Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4nap_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 2.A N LYS 33.A O VAL 2.A H 2.941 2.145 LEU 4.A N ASP 35.A O LEU 4.A H 2.998 2.184 ASN 5.A N ASP 58.A OD2 ASN 5.A H 3.029 2.180 TYR 6.A N LEU 37.A O TYR 6.A H 2.919 2.086 ALA 7.A N ILE 59.A O ALA 7.A H 2.678 1.868 ASN 8.A N TYR 39.A O ASN 8.A H 3.026 2.210 ASN 8.A ND2 PRO 16.A O ASN 8.A HD22 2.971 2.433 PHE 9.A N ASN 8.A OD1 PHE 9.A H 3.075 2.406 SER 13.A OG ASP 177.A O SER 13.A HG 3.175 2.692 THR 14.A N PRO 11.A O THR 14.A H 2.953 2.119 THR 14.A OG1 PRO 11.A O THR 14.A HG1 2.666 1.848 CYS 17.A N THR 14.A O CYS 17.A H 2.915 2.198 CYS 17.A SG PRO 10.A O CYS 17.A HG 3.107 2.388 ILE 18.A N THR 14.A O ILE 18.A H 3.011 2.177 GLN 19.A N PHE 15.A O GLN 19.A H 2.890 2.062 GLN 19.A NE2 TYR 6.A OH GLN 19.A HE22 3.150 2.341 GLN 19.A NE2 PRO 16.A O GLN 19.A HE21 2.951 2.267 GLU 20.A N CYS 17.A O GLU 20.A H 3.112 2.277 GLN 21.A N ILE 18.A O GLN 21.A H 3.188 2.361 TRP 22.A N GLN 19.A O TRP 22.A H 2.935 2.145 HIS 24.A N GLU 20.A O HIS 24.A H 2.915 2.101 GLU 25.A N GLN 21.A O GLU 25.A H 3.125 2.307 VAL 26.A N TRP 22.A O VAL 26.A H 2.869 2.023 ARG 27.A N ALA 23.A O ARG 27.A H 2.911 2.074 ARG 27.A NE ASP 35.A OD1 ARG 27.A HE 2.879 2.050 ARG 27.A NH2 VAL 36.A O ARG 27.A HH21 2.987 2.205 THR 28.A N HIS 24.A O THR 28.A H 3.105 2.330 THR 28.A OG1 HIS 24.A O THR 28.A HG1 2.849 2.042 ARG 29.A N GLU 25.A O ARG 29.A H 2.952 2.095 ARG 29.A NE GLU 25.A OE1 ARG 29.A HE 3.141 2.373 ARG 29.A NH1 GLU 220.A OE1 ARG 29.A HH12 3.424 2.680 ARG 29.A NH2 GLU 25.A OE1 ARG 29.A HH21 3.480 2.807 ARG 29.A NH2 GLU 220.A OE1 ARG 29.A HH22 3.209 2.396 ARG 29.A NH2 GLU 220.A OE2 ARG 29.A HH22 2.486 1.789 THR 30.A N VAL 26.A O THR 30.A H 2.994 2.180 THR 30.A OG1 VAL 26.A O THR 30.A HG1 2.827 2.046 ARG 31.A N THR 28.A O ARG 31.A H 3.059 2.244 GLY 32.A N ARG 27.A O GLY 32.A H 3.021 2.211 LYS 33.A N THR 30.A O LYS 33.A H 2.966 2.114 VAL 34.A N THR 30.A OG1 VAL 34.A H 3.136 2.347 ASP 35.A N VAL 2.A O ASP 35.A H 2.726 1.880 VAL 36.A N ASP 35.A OD1 VAL 36.A H 2.721 2.039 LEU 37.A N LEU 4.A O LEU 37.A H 2.911 2.111 THR 38.A OG1 GLU 20.A OE2 THR 38.A HG1 2.741 1.935 TYR 39.A N TYR 6.A O TYR 39.A H 2.873 2.090 GLY 41.A N PRO 10.A O GLY 41.A H 3.099 2.388 GLY 42.A N ASN 8.A O GLY 42.A H 2.996 2.200 THR 43.A OG1 PRO 40.A O THR 43.A HG1 3.200 2.463 GLY 46.A N ASN 49.A OD1 GLY 46.A H 2.926 2.286 ARG 48.A NH2 GLU 156.A OE2 ARG 48.A HH21 2.826 2.026 GLY 52.A N ASN 49.A O GLY 52.A H 2.874 2.190 SER 54.A OG GLY 52.A O SER 54.A HG 3.352 2.773 GLY 55.A N GLY 52.A O GLY 55.A H 3.139 2.474 ALA 57.A N GLY 52.A O ALA 57.A H 3.297 2.499 ASP 58.A N ASN 5.A O ASP 58.A H 3.074 2.446 ILE 59.A N ASN 5.A O ILE 59.A H 2.895 2.122 GLY 60.A N ILE 198.A O GLY 60.A H 2.818 2.019 ILE 62.A N ALA 196.A O ILE 62.A H 2.922 2.090 LEU 64.A N PRO 194.A O LEU 64.A H 2.985 2.191 TYR 66.A N SER 63.A O TYR 66.A H 3.086 2.237 HIS 67.A N LEU 64.A O HIS 67.A H 3.012 2.159 VAL 70.A N HIS 67.A O VAL 70.A H 3.199 2.370 VAL 73.A N GLU 103.A OE2 VAL 73.A H 2.798 1.942 SER 74.A N PHE 71.A O SER 74.A H 3.065 2.314 VAL 75.A N VAL 73.A O VAL 75.A H 3.202 2.350 GLU 77.A N SER 74.A O GLU 77.A H 2.910 2.060 LEU 78.A N VAL 75.A O LEU 78.A H 3.094 2.258 ALA 85.A N ASP 230.A OD1 ALA 85.A H 2.855 1.998 GLU 86.A N ASP 230.A OD2 GLU 86.A H 3.078 2.287 ALA 87.A N SER 84.A OG ALA 87.A H 3.028 2.170 ALA 88.A N SER 84.A O ALA 88.A H 3.243 2.400 SER 89.A N ALA 85.A O SER 89.A H 2.837 2.027 SER 90.A N GLU 86.A O SER 90.A H 3.004 2.187 VAL 91.A N ALA 87.A O VAL 91.A H 3.012 2.176 LEU 92.A N ALA 88.A O LEU 92.A H 2.902 2.053 TRP 93.A N SER 89.A O TRP 93.A H 3.114 2.272 GLU 94.A N SER 90.A O GLU 94.A H 3.110 2.285 LEU 95.A N VAL 91.A O LEU 95.A H 2.822 1.976 TYR 96.A N LEU 92.A O TYR 96.A H 2.957 2.104 SER 97.A N TRP 93.A O SER 97.A H 2.839 1.993 GLY 98.A N GLU 94.A O GLY 98.A H 3.096 2.335 LEU 99.A N LEU 95.A O LEU 99.A H 3.111 2.411 LEU 99.A N TYR 96.A O LEU 99.A H 3.272 2.577 ARG 100.A N TYR 96.A O ARG 100.A H 2.863 2.014 LEU 104.A N PRO 101.A O LEU 104.A H 3.234 2.380 GLU 105.A N ALA 102.A O GLU 105.A H 3.157 2.305 VAL 107.A N LEU 104.A O VAL 107.A H 3.363 2.545 LYS 108.A NZ ASP 215.A OD1 LYS 108.A HZ1 2.865 1.985 LEU 110.A N VAL 197.A O LEU 110.A H 2.830 1.990 THR 111.A OG1 ALA 218.A O THR 111.A HG1 2.793 2.161 PHE 112.A N PHE 195.A O PHE 112.A H 3.107 2.321 THR 113.A OG1 SER 114.A O THR 113.A HG1 2.910 2.154 SER 114.A N TYR 193.A O SER 114.A H 2.908 2.140 SER 117.A N GLN 190.A O SER 117.A H 3.373 2.570 HIS 118.A N THR 171.A O HIS 118.A H 2.844 2.004 PHE 119.A N THR 186.A O PHE 119.A H 2.950 2.114 THR 120.A N HIS 184.A O THR 120.A H 2.924 2.116 VAL 121.A N LYS 167.A O VAL 121.A H 2.888 2.082 ARG 125.A N ASP 129.A OD2 ARG 125.A H 2.900 2.049 LEU 127.A N ASP 254.A OD2 LEU 127.A H 2.895 2.096 ASP 129.A N SER 126.A O ASP 129.A H 3.281 2.628 LEU 130.A N LEU 127.A O LEU 130.A H 3.104 2.368 GLN 131.A N ARG 128.A O GLN 131.A H 3.189 2.348 GLN 131.A NE2 LEU 127.A O GLN 131.A HE21 2.980 2.139 GLN 131.A NE2 LEU 147.A O GLN 131.A HE22 2.687 1.895 GLY 132.A N GLY 148.A O GLY 132.A H 2.914 2.056 GLU 133.A N GLU 133.A OE1 GLU 133.A H 3.005 2.379 ILE 134.A N THR 150.A O ILE 134.A H 3.014 2.228 ARG 135.A N GLY 168.A O ARG 135.A H 2.897 2.050 GLY 136.A N VAL 152.A O GLY 136.A H 3.129 2.376 THR 139.A N GLU 77.A OE1 THR 139.A H 3.200 2.354 LEU 140.A N ALA 137.A O LEU 140.A H 3.191 2.550 SER 141.A OG SER 153.A OG SER 141.A HG 2.747 1.928 ALA 142.A N GLY 138.A O ALA 142.A H 3.231 2.488 ILE 143.A N THR 139.A O ILE 143.A H 2.863 2.045 LEU 144.A N LEU 140.A O LEU 144.A H 3.051 2.269 GLU 145.A N SER 141.A O GLU 145.A H 2.960 2.144 LYS 146.A N ALA 142.A O LYS 146.A H 3.063 2.264 LEU 147.A N ILE 143.A O LEU 147.A H 3.130 2.353 GLY 148.A N GLU 145.A O GLY 148.A H 2.938 2.114 ALA 149.A N LEU 144.A O ALA 149.A H 3.060 2.419 THR 150.A OG1 GLY 132.A O THR 150.A HG1 3.275 2.817 VAL 152.A N ILE 134.A O VAL 152.A H 2.984 2.147 GLU 156.A N PRO 154.A O GLU 156.A H 3.119 2.275 ALA 160.A N GLU 156.A O ALA 160.A H 3.260 2.429 VAL 161.A N VAL 157.A O VAL 161.A H 2.705 1.900 GLN 162.A N PRO 158.A O GLN 162.A H 2.717 1.868 LYS 163.A N GLU 159.A O LYS 163.A H 2.948 2.259 GLY 164.A N VAL 161.A O GLY 164.A H 2.969 2.119 ILE 165.A N ALA 160.A O ILE 165.A H 3.147 2.530 LYS 167.A N GLU 133.A O LYS 167.A H 2.878 2.020 PHE 170.A N ARG 135.A O PHE 170.A H 3.028 2.307 THR 171.A N HIS 118.A O THR 171.A H 3.114 2.412 LYS 176.A N ASP 174.A O LYS 176.A H 3.309 2.616 LYS 176.A N SER 236.A OG LYS 176.A H 3.223 2.565 ASP 177.A N ASP 174.A O ASP 177.A H 2.999 2.147 ASN 178.A N LYS 176.A O ASN 178.A H 2.882 2.054 PHE 179.A N VAL 175.A O PHE 179.A H 3.361 2.504 GLU 181.A N ASN 178.A O GLU 181.A H 3.395 2.566 THR 182.A N PHE 179.A O THR 182.A H 2.767 1.908 THR 182.A OG1 PHE 179.A O THR 182.A HG1 2.999 2.361 HIS 184.A N THR 120.A O HIS 184.A H 3.267 2.566 VAL 185.A N GLN 246.A O VAL 185.A H 2.906 2.071 THR 186.A N PHE 119.A O THR 186.A H 2.875 2.078 THR 186.A OG1 VAL 124.A O THR 186.A HG1 2.561 1.937 ARG 187.A N HIS 248.A O ARG 187.A H 3.166 2.340 GLN 190.A N SER 117.A O GLN 190.A H 3.083 2.223 ALA 191.A N GLN 190.A OE1 ALA 191.A H 2.960 2.194 TYR 193.A N SER 114.A OG TYR 193.A H 2.859 2.000 PHE 195.A N PHE 112.A O PHE 195.A H 2.738 1.981 ALA 196.A N ILE 62.A O ALA 196.A H 2.949 2.143 VAL 197.A N THR 111.A O VAL 197.A H 2.930 2.083 ILE 198.A N GLY 60.A O ILE 198.A H 2.800 1.962 ASN 199.A N ASP 58.A O ASN 199.A H 2.871 2.048 ASN 199.A ND2 VAL 53.A O ASN 199.A HD21 2.928 2.101 ASN 199.A ND2 GLU 201.A OE1 ASN 199.A HD22 2.883 2.151 ARG 200.A NE GLU 204.A OE2 ARG 200.A HE 2.952 2.112 ARG 200.A NH1 VAL 107.A O ARG 200.A HH11 3.266 2.657 ARG 200.A NH2 GLU 204.A OE2 ARG 200.A HH21 3.494 2.821 ALA 202.A N ASN 199.A OD1 ALA 202.A H 2.878 2.032 TRP 203.A N ASN 199.A O TRP 203.A H 2.968 2.157 GLU 204.A N ARG 200.A O GLU 204.A H 2.938 2.141 ARG 205.A N GLU 201.A O ARG 205.A H 2.943 2.214 LEU 206.A N TRP 203.A O LEU 206.A H 3.229 2.416 VAL 210.A N SER 207.A OG VAL 210.A H 3.336 2.486 GLN 211.A N SER 207.A O GLN 211.A H 3.085 2.268 GLN 211.A NE2 TRP 203.A O GLN 211.A HE21 3.021 2.186 GLN 212.A N PRO 208.A O GLN 212.A H 3.022 2.275 VAL 213.A N ASP 209.A O VAL 213.A H 3.198 2.423 LEU 214.A N VAL 210.A O LEU 214.A H 3.044 2.248 ASP 215.A N GLN 211.A O ASP 215.A H 2.960 2.103 GLY 216.A N GLN 212.A O GLY 216.A H 2.817 2.156 LEU 217.A N LEU 214.A O LEU 217.A H 3.110 2.312 ALA 218.A N ASP 215.A O ALA 218.A H 3.393 2.594 HIS 221.A N LEU 217.A O HIS 221.A H 2.833 1.986 HIS 221.A NE2 GLN 19.A OE1 HIS 221.A HE2 2.653 1.810 ALA 222.A N ALA 218.A O ALA 222.A H 3.158 2.342 ALA 223.A N ALA 219.A O ALA 223.A H 3.165 2.316 TRP 224.A N GLU 220.A O TRP 224.A H 2.999 2.194 THR 225.A N HIS 221.A O THR 225.A H 2.945 2.105 THR 225.A OG1 HIS 221.A O THR 225.A HG1 3.017 2.275 GLY 226.A N ALA 222.A O GLY 226.A H 3.286 2.435 ARG 227.A N ALA 223.A O ARG 227.A H 2.980 2.149 ARG 227.A NE GLU 86.A OE2 ARG 227.A HE 3.087 2.322 ARG 227.A NH2 GLU 86.A OE2 ARG 227.A HH21 3.025 2.253 TYR 228.A N TRP 224.A O TYR 228.A H 2.906 2.064 LEU 229.A N THR 225.A O LEU 229.A H 2.916 2.163 ASP 230.A N GLY 226.A O ASP 230.A H 2.922 2.116 ALA 231.A N ARG 227.A O ALA 231.A H 3.296 2.460 HIS 232.A N TYR 228.A O HIS 232.A H 3.065 2.284 HIS 232.A NE2 ASP 177.A OD1 HIS 232.A HE2 2.714 1.916 VAL 233.A N LEU 229.A O VAL 233.A H 2.971 2.181 ASP 235.A N ALA 231.A O ASP 235.A H 3.150 2.344 SER 236.A N HIS 232.A O SER 236.A H 2.729 1.886 SER 236.A OG LEU 173.A O SER 236.A HG 2.902 2.294 SER 236.A OG ASP 174.A O SER 236.A HG 3.567 2.903 ARG 237.A N GLN 234.A O ARG 237.A H 3.120 2.268 ARG 237.A NH2 ASP 235.A OD1 ARG 237.A HH21 2.955 2.208 TRP 238.A N ASP 235.A O TRP 238.A H 3.021 2.200 ALA 239.A N SER 236.A O ALA 239.A H 2.995 2.247 GLU 241.A N ARG 237.A O GLU 241.A H 3.210 2.376 HIS 243.A N ALA 239.A O HIS 243.A H 3.057 2.461 GLY 244.A N GLU 240.A O GLY 244.A H 3.192 2.607 GLN 246.A N GLY 183.A O GLN 246.A H 2.953 2.135 HIS 248.A N VAL 185.A O HIS 248.A H 2.721 1.919 ASP 254.A N PRO 251.A O ASP 254.A H 3.106 2.407 ILE 255.A N PRO 251.A O ILE 255.A H 3.218 2.374 ALA 256.A N GLU 252.A O ALA 256.A H 3.062 2.220 ALA 257.A N GLU 253.A O ALA 257.A H 3.089 2.267 ARG 258.A N ILE 255.A O ARG 258.A H 3.183 2.398 ARG 259.A N ALA 256.A O ARG 259.A H 3.210 2.381 SER 260.A N ALA 257.A O SER 260.A H 2.973 2.135 GLN 262.A N ARG 259.A O GLN 262.A H 3.256 2.495 LEU 264.A N VAL 261.A O LEU 264.A H 2.982 2.165 PHE 265.A N GLN 262.A O PHE 265.A H 3.170 2.362 ALA 267.A N PRO 263.A O ALA 267.A H 3.104 2.301 TRP 268.A N LEU 264.A O TRP 268.A H 2.877 2.035 TRP 268.A NE1 PRO 72.A O TRP 268.A HE1 2.858 2.202 ALA 269.A N PHE 265.A O ALA 269.A H 2.948 2.142 GLN 270.A N ASP 266.A O GLN 270.A H 3.063 2.224 ARG 271.A N ALA 267.A O ARG 271.A H 3.148 2.297 ALA 272.A N TRP 268.A O ALA 272.A H 3.009 2.231 ALA 273.A N ALA 269.A O ALA 273.A H 2.824 2.024 ASP 274.A N GLN 270.A O ASP 274.A H 3.025 2.232 LYS 275.A N ALA 272.A O LYS 275.A H 3.065 2.369 GLY 276.A N ALA 273.A O GLY 276.A H 3.096 2.257 ALA 277.A N ALA 272.A O ALA 277.A H 3.116 2.319 ASP 280.A N ASP 278.A OD1 ASP 280.A H 3.138 2.536 VAL 282.A N ASP 278.A O VAL 282.A H 3.150 2.306 ARG 283.A N ASP 280.A O ARG 283.A H 2.793 1.954 THR 284.A N ALA 281.A O THR 284.A H 2.768 1.935 THR 284.A OG1 ALA 281.A O THR 284.A HG1 2.840 2.100 VAL 285.A N VAL 282.A O VAL 285.A H 2.882 2.036 ALA 287.A N ARG 283.A O ALA 287.A H 3.056 2.244 LEU 288.A N THR 284.A O LEU 288.A H 2.937 2.085 LYS 289.A N VAL 285.A O LYS 289.A H 2.928 2.072 LYS 289.A NZ LEU 80.A O LYS 289.A HZ3 3.043 2.329 ALA 290.A N ASP 286.A O ALA 290.A H 3.023 2.203 GLN 291.A N LYS 289.A O GLN 291.A H 2.769 2.162 TYR 292.A N LYS 289.A O TYR 292.A H 3.395 2.551