Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ly6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 1.A N GLU 1.A OE2 no hydrogen 2.276 N/A SER 6.A N ASP 179.A OD1 SER 6.A H 2.466 1.743 LYS 8.A NZ GLU 175.A O LYS 8.A HZ1 2.580 1.803 LYS 10.A N SER 6.A O LYS 10.A H 2.731 1.919 GLU 11.A N PRO 7.A O GLU 11.A H 2.742 1.974 ILE 12.A N LYS 8.A O ILE 12.A H 3.312 2.549 LEU 13.A N MET 9.A O LEU 13.A H 3.236 2.479 GLU 14.A N LYS 10.A O GLU 14.A H 3.330 2.551 LYS 15.A N GLU 11.A O LYS 15.A H 3.045 2.201 ILE 16.A N ILE 12.A O ILE 16.A H 2.827 2.004 LYS 17.A N LEU 13.A O LYS 17.A H 3.318 2.519 LYS 18.A N GLU 14.A O LYS 18.A H 3.192 2.486 ILE 19.A N ILE 16.A O ILE 19.A H 3.192 2.536 SER 20.A N LYS 17.A O SER 20.A H 3.451 2.608 ALA 22.A N ILE 19.A O ALA 22.A H 2.733 1.894 LEU 27.A N ILE 166.A O LEU 27.A H 2.950 2.094 ILE 28.A N ALA 140.A O ILE 28.A H 2.965 2.130 THR 29.A N ILE 168.A O THR 29.A H 2.991 2.146 LYS 36.A NZ GLY 30.A O LYS 36.A HZ2 3.223 2.405 VAL 39.A N GLY 35.A O VAL 39.A H 3.304 2.481 ALA 40.A N LYS 36.A O ALA 40.A H 3.121 2.323 ARG 41.A N GLU 37.A O ARG 41.A H 2.952 2.137 LEU 42.A N VAL 38.A O LEU 42.A H 2.698 1.983 ILE 43.A N VAL 39.A O ILE 43.A H 2.992 2.180 HIS 44.A NE2 GLU 52.A O HIS 44.A HE2 2.860 2.263 LYS 45.A N ARG 41.A O LYS 45.A H 3.285 2.513 LEU 46.A N LEU 42.A O LEU 46.A H 3.033 2.273 SER 47.A OG ILE 43.A O SER 47.A HG 3.563 3.107 SER 47.A OG HIS 44.A O SER 47.A HG 2.851 2.057 ARG 49.A NH2 ASN 135.A OD1 ARG 49.A HH22 2.531 1.736 SER 50.A OG LYS 45.A O SER 50.A HG 2.403 1.841 GLU 52.A N ARG 49.A O GLU 52.A H 2.518 1.682 VAL 55.A N THR 97.A O VAL 55.A H 2.975 2.116 LEU 57.A N PHE 99.A O LEU 57.A H 3.099 2.303 SER 61.A N ASN 58.A OD1 SER 61.A H 2.670 1.898 SER 61.A OG ASN 58.A O SER 61.A HG 3.078 2.327 SER 61.A OG ASN 58.A OD1 SER 61.A HG 3.236 2.681 ARG 64.A NH1 GLU 109.A OE2 ARG 64.A HH12 3.377 2.707 ARG 64.A NH2 GLU 109.A OE1 ARG 64.A HH22 3.264 2.529 ARG 64.A NH2 GLU 109.A OE2 ARG 64.A HH22 2.936 2.136 GLU 70.A N ILE 66.A O GLU 70.A H 2.820 2.014 LEU 71.A N PHE 67.A O LEU 71.A H 3.247 2.444 PHE 72.A N GLU 68.A O PHE 72.A H 2.999 2.144 GLY 73.A N ALA 69.A O GLY 73.A H 2.692 2.051 TYR 74.A N LYS 86.A O TYR 74.A H 3.292 2.467 GLY 77.A N ALA 82.A O GLY 77.A H 3.204 2.466 LYS 86.A N TYR 74.A O LYS 86.A H 3.113 2.273 LEU 92.A N GLY 88.A O LEU 92.A H 3.127 2.351 ALA 93.A N PHE 89.A O ALA 93.A H 3.073 2.423 ALA 93.A N PHE 90.A O ALA 93.A H 3.081 2.421 ASP 94.A N GLU 91.A O ASP 94.A H 3.253 2.415 GLY 95.A N ASN 135.A O GLY 95.A H 2.638 1.778 GLY 96.A N ALA 93.A O GLY 96.A H 2.647 1.864 THR 97.A N PRO 53.A O THR 97.A H 3.158 2.346 LEU 98.A N ARG 137.A O LEU 98.A H 3.190 2.341 PHE 99.A N VAL 55.A O PHE 99.A H 2.954 2.108 LEU 100.A N LEU 139.A O LEU 100.A H 2.829 1.977 ILE 103.A N ALA 141.A O ILE 103.A H 3.116 2.290 GLU 105.A N GLU 102.A O GLU 105.A H 3.287 2.428 ALA 110.A N SER 107.A O ALA 110.A H 2.552 1.921 ALA 110.A N SER 107.A OG ALA 110.A H 3.129 2.428 GLN 111.A N SER 107.A O GLN 111.A H 2.662 1.871 GLN 111.A NE2 LEU 106.A O GLN 111.A HE21 2.810 2.167 GLN 111.A NE2 LYS 154.A O GLN 111.A HE22 3.386 2.553 ALA 112.A N LEU 108.A O ALA 112.A H 3.050 2.239 VAL 117.A N LEU 114.A O VAL 117.A H 3.206 2.462 ILE 118.A N LEU 114.A O ILE 118.A H 3.337 2.541 GLY 121.A N VAL 117.A O GLY 121.A H 2.537 1.732 PHE 123.A N ILE 132.A O PHE 123.A H 3.304 2.475 ARG 125.A NE GLU 91.A OE2 ARG 125.A HE 3.035 2.203 ARG 125.A NH1 GLU 75.A OE1 ARG 125.A HH11 2.891 2.075 ARG 125.A NH2 GLU 91.A OE1 ARG 125.A HH21 2.745 1.911 ARG 125.A NH2 GLU 91.A OE2 ARG 125.A HH21 3.376 2.661 LEU 126.A N GLY 73.A O LEU 126.A H 3.163 2.323 GLY 128.A N ARG 125.A O GLY 128.A H 3.120 2.313 ILE 132.A N PHE 123.A O ILE 132.A H 3.202 2.348 VAL 134.A N GLY 121.A O VAL 134.A H 3.389 2.548 ASN 135.A N ASP 94.A OD1 ASN 135.A H 2.883 2.071 ARG 137.A NE CYS 24.A O ARG 137.A HE 2.771 1.964 ARG 137.A NH2 CYS 24.A O ARG 137.A HH21 3.494 2.905 LEU 139.A N LEU 98.A O LEU 139.A H 2.984 2.158 ALA 140.A N VAL 26.A O ALA 140.A H 3.129 2.304 ALA 141.A N LEU 100.A O ALA 141.A H 2.929 2.181 THR 142.A N ILE 28.A O THR 142.A H 3.149 2.349 ARG 144.A N THR 142.A OG1 ARG 144.A H 3.101 2.265 ASN 145.A ND2 GLU 148.A OE1 ASN 145.A HD22 3.566 2.827 LEU 149.A N ASN 145.A O LEU 149.A H 3.280 2.471 GLU 152.A N GLU 148.A O GLU 152.A H 2.938 2.220 GLY 153.A N VAL 150.A O GLY 153.A H 2.902 2.091 LYS 154.A N LEU 149.A O LYS 154.A H 3.049 2.297 LYS 154.A NZ GLU 152.A OE1 LYS 154.A HZ2 3.434 2.711 ARG 162.A N LEU 159.A O ARG 162.A H 3.254 2.577 LEU 163.A N LEU 159.A O LEU 163.A H 3.122 2.295 GLY 164.A N TYR 160.A O GLY 164.A H 2.364 1.732 ILE 168.A N LEU 27.A O ILE 168.A H 3.195 2.428 ILE 170.A N THR 29.A O ILE 170.A H 2.906 2.195 ARG 174.A NE PRO 214.A O ARG 174.A HE 3.254 2.440 ARG 176.A N LEU 173.A O ARG 176.A H 2.726 1.945 ARG 176.A NH1 PRO 171.A O ARG 176.A HH11 3.549 2.739 ARG 176.A NH2 ASP 179.A OD2 ARG 176.A HH21 3.270 2.469 GLU 178.A N GLU 178.A OE1 GLU 178.A H 2.634 1.818 ILE 180.A N LYS 177.A O ILE 180.A H 3.152 2.310 ALA 184.A N ILE 180.A O ALA 184.A H 2.868 2.052 ASN 185.A N ILE 181.A O ASN 185.A H 2.796 1.962 HIS 186.A N PRO 182.A O HIS 186.A H 3.204 2.425 PHE 187.A N LEU 183.A O PHE 187.A H 3.141 2.308 LEU 188.A N ALA 184.A O LEU 188.A H 3.220 2.421 LYS 189.A N ASN 185.A O LYS 189.A H 3.034 2.208 LYS 190.A N HIS 186.A O LYS 190.A H 2.968 2.193 PHE 191.A N PHE 187.A O PHE 191.A H 2.800 1.946 SER 192.A N LEU 188.A O SER 192.A H 2.882 2.102 SER 192.A OG VAL 199.A O SER 192.A HG 3.427 2.689 ARG 193.A N LYS 189.A O ARG 193.A H 3.295 2.597 ARG 193.A N LYS 190.A O ARG 193.A H 2.989 2.316 LYS 194.A N LYS 190.A O LYS 194.A H 3.180 2.392 TYR 195.A N PHE 191.A O TYR 195.A H 3.057 2.208 LYS 197.A N SER 192.A O LYS 197.A H 2.966 2.234 GLU 200.A N LYS 236.A O GLU 200.A H 3.177 2.355 THR 203.A N ILE 238.A O THR 203.A H 3.386 2.527 ALA 206.A N THR 203.A OG1 ALA 206.A H 2.922 2.115 GLN 207.A N THR 203.A O GLN 207.A H 2.821 2.059 GLU 208.A N LYS 204.A O GLU 208.A H 3.163 2.390 LEU 209.A N ALA 206.A O LEU 209.A H 3.039 2.413 LEU 210.A N ALA 206.A O LEU 210.A H 3.320 2.504 SER 212.A N GLU 208.A O SER 212.A H 3.222 2.550 SER 212.A N LEU 209.A O SER 212.A H 2.900 2.252 SER 212.A OG GLU 208.A O SER 212.A HG 3.357 2.652 SER 212.A OG LEU 209.A O SER 212.A HG 2.930 2.332 TYR 213.A OH GLU 221.A OE2 TYR 213.A HH 2.784 2.110 TRP 215.A NE1 LEU 210.A O TRP 215.A HE1 3.165 2.425 GLY 217.A N GLU 221.A OE1 GLY 217.A H 2.820 2.146 ASN 218.A N TRP 215.A O ASN 218.A H 3.063 2.233 ASN 218.A ND2 GLU 31.A OE1 ASN 218.A HD21 3.261 2.496 VAL 219.A N GLY 33.A O VAL 219.A H 3.226 2.475 GLU 221.A N GLY 217.A O GLU 221.A H 3.257 2.403 LYS 223.A N VAL 219.A O LYS 223.A H 3.035 2.209 ASN 224.A N ARG 220.A O ASN 224.A H 2.899 2.119 VAL 225.A N GLU 221.A O VAL 225.A H 2.996 2.176 ILE 226.A N LEU 222.A O ILE 226.A H 3.422 2.592 GLU 227.A N LYS 223.A O GLU 227.A H 3.383 2.601 ARG 228.A N ASN 224.A O ARG 228.A H 3.169 2.391 ALA 229.A N VAL 225.A O ALA 229.A H 2.878 2.084 VAL 230.A N ILE 226.A O VAL 230.A H 2.710 1.871 LEU 231.A N GLU 227.A O LEU 231.A H 3.402 2.601 PHE 232.A N ARG 228.A O PHE 232.A H 3.023 2.235 SER 233.A N VAL 230.A O SER 233.A H 3.369 2.577 SER 233.A OG VAL 230.A O SER 233.A HG 2.533 1.745 GLY 241.A N ASP 239.A OD2 GLY 241.A H 3.239 2.431 CYS 245.A SG GLU 242.A O CYS 245.A HG 3.407 2.542 LEU 246.A N LEU 243.A O LEU 246.A H 2.912 2.239 VAL 247.A N LEU 243.A O VAL 247.A H 2.949 2.210