Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4kdx_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A N ARG 57.A O GLN 3.A H 2.955 2.099 GLN 3.A NE2 MET 1.A O GLN 3.A HE21 3.227 2.423 GLN 3.A NE2 GLU 28.A OE1 GLN 3.A HE22 2.612 1.755 ILE 4.A N GLU 28.A O ILE 4.A H 2.827 1.982 LEU 5.A N VAL 55.A O LEU 5.A H 2.813 1.953 GLY 6.A N GLU 30.A O GLY 6.A H 2.782 1.939 LYS 7.A N TRP 32.A O LYS 7.A H 2.857 2.066 LYS 7.A NZ ALA 34.A O LYS 7.A HZ3 2.822 2.063 SER 10.A N LYS 7.A O SER 10.A H 3.432 2.600 VAL 13.A N SER 10.A OG VAL 13.A H 3.061 2.209 ARG 14.A N SER 10.A O ARG 14.A H 2.830 2.010 ARG 14.A NE TYR 201.A O ARG 14.A HE 2.900 2.052 ARG 14.A NH1 THR 9.A O ARG 14.A HH11 3.238 2.422 ARG 14.A NH1 THR 206.A O ARG 14.A HH12 3.242 2.585 ARG 14.A NH1 PRO 207.A O ARG 14.A HH12 3.025 2.290 ARG 14.A NH2 ASN 170.A OD1 ARG 14.A HH22 3.386 2.695 ARG 14.A NH2 TYR 201.A O ARG 14.A HH21 3.543 2.889 ARG 14.A NH2 CYS 202.A O ARG 14.A HH21 2.989 2.342 ARG 14.A NH2 THR 206.A O ARG 14.A HH22 2.876 2.108 LYS 15.A N ILE 11.A O LYS 15.A H 3.080 2.349 LYS 15.A NZ SER 66.A OG LYS 15.A HZ2 3.171 2.420 LYS 15.A NZ ASN 67.A OD1 LYS 15.A HZ3 2.801 1.928 LYS 15.A NZ GLN 100.A OE1 LYS 15.A HZ1 2.940 2.272 LEU 17.A N VAL 13.A O LEU 17.A H 2.928 2.094 TRP 18.A N ARG 14.A O TRP 18.A H 2.874 2.022 TRP 18.A NE1 GLU 22.A OE2 TRP 18.A HE1 2.922 2.100 THR 19.A N LYS 15.A O THR 19.A H 3.061 2.243 THR 19.A OG1 LYS 15.A O THR 19.A HG1 2.819 2.079 CYS 20.A N VAL 16.A O CYS 20.A H 2.913 2.098 CYS 20.A SG VAL 16.A O CYS 20.A HG 3.380 2.454 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 3.042 2.208 GLU 22.A N TRP 18.A O GLU 22.A H 2.910 2.073 LEU 23.A N THR 19.A O LEU 23.A H 2.947 2.123 GLY 24.A N CYS 20.A O GLY 24.A H 3.086 2.419 LEU 25.A N CYS 20.A O LEU 25.A H 2.980 2.125 GLU 28.A N LEU 2.A O GLU 28.A H 2.898 2.074 ARG 29.A NH1 GLY 6.A O ARG 29.A HH11 2.987 2.238 ARG 29.A NH1 ASP 31.A OD1 ARG 29.A HH12 2.414 1.577 ARG 29.A NH2 ASP 31.A OD1 ARG 29.A HH22 3.026 2.412 GLU 30.A N ILE 4.A O GLU 30.A H 2.895 2.094 TRP 32.A NE1 GLU 30.A OE1 TRP 32.A HE1 2.918 2.088 GLY 33.A N ARG 37.A O.A GLY 33.A H 2.857 2.016 GLY 33.A N ARG 37.A O.B GLY 33.A H 2.865 2.023 PHE 36.A N.A GLY 33.A O PHE 36.A H.A 2.810 2.020 PHE 36.A N.B GLY 33.A O PHE 36.A H.B 2.877 2.094 ARG 37.A N.B GLY 33.A O ARG 37.A H.B 3.196 2.531 ARG 37.A NH2.B GLU 43.A OE1 ARG 37.A HH22.B 3.548 2.944 THR 39.A OG1 ALA 51.A O THR 39.A HG1 2.776 2.074 VAL 41.A N THR 39.A O VAL 41.A H 2.874 2.155 PHE 44.A N VAL 41.A O PHE 44.A H 3.065 2.390 LEU 45.A N VAL 41.A O LEU 45.A H 2.958 2.103 ALA 46.A N PRO 42.A O ALA 46.A H 2.989 2.191 LEU 47.A N PHE 44.A O LEU 47.A H 2.895 2.196 ASN 48.A N PHE 44.A O ASN 48.A H 2.942 2.147 ASN 48.A ND2 MET 52.A O ASN 48.A HD21 2.862 2.173 ASN 50.A N ASN 48.A OD1 ASN 50.A H 2.943 2.122 ASN 50.A ND2 ASN 48.A OD1 ASN 50.A HD21 2.943 2.155 ALA 51.A N ASN 48.A O ALA 51.A H 2.893 2.041 VAL 55.A N LEU 5.A O VAL 55.A H 3.162 2.352 ILE 56.A N LEU 63.A O ILE 56.A H 2.851 2.015 ARG 57.A N GLN 3.A O ARG 57.A H 2.964 2.156 ASP 58.A N PHE 61.A O ASP 58.A H 2.753 1.912 PHE 61.A N ASP 58.A O PHE 61.A H 2.992 2.156 LEU 63.A N ILE 56.A O LEU 63.A H 3.075 2.263 ILE 69.A N GLU 65.A O ILE 69.A H 2.944 2.135 ILE 70.A N SER 66.A O ILE 70.A H 2.957 2.134 ARG 71.A N ASN 67.A O ARG 71.A H 3.191 2.358 ARG 71.A NE TYR 83.A OH ARG 71.A HE 3.095 2.274 ARG 71.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 71.A HH12 3.105 2.391 ARG 71.A NH2 ASP 94.A OD1 ARG 71.A HH21 2.884 2.026 ARG 71.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 71.A HH22 2.855 2.051 ARG 71.A NH2 ASP 98.A OD2 ARG 71.A HH22 3.370 2.697 TYR 72.A N SER 68.A O TYR 72.A H 2.940 2.129 LEU 73.A N ILE 69.A O LEU 73.A H 2.888 2.053 ALA 74.A N ILE 70.A O ALA 74.A H 3.047 2.200 GLY 75.A N ARG 71.A O GLY 75.A H 2.950 2.167 ARG 76.A N TYR 72.A O ARG 76.A H 2.828 2.091 ARG 76.A NH1 ARG 76.A O ARG 76.A HH11 3.030 2.218 TYR 77.A N LEU 73.A O TYR 77.A H 2.910 2.161 GLY 79.A N ALA 74.A O GLY 79.A H 2.974 2.316 GLU 80.A N GLU 80.A OE1 GLU 80.A H 2.872 2.076 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.856 2.065 TYR 83.A N GLY 79.A O TYR 83.A H 2.869 2.093 GLU 89.A N ASP 86.A OD2 GLU 89.A H 2.985 2.161 ARG 90.A N ASP 86.A O ARG 90.A H 2.849 2.003 ARG 90.A NE PRO 84.A O ARG 90.A HE 2.812 2.000 ARG 90.A NH2 TYR 83.A O ARG 90.A HH21 3.068 2.402 ARG 90.A NH2 PRO 84.A O ARG 90.A HH21 3.292 2.632 ALA 91.A N ALA 87.A O ALA 91.A H 2.906 2.099 ARG 92.A N ARG 88.A O ARG 92.A H 3.057 2.254 CYS 93.A N GLU 89.A O CYS 93.A H 3.379 2.613 CYS 93.A SG GLU 89.A O CYS 93.A HG 3.650 2.544 ASP 94.A N ARG 90.A O ASP 94.A H 2.804 1.983 GLN 95.A N ALA 91.A O GLN 95.A H 2.988 2.144 TRP 96.A N CYS 93.A O TRP 96.A H 3.190 2.585 ILE 97.A N CYS 93.A O ILE 97.A H 3.082 2.238 ASP 98.A N ASP 94.A O ASP 98.A H 2.794 1.939 TRP 99.A N GLN 95.A O TRP 99.A H 3.008 2.193 GLN 100.A N TRP 96.A O GLN 100.A H 2.911 2.108 GLN 100.A NE2 SER 168.A OG GLN 100.A HE21 2.939 2.183 ALA 101.A N ILE 97.A O ALA 101.A H 3.319 2.569 SER 102.A N ASP 98.A O SER 102.A H 2.936 2.154 GLU 103.A N TRP 99.A O GLU 103.A H 2.876 2.057 LEU 104.A N TRP 99.A O LEU 104.A H 3.106 2.285 ASN 105.A N GLN 100.A O ASN 105.A H 2.857 2.007 SER 107.A N GLU 103.A O SER 107.A H 3.095 2.392 SER 107.A N LEU 104.A O SER 107.A H 3.082 2.411 SER 107.A OG LEU 104.A O SER 107.A HG 2.710 2.228 ALA 111.A N SER 131.A OG ALA 111.A H 3.082 2.242 PHE 112.A N TRP 108.A O PHE 112.A H 2.928 2.075 LEU 113.A N SER 109.A O LEU 113.A H 2.979 2.122 ALA 114.A N TYR 110.A O ALA 114.A H 2.926 2.103 LEU 115.A N ALA 111.A O LEU 115.A H 2.880 2.072 VAL 116.A N PHE 112.A O VAL 116.A H 2.895 2.071 ARG 117.A N PHE 112.A O ARG 117.A H 3.237 2.427 SER 119.A N LEU 113.A O SER 119.A H 2.935 2.077 ALA 121.A N SER 119.A OG ALA 121.A H 3.173 2.443 HIS 122.A N SER 119.A O HIS 122.A H 3.034 2.189 ASP 124.A N TYR 110.A OH ASP 124.A H 3.049 2.205 GLN 126.A N ASP 124.A OD1 GLN 126.A H 2.817 2.143 GLN 127.A NE2 ASP 124.A OD2 GLN 127.A HE21 2.940 2.104 ILE 128.A N ASP 124.A O ILE 128.A H 2.990 2.191 GLU 129.A N ALA 125.A O GLU 129.A H 3.061 2.230 ALA 130.A N GLN 126.A O ALA 130.A H 2.928 2.110 SER 131.A N GLN 127.A O SER 131.A H 3.001 2.164 SER 131.A OG SER 107.A O SER 131.A HG 2.914 2.367 ARG 132.A N ILE 128.A O ARG 132.A H 2.905 2.080 ARG 132.A NE GLU 129.A OE2 ARG 132.A HE 2.909 2.057 ARG 132.A NH2 GLU 129.A OE1 ARG 132.A HH21 2.713 1.857 ALA 133.A N GLU 129.A O ALA 133.A H 2.833 1.997 ASN 134.A N ALA 130.A O ASN 134.A H 3.014 2.180 TRP 135.A N SER 131.A O TRP 135.A H 2.856 2.002 ALA 136.A N ARG 132.A O ALA 136.A H 2.862 2.075 LYS 137.A N ALA 133.A O LYS 137.A H 3.081 2.295 HIS 138.A N ASN 134.A O HIS 138.A H 3.144 2.351 HIS 138.A ND1 ASN 134.A O HIS 138.A HD1 2.782 1.921 MET 139.A N TRP 135.A O MET 139.A H 2.905 2.092 ALA 140.A N ALA 136.A O ALA 140.A H 3.001 2.239 ILE 141.A N HIS 138.A O ILE 141.A H 3.081 2.473 VAL 142.A N HIS 138.A O VAL 142.A H 3.190 2.376 GLU 143.A N MET 139.A O GLU 143.A H 2.898 2.071 GLY 144.A N ALA 140.A O GLY 144.A H 2.994 2.179 GLN 145.A N ILE 141.A O GLN 145.A H 3.076 2.296 GLN 145.A NE2 ILE 153.A O GLN 145.A HE21 2.869 2.032 LEU 146.A N VAL 142.A O LEU 146.A H 3.000 2.161 GLN 147.A N GLU 143.A O GLN 147.A H 2.829 2.014 GLN 147.A NE2 GLU 143.A OE2 GLN 147.A HE21 2.759 1.950 ARG 148.A N GLY 144.A O ARG 148.A H 3.153 2.394 ARG 148.A NE GLN 145.A OE1 ARG 148.A HE 3.338 2.675 ARG 148.A NH2 GLN 145.A OE1 ARG 148.A HH21 2.857 2.074 THR 149.A N GLN 145.A O THR 149.A H 2.943 2.147 THR 149.A OG1 PHE 152.A O THR 149.A HG1 2.766 1.960 GLY 150.A N LEU 146.A O GLY 150.A H 2.805 2.002 ALA 151.A N THR 149.A OG1 ALA 151.A H 3.039 2.196 PHE 152.A N GLY 155.A O PHE 152.A H 2.956 2.135 ILE 153.A N ASP 162.A OD1 ILE 153.A H 2.912 2.057 SER 159.A N ASP 162.A OD2 SER 159.A H 2.861 2.047 LEU 160.A N LEU 82.A O LEU 160.A H 2.824 2.072 ALA 161.A N SER 159.A OG ALA 161.A H 3.237 2.507 ASP 162.A N SER 159.A O ASP 162.A H 2.989 2.229 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.167 2.368 ILE 165.A N ALA 161.A O ILE 165.A H 3.276 2.445 ALA 166.A N ASP 162.A O ALA 166.A H 2.787 1.938 LEU 167.A N ILE 163.A O LEU 167.A H 3.171 2.320 SER 168.A N PRO 164.A O SER 168.A H 3.064 2.291 ILE 169.A N ILE 165.A O ILE 169.A H 2.907 2.086 ASN 170.A N ALA 166.A O ASN 170.A H 2.911 2.074 ARG 171.A N LEU 167.A O ARG 171.A H 3.093 2.329 ARG 171.A NE PRO 207.A OXT ARG 171.A HE 2.847 1.991 ARG 171.A NH2 PRO 207.A O ARG 171.A HH21 3.269 2.442 ARG 171.A NH2 PRO 207.A OXT ARG 171.A HH21 3.496 2.839 TRP 172.A N SER 168.A O TRP 172.A H 3.115 2.281 LEU 173.A N ILE 169.A O LEU 173.A H 2.902 2.092 GLU 174.A N ASN 170.A O GLU 174.A H 2.968 2.325 GLU 174.A N ARG 171.A O GLU 174.A H 3.279 2.564 THR 175.A OG1 ARG 171.A O THR 175.A HG1 2.780 2.011 ILE 177.A N THR 175.A O ILE 177.A H 2.846 2.154 ARG 179.A NH1 TRP 172.A O ARG 179.A HH11 2.969 2.387 ALA 184.A N GLU 143.A OE2 ALA 184.A H 2.842 1.987 VAL 185.A N GLU 143.A OE1 VAL 185.A H 2.859 2.055 ASP 186.A N LEU 182.A O ASP 186.A H 3.051 2.225 ALA 187.A N PRO 183.A O ALA 187.A H 2.927 2.093 TYR 188.A N ALA 184.A O TYR 188.A H 2.942 2.135 MET 189.A N VAL 185.A O MET 189.A H 3.014 2.186 THR 190.A N ASP 186.A O THR 190.A H 2.987 2.208 THR 190.A OG1 ASP 186.A O THR 190.A HG1 3.114 2.406 ARG 191.A N ALA 187.A O ARG 191.A H 2.912 2.103 ARG 191.A NH1 ALA 151.A O ARG 191.A HH11 2.763 2.072 LEU 192.A N TYR 188.A O LEU 192.A H 2.991 2.211 ALA 193.A N THR 190.A O ALA 193.A H 3.105 2.321 ARG 195.A N LEU 192.A O ARG 195.A H 2.882 2.026 ARG 195.A NE GLU 22.A OE2 ARG 195.A HE 2.979 2.122 ARG 195.A NH2 GLU 22.A OE1 ARG 195.A HH21 2.767 1.909 ARG 199.A N ARG 195.A O ARG 199.A H 3.221 2.418 ARG 199.A NH1 ALA 193.A O ARG 199.A HH11 2.851 2.005 ARG 199.A NH1 ASP 196.A OD1.A ARG 199.A HH12 3.175 2.591 ARG 199.A NH2 ASP 196.A OD1.A ARG 199.A HH22 2.597 1.853 GLU 200.A N ASP 196.A O.A GLU 200.A H 2.979 2.217 GLU 200.A N ASP 196.A O.B GLU 200.A H 3.027 2.272 TYR 201.A N ALA 197.A O TYR 201.A H 2.913 2.104 CYS 202.A N TYR 198.A O CYS 202.A H 2.839 2.049 ARG 203.A N TYR 198.A O ARG 203.A H 2.952 2.240 ASN 204.A N CYS 202.A O ASN 204.A H 2.927 2.325 ASN 204.A ND2 GLU 200.A O ASN 204.A HD21 2.971 2.133 THR 206.A N ASN 204.A OD1 THR 206.A H 2.924 2.076 THR 206.A OG1 ASN 204.A OD1 THR 206.A HG1 3.476 2.955