Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4mk3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N GLU 55.A OE1 MET 1.A H 3.399 2.553 LYS 2.A N VAL 53.A O LYS 2.A H 2.914 2.066 LEU 3.A N GLU 27.A O LEU 3.A H 2.783 1.939 TYR 4.A N CYS 51.A O TYR 4.A H 2.832 2.001 ALA 5.A N ILE 29.A O ALA 5.A H 3.047 2.251 GLN 7.A NE2 GLU 30.A OE1 GLN 7.A HE21 2.984 2.152 SER 9.A N SER 6.A OG SER 9.A H 3.006 2.254 TYR 11.A OH ASP 102.A OD1 TYR 11.A HH 2.628 1.923 ALA 12.A N SER 9.A OG ALA 12.A H 2.993 2.149 ARG 13.A N SER 9.A O ARG 13.A H 2.835 2.102 ARG 13.A NE THR 199.A OG1 ARG 13.A HE 2.903 2.090 ARG 13.A NH2 PHE 196.A O ARG 13.A HH21 2.912 2.170 LYS 14.A N PRO 10.A O LYS 14.A H 3.050 2.241 LYS 14.A NZ SER 63.A OG LYS 14.A HZ1 2.886 2.092 LYS 14.A NZ GLU 94.A OE2 LYS 14.A HZ2 2.771 1.882 LYS 14.A NZ ASP 98.A OD1 LYS 14.A HZ3 2.942 2.064 VAL 15.A N TYR 11.A O VAL 15.A H 3.394 2.582 ARG 16.A N.A ALA 12.A O ARG 16.A H.A 2.847 2.010 ARG 16.A N.B ALA 12.A O ARG 16.A H.B 2.871 2.039 ARG 16.A NE.B TYR 26.A OH ARG 16.A HE.B 3.483 2.674 ARG 16.A NH1.B GLN 7.A OE1 ARG 16.A HH12.B 3.190 2.528 ARG 16.A NH2.B GLN 7.A OE1 ARG 16.A HH22.B 3.561 2.990 VAL 17.A N ARG 13.A O VAL 17.A H.B 2.808 1.973 VAL 18.A N LYS 14.A O VAL 18.A H 3.029 2.193 LEU 19.A N VAL 15.A O LEU 19.A H 2.857 2.013 ALA 20.A N ARG 16.A O.A ALA 20.A H 2.977 2.166 ALA 20.A N ARG 16.A O.B ALA 20.A H 2.899 2.081 GLU 21.A N VAL 17.A O GLU 21.A H 2.832 1.985 LYS 22.A N VAL 18.A O LYS 22.A H 2.943 2.148 LYS 22.A NZ ASP 71.A OD1 LYS 22.A HZ3 2.911 2.035 LYS 22.A NZ SER 74.A O LYS 22.A HZ1 2.946 2.192 LYS 22.A NZ VAL 76.A O LYS 22.A HZ2 2.715 1.948 LYS 22.A NZ SER 77.A O LYS 22.A HZ2 3.302 2.720 LYS 23.A N ALA 20.A O LYS 23.A H 3.107 2.313 ILE 24.A N LEU 19.A O ILE 24.A H 3.026 2.188 GLU 27.A N MET 1.A O GLU 27.A H 2.849 1.996 ILE 29.A N LEU 3.A O ILE 29.A H 2.819 1.978 GLU 31.A N ALA 5.A O GLU 31.A H 2.858 2.085 TRP 34.A N ASN 32.A OD1 TRP 34.A H 3.018 2.218 SER 35.A N ASN 32.A O SER 35.A H 3.104 2.267 ASP 37.A N SER 35.A OG ASP 37.A H 2.993 2.164 THR 38.A N SER 35.A O THR 38.A H 3.159 2.334 THR 38.A OG1 GLU 31.A OE2 THR 38.A HG1 2.621 1.866 THR 39.A N GLU 31.A OE2 THR 39.A H 3.008 2.224 ILE 40.A N THR 38.A OG1 ILE 40.A H 3.272 2.431 ARG 42.A N THR 39.A O ARG 42.A H 3.123 2.279 PHE 43.A N ILE 40.A O PHE 43.A H 2.909 2.062 ASN 44.A N ILE 40.A O ASN 44.A H 2.906 2.053 ASN 44.A ND2 LYS 48.A O ASN 44.A HD22 2.937 2.164 LEU 46.A N ASN 44.A OD1 LEU 46.A H 2.904 2.091 GLY 47.A N ASN 44.A O GLY 47.A H 2.846 2.008 CYS 51.A N TYR 4.A O CYS 51.A H 3.017 2.226 LEU 52.A N VAL 60.A O LEU 52.A H 2.917 2.114 VAL 53.A N LYS 2.A O VAL 53.A H 2.761 1.917 MET 54.A N GLY 58.A O MET 54.A H 2.740 1.890 GLY 57.A N MET 54.A O GLY 57.A H 2.687 1.875 GLY 58.A N ASP 56.A OD1 GLY 58.A H 2.778 1.971 VAL 60.A N LEU 52.A O VAL 60.A H 2.687 1.884 ARG 64.A N ASP 62.A OD1 ARG 64.A H 3.256 2.577 ARG 64.A NE ASP 98.A OD2 ARG 64.A HE 3.052 2.227 ILE 66.A N ASP 62.A O ILE 66.A H 2.964 2.130 ALA 67.A N SER 63.A O ALA 67.A H 2.912 2.076 GLU 68.A N ARG 64.A O GLU 68.A H 3.030 2.183 TYR 69.A N VAL 65.A O TYR 69.A H 3.064 2.231 ALA 70.A N ILE 66.A O ALA 70.A H 2.836 1.987 ASP 71.A N ALA 67.A O ASP 71.A H 3.059 2.251 THR 72.A N TYR 69.A O THR 72.A H 2.964 2.197 THR 72.A OG1 TYR 69.A O THR 72.A HG1 2.779 1.947 LEU 73.A N ALA 70.A O LEU 73.A H 2.986 2.139 VAL 76.A N SER 74.A OG VAL 76.A H 3.265 2.407 LEU 79.A N ASP 71.A OD1 LEU 79.A H 2.874 2.043 ILE 80.A N ASP 71.A OD2 ILE 80.A H 2.969 2.231 ARG 85.A NE GLU 86.A OE2.A ARG 85.A HE 2.562 1.758 ARG 85.A NH1 GLU 86.A OE2.A ARG 85.A HH11 2.899 2.232 ARG 87.A N GLY 83.A O ARG 87.A H.A 2.713 1.878 ARG 87.A NH1 PRO 81.A O ARG 87.A HH11 3.259 2.551 ARG 87.A NH2 GLU 68.A OE2 ARG 87.A HH22 3.530 2.710 LEU 88.A N SER 84.A O LEU 88.A H 2.893 2.070 GLU 89.A N.A ARG 85.A O GLU 89.A H.A 3.120 2.301 GLU 89.A N.B ARG 85.A O GLU 89.A H.B 3.110 2.297 VAL 90.A N GLU 86.A O.A VAL 90.A H.B 3.146 2.313 VAL 90.A N GLU 86.A O.B VAL 90.A H.B 3.047 2.208 ARG 91.A N ARG 87.A O ARG 91.A H 2.832 1.994 ARG 91.A NE GLU 94.A OE1 ARG 91.A HE 2.877 2.113 ARG 91.A NH2 ARG 64.A O ARG 91.A HH22 3.263 2.647 ARG 91.A NH2 GLU 94.A OE1 ARG 91.A HH21 2.782 2.006 CYS 92.A N.A LEU 88.A O CYS 92.A H.A 2.870 2.061 CYS 92.A N.B LEU 88.A O CYS 92.A H.B 2.823 1.992 CYS 92.A SG.B LEU 88.A O CYS 92.A HG.B 3.160 2.332 TRP 93.A N GLU 89.A O.A TRP 93.A H.A 3.018 2.169 TRP 93.A N GLU 89.A O.B TRP 93.A H.A 3.099 2.251 GLU 94.A N VAL 90.A O GLU 94.A H 3.013 2.207 ALA 95.A N ARG 91.A O ALA 95.A H 2.928 2.121 LEU 96.A N CYS 92.A O.A LEU 96.A H 2.872 2.070 LEU 96.A N CYS 92.A O.B LEU 96.A H 2.918 2.125 ALA 97.A N TRP 93.A O ALA 97.A H 3.002 2.163 ASP 98.A N GLU 94.A O ASP 98.A H 2.839 1.990 GLY 99.A N ALA 95.A O GLY 99.A H 2.837 2.047 LEU 100.A N LEU 96.A O LEU 100.A H 3.020 2.205 LEU 101.A N ALA 97.A O LEU 101.A H 3.016 2.177 ASP 102.A N ASP 98.A O ASP 102.A H 2.797 2.028 ALA 103.A N GLY 99.A O ALA 103.A H 3.123 2.309 ALA 104.A N LEU 100.A O ALA 104.A H 2.906 2.081 LEU 105.A N LEU 101.A O LEU 105.A H 2.782 1.928 LEU 106.A N ASP 102.A O LEU 106.A H 3.076 2.239 ALA 107.A N ALA 103.A O ALA 107.A H 2.955 2.155 ARG 108.A N ALA 104.A O ARG 108.A H 2.912 2.104 LEU 109.A N LEU 105.A O LEU 109.A H 2.745 1.906 GLU 110.A N LEU 106.A O GLU 110.A H 3.062 2.340 VAL 111.A N ARG 108.A O VAL 111.A H 3.052 2.302 THR 112.A N ARG 108.A O THR 112.A H 3.081 2.259 GLN 113.A N LEU 109.A O GLN 113.A H 2.913 2.094 GLN 113.A NE2 THR 112.A OG1 GLN 113.A HE21 3.106 2.314 ARG 114.A NH1 GLU 118.A O ARG 114.A HH11 3.096 2.331 LYS 115.A N GLU 118.A OE1 LYS 115.A H 2.860 2.055 GLU 118.A N LYS 115.A O GLU 118.A H 2.748 1.906 ARG 119.A N GLU 116.A O ARG 119.A H 3.244 2.446 ARG 119.A NE ARG 114.A O ARG 119.A HE 3.205 2.476 ARG 119.A NH2 ARG 114.A O ARG 119.A HH21 3.005 2.234 SER 120.A N GLU 110.A OE2 SER 120.A H 2.767 1.976 TRP 123.A N SER 120.A OG TRP 123.A H 2.984 2.149 VAL 124.A N SER 120.A O VAL 124.A H 3.290 2.451 GLN 125.A N GLU 121.A O GLN 125.A H 2.968 2.149 ARG 126.A N SER 122.A O ARG 126.A H 2.978 2.156 GLN 127.A N TRP 123.A O GLN 127.A H 3.010 2.180 ARG 128.A N VAL 124.A O ARG 128.A H 2.864 2.026 ARG 128.A NH1 ASP 173.A OD2 ARG 128.A HH12 2.890 2.092 ARG 128.A NH2 ASP 173.A OD2 ARG 128.A HH22 3.568 2.957 SER 129.A N GLN 125.A O SER 129.A H 2.862 2.067 SER 129.A OG GLN 125.A O SER 129.A HG 3.084 2.352 LYS 130.A N ARG 126.A O LYS 130.A H 3.100 2.343 ILE 131.A N GLN 127.A O ILE 131.A H 3.120 2.334 ASP 132.A N ARG 128.A O ASP 132.A H 3.079 2.249 ALA 133.A N SER 129.A O ALA 133.A H 2.979 2.146 ALA 134.A N LYS 130.A O ALA 134.A H 2.803 1.984 LEU 135.A N ILE 131.A O LEU 135.A H 2.895 2.059 THR 136.A N ASP 132.A O THR 136.A H 3.067 2.238 ALA 137.A N ALA 133.A O ALA 137.A H 2.939 2.115 MET 138.A N ALA 134.A O MET 138.A H 2.838 2.038 SER 139.A N LEU 135.A O SER 139.A H 2.966 2.140 SER 139.A OG ASN 182.A OD1 SER 139.A HG 2.758 1.922 THR 140.A N THR 136.A O THR 140.A H 2.852 2.013 THR 140.A OG1 THR 136.A O THR 140.A HG1 3.048 2.329 GLY 141.A N ALA 137.A O GLY 141.A H 2.793 1.977 LEU 142.A N MET 138.A O LEU 142.A H 2.930 2.094 ALA 143.A N SER 139.A O ALA 143.A H 3.005 2.180 ASP 144.A N.A ASP 144.A OD1.A ASP 144.A H.A 2.483 1.818 LYS 145.A N LEU 142.A O LYS 145.A H.B 3.027 2.203 LYS 145.A NZ GLY 141.A O LYS 145.A HZ1 2.906 2.152 LYS 145.A NZ CYS 148.A O LYS 145.A HZ2 2.760 2.017 TRP 147.A N GLY 150.A O TRP 147.A H 2.984 2.206 CYS 148.A N ASP 157.A OD1 CYS 148.A H 2.813 1.955 GLY 150.A N TRP 147.A O GLY 150.A H 2.964 2.137 HIS 152.A ND1 THR 151.A OG1 HIS 152.A HD1 2.720 1.928 THR 154.A N ASP 157.A OD2 THR 154.A H 2.840 2.017 THR 154.A OG1 ASP 157.A OD2 THR 154.A HG1 3.455 2.683 LEU 155.A N LEU 79.A O LEU 155.A H 2.830 1.993 ALA 156.A N THR 154.A OG1 ALA 156.A H 3.072 2.355 VAL 158.A N THR 154.A O VAL 158.A H 3.226 2.404 ALA 159.A N LEU 155.A O ALA 159.A H 2.940 2.102 VAL 160.A N ALA 156.A O VAL 160.A H 2.976 2.127 GLY 161.A N ASP 157.A O GLY 161.A H 2.835 1.986 CYS 162.A N VAL 158.A O CYS 162.A H 2.968 2.148 CYS 162.A SG VAL 158.A O CYS 162.A HG 3.372 2.499 ALA 163.A N ALA 159.A O ALA 163.A H 3.047 2.260 LEU 164.A N VAL 160.A O LEU 164.A H 2.896 2.056 ALA 165.A N GLY 161.A O ALA 165.A H 3.024 2.179 TYR 166.A N CYS 162.A O TYR 166.A H 2.960 2.199 LEU 167.A N ALA 163.A O LEU 167.A H 3.076 2.261 ASP 168.A N LEU 164.A O ASP 168.A H 3.012 2.180 PHE 169.A N ALA 165.A O PHE 169.A H 3.000 2.258 ARG 170.A N TYR 166.A O ARG 170.A H 2.776 1.931 PHE 171.A N LEU 167.A O PHE 171.A H 2.811 2.035 ILE 174.A N PHE 171.A O ILE 174.A H 2.932 2.092 TRP 176.A N ILE 174.A O TRP 176.A H 2.852 2.137 ARG 177.A NE ASP 168.A OD1 ARG 177.A HE 2.946 2.117 ARG 177.A NH1 ASP 168.A OD2 ARG 177.A HH11 2.813 1.956 ARG 177.A NH2 GLU 188.A OE2.B ARG 177.A HH22 3.350 2.513 ASP 178.A N ALA 175.A O ASP 178.A H 3.181 2.483 ARG 179.A NH1 ASP 132.A OD1 ARG 179.A HH12 2.790 1.967 ARG 179.A NH2 ASP 132.A OD1 ARG 179.A HH22 3.354 2.704 HIS 180.A N TRP 176.A O HIS 180.A H 3.049 2.348 ASN 182.A ND2 SER 139.A O ASN 182.A HD21 2.957 2.127 ASN 182.A ND2 ALA 143.A O ASN 182.A HD22 2.887 2.031 LEU 183.A N HIS 180.A O LEU 183.A H 3.041 2.449 VAL 184.A N HIS 180.A O VAL 184.A H 3.184 2.385 ALA 185.A N PRO 181.A O ALA 185.A H 3.046 2.230 PHE 186.A N ASN 182.A O PHE 186.A H 3.037 2.200 GLN 187.A N LEU 183.A O GLN 187.A H 2.839 2.035 GLN 187.A NE2 GLY 161.A O GLN 187.A HE22 3.054 2.257 GLU 188.A N.A VAL 184.A O GLU 188.A H.A 2.949 2.119 GLU 188.A N.B VAL 184.A O GLU 188.A H.B 2.945 2.117 LYS 189.A N ALA 185.A O LYS 189.A H 3.231 2.452 LYS 189.A N PHE 186.A O LYS 189.A H 3.199 2.605 LYS 189.A NZ THR 146.A O LYS 189.A HZ1 2.882 2.003 ILE 190.A N PHE 186.A O ILE 190.A H 2.957 2.129 GLU 191.A N GLN 187.A O GLU 191.A H 3.005 2.200 LYS 192.A N LYS 189.A O LYS 192.A H 3.083 2.275 ARG 193.A N ILE 190.A O ARG 193.A H 3.004 2.159 ARG 193.A NE GLU 21.A OE2 ARG 193.A HE 2.929 2.089 ARG 193.A NH2 GLU 21.A OE1 ARG 193.A HH21 2.937 2.079 ARG 193.A NH2 GLU 21.A OE2 ARG 193.A HH21 3.541 2.890 GLN 194.A NE2 ASP 198.A OD1 GLN 194.A HE21 3.217 2.470 GLN 194.A NE2 ASP 198.A OD2 GLN 194.A HE21 3.339 2.536 SER 195.A OG GLU 21.A OE2 SER 195.A HG 2.674 2.032 PHE 196.A N ARG 193.A O PHE 196.A H 3.040 2.443 ILE 197.A N ARG 193.A O ILE 197.A H 2.986 2.139 ASP 198.A N GLN 194.A O ASP 198.A H 2.953 2.160 THR 199.A N PHE 196.A O THR 199.A H 3.046 2.220 THR 199.A OG1 SER 195.A O THR 199.A HG1 2.770 2.083 THR 199.A OG1 PHE 196.A O THR 199.A HG1 3.330 2.785