Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4nkc_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 3.A N MET 11.A O ILE 3.A H 2.856 2.042 LEU 5.A N ALA 9.A O LEU 5.A H 2.813 1.953 ASN 6.A ND2 PRO 178.A O.A ASN 6.A HD21 3.261 2.432 ASN 6.A ND2 PRO 178.A O.B ASN 6.A HD21 3.034 2.192 ASN 7.A ND2 LYS 153.A O ASN 7.A HD22 2.973 2.173 GLY 8.A N LEU 5.A O GLY 8.A H 3.000 2.166 ALA 9.A N ASN 7.A OD1 ALA 9.A H 2.912 2.060 MET 11.A N ILE 3.A O MET 11.A H 2.857 2.022 ILE 13.A N SER 1.A O ILE 13.A H 2.944 2.106 GLY 15.A N VAL 258.A O GLY 15.A H 2.947 2.123 LEU 16.A N HIS 40.A O LEU 16.A H 2.919 2.119 GLY 17.A N PRO 260.A O GLY 17.A H 2.990 2.135 THR 18.A OG1 ASP 42.A O THR 18.A HG1 2.704 1.938 LYS 20.A NZ TRP 19.A O LYS 20.A HZ1 2.853 1.978 LYS 20.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 20.A HZ2 2.949 2.084 SER 21.A N THR 18.A O SER 21.A H 3.206 2.364 GLN 25.A N PRO 22.A O GLN 25.A H 2.897 2.052 VAL 26.A N PRO 22.A O VAL 26.A H 2.882 2.221 THR 27.A OG1 GLU 52.A O THR 27.A HG1 2.786 1.967 ALA 29.A N GLN 25.A O ALA 29.A H 3.059 2.258 VAL 30.A N VAL 26.A O VAL 30.A H 2.959 2.132 LYS 31.A N THR 27.A O LYS 31.A H 3.026 2.186 VAL 32.A N GLU 28.A O VAL 32.A H 2.890 2.034 ALA 33.A N ALA 29.A O ALA 33.A H 2.875 2.050 ILE 34.A N VAL 30.A O ILE 34.A H 2.956 2.112 ASP 35.A N LYS 31.A O ASP 35.A H 2.956 2.122 VAL 36.A N VAL 32.A O VAL 36.A H 2.939 2.215 VAL 36.A N ALA 33.A O VAL 36.A H 3.179 2.522 GLY 37.A N ILE 34.A O GLY 37.A H 3.233 2.429 TYR 38.A N ALA 33.A O TYR 38.A H 2.879 2.089 TYR 38.A OH ILE 268.A O TYR 38.A HH 2.761 1.924 ARG 39.A NH1 ILE 34.A O ARG 39.A HH12 2.990 2.174 ARG 39.A NH1 TYR 38.A O ARG 39.A HH11 2.801 2.004 HIS 40.A ND1 PRO 12.A O no hydrogen 3.052 N/A ILE 41.A N PHE 72.A O ILE 41.A H 3.190 2.440 ASP 42.A N LEU 16.A O ASP 42.A H 2.867 2.011 CYS 43.A N VAL 74.A O CYS 43.A H 2.866 2.122 TYR 47.A N ALA 44.A O TYR 47.A H 3.057 2.245 GLN 48.A N HIS 45.A O GLN 48.A H 3.060 2.233 ASN 49.A ND2 THR 18.A O ASN 49.A HD21 2.943 2.130 ASN 49.A ND2 SER 21.A O ASN 49.A HD22 3.043 2.217 GLU 52.A N GLU 52.A OE1 GLU 52.A H 2.808 2.069 VAL 53.A N ASN 49.A O VAL 53.A H 3.017 2.175 GLY 54.A N GLU 50.A O GLY 54.A H 2.871 2.044 VAL 55.A N ASN 51.A O VAL 55.A H 2.974 2.234 ILE 57.A N VAL 53.A O ILE 57.A H 3.064 2.229 GLN 58.A N GLY 54.A O GLN 58.A H 2.862 2.016 GLU 59.A N VAL 55.A O GLU 59.A H 3.001 2.176 LYS 60.A N ALA 56.A O LYS 60.A H 3.093 2.266 LYS 60.A NZ ASP 35.A OD1 LYS 60.A HZ2 2.799 1.978 LEU 61.A N ILE 57.A O LEU 61.A H 2.919 2.098 ARG 62.A N GLN 58.A O ARG 62.A H 2.806 1.958 GLU 63.A N GLU 59.A O GLU 63.A H 2.871 2.054 GLN 64.A N LEU 61.A O GLN 64.A H 3.000 2.196 VAL 65.A N LYS 60.A O VAL 65.A H 2.981 2.228 LYS 67.A N GLU 70.A OE1 LYS 67.A H 2.911 2.052 ARG 68.A NH1 ARG 68.A O ARG 68.A HH11 2.937 2.178 ARG 68.A NH1 LEU 71.A O ARG 68.A HH12 3.176 2.595 ARG 68.A NH1 ASP 104.A OD2 ARG 68.A HH12 2.926 2.170 ARG 68.A NH2 TYR 102.A O ARG 68.A HH21 2.867 2.048 ARG 68.A NH2 ASP 104.A OD2 ARG 68.A HH22 2.888 2.114 GLU 70.A N LYS 67.A O GLU 70.A H 2.929 2.155 LEU 71.A N ARG 68.A O LEU 71.A H 3.037 2.239 PHE 72.A N ARG 39.A O PHE 72.A H 2.697 1.932 ILE 73.A N ASP 104.A OD2 ILE 73.A H 2.880 2.046 VAL 74.A N ILE 41.A O VAL 74.A H 3.072 2.227 SER 75.A N LEU 105.A O SER 75.A H 3.119 2.345 LYS 76.A NZ ASP 42.A OD1 LYS 76.A HZ3 3.344 2.734 LYS 76.A NZ ASP 42.A OD2 LYS 76.A HZ3 2.678 1.796 LYS 76.A NZ CYS 43.A O LYS 76.A HZ1 2.905 2.022 LYS 76.A NZ TYR 47.A OH LYS 76.A HZ2 3.052 2.241 LEU 77.A N LEU 107.A O LEU 77.A H 2.780 1.959 TRP 78.A NE1 PHE 120.A O TRP 78.A HE1 2.859 2.025 TYR 81.A N TRP 78.A O TYR 81.A H 3.008 2.191 LEU 86.A N GLU 83.A O LEU 86.A H 2.902 2.055 VAL 87.A N LYS 84.A O VAL 87.A H 3.459 2.622 LYS 88.A NZ GLU 149.A OE2 LYS 88.A HZ1 3.396 2.583 ALA 90.A N LEU 86.A O ALA 90.A H 3.112 2.287 CYS 91.A N VAL 87.A O CYS 91.A H 3.011 2.182 GLN 92.A N LYS 88.A O GLN 92.A H 2.832 1.998 LYS 93.A N GLY 89.A O LYS 93.A H 2.911 2.108 LYS 93.A NZ ASP 97.A OD1 LYS 93.A HZ2 2.925 2.060 THR 94.A N ALA 90.A O THR 94.A H 3.165 2.325 THR 94.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 94.A HG1 2.713 1.880 LEU 95.A N CYS 91.A O LEU 95.A H 2.883 2.056 SER 96.A N GLN 92.A O SER 96.A H 2.869 2.056 SER 96.A OG.B GLN 92.A O SER 96.A HG.B 3.065 2.327 ASP 97.A N LYS 93.A O ASP 97.A H 2.909 2.065 LEU 98.A N THR 94.A O LEU 98.A H 2.850 2.009 LYS 99.A N SER 96.A O LYS 99.A H 3.229 2.477 LYS 99.A NZ ASN 51.A O LYS 99.A HZ2 3.003 2.136 LYS 99.A NZ ASP 97.A O LYS 99.A HZ1 2.757 2.133 LEU 100.A N LEU 95.A O LEU 100.A H 3.023 2.183 LEU 103.A N LEU 151.A O LEU 103.A H 2.942 2.148 ASP 104.A N ILE 73.A O ASP 104.A H 2.937 2.264 LEU 105.A N ILE 73.A O LEU 105.A H 3.352 2.603 TYR 106.A N ALA 154.A O TYR 106.A H 3.014 2.251 LEU 107.A N SER 75.A O LEU 107.A H 2.959 2.150 ILE 108.A N GLY 156.A O ILE 108.A H 2.920 2.130 HIS 109.A N LEU 77.A O HIS 109.A H 3.133 2.301 PHE 114.A N CYS 79.A O PHE 114.A H 2.848 1.996 LYS 115.A N VAL 130.A O LYS 115.A H 2.895 2.072 ASP 124.A N ASN 128.A O ASP 124.A H 2.889 2.070 SER 126.A N ASP 124.A OD1 SER 126.A H 3.010 2.292 GLY 127.A N ASP 124.A O GLY 127.A H 3.005 2.157 ASN 128.A N ASP 124.A OD1 ASN 128.A H 3.042 2.264 ASN 128.A ND2 ASP 124.A OD1 ASN 128.A HD22 3.518 2.908 ASN 128.A ND2 ASP 124.A OD2 ASN 128.A HD22 3.376 2.566 VAL 129.A N SER 301.A O VAL 129.A H 3.076 2.219 VAL 130.A N PRO 122.A O VAL 130.A H 2.877 2.085 SER 132.A N.A GLY 113.A O SER 132.A H.A 2.924 2.095 SER 132.A N.B GLY 113.A O SER 132.A H.B 2.956 2.151 THR 134.A N SER 132.A OG.A THR 134.A H 3.080 2.222 LEU 137.A N ASN 135.A OD1 LEU 137.A H 2.834 1.987 ASP 138.A N ASN 135.A O ASP 138.A H 2.855 2.217 THR 139.A N ASN 135.A O THR 139.A H 3.139 2.336 THR 139.A OG1 HIS 82.A O THR 139.A HG1 2.871 2.046 TRP 140.A N ILE 136.A O TRP 140.A H 2.848 2.046 TRP 140.A NE1 TYR 176.A O TRP 140.A HE1 2.913 2.172 ALA 141.A N LEU 137.A O ALA 141.A H 3.034 2.236 ALA 142.A N ASP 138.A O ALA 142.A H 3.097 2.289 MET 143.A N THR 139.A O MET 143.A H 2.931 2.145 GLU 144.A N TRP 140.A O GLU 144.A H 2.884 2.083 GLU 145.A N ALA 141.A O GLU 145.A H 3.173 2.412 LEU 146.A N MET 143.A O LEU 146.A H 2.990 2.337 VAL 147.A N GLU 144.A O VAL 147.A H 3.126 2.541 ASP 148.A N GLU 144.A O ASP 148.A H 3.228 2.410 GLU 149.A N GLU 145.A O GLU 149.A H 2.888 2.247 GLY 150.A N VAL 147.A O GLY 150.A H 3.093 2.270 LEU 151.A N LEU 146.A O LEU 151.A H 3.038 2.318 LYS 153.A N LEU 103.A O LYS 153.A H 2.871 2.080 GLY 156.A N TYR 106.A O GLY 156.A H 2.972 2.208 ILE 157.A N VAL 180.A O ILE 157.A H 2.909 2.067 SER 158.A OG GLN 182.A O SER 158.A HG 2.787 2.089 ASN 159.A N GLN 182.A O ASN 159.A H 2.936 2.176 ASN 159.A ND2 HIS 109.A O ASN 159.A HD22 2.972 2.182 ASN 161.A N GLN 164.A OE1 ASN 161.A H 2.894 2.056 ASN 161.A ND2 PRO 309.A O ASN 161.A HD22 2.970 2.128 HIS 162.A N PHE 314.A O HIS 162.A H 3.434 2.624 HIS 162.A N PHE 314.A OXT HIS 162.A H 2.844 2.071 HIS 162.A ND1 PHE 314.A O no hydrogen 2.902 N/A GLN 164.A N ASN 161.A OD1 GLN 164.A H 2.911 2.127 GLN 164.A NE2 ASP 307.A O GLN 164.A HE22 2.880 2.138 VAL 165.A N ASN 161.A O VAL 165.A H 2.920 2.086 GLU 166.A N HIS 162.A O GLU 166.A H 2.921 2.085 MET 167.A N LEU 163.A O MET 167.A H 2.913 2.159 ILE 168.A N GLN 164.A O ILE 168.A H 3.226 2.422 LEU 169.A N VAL 165.A O LEU 169.A H 2.928 2.089 ASN 170.A N GLU 166.A O ASN 170.A H 2.857 2.128 LYS 171.A N ILE 168.A O LYS 171.A H 2.981 2.131 LYS 171.A NZ PRO 172.A O LYS 171.A HZ2 3.037 2.295 LEU 174.A N LYS 171.A O LEU 174.A H 3.109 2.333 LYS 175.A N GLU 144.A OE2 LYS 175.A H 2.761 1.951 LYS 175.A NZ ASP 148.A OD2 LYS 175.A HZ2 2.743 1.853 TYR 176.A N GLU 144.A OE2 TYR 176.A H 2.914 2.086 TYR 176.A OH ASP 148.A OD1 TYR 176.A HH 2.614 1.804 ALA 179.A N ILE 155.A O ALA 179.A H.B 2.870 2.027 ASN 181.A N VAL 204.A O ASN 181.A H 2.938 2.180 ASN 181.A ND2 PHE 160.A O ASN 181.A HD21 3.110 2.272 GLN 182.A N ILE 157.A O GLN 182.A H 2.971 2.172 GLN 182.A NE2 ASP 42.A OD1 GLN 182.A HE22 2.979 2.144 ILE 183.A N THR 206.A O ILE 183.A H 2.881 2.059 CYS 185.A N TYR 208.A O CYS 185.A H 3.134 2.305 CYS 185.A SG THR 190.A O CYS 185.A HG 3.674 2.661 HIS 186.A N LEU 189.A O HIS 186.A H 3.148 2.327 HIS 186.A NE2 GLU 184.A OE2 no hydrogen 2.858 N/A TYR 188.A N HIS 186.A ND1 TYR 188.A H 3.173 2.445 TYR 188.A OH ASP 229.A OD2 TYR 188.A HH 2.609 1.792 LEU 189.A N HIS 186.A O LEU 189.A H 2.927 2.106 THR 190.A N ASN 291.A OD1 THR 190.A H 2.986 2.178 THR 190.A OG1 GLU 192.A OE1.A THR 190.A HG1 2.456 1.852 GLN 191.A NE2 GLU 184.A O GLN 191.A HE21 2.828 1.986 GLU 192.A N.A GLU 192.A OE1.A GLU 192.A H.A 2.811 2.086 ILE 195.A N GLN 191.A O ILE 195.A H 2.977 2.125 GLN 196.A N GLU 192.A O.A GLN 196.A H 3.002 2.148 GLN 196.A N GLU 192.A O.B GLN 196.A H 3.105 2.256 TYR 197.A N LYS 193.A O TYR 197.A H 3.103 2.265 CYS 198.A N LEU 194.A O CYS 198.A H 2.966 2.122 GLN 199.A N ILE 195.A O GLN 199.A H 2.890 2.031 GLN 199.A NE2 ARG 254.A O GLN 199.A HE22 3.131 2.286 GLN 199.A NE2 ASN 255.A O GLN 199.A HE21 3.654 3.178 SER 200.A N GLN 196.A O SER 200.A H 2.974 2.162 SER 200.A OG GLN 196.A O SER 200.A HG 3.498 3.035 SER 200.A OG TYR 197.A O SER 200.A HG 2.764 1.943 LYS 201.A N CYS 198.A O LYS 201.A H 2.985 2.238 GLY 202.A N GLN 199.A O GLY 202.A H 3.015 2.169 ILE 203.A N CYS 198.A O ILE 203.A H 3.034 2.206 VAL 204.A N ALA 179.A O VAL 204.A H 3.042 2.220 THR 206.A N ASN 181.A O THR 206.A H 3.154 2.375 ALA 207.A N VAL 257.A O ALA 207.A H 2.747 1.902 TYR 208.A N ILE 183.A O TYR 208.A H 2.885 2.045 TYR 208.A OH ASN 159.A OD1 TYR 208.A HH 2.660 1.837 GLY 212.A N SER 209.A O GLY 212.A H 2.954 2.115 ASP 215.A N ASP 215.A OD1 ASP 215.A H 2.714 2.056 ARG 216.A N SER 213.A O ARG 216.A H 2.953 2.098 ARG 216.A NH1 SER 213.A O ARG 216.A HH11 2.962 2.129 ARG 216.A NH2 ASP 223.A OD2 ARG 216.A HH21 2.845 2.036 TRP 218.A NE1 VAL 296.A O TRP 218.A HE1 2.893 2.193 ALA 219.A N ARG 216.A O ALA 219.A H 3.310 2.503 LYS 220.A N ASP 223.A OD2 LYS 220.A H 3.056 2.219 GLU 222.A N GLU 222.A OE1 GLU 222.A H 2.675 2.036 ASP 223.A N LYS 220.A O ASP 223.A H 2.956 2.102 GLU 228.A N SER 225.A O GLU 228.A H 3.212 2.473 ASP 229.A N LEU 226.A O ASP 229.A H 3.183 2.330 ARG 231.A N ASP 229.A OD1 ARG 231.A H 2.954 2.189 ARG 231.A NE ASP 229.A OD1 ARG 231.A HE 2.982 2.129 ARG 231.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 231.A HH21 2.817 1.963 ILE 232.A N ASP 229.A O ILE 232.A H 3.039 2.391 LYS 233.A N ASP 229.A O LYS 233.A H 2.991 2.143 ALA 234.A N PRO 230.A O ALA 234.A H 2.921 2.173 ILE 235.A N ARG 231.A O ILE 235.A H 3.369 2.578 ALA 236.A N ILE 232.A O ALA 236.A H 2.984 2.139 ALA 237.A N LYS 233.A O ALA 237.A H 2.900 2.085 LYS 238.A N ALA 234.A O LYS 238.A H 3.083 2.289 LYS 238.A NZ ASP 283.A OD1 LYS 238.A HZ3 2.814 1.926 HIS 239.A N ILE 235.A O HIS 239.A H 3.284 2.545 HIS 239.A N ALA 236.A O HIS 239.A H 3.054 2.419 HIS 239.A NE2 ASP 283.A OD2 no hydrogen 2.745 N/A ASN 240.A N ALA 237.A O ASN 240.A H 3.088 2.246 LYS 241.A N ALA 236.A O LYS 241.A H 2.968 2.112 LYS 241.A NZ LYS 273.A O LYS 241.A HZ1 2.887 2.047 LYS 241.A NZ ASP 276.A OD1 LYS 241.A HZ3 3.009 2.369 THR 242.A N GLN 245.A OE1 THR 242.A H 2.843 2.000 THR 242.A OG1 GLU 270.A OE2 THR 242.A HG1 2.758 1.931 GLN 245.A N THR 242.A OG1 GLN 245.A H 3.089 2.261 GLN 245.A NE2 GLU 270.A O GLN 245.A HE21 2.917 2.075 VAL 246.A N THR 242.A O VAL 246.A H 3.092 2.285 LEU 247.A N THR 243.A O.A LEU 247.A H 2.944 2.123 LEU 247.A N THR 243.A O.B LEU 247.A H 2.986 2.169 ILE 248.A N ALA 244.A O ILE 248.A H 2.955 2.253 ARG 249.A N GLN 245.A O ARG 249.A H 2.914 2.082 ARG 249.A NE GLN 253.A OE1 ARG 249.A HE 2.829 1.970 ARG 249.A NH1 VAL 274.A O ARG 249.A HH11 2.870 2.086 ARG 249.A NH2 GLN 253.A OE1 ARG 249.A HH21 3.565 2.932 PHE 250.A N VAL 246.A O PHE 250.A H 2.960 2.167 GLN 253.A N ARG 249.A O GLN 253.A H 3.111 2.344 GLN 253.A N PHE 250.A O GLN 253.A H 3.172 2.542 GLN 253.A NE2 LEU 279.A O GLN 253.A HE22 2.901 2.043 ARG 254.A N PRO 251.A O ARG 254.A H 2.942 2.168 ARG 254.A NH1 THR 190.A O ARG 254.A HH12 2.913 2.154 ARG 254.A NH2 THR 190.A O ARG 254.A HH22 2.888 2.120 ASN 255.A N MET 252.A O ASN 255.A H 3.135 2.370 LEU 256.A N PRO 251.A O LEU 256.A H 3.102 2.278 VAL 257.A N VAL 205.A O VAL 257.A H 2.985 2.167 VAL 258.A N ILE 13.A O VAL 258.A H 2.814 2.009 LYS 261.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 261.A HZ1 2.868 1.986 THR 264.A N SER 262.A OG THR 264.A H 2.943 2.099 ILE 268.A N THR 264.A O ILE 268.A H 2.894 2.058 ALA 269.A N PRO 265.A O ALA 269.A H 3.100 2.264 GLU 270.A N GLU 266.A O.A GLU 270.A H 2.918 2.077 GLU 270.A N GLU 266.A O.B GLU 270.A H 3.050 2.218 ASN 271.A N ARG 267.A O ASN 271.A H 2.816 1.988 PHE 272.A N ALA 269.A O PHE 272.A H 3.148 2.394 LYS 273.A N GLU 270.A O LYS 273.A H 3.039 2.227 VAL 274.A N PHE 272.A O VAL 274.A H 2.951 2.269 LEU 279.A N GLN 253.A OE1 LEU 279.A H 2.824 2.025 SER 280.A N ASP 283.A OD2 SER 280.A H 2.973 2.170 ASP 283.A N SER 280.A OG ASP 283.A H 2.886 2.048 MET 284.A N SER 280.A O MET 284.A H 2.883 2.062 THR 285.A N SER 281.A O THR 285.A H 2.876 2.034 THR 286.A N GLN 282.A O THR 286.A H 2.872 2.047 THR 286.A OG1 GLN 282.A O THR 286.A HG1 2.739 1.993 LEU 287.A N ASP 283.A O LEU 287.A H 2.880 2.041 LEU 288.A N MET 284.A O LEU 288.A H 2.906 2.069 SER 289.A N THR 285.A O SER 289.A H 2.978 2.328 SER 289.A N THR 286.A O SER 289.A H 3.055 2.383 SER 289.A OG THR 286.A O SER 289.A HG 2.656 1.817 TYR 290.A N LEU 287.A O TYR 290.A H 3.112 2.263 ASN 291.A N LEU 288.A O ASN 291.A H 3.281 2.443 ASN 291.A ND2 ASN 293.A OD1 ASN 291.A HD21 2.981 2.172 ARG 292.A N TYR 188.A O ARG 292.A H 2.947 2.094 ASN 293.A N ASN 291.A OD1 ASN 293.A H 3.353 2.505 TRP 294.A N TYR 188.A O TRP 294.A H 2.991 2.142 VAL 296.A N GLU 184.A OE2 VAL 296.A H 2.748 1.892 CYS 297.A N GLU 184.A OE1 CYS 297.A H 2.938 2.114 CYS 302.A N LEU 299.A O CYS 302.A H 3.033 2.198 THR 303.A N LEU 300.A O THR 303.A H 3.212 2.352 THR 303.A OG1 LEU 300.A O THR 303.A HG1 2.887 2.065 HIS 305.A N CYS 302.A O HIS 305.A H 3.007 2.184 HIS 305.A NE2 GLY 113.A O no hydrogen 2.775 N/A LYS 306.A NZ ASP 307.A OD2 LYS 306.A HZ3 2.838 2.030 ASP 307.A N HIS 305.A ND1 ASP 307.A H 2.935 2.081 TYR 308.A N HIS 305.A O TYR 308.A H 2.979 2.121 HIS 311.A NE2 THR 303.A O no hydrogen 2.781 N/A