Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4myd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 3.A N THR 71.A OG1 LEU 3.A H 2.906 2.059 HIS 4.A N SER 53.A OG HIS 4.A H 2.925 2.220 HIS 4.A ND1 ASP 46.A OD2 HIS 4.A HD1 2.764 1.932 GLN 6.A N TYR 44.A O GLN 6.A H 2.888 2.083 LYS 8.A N ARG 42.A O LYS 8.A H 2.835 2.006 GLY 10.A N SER 41.A OG GLY 10.A H 2.962 2.103 LYS 11.A N ASP 39.A O.A LYS 11.A H 2.845 2.005 LYS 11.A N ASP 39.A O.B LYS 11.A H 2.752 1.911 LEU 14.A N LYS 11.A O LEU 14.A H 3.205 2.359 TRP 16.A N ASP 79.A O TRP 16.A H 3.019 2.187 LEU 17.A N SER 41.A O LEU 17.A H 2.809 1.973 VAL 18.A N TRP 81.A O VAL 18.A H 2.834 1.983 PHE 19.A N LEU 43.A O PHE 19.A H 2.896 2.053 LEU 20.A N VAL 83.A O LEU 20.A H 2.770 1.954 HIS 21.A ND1 GLY 22.A O HIS 21.A HD1 2.726 1.887 SER 24.A N HIS 50.A NE2 SER 24.A H 2.903 2.083 SER 24.A OG PHE 23.A O SER 24.A HG 2.702 1.962 GLY 25.A N GLY 22.A O GLY 25.A H 2.912 2.077 CYS 27.A N ASP 46.A OD1 CYS 27.A H 2.720 2.056 HIS 28.A N ASP 26.A OD1 HIS 28.A H 2.928 2.107 GLU 29.A N ASP 26.A O GLU 29.A H 2.988 2.131 TRP 30.A NE1 LEU 20.A O TRP 30.A HE1 3.021 2.290 GLN 31.A N HIS 28.A O GLN 31.A H 3.094 2.239 GLN 31.A NE2 GLN 6.A OE1 GLN 31.A HE22 2.889 2.072 GLN 31.A NE2 CYS 27.A O GLN 31.A HE21 3.057 2.243 GLY 34.A N TRP 30.A O GLY 34.A H 2.717 1.868 GLU 35.A N GLN 31.A O GLU 35.A H 3.056 2.226 ALA 36.A N VAL 33.A O ALA 36.A H 3.084 2.316 PHE 37.A N GLY 34.A O PHE 37.A H 2.904 2.073 TYR 40.A N PHE 37.A O TYR 40.A H.B 2.978 2.249 SER 41.A N PRO 15.A O SER 41.A H 3.360 2.598 ARG 42.A N LYS 8.A O ARG 42.A H 2.853 2.031 ARG 42.A NE GLU 35.A OE1 ARG 42.A HE 2.865 2.019 ARG 42.A NH1 GLU 35.A OE1 ARG 42.A HH11 3.316 2.626 ARG 42.A NH1 GLU 35.A OE2 ARG 42.A HH11 2.804 1.963 ARG 42.A NH2 TYR 40.A O ARG 42.A HH21 2.833 2.000 LEU 43.A N LEU 17.A O LEU 43.A H 2.894 2.067 TYR 44.A N GLN 6.A O TYR 44.A H 2.839 1.983 TYR 44.A OH GLU 35.A OE1 TYR 44.A HH 2.596 1.763 VAL 45.A N PHE 19.A O VAL 45.A H 3.238 2.378 ASP 46.A N HIS 4.A O ASP 46.A H 2.841 1.983 LEU 47.A N HIS 21.A NE2 LEU 47.A H 2.943 2.090 GLY 49.A N SER 53.A O GLY 49.A H 3.002 2.226 HIS 50.A N LEU 47.A O HIS 50.A H 2.986 2.224 HIS 50.A ND1 PRO 48.A O HIS 50.A HD1 2.880 2.032 GLY 52.A N ASP 46.A OD2 GLY 52.A H 2.876 2.070 SER 53.A N HIS 50.A O SER 53.A H 2.838 2.120 SER 53.A OG ASP 46.A O SER 53.A HG 2.750 2.044 ALA 54.A N GLY 51.A O ALA 54.A H 3.233 2.507 ILE 56.A N SER 53.A O ILE 56.A H 3.019 2.179 ASP 59.A N ASP 63.A OD2 ASP 59.A H 2.771 1.917 VAL 64.A N GLY 60.A O VAL 64.A H 3.322 2.534 THR 65.A N PHE 61.A O THR 65.A H 2.862 2.012 THR 65.A OG1 GLN 98.A OE1 THR 65.A HG1 2.739 2.016 ASP 66.A N ASP 62.A O ASP 66.A H 2.997 2.167 LEU 67.A N ASP 63.A O LEU 67.A H 2.985 2.152 LEU 68.A N VAL 64.A O LEU 68.A H 2.823 1.992 ARG 69.A N THR 65.A O ARG 69.A H 2.857 2.023 ARG 69.A NE GLY 99.A O ARG 69.A HE 3.057 2.333 ARG 69.A NH2 GLY 99.A O ARG 69.A HH21 2.767 1.966 LYS 70.A N ASP 66.A O LYS 70.A H 2.989 2.147 THR 71.A N LEU 67.A O THR 71.A H 2.933 2.131 THR 71.A OG1 LEU 67.A O THR 71.A HG1 2.731 1.930 LEU 72.A N LEU 68.A O LEU 72.A H 2.953 2.112 VAL 73.A N ARG 69.A O VAL 73.A H 3.094 2.269 SER 74.A N LYS 70.A O SER 74.A H 2.970 2.147 TYR 75.A N THR 71.A O TYR 75.A H 3.121 2.371 TYR 75.A N LEU 72.A O TYR 75.A H 3.248 2.627 ASN 76.A N VAL 73.A O ASN 76.A H 2.947 2.114 ILE 77.A N LEU 72.A O ILE 77.A H 3.002 2.142 PHE 80.A N GLY 102.A O PHE 80.A H 3.072 2.285 TRP 81.A N TRP 16.A O TRP 81.A H 2.856 2.040 LEU 82.A N GLY 105.A O LEU 82.A H 3.002 2.184 VAL 83.A N VAL 18.A O VAL 83.A H 2.830 1.993 GLY 84.A N ILE 107.A O GLY 84.A H 2.944 2.141 TYR 85.A N LEU 20.A O TYR 85.A H 3.016 2.191 SER 86.A N GLU 109.A O SER 86.A H 2.867 2.041 SER 86.A OG HIS 232.A NE2 SER 86.A HG 2.701 2.081 GLY 88.A N TYR 85.A O GLY 88.A H 2.832 2.170 ARG 90.A N SER 86.A O ARG 90.A H 2.982 2.207 ARG 90.A NH1 THR 183.A O ARG 90.A HH12 2.975 2.234 ARG 90.A NH1 GLN 188.A OE1 ARG 90.A HH11 2.870 2.019 ARG 90.A NH2 THR 183.A O ARG 90.A HH22 2.948 2.188 VAL 91.A N LEU 87.A O VAL 91.A H 2.847 2.007 ALA 92.A N GLY 88.A O ALA 92.A H 2.918 2.122 MET 93.A N GLY 89.A O MET 93.A H 2.894 2.071 MET 94.A N ARG 90.A O MET 94.A H 2.940 2.088 ALA 95.A N VAL 91.A O ALA 95.A H 2.890 2.043 ALA 96.A N ALA 92.A O ALA 96.A H 2.902 2.066 CYS 97.A N MET 93.A O CYS 97.A H 2.966 2.137 CYS 97.A SG MET 93.A O CYS 97.A HG 3.299 2.553 GLN 98.A N MET 94.A O GLN 98.A H 2.946 2.158 GLN 98.A NE2 ASP 62.A OD1 GLN 98.A HE22 2.722 2.060 GLY 99.A N ALA 95.A O GLY 99.A H 2.857 2.082 LEU 103.A N LEU 100.A O LEU 103.A H 3.174 2.339 CYS 104.A N PHE 80.A O CYS 104.A H 2.808 1.964 VAL 106.A N ALA 201.A O VAL 106.A H 2.820 2.016 ILE 107.A N LEU 82.A O ILE 107.A H 2.836 2.005 VAL 108.A N TYR 203.A O VAL 108.A H 2.929 2.103 GLU 109.A N GLY 84.A O GLU 109.A H 2.858 2.009 GLY 110.A N LEU 205.A O GLY 110.A H 3.186 2.508 GLY 114.A N HIS 112.A ND1 GLY 114.A H 2.963 2.132 GLN 116.A N GLN 120.A OE1 GLN 116.A H 3.098 2.239 GLN 116.A NE2 ASP 190.A OD2 GLN 116.A HE21 3.002 2.169 GLN 120.A N ASN 117.A OD1 GLN 120.A H 2.840 2.002 ARG 121.A N ASN 117.A O ARG 121.A H 3.233 2.414 ARG 121.A NH1 ALA 186.A O ARG 121.A HH11 3.139 2.428 ARG 121.A NH1 GLN 188.A O ARG 121.A HH12 2.753 1.976 ARG 121.A NH2 GLN 188.A O ARG 121.A HH22 2.924 2.205 ALA 122.A N ALA 118.A O ALA 122.A H 2.902 2.067 GLU 123.A N GLU 119.A O GLU 123.A H 2.989 2.155 ARG 124.A N GLN 120.A O ARG 124.A H 2.996 2.167 GLN 125.A N ARG 121.A O GLN 125.A H 2.832 2.014 ARG 126.A N ALA 122.A O ARG 126.A H 2.908 2.075 SER 127.A N GLU 123.A O SER 127.A H 2.893 2.058 ASP 128.A N ARG 124.A O ASP 128.A H 2.791 1.934 ARG 129.A N GLN 125.A O ARG 129.A H 2.950 2.131 GLN 130.A N ARG 126.A O GLN 130.A H 3.040 2.249 TRP 131.A N SER 127.A O TRP 131.A H 3.031 2.209 VAL 132.A N ASP 128.A O VAL 132.A H 2.824 1.992 GLN 133.A N ARG 129.A O GLN 133.A H 3.121 2.316 ARG 134.A N GLN 130.A O ARG 134.A H 3.138 2.339 ARG 134.A NE GLU 138.A OE1 ARG 134.A HE 3.265 2.541 ARG 134.A NE GLU 138.A OE2 ARG 134.A HE 3.124 2.432 ARG 134.A NH1 ASP 146.A OD2 ARG 134.A HH12 2.975 2.227 ARG 134.A NH2 GLU 138.A OE1 ARG 134.A HH21 2.967 2.148 ARG 134.A NH2 ASP 146.A OD2 ARG 134.A HH22 2.941 2.179 PHE 135.A N TRP 131.A O PHE 135.A H 2.838 2.009 LEU 136.A N VAL 132.A O LEU 136.A H 3.039 2.317 THR 137.A N ARG 134.A O THR 137.A H 3.101 2.259 THR 137.A OG1 GLN 133.A O THR 137.A HG1 2.758 1.965 GLU 138.A N ARG 134.A O GLU 138.A H 2.952 2.210 ALA 142.A N PRO 139.A O ALA 142.A H 2.974 2.347 VAL 143.A N PRO 139.A O VAL 143.A H 3.068 2.258 PHE 144.A N LEU 140.A O PHE 144.A H 2.822 1.967 ALA 145.A N THR 141.A O ALA 145.A H 3.153 2.380 ASP 146.A N ALA 142.A O ASP 146.A H 3.387 2.599 ASP 146.A N VAL 143.A O ASP 146.A H 3.157 2.558 TRP 147.A N VAL 143.A O TRP 147.A H 2.814 2.001 TYR 148.A N PHE 144.A O TYR 148.A H 3.012 2.188 GLN 149.A N ASP 146.A O GLN 149.A H 2.926 2.094 GLN 149.A NE2 ALA 145.A O GLN 149.A HE21 3.113 2.314 GLN 150.A N TRP 147.A O GLN 150.A H 3.212 2.359 GLN 150.A NE2 TRP 147.A O GLN 150.A HE21 3.022 2.209 PHE 153.A N GLN 150.A O PHE 153.A H 2.791 1.982 ALA 154.A N PRO 151.A O ALA 154.A H 3.051 2.194 LEU 156.A N PHE 153.A O LEU 156.A H 3.131 2.303 ASN 157.A N GLN 160.A OE1 ASN 157.A H 2.913 2.082 GLN 160.A N ASN 157.A OD1 GLN 160.A H 2.867 2.030 GLN 160.A NE2 GLU 237.A OE2 GLN 160.A HE22 3.084 2.249 ARG 161.A N ASN 157.A O ARG 161.A H 3.027 2.201 ARG 161.A NE TYR 148.A O ARG 161.A HE 2.749 1.945 ARG 161.A NH2 PHE 153.A O ARG 161.A HH21 2.966 2.223 ARG 161.A NH2 ALA 154.A O ARG 161.A HH22 3.140 2.561 ARG 162.A N ASP 158.A O ARG 162.A H 2.931 2.098 ARG 162.A NH2 ASP 159.A OD1 no hydrogen 2.471 N/A GLU 163.A N ASP 159.A O GLU 163.A H 3.092 2.261 LEU 164.A N GLN 160.A O LEU 164.A H 2.961 2.135 VAL 165.A N ARG 161.A O VAL 165.A H 2.840 1.994 ALA 166.A N ARG 162.A O ALA 166.A H 3.130 2.290 LEU 167.A N GLU 163.A O LEU 167.A H 3.043 2.226 ARG 168.A N LEU 164.A O ARG 168.A H 2.845 1.988 ARG 168.A NE TYR 148.A OH ARG 168.A HE 2.909 2.109 ARG 168.A NH1 GLU 29.A OE1 ARG 168.A HH12 2.981 2.244 ARG 168.A NH2 GLU 29.A OE1 ARG 168.A HH22 2.925 2.172 SER 169.A N.A VAL 165.A O SER 169.A H.A 3.044 2.303 SER 169.A N.B VAL 165.A O SER 169.A H.B 3.029 2.309 SER 169.A OG.A VAL 165.A O SER 169.A HG.A 2.756 2.060 SER 169.A OG.B ALA 166.A O SER 169.A HG.B 2.836 2.021 ASN 170.A N LEU 167.A O ASN 170.A H.A 3.236 2.396 ASN 171.A ND2 SER 24.A O ASN 171.A HD21 2.862 2.016 ASN 171.A ND2 ARG 168.A O ASN 171.A HD22 2.816 1.999 THR 175.A N ASN 172.A OD1 THR 175.A H 3.139 2.366 THR 175.A OG1 GLY 49.A O THR 175.A HG1 2.858 2.194 LEU 176.A N ASN 172.A O LEU 176.A H 2.922 2.070 ALA 177.A N GLY 173.A O ALA 177.A H 2.955 2.132 ALA 178.A N ALA 174.A O ALA 178.A H 3.020 2.219 MET 179.A N THR 175.A O MET 179.A H 3.013 2.178 LEU 180.A N LEU 176.A O LEU 180.A H 2.828 2.004 GLU 181.A N ALA 177.A O GLU 181.A H 3.209 2.363 ALA 182.A N ALA 178.A O ALA 182.A H 3.037 2.218 THR 183.A N MET 179.A O THR 183.A H 3.025 2.223 THR 183.A OG1 MET 179.A O THR 183.A HG1 2.938 2.199 SER 184.A N GLU 181.A O SER 184.A H 3.345 2.491 SER 184.A OG ASP 128.A OD2 SER 184.A HG 2.622 1.833 ALA 186.A N SER 184.A OG ALA 186.A H 3.050 2.240 VAL 187.A N SER 184.A O VAL 187.A H 2.963 2.129 GLN 188.A N LEU 185.A O GLN 188.A H 3.166 2.322 GLN 188.A NE2 HIS 112.A O GLN 188.A HE22 3.043 2.196 GLN 188.A NE2 PRO 189.A O GLN 188.A HE21 3.616 2.855 LEU 191.A N PRO 113.A O LEU 191.A H 2.886 2.026 ARG 192.A N ASP 190.A OD1 ARG 192.A H 3.034 2.176 ARG 192.A NE GLU 219.A OE1 ARG 192.A HE 2.826 2.070 ARG 192.A NH1 GLY 114.A O ARG 192.A HH12 2.750 1.903 ARG 192.A NH1 ASP 190.A OD1 ARG 192.A HH11 2.839 2.042 ARG 192.A NH2 GLY 114.A O ARG 192.A HH22 3.342 2.689 ARG 192.A NH2 GLU 219.A OE1 ARG 192.A HH21 2.866 2.129 LEU 195.A N LEU 191.A O LEU 195.A H 2.812 1.956 SER 196.A N ARG 192.A O SER 196.A H 3.003 2.204 SER 196.A OG ARG 192.A O SER 196.A HG 3.011 2.211 ALA 197.A N ALA 193.A O ALA 197.A H 3.286 2.604 ALA 197.A N ASN 194.A O ALA 197.A H 3.067 2.366 ARG 198.A N LEU 195.A O ARG 198.A H 3.324 2.508 ARG 198.A NH1 LEU 195.A O ARG 198.A HH11 2.993 2.180 ARG 198.A NH1 ALA 221.A O ARG 198.A HH12 2.697 2.004 ARG 198.A NH2 ALA 221.A O ARG 198.A HH22 2.655 1.948 ALA 201.A N CYS 104.A O ALA 201.A H 3.430 2.602 TYR 203.A N VAL 106.A O TYR 203.A H 2.947 2.129 TYR 204.A N ASP 223.A O TYR 204.A H 2.950 2.100 TYR 204.A OH GLY 111.A O TYR 204.A HH 2.715 1.899 LEU 205.A N VAL 108.A O LEU 205.A H 2.750 1.912 CYS 206.A N HIS 225.A O CYS 206.A H 3.013 2.219 CYS 206.A SG GLY 207.A O CYS 206.A HG 3.625 2.455 GLU 208.A N ILE 227.A O GLU 208.A H 2.883 2.058 ARG 209.A N ALA 230.A O ARG 209.A H 2.839 1.989 ASP 210.A N GLY 207.A O ASP 210.A H 3.026 2.179 PHE 213.A N ASP 210.A OD1 PHE 213.A H 3.321 2.494 ARG 214.A N ASP 210.A O ARG 214.A H 3.011 2.208 ARG 214.A NH1 GLU 208.A O ARG 214.A HH11 3.016 2.198 ALA 215.A N SER 211.A O ALA 215.A H 3.233 2.411 LEU 216.A N LYS 212.A O LEU 216.A H 3.177 2.368 ALA 217.A N PHE 213.A O ALA 217.A H 2.941 2.106 ALA 218.A N ALA 215.A O ALA 218.A H 3.222 2.591 GLU 219.A N LEU 216.A O GLU 219.A H 2.929 2.199 LEU 220.A N ALA 217.A O LEU 220.A H 3.070 2.236 HIS 225.A N TYR 204.A O HIS 225.A H 2.772 1.935 ILE 227.A N CYS 206.A O ILE 227.A H 2.837 2.003 ARG 229.A N GLU 208.A OE1 ARG 229.A H 2.906 2.059 GLY 231.A N GLU 237.A OE1 GLY 231.A H 2.867 2.024 HIS 232.A ND1 ASP 210.A OD2 HIS 232.A HD1 2.648 1.826 ASN 233.A ND2 GLU 29.A OE2 ASN 233.A HD21 3.066 2.207 HIS 235.A N GLU 109.A OE2 HIS 235.A H 2.776 2.054 HIS 235.A ND1 GLU 109.A OE1 HIS 235.A HD1 2.520 1.675 HIS 235.A NE2 GLU 29.A OE2 HIS 235.A HE2 2.651 1.887 ARG 236.A N ASN 233.A OD1 ARG 236.A H 2.973 2.194 GLU 237.A N ASN 233.A O GLU 237.A H 3.316 2.547 ASN 238.A N ALA 234.A O ASN 238.A H 2.758 1.926 ASN 238.A ND2 PRO 228.A O ASN 238.A HD22 2.921 2.098 GLY 241.A N ASN 238.A OD1 GLY 241.A H 2.923 2.117 VAL 242.A N ASN 238.A O VAL 242.A H 3.090 2.266 ILE 243.A N PRO 239.A O ILE 243.A H 2.816 1.975 ALA 244.A N ALA 240.A O ALA 244.A H 3.026 2.216 SER 245.A N GLY 241.A O SER 245.A H 3.064 2.241 LEU 246.A N VAL 242.A O LEU 246.A H 2.858 2.010 ALA 247.A N ILE 243.A O ALA 247.A H 2.884 2.089 GLN 248.A N ALA 244.A O GLN 248.A H 3.025 2.219 ILE 249.A N SER 245.A O ILE 249.A H 3.066 2.250 LEU 250.A N LEU 246.A O LEU 250.A H 2.842 2.023 ARG 251.A N ALA 247.A O ARG 251.A H 3.020 2.218 ARG 251.A NH1 ASP 39.A OD1.A ARG 251.A HH12 3.098 2.262 ARG 251.A NH2 ASP 39.A OD2.A ARG 251.A HH22 3.005 2.150