Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4nq8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 1.A N LYS 33.A O THR 1.A H 2.885 2.054 LEU 3.A N LYS 35.A O LEU 3.A H 2.647 1.819 LYS 4.A N ASP 60.A OD2 LYS 4.A H 2.712 1.863 MET 5.A N GLN 37.A O MET 5.A H 2.942 2.093 ALA 6.A N LEU 61.A O ALA 6.A H 2.991 2.184 TYR 7.A N PHE 39.A O TYR 7.A H 3.168 2.348 SER 12.A N SER 10.A OG SER 12.A H 3.235 2.562 SER 12.A OG SER 10.A OG SER 12.A HG 3.275 2.482 SER 13.A N SER 10.A O SER 13.A H 3.215 2.367 HIS 14.A NE2 GLN 120.A OE1 HIS 14.A HE2 2.871 2.014 TYR 15.A N SER 13.A OG TYR 15.A H 3.112 2.522 GLY 16.A N SER 13.A OG GLY 16.A H 3.214 2.403 ALA 17.A N SER 13.A O ALA 17.A H 2.956 2.206 GLY 18.A N HIS 14.A O GLY 18.A H 2.927 2.122 ALA 19.A N TYR 15.A O ALA 19.A H 2.834 2.045 GLU 20.A N GLY 16.A O GLU 20.A H 2.893 2.060 ALA 21.A N ALA 17.A O ALA 21.A H 3.034 2.202 PHE 22.A N GLY 18.A O PHE 22.A H 2.985 2.166 ALA 23.A N ALA 19.A O ALA 23.A H 2.892 2.059 LYS 24.A N GLU 20.A O LYS 24.A H 2.962 2.124 SER 25.A N ALA 21.A O SER 25.A H 3.052 2.217 ILE 26.A N PHE 22.A O ILE 26.A H 3.010 2.174 GLU 27.A N ALA 23.A O GLU 27.A H 2.923 2.085 GLY 28.A N LYS 24.A O GLY 28.A H 3.036 2.220 ALA 29.A N SER 25.A O ALA 29.A H 3.011 2.166 SER 30.A N ILE 26.A O SER 30.A H 2.933 2.160 GLY 31.A N GLY 28.A O GLY 31.A H 3.366 2.532 GLY 32.A N GLU 27.A O GLY 32.A H 3.030 2.296 LYS 33.A N SER 30.A O LYS 33.A H 3.152 2.297 LYS 33.A NZ GLU 227.A OE2 LYS 33.A HZ3 2.836 1.955 TYR 34.A N SER 30.A OG TYR 34.A H 3.066 2.215 LYS 35.A N THR 1.A O LYS 35.A H 2.894 2.066 VAL 36.A N GLU 27.A OE2 VAL 36.A H 2.918 2.070 GLN 37.A N LEU 3.A O GLN 37.A H 2.889 2.045 GLN 38.A NE2 GLU 20.A OE1 GLN 38.A HE22 3.020 2.285 PHE 39.A N MET 5.A O PHE 39.A H 2.739 1.901 ASN 41.A N LEU 9.A O ASN 41.A H 2.805 1.981 SER 42.A N TYR 7.A O SER 42.A H 3.123 2.268 SER 42.A OG ALA 8.A O SER 42.A HG 2.891 2.468 ALA 43.A N ALA 40.A O ALA 43.A H 3.281 2.466 GLY 45.A N SER 42.A O GLY 45.A H 2.982 2.145 VAL 50.A N GLY 46.A O VAL 50.A H 3.031 2.221 ILE 51.A N GLU 47.A O ILE 51.A H 2.978 2.142 GLU 52.A N ARG 48.A O GLU 52.A H 3.032 2.193 GLY 53.A N GLU 49.A O GLY 53.A H 2.893 2.111 LEU 54.A N VAL 50.A O LEU 54.A H 3.056 2.326 LEU 54.A N ILE 51.A O LEU 54.A H 3.150 2.563 GLN 55.A N ILE 51.A O GLN 55.A H 3.116 2.318 GLN 55.A NE2 ARG 110.A O GLN 55.A HE21 2.853 2.030 ILE 56.A N GLU 52.A O ILE 56.A H 3.186 2.405 GLY 57.A N GLY 53.A O GLY 57.A H 2.877 2.167 ILE 59.A N GLY 53.A O ILE 59.A H 3.201 2.358 ASP 60.A N LYS 4.A O ASP 60.A H 3.124 2.397 LEU 61.A N LYS 4.A O LEU 61.A H 2.938 2.196 ALA 62.A N LEU 214.A O ALA 62.A H 2.976 2.220 ILE 63.A N ALA 6.A O ILE 63.A H 3.170 2.398 VAL 64.A N LEU 212.A O VAL 64.A H 3.052 2.250 SER 65.A N GLU 47.A OE2 SER 65.A H 2.950 2.119 THR 66.A OG1 ASP 80.A OD1 THR 66.A HG1 2.804 2.052 PHE 72.A N THR 69.A O PHE 72.A H 2.961 2.132 VAL 73.A N THR 69.A O VAL 73.A H 2.903 2.055 GLU 75.A N GLU 75.A OE1 GLU 75.A H 2.736 1.931 THR 76.A N VAL 73.A O THR 76.A H 3.392 2.552 THR 76.A OG1 VAL 73.A O THR 76.A HG1 3.063 2.258 GLY 77.A N PRO 74.A O GLY 77.A H 2.957 2.119 PHE 79.A N THR 76.A O PHE 79.A H 3.107 2.280 ASP 80.A N GLY 77.A O ASP 80.A H 2.891 2.090 ILE 81.A N VAL 78.A O ILE 81.A H 3.364 2.508 LEU 84.A N ILE 81.A O LEU 84.A H 3.216 2.367 ARG 86.A NH1 ARG 296.A O ARG 86.A HH12 2.930 2.109 HIS 90.A N ASP 87.A OD1 HIS 90.A H 2.984 2.142 HIS 90.A NE2 ILE 295.A O HIS 90.A HE2 2.880 2.069 ALA 91.A N ASP 87.A O ALA 91.A H 2.921 2.064 ARG 92.A N LEU 88.A O ARG 92.A H 2.967 2.125 ARG 92.A NE GLU 119.A OE1 ARG 92.A HE 2.863 2.004 ARG 92.A NH1 ASP 247.A OD1 ARG 92.A HH12 3.324 2.635 ARG 92.A NH1 ASP 247.A OD2 ARG 92.A HH12 3.523 2.748 ARG 92.A NH2 GLU 119.A OE2 ARG 92.A HH21 2.697 1.845 ARG 92.A NH2 ASP 247.A OD1 ARG 92.A HH22 2.965 2.166 ALA 93.A N PRO 89.A O ALA 93.A H 3.064 2.253 VAL 94.A N HIS 90.A O VAL 94.A H 2.985 2.160 LEU 95.A N ALA 91.A O LEU 95.A H 3.022 2.175 ASP 96.A N ARG 92.A O ASP 96.A H 2.889 2.080 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 2.973 2.322 SER 97.A N VAL 94.A O SER 97.A H 3.221 2.525 GLY 100.A N VAL 94.A O GLY 100.A H 3.259 2.560 GLN 101.A N SER 97.A O GLN 101.A H 2.902 2.060 ASP 102.A N LYS 98.A O ASP 102.A H 2.831 1.992 MET 103.A N GLY 100.A O MET 103.A H 3.146 2.552 LEU 104.A N GLY 100.A O LEU 104.A H 3.208 2.438 ALA 105.A N GLN 101.A O ALA 105.A H 3.279 2.565 ALA 105.A N ASP 102.A O ALA 105.A H 3.266 2.625 LYS 106.A N MET 103.A O LYS 106.A H 3.026 2.185 PHE 107.A N LEU 104.A O PHE 107.A H 3.273 2.421 ARG 110.A N PHE 107.A O ARG 110.A H 2.768 1.949 ARG 110.A NE PHE 72.A O ARG 110.A HE 3.234 2.682 GLY 111.A N PRO 108.A O GLY 111.A H 2.886 2.038 ILE 112.A N PHE 107.A O ILE 112.A H 3.384 2.548 ILE 113.A N MET 215.A O ILE 113.A H 2.841 1.993 LEU 115.A N VAL 213.A O LEU 115.A H 2.836 2.069 TRP 117.A NE1 GLY 100.A O TRP 117.A HE1 2.985 2.156 GLY 118.A N ALA 211.A O GLY 118.A H 2.697 2.068 GLN 120.A N GLY 209.A O GLN 120.A H 2.792 1.949 GLY 121.A N GLY 209.A O GLY 121.A H 3.319 2.629 ARG 123.A N VAL 207.A O ARG 123.A H 2.848 1.999 ARG 123.A NE GLU 183.A OE1 ARG 123.A HE 2.811 1.994 ARG 123.A NE GLU 183.A OE2 ARG 123.A HE 3.415 2.695 ARG 123.A NH2 GLU 183.A O ARG 123.A HH21 2.899 2.272 ARG 123.A NH2 GLU 183.A OE2 ARG 123.A HH21 3.123 2.365 HIS 124.A N ASN 184.A O HIS 124.A H 2.892 2.059 LEU 125.A N THR 204.A OG1 LEU 125.A H 3.252 2.548 THR 126.A N GLN 182.A O THR 126.A H 2.912 2.055 THR 126.A OG1 GLN 198.A OE1 THR 126.A HG1 2.613 1.879 ASN 127.A N TYR 200.A O ASN 127.A H 3.033 2.268 ASN 127.A ND2 ARG 130.A O ASN 127.A HD22 2.850 2.027 ASN 128.A N ASP 180.A O ASN 128.A H 2.896 2.265 ASN 128.A ND2 LEU 197.A O ASN 128.A HD22 2.808 2.073 VAL 129.A N ASN 127.A OD1 VAL 129.A H 2.778 1.991 ARG 130.A N ASN 127.A OD1 ARG 130.A H 2.992 2.171 ARG 130.A NE ASP 137.A O ARG 130.A HE 2.909 2.121 ARG 130.A NH2 ASP 137.A O ARG 130.A HH21 2.983 2.234 LYS 133.A N ASP 137.A OD2 LYS 133.A H 2.861 2.033 THR 134.A N ASP 137.A OD2 THR 134.A H 3.152 2.396 ASP 137.A N THR 134.A O ASP 137.A H 3.018 2.327 ASP 137.A N THR 134.A OG1 ASP 137.A H 3.303 2.562 ALA 138.A N PRO 135.A O ALA 138.A H 2.995 2.197 LYS 139.A N ALA 136.A O LYS 139.A H 3.254 2.444 GLY 140.A N GLY 159.A O GLY 140.A H 2.825 1.978 LEU 141.A N ALA 138.A O LEU 141.A H 3.094 2.240 LYS 142.A N ASP 180.A OD2 LYS 142.A H 2.952 2.095 ILE 143.A N LEU 161.A O ILE 143.A H 3.075 2.341 ARG 144.A N GLY 181.A O ARG 144.A H 2.873 2.049 ARG 144.A NE MET 165.A O ARG 144.A HE 2.929 2.200 ARG 144.A NH2 MET 165.A O ARG 144.A HH21 2.879 2.113 THR 145.A N THR 163.A O THR 145.A H 3.073 2.273 THR 145.A OG1 THR 146.A O THR 145.A HG1 2.860 2.107 ASN 148.A N THR 146.A OG1 ASN 148.A H 3.230 2.405 ASN 148.A ND2 THR 66.A O ASN 148.A HD21 3.039 2.204 ASN 148.A ND2 ASP 80.A OD2 ASN 148.A HD22 2.885 2.121 ILE 150.A N ASN 148.A OD1 ILE 150.A H 2.824 2.123 HIS 151.A N ASN 148.A OD1 HIS 151.A H 3.179 2.375 ILE 152.A N ASN 148.A O ILE 152.A H 3.191 2.369 THR 153.A N PRO 149.A O THR 153.A H 3.062 2.242 THR 153.A OG1 PRO 149.A O THR 153.A HG1 2.947 2.203 ALA 154.A N ILE 150.A O ALA 154.A H 3.215 2.394 PHE 155.A N HIS 151.A O PHE 155.A H 3.050 2.225 ARG 156.A N ILE 152.A O ARG 156.A H 3.117 2.276 GLN 157.A N ALA 154.A O GLN 157.A H 2.940 2.211 ILE 158.A N PHE 155.A O ILE 158.A H 3.184 2.448 GLY 159.A N ARG 156.A O GLY 159.A H 3.044 2.211 ILE 160.A N PHE 155.A O ILE 160.A H 3.290 2.520 LEU 161.A N LEU 141.A O LEU 161.A H 2.852 2.007 THR 163.A N ILE 143.A O THR 163.A H 3.011 2.213 MET 165.A N THR 145.A O MET 165.A H 3.004 2.224 GLU 169.A N ALA 166.A O GLU 169.A H 3.172 2.379 VAL 170.A N TRP 167.A O VAL 170.A H 2.974 2.118 ALA 173.A N GLU 169.A O ALA 173.A H 3.105 2.265 LEU 174.A N VAL 170.A O LEU 174.A H 2.891 2.085 GLN 175.A N ALA 171.A O GLN 175.A H 3.068 2.242 GLN 176.A N THR 172.A O GLN 176.A H 2.927 2.127 GLY 177.A N ALA 173.A O GLY 177.A H 2.964 2.356 GLY 177.A N LEU 174.A O GLY 177.A H 3.171 2.462 THR 178.A N ALA 173.A O THR 178.A H 3.277 2.604 ASP 180.A N LYS 142.A O ASP 180.A H 2.694 1.904 GLY 181.A N LYS 142.A O GLY 181.A H 3.218 2.508 GLN 182.A N THR 126.A O GLN 182.A H 3.165 2.395 GLN 182.A NE2 THR 126.A OG1 GLN 182.A HE21 2.850 1.992 ASN 184.A N HIS 124.A O ASN 184.A H 3.000 2.244 ASN 184.A ND2 GLN 182.A OE1 ASN 184.A HD21 2.899 2.069 SER 187.A OG GLN 120.A O SER 187.A HG 2.846 2.364 VAL 188.A N PRO 185.A O VAL 188.A H 2.985 2.364 ILE 189.A N PRO 185.A O ILE 189.A H 2.911 2.082 THR 190.A N LEU 186.A O THR 190.A H 2.983 2.132 THR 190.A OG1 LEU 186.A O THR 190.A HG1 2.757 1.970 THR 190.A OG1 SER 187.A O THR 190.A HG1 3.184 2.807 SER 191.A N SER 187.A O SER 191.A H 3.209 2.367 ALA 192.A N VAL 188.A O ALA 192.A H 2.840 1.996 LYS 193.A N THR 190.A O LYS 193.A H 3.132 2.286 LEU 194.A N ILE 189.A O LEU 194.A H 3.036 2.257 SER 195.A OG GLU 260.A OE1 SER 195.A HG 2.562 1.994 GLN 196.A N LYS 193.A O GLN 196.A H 2.997 2.154 LEU 197.A N LEU 194.A O LEU 197.A H 2.863 2.031 GLN 198.A NE2 ASP 180.A O GLN 198.A HE22 3.313 2.465 GLN 198.A NE2 LEU 197.A O GLN 198.A HE21 2.829 1.990 LYS 199.A N ASN 128.A OD1 LYS 199.A H 2.988 2.330 TYR 200.A N ASN 127.A O TYR 200.A H 2.972 2.183 LEU 201.A N GLU 263.A O LEU 201.A H 2.963 2.127 SER 202.A N LEU 125.A O SER 202.A H 2.874 2.017 SER 202.A OG VAL 132.A O SER 202.A HG 2.547 2.066 LEU 203.A N SER 265.A O LEU 203.A H 2.918 2.111 THR 204.A N SER 202.A O THR 204.A H 2.853 2.124 HIS 206.A N ARG 123.A O HIS 206.A H 3.053 2.401 HIS 206.A NE2 GLU 183.A OE1 HIS 206.A HE2 2.908 2.057 GLY 209.A N GLY 121.A O GLY 209.A H 2.800 2.024 ALA 211.A N GLY 118.A O ALA 211.A H 3.171 2.327 LEU 212.A N VAL 64.A O LEU 212.A H 2.788 1.971 VAL 213.A N ALA 116.A O VAL 213.A H 2.958 2.105 LEU 214.A N ALA 62.A O LEU 214.A H 2.820 1.967 MET 215.A N ILE 113.A O MET 215.A H 2.808 2.073 SER 216.A N ASP 60.A O SER 216.A H 2.935 2.119 VAL 219.A N SER 216.A OG VAL 219.A H 3.317 2.501 TYR 220.A N SER 216.A O TYR 220.A H 3.106 2.247 ASN 221.A N ALA 217.A O ASN 221.A H 2.907 2.056 GLY 222.A N VAL 219.A O GLY 222.A H 3.041 2.341 LEU 223.A N TYR 220.A O LEU 223.A H 3.075 2.226 SER 224.A N GLU 227.A OE1 SER 224.A H 3.112 2.276 GLU 227.A N SER 224.A OG GLU 227.A H 3.072 2.262 LYS 228.A N SER 224.A O LYS 228.A H 2.823 1.987 ALA 229.A N ASP 225.A O ALA 229.A H 3.075 2.251 SER 230.A N ALA 226.A O SER 230.A H 3.048 2.278 SER 230.A OG GLU 227.A O SER 230.A HG 2.785 2.185 PHE 231.A N GLU 227.A O PHE 231.A H 3.039 2.264 LYS 232.A N LYS 228.A O LYS 232.A H 3.035 2.203 ALA 233.A N ALA 229.A O ALA 233.A H 2.859 2.058 ALA 234.A N SER 230.A O ALA 234.A H 3.010 2.220 GLY 235.A N PHE 231.A O GLY 235.A H 2.938 2.162 LYS 236.A N LYS 232.A O LYS 236.A H 3.018 2.208 ASP 237.A N ALA 233.A O ASP 237.A H 2.936 2.125 SER 238.A N ALA 234.A O SER 238.A H 2.897 2.069 ALA 239.A N GLY 235.A O ALA 239.A H 2.918 2.079 GLN 240.A N LYS 236.A O GLN 240.A H 2.967 2.128 ALA 241.A N ASP 237.A O ALA 241.A H 3.015 2.261 MET 242.A N SER 238.A O MET 242.A H 3.035 2.231 ARG 243.A N ALA 239.A O ARG 243.A H 2.978 2.141 ARG 243.A NH1 ASP 96.A OD1 ARG 243.A HH12 3.494 2.851 ARG 243.A NH1 ASP 96.A OD2 ARG 243.A HH12 2.863 2.012 ARG 243.A NH2 ASP 96.A OD1 ARG 243.A HH22 2.941 2.131 ALA 244.A N GLN 240.A O ALA 244.A H 2.914 2.087 TYR 245.A N ALA 241.A O TYR 245.A H 2.977 2.159 TYR 245.A OH SER 12.A O TYR 245.A HH 3.082 2.485 VAL 246.A N MET 242.A O VAL 246.A H 2.989 2.177 ASP 247.A N ARG 243.A O ASP 247.A H 2.878 2.040 ASN 248.A N ALA 244.A O ASN 248.A H 3.137 2.371 ASN 248.A N TYR 245.A O ASN 248.A H 3.207 2.619 ILE 249.A N TYR 245.A O ILE 249.A H 2.941 2.119 GLU 250.A N VAL 246.A O GLU 250.A H 2.872 2.077 GLN 251.A N ASN 248.A O GLN 251.A H 3.035 2.272 GLN 251.A NE2 ASP 247.A O GLN 251.A HE21 3.181 2.353 THR 252.A N ILE 249.A O THR 252.A H 3.287 2.603 GLY 253.A N ILE 249.A O GLY 253.A H 2.773 2.085 GLN 256.A N THR 252.A O GLN 256.A H 3.034 2.196 GLN 256.A NE2 GLU 260.A OE2 GLN 256.A HE21 2.946 2.094 LEU 257.A N GLY 253.A O LEU 257.A H 2.958 2.134 LYS 258.A N VAL 254.A O LYS 258.A H 2.882 2.034 LYS 259.A N GLU 255.A O LYS 259.A H 2.974 2.146 GLU 260.A N GLN 256.A O GLU 260.A H 3.040 2.342 GLU 260.A N LEU 257.A O GLU 260.A H 3.167 2.580 GLY 261.A N LYS 258.A O GLY 261.A H 2.906 2.113 MET 262.A N LEU 257.A O MET 262.A H 2.936 2.087 GLU 263.A N LYS 199.A O GLU 263.A H 2.915 2.061 SER 265.A N LEU 201.A O SER 265.A H 2.723 1.891 ARG 269.A NE THR 204.A O ARG 269.A HE 2.864 2.110 ARG 269.A NH2 GLY 205.A O ARG 269.A HH21 2.726 1.870 ALA 271.A N ASP 268.A O ALA 271.A H 3.046 2.390 ALA 273.A N ARG 269.A O ALA 273.A H 2.864 2.044 ALA 274.A N ALA 270.A O ALA 274.A H 2.956 2.143 ALA 275.A N ALA 271.A O ALA 275.A H 3.056 2.265 VAL 276.A N PHE 272.A O VAL 276.A H 3.062 2.324 ALA 279.A N VAL 276.A O ALA 279.A H 3.054 2.210 TYR 280.A N GLU 277.A O TYR 280.A H 2.980 2.122 ALA 281.A N PRO 278.A O ALA 281.A H 3.081 2.225 GLU 282.A N ALA 279.A O GLU 282.A H 2.887 2.182 TYR 283.A N ALA 279.A O TYR 283.A H 3.038 2.255 TYR 284.A N TYR 280.A O TYR 284.A H 2.949 2.131 LYS 285.A N GLU 282.A O LYS 285.A H 3.032 2.248 LYS 286.A N TYR 283.A O LYS 286.A H 2.977 2.176 PHE 287.A N TYR 283.A O PHE 287.A H 2.878 2.115 LEU 291.A N ASP 288.A OD2 LEU 291.A H 2.921 2.183 ILE 292.A N ASP 288.A O ILE 292.A H 3.198 2.376 GLN 293.A N LYS 289.A O GLN 293.A H 3.035 2.213 SER 294.A N GLN 290.A O SER 294.A H 2.901 2.094 ILE 295.A N LEU 291.A O ILE 295.A H 3.020 2.230 ARG 296.A N ILE 292.A O ARG 296.A H 3.042 2.215 ASP 297.A N GLN 293.A O ASP 297.A H 2.990 2.266 THR 298.A N ILE 295.A O THR 298.A H 3.195 2.404 THR 298.A OG1 SER 294.A O THR 298.A HG1 2.863 2.072 LYS 299.A NZ ASP 297.A O LYS 299.A HZ1 2.815 1.955