Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4paf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N ALA 33.A O no hydrogen 2.910 N/A PHE 3.A N SER 35.A O PHE 3.A H 2.819 2.009 ARG 4.A N ASP 59.A OD2 ARG 4.A H 2.873 2.046 ARG 4.A NH1 ALA 57.A O ARG 4.A HH11 2.988 2.179 LEU 5.A N SER 37.A O.A LEU 5.A H 3.020 2.189 LEU 5.A N SER 37.A O.B LEU 5.A H 2.916 2.096 LEU 7.A N PHE 39.A O LEU 7.A H 2.991 2.174 THR 9.A OG1 THR 16.A OG1 THR 9.A HG1 2.963 2.234 HIS 13.A N PRO 10.A O HIS 13.A H 3.090 2.250 THR 14.A N GLU 179.A OE2 THR 14.A H 2.975 2.145 THR 14.A OG1 GLU 179.A OE2 THR 14.A HG1 2.820 2.022 TRP 15.A NE1 SER 115.A O TRP 15.A HE1 2.889 2.062 THR 16.A N HIS 13.A O THR 16.A H 3.000 2.397 THR 16.A OG1 THR 9.A O THR 16.A HG1 3.365 2.846 THR 16.A OG1 PRO 10.A O THR 16.A HG1 2.830 2.148 LYS 17.A N HIS 13.A O LYS 17.A H 3.111 2.279 ALA 18.A N THR 14.A O ALA 18.A H 2.988 2.175 ALA 19.A N TRP 15.A O ALA 19.A H 2.924 2.119 GLU 20.A N THR 16.A O GLU 20.A H 2.964 2.136 ALA 21.A N LYS 17.A O ALA 21.A H 2.908 2.096 PHE 22.A N ALA 18.A O PHE 22.A H 2.887 2.063 GLY 23.A N ALA 19.A O GLY 23.A H 2.908 2.084 ALA 24.A N GLU 20.A O ALA 24.A H 2.953 2.133 GLU 25.A N ALA 21.A O GLU 25.A H 3.015 2.192 LEU 26.A N PHE 22.A O LEU 26.A H 2.845 2.043 SER 27.A N GLY 23.A O SER 27.A H 3.131 2.284 GLU 28.A N ALA 24.A O GLU 28.A H 3.158 2.369 LYS 29.A N GLU 25.A O LYS 29.A H 2.778 1.923 SER 30.A N LEU 26.A O SER 30.A H 2.942 2.152 SER 30.A OG SER 27.A O SER 30.A HG 3.352 2.589 GLY 31.A N GLU 28.A O GLY 31.A H 3.025 2.175 GLY 32.A N SER 27.A O GLY 32.A H 2.891 2.094 ALA 33.A N SER 30.A O ALA 33.A H 3.046 2.196 HIS 34.A N SER 30.A OG HIS 34.A H 3.053 2.225 HIS 34.A NE2 ASP 215.A OD2 HIS 34.A HE2 2.829 1.999 SER 35.A N LYS 1.A O SER 35.A H 2.992 2.187 SER 37.A N.A PHE 3.A O SER 37.A H.A 2.782 1.953 SER 37.A N.B PHE 3.A O SER 37.A H.B 2.784 1.954 SER 37.A OG.B GLU 2.A OE1 SER 37.A HG.B 2.796 2.161 PHE 39.A N LEU 5.A O PHE 39.A H 2.794 1.968 ALA 41.A N THR 9.A O ALA 41.A H 2.821 2.084 ARG 42.A N LEU 7.A O ARG 42.A H 3.083 2.235 GLN 43.A N PRO 40.A O GLN 43.A H 3.087 2.235 GLY 45.A N ARG 42.A O GLY 45.A H 2.895 2.053 ASN 46.A N GLN 49.A OE1 ASN 46.A H 2.959 2.166 GLN 49.A N ASN 46.A OD1 GLN 49.A H 2.794 1.955 LEU 50.A N GLU 47.A O LEU 50.A H 2.883 2.063 GLN 51.A N ALA 48.A O GLN 51.A H 3.092 2.287 GLN 52.A N GLN 49.A O GLN 52.A H 3.060 2.284 GLN 54.A N LEU 50.A O GLN 54.A H 2.898 2.132 THR 55.A N GLN 51.A O THR 55.A H 3.133 2.392 GLY 56.A N GLN 52.A O GLY 56.A H 2.901 2.182 ALA 57.A N THR 55.A OG1 ALA 57.A H 3.237 2.383 LEU 58.A N GLN 52.A O LEU 58.A H 3.005 2.153 ALA 60.A N LEU 203.A O ALA 60.A H 3.030 2.253 PHE 61.A N GLY 6.A O PHE 61.A H 3.245 2.543 THR 62.A N GLU 47.A OE2 THR 62.A H 2.790 1.945 THR 62.A OG1 GLU 47.A OE1 THR 62.A HG1 2.565 1.942 VAL 63.A N PRO 200.A O VAL 63.A H 2.994 2.135 GLU 65.A N THR 62.A OG1 GLU 65.A H 2.952 2.123 VAL 66.A N THR 62.A O VAL 66.A H 3.467 2.626 SER 67.A N VAL 63.A O SER 67.A H 2.862 2.107 SER 67.A N ALA 64.A O SER 67.A H 3.193 2.596 SER 67.A OG ALA 64.A O SER 67.A HG 2.634 2.170 ASN 68.A N GLU 65.A O ASN 68.A H 3.005 2.258 ASN 68.A ND2 GLU 65.A OE1 ASN 68.A HD21 3.566 2.919 ASN 68.A ND2 GLU 65.A OE2 ASN 68.A HD21 3.099 2.239 ASN 68.A ND2 PRO 141.A O ASN 68.A HD22 3.049 2.198 ARG 69.A N VAL 66.A O ARG 69.A H 2.909 2.205 ARG 69.A NE GLU 105.A O ARG 69.A HE 2.869 2.059 VAL 70.A N VAL 66.A O VAL 70.A H 2.740 1.974 ASN 72.A ND2 SER 274.A OG ASN 72.A HD22 2.807 1.957 GLY 73.A N PRO 71.A O GLY 73.A H 2.818 2.003 ALA 74.A N ASN 72.A O ALA 74.A H 3.052 2.194 TYR 76.A N GLY 73.A O TYR 76.A H 2.991 2.148 ALA 77.A N ALA 74.A O ALA 77.A H 3.397 2.550 TYR 79.A N HIS 198.A O TYR 79.A H 2.989 2.239 TYR 79.A OH SER 196.A O TYR 79.A HH 2.743 1.984 LEU 80.A N ALA 77.A O LEU 80.A H 3.134 2.306 HIS 86.A N ASP 83.A OD1 HIS 86.A H 2.902 2.062 HIS 86.A NE2 ALA 282.A O HIS 86.A HE2 2.825 2.055 ALA 87.A N ASP 83.A O ALA 87.A H 2.952 2.132 ALA 88.A N ILE 84.A O ALA 88.A H 2.935 2.102 ALA 89.A N ASN 85.A O ALA 89.A H 3.143 2.317 ILE 90.A N HIS 86.A O ILE 90.A H 2.955 2.150 LEU 91.A N ALA 87.A O LEU 91.A H 2.911 2.132 ARG 92.A N ALA 88.A O ARG 92.A H 3.097 2.438 ARG 92.A NE ASP 226.A OD1 ARG 92.A HE 2.894 2.037 ARG 92.A NH2 ASP 226.A OD1 ARG 92.A HH21 3.483 2.817 ARG 92.A NH2 ASP 226.A OD2 ARG 92.A HH21 3.031 2.234 ARG 92.A NH2 ASP 230.A OD2 ARG 92.A HH22 2.946 2.191 SER 93.A N ILE 90.A O SER 93.A H 3.071 2.236 THR 95.A OG1 THR 281.A OG1 THR 95.A HG1 2.766 2.051 ARG 97.A N SER 93.A O ARG 97.A H 3.009 2.154 ARG 97.A NE ARG 92.A O ARG 97.A HE 3.288 2.495 GLY 98.A N ASP 94.A O GLY 98.A H 2.867 2.064 LEU 99.A N ARG 97.A O LEU 99.A H 3.058 2.234 ALA 100.A N GLY 98.A O ALA 100.A H 3.305 2.450 LEU 102.A N LEU 99.A O LEU 102.A H 3.047 2.189 GLU 105.A N VAL 101.A O GLU 105.A H.A 2.934 2.082 ALA 106.A N LEU 102.A O ALA 106.A H 2.829 2.032 GLY 107.A N PRO 103.A O GLY 107.A H 3.083 2.413 VAL 108.A N LEU 102.A O VAL 108.A H 3.370 2.521 VAL 109.A N ILE 204.A O VAL 109.A H 2.844 2.000 VAL 111.A N GLY 202.A O VAL 111.A H 2.966 2.146 SER 115.A N THR 228.A OG1 SER 115.A H 3.265 2.491 ALA 116.A N PHE 199.A O ALA 116.A H 2.929 2.087 ARG 118.A NE ASP 176.A OD1 ARG 118.A HE 2.753 1.967 ARG 118.A NH2 ASP 176.A OD1 ARG 118.A HH21 2.937 2.218 GLN 119.A NE2 ASN 197.A OD1 GLN 119.A HE22 2.810 1.972 ILE 120.A N LEU 194.A O.A ILE 120.A H 3.123 2.266 ILE 120.A N LEU 194.A O.B ILE 120.A H 3.093 2.239 LEU 121.A N ILE 175.A O LEU 121.A H 2.940 2.111 SER 122.A N THR 192.A O SER 122.A H 2.895 2.079 ARG 123.A N ASP 173.A O ARG 123.A H 2.776 1.935 ARG 123.A NE LEU 167.A O ARG 123.A HE 2.660 1.864 ARG 123.A NH2 LEU 167.A O ARG 123.A HH21 2.845 2.134 ARG 123.A NH2 ALA 168.A O ARG 123.A HH21 3.558 2.946 GLY 124.A N SER 122.A OG GLY 124.A H 3.400 2.551 ASN 127.A N ASP 131.A OD2 ASN 127.A H 2.697 1.842 SER 128.A N ASP 131.A OD2 SER 128.A H 3.264 2.565 ASP 131.A N SER 128.A O ASP 131.A H 2.968 2.174 LEU 132.A N ALA 129.A O LEU 132.A H 2.896 2.069 SER 133.A N ALA 130.A O SER 133.A H 3.112 2.277 GLY 134.A N GLY 153.A O GLY 134.A H 2.888 2.047 LEU 135.A N LEU 132.A O LEU 135.A H 3.086 2.232 LYS 136.A N ASP 173.A OD2 LYS 136.A H 2.996 2.201 LYS 136.A NZ ASP 173.A OD2 LYS 136.A HZ1 3.252 2.573 LEU 137.A N ALA 155.A O LEU 137.A H 3.078 2.277 ARG 138.A N ALA 174.A O ARG 138.A H 2.857 2.051 ARG 138.A NH2 ASP 176.A O ARG 138.A HH21 3.019 2.272 ILE 139.A N THR 157.A O ILE 139.A H 2.913 2.108 PHE 142.A N THR 140.A O PHE 142.A H 2.866 2.234 ASP 147.A N ASP 143.A O ASP 147.A H 2.844 2.010 PHE 148.A N PRO 144.A O PHE 148.A H 3.253 2.459 TYR 149.A N ILE 145.A O TYR 149.A H 3.062 2.214 ASN 150.A N LEU 146.A O ASN 150.A H 2.830 2.023 ALA 151.A N ASP 147.A O ALA 151.A H 2.954 2.153 LEU 152.A N PHE 148.A O LEU 152.A H 3.117 2.377 GLY 153.A N ASN 150.A O GLY 153.A H 3.109 2.348 ALA 154.A N TYR 149.A O ALA 154.A H 3.007 2.293 ALA 155.A N LEU 135.A O ALA 155.A H 2.744 1.906 THR 157.A N LEU 137.A O THR 157.A H 2.833 2.056 ALA 162.A N PRO 159.A O ALA 162.A H 3.256 2.442 VAL 163.A N LEU 160.A O VAL 163.A H 3.203 2.348 ALA 166.A N ALA 162.A O ALA 166.A H 3.051 2.262 LEU 167.A N VAL 163.A O LEU 167.A H 3.050 2.226 ALA 168.A N TYR 164.A O ALA 168.A H 2.982 2.149 ASN 169.A N ASP 165.A O ASN 169.A H 2.843 2.143 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 3.422 2.608 VAL 172.A N ALA 166.A O VAL 172.A H 3.249 2.428 ASP 173.A N LYS 136.A O ASP 173.A H 2.763 1.957 ALA 174.A N LYS 136.A O ALA 174.A H 3.103 2.421 ILE 175.A N LEU 121.A O ILE 175.A H 2.817 2.016 ASP 176.A N ARG 138.A O ASP 176.A H 2.917 2.073 LEU 180.A N ASP 177.A OD1 LEU 180.A H 3.002 2.157 ILE 181.A N ASP 177.A O ILE 181.A H 2.974 2.145 ASN 182.A N VAL 178.A O ASN 182.A H 3.023 2.185 ASN 182.A ND2 VAL 178.A O ASN 182.A HD21 2.852 2.057 ASN 182.A ND2 TRP 238.A O ASN 182.A HD22 3.106 2.305 VAL 183.A N GLU 179.A O VAL 183.A H 2.831 1.997 LEU 184.A N LEU 180.A O LEU 184.A H 2.790 1.944 LYS 185.A N ASN 182.A O LYS 185.A H 3.291 2.559 LYS 185.A NZ VAL 183.A O LYS 185.A HZ2 3.498 2.745 GLU 188.A N LYS 185.A O GLU 188.A H 3.054 2.202 ALA 190.A N HIS 187.A O ALA 190.A H 3.169 2.346 ASP 191.A N SER 122.A O ASP 191.A H 2.809 1.984 THR 192.A N SER 122.A O THR 192.A H 2.991 2.146 THR 192.A OG1 GLY 124.A O THR 192.A HG1 3.179 2.694 THR 192.A OG1 ASP 191.A OD1 THR 192.A HG1 2.590 1.916 ILE 193.A N THR 248.A O ILE 193.A H 2.752 1.910 LEU 194.A N.A ILE 120.A O LEU 194.A H.A 2.755 1.914 LEU 194.A N.B ILE 120.A O LEU 194.A H.B 2.762 1.916 ILE 195.A N LYS 250.A O ILE 195.A H.B 2.803 1.961 ASN 197.A N GLN 119.A OE1 ASN 197.A H 2.917 2.063 HIS 198.A N ARG 118.A O HIS 198.A H 3.224 2.513 HIS 198.A NE2 ASP 176.A OD2 HIS 198.A HE2 2.838 2.106 GLY 202.A N GLY 112.A O GLY 202.A H 3.384 2.583 LEU 203.A N ALA 60.A O LEU 203.A H 2.891 2.040 ILE 204.A N VAL 109.A O ILE 204.A H 2.890 2.064 SER 205.A N ASP 59.A O SER 205.A H 2.829 1.994 ALA 206.A N GLY 107.A O ALA 206.A H 2.871 2.012 VAL 208.A N SER 205.A OG VAL 208.A H 3.417 2.590 TYR 209.A N SER 205.A O TYR 209.A H 2.879 2.028 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.913 2.096 GLY 211.A N VAL 208.A O GLY 211.A H 2.984 2.252 ASP 215.A N SER 212.A OG ASP 215.A H 3.063 2.253 LYS 216.A N SER 212.A O LYS 216.A H 2.880 2.062 ALA 217.A N ASP 213.A O ALA 217.A H 3.243 2.424 ILE 218.A N ASP 215.A O ILE 218.A H 2.806 1.958 SER 219.A N LYS 216.A O SER 219.A H 3.134 2.305 GLU 220.A N ALA 217.A O GLU 220.A H 2.999 2.157 ALA 222.A N SER 219.A O ALA 222.A H 2.892 2.066 LYS 223.A N GLU 220.A O LYS 223.A H 3.039 2.264 LYS 223.A NZ GLU 25.A OE1 LYS 223.A HZ1 2.974 2.145 LYS 223.A NZ GLU 25.A OE2 LYS 223.A HZ1 2.986 2.301 HIS 224.A N LEU 221.A O HIS 224.A H 3.155 2.361 HIS 224.A NE2 GLU 25.A OE1 HIS 224.A HE2 2.671 1.879 ASP 226.A N ALA 222.A O ASP 226.A H 2.921 2.093 SER 227.A N LYS 223.A O SER 227.A H 2.989 2.245 THR 228.A N VAL 225.A O THR 228.A H 3.139 2.330 THR 228.A OG1 VAL 225.A O THR 228.A HG1 2.746 1.933 LEU 229.A N ASP 226.A O LEU 229.A H 2.983 2.246 VAL 231.A N SER 227.A O VAL 231.A H 3.303 2.509 TYR 232.A N THR 228.A O TYR 232.A H 3.043 2.220 VAL 233.A N ASP 230.A O VAL 233.A H 3.167 2.402 VAL 233.A N VAL 231.A O VAL 233.A H 3.143 2.526 LYS 234.A N VAL 231.A O LYS 234.A H 2.800 1.976 GLU 235.A N TYR 232.A O GLU 235.A H 2.955 2.111 TRP 238.A N LYS 234.A O TRP 238.A H 2.815 1.977 THR 239.A N GLU 235.A O THR 239.A H 2.985 2.191 THR 239.A OG1 GLU 235.A O THR 239.A HG1 2.704 1.933 ASP 240.A N PRO 236.A O ASP 240.A H 2.939 2.117 ALA 241.A N GLU 237.A O ALA 241.A H 3.071 2.296 LEU 242.A N THR 239.A O LEU 242.A H 2.984 2.286 THR 243.A N ASP 240.A O THR 243.A H 2.993 2.154 THR 243.A OG1 ASP 240.A O THR 243.A HG1 2.663 1.843 LYS 244.A N ALA 241.A O LYS 244.A H 3.047 2.243 LYS 247.A NZ HIS 187.A O LYS 247.A HZ2 2.671 1.989 LYS 247.A NZ GLU 188.A O LYS 247.A HZ1 3.168 2.491 LYS 247.A NZ ALA 190.A O LYS 247.A HZ3 2.867 2.054 THR 248.A N ASP 191.A O THR 248.A H 3.005 2.205 LYS 250.A N ILE 193.A O LYS 250.A H 2.990 2.160 LYS 250.A NZ VAL 126.A O LYS 250.A HZ2 3.023 2.281 VAL 252.A N ILE 195.A O VAL 252.A H 3.112 2.296 SER 255.A N ASP 253.A OD1 SER 255.A H 2.992 2.310 PHE 256.A N ASP 253.A O PHE 256.A H 2.903 2.099 PHE 257.A N GLN 254.A O PHE 257.A H 3.075 2.252 GLY 258.A N SER 255.A O GLY 258.A H 3.231 2.389 ALA 260.A N PHE 257.A O ALA 260.A H 3.116 2.262 GLN 263.A N ASP 259.A O GLN 263.A H 3.079 2.255 TRP 264.A N ALA 260.A O TRP 264.A H 2.966 2.178 TRP 264.A NE1 PRO 144.A O TRP 264.A HE1 3.000 2.240 GLU 265.A N ILE 261.A O GLU 265.A H 3.134 2.312 THR 266.A N ALA 262.A O THR 266.A H 3.170 2.357 ILE 267.A N GLN 263.A O ILE 267.A H 3.056 2.244 TRP 268.A N TRP 264.A O TRP 268.A H 2.965 2.221 TRP 268.A NE1 ASP 147.A OD2 TRP 268.A HE1 2.747 2.072 LYS 271.A N TRP 268.A O LYS 271.A H 2.999 2.195 LYS 271.A NZ ILE 267.A O LYS 271.A HZ3 2.869 2.104 ALA 272.A N TRP 268.A O ALA 272.A H 3.039 2.237 SER 274.A N ASN 72.A OD1 SER 274.A H 2.940 2.088 LEU 275.A N ALA 272.A O LEU 275.A H 2.953 2.121 LEU 278.A N SER 274.A O LEU 278.A H 2.988 2.154 ARG 279.A N LEU 275.A O ARG 279.A H 2.833 2.008 LYS 280.A N PRO 276.A O LYS 280.A H 3.083 2.288 THR 281.A N GLU 277.A O THR 281.A H 2.926 2.090 ALA 282.A N LEU 278.A O ALA 282.A H 2.915 2.085 ALA 283.A N ARG 279.A O ALA 283.A H 2.931 2.128 ASP 284.A N LYS 280.A O ASP 284.A H 2.900 2.079 LEU 285.A N THR 281.A O LEU 285.A H 3.026 2.222 GLN 286.A N ALA 282.A O GLN 286.A H 3.194 2.409 ALA 287.A N ALA 283.A O ALA 287.A H 2.899 2.072 GLU 288.A N ASP 284.A O GLU 288.A H 2.983 2.177 ASN 289.A N GLN 286.A O ASN 289.A H 3.151 2.315 LEU 290.A N LEU 285.A O LEU 290.A H 3.037 2.185