Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4npk_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N VAL 67.A O LYS 5.A H 2.653 2.030 GLY 6.A N VAL 67.A O GLY 6.A H 3.159 2.414 VAL 7.A N LEU 127.A O VAL 7.A H 2.730 1.886 LEU 8.A N ALA 65.A O LEU 8.A H 2.911 2.082 ARG 9.A N GLU 125.A O ARG 9.A H 2.804 1.965 ARG 9.A NE GLU 64.A OE2 ARG 9.A HE 3.240 2.460 ARG 9.A NH1 GLU 125.A OE1 ARG 9.A HH11 3.054 2.214 ARG 9.A NH2 GLU 64.A OE2 ARG 9.A HH21 3.262 2.505 ILE 10.A N TYR 63.A O ILE 10.A H 2.789 1.931 HIS 11.A N ARG 123.A O HIS 11.A H 2.966 2.120 PHE 12.A N GLU 61.A O PHE 12.A H 2.642 1.888 ALA 15.A N PRO 57.A O ALA 15.A H 3.070 2.272 GLN 16.A N LYS 119.A O GLN 16.A H 2.898 2.153 LEU 18.A N LEU 55.A O LEU 18.A H 3.199 2.352 GLN 19.A NE2 GLY 20.A O GLN 19.A HE21 3.356 2.866 LYS 21.A N SER 33.A OG LYS 21.A H 2.608 1.780 ASP 22.A N LYS 32.A O ASP 22.A H 3.088 2.397 GLY 27.A N TYR 24.A O GLY 27.A H 3.169 2.395 LEU 28.A N LEU 25.A O LEU 28.A H 2.806 1.951 VAL 29.A N TYR 24.A O VAL 29.A H 3.414 2.597 GLY 31.A N ASP 22.A O GLY 31.A H 2.975 2.255 SER 33.A OG GLN 19.A O SER 33.A HG 3.435 2.800 ASP 34.A N ASP 81.A OD1 ASP 34.A H 2.810 2.043 TYR 36.A N PHE 80.A O TYR 36.A H 3.019 2.265 TYR 36.A OH ASP 87.A OD2 TYR 36.A HH 2.703 1.875 GLY 37.A N SER 48.A OG GLY 37.A H 2.569 1.772 ILE 38.A N GLU 78.A O ILE 38.A H 2.734 1.901 ILE 39.A N PHE 46.A O ILE 39.A H 2.668 1.824 ARG 40.A N GLU 76.A O ARG 40.A H 2.754 1.923 ARG 40.A NE GLY 42.A O ARG 40.A HE 3.465 2.658 VAL 41.A N GLN 44.A O VAL 41.A H 2.889 2.066 GLN 44.A N VAL 41.A O GLN 44.A H 2.941 2.137 GLN 44.A NE2 LEU 66.A O GLN 44.A HE22 3.504 2.804 PHE 46.A N ILE 39.A O PHE 46.A H 2.606 1.817 SER 48.A N GLY 37.A O SER 48.A H 2.929 2.096 ARG 49.A N GLU 61.A OE2 ARG 49.A H 2.684 1.832 ARG 49.A NH2 TRP 59.A O ARG 49.A HH21 3.276 2.527 ILE 51.A N PRO 35.A O ILE 51.A H 3.105 2.269 GLU 53.A N ASP 34.A OD1 GLU 53.A H 2.953 2.160 ASN 54.A N SER 33.A O ASN 54.A H 3.073 2.344 SER 56.A N ASN 54.A OD1 SER 56.A H 2.784 1.931 LYS 58.A NZ SER 56.A O LYS 58.A HZ2 3.191 2.521 TRP 59.A N ILE 13.A O TRP 59.A H 2.851 2.195 ASN 60.A N ILE 13.A O ASN 60.A H 2.928 2.075 GLU 61.A N PHE 12.A O GLU 61.A H 2.888 2.056 TYR 63.A N ILE 10.A O TYR 63.A H 2.915 2.112 TYR 63.A OH GLU 61.A OE1 TYR 63.A HH 2.603 1.871 ALA 65.A N LEU 8.A O ALA 65.A H 3.056 2.207 LEU 66.A N GLN 44.A OE1 LEU 66.A H 2.595 1.950 VAL 67.A N GLY 6.A O VAL 67.A H 2.954 2.119 LEU 75.A N ILE 95.A O LEU 75.A H 2.959 2.192 GLU 76.A N ARG 40.A O GLU 76.A H 2.876 2.019 ILE 77.A N LEU 93.A O ILE 77.A H 3.013 2.184 GLU 78.A N ILE 38.A O GLU 78.A H 2.933 2.102 LEU 79.A N GLY 91.A O LEU 79.A H 2.868 2.021 PHE 80.A N TYR 36.A O PHE 80.A H 2.908 2.079 ASP 81.A N ASP 88.A O ASP 81.A H 2.761 1.925 GLU 82.A N ASP 34.A O GLU 82.A H 2.944 2.096 ASP 88.A N ASP 83.A OD2 ASP 88.A H 3.263 2.508 LEU 90.A N LEU 79.A O LEU 90.A H 2.679 1.844 LEU 93.A N ILE 77.A O LEU 93.A H 2.819 2.131 ILE 95.A N LEU 75.A O ILE 95.A H 3.026 2.189 GLU 99.A N ASP 96.A O GLU 99.A H 3.185 2.555 VAL 100.A N ASP 96.A O VAL 100.A H 3.117 2.359 GLU 101.A N LEU 97.A O GLU 101.A H 2.810 2.012 GLU 103.A N GLU 99.A O GLU 103.A H 3.248 2.548 GLU 103.A N VAL 100.A O GLU 103.A H 3.234 2.600 ARG 104.A N VAL 100.A O ARG 104.A H 3.022 2.312 ARG 104.A N GLU 101.A O ARG 104.A H 3.098 2.435 ARG 104.A NH1 GLU 101.A O ARG 104.A HH11 2.742 1.957 ARG 104.A NH2 GLU 268.A OE2 ARG 104.A HH21 3.540 2.876 LEU 105.A N GLU 103.A O LEU 105.A H 2.618 1.857 LEU 106.A N LEU 124.A O LEU 106.A H 2.959 2.132 GLU 108.A N LEU 122.A O GLU 108.A H 3.022 2.208 PHE 110.A N LEU 120.A O PHE 110.A H 2.723 1.901 LEU 112.A N GLY 118.A O LEU 112.A H 3.061 2.299 ASP 113.A N SER 92.A O ASP 113.A H 3.127 2.280 LYS 119.A N GLN 16.A O LYS 119.A H 3.013 2.301 LEU 120.A N PHE 110.A O LEU 120.A H 2.748 1.941 HIS 121.A N GLU 14.A O HIS 121.A H 2.611 1.766 HIS 121.A ND1 GLU 14.A OE1 HIS 121.A HD1 2.870 2.033 LEU 122.A N GLU 108.A O LEU 122.A H 3.006 2.160 LEU 124.A N LEU 106.A O LEU 124.A H 2.908 2.159 GLU 125.A N ARG 9.A O GLU 125.A H 2.985 2.136 TRP 126.A N ARG 104.A O TRP 126.A H 2.850 1.994 LEU 127.A N VAL 7.A O LEU 127.A H 2.715 1.859 THR 128.A N HIS 266.A O THR 128.A H 2.889 2.056 THR 128.A OG1 GLU 268.A OE2 THR 128.A HG1 3.113 2.449 MET 130.A N VAL 264.A O MET 130.A H 2.918 2.135 LEU 136.A N VAL 133.A O LEU 136.A H 3.321 2.465 VAL 139.A N ASN 135.A O VAL 139.A H 2.936 2.143 LEU 140.A N LEU 136.A O LEU 140.A H 2.859 2.052 THR 141.A N ASP 137.A O THR 141.A H 3.366 2.574 THR 141.A OG1 ASP 137.A O THR 141.A HG1 2.619 1.856 ASP 142.A N LYS 138.A O ASP 142.A H 2.997 2.151 ILE 143.A N VAL 139.A O ILE 143.A H 3.213 2.366 LYS 144.A N LEU 140.A O LYS 144.A H 3.060 2.349 ALA 145.A N LEU 140.A O ALA 145.A H 2.950 2.223 SER 149.A N GLU 64.A OE2 SER 149.A H 2.968 2.161 SER 149.A OG GLU 64.A OE1 SER 149.A HG 2.689 2.041 SER 150.A N ILE 202.A O SER 150.A H 2.704 2.089 SER 150.A N HIS 203.A O SER 150.A H 3.314 2.597 ALA 151.A N ILE 202.A O ALA 151.A H 3.079 2.301 LEU 152.A N ARG 263.A O LEU 152.A H 2.893 2.070 LEU 153.A N PHE 200.A O LEU 153.A H 2.734 1.884 ILE 154.A N ALA 261.A O ILE 154.A H 2.907 2.049 LEU 155.A N PHE 198.A O LEU 155.A H 2.904 2.079 TYR 156.A N LYS 259.A O TYR 156.A H 2.642 1.844 LEU 157.A N GLU 196.A O LEU 157.A H 2.804 1.967 ASP 158.A N LYS 257.A O ASP 158.A H 3.074 2.266 SER 159.A OG ASP 158.A OD2 SER 159.A HG 3.082 2.389 ALA 160.A N PRO 192.A O ALA 160.A H 2.963 2.169 ARG 161.A N THR 255.A O ARG 161.A H 2.937 2.133 LEU 163.A N ASN 190.A O LEU 163.A H 3.143 2.300 ASN 167.A ND2 SER 166.A O ASN 167.A HD22 3.555 2.845 ASN 167.A ND2 ASN 190.A OD1 ASN 167.A HD21 2.387 1.721 ASN 169.A N ASP 216.A OD2 ASN 169.A H 2.757 1.975 VAL 171.A N ARG 215.A O VAL 171.A H 2.835 2.016 VAL 172.A N SER 183.A OG VAL 172.A H 3.034 2.211 GLN 173.A N GLU 213.A O GLN 173.A H 2.877 2.024 MET 174.A N GLN 181.A O MET 174.A H 3.022 2.224 SER 175.A N GLU 211.A O SER 175.A H 2.956 2.148 GLN 181.A N MET 174.A O GLN 181.A H 3.068 2.234 GLN 181.A NE2 THR 199.A O GLN 181.A HE22 2.593 1.868 SER 183.A N VAL 172.A O SER 183.A H 2.902 2.054 LYS 184.A N GLU 196.A OE1 LYS 184.A H 3.067 2.334 LYS 184.A N GLU 196.A OE2 LYS 184.A H 3.055 2.237 ARG 186.A N PRO 170.A O ARG 186.A H 3.075 2.224 THR 189.A N PRO 168.A O THR 189.A H 2.971 2.300 ASN 190.A ND2 LEU 163.A O ASN 190.A HD22 2.876 2.021 ASN 190.A ND2 PRO 164.A O ASN 190.A HD22 3.634 3.144 ASN 190.A ND2 SER 165.A OG ASN 190.A HD21 3.075 2.315 GLU 191.A N THR 189.A OG1 GLU 191.A H 2.927 2.083 TRP 194.A N ASP 158.A O TRP 194.A H 2.896 2.066 GLU 195.A N ASP 158.A O GLU 195.A H 3.208 2.372 GLU 196.A N LEU 157.A O GLU 196.A H 3.021 2.238 PHE 198.A N LEU 155.A O PHE 198.A H 2.887 2.055 PHE 200.A N LEU 153.A O PHE 200.A H 2.663 1.837 ILE 202.A N ALA 151.A O ILE 202.A H 2.700 1.911 ASN 204.A N GLN 208.A OE1 ASN 204.A H 2.664 1.819 LYS 206.A N ASN 204.A OD1 LYS 206.A H 2.953 2.150 LYS 206.A NZ ASP 137.A OD1 LYS 206.A HZ1 3.400 2.527 ARG 207.A N ASN 204.A O ARG 207.A H 3.105 2.254 GLN 208.A N ASN 204.A O GLN 208.A H 3.162 2.409 LEU 210.A N VAL 228.A O LEU 210.A H 2.879 2.043 VAL 212.A N LEU 226.A O VAL 212.A H 2.784 1.983 GLU 213.A N GLN 173.A O GLU 213.A H 2.918 2.073 VAL 214.A N GLY 224.A O VAL 214.A H 2.812 1.970 ARG 215.A N VAL 171.A O ARG 215.A H 2.837 1.982 ARG 215.A NH2 GLU 213.A OE1 ARG 215.A HH21 3.459 2.631 ASP 216.A N CYS 221.A O ASP 216.A H 3.157 2.298 GLU 217.A N ASN 169.A O GLU 217.A H 3.297 2.477 GLN 218.A N ASN 169.A OD1 GLN 218.A H 3.230 2.379 HIS 219.A N ASP 216.A OD1 HIS 219.A H 2.914 2.098 LEU 223.A N VAL 214.A O LEU 223.A H 2.612 1.761 GLY 224.A N SER 222.A OG GLY 224.A H 3.300 2.460 ASN 225.A N SER 248.A O ASN 225.A H 2.971 2.221 LEU 226.A N VAL 212.A O LEU 226.A H 2.734 2.001 VAL 228.A N LEU 210.A O VAL 228.A H 2.846 2.012 LEU 230.A N GLN 208.A O LEU 230.A H 3.226 2.382 GLN 232.A N PRO 229.A O GLN 232.A H 3.057 2.301 LEU 233.A N LEU 230.A O LEU 233.A H 3.031 2.293 LEU 234.A N SER 231.A O LEU 234.A H 2.871 2.099 THR 235.A OG1 GLN 232.A O THR 235.A HG1 3.385 2.545 SER 236.A N LEU 233.A O SER 236.A H 2.984 2.134 SER 236.A OG THR 240.A O SER 236.A HG 2.535 1.970 MET 239.A N SER 236.A O MET 239.A H 2.999 2.229 THR 240.A N GLU 237.A O THR 240.A H 3.197 2.446 THR 240.A OG1 ASP 238.A O THR 240.A HG1 2.782 1.952 VAL 241.A N ILE 260.A O VAL 241.A H 2.812 2.031 PHE 245.A N ILE 256.A O PHE 245.A H 2.795 1.988 GLN 246.A NE2 LEU 247.A O GLN 246.A HE21 2.909 2.170 GLN 246.A NE2 GLY 251.A O GLN 246.A HE22 3.330 2.766 GLN 246.A NE2 PRO 252.A O GLN 246.A HE22 3.629 3.097 LEU 247.A N SER 254.A O LEU 247.A H 3.118 2.267 SER 248.A N ASN 225.A O SER 248.A H 2.819 1.969 SER 250.A OG LEU 223.A O SER 250.A HG 3.107 2.533 GLY 251.A N SER 254.A OG GLY 251.A H 3.113 2.475 SER 254.A OG ASN 162.A O SER 254.A HG 2.691 1.852 THR 255.A N ARG 161.A O THR 255.A H 3.252 2.464 ILE 256.A N PHE 245.A O ILE 256.A H 2.848 2.089 LYS 257.A N SER 159.A O LYS 257.A H 2.807 1.963 MET 258.A N GLN 243.A O MET 258.A H 3.340 2.496 LYS 259.A N TYR 156.A O LYS 259.A H 3.170 2.418 ILE 260.A N VAL 241.A O ILE 260.A H 2.865 2.051 ALA 261.A N ILE 154.A O ALA 261.A H 2.788 1.940 LEU 262.A N MET 239.A O LEU 262.A H 2.753 1.964 ARG 263.A N LEU 152.A O ARG 263.A H 3.112 2.306 ARG 263.A NH1 ASP 238.A O ARG 263.A HH12 2.918 2.160 ARG 263.A NH1 LEU 262.A O ARG 263.A HH11 2.898 2.241 VAL 264.A N MET 130.A O VAL 264.A H 3.091 2.359 LEU 265.A N SER 150.A O LEU 265.A H 3.177 2.331 HIS 266.A N THR 128.A O HIS 266.A H 3.047 2.277 GLU 268.A N GLU 268.A OE1 GLU 268.A H 2.464 1.845