.307 2.471 THR 114.A N ASP 109.A O THR 114.A H 2.959 2.266 THR 114.A OG1 SER 112.A OG THR 114.A HG1 2.675 2.049 ALA 115.A N ASP 109.A O ALA 115.A H 3.236 2.486 ASN 116.A N ARG 6.A O ASN 116.A H 2.809 1.996 ALA 118.A N GLY 253.A O ALA 118.A H 2.797 1.987 VAL 119.A N VAL 8.A O VAL 119.A H 2.968 2.181 THR 120.A OG1 LEU 10.A O THR 120.A HG1 2.763 2.265 PHE 122.A N THR 120.A O PHE 122.A H 2.870 2.241 SER 123.A OG.B SER 178.A OG.B SER 123.A HG.B 2.701 1.960 ILE 124.A N GLY 249.A O ILE 124.A H 2.970 2.134 ARG 128.A N ASN 125.A OD1 ARG 128.A H 2.819 1.963 ARG 128.A NE GLY 96.A O ARG 128.A HE 2.977 2.181 ARG 128.A NH1 SER 123.A O ARG 128.A HH11 3.031 2.270 ARG 128.A NH2 GLY 96.A O ARG 128.A HH21 2.991 2.221 SER 129.A N ASN 125.A O SER 129.A H.B 2.945 2.141 GLN 130.A N THR 126.A O GLN 130.A H 3.078 2.411 VAL 131.A N ARG 128.A O VAL 131.A H 3.000 2.172 ILE 132.A N ARG 128.A O ILE 132.A H 2.982 2.168 ASP 133.A N LEU 254.A O ASP 133.A H 2.938 2.212 THR 135.A N ILE 252.A O THR 135.A H 2.969 2.159 THR 135.A OG1 SER 136.A O THR 135.A HG1 2.843 2.067 SER 136.A N SER 265.A OG SER 136.A H.A 3.009 2.208 PHE 138.A N TYR 250.A O PHE 138.A H 2.791 2.098 THR 141.A N GLU 248.A O THR 141.A H 2.793 1.938 LEU 143.A N PHE 245.A O LEU 143.A H 2.900 2.158 LEU 143.A N ALA 246.A O LEU 143.A H 3.190 2.533 GLY 144.A N MET 221.A O GLY 144.A H 2.865 2.076 LEU 146.A N PHE 219.A O LEU 146.A H 2.795 1.939 VAL 147.A N LEU 239.A O VAL 147.A H 2.888 2.040 ARG 148.A NH1 LEU 209.A O ARG 148.A HH11 2.784 1.933 ARG 148.A NH1 ASN 211.A O ARG 148.A HH12 2.818 2.111 ARG 148.A NH1 ASP 212.A OD1 ARG 148.A HH12 3.383 2.750 ARG 148.A NH2 ASP 212.A OD1 ARG 148.A HH22 2.894 2.121 THR 149.A N LYS 237.A O THR 149.A H.B 2.834 1.998 GLY 151.A N ARG 148.A O GLY 151.A H 2.975 2.215 SER 155.A N ASP 159.A OD2 SER 155.A H 2.872 2.084 ASP 159.A N GLY 156.A O ASP 159.A H 3.162 2.307 LYS 161.A N ASP 159.A OD1 LYS 161.A H 2.956 2.103 LEU 162.A N ASP 159.A O LEU 162.A H 2.906 2.067 HIS 163.A N PRO 160.A O HIS 163.A H 3.185 2.535 HIS 163.A NE2 ILE 157.A O no hydrogen 2.590 N/A HIS 164.A N.A PRO 160.A O HIS 164.A H.A 3.030 2.205 HIS 164.A N.B PRO 160.A O HIS 164.A H.B 3.079 2.221 PHE 169.A N SER 166.A O PHE 169.A H 3.007 2.153 ARG 170.A N.A ASP 217.A OD2 ARG 170.A H.A 2.907 2.055 ARG 170.A N.B ASP 217.A OD2 ARG 170.A H.B 2.899 2.041 ARG 170.A NE.A ASP 217.A OD2 ARG 170.A HE.A 3.106 2.248 ARG 170.A NH1.A GLU 214.A O ARG 170.A HH12.A 3.084 2.498 ARG 170.A NH1.B LYS 215.A O ARG 170.A HH11.B 3.250 2.533 ARG 170.A NH2.A GLU 214.A O ARG 170.A HH22.A 2.939 2.319 ARG 170.A NH2.A ASP 217.A OD1 ARG 170.A HH21.A 2.817 1.968 GLY 172.A N ALA 218.A O GLY 172.A H 3.219 2.444 THR 173.A N ASN 198.A OD1 THR 173.A H 2.817 2.021 THR 173.A OG1 ILE 220.A O THR 173.A HG1 2.715 1.993 ARG 175.A N VAL 199.A O ARG 175.A H 2.926 2.103 GLU 176.A N GLU 180.A OE2 GLU 176.A H.A 2.736 1.877 SER 177.A N VAL 174.A O SER 177.A H 3.024 2.238 SER 177.A OG THR 173.A OG1 SER 177.A HG 2.746 1.981 SER 178.A OG.A ASP 222.A OD1 SER 178.A HG.A 2.665 2.003 GLU 180.A N SER 177.A OG GLU 180.A H 2.951 2.116 ASP 181.A N SER 177.A O ASP 181.A H 2.989 2.159 TYR 182.A N SER 178.A O TYR 182.A H 2.966 2.164 VAL 183.A N ALA 179.A O VAL 183.A H 2.904 2.063 ARG 184.A N GLU 180.A O ARG 184.A H 2.874 2.028 ARG 184.A NH1 ASP 181.A OD1 ARG 184.A HH12 2.859 2.047 GLN 185.A N.A ASP 181.A O GLN 185.A H.A 3.315 2.529 GLN 185.A N.B ASP 181.A O GLN 185.A H.B 3.291 2.495 SER 186.A N TYR 182.A O SER 186.A H.A 2.852 2.016 PHE 187.A N VAL 183.A O PHE 187.A H 2.773 1.953 HIS 191.A N PHE 187.A O HIS 191.A H 2.932 2.126 HIS 191.A ND1 GLU 192.A OE2.B no hydrogen 2.978 N/A HIS 191.A NE2 GLU 180.A OE1 no hydrogen 2.796 N/A GLU 192.A N PRO 188.A O GLU 192.A H.B 3.145 2.333 TYR 193.A N GLU 189.A O TYR 193.A H 3.059 2.246 MET 194.A N MET 190.A O MET 194.A H 3.027 2.240 ARG 195.A N GLU 192.A O ARG 195.A H 3.224 2.418 ARG 195.A NH1 GLU 192.A OE2.A ARG 195.A HH11 3.415 2.721 TYR 197.A N MET 194.A O TYR 197.A H 2.849 2.040 VAL 199.A N THR 173.A O VAL 199.A H 2.910 2.116 ALA 201.A N ASP 204.A OD2 ALA 201.A H 3.136 2.531 THR 202.A OG1 GLU 12.A OE1 THR 202.A HG1 2.687 1.948 ASP 204.A N ALA 201.A O ASP 204.A H 2.899 2.176 VAL 206.A N THR 202.A O VAL 206.A H 3.242 2.392 GLN 207.A N PRO 203.A O GLN 207.A H 2.893 2.052 TYR 208.A N ASP 204.A O TYR 208.A H 2.933 2.117 LEU 209.A N GLY 205.A O LEU 209.A H 3.081 2.253 LYS 210.A N VAL 206.A O LYS 210.A H.A 3.039 2.315 LYS 210.A N GLN 207.A O LYS 210.A H.A 3.078 2.483 ASN 211.A N TYR 208.A O ASN 211.A H 3.324 2.513 ASN 211.A ND2 GLN 207.A O ASN 211.A HD21 2.826 2.005 GLU 214.A N GLU 214.A OE1.B GLU 214.A H.B 2.621 1.821 LYS 215.A N TYR 208.A O LYS 215.A H 2.849 2.003 ASP 217.A N ARG 170.A O.A ASP 217.A H 2.751 1.942 ASP 217.A N ARG 170.A O.B ASP 217.A H 2.839 2.057 ALA 218.A N ARG 170.A O.A ALA 218.A H 3.165 2.431 ALA 218.A N ARG 170.A O.B ALA 218.A H 3.112 2.427 PHE 219.A N LEU 146.A O PHE 219.A H 2.947 2.223 ILE 220.A N GLY 172.A O ILE 220.A H 2.969 2.148 MET 221.A N GLY 144.A O MET 221.A H 3.256 2.517 LYS 223.A N SER 142.A O LYS 223.A H 2.710 1.860 LYS 223.A NZ ASP 227.A OD1 LYS 223.A HZ3 2.847 2.031 LYS 223.A NZ ASP 227.A OD2 LYS 223.A HZ3 3.002 2.321 ALA 224.A N THR 141.A OG1 ALA 224.A H 3.106 2.491 LEU 225.A N ASP 222.A O LEU 225.A H 3.024 2.304 LEU 226.A N ASP 222.A O LEU 226.A H 3.090 2.247 ASP 227.A N LYS 223.A O ASP 227.A H 2.782 1.941 GLU 229.A N LEU 225.A O GLU 229.A H 3.091 2.295 VAL 230.A N LEU 226.A O VAL 230.A H 2.940 2.156 SER 231.A N ASP 227.A O SER 231.A H 2.916 2.185 SER 231.A OG TYR 228.A O SER 231.A HG 2.746 2.299 ILE 232.A N TYR 228.A O ILE 232.A H 3.188 2.513 ASP 233.A N VAL 230.A O ASP 233.A H 3.383 2.574 ASP 235.A N ASP 233.A OD1 ASP 235.A H 2.926 2.304 CYS 236.A N ASP 233.A O CYS 236.A H 3.203 2.350 LYS 237.A N ASP 233.A OD1 LYS 237.A H 2.983 2.159 LYS 237.A NZ LYS 210.A O LYS 237.A HZ1 2.769 2.152 LYS 237.A NZ ASP 212.A OD1 LYS 237.A HZ2 3.424 2.579 LEU 239.A N VAL 147.A O LEU 239.A H 3.023 2.213 VAL 241.A N ILE 145.A O VAL 241.A H 2.984 2.206 LYS 243.A N SER 155.A O LYS 243.A H 3.232 2.445 GLU 248.A N THR 141.A O GLU 248.A H 2.964 2.111 TYR 250.A N PHE 139.A O TYR 250.A H 2.838 2.021 GLY 251.A N PHE 122.A O GLY 251.A H 3.035 2.241 ILE 252.A N THR 135.A OG1 ILE 252.A H 2.961 2.158 GLY 253.A N ALA 118.A O GLY 253.A H 3.085 2.256 LEU 254.A N ASP 133.A O LEU 254.A H 2.915 2.085 ASN 257.A N ASP 133.A OD1 ASN 257.A H 2.963 2.172 SER 258.A N ASP 133.A OD2 SER 258.A H 3.153 2.464 LEU 260.A N SER 258.A OG LEU 260.A H 2.985 2.152 THR 261.A N SER 258.A O THR 261.A H 3.448 2.608 THR 261.A OG1 ASP 133.A OD2 THR 261.A HG1 2.712 1.937 SER 262.A OG ASN 263.A OD1.A SER 262.A HG 3.288 2.574 ILE 264.A N LEU 260.A O ILE 264.A H 3.083 2.260 SER 265.A N THR 261.A O SER 265.A H 2.994 2.147 GLU 266.A N SER 262.A O GLU 266.A H 2.990 2.182 LEU 267.A N ASN 263.A O LEU 267.A H 3.061 2.239 ILE 268.A N ILE 264.A O ILE 268.A H 2.804 1.967 SER 269.A N SER 265.A O SER 269.A H.B 3.034 2.242 GLN 270.A N GLU 266.A O GLN 270.A H 3.077 2.267 GLN 270.A NE2 GLU 266.A OE1 GLN 270.A HE21 2.763 1.905 TYR 271.A N LEU 267.A O TYR 271.A H 2.821 1.982 LYS 272.A N ILE 268.A O LYS 272.A H 2.946 2.135 LYS 272.A NZ PHE 138.A O LYS 272.A HZ1 3.318 2.731 SER 273.A N SER 269.A O SER 273.A H 2.921 2.093 SER 273.A OG GLN 270.A O SER 273.A HG 3.158 2.409 HIS 274.A N GLN 270.A O HIS 274.A H 2.821 2.055 GLY 275.A N LYS 272.A O GLY 275.A H 3.280 2.452 PHE 276.A N TYR 271.A O PHE 276.A H 2.859 2.263 MET 277.A N TYR 271.A O MET 277.A H 3.332 2.526 VAL 279.A N GLY 275.A O VAL 279.A H 3.043 2.236 LEU 280.A N PHE 276.A O LEU 280.A H 2.983 2.186 HIS 281.A N MET 277.A O HIS 281.A H 3.015 2.228 ASP 282.A N ASP 278.A O ASP 282.A H 2.940 2.104 LYS 283.A N VAL 279.A O LYS 283.A H 3.048 2.333 LYS 283.A N LEU 280.A O LYS 283.A H 3.221 2.626 LYS 283.A NZ ASP 72.A OD1 LYS 283.A HZ3 3.538 2.795 LYS 283.A NZ ASP 72.A OD2 LYS 283.A HZ3 2.778 1.905 TRP 284.A N LEU 280.A O TRP 284.A H 3.075 2.308 TRP 284.A NE1 ASP 72.A OD2 TRP 284.A HE1 2.797 2.006 TYR 285.A N HIS 281.A O TYR 285.A H 2.948 2.202 LYS 286.A NZ LYS 283.A O LYS 286.A HZ2 2.915 2.201